Programa de Pós-Graduação Interunidades em Bioinformãtica

Fernando Pacheco Nobre Rossi

Sou graduado em Ciências Biológicas pela Universidade Presbiteriana Mackenzie, obtive titulo de Doutor em Bioinformática na Universidade de São Paulo (USP - 2024) sob orientação da Dra. Aline Maria da Silva e coorientação do Dr. João Carlos Setubal, como Bolsista CNPq. Trabalhei por dois anos como Bioinformata no Hospital das Clinicas (HC - FMUSP) no projeto PROADI Mapa Genomas Brasil. Atualmente atuo como bolsista FAPESP TT5 no CEPID B3 sediado na Universidade de São Paulo. Minha área principal de pesquisa é bioinformática e genômica comparativa de bactérias e bacteriófagos. Possuo experiencia no desenvolvimento de pipelines automatizados para bioinformática utilizando as linguagens Bash, Python, R e linguagens de workflow NextFLow e SnakeMake. (Texto informado pelo autor)

http://lattes.cnpq.br/1238984671127304 (24/06/2024)

Rótulo/Grupo:

Bolsa CNPq:

Período de análise:

Endereço:

Grande área: Ciências Biológicas

Área: Biologia Geral

Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Artigos completos publicados em periódicos (5)
1. ROSSI, F. P. N.; PATANE, J. S. L. ; SOUZA, V. ; NEYRA, J. M. ; ROSA, R. S. ; KRIEGER, J. E. ; TEIXEIRA, S. K.. GARSA: An integrative pipeline for genome wide association studies and polygenic risk score inference in admixed human populations. https://doi.org/10.1101/2023.05.03.539305. v. 1, p. 1, 2023.Qualis: Não identificado (HTTPS://DOI.ORG/10.1101/2023.05.03.539305)
2. HARADA, LILIAM K ; SILVA, ERICA C ; ROSSI, FERNANDO PN ; CIEZA, BASILIO ; OLIVEIRA, THAIS J ; PEREIRA, CARLA ; TOMAZETTO, GEIZECLER ; SILVA, BIANCA B ; SQUINA, FABIO M ; VILA, MARTA MDC ; SETUBAL, JOÃO C ; HA, TAEKJIP ; DA SILVA, ALINE M ; BALCÃO, VICTOR M. Characterization and testing of newly isolated lytic bacteriophages for the biocontrol of. Future Microbiology. v. 17, p. 111-141, 2022. Qualis: A3
3. BALCÃO, VICTOR M ; BASU, AAKASH ; CIEZA, BASILIO ; ROSSI, FERNANDO N ; PEREIRA, CARLA ; VILA, MARTA MDC ; SETUBAL, JOÃO C ; HA, TAEKJIP ; DA SILVA, ALINE M. Pseudomonas -tailed lytic phages: genome mechanical analysis and putative correlation with virion morphogenesis yield. Future Microbiology. v. 17, p. 1009-1026, 2022. Qualis: A3
4. MARQUIONI, VINÍCIUS ; ROSSI, FERNANDO PACHECO NOBRE ; MENDONÇA, DEBORAH CEZAR ; MARTINS, LAYLA FARAGE ; BEHLAU, FRANKLIN ; SETUBAL, JOÃO CARLOS ; DA SILVA, ALINE MARIA ; NOVO-MANSUR, MARIA TERESA MARQUES. Isolation and characterization of vB_XciM_LucasX, a new jumbo phage that infects Xanthomonas citri and Xanthomonas fuscans. PLoS One. v. 17, p. e0266891, 2022. Qualis: A1
5. BALCÃO, VICTOR M. ; MORELI, FERNANDA C. ; SILVA, ERICA C. ; BELLINE, BIANCA G. ; MARTINS, LAYLA F. ; ROSSI, FERNANDO P. N. ; PEREIRA, CARLA ; VILA, MARTA M. D. C. ; DA SILVA, ALINE M.. Isolation and Molecular Characterization of a Novel Lytic Bacteriophage That Inactivates MDR Klebsiella pneumoniae Strains. PHARMACEUTICS. v. 14, p. 1421, 2022. Qualis: A1
Livros publicados/organizados ou edições (0)
Capítulos de livros publicados (1)
1. ROSSI, FERNANDO PACHECO NOBRE; Flores, Vinicius Sousa ; Uceda-Campos, Guillermo ; Amgarten, Deyvid Emanuel ; SETUBAL, JOÃO CARLOS ; DA SILVA, ALINE MARIA. Comparative Analyses of Bacteriophage Genomes. Methods in Molecular Biology. 2ed. Em: . : Springer US. 2024.p. 427-453.
Textos em jornais de notícias/revistas (0)
Trabalhos completos publicados em anais de congressos (0)
Resumos expandidos publicados em anais de congressos (0)
Resumos publicados em anais de congressos (1)
1. M. J. Azevedo ; MARTINS, LAYLA F. ; A. P. dos Santos-Jr ; ROSSI, FERNANDO PACHECO NOBRE ; Campos, G. ; Silva, A. M.. Isolation and genomic characterization of Klebsiella pneumoniae phages with potential for therapeutic application. Em: XXII Interunit Graduate Program in Bioinformatics Workshop - USP, 2023, São Paulo. XXII Interunit Graduate Program in Bioinformatics Workshop, 2023.
Artigos aceitos para publicação (0)
Apresentações de trabalho (6)
1. ROSSI, FERNANDO PACHECO NOBRE. Introdução à Bioinformática. 2024. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
2. ROSSI, FERNANDO PACHECO NOBRE. Introdução à Bioinformática. 2022. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
3. ROSSI, FERNANDO PACHECO NOBRE. Aplicações de Bioinformática. 2022. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
4. ROSSI, F. P. N.; Amgartem, D. ; Martins, L. ; Setubal, J. C. ; Silva, A. M.. Comparative genomics of Pseudomonas phages and study of determinants involved in specific adsorption phage-bacteria. 2018. Apresentação de Trabalho/Congresso
5. ROSSI, F. P. N. Comparative genomics of Pseudomonas phages and study of determinants involved in specific adsorption phage-bacteria. 2018. Apresentação de Trabalho/Simpósio
6. ROSSI, F. P. N.; Amgartem, D. ; Setubal, J. C. ; Silva, A. M.. Comparative Genomics of six Pseudomonas phages isolated from composting. 2017. Apresentação de Trabalho/Congresso
Demais tipos de produção bibliográfica (0)

