Programa de Pós-Graduação Interunidades em Bioinformãtica

Matheus Carvalho Bürger

Possui graduação em Informática Biomédica pela Universidade de São Paulo (2013) e mestrado em Bioinformática na mesma instituição (2017). Realiza estudos em bioinformática desde 2009, com foco em genômica e transcriptômica, mais especificamente a análise de expressão gênica e a aplicação de metodologias moleculares para investigar doenças complexas, incluindo câncer e condições inflamatórias. Além disso, desenvolve trabalhos na área de diagnóstico utilizando métodos de sequenciamento.Teve breve experiência como docente. (Texto informado pelo autor)

http://lattes.cnpq.br/0361905518940320 (01/11/2024)

Rótulo/Grupo:

Bolsa CNPq:

Período de análise:

Endereço:

Grande área: Ciências Biológicas

Área: Genética

Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Artigos completos publicados em periódicos (9)
1. Biselli, Joice Matos ; ZAMPIERI, Bruna Lancia ; BISELLI-CHICOTE, PATRÍCIA MATOS ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA ; BÜRGER, M. C. ; DA SILVA JR, WILSON ARAÚJO ; Goloni-Bertollo, Eny Maria ; PAVARINO, E.C.. Differential microRNA expression profile in blood of children with Down syndrome suggests a role in immunological dysfunction. Human Cell. v. 1, p. 1-10, 2022. Qualis: Não identificado (HUMAN CELL)
2. FONSECA, ALINE SIMONETI ; RAMÃO, ANELISA ; BÜRGER, M. C. ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA ; ZANETTE, DALILA LUCÍOLA ; De Molfetta, Greice Andreotti ; DE ARAÚJO, LUIZA FERREIRA ; DE BARROS E LIMA BUENO, RAFAELA ; AGUIAR, GRAZIELA MOURA ; PLAÇA, JESSICA RODRIGUES ; ALVES, CLEIDSON DE PÁDUA ; DOS SANTOS, ANEMARI RAMOS DINARTE ; VIDAL, DANIEL ONOFRE ; SILVA, GYL EANES BARROS ; PANEPUCCI, RODRIGO ALEXANDRE ; PERIA, FERNANDA MARIS ; FERES, OMAR ; DA ROCHA, JOSÉ JOAQUIM RIBEIRO ; Silva Jr, WA ; SILVA, WILSON ARAÚJO ; et.al. ETV4 plays a role on the primary events during the adenoma-adenocarcinoma progression in colorectal cancer. BMC CANCER. v. 21, p. 207, 2021. Qualis: A2
3. RUSSO, PEDRO S. T. ; FERREIRA, GUSTAVO R. ; CARDOZO, LUCAS E. ; BÜRGER, M. C. ; ARIAS-CARRASCO, RAUL ; MARUYAMA, SANDRA R. ; HIRATA, T.D.C. ; LIMA, DIÓGENES S. ; PASSOS, FERNANDO M. ; FUKUTANI, KIYOSHI F. ; LEVER, MELISSA ; SILVA, JOÃO S. ; MARACAJA-COUTINHO, VINICIUS ; NAKAYA, HELDER I.. CEMiTool: a Bioconductor package for performing comprehensive modular co-expression analyses. BMC BIOINFORMATICS. v. 19, p. 56, 2018. Qualis: A1
4. REESE, TIFFANY A. ; BI, KEVIN ; KAMBAL, AMAL ; FILALI-MOUHIM, ALI ; BEURA, LALIT K. ; BÜRGER, MATHEUS C. ; PULENDRAN, BALI ; SEKALY, RAFICK-PIERRE ; JAMESON, STEPHEN C. ; MASOPUST, DAVID ; HAINING, W. NICHOLAS ; VIRGIN, HERBERT W.. Sequential Infection with Common Pathogens Promotes Human-like Immune Gene Expression and Altered Vaccine Response. Cell Host & Microbe. v. 20, p. 1, 2016. Qualis: A1
