Programa de Pós-Graduação Interunidades em Bioinformãtica
Ricardo Piuco
Procurando por uma oportunidade de trabalho para vivenciar, melhorar e usar minhas habilidades de bioinformática, genética, biologia molecular e programação para desenvolver minha carreira. Atualmente trabalhando como desenvolvedor full stack e curador de dados do piRNAdb.org e aluno de doutorado-direto em Bioinformática na Universidade de São Paulo (USP). Meu doutorado foca em small RNAs, mais especificamente em piRNAs, buscando por banco de dados, expressão diferencial, implicações moleculares da desregulação em diversos cânceres humanos e fornecer dados confiáveis para pesquisadores e entusiastas que buscam aprimorar o campo de pesquisa. Também já fiz pesquisas e sistema web nas áreas de TDAH, desenvolvimento de plataforma web para dados de APAEs, páginas web para particulares, bancos de dados, melhorias de SEO e desenvolvimento de pipeline de bioinformática. Iniciei minha carreira acadêmica com foco em HTML, PHP e MYSQL em 2008, no mesmo ano em que iniciei meu bacharelado em Ciências Biológicas na Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC). Até o final de 2015, ano da formatura em ciências biológicas, aprendi muitas habilidades de programação sozinho, discutindo com outros programadores e trabalhando em alguns freelances em: HTML, PHP, JavaScript, CSS, MySQL, SEO e análise de dados. Aumentei minha experiência em experimentos de laboratório com manipulação de Orchidaceae, ensaios imunológicos, biologia molecular e genética em diferentes laboratórios durante o curso de meu bacharelado em biologia. Imediatamente após a conclusão da minha graduação, comecei meu doutorado onde pude aprimorar minhas habilidades adquiridas e aprender diversas outras em small-RNAs, ciências biológicas avançadas e linguagens de programação: Perl, R, ambiente linux, servidores, computação em nuvem e performance web. (Texto informado pelo autor)
Trabalhos completos publicados em anais de congressos (0)
Resumos expandidos publicados em anais de congressos (0)
Resumos publicados em anais de congressos (0)
Artigos aceitos para publicação (0)
Apresentações de trabalho (0)
Demais tipos de produção bibliográfica (0)
Produção técnica
Programas de computador com registro (0)
Programas de computador sem registro (0)
Produtos tecnológicos (0)
Processos ou técnicas (0)
Trabalhos técnicos (0)
Demais tipos de produção técnica (0)
Produção artística
Total de produção artística (0)
Orientações em andamento
Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (0)
Dissertação de mestrado (0)
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (0)
Supervisões e orientações concluídas
Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (0)
Dissertação de mestrado (0)
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (0)
Projetos de pesquisa
Total de projetos de pesquisa (2)
2015-Atual. Estudo dos Piwi-interacting RNAs (piRNAs) em primatas e roedores Descrição: Eucariotos apresentam pequenos RNAs que possuem diversas atividades na regulação da expressão gênica por degradação do RNA mensageiro e/ou silenciando genes transcritos via repressão da tradução. O mais abundante, com relação à diversidade, é o Piwi-interacting RNA (piRNA), o qual varia de 26 a 31 nucleotídeos. Atualmente sabemos que os piRNAs atuam, por exemplo, na repressão de elementos transponíveis no genoma, não somente localmente mas também em regiões genômicas distantes, e na repressão de mRNAs de genes codificadores e não codificadores. Sua interação com proteínas argonautas Piwi para formar o complexo de silenciamento ainda precisa ser melhor explorada, porém já se tem conhecimento de que alterações nesse complexo possui relação com aumento da proliferação, supressão e invasão de vários tipos de células cancerígenas. Apesar de conhecermos estas característica e funções, ainda existem poucos estudos sistemáticos sobre os piRNAs, mesmo em espécies muito bem estudadas como Homo sapiens e Mus musculus. Neste projeto, pretendemos estudar sistematicamente diversas características genômicas e de expressão destes piRNAs. Para isso, vamos construir ferramentas computacionais e usar dados públicos de sequenciamento para explorar os piRNAs já caracterizados e descobrir novos candidatos, assim como identificar suas localizações (e co-localizações) genômicas e possíveis influências nos genes próximos. Iremos analisar os piRNAs espécie-específicos e aqueles conservados entre humanos, em outros primatas (chimpanzé, rhesus e sagui) e entre estes primatas e roedores (camundongo e rato). Por fim, mapearemos o perfil de expressão destes piRNAs em tecidos tumorais e buscar aqueles diferencialmente expressos em tumores colorretais e glioblastomas. Boa parte dos dados produzidos serão integrados em um banco de dados web e disponibilizados à comunidade científica.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (2) . Integrantes: Ricardo Piuco - Coordenador / Pedro Alexandre Favoretto Galante - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa. Membro: Ricardo Piuco.
2011-2011. Otimização do teste de cometa em amostras de bivalves marinhos Descrição: Desenvolvemos todas as atividades relacionadas com o chamado teste de cometa, que visa a quantificação de dano ao material genético (DNA), desde o procedimento de coleta das amostras até os estágios finais de classificação e resultados do teste. O teste de cometa vem sendo proposto para estudos de toxicogenética devido a suas peculiaridades e vantagens quando comparado a outros testes para detecção de substâncias genotóxicas. Desenvolvemos práticas laboratoriais de extração de material, preparo, armazenamento, preparação de reagentes e soluções, e por fim a execução do teste per se. Além de aplicar e aprender alguns conceitos teóricos relacionados com os eventos inerentes ao teste de cometa.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) . Integrantes: Ricardo Piuco - Coordenador / Angelica Francesca Maris - Integrante / Aline Zanini Carpes - Integrante. Membro: Ricardo Piuco.
Prêmios e títulos
Total de prêmios e títulos (1)
Best Poster Award, X-meeting 2018 - 14th International Conference of the AB3C.. 2018. Membro: Ricardo Piuco.
Participação em eventos
Total de participação em eventos (17)
1ª Feira Paulista de Ciência e Tecnologia. Membro da Banca de Avaliação. 2021. (Feira).
Intersections: Avanços na Oncologia de Precisão. 2019. (Simpósio).
Workshop de Bioinformática.Perfil de expressão de PIWI-interacting RNAs (piRNAs) em 4 tipos tumorais humanos. 2019. (Outra).
X-meeting 2019 - 15th International Conference of the AB3C. piRNAs expression profiles: Estimates and insights found in four human tumor tissues. 2019. (Congresso).
Bioinformatics Contest ITMO 2018. Desafio de solução de exercícios relacionados a bioinformatica. 2018. (Olimpíada).
EMBO Workshop: piRNAs and PIWI proteins. piRNAdb.org: a PIWI-interacting RNA database. 2018. (Congresso).
X-meeting 2018 - 14th International Conference of the AB3C. piRNAdb: A piwi-interacting RNA database. 2018. (Congresso).
4º Workshop de Bioinformática.piwi-interacting RNAs database (piRNAdb) and piRNA cancer expression. 2017. (Outra).
AACR-LACOG Translational Cancer Medicine conference.Analysis of alternative splicing events in bladder tumors. 2017. (Outra).