Programa de Pós-Graduação Interunidades em Bioinformãtica
Alan Pericles Rodrigues Lorenzetti
Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade Estadual de Londrina (2013), mestrado em Genética e Biologia Molecular pela Universidade Estadual de Londrina (2016) e doutorado em Bioinformática pela Universidade de São Paulo (2021). Tem experiência na área de Genética, com ênfase em Bioinformática. (Texto informado pelo autor)
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Projetos de pesquisa
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2020-Atual. Moleculas sinalizadoras na modulacao do transcriptoma, fluxo metabolico e producao de saponinas triterpenicas imunoadjuvantes em Quillaja brasiliensis Mart. (Quillajaceae) Descrição: Quillaja brasiliensis é uma espécie arbórea nativa do sul do Brasil, conhecida popularmente como pau-sabão, que produz saponinas triterpênicas bioativas. Saponinas foliares de Q. brasiliensis apresentam pronunciada atividade adjuvante em vacinas veterinárias experimentais, de forma comparável ao adjuvante comercial Quil-A®, obtido de cascas de Quillaja saponaria, uma fonte pouco renovável e sob risco de escassez iminente. Além disso, saponinas de Q. brasiliensis apresentam toxicidade significativamente menor em comparação àquelas de Q. saponaria, característica muito vantajosa no uso de saponinas adjuvantes. Assim como em Q. saponaria, dentre as saponinas de Q. brasiliensis está uma molécula específica, QS-21, aprovada para uso em vacinas humanas contra malária e herpes zoster Culturas celulares de Q. brasiliensis produtoras de saponinas estão disponíveis no laboratório do proponente do RS e seu uso como material experimental facilita sobremaneira avaliações transcriptônicas e metabólicas. Tendo em vista a possibilidade da utilização de Q. brasiliensis para a obtenção sustentável de saponinas com potencial uso comercial e considerando a necessidade de maior conhecimento sobre produção e acúmulo de saponinas bioativas, este projeto propõe-se a caracterizar aspectos metabólicos e transcricionais relacionados à produção de saponinas imunoadjuvantes em culturas celulares de Quillaja brasiliensis. A caracterização incluirá avaliação química, de biossíntese e de respostas transcricionais nos cultivos frente a elicitores metabólicos. Dessa forma, espera-se melhor compreender a regulação de biossíntese de saponinas triterpênicas de alto valor comercial em cultivos celulares de Q. brasiliensis e avaliar sua viabilidade como fonte alternativa e/ou complementar destes produtos naturais e a, longo prazo, dar subsídios à produção biotecnológica em sistemas heterólogos.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Alan Péricles Rodrigues Lorenzetti - Coordenador / Douglas Silva Domingues - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Alan Pericles Rodrigues Lorenzetti.
2016-2021. RNAs nao codificantes derivados de sequencias de insercao na arqueia halofila Halobacterium salinarum NRC-1 Descrição: Sequências de inserção (IS) são elementos genéticos móveis amplamente distribuídos nos procariontes e que causam grande impacto no genoma que as abrigam. Dependendo da situação, o impacto desses elementos pode ser benéfico ao hospedeiro, promovendo a diversidade genética e a modulação da expressão gênica. Por outro lado, são comuns eventos de mobilização que causam prejuízo, como por exemplo em casos onde a inserção de IS em genes essenciais compromete a viabilidade do organismo. Diversos mecanismos de regulação se encarregam de manter baixos os níveis de transposição, evitando efeitos deletérios. Em bactérias, um dos mecanismos que regulam a taxa de transposição de elementos da família IS200/IS605 atua em nível pós-transcricional, impedindo a tradução de RNAs mensageiros (mRNAs) codificadores de transposases por meio do acoplamento à proteína Hfq e/ou RNAs antisenso (asRNAs). Em arqueias, a proteína LSm, homóloga da Hfq, parece desempenhar função similar, entretanto, a literatura mostra que o conhecimento destes fenômenos ainda é bastante inferior no terceiro domínio da vida em relação ao conhecido para bactérias. Nosso grupo de pesquisa tem estudado diversos aspectos dos RNAs não codificantes (ncRNAs) da arqueia halófila Halobacterium salinarum NRC-1, inclusive no contexto das IS. Analisamos experimentos piloto de sequenciamento de RNAs coimunoprecipitados com LSm em H. salinarum NRC-1 e resultados preliminares indicam que aproximadamente 85% das IS intactas produzem RNAs que apresentam interação com essa proteína. O projeto de doutorado aqui proposto tem como objetivo identificar ncRNAs sense ou antisense derivados de IS, caracterizar sua interação com LSm, identificar possíveis alvos de regulação e por fim elucidar, tanto experimentalmente quanto in silico, sua estrutura secundária em H. salinarum NRC-1. A prevalência, conservação e especificidade da interação entre esses ncRNAs e LSm/Hfq em procariontes será analisada, contribuindo para a compreensão da regulação da transposição em nível pós-transcricional.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Alan Péricles Rodrigues Lorenzetti - Integrante / Tie Koide - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa. Membro: Alan Pericles Rodrigues Lorenzetti.
2011-2012. PIBID/UEL II: CONSOLIDACAO E AMPLIACAO DAS ATIVIDADES Descrição: O projeto PIBID 2011 é um projeto de ensino da Universidade Estadual de Londrina, cadastrado na PROGRAD, patrocinado pelo Ministério da Educação, por meio do Programa Institucional de Bolsas de Iniciação à Docência (PIBID) da Capes. Tem como objetivo geral incentivar a formação de professores para a educação básica nas 15 licenciaturas da UEL [Artes, Biologia, C. Sociais, Ed. Fisica, Filosofia, Física, Geografia, Historia, Espanhol, Ingles, Portugues, Matematica, Musica, Pedagogia e Quimica]. O projeto envolve 45 professores do ensino basico, 360 estudantes de graduaçao [bolsistas] e 20 docentes da UEL. O projeto foi aprovado em 2011 e 2012.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (99) / Mestrado acadêmico: (2) . Integrantes: Alan Péricles Rodrigues Lorenzetti - Integrante / Virginia Iara de Andrade Maistro - Integrante / Sérgio de Mello Arruda - Coordenador. Membro: Alan Pericles Rodrigues Lorenzetti.
Menção honrosa - 2º melhor pôster (People Awards) apresentado no ISCB-Latin American X-Meeting on Bioinformatics with BSB & SoiBio, International Society for Computational Biology, AB3C e SoIBio.. 2014. Membro: Alan Péricles Rodrigues Lorenzetti.
Participação em eventos
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Organização de eventos
Total de organização de eventos (0)
Lista de colaborações
Colaborações endôgenas (0)
(*) Relatório criado com produções desde 2000 até 2024
Data de processamento: 11/04/2024 18:00:26