Mauro de Medeiros Oliveira

http://lattes.cnpq.br/4424054895365328 (06/06/2024) Rótulo/Grupo: Bolsa CNPq: Período de análise: Endereço: Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias de Jaboticabal, Departamento de Biotecnologia Agropecuária e Ambiental. Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias de Jaboticabal Vila Industrial 14884900 - Jaboticabal, SP - Brasil Telefone: (11) 30917592 URL da Homepage: https://www.fcav.unesp.br/#!/genomics Grande área: Ciências Biológicas Área: Biotecnologia Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

• Artigos completos publicados em periódicos (7)
• Livros publicados/organizados ou edições (0)
• Capítulos de livros publicados (0)
• Textos em jornais de notícias/revistas (0)
• Trabalhos completos publicados em anais de congressos (0)
• Resumos expandidos publicados em anais de congressos (2)
• Resumos publicados em anais de congressos (2)
• Artigos aceitos para publicação (0)
• Apresentações de trabalho (6)
• Demais tipos de produção bibliográfica (5)

Produção técnica

• Programas de computador com registro (0)
• Programas de computador sem registro (0)
• Produtos tecnológicos (0)
• Processos ou técnicas (0)
• Trabalhos técnicos (0)
• Demais tipos de produção técnica (0)

Produção artística

• Total de produção artística (0)

Orientações em andamento

• Supervisão de pós-doutorado (0)
• Tese de doutorado (0)
• Dissertação de mestrado (0)
• Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
• Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
• Iniciação científica (0)
• Orientações de outra natureza (0)

Supervisões e orientações concluídas

• Supervisão de pós-doutorado (0)
• Tese de doutorado (0)
• Dissertação de mestrado (0)
• Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
• Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
• Iniciação científica (0)
• Orientações de outra natureza (0)

Projetos de pesquisa

• Total de projetos de pesquisa (3)

Prêmios e títulos

• Total de prêmios e títulos (0)

Participação em eventos

• Total de participação em eventos (8)

Organização de eventos

• Total de organização de eventos (1)

Lista de colaborações

• Colaborações endôgenas (0)

Produção bibliográfica

• Artigos completos publicados em periódicos (7)
  
