Programa de Pós-Graduação Interunidades em Bioinformãtica

2023

2023-Atual. Análise genômica de bactérias probióticas bacteriocinogênicas: identificação taxonômica e caracterização de genes relacionados à síntese de bacteriocinas
Descrição: A utilização de micro-organismos probióticos na prevenção e no tratamento de infecções bacterianas em animais destinados ao consumo humano vem sendo considerada uma alternativa eficiente frente ao uso de antibióticos. Adicionalmente, estudos recentes demonstram que determinadas biomoléculas produzidas por estes micro-organismos, tais como bacteriocinas, vitaminas, ácidos graxos, exopolissacarídeos, enzimas, entre outras, podem melhorar a imunidade e o desenvolvimento de seus hospedeiros. Os micro-organismos probióticos mais utilizados atualmente nas indústrias de alimentos e farmacêuticas são os pertencentes ao grupo de bactérias ácido-láticas (BALs), uma vez que são consideradas seguras pelos órgãos reguladores nesta área. No entanto, sabe-se que os efeitos benéficos gerados pelos probióticos são específicos para cada hospedeiro e que, frequentemente, cada biomolécula de interesse é sintetizada, em maior quantidade, por uma determinada linhagem bacteriana. Nesse contexto, o presente projeto tem como objetivo principal o isolamento e a identificação de BALs probióticas presentes na microbiota do intestino de aves, suínos e peixes. Para tanto, serão selecionadas cepas com alta capacidade de produzir bacteriocinas. A partir desta seleção, serão realizados ensaios de compatibilidade entre as cepas e, posteriormente será confeccionado um "mix" de probióticos. As cepas que o compõe serão individualmente micro-encapsuladas e administradas diariamente na dieta dos animais de interesse do setor agropecuário, através de ração e água, a fim de averiguar a eficácia probiótica da mistura. Bacteriocinas sintéticas serão igualmente micro-encapsuladas e administradas na dieta dos animais para compreender seu efeito individual na saúde dos mesmos. Os resultados obtidos com as microcápsulas serão comparados com aqueles obtidos com as mesmas estruturas livres. Ademais, serão realizados estudos imunológicos, análises de microscopia eletrônica e de diversidade da microbiota intestinal desses animais. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (4) . Integrantes: Mauro de Medeiros Oliveira - Integrante / Alessandro de Mello Varani - Integrante / Ricardo Pinheiro de Souza Oliveira - Coordenador / Taís Mayumi Kuniyoshi - Integrante / Carlos Miguel Nóbrega Mendonça - Integrante / Iago Rodrigues Blanco - Integrante / João Victor Dos Anjos - Integrante.
Membro: Mauro de Medeiros Oliveira.

2021

2021-2023. Abordagem sistêmica da cana de açúcar: entendendo a expressão gênica para melhorar o crescimento e produção de bioetanol
Descrição: O projeto de pesquisa INCT-Bioetanol tem como um dos objetivos explorar o potencial de alvos relacionados às modificações de parede celular e de rotas sinalizadoras de açúcares a fim de aumentar a produção de biomassa para bioenergia. Contudo, eventos espontâneos de poliploidização no gênero Saccharum tornaram o genoma de cana-de-açúcar redundante, abrigando genes em várias cópias funcionais. Adicionalmente, as cultivares de cana-de-açúcar são híbridos interespecíficos poliploides/aneuplóides, o que confere uma complexidade ao genoma, tornando estudos moleculares nesta espécie um desafio. Atualmente, o grupo de pesquisa LAFIECO possui três bancos de transcriptoma, um proteoma e um microtranscriptoma. Além disso, duas ferramentas para análise sistêmica de redes foram desenvolvidas. Desta forma, pretende-se desenvolver um banco de dados local para armazenamento e divulgação dos resultados obtidos, os quais poderão ser facilmente acessados e utilizados em estudos posteriores, além de se estruturar a integração das ferramentas de análise de redes. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Mauro de Medeiros Oliveira - Integrante / Marcos Silveira Buckeridge - Coordenador / Adriana Grandis - Integrante / Bruno Viana Navarro - Integrante.
Membro: Mauro de Medeiros Oliveira.

2021-Atual. UM MODELO DE TARIFA DINÂMICA DE ENERGIA, APLICANDO CONTROLE ESTATÍSTICO DE PROCESSOS E VALENDO-SE DE MEDIDORES INTELIGENTES EM UM SISTEMA DE REDES INTELIGENTES
Descrição: Aplicação do uso de medidores inteligentes no desenvolvimento de um modelo de tarifação dinâmica utilizando métodos computacionais e estatísticos.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Felipe Prata Lima - Coordenador / CLEVERTON DA SILVA VASCONCELOS - Integrante / ROBERTO NILTON BENTO DA SILVA - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.Número de orientações: 1
Membro: Felipe Prata Lima.

2020

2020-2021. COVID-19: Ações estratégicas do Programa de Pós-Graduação em Biociências e Biotecnologia do Instituto na modalidade deCarlos Chagas da Fiocruz para o desenvolvimento de ferramentas múltiplas de diagnóstico
Descrição: O projeto COVID-19: Ações estratégicas do Programa de Pós-Graduação em Biociências e Biotecnologia do Instituto Carlos Chagas da Fiocruz para o desenvolvimento de ferramentas múltiplas de diagnóstico será desenvolvido na FUNDAÇÃO OSWALDO CRUZ (FIOCRUZ) e está vinculado ao Programa Estratégico Emergencial de Prevenção e Combate a Surtos, Endemias, Epidemias e Pandemias (CAPES-EPIDEMIAS). Este programa tem o objetivo de apoiar projetos de pesquisas e formação de recursos humanos altamente qualificados, no âmbito dos Programas de Pós-Graduação stricto sensu, voltados ao enfrentamento à nova pandemia da COViD-19 e em temas relacionados a endemias e epidemias típicas no país, com foco nas áreas específicas descritas a seguir: Epidemiologia, Infectologia, Microbiologia, Imunologia, Bioengenharia e Bioinformática. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Mauro de Medeiros Oliveira - Integrante / Helisson Faoro - Coordenador / Michelle Orane Schemberger - Integrante / Andreia Akemi Suzukawa - Integrante.
Membro: Mauro de Medeiros Oliveira.

