Programa de Pós-Graduação Interunidades em Bioinformãtica
Helena Beatriz da Conceição
Possui graduação em Ciências Físicas e Biomoleculares pela Universidade de São Paulo (2017) e doutorado em Bioinformática pela Universidade de São Paulo (2023). Tem experiência na área de Genética, com ênfase em Bioinformática, atuando principalmente nos seguintes temas: bioinformática, retrocópias, expressão, transcriptoma e identificação. (Texto informado pelo autor)
BARREIRO, RODRIGO A. S. ; GUARDIA, GABRIELA D. A. ; MELISO, FABIANA M. ; LEI, XIUFEN ; LI, WEI-QING ; SAVIO, ANDRE ; FELLERMEYER, MARTIN ; CONCEIÇÃO, HELENA B. ; MERCURI, RAFAEL L. V. ; LANDRY, TESHA ; QIAO, MEI ; BLAZQUEZ, LOREA ; ULE, JERNEJ ; PENALVA, LUIZ O.F. ; GALANTE, PEDRO A. F.. The paralogues MAGOH and MAGOHB are oncogenic factors in high-grade gliomas and safeguard the splicing of cell division and cell cycle genes. RNA Biology. v. 20, p. 311-322, 2023. Qualis: A2
MERCURI, RAFAEL L. V. ; CONCEIÇÃO, HELENA B. ; GUARDIA, GABRIELA D. A. ; GOLDSTEIN, GABRIEL ; VIBRANOVSKI, MARIA D. ; HINSKE, LUDWIG C. ; GALANTE, PEDRO A. F.. Retro-miRs: novel and functional miRNAs originating from mRNA retrotransposition. Mobile DNA. v. 14, p. 12, 2023. Qualis: A1
Livros publicados/organizados ou edições (0)
Capítulos de livros publicados (0)
Textos em jornais de notícias/revistas (0)
Trabalhos completos publicados em anais de congressos (0)
Resumos expandidos publicados em anais de congressos (0)
Resumos publicados em anais de congressos (0)
Artigos aceitos para publicação (0)
Apresentações de trabalho (6)
CONCEIÇÃO, H. B.; GUARDIA, G. D. A. ; GALANTE, P. A. F.. RETROCOPIES: ALIVE AND FUNCTIONAL GENE COPIES. 2022. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
CONCEIÇÃO, H. B.; GALANTE, P. A. F.. Identifying Retrocopies in Mammalian Genomes. 2021. Apresentação de Trabalho/Congresso
CONCEIÇÃO, H. B.; GALANTE, P. A. F.. Identification of fixed retrocopies in mammalian genomes. 2020. Apresentação de Trabalho/Congresso
CONCEIÇÃO, H. B.; GUARDIA, G. D. A. ; GALANTE, P. A. F.. Human Retrocopies and Genetic Expression in Tumor and Normal Tissues. 2019. Apresentação de Trabalho/Congresso
Mercuri, R. L. V. ; CONCEIÇÃO, H. B. ; GALANTE, P. A. F.. Identification of intragenic retrocopies in chimeric transcripts in humans. 2019. Apresentação de Trabalho/Congresso
CONCEIÇÃO, H. B.; GUARDIA, G. D. A. ; GALANTE, P. A. F.. Retrocopies and Genetic Expression. 2018. Apresentação de Trabalho/Congresso
Demais tipos de produção bibliográfica (0)
Produção técnica
Programas de computador com registro (0)
Programas de computador sem registro (0)
Produtos tecnológicos (0)
Processos ou técnicas (0)
Trabalhos técnicos (0)
Demais tipos de produção técnica (0)
Produção artística
Total de produção artística (0)
Orientações em andamento
Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (0)
Dissertação de mestrado (0)
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (0)
Supervisões e orientações concluídas
Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (0)
Dissertação de mestrado (0)
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (0)
Projetos de pesquisa
Total de projetos de pesquisa (3)
2018-Atual. Estudo da Contribuição de Retrocópias na Origem de Novas Regiões Gênicas Descrição: As retrocópias de genes codificadores foram classificadas por muito tempo como pseudogenes processados e não funcionais. Contudo, hoje sabemos que a retroduplicação gênica, o mecanismo de geração dessas retrocópias, possui um papel relevante na gênese de novos genes em humanos e em outros organismos. Entretanto, esse papel se limita a exemplos pontuais e são raros os estudos que analisam sistematicamente o papel funcional das retrocópias. Atualmente, o estudo da origem de novos genes e de regiões gênicas está em ascensão graças às novas tecnologias nas diversas "ômicas", ao sequenciamento de DNA/RNA em larga escala e às ferramentas computacionais. Todo esse repertório metodológico nos fornece informações mais precisas, profundas e robustas para serem integradas e analisadas sistematicamente. Neste projeto, propomos elucidar parte do papel funcional das retrocópias através do estudo detalhado de suas contribuições para a geração de novos genes e regiões gênicas no genoma humano em condições normais e tumorais. Tal estudo será realizado por meio da análise e integração de diversos conjuntos de dados de retrocópias fixadas e polimórficas presentes no genoma humano. De maneira geral, como resultado esperamos obter um repertório mais completo sobre o papel funcional das retrocópias na origem de novos genes, regiões gênicas e, caso haja, a sua importância no processo de tumorigênese.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Helena Beatriz da Conceição - Integrante / Pedro A. F. Galante - Coordenador / Gabriela Der Agopian Guardia - Integrante. Membro: Helena Beatriz da Conceição.
