José Geraldo de Carvalho Pereira

http://lattes.cnpq.br/0181433998897446 (29/08/2023) Rótulo/Grupo: Bolsa CNPq: Período de análise: Endereço: Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Laboratório Nacional de Biociências. Rua Giuseppe Máximo Scolfaro, 10.000 Cidade Universitária 13083970 - Campinas, SP - Brasil Telefone: (19) 3512 Ramal: 1255 Grande área: Ciências Exatas e da Terra Área: Ciência da Computação Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

• Artigos completos publicados em periódicos (12)
• Livros publicados/organizados ou edições (0)
• Capítulos de livros publicados (0)
• Textos em jornais de notícias/revistas (0)
• Trabalhos completos publicados em anais de congressos (0)
• Resumos expandidos publicados em anais de congressos (0)
• Resumos publicados em anais de congressos (0)
• Artigos aceitos para publicação (0)
• Apresentações de trabalho (3)
• Demais tipos de produção bibliográfica (3)

Produção técnica

• Programas de computador com registro (0)
• Programas de computador sem registro (0)
• Produtos tecnológicos (0)
• Processos ou técnicas (0)
• Trabalhos técnicos (0)
• Demais tipos de produção técnica (0)

Produção artística

• Total de produção artística (0)

Orientações em andamento

• Supervisão de pós-doutorado (0)
• Tese de doutorado (0)
• Dissertação de mestrado (0)
• Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
• Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
• Iniciação científica (0)
• Orientações de outra natureza (1)

Supervisões e orientações concluídas

• Supervisão de pós-doutorado (0)
• Tese de doutorado (0)
• Dissertação de mestrado (0)
• Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
• Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
• Iniciação científica (0)
• Orientações de outra natureza (0)

Projetos de pesquisa

• Total de projetos de pesquisa (0)

Prêmios e títulos

• Total de prêmios e títulos (1)

Participação em eventos

• Total de participação em eventos (11)

Organização de eventos

• Total de organização de eventos (0)

Lista de colaborações

• Colaborações endôgenas (0)

Produção bibliográfica

• Artigos completos publicados em periódicos (12)
  