2019

1.	2019-2024. Investigação das alterações na expressão dos HERVs e das interleucinas na resposta imune em células de linhagens placentárias associadas à infecção pelo vírus Zika Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . Integrantes: Paula Prieto Oliveira - Integrante / Luiz Mário Ramos Janini - Coordenador / Fernando Antoneli - Integrante / Juliana T Maricato - Integrante / Isabel Maria Vicente Guedes de Carvalho Mello - Integrante / Thamires Prolo - Integrante / Anderson Luis da Costa - Integrante / Denis Jacob Machado - Integrante / Márcia Duarte Barbosa - Integrante / Robert Andreata-Santos - Integrante / Cristina M Peter - Integrante / Paolo M A Zanotto - Integrante. Membro: Paula Prieto Oliveira.
2.	2019-Atual. Recipient Epidemiology and Donor Evaluation Study-IV-Pediatric (REDS-IV- P) Descrição: (da Fundação Pró-Sangue-USP, entre outras instituições brasileiras e norte-americanas) - projeto internacional REDS, iniciado em 2005 e financiado pelo National Institute of Health (NIH) dos EUA. Nesta quarta fase, o REDS-IV-P tem como objetivo o aprimoramento dos benefícios da transfusão e a redução de seus riscos, focando também em populações negligenciadas. O estudo dará continuidade aos estudos do REDS-III, com atenção adicional a recém-nascidos, crianças e grávidas que necessitam de transfusões. O projeto pretende responder importantes perguntas sobre a medicina transfusional e políticas de decisões relacionadas ao sangue. O REDS-IV-P também estende o Brazilian sickle cell disease cohort iniciado no REDS-III, avaliando práticas transfusionais e dados clínicos de pacientes com anemia falciforme. O projeto ainda monitora e investiga ameaças relacionadas a estoques de sangue, como zika, chikungunya e dengue.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Mina Cintho Ozahata - Integrante / João Eduardo Ferreira - Integrante / CARNEIRO PROIETTI, ANNA BÁRBARA - Integrante / SABINO, ESTER - Coordenador / ALMEIDA NETO, CESAR - Integrante. Membro: Mina Cintho Ozahata.
3.	2019-2020. SIMULAÇÃO 3D DE EXPERIMENTOS: UMA ABORDAGEM INTERDISCIPLINAR PARA AS CIÊNCIAS DA NATUREZA Descrição: Esse projeto consiste na criação de um software que simula em três dimensões (3D) experimentos na área das ciências da natureza: biologia, química e física. Seu propósito é demonstrar e simplificar o entendimento de como essas três ciências se relacionam. Os assuntos da grade curricular do ensino médio serão o foco para seleção dos experimentos, a fim de: (i) auxiliar os professores dessas diferentes áreas na execução de atividades acadêmicas interdisciplinares que necessitem ou se beneficiem dessa visão integrada nesse nível de ensino; e (ii) complementar e/ou facilitar o aprendizado por parte dos seus estudantes através de recursos visuais interativos. Embora nos dias atuais haja a disponibilidade de recursos interativos para auxílio ao aprendizado, ainda se pode perceber certa carência deles, principalmente se considerados os aspectos da diversidade de assuntos, da falta integração por causa da estrutura compartimentalizada das áreas do saber, da formação inadequada dos docentes no que tange à visão fragmentada dos conhecimentos de diferentes áreas.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Felipe Prata Lima - Coordenador / José Leandro Costa Gomes - Integrante / Suellen Evelyn de Oliveira Silva - Integrante / Vitória de Lira Tenório - Integrante. Número de produções C, T & A: 2 Membro: Felipe Prata Lima.

2018

2018-2022. Genômica comparativa em Euglenozoários: análise dos diferentes modos de vida
Descrição: O filo Euglenozoa é um diverso grupo de organismos unicelulares eucariotos, que engloba três grupos: euglenídeos, diplonemídeos e cinetoplastídeos, apresentando uma grande diversidade de modos de nutrição, incluindo fagotrófico (bacterívoro e eucarióvoro), osmotrófico e fototrófico; e estilo de vida, como livre, parasitário, comensal e endossimbionte. E, apesar de diverso, o foco de pesquisas anteriores foram em organismos de importância econômica e, principalmente, médica, prejudicando as análises comparativas necessárias para a determinação do(s) modo(s) de evolução de muitas características de interesse, inclusive nos modos de vida. Também, a genômica e a transcritômica são abordagens de crescente importância no estudo de todos os grupos de organismos, em especial os protozoários. À proporção que novos genomas são sequenciados e disponibilizados, nos permitindo expandir cada vez mais nossas análises, é possível compreender melhor as relações entre as espécies. Neste trabalho será realizado um estudo a nível molecular, particularmente genômico, comparando os mudanças no conteúdo genético e nas capacidades metabólicas dentro deste grande filo tentando identificar as principais diferenças e semelhanças entre os modos de vida e nutrição dos grupos contidos, além de realizar uma análise filogenética multigênica. Com isso pretende-se entender melhor tanto como ocorreu a evolução do grupo, como o evolução do conteúdo gênico e sua relação com modo de vida, também verificar a pressão que ocorre nos genes de acordo com as singularidades de cada genoma. Para isso, foram selecionados até o momento, 15 genomas e transcriptomas disponíveis em bancos de dados públicos, e outros que fazem parte do projeto maior AToLe que ainda não foram publicados. Será feita a montagem, dos sequenciados que ainda não estão prontos para análise usando o programa Newbler, a predição das sequencias gênicas, e montagem de todos os genomas. Uma parte da anotação será feita utilizando o programa Asgasrd, que identifica proteínas, a partir de bancos de dados como o KEGG e UniProt, e seleciona as vias metabólicas que proteína identificada participa. A análise filogenética será feita através da abordagem de filogenômica, a partir da identificação dos genes ortólogos entre todos os genomas.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Anderson Carvalho Morais - Integrante / João Marcelo Pereira Alves - Coordenador.
Membro: Anderson Carvalho Morais.

