Comissão de Pesquisa e Inovação do IME-USP

Comissão de Pesquisa e Inovação do IME-USP - Pós-Doutorado concluído

Shantanu Gupta

Graduado em Bioinformática em 2011 na Universidade de Singhania na Índia entre os top 5% , mudou-se para o Brasil onde iniciou o Mestrado em Física em 2015 na UFSM, concluindo em 2016, onde iniciou o Doutorado em Física no mesmo tempo e no mesmo departamento . O doutorado foi concluído em março de 2021. Nesse periodo, tornou-se revisor em muitas revistas científicas e publicou muitos artigos relevantes. Atualmente, faz Pós Doutorado em Matemática e Estatística no Departamento de Ciência da Computação na USP. (Texto informado pelo autor)

http://lattes.cnpq.br/6789352914572817 (22/03/2024)

Rótulo/Grupo:

Bolsa CNPq:

Período de análise:

Endereço: Universidade de São Paulo, Instituto de Matemática e Estatística. Rua do Matão 1010 Butantã 05508090 - São Paulo, SP - Brasil Telefone: (55) 32209521

Grande área: Ciências Biológicas

Área: Biologia Geral

Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Artigos completos publicados em periódicos (17)
1. MARCELLO, YOLANDA M.B. ; SILVEIRA, DANER A. ; GUPTA, SHANTANU ; MOMBACH, JOSÉ CARLOS M.. PTEN expression can be used as a switch between senescence and apoptosis in breast cancer cells according to a logical model of the G2/M checkpoint. BIOSYSTEMS. v. 235, p. 105097, 2024. Qualis: A4
2. GUPTA, SHANTANU; SILVEIRA, DANER A. ; PIEDADE, GABRIEL P.S. ; OSTROWSKI, MIGUEL P. ; MOMBACH, JOSÉ CARLOS M. ; HASHIMOTO, RONALDO F.. A dynamic Boolean network reveals that the BMI1 and MALAT1 axis is associated with drug resistance by limiting miR-145-5p in non-small cell lung cancer. Non-Coding Rna Research. v. 9, p. 185-193, 2024. Qualis: Não identificado (NON-CODING RNA RESEARCH)
3. GUPTA, SHANTANU; SILVEIRA, DANER A. ; HASHIMOTO, RONALDO F.. A Boolean model of the oncogene role of FAM111B in lung adenocarcinoma. COMPUTATIONAL BIOLOGY AND CHEMISTRY. v. 106, p. 107926, 2023. Qualis: A3
4. SILVEIRA, DANER A. ; GUPTA, SHANTANU ; DA CUNHA JAEGER, MARIANE ; BRUNETTO DE FARIAS, CAROLINE ; MOMBACH, JOSÉ CARLOS MERINO ; SINIGAGLIA, MARIALVA. A logical model of Ewing sarcoma cell epithelial-to-mesenchymal transition supports the existence of hybrid cellular phenotypes. FEBS LETTERS. v. 1, p. 1, 2023. Qualis: A2
5. GUPTA, SHANTANU; SILVEIRA, DANER A. ; MOMBACH, JOSÉ CARLOS M. ; HASHIMOTO, RONALDO F.. The lncRNA DLX6-AS1/miR-16-5p axis regulates autophagy and apoptosis in non-small cell lung cancer: A Boolean model of cell death. Non-Coding Rna Research. v. 1, p. 1, 2023. Qualis: Não identificado (NON-CODING RNA RESEARCH)
6. GUPTA, SHANTANU; PANDA, PRITAM KUMAR ; SILVEIRA, DANER A. ; AHUJA, RAJEEV ; HASHIMOTO, RONALDO F.. Quadra-Stable Dynamics of p53 and PTEN in the DNA Damage Response. Cells. v. 12, p. 1085, 2023. Qualis: A1
7. GUPTA, SHANTANU; PANDA, PRITAM KUMAR ; HASHIMOTO, RONALDO F. ; SAMAL, SHAILESH KUMAR ; MISHRA, SUMAN ; VERMA, SURESH KR. ; MISHRA, YOGENDRA KUMAR ; AHUJA, RAJEEV. Dynamical modeling of miR-34a, miR-449a, and miR-16 reveals numerous DDR signaling pathways regulating senescence, autophagy, and apoptosis in HeLa cells. Scientific Reports. v. 12, p. 4911, 2022. Qualis: A2
8. GUPTA, SHANTANU; HASHIMOTO, RONALDO F.. Dynamical Analysis of a Boolean Network Model of the Oncogene Role of lncRNA ANRIL and lncRNA UFC1 in Non-Small Cell Lung Cancer. BIOMOLECULES. v. 12, p. 420, 2022. Qualis: A1
9. GUPTA, SHANTANU; SILVEIRA, DANER A. ; HASHIMOTO, RONALDO F. ; MOMBACH, JOSE CARLOS M.. A Boolean Model of the Proliferative Role of the lncRNA XIST in Non-Small Cell Lung Cancer Cells. BIOLOGY. v. 11, p. 480, 2022. Qualis: A1
10. SILVEIRA, DANER ACUNHA ; GUPTA, SHANTANU ; SINIGAGLIA, MARIALVA ; MOMBACH, JOSÉ CARLOS MERINO. The Wnt pathway can stabilize hybrid phenotypes in the epithelial-mesenchymal transition: A logical modeling approach. COMPUTATIONAL BIOLOGY AND CHEMISTRY. v. 99, p. 107714, 2022. Qualis: A3