5. SILVA, CLÁUDIA REGINA SANTOS ; BISELLI-PÉRICO, JOICE MATOS ; ZAMPIERI, BRUNA LANCIA ; SILVA, WILSON ARAUJO ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA ; BÜRGER, M. C. ; Goloni-Bertollo, Eny Maria ; PAVARINO, E.C.. Differential Expression of Inflammation-Related Genes in Children with Down Syndrome. Mediators of Inflammation. v. 2016, p. 1-8, 2016. Qualis: A3
6. IM, SE JIN ; HASHIMOTO, MASAO ; GERNER, MICHAEL Y. ; LEE, JUNGHWA ; KISSICK, HAYDN T. ; BURGER, MATHEUS C. ; SHAN, QIANG ; HALE, J. SCOTT ; LEE, JUDONG ; NASTI, TAHSEEN H. ; SHARPE, ARLENE H. ; FREEMAN, GORDON J. ; GERMAIN, RONALD N. ; NAKAYA, HELDER I. ; XUE, HAI-HUI ; AHMED, RAFI. Defining CD8+ T cells that provide the proliferative burst after PD-1 therapy. Nature. v. 537, p. 417-421, 2016. Qualis: A1
7. KASTURI, SUDHIR PAI ; KOZLOWSKI, PAMELA A. ; NAKAYA, HELDER I ; BURGER, MATHEUS C. ; RUSSO, PEDRO ; PHAM, MATHEW ; KOVALENKOV, YEVGENIY ; SILVEIRA, EDUARDO L. V. ; HAVENAR-DAUGHTON, COLIN ; BURTON, SAMANTHA L. ; KILGORE, KATIE M. ; JOHNSON, MATHEW J. ; NABI, RAFIQ ; LEGERE, TRACI ; SHER, ZARPHEEN JINNAH ; CHEN, XUEMIN ; AMARA, RAMA R. ; HUNTER, ERIC ; BOSINGER, STEVEN E. ; SPEARMAN, PAUL ; et.al. Adjuvanting an SIV vaccine with TLR ligands encapsulated in nanoparticles induces persistent antibody responses and enhanced protection in TRIM5α restrictive macaques. Journal of Virology (Print). v. 1, p. JVI.01844-16-1, 2016. Qualis: A1
8. ZAMPIERI, BRUNA LANCIA ; BISELLI-PÉRICO, JOICE MATOS ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA ; BÜRGER, MATHEUS CARVALHO ; SILVA JÚNIOR, WILSON ARAÚJO ; GOLONI-BERTOLLO, ENY MARIA ; PAVARINO, ÉRIKA CRISTINA. Altered Expression of Immune-Related Genes in Children with Down Syndrome. Plos One. v. 9, p. e107218, 2014. Qualis: A1
9. ALVES, CLEIDSON PÁDUA ; FONSECA, ALINE SIMONETI ; MUYS, BRUNA RODRIGUES ; DE BARROS E LIMA BUENO, RAFAELA ; BÜRGER, MATHEUS CARVALHO ; DE SOUZA, JORGE E. S. ; VALENTE, VALERIA ; ZAGO, MARCO ANTONIO ; SILVA, WILSON ARAÚJO. The lincRNA Hotair is required for epithelial-to-mesenchymal transition and stemness maintenance of cancer cells lines. Stem Cells (Dayton, Ohio). v. n/a, p. n/a-n/a, 2013. Qualis: Não identificado (STEM CELLS)
Livros publicados/organizados ou edições (0)
Capítulos de livros publicados (0)
Textos em jornais de notícias/revistas (0)
Trabalhos completos publicados em anais de congressos (0)
Resumos expandidos publicados em anais de congressos (0)
Resumos publicados em anais de congressos (7)
1. ZAMPIERI, BRUNA LANCIA ; BISELLI-PERICO, J.M. ; BÜRGER, M. C. ; SOUZA, J.E.S. ; SILVA JUNIOR, W.A. ; FERREIRA, E.N. ; CARRARO, D.M. ; GOLONI-BERTOLLO, E.M. ; PAVARINO, E.C.. Analysis of microRNA and gene expression profile in Down syndrome children. Em: XLIII Congreso Argentino de Genética,, 2014, San Carlos de Bariloche. BAG. Journal of basic and applied genetics, 2014.
2. TORRES, H. A. M. ; BÜRGER, M. C. ; ANTONIO, D. S. M. ; COETZEE, S. ; URUSHIBATA, E. T. ; SABEDOT, T. S. ; SOUZA, J. E. S. ; PINHEIRO, D. G. ; DELFINI, M. G. ; MIORANZA, A. ; PAULA, M. G. ; Silva Jr, WA ; NOUSHMEHR, H.. Biomics+: A bioconductor package for integrating plublicly available genomic data sets. Em: 59º Congresso Brasileiro de Genética, 2013, Águas de Lindóia. Resumos do 59o Congresso Brasileiro de Genética, p. 41-41, 2013.