2016

2016-2016. Sequênciamento genômico do sapo pé-de-pá-oriental, Scaphiopus holbrookii (Amphibia: Anura: Scaphiopodidade) e do sapo flamenguinho, Melanophryniscus moreirae (Amphibia: Anura: Bufonidae)
Descrição: Projeto de Bolsa em Extensão e Pesquisa no Exterior (BEPE), FAPESP, Proc. No. 2015/18654-2. Apesar da disponibilidade de tecnologias de sequenciamento de alta performance que permitem a aquisição de dados moleculares a preços factíveis, dificuldades computacionais em analisar grandes bancos de dados de sequências e o pequeno número de genomas nucleares de sapos que possam ser usados como referência têm dificultado avanços em estudos genômicos de anuros. Apenas dois genomas nucleares e 81 genomas mitocondriais completes foram publicados para Anura até a data de submissão desta proposta, uma amostragem muito pequena das atuais 6.483 espécies de sapos. Aqui eu proponho montar e analisar o genoma nuclear parcial e o genoma mitocondrial completo do sapo-pé-de-pá-oriental, Scaphiopus holbrookii, e do sapo-flamenguinho, Melanophyniscus moreirae, usando tecnologias de sequenciamento de alta eficiência (Illumina HiSeq). Estas espécies foram selecionadas devido à características genéticas que facilitam a análise de seu genoma e qualidades únicas que as tornam interessantes para o estudo da evolução de Anfíbios e da defesa química neste grupo. O sapo-pé-de-pá-oriental tem posição filogenética estratégica que possibilita a investigação de aspectos genômicos associados com a transição para o ambiente terrestre em sapos, do papel dos elementos transponíveis no tamanho do genoma de anfíbios, da distribuição e variabilidade de elementos ultra-conservados específicos à linhagem ou aos anuros, da evolução de genes organelares e dos rearranjos genômicos mitocondriais em anuros, entre outros. Já o sapo-flamenguinho é um bufonídeo que apresenta defesa química baseada tanto em alcaloides sequestrados da dieta quanto bufoteninas biosintetizadas, sendo então uma espécie chave para o entendimento da defesa química em anuros. A viabilidade deste projeto é garantida pela disponibilidade de sequências brutas já obtidas para ambas as espécies e recursos computacionais massivos dedicados à este projeto, aliados à experiência dos nossos colaboradores internacionais na área da genômica de organismos não-modelo. Eu acredito que a presente proposta irá nos levar um passo adiante na superação da nossa atual falta de conhecimento em genômica comparada de anuros e na distância entre a facilidade atual na obtenção de dados genômicos e a dificuldade de analisá-los.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Denis Jacob Machado - Integrante / Taran Grant - Integrante / DANIEL JANIES - Coordenador.
Membro: Denis Jacob Machado.

2015

2015-Atual. Assinatura angiogenica patológica e seu poder prognóstico
Descrição: O projeto tem o objetivo de criar uma assinatura angiogênica capaz de estratificar amostras tumorais humanas quanto à sobrevida. Se mostras bons resultados essa assinatura pode ser incorporada à clinica como um marcador molecular capaz de auxiliar no tratamento de alguns tipos de canceres. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rodrigo Guarischi Mattos Amaral de Sousa - Integrante / Ricardo José Giordano - Integrante / Joao Carlos Setubal - Integrante / Paul Boutros - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
Membro: Rodrigo Guarischi Mattos Amaral de Sousa.

2015-2018. Genômica comparativa de tripanossomatídeos portadores de endossimbiontes e sua implicação no genoma de Angomonas ambiguus.
Descrição: Tripanossomatídeos hospedeiros de endossimbiontes (SHT) possuem características únicas, em aspectos morfológicos, bioquímicos e moleculares, quando comparados a tripanossomatídeos regulares (RT). Dentre as sete espécies conhecidas atualmente, Angomonas ambiguus (Filo Euglenozoa; Família Trypanosomatidae) parece apresentar uma incongruência evolutiva entre os genomas do hospedeiro (núcleo) e seu endossimbionte (TPE), uma β-proteobactéria. Para entender esta incoerência, dentre outros aspectos genômicos e evolutivos, este trabalho iniciou uma análise comparativa entre os genomas de seis espécies de SHTs e seus respectivos TPEs, através de ferramentas de bioinformática. Com os genomas sequenciados e montados, foram preditas e anotadas os genes codificadores de proteínas, de rRNAs e tRNAs; identificados os genes ortólogos, com objetivo de realizar uma comparação do conteúdo gênico, e também para realizar a comparação posterior por meio de inferência filogenética por máxima verossimilhança entre todos os grupos ortólogos encontrados entre A. ambiguus, A. deanei, A. desouzai, Strigomonas Galati, S. oncopelti e S. culicis, e entre os respectivos endossimbiontes. Foi feita também análise filogenômica através da construção de uma superárvore. O genoma do endossimbionte é bem reduzido, com perda no conteúdo GC, além disso notou-se perdas de genes ortólogos, tanto para essa espécie, quanto para os outros TPEs. A anotação funcional dos genes a partir das vias metabólicas do KEGG e utilizando o programa ASGARD, verificou-se que o TPE contribui fornecendo genes para completar muitas das vias de aminoácidos dos SHT, como em alguns aminoácidos essenciais, tal qual prolina, arginina, valina, leucina, e outros não essenciais, comprovando a relação mutualística entre endossimbionte e hospedeiro, como é visto em outros trabalhos. Também, comprovou-se por filogenia multigênica que A. ambiguus está mais relacionada com A. desouzai, enquanto Candidatus Kinetoplastibacterium crithidii ?amb? está diretamente relacionado com o endossimbionte de A. deanei. No caso das espécies do gênero Strigomonas, cada flagelado possui sua própria espécie de endossimbionte, em perfeita coespeciação. O que provavelmente aconteceu foi a hibridização entre as espécies A. desouzai e A. deanei, permanecendo o núcleo da primeira e o endossimbionte da segunda espécie, hibridação é um fenômeno bem relatado em espécies do gênero Leishmania.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Anderson Carvalho Morais - Integrante / João Marcelo Pereira Alves - Coordenador.
Membro: Anderson Carvalho Morais.