2017-2017. Retrocópias e Expressão Genética Descrição: Neste projeto, estudamos diversas características das retrocópias expressas, tais como o nível de expressão de cada retrocópia entre diferentes tecidos de primatas, a expressão espécie-específica e o potencial funcional de cada retrocópia expressa. Para isso, utilizamos os dados da RCPedia, uma base de dados desenvolvida pelo nosso grupo de pesquisa, que contém um catálogo completo de retrocópias presentes em humanos e em outros cinco primatas, o seu contexto genômico, conservação entre-espécie e dados de expressão em seis tecidos diferentes. No final, esse trabalho revelou padrões importantes das retrocópias em primatas, tais como a predominância da expressão tecido-específica (especialmente em testículos), a aquisição de novas sequências regulatórias e a divergência em termos de sequência e expressão das retrocópias em relação aos seus respectivos genes parentais. Todas essas informações, reforçam, portanto, o papel central das retrocópias no surgimento de novos genes em humanos e em outros primatas.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Helena Beatriz da Conceição - Integrante / Pedro A. F. Galante - Coordenador. Membro: Helena Beatriz da Conceição.
2016-2016. Análise Bioquímica e Bioinformática de Helicases Reparadoras de DNA Hel308/HelQ Descrição: Caracterizar experimentalmente a atividade de helicase da Hel308 com substituições de aminoácidos em um link inter-domínio predito. Determinar, usando bioinformática e análise de databases a distribuições filogenética de proteínas Hel308 e HelQ através de todas as espécies e o grau de conservação de cada aminoácido no domínio de hélice alada.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Helena Beatriz da Conceição - Integrante / Edward L. Bolt - Coordenador. Membro: Helena Beatriz da Conceição.
Prêmios e títulos
Total de prêmios e títulos (0)
Participação em eventos
Total de participação em eventos (7)
Biology of Genomes. GENE copies identified in vertebrates and invertebrates? genomes and their orthology. 2023. (Congresso).
The Mobile DNA Conference: Evolution, Diversity, and Impact. RETROCOPIES: ALIVE AND FUNCTIONAL GENE COPIES.. 2022. (Congresso).
The Mobile DNA Conference: Evolution, Diversity, and Impact. Identifying Retrocopies in Mammalian Genomes. 2021. (Congresso).
Transposable Elements. Identification of fixed retrocopies in mammalian genomes. 2020. (Congresso).
4th Brazilian Student Council Symposium: Women in Bioinformatics.Human Retrocopies and Genetic Expression in Tumor and Normal Tissues. 2019. (Simpósio).
X-meeting 2019 - 15th International Conference of the AB3C. Human Retrocopies and Genetic Expression in Tumor and Normal Tissues. 2019. (Congresso).
X-meeting 2018 - 14th International Conference of the AB3C. Retrocopies and Genetic Expression. 2018. (Congresso).
Organização de eventos
Total de organização de eventos (0)
Lista de colaborações
Colaborações endôgenas (0)
(*) Relatório criado com produções desde 2000 até 2024
Data de processamento: 08/08/2024 17:41:46