  1. ALVES, RAFAEL MOYSÉS ; DE ABREU, VINICIUS A C ; OLIVEIRA, RAFAELY PANTOJA ; ALMEIDA, JOÃO VICTOR DOS ANJOS ; DE OLIVEIRA, MAURO DE MEDEIROS ; SILVA, SAURA R ; PASCHOAL, ALEXANDRE R ; DE ALMEIDA, SINTIA S ; DE SOUZA, PEDRO A F ; FERRO, JESUS A ; MIRANDA, VITOR F O ; FIGUEIRA, ANTONIO ; DOMINGUES, DOUGLAS S ; VARANI, ALESSANDRO M. Genomic decoding of (cupuassu) at chromosomal scale: evolutionary insights for horticultural innovation. GigaScience. v. 13, p. 1-19, 2024. Qualis: A1
  2. GRÄF, TIAGO ; BELLO, GONZALO ; NAVECA, FELIPE GOMES ; GOMES, MARCELO ; CARDOSO, VANESSA LEIKO OIKAWA ; DA SILVA, ALEXANDRE FREITAS ; DEZORDI, FILIPE ZIMMER ; DOS SANTOS, MIRLEIDE CORDEIRO ; SANTOS, KATIA CORREA DE OLIVEIRA ; BATISTA, ÉRIKA LOPES ROCHA ; MAGALHÃES, ALESSANDRO LEONARDO ÁLVARES ; VINHAL, FERNANDO ; MIYAJIMA, FÁBIO ; FAORO, HELISSON ; KHOURI, RICARDO ; WALLAU, GABRIEL LUZ ; DELATORRE, EDSON ; SIQUEIRA, MARILDA MENDONÇA ; RESENDE, PAOLA CRISTINA ; OLIVEIRA, M. M.. Phylogenetic-based inference reveals distinct transmission dynamics of SARS-CoV-2 lineages Gamma and P.2 in Brazil. Iscience. v. 25, p. 104156, 2022. Qualis: Não identificado (ISCIENCE)
  3. ARANTES, IGHOR ; GOMES NAVECA, FELIPE ; GRÄF, TIAGO ; COVID-19 FIOCRUZ GENOMIC SURVEILLANCE NETWORK ; MIYAJIMA, FÁBIO ; FAORO, HELISSON ; LUZ WALLAU, GABRIEL ; DELATORRE, EDSON ; REIS APPOLINARIO, LUCIANA ; CAVALCANTE PEREIRA, ELISA ; VENAS, TAINÁ MOREIRA MARTINS ; SAMPAIO ROCHA, ALICE ; SERRANO LOPES, RENATA ; MENDONÇA SIQUEIRA, MARILDA ; BELLO, GONZALO ; CRISTINA RESENDE, PAOLA ; ARAÚJO, CARLOS LEONARDO ; AKESENEN, CLEBER FURTADO ; DIAS, FERNANDO BRAGA STEHLING ; OLIVEIRA, M. M.. Emergence and Spread of the SARS-CoV-2 Variant of Concern Delta across Different Brazilian Regions. MICROBIOLOGY SPECTRUM. v. 11, p. e02641-21, 2022. Qualis: A2
  4. DE MEDEIROS OLIVEIRA, MAURO; BONADIO, IGOR ; LIE DE MELO, ALICIA ; MENDES SOUZA, GLAUCIA ; DURHAM, ALAN MITCHELL. TSSFinder-fast and accurate ab initio prediction of the core promoter in eukaryotic genomes. Briefings in Bioinformatics. v. 22, p. bbab198, 2021. Qualis: A1
  5. OLIVEIRA, MAURO M.; SCHEMBERGER, MICHELLE O. ; SUZUKAWA, ANDREIA A. ; RIEDIGER, IRINA N. ; DO CARMO DEBUR, MARIA ; BECKER, GUILHERME ; RESENDE, PAOLA CRISTINA ; GRÄF, TIAGO ; BALSANELLI, EDUARDO ; DE BAURA, VALTER ANTÔNIO ; DE SOUZA, EMANUEL M. ; PEDROSA, FÁBIO O. ; ALVES, LYSANGELA R. ; BLANES, LUCAS ; NARDELLI, SHEILA CRISTINA ; AGUIAR, ALESSANDRA M. ; ALBRECHT, LETUSA ; ZANETTE, DALILA ; ÁVILA, ANDRÉA R. ; MORELLO, LUIS GUSTAVO. Re-emergence of Gamma-like-II and emergence of Gamma-S:E661D SARS-CoV-2 lineages in the south of Brazil after the 2021 outbreak. Virology Journal. v. 18, p. 222, 2021. Qualis: A3
  6. SOUZA, GLAUCIA MENDES ; VAN SLUYS, MARIE-ANNE ; LEMBKE, CAROLINA GIMILIANI ; LEE, HAYAN ; MARGARIDO, GABRIEL RODRIGUES ALVES ; HOTTA, CARLOS TAKESHI ; GAIARSA, JONAS WEISSMANN ; DINIZ, AUGUSTO LIMA ; OLIVEIRA, MAURO DE MEDEIROS ; FERREIRA, SÁVIO DE SIQUEIRA ; NISHIYAMA, MILTON YUTAKA ; TEN-CATEN, FELIPE ; RAGAGNIN, GEOVANI TOLFO ; ANDRADE, PABLO DE MORAIS ; DE SOUZA, ROBSON FRANCISCO ; NICASTRO, GIANLUCCA GONÇALVES ; PANDYA, RAVI ; KIM, CHANGSOO ; GUO, HUI ; DURHAM, ALAN MITCHELL. Assembly of the 373k gene space of the polyploid sugarcane genome reveals reservoirs of functional diversity in the world's leading biomass crop. GigaScience. v. 8, p. 129, 2019. Qualis: A1
  7. OLIVEIRA, M.M.; RAMOS, E.T.A. ; DRECHSEL, M.M. ; VIDAL, M.S. ; SCHWAB, S. ; BALDANI, J.I.. Gluconacin from Gluconacetobacter diazotrophicus PAL5 is an active bacteriocin against phytopathogenic and beneficial sugarcane bacteria. JOURNAL OF APPLIED MICROBIOLOGY. v. 125, p. 1812-1826, 2018. Qualis: A3
  
  
• Livros publicados/organizados ou edições (0)
  
  
  
• Capítulos de livros publicados (0)
  
  
  
• Textos em jornais de notícias/revistas (0)
  
  
  
• Trabalhos completos publicados em anais de congressos (0)
  
  
  
• Resumos expandidos publicados em anais de congressos (2)
  