2014

1.	2014-2016. Desenvolvimento de um algoritmo para a montagem do genoma poliploide de cana-de-açúcar (FAPESP-MICROSOFT). Descrição: Os desafios do seqüenciamento do genoma da cana-de-açúcar são a montagem e a análise de um genoma altamente complexo poliplóide e aneupoliplóide, com set de genes homólogos que podem variar de 10 a 20 cópias (alelos). O projeto proposto pretende melhorar, através do desenvolvimento de novos algoritmos, a montagem de seqüências de shotgun dos conjuntos de dados gerados pelos grupos de pesquisa do programa BIOEN. Pretendemos reunir dados de seqüenciamento de shotgun obtidos utilizando equipamento 454 e Illumina utilizando diferentes protocolos para a montagem de um genoma referencia do cultivar SP80-3280. Para completar a montagem o grupo desenvolverá algoritmos que permitirão o reconhecimento de cópias múltiplas de qualquer região do genoma referência. O grupo realizará análise comparativa com outros genomas, especialmente Sorghum que apresenta muita sintenia com cana-de-açúcar, para avaliar a qualidade das seqüências montadas. Dados já existentes de transcriptoma de cana-de-açúcar serão integrados para validar modelos gênicos e inferir funções gênicas. A Microsoft irá desenvolver algoritmos para a montagem do genoma poliplóide de cana-de-açúcar para reforçar a identificação de alelos e melhorar a montagem, os resultados irão contribuir para o avanço do conhecimento em genômica de plantas, para estabelecer infra-estrutura computacional e na formação de recursos humanos altamente qualificados em bioinformática. A longo prazo, esperamos criar ferramentas de biologia computacional para resolver genomas poliplóides inicialmente com a cana-de-açúcar, mas que poderão ser aplicadas para outros cultivares poliplóides.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Pablo de Morais Andrade - Coordenador / glaucia mendes souza - Integrante. Membro: Pablo de Morais Andrade.
2.	2014-2018. Incorporação de evidências biológicas para a identificação de SNPs interferindo em sítios alvos de miRNAs Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Paula Prieto Oliveira - Integrante / Ariane Machado Lima - Coordenador / Helena Paula Brentani - Integrante. Membro: Paula Prieto Oliveira.
3.	2014-2017. Parasite Image Database - Um banco de imagens de parasitas Descrição: O ?Parasite Image Database? é um portal de imagens digitais de parasitas disponível em http://data.ime. usp.br/parasitedb/, cujo projeto se iniciou em 2011, no âmbito do Programa Aprender com Cultura e Extensão, da Pró-Reitoria de Cultura e Extensão da USP (PRCEU). O projeto consistiu inicialmente na digitalização do acervo de diapositivos do Departamento de Parasitologia, com imagens de parasitas artrópodes, helmintos e protozoários. Desde então, o projeto foi sendo aprimorado tanto na captura e edição de imagens digitais de parasitas como também na construção de um sistema de banco de dados relacional e um sítio web com interface amigável para usuários e administradores do portal. Para isso, tem sido utilizadas câmeras digitais acopladas a microscópio e lupa, além de equipamento de macrofotografia em estúdio. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Mina Cintho Ozahata - Integrante / João Eduardo Ferreira - Integrante / arthur gruber - Coordenador / Alda Maria Backx Noronha Madeira - Integrante / Leonardo Tadashi Kamaura - Integrante. Membro: Mina Cintho Ozahata.