3. FONSECA, A. S. ; BÜRGER, M. C. ; SOUZA, J. E. S. ; Silva, KA ; ALVES, C. P. ; ZANETTE, D. L. ; Peria, MF ; Feres, O ; Rocha, JJR ; Ramos, AD ; ARAUJO, A. G. ; Panepucci, RA ; Silva Jr, WA. COMPARATIVE GENOMIC ANALYSIS OF COLORECTAL CANCER. Em: 59º Congresso Brasileiro de Genética, 2013, Águas de Lindóia. Resumos do 59o Congresso Brasileiro de Genética, p. 226-226, 2013.
4. BISELLI, J. M. ; ZAMPIERI, B. L. ; SILVA, C. R. S ; BÜRGER, M. C. ; SOUZA, J. E. S. ; Silva Jr, WA ; FERREIRA, E. N. ; CARRARO, D. M. ; GOLONI-BERTOLLO, E. M. ; PAVARINO, E. C.. Padrão de expressão de microRNAs em células sanguíneas de crianças com síndrome de Down. Em: XV Congresso Latinoamericano de Genética, 2012, Rosario - Argentina. Journal of Basic and Applied Genetics.. Argentina: Argentina: Sociedad Argentina de genética, v. XXII, p. 148-149, 2012.
5. BÜRGER, M. C.; PINHEIRO, D. G. ; DE BARROS E LIMA BUENO, RAFAELA ; ARAUJO, A. G. ; FIGUEIREDO, D. L. A. ; MAMEDE, R. C. M. ; Silva Jr, WA. Análise da Expressão Gênica e de MicroRNAs em Larga Escala do Carcinoma Espinocelular de Laringe. Em: X Semana da Informática Biomédica, 2012, Ribeirão Preto. II Workshop de Informática Biomédica, v. 2, p. 95-98, 2012.
6. DE BARROS E LIMA BUENO, RAFAELA ; PINHEIRO, D. G. ; BÜRGER, M. C. ; ARAUJO, A. G. ; FIGUEIREDO, D. L. A. ; Silva Jr, WA. Gene expression signature during development of larynx squamous cell carcinoma. Em: 58º Congresso Brasileiro de Genética, 2012, Foz de Iguaçu. Resumos do 58º Congresso Brasileiro de Genética, p. 137-137, 2012.
7. BÜRGER, M. C.; PINHEIRO, D. G. ; KANETO, C. M. ; SILVA JUNIOR, W. A.. Análise Computacional de Microarranjos no Estudo da Diferenciação de Células Tronco Mesenquimais em Pacientes com Osteogênese Imperfeita. Em: I Workshop de Informatica Biomédica, 2011, Ribeirao Preto. Anais do Workshop de Informática Biomédica, v. 1, 2011.
Artigos aceitos para publicação (0)
Apresentações de trabalho (4)
1. BÜRGER, M. C.; Cardozo, Lucas ; HIRATA, T. D. C. ; NAKAYA, HELDER I.. Long Noncoding RNAs in Patients with Dengue: Insights into Gene Regulation. 2016. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
2. RUSSO, P. S. T. ; Ferreira, G. R. ; Medina, C. A. P. ; BÜRGER, M. C. ; Cardozo, Lucas ; Fonseca, L. S. ; HIRATA, T. D. C. ; Hermosilla, G. S. ; Coutinho, V. M. ; NAKAYA, HELDER I.. CEMiTool: Co-expression Modules Identification Tool. 2016. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
3. Passos, F. M. ; RUSSO, P. S. T. ; BÜRGER, M. C. ; HIRATA, T. D. C. ; NAKAYA, HELDER I.. Using Systems Biology to understand Immunosenescence. 2016. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
4. BÜRGER, M. C.; PINHEIRO, D. G. ; KANETO, C. M. ; Silva Jr, WA. Análise Computacional de Microarranjos no Estudo da Diferenciação de Células Tronco Mesenquimais em Pacientes com Osteogênese Imperfeita. 2011. Apresentação de Trabalho/Outra
Demais tipos de produção bibliográfica (0)