  1. OLIVEIRA, M. M.; Gitahy, P. M ; S. Schwab ; baldani. Transformação de Gluconacetobacter diazotrophicus (PAL5T) usando o plasmídeo mutagênico pTnMod-OGmKmlacZ contendo o gene cry1Ab em fusão com gfp. Em: XX JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFRRJ, 2010, SEROPÉDICA. XX JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFRRJ, 2010. Qualis: Não identificado (XX JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFRRJ, 2010, SEROPÉDICA. XX JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFRRJ)
  2. OLIVEIRA, M. M.; Gitahy, P. M ; S. Schwab ; baldani. Clonagem do gene heterólogo cry1Ab de Bacillus thuringiensis, para Gluconacetobacter diazotrophicus visando o controle da broca da cana. Em: XIX JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 2009, SEROPÉDICA. XIX JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 2009. Qualis: Não identificado (XIX JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 2009, SEROPÉDICA. XIX JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA)
  
  
• Resumos publicados em anais de congressos (2)
  
  1. OLIVEIRA, M. M.; Gitahy, P. M ; S. Schwab ; baldani. Transformação de Gluconacetobacter diazotrophicus (PAL5T) usando o plasmídeo mutagênico pTnMod-OGmKmlacZ contendo o gene cry1Ab. Em: X Semana Científica Johanna Döbereiner, 2010, SEROPÉDICA. Ciência para o desenvolvimento sustentável, 2010.
  2. OLIVEIRA, M. M.; Gitahy, P. M ; baldani ; S. Schwab. Construção de uma estirpe de Gluconacetobacter diazotrophicus capaz de expressar o gene heterólogo cry1Ab. Em: IX Semana Científica Johanna Döbereiner, 2009, SEROPÉDICA. Ciência no Brasil: desafios, avanços e aplicações, 2009.
  
  
• Artigos aceitos para publicação (0)
  
  
  
• Apresentações de trabalho (6)
  
  1. OLIVEIRA, M.M.; BONADIO, I. ; DURHAM, A. M.. Core promoter region labeling of model or non-models organisms. 2018. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
  2. OLIVEIRA, M. M.; BONADIO, I. ; DURHAM, A. M. ; SOUZA, G. M.. Identification in silico of the Promoter Region of Genes in Sugarcane Variety SP80-3280. 2018. Apresentação de Trabalho/Congresso
  3. OLIVEIRA, M. M.; DURHAM, A. M. ; SOUZA, G. M.. Different architectures of promoter region for the scdr1 gene and its variants in sugarcane. 2017. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
  4. OLIVEIRA, M. M.; DURHAM, A. M. ; SOUZA, G. M.. Identification of motifs in the promoter region of genes related to the ABA-dependent pathway in sugarcane. 2017. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
  5. BONADIO, I. ; OLIVEIRA, M. M. ; DURHAM, A. M.. Ab initio characterization of promoter regions based on Conditional Random Fields. 2016. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
  6. OLIVEIRA, M.M.; SILVA, D. I. R. ; DURHAM, A. M. ; SOUZA, G. M.. TFBS prediction in sugarcane using binding sites prediction from PlantTFDB server. 2016. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
  
  
• Demais tipos de produção bibliográfica (5)
  