2013

1.	2013-Atual. Busca de alvos moleculares para o diagnóstico do adenocarcinoma de pâncreas através do sequenciamento com alta-resolução do exoma e transcriptoma de amostras clínicas Descrição: Descrição: O advento das tecnologias de nova geração para sequenciamento de DNA/RNA (NGS) abriu a possibilidade de análise de alterações no genoma e transcriptoma com um grau de resolução sem precedentes. Nos próximos anos pretendemos aplicar essas abordagens para identificar alterações somáticas e transcricionais associadas com a transformação maligna e progressão do adenocarcinoma do pâncreas, com potencial uso diagnóstico e/ou terapêutico.Iremos desenvolver e otimizar métodos para a análise molecular em escala genômica de amostras biológicas de pâncreas obtidas através de ecoendoscopia por aspiração com agulha fina guiada por ultrasom (EUS-FNA). A técnica de EUS-FNA permite a obtenção de amostras clínicas de tumores de pâncreas e lesões pré-malignas de pequeno tamanho e de difícil diagnóstico através dos métodos atuais.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . Integrantes: Omar Julio Sosa - Coordenador / Eduardo Moraes Rego Reis - Integrante / Ester Risério Matos Bertoldi - Integrante / José Celso Ardengh - Integrante. Membro: Omar Julio Sosa.
2.	2013-2014. Estudo de miRNAs, em vegetais, relacionados a condições de estresse abiótico: perspectivas de uso no Bioma Caatinga Descrição: miRNAs são moléculas pequenas, com cerca de 20-24 nucleotídeos (nt), não-codificantes de proteínas. São conhecidos por desempenhar papéis regulatórios importantes em diversos eucariotos, inclusive em plantas envolvendo respostas a condições de estresse abiótico. Sob condições adversas, a expressão gênica pode ser regulada para facilitar a ativação de mecanismos de tolerância à seca, altas temperaturas e salinidade em plantas. A disponibilidade de bancos específicos para essas moléculas, albergando registros da ordem de milhões, e os métodos biológicos e computacionais para a detecção e caracterização de miRNAs, seus promotores e respectivos alvos, demandam dos cientistas a constante busca por métodos inovadores para classificar e integrar esses dados, favorecendo o aumento da compreensão dos processos biológicos, e consequente formulação de soluções para resistência ambiental, para saúde e agricultura. Considerando a tendência mundial, em estudos in silico, in vitro e in vivo de expressão, através da caracterização dos miRNAs; e as condições peculiares da Caatinga, é que a proposta em questão torna-se inovadora e oportuna. Os objetivos dessa proposta são caracterizar computacionalmente os miRNAs e possíveis promotores, estudando os fatores de transcrição que provavelmente controlam a expressão de miRNAs; e fornecer subsídios para elaboração de novas técnicas/processos com potencial biotecnológico para obtenção miRNA exógenos que atuem em características relativas ao estresse abiótico... Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Clebiano da Costa Sá - Integrante / Michely Correia Diniz - Coordenador. Membro: Clebiano da Costa Sá.
3.	2013-Atual. Genômica Comparada e a Evolução da Defesa Química de Anfíbios Descrição: Projeto de doutorado FAPESP, proc. no. 2013/05958-8. Esta proposta visa integrar técnicas de sequenciamento de próxima-geração ("next-generation sequencing", NGS) ao estudo da evolução da defesa química em anfíbios. Do ponto de vista da sistemática filogenética, o NGS possui o potencial para obtenção de filogenias mais bem suportadas, aumentando nossa capacidade de lidar com dificuldades causadas por poliploidia e hibridização e provendo novas opções para o estudo filogenético em diversos níveis taxonômicos. De uma perspectiva genômica, a análise comparada de rãs de veneno e outros anuros tem o potencial de identificar mudanças genéticas relacionadas à base molecular da defesa química em anfíbios (i.e., sequestro de alcaloides lipofílicos e resistência fisiológica), direcionando futuras pesquisas. Neste contexto, nós usaremos NGS (Illumina® HiSeqTM 2000) para gerar seis genomas nucleares completos de anuros com foco em rãs de veneno. Os dados assim obtidos serão empregados para: (1) identificar variações genéticas que possam estar associadas nos mecanismos de sequestro e resistência a alcaloides lipofílicos em rãs de veneno e (2) desenhar sondas que nos permitam empregar NGS na obtenção de loci específicos para o estudo da sistemática de anfíbios em diferentes níveis de divergência.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Denis Jacob Machado - Integrante / Taran Grant - Coordenador. Membro: Denis Jacob Machado.
4.	2013-2018. SaMi-Trop Descrição: Com objetivo de contribuir com a elucidação dos mecanismo envolvidos no curso da Doença de Chagas, o SaMi-Trop, um grande coorte de estudo prospectivo com acompanhamento de 2 anos, com aproximadamente 2000 pacientes com cardiomiopatia de Chagas foi estabelecido no estado de Minas Gerais. Este coorte teve como objetivo desenvolver um prognóstico baseado em algoritmo com medidas de eletrocardiograma, informações clínicas, níveis de peptídeo natriurético cerebral (BNP) e outros biomarcadores. Este prognóstico seria de grande importância no tratamento de pacientes, sendo empregado na predição de progressão da doença e de morte.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Mina Cintho Ozahata - Integrante / João Eduardo Ferreira - Integrante / OLIVEIRA, CLAUDIA DI LORENZO - Integrante / SABINO, ESTER - Coordenador. Membro: Mina Cintho Ozahata.

2012

1.	2012-Atual. Biologia de sistemas da formação de vasos sanguíneos: Um estudo de transcriptoma Descrição: A formação de vasos sanguíneos a partir de vasos pré-existentes denomina-se angiogênese. Uma série de doenças, entre elas o câncer e retinopatias, depende da angiogênese para progredir. Nosso projeto usa uma série temporal de um modelo angiogênico animal juntamente com a tecnologia de sequenciamento massivo paralelo (RNA-seq) para tentar compreender o complexo sistema envolvido na formação de novos vasos. Website: http://lbi.usp.br/angiogenesis. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rodrigo Guarischi Mattos Amaral de Sousa - Integrante / Ricardo José Giordano - Coordenador / Jussara Michaloski Souza - Integrante / Laura Beatriz da Silva Cardeal - Integrante / Joao Carlos Setubal - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa. Membro: Rodrigo Guarischi Mattos Amaral de Sousa.
2.	2012-Atual. Busca de alvos moleculares para o diagnóstico do adenocarcinoma de pâncreas através do sequenciamento com alta-resolução do exoma e transcriptoma de amostras clínicas Descrição: O advento das tecnologias de nova geração para sequenciamento de DNA/RNA (NGS) abriu a possibilidade de análise de alterações no genoma e transcriptoma com um grau de resolução sem precedentes. Nos próximos anos pretendemos aplicar essas abordagens para identificar alterações somáticas e transcricionais associadas com a transformação maligna e progressão do adenocarcinoma do pâncreas, com potencial uso diagnóstico e/ou terapêutico.Iremos desenvolver e otimizar métodos para a análise molecular em escala genômica de amostras biológicas de pâncreas obtidas através de ecoendoscopia por aspiração com agulha fina guiada por ultrasom (EUS-FNA). A técnica de EUS-FNA permite a obtenção de amostras clínicas de tumores de pâncreas e lesões pré-malignas de pequeno tamanho e de difícil diagnóstico através dos métodos atuais.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . Integrantes: Ester Riserio Matos Bertoldi - Coordenador / Eduardo Moraes Rego Reis - Integrante / José Celso Ardengh - Integrante / Omar Julio Sosa - Integrante. Membro: Ester Riserio Matos Bertoldi.
3.	2012-2019. Recipient Epidemiology and Donor Evaluation Study III (REDS-III) Descrição: (da Fundação Pró-Sangue-USP, entre outras instituições brasileiras e norte-americanas) - projeto internacional REDS, iniciado em 2005 e financiado pelo National Institute of Health (NIH) dos EUA, estuda todos elementos na cadeia transfusional, do doador de sangue, aos produ- tos originários da doação e aos pacientes que recebem as transfusões. No segundo semestre de 2011, o REDS deu início ao Brazilian sickle cell disease cohort passando também a enfocar o estudo da Doença Falciforme, que é a doença genética de maior incidência no mundo.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Mina Cintho Ozahata - Integrante / João Eduardo Ferreira - Integrante / CARNEIRO PROIETTI, ANNA BÁRBARA - Integrante / SABINO, ESTER - Coordenador / ALMEIDA NETO, CESAR - Integrante. Membro: Mina Cintho Ozahata.
4.	2012-2013. Sistema Integrado para controle de pacientes no Laboratório de Estudos Genômicos e de Histocompatibilidade do Hospital Universitário da UFMA Descrição: Criação de um sistema que integre todas as atividades desenvolvidas no LEGH, tanto em termos de biologia molecular quanto de imunologia.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (2) . Integrantes: Anderson Carvalho Morais - Coordenador / Emygdia Rosa do Rego Leal Mesquita - Integrante. Membro: Anderson Carvalho Morais.

