Programa de Pós-Graduação Interunidades em Bioinformãtica
Suzane de Andrade Barboza
Analista de biologia molecular na Genomic e Mestre em Bioinformática pela Universidade de São Paulo. Graduada em Ciências Biológicas pela Fundação Santo André, participou do programa de microbiologia e genética na Universidade de Rennes (França) pelo programa Ciência sem Fronteiras. Tem experiência em NGS, bioinformática, biologia molecular e genética. (Texto informado pelo autor)
DE ANDRADE BARBOZA, SUZANE; MEYGRET, ALEXANDRA ; VINCENT, PASCAL ; MOULLEC, SÉVERINE ; SORIANO, NICOLAS ; LAGENTE, VINCENT ; MINET, JACQUES ; KAYAL, SAMER ; FAILI, AHMAD. Complete Genome Sequence of Noninvasive M/ Strain STAB10015, Isolated from a Child with Perianal Dermatitis in French Brittany. Genome Announcements. v. 3, p. e00806-15, 2015. Qualis: B3
Livros publicados/organizados ou edições (0)
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Resumos publicados em anais de congressos (0)
Artigos aceitos para publicação (0)
Apresentações de trabalho (3)
BARBOZA, S. A.; Santiago, C. R. do N. ; DIGIAMPIETRI, L. A.. Poster: New approach for genomic comparison of invasive and non-invasive strains of Streptococcus pyogenes. 2017. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
BARBOZA, S. A. Atuação do biólogo em medicina genômica. 2017. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
DE ANDRADE BARBOZA, SUZANE. Genômica de Microorganismos. 2015. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
Demais tipos de produção bibliográfica (0)
Produção técnica
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Produção artística
Total de produção artística (0)
Orientações em andamento
Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (0)
Dissertação de mestrado (0)
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (0)
Supervisões e orientações concluídas
Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (0)
Dissertação de mestrado (0)
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (0)
Projetos de pesquisa
Total de projetos de pesquisa (2)
2016-2019. Genômica comparativa aplicada no estudo da invasividade de Streptococcus pyogenes. Descrição: Streptococcus pyogenes é um patógeno Gram positivo estritamente humano, associado a uma vasta gama de infecções invasivas e não-invasivas, ocupando o quarto lugar entre os patógenos mais associados a óbitos. Apesar dos avanços do sequenciamento de nova geração, a grande capacidade desse patógeno para o rearranjo do genoma requer um grande número de isolados a serem comparados, o que dificulta a realização de comparações de genomas completos. Com isso em mente, foram utilizadas ferramentas baseadas na construção de uma rede gênica como uma nova abordagem para a comparação genômica de 55 isolados de S. pyogenes. Essa nova estratégia facilitou a identificação de genes pertencentes ao pan e ao core genoma, genes exclusivos e hipotéticos que poderiam estar relacionados à virulência de S. pyogenes. As comparações indicaram que não há um subconjunto de genes cuja presença influenciasse unicamente e diretamente o comportamento invasivo de certos isolados, fator que deve estar relacionado à regulação dos fatores de virulência. Apesar disso, vários fatores de virulência e proteínas hipotéticas foram exclusivamente associados a cepas relacionas à mesma doença ou genótipo emm. O estudo dessas proteínas deve auxiliar no entendimento das relações entre genótipo e alterações fenotípicas. Por fim, 14 proteínas foram destacadas como potenciais genes-alvo para o desenvolvimento de uma vacina anti-estreptocócica não-orientada à proteína M, visando evitar o surgimento de reações imunológicas cruzadas que podem levar ao surgimento de doenças autoimunes. Todos os resultados gerados nesse estudo foram disponibilizados em uma nova base de dados (http://143.107.58.250/reportStrep2/), desenvolvida para a centralização e padronização dos dados genômicos de S. pyogenes. A incorporação de novos dados e implementação de novas ferramentas de genômica comparativa continuarão a ser realizadas pela equipe.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: / Mestrado profissional: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Suzane de Andrade Barboza - Integrante / Luciano Antonio Digiampietri - Coordenador / Caio Rafael do Nascimento Santiago - Integrante. Membro: Suzane de Andrade Barboza.
2015-2015. ANÁLISE GENÔMICA DE CEPAS DE STREPTOCOCCUS PYOGENES DO TIPO emm28 ISOLADOS DE PACIENTES COM DERMATITE ESTREPTOCÓCICA PERIANAL Descrição: As cepas responsáveis pelas infecções sem caráter invasivo devem apresentar uma superexpressão ou uma repressão da regulação de genes inferidos à invasividade, fator que pode ser causado pela integração de um fago, rearranjos genômicos ou mesmo por uma mutação. O caráter invasivo de centenas de cepas de S. pyogenes poderá, então, ser explicado pela arquitetura genômica dos isolados não-invasivos, principalmente pelos originários das dermites estreptocócicas perianais infantis. O objetivo é identificar, por análise genômica comparativa, genes potencialmente relacionados aos processos invasivos de S.pyogenes, ao comparar o genoma de cepas virulentas de mesmo genótipo M isoladas de infecções invasivas, como febre puerperal ou infecções supurativas localizadas na região extra-genital.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Suzane de Andrade Barboza - Integrante / Ahmad Faili - Integrante / Samer Kayal - Coordenador. Número de produções C, T & A: 1 Membro: Suzane de Andrade Barboza.
Prêmios e títulos
Total de prêmios e títulos (0)
Participação em eventos
Total de participação em eventos (8)
IX SAPEX - Simpósio de Atividades de Pesquisa e Extensão.ANÁLISE GENÔMICA DE CEPAS INVASIVAS E NÃO INVASIVAS DE STREPTOCOCCUS PYOGENES DO TIPO M/emm28 ISOLADOS DE PACIENTES NA BRETANHA (FRANÇA). 2015. (Simpósio).
26ª Semana de Ciências FSA.. 2013. (Simpósio).
III Encontro PIBID FSA.Sexualidade. 2013. (Simpósio).
II Simpósio de Práticas Educativas da Fundação Santo André.Sabina: Espalhando o Saber. 2013. (Simpósio).
II Workshop on Astro and Paleobiology - Extreme Environments in modern and ancient times (USP). 2013. (Outra).
XX Simpósio Nacional de Ensino de Física - O Ensino de Física nos últimos 40 anos: balanço, desafios e perspectivas.s:.Produção de uma Contação de História: Um Relato de Experiência.. 2013. (Simpósio).
25ª Semana de Ciências FSA. 2012. (Simpósio).
24ª Semana de Ciências - FSA. 2011. (Simpósio).
Organização de eventos
Total de organização de eventos (0)
Lista de colaborações
Colaborações endôgenas (0)
(*) Relatório criado com produções desde 2000 até 2024
Data de processamento: 08/08/2024 17:41:46