  1. ALVES, V. O. P. M. ; ABREU, V. A. C. ; OLIVEIRA, R. P. ; ALMEIDA, J. V. A. ; OLIVEIRA, MAURO M. ; SILVA, S. R. ; PASCHOAL, A. R. ; ALMEIDA, S. S. ; SOUZA, P. A. F. ; FERRO, J. A. ; MIRANDA, V. F. O. ; FIGUEIRA, A. ; DOMINGUES, D. S. ; VARANI, A. M.. Genomic decoding of Theobroma grandiflorum (cupuassu) at chromosomal scale: Evolutionary insights for horticultural innovation. bioRxiv. 2023. cupuassu) at chromosomal scale: Evolutionary insights for horticultural innovation. bioRxiv, 2023 (Preprint
  2. OLIVEIRA, M. M.; SCHEMBERGER, M. O. ; SUZUKAWA, A. A. ; RIEDIGER, I. N. ; DEBUR, M. C. ; BECKER, G. ; RESENDE, P. C. ; GRAF, T. ; BALSANELLI, E. ; BAURA, V. A. ; SOUZA, E. M. ; PEDROSA, F. O. ; ALVES, L. R. ; BLANES, L. ; NARDELI, S. C. ; AGUIAR, A. M. ; ALBRECHT, L. ; ZANETTE, D. ; AVILA, A. R. ; MORELLO, L. G.. Genomic surveillance of SARS-CoV-2 in the state of Paraná, Southern Brazil, reveals the cocirculation of the VOC P. 1, P. 1-like-II lineage and a P. 1 cluster harboring the S: E661D mutation. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2021. medRxiv preprint
  3. GRAF, T. ; BELLO, G. ; NAVECA, F. G. ; GOMES, M. ; CARDOSO, V. L. O. ; SILVA, A. F. ; DEZORDI, F. Z. ; SANTOS, M. C. ; SANTOS, K. C. O. ; BATISTA, E. L. R. ; MAGALHAES, A. L. A. ; VINHAL, F. ; SURVEILLANCE N, B. M. O. H. C. G. ; OLIVEIRA, M.M. ; MIYAJIMA, F. ; FAORO, H. ; KHOURI, R. ; WALLAU, A. L. ; DELATORRE, E. ; SIQUEIRA, M. M.. Phylogenetic-based inference reveals distinct transmission dynamics of SARS-CoV-2 variant of concern Gamma and lineage P.2 in Brazil. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2021. medRxiv preprint
  4. ARANTES, I. ; NAVECA, F. G. ; GRAF, T. ; NETWORK, C. F. G. S. ; OLIVEIRA, M. M. ; MIYAJIMA, F. ; Faoro H. ; WALLAU, G. L. ; DELATORRE, E. ; APPOLINARIO, L. R. ; PEREIRA, E. C. ; ROCHA, A. S. ; VENAS, T. M. M. ; LOPES, R. S. ; SIQUEIRA, M. M. ; BELLO, G. ; RESENDE, P. C.. Emergence and Spread of the SARS-CoV-2 Variant of Concern Delta Across Different Brazilian Regions. medRxiv. 2021. medRxiv preprint
  5. MELO, L. H. V. ; Gitahy, P. M ; OLIVEIRA, M. M. ; ROCHA, F. Y. O. ; Cruz, Leonardo Magalhães ; Baldani, José Ivo. Base de dados genômica de Bacillus thuringiensis subsp. Kurstaki - estirpe S76. Seropédica: Embrapa Agrobiologia. 2011. Documentos 279
  
  

Produção técnica

• Programas de computador com registro (0)
  
  
  
• Programas de computador sem registro (0)
  
  
  
• Produtos tecnológicos (0)
  
  
  
• Processos ou técnicas (0)
  
  
  
• Trabalhos técnicos (0)
  
  
  
• Demais tipos de produção técnica (0)
  
  
  

Produção artística

• Total de produção artística (0)
  
  
  

Orientações em andamento

• Supervisão de pós-doutorado (0)
  
  
  
• Tese de doutorado (0)
  
  
  
• Dissertação de mestrado (0)
  
  
  
• Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
  
  
  
• Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
  
  
  
• Iniciação científica (0)
  
  
  
• Orientações de outra natureza (0)
  
  
  

Supervisões e orientações concluídas

• Supervisão de pós-doutorado (0)
  
  
  
• Tese de doutorado (0)
  
  
  
• Dissertação de mestrado (0)
  
  
  
• Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
  
  
  
• Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
  
  
  
• Iniciação científica (0)
  
  
  
• Orientações de outra natureza (0)
  
  
  

Projetos de pesquisa

• Total de projetos de pesquisa (3)
  