2010

1.	2010-2013. Análise da variabilidade genética, através de DNA mitocondrial, da ictiofauna capturada nas regiões de influência do projeto de integração do rio São Francisco com bacias hidrográficas do nordeste setentrional Descrição: O Vale do Rio São Francisco é uma região agraciada pela biota Caatinga, rica em diversidade florística e faunística, contudo, de acordo com o Projeto de Integração do Rio São Francisco com Bacias Hidrográficas do Nordeste Setentrional (Plano Básico Ambiental (PBA) 23, 2005) ainda pouco se conhece sobre o status de conservação desses ecossistemas como a identificação das espécies, distribuição geográfica, dinâmica ecológica (tal como sensibilidade às alterações do ambiente e interações com outras espécies e/ou microrganismos). Sabe-se que a fauna de peixes de água doce do Brasil é a mais rica do mundo, existindo ainda muitas desconhecidas. Em relação ao nordeste brasileiro, poucos são os trabalhos publicados sobre a ictiofauna dulcícola. O objetivo principal desse projeto é analisar e caracterizar a variabilidade genética da ictiofauna coletado nas regiões afetadas pela integração do rio São Francisco, realizando uma caracterização quali/quantitativa das populações das bacias receptoras, através da análise de genes mitocondriais ... Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Clebiano da Costa Sá - Integrante / Michely Correia Diniz - Coordenador / Patricia Avello Nicola - Integrante / Luiz Cesar Machado Pereira - Integrante. Membro: Clebiano da Costa Sá.
2.	2010-2012. Análise histológica e imunoistoquímica de leiomiomas e leiomiossarcomas de boca Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Paula Prieto Oliveira - Integrante / Fábio Daumas Nunes - Coordenador. Membro: Paula Prieto Oliveira.
3.	2010-2012. Estrongiloidiosis: optimización de un método molecular para el diagnóstico sensible y específico de esta parasitosis endémica en Misiones Descrição: Strongyloides stercoralis é um parasita que infeta a aprosimadamente 100 milhões de pessoas no mundo, embora este número pode estar sendo subestimado debido a su dificil diagnóstico. O objetivo deste trabalho foi identificar S. stercoralis usando os atributos de sensibilidade e especificidade das técnicas de biología molecular. O estudo foi feito no estado de Misiones (Argentina), os vermes foram isolados e vários métodos de extração de DNA foram otimizados. Foi amplificada uma região do gene COI e sequenciada posteriormente, confirmando a presença de S. stercoralis nas amostras analizadas.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Omar Julio Sosa - Integrante / Fabián Galarza - Integrante / Carina Francisca Arguelles - Coordenador. Membro: Omar Julio Sosa.
4.	2010-2012. Identificação de genes relacionados à LOX em astrocitomas através de silenciamento por siRNA. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Ester Riserio Matos Bertoldi - Integrante / Miyuki - Integrante / Roseli - Integrante / Sueli Oba - Integrante / Suely Marie - Coordenador. Membro: Ester Riserio Matos Bertoldi.
5.	2010-2012. Métodos de genômica em bioinformática Descrição: Este é um projeto de estudos para a Iniciação Científica de Pedro Ivo Gomes de Faria, a ser desenvolvido sob a supervisão do professor Alan Mitchell Durham, no Instituto de Matemática e Estatística da USP. O foco deste projeto é o estudo de vários tópicos na área de bioinformática, com aplicação à análise genômica de cana-de-açúcar. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Pedro Ivo Gomes de Faria - Integrante / Alan Mitchell Durham - Coordenador. Membro: Pedro Ivo Gomes de Faria.
6.	2010-2012. Utilização de resíduos sólidos orgânicos na construção de uma composteira em uma escola pública de São Luís - Ma. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Doutorado: (1) . Integrantes: Anderson Carvalho Morais - Coordenador. Membro: Anderson Carvalho Morais.