11. GUPTA, SHANTANU; PANDA, PRITAM KUMAR ; LUO, WEI ; HASHIMOTO, RONALDO F. ; AHUJA, RAJEEV. Network analysis reveals that the tumor suppressor lncRNA GAS5 acts as a double-edged sword in response to DNA damage in gastric cancer. Scientific Reports. v. 12, p. 18312, 2022. Qualis: A2
12. GUPTA, SHANTANU; SILVEIRA, DANER A. ; MOMBACH, JOSÉ CARLOS M.. ATM /miR-34a-5p axis regulates a p21-dependent senescence-apoptosis switch in non-small cell lung cancer: a Boolean model of G1/S checkpoint regulation. FEBS LETTERS. v. 594, p. 227-239, 2020. Qualis: A2
13. SILVEIRA, DANER A ; GUPTA, SHANTANU ; MOMBACH, JOSÉ CARLOS M. p53/E2F1/miR-25 axis regulates apoptosis induction in glioblastoma cells: a qualitative model. Journal of Physics: Complexity. v. 1, p. 035001, 2020. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF PHYSICS: COMPLEXITY)
14. SILVEIRA, DANER A. ; GUPTA, SHANTANU ; MOMBACH, JOSÉ CARLOS M.. Systems biology approach suggests new miRNAs as phenotypic stability factors in the epithelial-mesenchymal transition. Journal of the Royal Society Interface. v. 17, p. 20200693, 2020. Qualis: A1
15. GUPTA, SHANTANU; SILVEIRA, DANER A. ; BARBÉ-TUANA, FLORENCIA M. ; MOMBACH, JOSÉ CARLOS M.. Integrative data modeling from lung and lymphatic cancer predicts functional roles for miR-34a and miR-16 in cell fate regulation. Scientific Reports. v. 10, p. 1, 2020. Qualis: A2
16. GUPTA, SHANTANU; SILVEIRA, DANER A. ; MOMBACH, JOSÉ CARLOS M.. Towards DNA-damage induced autophagy: A Boolean model of p53-induced cell fate mechanisms. DNA REPAIR. v. 96, p. 102971, 2020. Qualis: A1
17. GUPTA, SHANTANU; SILVEIRA, DANER A. ; MOMBACH, JOSÉ CARLOS M.. Modeling the role of microRNA-449a in the regulation of the G2/M cell cycle checkpoint in prostate LNCaP cells under ionizing radiation. PLoS One. v. 13, p. e0200768, 2018. Qualis: A1
Livros publicados/organizados ou edições (0)
Capítulos de livros publicados (0)
Textos em jornais de notícias/revistas (0)
Trabalhos completos publicados em anais de congressos (0)
Resumos expandidos publicados em anais de congressos (0)
Resumos publicados em anais de congressos (0)
Artigos aceitos para publicação (1)
1. GUPTA, SHANTANU; SILVEIRA, DANER A. ; BARBE-TUANA, F. M. ; MOMBACH, JOSÉ CARLOS M.. Integrative data modeling from lung and lymphatic cancer predicts functional roles for miR-34a and miR-16 in cell fate regulation. Scientific Reports. 2020. Qualis: A2
Apresentações de trabalho (0)
Demais tipos de produção bibliográfica (0)

Produção técnica

Programas de computador com registro (0)
Programas de computador sem registro (0)
Produtos tecnológicos (0)
Processos ou técnicas (0)
Trabalhos técnicos (0)
Demais tipos de produção técnica (0)

Produção artística

Total de produção artística (0)

Orientações em andamento

Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (0)
Dissertação de mestrado (0)
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (0)

Supervisões e orientações concluídas

Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (0)
Dissertação de mestrado (0)
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (0)

Projetos de pesquisa

Total de projetos de pesquisa (0)

Prêmios e títulos

Total de prêmios e títulos (0)

Participação em eventos

Total de participação em eventos (2)
1. National Workshop on Biological Sequence Analysis. 2009. (Outra).
2. 5ª International Conference on Bioinformatics and Biotechnology InCob 2006. 2006. (Congresso).

Organização de eventos

Total de organização de eventos (0)

Lista de colaborações

Colaborações endôgenas (0)

(*) Relatório criado com produções desde 2000 até 2024
Data de processamento: 08/08/2024 12:42:22