  1. 2023-Atual. Análise genômica de bactérias probióticas bacteriocinogênicas: identificação taxonômica e caracterização de genes relacionados à síntese de bacteriocinas
     Descrição: A utilização de micro-organismos probióticos na prevenção e no tratamento de infecções bacterianas em animais destinados ao consumo humano vem sendo considerada uma alternativa eficiente frente ao uso de antibióticos. Adicionalmente, estudos recentes demonstram que determinadas biomoléculas produzidas por estes micro-organismos, tais como bacteriocinas, vitaminas, ácidos graxos, exopolissacarídeos, enzimas, entre outras, podem melhorar a imunidade e o desenvolvimento de seus hospedeiros. Os micro-organismos probióticos mais utilizados atualmente nas indústrias de alimentos e farmacêuticas são os pertencentes ao grupo de bactérias ácido-láticas (BALs), uma vez que são consideradas seguras pelos órgãos reguladores nesta área. No entanto, sabe-se que os efeitos benéficos gerados pelos probióticos são específicos para cada hospedeiro e que, frequentemente, cada biomolécula de interesse é sintetizada, em maior quantidade, por uma determinada linhagem bacteriana. Nesse contexto, o presente projeto tem como objetivo principal o isolamento e a identificação de BALs probióticas presentes na microbiota do intestino de aves, suínos e peixes. Para tanto, serão selecionadas cepas com alta capacidade de produzir bacteriocinas. A partir desta seleção, serão realizados ensaios de compatibilidade entre as cepas e, posteriormente será confeccionado um "mix" de probióticos. As cepas que o compõe serão individualmente micro-encapsuladas e administradas diariamente na dieta dos animais de interesse do setor agropecuário, através de ração e água, a fim de averiguar a eficácia probiótica da mistura. Bacteriocinas sintéticas serão igualmente micro-encapsuladas e administradas na dieta dos animais para compreender seu efeito individual na saúde dos mesmos. Os resultados obtidos com as microcápsulas serão comparados com aqueles obtidos com as mesmas estruturas livres. Ademais, serão realizados estudos imunológicos, análises de microscopia eletrônica e de diversidade da microbiota intestinal desses animais. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (4) . Integrantes: Mauro de Medeiros Oliveira - Integrante / Alessandro de Mello Varani - Integrante / Ricardo Pinheiro de Souza Oliveira - Coordenador / Taís Mayumi Kuniyoshi - Integrante / Carlos Miguel Nóbrega Mendonça - Integrante / Iago Rodrigues Blanco - Integrante / João Victor Dos Anjos - Integrante.
     Membro: Mauro de Medeiros Oliveira.
  2. 2021-2023. Abordagem sistêmica da cana de açúcar: entendendo a expressão gênica para melhorar o crescimento e produção de bioetanol
     Descrição: O projeto de pesquisa INCT-Bioetanol tem como um dos objetivos explorar o potencial de alvos relacionados às modificações de parede celular e de rotas sinalizadoras de açúcares a fim de aumentar a produção de biomassa para bioenergia. Contudo, eventos espontâneos de poliploidização no gênero Saccharum tornaram o genoma de cana-de-açúcar redundante, abrigando genes em várias cópias funcionais. Adicionalmente, as cultivares de cana-de-açúcar são híbridos interespecíficos poliploides/aneuplóides, o que confere uma complexidade ao genoma, tornando estudos moleculares nesta espécie um desafio. Atualmente, o grupo de pesquisa LAFIECO possui três bancos de transcriptoma, um proteoma e um microtranscriptoma. Além disso, duas ferramentas para análise sistêmica de redes foram desenvolvidas. Desta forma, pretende-se desenvolver um banco de dados local para armazenamento e divulgação dos resultados obtidos, os quais poderão ser facilmente acessados e utilizados em estudos posteriores, além de se estruturar a integração das ferramentas de análise de redes. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Mauro de Medeiros Oliveira - Integrante / Marcos Silveira Buckeridge - Coordenador / Adriana Grandis - Integrante / Bruno Viana Navarro - Integrante.
     Membro: Mauro de Medeiros Oliveira.
  3. 2020-2021. COVID-19: Ações estratégicas do Programa de Pós-Graduação em Biociências e Biotecnologia do Instituto na modalidade deCarlos Chagas da Fiocruz para o desenvolvimento de ferramentas múltiplas de diagnóstico
     Descrição: O projeto COVID-19: Ações estratégicas do Programa de Pós-Graduação em Biociências e Biotecnologia do Instituto Carlos Chagas da Fiocruz para o desenvolvimento de ferramentas múltiplas de diagnóstico será desenvolvido na FUNDAÇÃO OSWALDO CRUZ (FIOCRUZ) e está vinculado ao Programa Estratégico Emergencial de Prevenção e Combate a Surtos, Endemias, Epidemias e Pandemias (CAPES-EPIDEMIAS). Este programa tem o objetivo de apoiar projetos de pesquisas e formação de recursos humanos altamente qualificados, no âmbito dos Programas de Pós-Graduação stricto sensu, voltados ao enfrentamento à nova pandemia da COViD-19 e em temas relacionados a endemias e epidemias típicas no país, com foco nas áreas específicas descritas a seguir: Epidemiologia, Infectologia, Microbiologia, Imunologia, Bioengenharia e Bioinformática. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Mauro de Medeiros Oliveira - Integrante / Helisson Faoro - Coordenador / Michelle Orane Schemberger - Integrante / Andreia Akemi Suzukawa - Integrante.
     Membro: Mauro de Medeiros Oliveira.
  
  

Prêmios e títulos