2009

1.	2009-2010. Construção de Vídeos Educativos Voltados para o ensino de citologia no 1º ano do ensino médio: Ação Desenvolvida entre estudantes Matriculados(as) no Liceu Paraibano Descrição: Construção de material audio-visual (vídeos e animações) aplicados à difusão da ciência e melhoramento do aprendizado dos alunos do ensino médio em escolas públicas.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Francisco Ivanio Arruda Alves - Integrante / Vagner Ramos Dantas - Integrante / Soraia Fernanda Costa Inácio - Integrante / José Antônio Novaes da Silva - Coordenador. Número de produções C, T & A: 4 Membro: Francisco Ivanio Arruda Alves.
2.	2009-2011. Estudo e desenvolvimento de ferramentas computacionais voltadas à aplicação e análise de algoritmos de predição da transferência horizontal entre organismos procariotos Descrição: Os métodos para identificação de genes de transferência horizontal são vários, mas todos apresentam artefatos de técnica que muitas vezes levam à falsos positivos ou e até mesmo à falsos negativos. Os objetivos deste projeto foram: a criação de ferramentas para avaliação das ferramentas existentes assim como o desenvolvimento de novas estratégias para detecção destes genes.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Francisco Ivanio Arruda Alves - Integrante / Sávio Torres de Farias - Coordenador / Thaís Gaudencio do Rêgo - Integrante / Patrícia Keytth Lins Rocha - Integrante / Diego Cavalcanti - Integrante / Max Mahyron Guedes Santos - Integrante. Número de produções C, T & A: 3 Membro: Francisco Ivanio Arruda Alves.
3.	2009-2012. iversidade filogenética das linhagens de Acanthobothrium van Beneden, 1850 (Eucestoda: Tetraphyllidea: Onchobothriidae) parasitas de Potamotrygonidae (Chondrichthyes: Myliobatoidei) Descrição: Um importante impedimento para apresentação de uma hipótese robusta acerca da origem e diversificação dos potamotrigonídeos com base em dados parasitológicos reside nas lacunas do conhecimento sobre a diversidade e relação de parentesco de suas linhagens de parasitas. Membros da família Potamotrygonidae são elasmobrânquios estenohalinos endêmicos dos sistemas fluviais da região Neotropical, cujo o ancestral das ~20 espécies reconhecidas para a família provavelmente derivou de uma raia marinha durante as ingressões marinhas do Mioceno ao norte da América do Sul. A história biogeográfica destes hospedeiros impingiu padrões de diversificação em sua fauna parasitária composta de elementos endêmicos dos sistemas fluviais da América do Sul, bem como de linhagens compartinhadas com elasmobrânquios marinhos. Diante das discrepâncias entre as hipóteses sustentadas por dados provenientes do hospedeiro, para a origem e diversificação dos potamotrigonídeos, em relação àquelas sugeridas por dados parasitológicos, evidencia-se a necessidade de se examinar mais detalhadamente este sistema. Acredita-se que o uso de dados parasitológicos depende do esforço em documentar e postular hipóteses filogenéticas para diversas linhagens de parasitas. Com o auxílio de dados moleculares, este projeto visa abordar duas questões referentes à diversidade de uma linhagem particular de tetrafilídeos: o gênero Acantobotrium. Primeiro, objetiva-se identificar a posição relativa de linhagens monofiléticas deste gênero em relação a linhagens marinhas. Segundo, objetiva-se correlacionar estes grupos monofiléticos com o conceito atual das espécies nominais disponíveis para o gênero, ou seja, buscar suporte filogenético para espécies nominais que até o momento são definidas por caracteres morfológicos.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Denis Jacob Machado - Integrante / Fernando Portella de Luna Marques - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa. Membro: Denis Jacob Machado.
4.	2009-2009. Posição filogenética de linhagens da Phyllobothriidae (Eucestoda: Tetraphyllidea) pasitas das raias de água doce da família Potamotrygonidae (Chondrichthyes: Myliobatoidei) baseada em otimização direta de dados moleculares Descrição: Este projeto visa identificar a posição filogenética de quatro gêneros de filobotriídeos (Rhinebothrium, Rhinebothroides, Anindobothrium e Nandocestus) parasitas de potamotrigonídeos utilizando dados moleculares (18S e 28S rDNA).. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Denis Jacob Machado - Integrante / Fernando Portella de Luna Marques - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa. Membro: Denis Jacob Machado.

2008

1.	2008-2009. Bioeduca: Desenvolvendo a meliponicultura e a sustentabilidade no campo Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (12) / Doutorado: (2) . Integrantes: Anderson Carvalho Morais - Coordenador / Gisele Garcia Azevedo - Integrante. Membro: Anderson Carvalho Morais.
2.	2008-2010. Classificação das mutações de vírus HIV Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Mina Cintho Ozahata - Integrante / João Eduardo Ferreira - Coordenador. Membro: Mina Cintho Ozahata.
3.	2008-2012. Identificação de novas mutações de ponto em sequenciamento de cDNA Descrição: Identificação computacional e validação experimental de novas mutações de ponto em sequências de cDNA obtidas pelo projeto genoma humano do câncer. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rodrigo Guarischi Mattos Amaral de Sousa - Integrante / Wilson Araújo da Silva Júnior - Coordenador / Tojal, I. - Integrante / Rafaela de Barros e Lima Bueno - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa. Número de produções C, T & A: 1 Membro: Rodrigo Guarischi Mattos Amaral de Sousa.
4.	2008-2010. Mocambo: Projeto de Revitalazação da trilha ecológica do Rio Mocambo Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (12) / Doutorado: (3) . Integrantes: Anderson Carvalho Morais - Coordenador / Gisele Garcia Azevedo - Integrante. Membro: Anderson Carvalho Morais.
5.	2008-2008. Modelagem de Sistema para Armazenamento de Seqüências de rDNA 16S de Bactérias Patogênicas Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Felipe Prata Lima - Integrante / Felipe Sarmento - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas - Bolsa. Número de produções C, T & A: 2 Membro: Felipe Prata Lima.
6.	2008-2010. Raposa: Desenvolvendo a conscientização ambiental numa comunidade de pescadores da ilha do Maranhão Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Anderson Carvalho Morais - Coordenador. Membro: Anderson Carvalho Morais.
7.	2008-2008. Vigilância Epidemiológica na Unidade de Emergência do Agreste: Implantação de Serviço de Epidemiologia Molecular e Criação de Banco de Dados Informatizado para seqüências de rDNA 16S de bactérias patogênicas Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Felipe Prata Lima - Integrante / Tiago Gomes de Andrade - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Ministério da Saúde - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas - Auxílio financeiro. Número de produções C, T & A: 2 Membro: Felipe Prata Lima.

