Programa de Pós-Graduação Interunidades em Bioinformãtica

Andrew Maltez Thomas

Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade Presbiteriana Mackenzie (2009), Mestrado em Oncologia pela Fundação Antônio Prudente (2012) e Doutorado em Bioinformática pela Universidade de São Paulo (2018). Tem experiência na área de Biologia Molecular e Bioinformática, concentrando sua pesquisa no estudo do microbioma humano e outros sistemas microbianos. Programa nas linguagens R e Python. (Texto informado pelo autor)

http://lattes.cnpq.br/8431301068663643 (18/09/2019)

Rótulo/Grupo:

Bolsa CNPq:

Período de análise:

Endereço: Università Degli Studi di Trento, CIBIO - Centre for Integrative Biology. Via Sommarive 9 Povo 38123 - Povo, - Itália Telefone: (39) 046128521 URL da Homepage: http://segatalab.cibio.unitn.it

Grande área: Ciências Biológicas

Área: Genética

Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Artigos completos publicados em periódicos (12)
1. THOMAS, ANDREW MALTEZ; THOMAS, ANDREW MALTEZ MANGHI, PAOLO ASNICAR, FRANCESCO PASOLLI, EDOARDO ARMANINI, FEDERICA ZOLFO, MORENO BEGHINI, FRANCESCO MANARA, SERENA KARCHER, NICOLAI POZZI, CHIARA GANDINI, SARA SERRANO, DAVIDE TARALLO, SONIA FRANCAVILLA, ANTONIO GALLO, GAETANO TROMPETTO, MARIO FERRERO, GIULIO MIZUTANI, SAYAKA SHIROMA, HIROTSUGU SHIBA, SATOSHI SHIBATA, TATSUHIRO YACHIDA, SHINICHI YAMADA, TAKUJI WIRBEL, JAKOB SCHROTZ-KING, PETRA , et al.ULRICH, CORNELIA M. BRENNER, HERMANN ARUMUGAM, MANIMOZHIYAN BORK, PEER ZELLER, GEORG CORDERO, FRANCESCA DIAS-NETO, EMMANUEL SETUBAL, JOÃO CARLOS TETT, ADRIAN PARDINI, BARBARA RESCIGNO, MARIA WALDRON, LEVI NACCARATI, ALESSIO SEGATA, NICOLA ; Metagenomic analysis of colorectal cancer datasets identifies cross-cohort microbial diagnostic signatures and a link with choline degradation. NATURE MEDICINE. v. 25, p. 667-678, 2019. Qualis: A1
2. FACHI, JOSÉ LUÍS ; FELIPE, JAQUELINE DE SOUZA ; PRAL, LAÍS PASSARIELLO ; DA SILVA, BRUNA KARADI ; CORRÊA, RENAN OLIVEIRA ; DE ANDRADE, MIRELLA CRISTINY PEREIRA ; DA FONSECA, DENISE MORAIS ; BASSO, PAULO JOSÉ ; CÂMARA, NIELS OLSEN SARAIVA ; DE SALES E SOUZA, ÉRICKA LORENNA ; DOS SANTOS MARTINS, FLAVIANO ; GUIMA, SUZANA EIKO SATO ; THOMAS, ANDREW MALTEZ ; SETUBAL, JOÃO CARLOS ; MAGALHÃES, YULI THAMIRES ; FORTI, FÁBIO LUIS ; CANDREVA, THAMIRIS ; RODRIGUES, HOSANA GOMES ; DE JESUS, MARCELO BISPO ; CONSONNI, SÍLVIO ROBERTO ; FARIAS, ALESSANDRO DOS SANTOS ; VARGA-WEISZ, PATRICK ; VINOLO, MARCO AURÉLIO RAMIREZ. Butyrate Protects Mice from Clostridium difficile-Induced Colitis through an HIF-1-Dependent Mechanism. Cell Reports. v. 27, p. 750-761.e7, 2019. Qualis: A1
3. THOMAS, ANDREW MALTEZ; SEGATA, NICOLA. Multiple levels of the unknown in microbiome research. BMC BIOLOGY. v. 17, p. 48, 2019. Qualis: A1
4. FUKUMORI, CLAUDIO ; CASARO, MATEUS B. ; THOMAS, ANDREW M. ; MENDES, EDUARDO ; RIBEIRO, WILLIAN R. ; CRISMA, AMANDA R. ; MURATA, GILSON M. ; BIZZARRO, BRUNA ; DIAS-NETO, EMMANUEL ; SETUBAL, JOAO C. ; OLIVEIRA, MARIA A. ; TAVARES-DE-LIMA, WOTHAN ; CURI, RUI ; BORDIN, SILVANA ; SARTORELLI, PATRICIA ; FERREIRA, CAROLINE M.. Maternal supplementation with a synbiotic has distinct outcomes on offspring gut microbiota formation in A/J and C57BL/6 mice, differentially affecting airway inflammatory cell infiltration and mucus production. Journal of Functional Foods. v. 61, p. 103496, 2019. Qualis: A1
