Programa de Pós-Graduação Interunidades em Bioinformãtica

Mauricio Lopes Casagrande

Bacharel e licenciado em Ciências Biológicas pela UNESP, mestre em Bioinformática pelo Programa Interunidades de Pós-Graduação Bioinformática da USP. Durante a graduação me interessei principalmente por genética, evolução das espécies e bioinformática. Desde então me dediquei a aprimorar meu domínio nessas áreas. Concluí o bacharel com o trabalho intitulado "Predição de genes essenciais baseados em suas características físico-químicas", onde apliquei ferramentas de machine learning (através do software "Waikato Environment for Knowledge Analysis") para investigar se seria possível prever a essencialidade gênica em Saccharomices cerevisae. Foram necessários conhecimentos em genética molecular, Linux, aprendizado de máquina, obtenção de modelos de predição, mineração de dados e proteômica, bem como das linguagens de progamação Python e BASH. No mestrado permaneci no campo da genética mas migrei para a área da psiquiatria, onde fui orientado pela Prof. Dr. Helena Brentani no Instituto de Psiquiatria do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da USP. Para o desenvolvimento da minha tese intitulada "Comparação de redes de coexpressão gênica em circuitos neurais relacionados ao transtorno obsessivo-compulsivo", precisei aprofundar meus conhecimentos em R, Python e Bash, bem como acerca da anatomia e do funcionamento do cérebro humano e análises de transcriptoma partindo dos dados brutos de sequenciamento de RNA, realizando todo o processo de controle de qualidade do sequenciamento, alinhamento e mapeamento dos transcritos, passando por análises de co-expressão e enriquecimento, até a interpretação biológica dos resultados. (Texto informado pelo autor)


Produção bibliográfica

Produção técnica

Produção artística

Orientações em andamento

Supervisões e orientações concluídas

Projetos de pesquisa

Prêmios e títulos

Participação em eventos

Organização de eventos

Lista de colaborações


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Supervisões e orientações concluídas

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(*) Relatório criado com produções desde 2000 até 2024
Data de processamento: 11/04/2024 18:00:26