  1. GUERRA, JOÃO V S ; RIBEIRO-FILHO, HELDER V ; PEREIRA, JOSÉ G C ; LOPES-DE-OLIVEIRA, PAULO S. KVFinder-web: a web-based application for detecting and characterizing biomolecular cavities. NUCLEIC ACIDS RESEARCH. v. 51, p. W289-W297, 2023. Qualis: A1
  2. GUERRA, JOÃO VICTOR DA SILVA ; RIBEIRO-FILHO, HELDER VERAS ; JARA, GABRIEL ERNESTO ; BORTOT, LEANDRO OLIVEIRA ; PEREIRA, José Geraldo de Carvalho ; LOPES-DE-OLIVEIRA, PAULO SÉRGIO. pyKVFinder: an efficient and integrable Python package for biomolecular cavity detection and characterization in data science. BMC BIOINFORMATICS. v. 22, p. 607, 2021. Qualis: A1
  3. GUERRA, JOÃO VICTOR DA SILVA ; RIBEIRO FILHO, HELDER VERAS ; BORTOT, LEANDRO OLIVEIRA ; HONORATO, RODRIGO VARGAS ; PEREIRA, José Geraldo de Carvalho ; LOPES-DE-OLIVEIRA, PAULO SÉRGIO. ParKVFinder: A thread-level parallel approach in biomolecular cavity detection. Softwarex. v. 12, p. 100606, 2020. Qualis: A2
  4. TAHIRA, ANA CAROLINA ; BARBOSA, ANDRÉ ROCHA ; FELTRIN, ARTHUR SANT'ANNA ; GASTALDI, VINICIUS DAGUANO ; TOLEDO, VICTOR HUGO CALEGARI ; CARVALHO PEREIRA, JOSÉ GERALDO ; LISBOA, BIANCA CRISTINA GARCIA ; SOUZA REIS, VIVIANE NERI ; SANTOS, ANA CECÍLIA FEIO ; MASCHIETTO, MARIANA ; BRENTANI, HELENA. Putative contributions of the sex chromosome proteins SOX3 and SRY to neurodevelopmental disorders. AMERICAN JOURNAL OF MEDICAL GENETICS PART B-NEUROPSYCHIATRIC GENETICS. v. 180, p. 390-414, 2019. Qualis: A2 (AMERICAN JOURNAL OF MEDICAL GENETICS. PART B, NEUROPSYCHIATRIC GENETICS)
  5. MOTA, SABRINA G. R. ; MERCALDI, GUSTAVO F. ; PEREIRA, JOSÉ G. C. ; OLIVEIRA, PAULO S. L. ; RODRIGUEZ, ANA ; CORDEIRO, ARTUR T.. First Nonphosphorylated Inhibitors of Phosphoglucose Isomerase Identified by Chemical Library Screening. SLAS DISCOVERY: Advancing Life Sciences R&D. v. jul18, p. 247255521878746, 2018. Qualis: Não identificado (SLAS DISCOVERY: ADVANCING LIFE SCIENCES R&D)
  6. VASCONCELOS, THIAGO BRASILEIRO DE ; RIBEIRO-FILHO, HELDER VERAS ; LAHLOU, SAAD ; PEREIRA, José Geraldo de Carvalho ; OLIVEIRA, PAULO SÉRGIO LOPES DE ; MAGALHÃES, PEDRO JORGE CALDAS. Vasodilator effects and putative guanylyl cyclase stimulation by 2-nitro-1-phenylethanone and 2-nitro-2-phenyl-propane-1,3-diol on rat aorta. EUROPEAN JOURNAL OF PHARMACOLOGY. v. 830, p. 105-114, 2018. Qualis: A2
  7. RIBEIRO FILHO, HELDER VERAS ; BERNARDI VIDEIRA, NATÁLIA ; BRIDI, ALINE VILLANOVA ; TITTANEGRO, THAIS HELENA ; HELENA BATISTA, FERNANDA APARECIDA ; DE CARVALHO PEREIRA, JOSÉ GERALDO ; DE OLIVEIRA, PAULO SÉRGIO LOPES ; BAJGELMAN, MARCIO CHAIM ; LE MAIRE, ALBANE ; FIGUEIRA, ANA CAROLINA MIGLIORINI. Screening for PPAR Non-Agonist Ligands Followed by Characterization of a Hit, AM-879, with Additional No-Adipogenic and cdk5-Mediated Phosphorylation Inhibition Properties. Frontiers in Endocrinology. v. 9, p. 1, 2018. Qualis: A1
  8. GARCIA-ROSA, SHEILA TRIVELLA, DANIELA BB MARQUES, VANESSA D SERAFIM, RODOLFO B PEREIRA, JOSÉ GC LORENZI, JULIO CC MOLFETTA, GREICE A CHRISTO, PAULO P OLIVAL, GUILHERME S MARCHITTO, VANIA BT BRUM, DORALINA G SABEDOT, THAIS S NOUSHMEHR, HOUTAN FARIAS, ALESSANDRO S SANTOS, LEONILDA MB NOGUEIRA-MACHADO, JOSÉ A SOUZA, JORGE ES ROMANO, CAMILA M CONDE, RODRIGO M SANTOS, ANTONIO C GUERREIRO, CARLOS T SCHREUDER, WILLEM H GLEBER-NETTO, FREDERICO O AMORIM, MARIA VALIERIS, RENAN , et al.SILVA, ISRAEL TOJAL DA SILVA, WILSON A NUNES, DIANA N OLIVEIRA, PAULO SL VALENTE, VALERIA ARRUDA, MARIA AUGUSTA HILL, STEPHEN J BARREIRA, AMILTON A DIAS-NETO, EMMANUEL ; A non-functional galanin receptor-2 in a multiple sclerosis patient. PHARMACOGENOMICS JOURNAL. . v. X, p. X, 2018. Qualis: Não identificado ()
  9. SOPRANO, ADRIANA SANTOS ; GIUSEPPE, PRISCILA OLIVEIRA DE ; SHIMO, HUGO MASSAYOSHI ; LIMA, TATIANI BRENELLI ; BATISTA, FERNANDA APARECIDA HELENO ; RIGHETTO, GERMANNA LIMA ; PEREIRA, José Geraldo de Carvalho ; GRANATO, DANIELA CAMPOS ; NASCIMENTO, ANDREY FABRICIO ZIEM ; GOZZO, FABIO CESAR ; DE OLIVEIRA, PAULO SÉRGIO LOPES ; FIGUEIRA, ANA CAROLINA MIGLIORINI ; SMETANA, JULIANA HELENA COSTA ; PAES LEME, ADRIANA FRANCO ; MURAKAMI, MARIO TYAGO ; BENEDETTI, CELSO EDUARDO. Crystal Structure and Regulation of the Citrus Pol III Repressor MAF1 by Auxin and Phosphorylation. STRUCTURE. v. 25, p. 1360-1370.e4, 2017. Qualis: A1
  10. DE MORAES, FÁBIO R. ; NESHICH, IZABELLA A. P. ; MAZONI, IVAN ; YANO, INÁCIO H. ; PEREIRA, JOSÉ G. C. ; SALIM, JOSÉ A. ; JARDINE, JOSÉ G. ; Neshich, Goran. Improving Predictions of Protein-Protein Interfaces by Combining Amino Acid-Specific Classifiers Based on Structural and Physicochemical Descriptors with Their Weighted Neighbor Averages. Plos One. v. 9, p. e87107, 2014. Qualis: A1
  11. Paes Leme, Adriana F. ; Escalante, Teresa ; Pereira, Jose G.C. ; Oliveira, Ana K. ; Sanchez, Eladio F. ; Gutiérrez, José M. ; Serrano, Solange M.T. ; Fox, Jay W.. High resolution analysis of snake venom metalloproteinase (SVMP) peptide bond cleavage specificity using proteome based peptide libraries and mass spectrometry. Journal of Proteomics. v. 74, p. 401-410, 2011. Qualis: A1
  12. Viviani, Vadim R. ; Scorsato, Valeria ; Prado, Rogilene A. ; PEREIRA, José Geraldo de Carvalho ; Niwa, Kazuki ; Ohmiya, Yoshihiro ; Barbosa, João A. R. G.. The origin of luciferase activity in Zophobas mealworm AMP/CoA-ligase (protoluciferase): luciferin stereoselectivity as a switch for the oxygenase activity. Photochemical & Photobiological Sciences (Print). v. 9, p. 1111-1119, 2010. Qualis: A3
  