5. TARALLO, SONIA ; FERRERO, GIULIO ; GALLO, GAETANO ; FRANCAVILLA, ANTONIO ; CLERICO, GIUSEPPE ; REALIS LUC, ALBERTO ; MANGHI, PAOLO ; THOMAS, ANDREW MALTEZ ; VINEIS, PAOLO ; SEGATA, NICOLA ; PARDINI, BARBARA ; NACCARATI, ALESSIO ; CORDERO, FRANCESCA. Altered Fecal Small RNA Profiles in Colorectal Cancer Reflect Gut Microbiome Composition in Stool Samples. mSystems. v. 4, p. e00289, 2019. Qualis: A1
6. WIRBEL, JAKOB PYL, PAUL THEODOR KARTAL, ECE ZYCH, KONRAD KASHANI, ALIREZA MILANESE, ALESSIO FLECK, JONAS S. VOIGT, ANITA Y. PALLEJA, ALBERT PONNUDURAI, RUBY SUNAGAWA, SHINICHI COELHO, LUIS PEDRO SCHROTZ-KING, PETRA VOGTMANN, EMILY HABERMANN, NINA NIMÉUS, EMMA THOMAS, ANDREW M. MANGHI, PAOLO GANDINI, SARA SERRANO, DAVIDE MIZUTANI, SAYAKA SHIROMA, HIROTSUGU SHIBA, SATOSHI SHIBATA, TATSUHIRO YACHIDA, SHINICHI , et al.YAMADA, TAKUJI WALDRON, LEVI NACCARATI, ALESSIO SEGATA, NICOLA SINHA, RASHMI ULRICH, CORNELIA M. BRENNER, HERMANN ARUMUGAM, MANIMOZHIYAN BORK, PEER ZELLER, GEORG ; Meta-analysis of fecal metagenomes reveals global microbial signatures that are specific for colorectal cancer. NATURE MEDICINE. v. 25, p. 679-689, 2019. Qualis: Não identificado (PALLEJA, ALBERT PONNUDURAI, RUBY SUNAGAWA, SHINICHI COELHO, LUIS PEDRO SCHROTZ-KING, PETRA VOGTMANN, EMILY HABERMANN, NINA NIMÉUS, EMMA THOMAS, ANDREW M. MANGHI, PAOLO GANDINI, SARA SERRANO, DAVIDE MIZUTANI, SAYAKA SHIROMA, HIROTSUGU SHIBA, SATOSHI SHIBATA, TATSUHIRO YACHIDA, SHINICHI , ET AL.YAMADA, TAKUJI WALDRON, LEVI NACCARATI, ALESSIO SEGATA, NICOLA SINHA, RASHMI ULRICH, CORNELIA M. BRENNER, HERMANN ARUMUGAM, MANIMOZHIYAN BORK, PEER ZELLER, GEORG ; META-ANALYSIS OF FECAL METAGENOMES REVEALS GLOBAL MICROBIAL SIGNATURES THAT ARE SPECIFIC FOR COLORECTAL CANCER. NATURE MEDICINE)
7. SOARES, F. A. COIMBRA, F. J. F. PELOSOF, A. G. FREITAS, H. C. BEGNAMI, M. D. COSTA JR., W. L. FANNELLI, M. F. MELLO, C. A. L. AMORIM, M. G. PIZZI, M. P. CARAMELO, L. FERREIRA, E. N. BARROS, B. D. TORREZAN, G. T. RAMALHO, R. CARRARO, D. M. CHULAM, T. CARVALHO, F. S. KREPISCHI, A. C. TARAZONA-SANTOS, E. COELHO, L. G. V. SANT?ANA, R. O. BURBANO, R. R. ASSUMPCAO, P. SETUBAL, J. C. , et al.THOMAS, ANDREW M. CHINEN, L. T. D. BRAUN, A. C. ALVES, V. CASSINELA, E. K. OLIVEIRA, G. P. LANDEMBERGER, M. C. VALIERIS, R. DRUMMOND, R. SILVA, I. T. CEZAR, R. CALSAVARA, V. F. NOBREGA, C. R. BOBROVNITCHAIA, I. G. BARTELLI, T. F. BALADAO, G. P. PEREIRA, A. C. GATTI, C. M. ABRANTES, L. L. S. MARTINS, V. R. NUNES, D. N. CURADO, M. P. DIAS-NETO, E. ; Genomics and epidemiology for gastric adenocarcinomas. APPLIED CANCER RESEARCH (ONLINE). v. 1, p. 1, 2017.Qualis: Não identificado (COIMBRA, F. J. F. PELOSOF, A. G. FREITAS, H. C. BEGNAMI, M. D. COSTA JR., W. L. FANNELLI, M. F. MELLO, C. A. L. AMORIM, M. G. PIZZI, M. P. CARAMELO, L. FERREIRA, E. N. BARROS, B. D. TORREZAN, G. T. RAMALHO, R. CARRARO, D. M. CHULAM, T. CARVALHO, F. S. KREPISCHI, A. C. TARAZONA-SANTOS, E. COELHO, L. G. V. SANT?ANA, R. O. BURBANO, R. R. ASSUMPCAO, P. SETUBAL, J. C. , ET AL.THOMAS, ANDREW M. CHINEN, L. T. D. BRAUN, A. C. ALVES, V. CASSINELA, E. K. OLIVEIRA, G. P. LANDEMBERGER, M. C. VALIERIS, R. DRUMMOND, R. SILVA, I. T. CEZAR, R. CALSAVARA, V. F. NOBREGA, C. R. BOBROVNITCHAIA, I. G. BARTELLI, T. F. BALADAO, G. P. PEREIRA, A. C. GATTI, C. M. ABRANTES, L. L. S. MARTINS, V. R. NUNES, D. N. CURADO, M. P. DIAS-NETO, E. ; GENOMICS AND EPIDEMIOLOGY FOR GASTRIC ADENOCARCINOMAS. APPLIED CANCER RESEARCH)
