Programa de Pós-Graduação Interunidades em Bioinformãtica
Luiz Thibério Lira Diniz Rangel
Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade Federal da Paraíba (2009) e mestrado em Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro pela Universidade de São Paulo (2012), e doutorado em Bioinformática também pela Universidade de São Paulo. Tem experiência na área de Genômica e Filogenômica, com ênfase em Bioinformática (Texto informado pelo autor)
WANG, NIAN ; PIERSON, ELIZABETH A. ; SETUBAL, JOÃO CARLOS ; XU, JIN ; LEVY, JULIEN G. ; ZHANG, YUNZENG ; LI, JINYUN ; Rangel, Luiz Thiberio ; MARTINS, JOAQUIM. The Candidatus Liberibacter-Host Interface: Insights into Pathogenesis Mechanisms and Disease Control. Annual Review of Phytopathology. v. 55, p. 451-482, 2017. Qualis: A1
Rangel, L. T.; NOVAES, J. ; DURHAM, A. M. ; MADEIRA, A. M. B. N. ; GRUBER, A.. The Eimeria Transcript DB: an integrated resource for annotated transcripts of protozoan parasites of the genus Eimeria. DATABASE-OXFORD. v. 2013, p. bat006-bat006, 2013. Qualis: Não identificado (DATABASE-OXFORD)
WULFF, NELSON ARNO ; ZHANG, SHUJIAN ; SETUBAL, JOÃO C ; ALMEIDA, NALVO F ; MARTINS, ELAINE C ; HARAKAVA, RICARDO ; KUMAR, DIBYENDU ; Rangel, Luiz T ; FOISSAC, XAVIER ; BOVE, JOSEPH ; GABRIEL, DEAN W. The complete genome sequence of Candidatus Liberibacter americanus, associated with citrus Huanglongbing.. Molecular Plant-Microbe Interactions. v. 27, p. 131107142521009, 2013. Qualis: A1
Novaes, Jeniffer ; RANGEL, L. T. L. D. ; Ferro, Milene ; Abe, Ricardo Y. ; Manha, Alessandra P.S. ; de Mello, Joana C.M. ; Varuzza, Leonardo ; Durham, Alan M. ; Madeira, Alda Maria B.N. ; Gruber, Arthur. A comparative transcriptome analysis reveals expression profiles conserved across three Eimeria spp. of domestic fowl and associated with multiple developmental stages. International Journal for Parasitology. v. 42, p. 39-48, 2012. Qualis: A1
Livros publicados/organizados ou edições (0)
Capítulos de livros publicados (0)
Textos em jornais de notícias/revistas (0)
Trabalhos completos publicados em anais de congressos (0)
Resumos expandidos publicados em anais de congressos (0)
Resumos publicados em anais de congressos (2)
SOUZA, H. D. N. ; DURBANO, J. P. M. ; ROCHA, P. K. L. ; Itácio Queiroz de Mello Padilha ; ALMEIDA, R. S. ; BEZERRA, A. V. ; RANGEL, L. T. L. D. ; ARAÚJO, D.A.M.. CURSO DE CURTA DURAÇÃO EM BIOINFORMÁTICA COMO INSTRUMENTO DE INSERÇÃO E DE DIFUSÃO BIOTECNOLÓGICA. Em: X ENEX, 2008, João Pessoa. Caderno de Resumos do X Encontro de Extensão da UFPB, 2008.
BEZERRA, A. V. ; MARTINS, A.B. ; SOUZA, H. D. N. ; RANGEL, L. T. L. D. ; ROCHA, P. K. L. ; ARAÚJO, D.A.M.. AVALIAÇÃO DO POTENCIAL LEISHMANIOSTÁTICO DO COMPOSTO NATURAL ISOLADO QUERCETINA SOBRE LEISHMANIA CHAGASI. Em: XX Congresso Brasileiro de Parasitologia, 2007, RECIFE. Revista de Patologia Tropical. Goiânia: Editora da Universidade Federal de Goiás, v. 36, p. 286-287, 2007.