  
• Livros publicados/organizados ou edições (0)
  
  
  
• Capítulos de livros publicados (0)
  
  
  
• Textos em jornais de notícias/revistas (0)
  
  
  
• Trabalhos completos publicados em anais de congressos (0)
  
  
  
• Resumos expandidos publicados em anais de congressos (0)
  
  
  
• Resumos publicados em anais de congressos (0)
  
  
  
• Artigos aceitos para publicação (0)
  
  
  
• Apresentações de trabalho (3)
  
  1. ALBORGHETTI, M. R. ; HORTEGAL, R. ; Pereira, Jose G. C. ; GRIZANTE, M. ; CANCELLIER, R. ; ALVES, L. F. G. ; FREITAS, R. V. ; CARNIELLI, C. M. ; SFORCA, M. ; MORIYA, H. T. ; LEME, A. P. ; FERES, F. ; FRANCHINI, K.. Machine Learning-Driven Serum Metabolomics: Insights Into the Transition to Early-Stage Heart Failure With Preserved Ejection Fraction. 2022. Apresentação de Trabalho/Congresso
  2. Pereira, Jose G. C.; Paes Leme, Adriana F. ; Neshich, Goran. Comparative Structural analysis of Interaction Between Three Snake Venom Metalloproteinases and Peptide Substrates. 2011. Apresentação de Trabalho/Outra
  3. Pereira, Jose G. C.; CAPPARELLI, F. E. ; GOULART FILHO, L. R.. Mapping Epitopes in Protein Sequences using Mimotopes. 2008. Apresentação de Trabalho/Congresso
  
  
• Demais tipos de produção bibliográfica (3)
  
  1. PEREIRA, José Geraldo de Carvalho; BARBOSA, J. A. R. G.. Modelagem por homologia das proteínas Nek humanas. 2007. Relatório do 16 Programa Bolsas de Verão - Laboratório Nacional de Luz Síncrotron
  2. PEREIRA, José Geraldo de Carvalho. Introdução à bioinformática estrutural. 2013. Curso de curta duração ministrado/Outra
  3. PEREIRA, José Geraldo de Carvalho. Bioinformática. 2006. Curso de curta duração ministrado/Outra
  
  

Produção técnica

• Programas de computador com registro (0)
  
  
  
• Programas de computador sem registro (0)
  
  
  
• Produtos tecnológicos (0)
  
  
  
• Processos ou técnicas (0)
  
  
  
• Trabalhos técnicos (0)
  
  
  
• Demais tipos de produção técnica (0)
  
  
  

Produção artística

• Total de produção artística (0)
  
  
  

Orientações em andamento

• Supervisão de pós-doutorado (0)
  
  
  
• Tese de doutorado (0)
  
  
  
• Dissertação de mestrado (0)
  
  
  
• Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
  
  
  
• Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
  
  
  
• Iniciação científica (0)
  
  
  
• Orientações de outra natureza (1)
  
  1. Tarlison Sander Lima Brito. Deep Learning aplicado a anotação da localização celular de proteínas marcadas por imunofluorescência. Orientação de outra natureza. Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, . Início: 2020.
     Orientador: José Geraldo de Carvalho Pereira.
  
  

Supervisões e orientações concluídas

• Supervisão de pós-doutorado (0)
  
  
  
• Tese de doutorado (0)
  
  
  
• Dissertação de mestrado (0)
  
  
  
• Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
  
  
  
• Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
  
  
  
• Iniciação científica (0)
  
  
  
• Orientações de outra natureza (0)
  
  
  

Projetos de pesquisa

• Total de projetos de pesquisa (0)
  
  
  

Prêmios e títulos

• Total de prêmios e títulos (1)
  
  1. Certificação Microsoft Technology Associate (MTA 98-361) - Software Development Fundamentals, Microsoft.. 2012.
     Membro: José Geraldo de Carvalho Pereira.
  
  

Participação em eventos