8. MENDES, EDUARDO ; ACETTURI, BEATRIZ G. ; THOMAS, ANDREW M. ; MARTINS, FLAVIANO DOS S. ; CRISMA, AMANDA R. ; MURATA, GILSON ; BRAGA, TÁRCIO T. ; CAMÂRA, NIELS O. S. ; FRANCO, ADRIANA L. DOS S. ; SETUBAL, JOÃO C. ; RIBEIRO, WILLIAN R. ; VALDUGA, CLAUDETE J. ; CURI, RUI ; DIAS-NETO, EMMANUEL ; TAVARES-DE-LIMA, WOTHAN ; FERREIRA, CAROLINE M.. Prophylactic Supplementation of Bifidobacterium longum 51A Protects Mice from Ovariectomy-Induced Exacerbated Allergic Airway Inflammation and Airway Hyperresponsiveness. Frontiers in Microbiology. v. 8, p. 1732, 2017. Qualis: A1
9. KINKER, GABRIELA SARTI ; THOMAS, ANDREW MALTEZ ; CARVALHO, VINICIUS JARDIM ; LIMA, FELIPE PRATA ; FUJITA, ANDRÉ. Deletion and low expression of NFKBIA are associated with poor prognosis in lower-grade glioma patients. Scientific Reports. v. 6, p. 24160, 2016. Qualis: A2
10. ANTUNES, LUCIANA PRINCIPAL ; MARTINS, LAYLA FARAGE ; PEREIRA, ROBERTA VERCIANO ; THOMAS, ANDREW MALTEZ ; BARBOSA, DEIBS ; LEMOS, LEANDRO NASCIMENTO ; SILVA, GIANLUCA MAJOR MACHADO ; MOURA, LIVIA MARIA SILVA ; EPAMINO, GEORGE WILLIAN CONDOMITTI ; DIGIAMPIETRI, LUCIANO ANTONIO ; LOMBARDI, KAREN CRISTINA ; RAMOS, PATRICIA LOCOSQUE ; QUAGGIO, RONALDO BENTO ; DE OLIVEIRA, JULIO CEZAR FRANCO ; PASCON, RENATA CASTIGLIONI ; CRUZ, JOÃO BATISTA DA ; DA SILVA, ALINE MARIA ; SETUBAL, JOÃO CARLOS. Microbial community structure and dynamics in thermophilic composting viewed through metagenomics and metatranscriptomics. Scientific Reports. v. 6, p. 38915, 2016. Qualis: A2
11. THOMAS, ANDREW M.; JESUS, ELIANE C. ; LOPES, ADEMAR ; AGUIAR, SAMUEL ; BEGNAMI, MARIA D. ; ROCHA, RAFAEL M. ; CARPINETTI, PAOLA AVELAR ; CAMARGO, ANAMARIA A. ; HOFFMANN, CHRISTIAN ; FREITAS, HELANO C. ; SILVA, ISRAEL T. ; NUNES, DIANA N. ; SETUBAL, JOÃO C. ; DIAS-NETO, EMMANUEL. Tissue-Associated Bacterial Alterations in Rectal Carcinoma Patients Revealed by 16S rRNA Community Profiling. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. v. 6, p. 179, 2016. Qualis: A1
12. THOMAS, ANDREW; GLEBER-NETTO, FREDERICO ; FERNANDES, GUSTAVO ; AMORIM, MARIA ; BARBOSA, LUISA ; FRANCISCO, ANA ; GUERRA DE ANDRADE, ARTHUR ; SETUBAL, JOÃO ; KOWALSKI, LUIZ ; NUNES, DIANA ; DIAS-NETO, EMMANUEL. Alcohol and tobacco consumption affects bacterial richness in oral cavity mucosa biofilms. BMC Microbiology (Online). v. 14, p. 250, 2014. Qualis: A2
Livros publicados/organizados ou edições (0)
Capítulos de livros publicados (1)
1. Maltez Thomas, Andrew; Prata Lima, Felipe ; Maria Silva Moura, Livia ; Maria da Silva, Aline ; DIAS-NETO, EMMANUEL ; SETUBAL, JOÃO C.. Comparative Metagenomics. Methods in Molecular Biology. 1ed. Em: . : Springer New York. 2018.v. 1704, p. 243-260.
Textos em jornais de notícias/revistas (0)
Trabalhos completos publicados em anais de congressos (0)
Resumos expandidos publicados em anais de congressos (0)
Resumos publicados em anais de congressos (1)
1. THOMAS, A. M.; GOMEZ, L. F. B. ; LIMA, L. A. ; PUGA, R. D. ; ROSSI, L. ; AMORIM, M. G. ; FRANCISCO, A. L. N. ; MENDES, G. ; CARVALHO, M. B. ; KOWALSKI, L. P. ; NUNES, D. N. ; DIAS-NETO, E.. A metagenomic survey of bacterial populations in oral cavity cancer. Em: 58o Congresso Brasileiro de Genética, 2012, Foz do Iguaçu. Resumos do 58o Congresso Brasileiro de Genética, p. 21-21, 2012.
Artigos aceitos para publicação (0)
Apresentações de trabalho (3)
1. THOMAS, A. M. Metodos computacionais de análise da microbiota intestinal. 2018. Apresentação de Trabalho/Seminário
2. THOMAS, A. M. The gut microbiome and colorectal cancer. 2018. Apresentação de Trabalho/Congresso
3. THOMAS, A. M. A metagenomic survey of bacterial populations in oral cavity cancer. 2013. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
Demais tipos de produção bibliográfica (0)