Produção técnica

Programas de computador com registro (0)
Programas de computador sem registro (0)
Produtos tecnológicos (0)
Processos ou técnicas (0)
Trabalhos técnicos (0)
Demais tipos de produção técnica (0)

Produção artística

Total de produção artística (0)

Orientações em andamento

Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (0)
Dissertação de mestrado (0)
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (0)

Supervisões e orientações concluídas

Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (0)
Dissertação de mestrado (0)
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (0)

Projetos de pesquisa

Total de projetos de pesquisa (0)

Prêmios e títulos

Total de prêmios e títulos (0)

Participação em eventos

Total de participação em eventos (13)
1. Curso de Verão em Bioinformática.Curso Prático de Introdução ao UNIX Shell. 2016. (Oficina).
2. X-Meeting 2016 - 12th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology (AB3C). Long Noncoding RNAs in Patients with Dengue: Insights into Gene Regulation. 2016. (Congresso).
3. I International Stymposium on Pathophysiology and Toxicology. 2015. (Congresso).
4. VI Simpósio de Pós-graduação em Análises Clínicas - SIMPAC. 2015. (Simpósio).
5. X-Meeting 2015 - 11th International Conference of th AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics. 2015. (Congresso).
6. IV Workshop do Programa de Pós-Graduação em Genética da FMRP-USP. 2013. (Outra).
7. A Bioinformática no Século 21. 2012. (Outra).
8. Cancer Genome Workshop. 2012. (Oficina).
9. Workshop de Informatica Biomédica.Análise da Expressão Gênica e de MicroRNAs em Larga Escala do Carcinoma Espinocelular de Laringe. 2012. (Outra).
10. Ferramentas de Bioinformática Aplicadas à Análise de Sequências Genômicas, Metagenômicas e Transcriptomicas - CBAB.Alinhamento de Seqüências de cDNA em Genoma Referência (Monitor). 2011. (Outra).
11. Ferramentas de Bioinformática Aplicadas à Análise de Sequências Genômicas, Metagenômicas e Transcriptomicas - CBAB.Montagem de Transcriptomas (Monitoria). 2011. (Outra).
12. Workshop de Informatica Biomédica (WIBm-11).Análise Computacional de Microarranjos no Estudo da Diferenciação de Células Tronco Mesenquimais em Pacientes com Osteogênese Imperfeita. 2011. (Outra).
13. VI Curso de Verão em Bioinformática. 2010. (Outra).

Organização de eventos

Total de organização de eventos (5)
1. AMGARTEN, DEYVID ; BÜRGER, M. C. ; CICONELLE, A. C. M. ; DURHAM, A. M. ; Gianluca Major M. S. ; LIMA, F. P. ; MOURA, L. M. S ; REGO, F. O. R. ; RUSSO, P. S. T. ; SETUBAL, J. C ; VILLAR, C. M.. VIII Curso de Verão em Bioinformática. 2016. Outro
2. BÜRGER, M. C.; ANTONIO, D. S. M. ; PAULA, M. G. ; PINHEIRO, D. G. ; TARLA, M. V. C. ; COETZEE, S. ; SILVA JUNIOR, W. A. ; NOUSHMEHR, H.. IX Curso de Verão em Bioinformática. 2013. Outro
3. BÜRGER, M. C.; SOUZA, J. E. S. ; NOUSHMEHR, H. ; PINHEIRO, D. G. ; PAULA, M. G. ; COETZEE, S. ; Silva Jr, WA ; SALGADO, L. R.. Escola de estudos avançados em Genômica - "Decodificando o DNA não-codificador". 2013. Outro
4. SOUSA, R. G. M. A.; D. G. Pinheiro ; PAULA, M. G ; BÜRGER, M. C. ; TARLA, M. ; MESSAGE, A. ; SILVA JUNIOR, W. A.. VIII Curso de Verão em Bioinformática. 2012. Outro
5. BÜRGER, M. C.; PINHEIRO, D. G. ; Tojal, I. ; PAULA, M. G. ; de Sousa, R. G. M. A. ; CARDENAS, R.G.C.C.L. ; Silva Jr, WA. VII Curso de Verão em Bioinformática. 2011. Outro

Lista de colaborações

Colaborações endôgenas (0)

(*) Relatório criado com produções desde 2000 até 2025
Data de processamento: 12/02/2025 19:33:35