Programa de Pós-Graduação Interunidades em Bioinformãtica

Omar Julio Sosa

Possui graduação em Genética (Universidad Nacional de Misiones, 2010). Desenvolveu seu trabalho de conclusão de curso na área de Biología Molecular procurando optimizar técnicas para um melhor diagnóstico de estrongiloidíase. Completou o Doutorado em Bioinformática pela Universidade de São Paulo (USP), trabalhando no Laboratório de Genômica e Expressão Gênica em Câncer do Instituto de Química (IQ-USP). Atua principalmente nos seguintes temas: Bioinformática, Transcriptômica, Genômica, Oncología e Biología Molecular. (Texto informado pelo autor)

http://lattes.cnpq.br/5678570343455404 (01/08/2020)

Rótulo/Grupo:

Bolsa CNPq:

Período de análise:

Endereço: Universidade de São Paulo, Instituto de Química. Avenida Professor Lineu Prestes Butantã 05508000 - São Paulo, SP - Brasil Telefone: (11) 30912173

Grande área: Ciências Exatas e da Terra

Área: Ciência da Computação

Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Artigos completos publicados em periódicos (0)
Livros publicados/organizados ou edições (0)
Capítulos de livros publicados (0)
Textos em jornais de notícias/revistas (0)
Trabalhos completos publicados em anais de congressos (0)
Resumos expandidos publicados em anais de congressos (0)
Resumos publicados em anais de congressos (4)
1. SOSA, O. J.; PAIXAO, V. F. ; Pellegrina D. ; BERTOLDI, E. R. M. ; J. C. Setubal ; REIS, E. M. R.. The transcriptional landscape of protein-coding and long noncoding RNAs in pancreatic adenocarcinoma revealed by total RNAseq analysis of matched tumor and nontumor patient samples. Em: AACR Pancreatic Cancer: Advances in Science and Clinical Care special conference, 2018, Boston. AACR Pancreatic Cancer: Advances in Science and Clinical Care special conference, 2018, p. 035, 2018.
2. SOSA, O. J.; PAIXAO, V. F. ; J. C. Setubal ; REIS, E. M. R.. Bioinformatic analysis of RNASeq data to search for novel diagnostic/prognostic biomarkers of pancreatic ductal adenocarcinoma. Em: AACR Annual Metting, 2016, New Orleans. AACR Annual Meeting 2016 abstract book, 2016.
3. Oliveira, Karina G ; SOSA, O. J. ; SUZUKI, A M ; Morales, A ; Brito, L ; Yamamoto, G ; REIS, E. M. R. ; MARIA, P.. Global gene expression analysis by RNAseq on neural progenitor cells from autistic individuals. Em: 13rd annual meeting International Society for Stem Cell Research, 2015, Stockholm. iPS cells: Disease modeling, 2015.
4. SOSA, O. J.; SOSA, L. N. ; GALARZA, F. ; ARGUELLES, C. F.. Genetic characterization of Strongyloides stercoralis, ethiologic agent of a disease underestimated in latinamerica. Em: 14 Congreso Latinoamericano de Genética (ALAG) y 39 Congreso Argentino de Genética, 2010, Viña del Mar. XIV Congreso Latinoamericano de Genética, p. 410, 2010.
Artigos aceitos para publicação (1)
1. GRIESI-OLIVEIRA, K. ; FOGO, M. S. ; PINTO, B. G. G. ; ALVES, A. Y. ; SUZUKI, A. M. ; MORALES, A. G. ; EZQUINA, S. ; SOSA, O. J. ; SUTTON, G. J. ; SUNAGA-FRANZE, D. Y. ; BUENO, A. P. ; SEABRA, G. ; SARDINHA, L. ; COSTA, S. S. ; ROSENBERG, C. ; ZACHI, E. C. ; SERTIE, A. L. ; MARTINS-DE-SOUZA, D. ; REIS, E. M. ; VOINEAGU, I. ; PASSOS-BUENO, M. R.. Transcriptome of iPSC-derived neuronal cells reveals a module of co-expressed genes consistently associated with autism spectrum disorder. Molecular Psychiatry. 2020. Qualis: A1
Apresentações de trabalho (8)
1. SOSA, O. J. Profissão: cientista. 2019. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
2. SOSA, O. J. Introdução às tecnologias de sequenciamento de DNA e bioinformática. 2018. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
3. SOSA, O. J. Identificação de novos genes relacionados com câncer pancreático: perspectiva desde a bioinformática. 2017. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
4. SOSA, O. J. Aplicação de bioinformática para a identificação de marcadores moleculares em câncer pancreático. 2017. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
5. SOSA, O. J. Aplicação de bioinformática na saúde. 2015. Apresentação de Trabalho/Simpósio
6. SOSA, O. J. Genômica e bioinformática. 2015. Apresentação de Trabalho/Congresso
7. SOSA, O. J. Análise do transcritoma de tumores pancreáticos a partir de dados de RNA-seq. 2015. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
8. SOSA, O. J. Estrongilaidíase: optimização de um método molecular para o diagnóstico sensível e específico desta parasitose endẽmica em Misiones, Argentina. 2011. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
Demais tipos de produção bibliográfica (0)