Produção técnica

Programas de computador com registro (0)
Programas de computador sem registro (0)
Produtos tecnológicos (0)
Processos ou técnicas (0)
Trabalhos técnicos (0)
Demais tipos de produção técnica (0)

Produção artística

Total de produção artística (0)

Orientações em andamento

Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (0)
Dissertação de mestrado (0)
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (0)

Supervisões e orientações concluídas

Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (0)
Dissertação de mestrado (0)
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (0)

Projetos de pesquisa

Total de projetos de pesquisa (4)
1. 2019-2024. ANÁLISE COMPARATIVA E FUNCIONAL DE PRÓFAGOS IDENTIFICADOS EM PSEUDOMONAS AERUGINOSA.
  Descrição: Neste projeto temos como objetivos realizar a caracterização da diversidade genômica de P. aeruginosa e a avaliação da abundância e da diversidade de seus prófagos.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Fernando Pacheco Nobre Rossi - Integrante / João Carlos Setubal - Integrante / Aline Maria da Silva - Coordenador.
  Membro: Fernando Pacheco Nobre Rossi.
2. 2017-2019. Análise comparativa do genoma de bacteriófagos isolados da compostagem e estudo dos determinantes de sua interação específica com cepas de Pseudomonas aeruginos
  Descrição: Projeto relacionado a identificação das principais estruturas e suas variações, responsáveis pela interação especifica entre fagos e seus hospedeiros. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . Integrantes: Fernando Pacheco Nobre Rossi - Integrante / Deyvid Amgarten - Integrante / João Carlos Setubal - Integrante / Aline Maria da Silva - Coordenador / Layla Martins - Integrante. Número de produções C, T & A: 2
  Membro: Fernando Pacheco Nobre Rossi.
3. 2015-2016. Identificação de linhagens de bactérias através da análise da sequência do gene que codifica o RNA ribossomal 16S.
  Descrição: Projeto de conclusão de curso. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Fernando Pacheco Nobre Rossi - Integrante / José Luiz Caldas Wolff - Coordenador.
  Membro: Fernando Pacheco Nobre Rossi.
4. 2014-2015. Ralstonia Solanacearum: caracterização bioquimica e molecular
  Descrição: Trabalho de pesquisa de iniciação cientifica. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Fernando Pacheco Nobre Rossi - Integrante / José Luiz Caldas Wolff - Coordenador.
  Membro: Fernando Pacheco Nobre Rossi.

Prêmios e títulos

Total de prêmios e títulos (0)

Participação em eventos

Total de participação em eventos (3)

X Semana de Estatistica da UFMT. 2020. (Seminário).
Escola Gaucha de Bioinformatica. 2017. (Congresso).
CICLO DE PALESTRAS (RETROCESSOS SOCIOAMBIENTAIS E O LEVANTE VERDE DE OUTUBRO) - COLETIVO UBUNTU".RETROCESSOS SOCIOAMBIENTAIS E O LEVANTE VERDE DE OUTUBRO. 2013. (Seminário).

Organização de eventos

Total de organização de eventos (5)

ROSSI, FERNANDO PN. Curso de Verão em Bioinformática da USP. 2022. (Outro).. . 0.
ROSSI, FERNANDO PN. Curso de Verão em Bioinformática da USP - Edição especial pandemia. 2021. (Outro).. . 0.
ROSSI, F. P. N.. Curso de Verão em Bioinformática da USP. 2020. (Outro).. . 0.
ROSSI, F. P. N.; Burke, P. ; Miranda, R. ; Campos, G. ; S., J. P. ; Boralli, L. A. ; Miranda, M. M. ; Maciel, L. F. ; MALVEZZI, J. V. M. ; BERTOLDI, E. R. ; PEREIRA, M. A. ; VIRGINIO, J. ; KAWASHIMA, I. Y. ; PIUCO, R.. Curso de verão em Bioinformática da USP. 2019. Outro
AMGARTEN, D. ; RYIUZO, R ; CICONELLE, A ; RODRIGUES, A. ; SOARES, A. C. ; L MOURA ; MAJOR, G. ; ROSSI, F. ; BURKE, P ; SUDRE, I. ; PESSOA, D. ; GUEDES, A. C. P. ; SETUBAL, J. C.. Curso de verão em Bioinformática da USP. 2018. Outro

Lista de colaborações

Colaborações endôgenas (0)

(*) Relatório criado com produções desde 2000 até 2024
Data de processamento: 08/08/2024 17:41:46

Relatório gerado por scriptLattes V9. Os resultados podem ser afetados por possíveis falhas decorrentes de inconsistências no preenchimento dos Currículos Lattes. E-mail de contato: webmaster@ime.usp.br