Artigos aceitos para publicação (0)
Apresentações de trabalho (10)
Rangel, Luiz T; Setubal, J. C.. Horizontal Gene Transfer and Nitrogen Fixation Genes in Gamma- and Beta-Proteobacteria. 2013. Apresentação de Trabalho/Congresso
RANGEL, L. T. L. D.; Setubal, J. C. ; WU, F. ; LIN, H. ; MOHAMED, N.. Analysis of Proteobacterial genomes using Phylogenomic Networks. 2012. Apresentação de Trabalho/Simpósio
Amgarten, Deyvid ; RANGEL, L. T. L. D. ; DURHAM, A. M. ; Gruber, A. Desenvolvimento de um Componente de anotação automática de vias metabólicas KEGGpara a plataforma EGene. 2010. Apresentação de Trabalho/Simpósio
RANGEL, L. T. L. D.; DURHAM, A. M. ; Gruber, A. Enriched annotation and functional assignment of proteins of Eimeria spp.: guilty by orthology. 2010. Apresentação de Trabalho/Congresso
FERRO, M. ; Yamamoto, R ; RANGEL, L. T. L. D. ; DURHAM, A. M. ; Gruber, A. EGENE 2: A GENERIC AND MODULAR PLATFORM FOR AUTOMATED SEQUENCE PROCESSING AND ANNOTATION. 2009. Apresentação de Trabalho/Congresso
RANGEL, L. T. L. D.; ROCHA, P. K. L. ; PASCHOAL, A. R. ; VITORELLO, C. B. M. ; ARAÚJO, D.A.M. ; REGO, T. G.. GIAnT: Genomic Island Analyzer Tool. 2008. Apresentação de Trabalho/Congresso
ROCHA, P. K. L. ; RANGEL, L. T. L. D. ; PASCHOAL, A. R. ; VITORELLO, C. B. M. ; ARAÚJO, D.A.M. ; REGO, T. G.. Quantitative analysis of genomic islands in Bacteria. 2008. Apresentação de Trabalho/Congresso
ROCHA, P. K. L. ; RANGEL, L. T. L. D. ; VITORELLO, C. B. M. ; ARAÚJO, D.A.M. ; REGO, T. G.. Identificação e caracterização de ilhas genômicas em bactérias do gênero Mycoplasma. 2008. Apresentação de Trabalho/Congresso
SOUZA, H. D. N. ; DURBANO, J. P. M. ; ROCHA, P. K. L. ; Itácio Queiroz de Mello Padilha ; ALMEIDA, R. S. ; BEZERRA, A. V. ; RANGEL, L. T. L. D. ; ARAÚJO, D.A.M.. CURSO DE CURTA DURAÇÃO EM BIOINFORMÁTICA COMO INSTRUMENTO DE INSERÇÃO E DE DIFUSÃO BIOTECNOLÓGICA. 2008. Apresentação de Trabalho/Congresso
BEZERRA, A. V. ; MARTINS, A.B. ; SOUZA, H. D. N. ; RANGEL, L. T. L. D. ; ROCHA, P. K. L. ; ARAÚJO, D.A.M.. AVALIAÇÃO DO POTENCIAL LEISHMANIOSTÁTICO DO COMPOSTO NATURAL ISOLADO QUERCETINA SOBRE LEISHMANIA CHAGASI. 2007. Apresentação de Trabalho/Congresso
Demais tipos de produção bibliográfica (0)
Produção técnica
Programas de computador com registro (0)
Programas de computador sem registro (1)
RANGEL, L. T. L. D.; ROCHA, P. K. L. ; PASCHOAL, A. R. ; ARAÚJO, D.A.M. ; VITORELLO, C. B. M. ; REGO, T. G.. GIAnT: Genomic Island Analyzer Tool. 2009.
Produtos tecnológicos (0)
Processos ou técnicas (0)
Trabalhos técnicos (0)
Demais tipos de produção técnica (1)
RANGEL, L. T. L. D. Curso de verão em Bioinformática. 2011. Curso de curta duração ministrado/Outra
Produção artística
Total de produção artística (0)
Orientações em andamento
Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (0)
Dissertação de mestrado (0)
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (0)
Supervisões e orientações concluídas
Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (0)
Dissertação de mestrado (0)
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (0)
Projetos de pesquisa
Total de projetos de pesquisa (3)
2007-2009. Desenvolvimento de software para detecção de ilhas gênomicas Descrição: A composição dos genomas bacterianos podem ser alterados rapidamente e dramaticamente através de uma grande variedade de processos, incluindo transferência genética horizontal. Este projeto tem como objetivo desenvolver um programa para detecção das regiões adquiridos com este mecanismo, as ilhas genômicas, em bactérias a partir da análise de elementos característicos, como transposases, integrases, condon usage tRNAs, etc., mudanças abruptas do conteúdo GC, utilizando para este último, os métodos com e sem janela, este baseado na representação de curva Z de sequências de DNA. A partir dos dados gerados e analisados serão realizados estudos para a classificação das ilhas genômicas de acordo com suas funções, que refletem no estilo de vida, patogenicidade, adaptação a nichos ecológicos e história evolutiva das bactérias.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Luiz Thibério Lira Diniz Rangel - Integrante / Demétrius Antônio Machado de Araújo - Integrante / Patrícia Keytth Lins Rocha - Integrante / Claudia Barros Monteiro Vitorello - Integrante / Thais Gaudencio do Rego - Coordenador / Alexandre Rossi Paschoal - Integrante. Membro: Luiz Thibério Lira Diniz Rangel.