Produção técnica

Programas de computador com registro (0)
Programas de computador sem registro (0)
Produtos tecnológicos (0)
Processos ou técnicas (0)
Trabalhos técnicos (0)
Demais tipos de produção técnica (4)
1. SOSA, O. J. Bioinformática na era do sequenciamento de nova geração. 2017. Curso de curta duração ministrado/Outra
2. SOSA, O. J. Diferenciación sexual y sus alteraciones. 2013. Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Desenvolvimento de conteúdo
3. SOSA, O. J. Genética de poblaciones y bioestadística. 2013. Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Desenvolvimento de conteúdo
4. SOSA, O. J. Introducción a la genética. 2013. Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Desenvolvimento de conteúdo

Produção artística

Total de produção artística (0)

Orientações em andamento

Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (0)
Dissertação de mestrado (0)
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (0)

Supervisões e orientações concluídas

Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (0)
Dissertação de mestrado (0)
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (1)
1. M. Natalia Coutouné. Variabilidade genética em populações de Heliconius hermathena (Nymphalidae, Heliconiinae) estimada com DNA mitocondrial e genotipificação por sequenciamento. (Graduação em Licenciatura en Genética) - Universidad Nacional de Misiones, . 2016.
  Orientador: Omar Julio Sosa.
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (0)

Projetos de pesquisa

Total de projetos de pesquisa (3)