Produção técnica

Programas de computador com registro (0)
Programas de computador sem registro (0)
Produtos tecnológicos (0)
Processos ou técnicas (0)
Trabalhos técnicos (0)
Demais tipos de produção técnica (0)

Produção artística

Total de produção artística (0)

Orientações em andamento

Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (0)
Dissertação de mestrado (0)
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (0)

Supervisões e orientações concluídas

Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (0)
Dissertação de mestrado (0)
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (1)
1. Iago Perissinotti. Metagenômica da Cavidade Oral: Efeitos do tabaco e do álcool na composição da microbiota fúngica e sua associação com o câncer da cavidade ora. (Graduando em Medicina) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2012.
  Orientador: Andrew Maltez Thomas.
Orientações de outra natureza (0)

Projetos de pesquisa

Total de projetos de pesquisa (0)

Prêmios e títulos

Total de prêmios e títulos (4)

Pesquisa em Oncologia, X Premio Octavio Frias de Oliveira - ICESP.. 2019.
Membro: Andrew Maltez Thomas.
Premio CAPES de Tese de Doutorado - Ciencias Biologicas I, CAPES.. 2019.
Membro: Andrew Maltez Thomas.
Melhor Trabalho Experimental - Pôster, 19º Fórum Paulista de Pesquisa em Nutrição Clínica e Experimental.. 2017.
Membro: Andrew Maltez Thomas.
Prêmio Pós Graduação Oral - Genética de Microorganismos, Sociedade Brasileira de Genética.. 2012.
Membro: Andrew Maltez Thomas.