2007

1.	2007-2009. Desenvolvimento de software para detecção de ilhas gênomicas Descrição: A composição dos genomas bacterianos podem ser alterados rapidamente e dramaticamente através de uma grande variedade de processos, incluindo transferência genética horizontal. Este projeto tem como objetivo desenvolver um programa para detecção das regiões adquiridos com este mecanismo, as ilhas genômicas, em bactérias a partir da análise de elementos característicos, como transposases, integrases, condon usage tRNAs, etc., mudanças abruptas do conteúdo GC, utilizando para este último, os métodos com e sem janela, este baseado na representação de curva Z de sequências de DNA. A partir dos dados gerados e analisados serão realizados estudos para a classificação das ilhas genômicas de acordo com suas funções, que refletem no estilo de vida, patogenicidade, adaptação a nichos ecológicos e história evolutiva das bactérias.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Luiz Thibério Lira Diniz Rangel - Integrante / Demétrius Antônio Machado de Araújo - Integrante / Patrícia Keytth Lins Rocha - Integrante / Claudia Barros Monteiro Vitorello - Integrante / Thais Gaudencio do Rego - Coordenador / Alexandre Rossi Paschoal - Integrante. Membro: Luiz Thibério Lira Diniz Rangel.
2.	2007-Atual. Estudo da transferência horizontal entre organismos do gênero Mycoplasma Descrição: As ilhas genômicas compreendem regiões genômicas adquiridas via transferência horizontal gênica. Este projeto tem como objetivo determinar as ilhas genômicas presentes nas treze espécies de bactérias seqüenciadas do gênero Mycoplasma baseado em dados gerados por gráficos sobre: conteúdo GC, uso de códon, uso de aminoácido e seqüências lineares de elementos típicos de transferência horizontal. Os dados serão analisados quantitativamente e qualitativamente, possibilitando a inferência sobre a origem das regiões e a vantagem evolutiva adquirida pelos indivíduos.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . Integrantes: Luiz Thibério Lira Diniz Rangel - Integrante / Demétrius Antônio Machado de Araújo - Integrante / Patrícia Keytth Lins Rocha - Integrante / Claudia Barros Monteiro Vitorello - Integrante / Thais Gaudencio do Rego - Coordenador / Alexandre Rossi Paschoal - Integrante. Membro: Luiz Thibério Lira Diniz Rangel.
3.	2007-2009. Freqüência da translocação BCL2/IGH no ponto de quebra MBR (major breakpoint region) em brasileiros de diferentes origens étnicas da cidade de São Paulo Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Ester Riserio Matos Bertoldi - Coordenador / Sérgio Paulo Bydlowski - Integrante / Débora Levy - Integrante. Membro: Ester Riserio Matos Bertoldi.
4.	2007-2008. Genotipificación Molecular de Strongyloides stercoralis en materia fecal de niños con strongyloidiosis de Posadas ? Misiones Descrição: O objetivo deste trabalho foi a caracterização genética de S. stercoralis, a população analizada correspondeu a crianças de bairros periféricos da cidade de Posadas (Argentina), que apresentaram necessidades básicas insatisfeitas. Vermes foram isolados e distintos protocolos de extração de DNA foram usados para posteriores análises moleculares. Os resultados parasitológicos mostraram que de 70 amostras de fezes analisadas todas elas foram infectadas com helminhos, protozoários ou ambos, enquanto apenas 5 com Strongyloides.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) . Integrantes: Omar Julio Sosa - Integrante / Laura Natalia Sosa - Integrante / Carina Francisca Arguelles - Coordenador / Jorge Deschuster - Integrante. Membro: Omar Julio Sosa.
5.	2007-2010. Projeto Exposição à Pesticida e Impacto Biológico Descrição: Avaliação dos efeitos causados por pesticidas ao sistema imunológico e cardíaco.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Lucas Ferreira da Silva - Integrante / Sandra Lauton Santos - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Auxílio financeiro. Membro: Lucas Ferreira da Silva.

2006

2006-2007. Análise espectral seletiva por freqüências de sons usando a técnica de análise de componentes independentes no contexto da separação cega de fontes
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Felipe Prata Lima - Integrante / Túlio César Soares dos Santos André - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas - Bolsa. Número de produções C, T & A: 2
Membro: Felipe Prata Lima.

2006-2007. Análise Proteômica em Leishmania chagasi: Avaliação de Compostos Naturais Isolados com Perspectiva Fitofarmacológica
Descrição: A leishmaniose visceral, provocada pelo microorganismo Leishmania chagasi, atinge quase duas mil pessoas por ano no Brasil, sendo cerca de 90% dos casos no Nordeste. O alto custo dos tratamentos, as dificuldades de administração das drogas e a toxicidade medicamentosa são fatores limitantes na terapêutica da leishmaniose. A constatação de falta de resposta aos medicamentos mais usuais torna urgente a necessidade de drogas alternativas que reponham e/ou suplementem as de uso atual. Dessa forma, o uso de plantas medicinais e a identificação de seus fitoconstituintes podem fornecer novos modelos terapêuticos no tratamento de leishmanioses. A proteômica permite identificar alvos moleculares para desenvolvimento de novas opções terapêuticas, por meio da busca por proteínas essenciais a sobrevivência do parasita, bem como pode fornecer dados para futuras pesquisas que viabilizem seu uso na terapêutica clínica. O presente projeto pretende utilizar ferramentas de proteômica para a caracterização de L. chagasi quando exposto ao estresse provocado pelos compostos naturais isolados ajimalicina, cumarina, quercetina e ácido ursínico.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (8) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Luiz Thibério Lira Diniz Rangel - Integrante / Itácio Queiroz de Mello Padilha - Integrante / Erica Renata dos Santos Almeita - Integrante / Amely Branquinho Martins - Integrante / Vinícius Ramos Henriques Maracajá Coutinho - Integrante / Demétrius Antônio Machado de Araújo - Coordenador / Patrícia Keytth Lins Rocha - Integrante / Héllio Danny Nóbrega de Souza - Integrante / João Paulo Di Monaco Durbano - Integrante / Aretha Vieira Bezerra - Integrante.
Membro: Luiz Thibério Lira Diniz Rangel.

(*) Relatório criado com produções desde 2000 até 2025
Data de processamento: 12/02/2025 19:33:35