2013-Atual. Busca de alvos moleculares para o diagnóstico do adenocarcinoma de pâncreas através do sequenciamento com alta-resolução do exoma e transcriptoma de amostras clínicas
Descrição: Descrição: O advento das tecnologias de nova geração para sequenciamento de DNA/RNA (NGS) abriu a possibilidade de análise de alterações no genoma e transcriptoma com um grau de resolução sem precedentes. Nos próximos anos pretendemos aplicar essas abordagens para identificar alterações somáticas e transcricionais associadas com a transformação maligna e progressão do adenocarcinoma do pâncreas, com potencial uso diagnóstico e/ou terapêutico.Iremos desenvolver e otimizar métodos para a análise molecular em escala genômica de amostras biológicas de pâncreas obtidas através de ecoendoscopia por aspiração com agulha fina guiada por ultrasom (EUS-FNA). A técnica de EUS-FNA permite a obtenção de amostras clínicas de tumores de pâncreas e lesões pré-malignas de pequeno tamanho e de difícil diagnóstico através dos métodos atuais.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . Integrantes: Omar Julio Sosa - Coordenador / Eduardo Moraes Rego Reis - Integrante / Ester Risério Matos Bertoldi - Integrante / José Celso Ardengh - Integrante.
Membro: Omar Julio Sosa.
2010-2012. Estrongiloidiosis: optimización de un método molecular para el diagnóstico sensible y específico de esta parasitosis endémica en Misiones
Descrição: Strongyloides stercoralis é um parasita que infeta a aprosimadamente 100 milhões de pessoas no mundo, embora este número pode estar sendo subestimado debido a su dificil diagnóstico. O objetivo deste trabalho foi identificar S. stercoralis usando os atributos de sensibilidade e especificidade das técnicas de biología molecular. O estudo foi feito no estado de Misiones (Argentina), os vermes foram isolados e vários métodos de extração de DNA foram otimizados. Foi amplificada uma região do gene COI e sequenciada posteriormente, confirmando a presença de S. stercoralis nas amostras analizadas.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Omar Julio Sosa - Integrante / Fabián Galarza - Integrante / Carina Francisca Arguelles - Coordenador.
Membro: Omar Julio Sosa.
2007-2008. Genotipificación Molecular de Strongyloides stercoralis en materia fecal de niños con strongyloidiosis de Posadas ? Misiones
Descrição: O objetivo deste trabalho foi a caracterização genética de S. stercoralis, a população analizada correspondeu a crianças de bairros periféricos da cidade de Posadas (Argentina), que apresentaram necessidades básicas insatisfeitas. Vermes foram isolados e distintos protocolos de extração de DNA foram usados para posteriores análises moleculares. Os resultados parasitológicos mostraram que de 70 amostras de fezes analisadas todas elas foram infectadas com helminhos, protozoários ou ambos, enquanto apenas 5 com Strongyloides.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) . Integrantes: Omar Julio Sosa - Integrante / Laura Natalia Sosa - Integrante / Carina Francisca Arguelles - Coordenador / Jorge Deschuster - Integrante.
Membro: Omar Julio Sosa.

Prêmios e títulos

Total de prêmios e títulos (0)

Participação em eventos

Total de participação em eventos (8)

El CEDIT va a la escuela.Estrongiloidiosis: optimización de un método molecular para el diagnóstico sensible y específico de esta parasitosis endémica en Misiones. 2011. (Seminário).
Jornada de Iniciación en la Investigación - CEDIT.Estrongiloidiosis: optimización de un método molecular para el diagnóstico sensible y específico de esta parasitosis endémica en Misiones. 2011. (Outra).
Primeras Jornadas de Divulgación y Educación Científica. 2010. (Outra).
Jornadas Darwinianas ?A 200 años del nacimiento de Darwin evocamos la teoría de la evolución?. 2009. (Outra).
XXXVIII Congreso Argentino de Genética. 2009. (Congresso).
XXXVII Congreso Argentino de Genética. 2008. (Congresso).
II Jornadas Nacionales de Estudiantes de Biología. 2007. (Outra).
Jornada de Iniciación en la Investigación - CEDIT.Genotipificación de Strongyloides stercoralis en materia fecal de población pediátrica de Posadas - Misiones. 2007. (Outra).

Organização de eventos

Total de organização de eventos (2)

SILVA, D. ; ORPINELLI, F. ; SOSA, O. J. ; AMGARTEN, D. ; MOURA, L.. Curso de verão em Bioinformática. 2015. Outro
VOGLER, R. ; SOSA, O. J.. I Taller para la Prevención, Monitoreo y Control del Caracol Gigante Africano (Achatina fulica) en Argentina. 2010. Outro

Lista de colaborações

Colaborações endôgenas (0)

(*) Relatório criado com produções desde 2000 até 2025
Data de processamento: 12/02/2025 19:33:35

Relatório gerado por scriptLattes V9. Os resultados podem ser afetados por possíveis falhas decorrentes de inconsistências no preenchimento dos Currículos Lattes. E-mail de contato: webmaster@ime.usp.br