2007-Atual. Estudo da transferência horizontal entre organismos do gênero Mycoplasma Descrição: As ilhas genômicas compreendem regiões genômicas adquiridas via transferência horizontal gênica. Este projeto tem como objetivo determinar as ilhas genômicas presentes nas treze espécies de bactérias seqüenciadas do gênero Mycoplasma baseado em dados gerados por gráficos sobre: conteúdo GC, uso de códon, uso de aminoácido e seqüências lineares de elementos típicos de transferência horizontal. Os dados serão analisados quantitativamente e qualitativamente, possibilitando a inferência sobre a origem das regiões e a vantagem evolutiva adquirida pelos indivíduos.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . Integrantes: Luiz Thibério Lira Diniz Rangel - Integrante / Demétrius Antônio Machado de Araújo - Integrante / Patrícia Keytth Lins Rocha - Integrante / Claudia Barros Monteiro Vitorello - Integrante / Thais Gaudencio do Rego - Coordenador / Alexandre Rossi Paschoal - Integrante. Membro: Luiz Thibério Lira Diniz Rangel.
2006-2007. Análise Proteômica em Leishmania chagasi: Avaliação de Compostos Naturais Isolados com Perspectiva Fitofarmacológica Descrição: A leishmaniose visceral, provocada pelo microorganismo Leishmania chagasi, atinge quase duas mil pessoas por ano no Brasil, sendo cerca de 90% dos casos no Nordeste. O alto custo dos tratamentos, as dificuldades de administração das drogas e a toxicidade medicamentosa são fatores limitantes na terapêutica da leishmaniose. A constatação de falta de resposta aos medicamentos mais usuais torna urgente a necessidade de drogas alternativas que reponham e/ou suplementem as de uso atual. Dessa forma, o uso de plantas medicinais e a identificação de seus fitoconstituintes podem fornecer novos modelos terapêuticos no tratamento de leishmanioses. A proteômica permite identificar alvos moleculares para desenvolvimento de novas opções terapêuticas, por meio da busca por proteínas essenciais a sobrevivência do parasita, bem como pode fornecer dados para futuras pesquisas que viabilizem seu uso na terapêutica clínica. O presente projeto pretende utilizar ferramentas de proteômica para a caracterização de L. chagasi quando exposto ao estresse provocado pelos compostos naturais isolados ajimalicina, cumarina, quercetina e ácido ursínico.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (8) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Luiz Thibério Lira Diniz Rangel - Integrante / Itácio Queiroz de Mello Padilha - Integrante / Erica Renata dos Santos Almeita - Integrante / Amely Branquinho Martins - Integrante / Vinícius Ramos Henriques Maracajá Coutinho - Integrante / Demétrius Antônio Machado de Araújo - Coordenador / Patrícia Keytth Lins Rocha - Integrante / Héllio Danny Nóbrega de Souza - Integrante / João Paulo Di Monaco Durbano - Integrante / Aretha Vieira Bezerra - Integrante. Membro: Luiz Thibério Lira Diniz Rangel.
Prêmios e títulos
Total de prêmios e títulos (0)
Participação em eventos
Total de participação em eventos (5)
X-Meeting. Enriched annotation and functional assignment of proteins of Eimeria spp.: guilty by orthology. 2010. (Congresso).
X-Meeting. EGENE 2: A GENERIC AND MODULAR PLATFORM FOR AUTOMATED SEQUENCE PROCESSING AND ANNOTATION. 2009. (Congresso).
54° Congresso Brasileiro de Genética. Identificação e caracterização de ilhas genômicas em bactérias do gênero Mycoplasma. 2008. (Congresso).
X ENEX.Curso de Curta Duração em Bioinformática como Instrumento de Inserção e de Difusão Biotecnológica. 2008. (Encontro).
X-Meeting. GIAnT: Genomic Island Analyzer Tool. 2008. (Congresso).
Organização de eventos
Total de organização de eventos (0)
Lista de colaborações
Colaborações endôgenas (0)
(*) Relatório criado com produções desde 2000 até 2025
Data de processamento: 12/02/2025 19:33:35