Participação em eventos

Total de participação em eventos (10)

3rd Annual European Microbiome Congress. Meta-analysis of fecal CRC metagenomes reveals their predictive power and sheds light on possible disease-associated strains. 2017. (Congresso).
X-Meeting 2015 - 11th International Conference of th AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics. Bacterial community profiling of human rectal cancers. 2015. (Congresso).
Advanced topics in cell biology and genomics. A metagenomic survey of bacterial populations in oral cavity cancer. 2014. (Congresso).
Next Frontiers to Cure Cancer - Integrating Science and Patient Care. A metagenomic survey of bacterial populations in oral cavity cancer. 2013. (Congresso).
58o Congresso Brasileiro de Genética. A metagenomic survey of bacterial populations in human oral cavity cancer. 2012. (Congresso).
São Paulo Advanced School Of Comparative Oncology.A metagenomic survey of bacterial populations in oral cavity cancer. 2012. (Encontro).
1º Encontro de Ciência Translacional do Hospital do Câncer AC Camargo. 2010. (Encontro).
6th SEARCH for the causes of Schizophrenia- Instituto de Psiquiatria- HC-FMUSP. 2009. (Simpósio).
Simpósio Comemorativo dos 10 anos do Laboratório de Neurociências (LIM-27)- Instituto de Psiquiatria HC-FMUSP. 2009. (Simpósio).
VI Semana da Ciência da Universidade Presbiteriana Mackenzie. 2008. (Congresso).

Organização de eventos

Total de organização de eventos (1)

RIYUZO, R. ; CICONELLE, A. ; AMGARTEN, D. E. ; MAJOR, G. ; RUSSO, P. ; MIRANDA, M. S. L. A. M. ; VILLAR, C. ; CARVALHO, V. ; BARBOSA, A. R. ; WALDEMARIN, R. ; RODRIGUES, A. ; THOMAS, A. M. ; SETUBAL, J. C.. Curso de Verão em Bioinformática. 2017. Outro

Lista de colaborações

Colaborações endôgenas (3)

Andrew Maltez Thomas ⇔ Felipe Prata Lima (2.0)
KINKER, GABRIELA SARTI ; THOMAS, ANDREW MALTEZ ; CARVALHO, VINICIUS JARDIM ; LIMA, FELIPE PRATA ; FUJITA, ANDRÉ. Deletion and low expression of NFKBIA are associated with poor prognosis in lower-grade glioma patients. Scientific Reports. v. 6, p. 24160, 2016. Qualis: A2
Maltez Thomas, Andrew ; Prata Lima, Felipe ; Maria Silva Moura, Livia ; Maria da Silva, Aline ; Dias-Neto, Emmanuel ; Setubal, João C.. Comparative Metagenomics. Methods in Molecular Biology. 1ed. Em: . : Springer New York. 2018.v. 1704, p. 243-260.

Andrew Maltez Thomas ⇔ George Willian Condomitti Epamino (1.0)
ANTUNES, LUCIANA PRINCIPAL ; MARTINS, LAYLA FARAGE ; PEREIRA, ROBERTA VERCIANO ; THOMAS, ANDREW MALTEZ ; BARBOSA, DEIBS ; LEMOS, LEANDRO NASCIMENTO ; SILVA, GIANLUCA MAJOR MACHADO ; MOURA, LIVIA MARIA SILVA ; EPAMINO, GEORGE WILLIAN CONDOMITTI ; DIGIAMPIETRI, LUCIANO ANTONIO ; LOMBARDI, KAREN CRISTINA ; RAMOS, PATRICIA LOCOSQUE ; QUAGGIO, RONALDO BENTO ; DE OLIVEIRA, JULIO CEZAR FRANCO ; PASCON, RENATA CASTIGLIONI ; CRUZ, JOÃO BATISTA DA ; DA SILVA, ALINE MARIA ; SETUBAL, JOÃO CARLOS. Microbial community structure and dynamics in thermophilic composting viewed through metagenomics and metatranscriptomics. Scientific Reports. v. 6, p. 38915, 2016. Qualis: A2

Andrew Maltez Thomas ⇔ Gianluca Major Machado da Silva (1.0)
ANTUNES, LUCIANA PRINCIPAL ; MARTINS, LAYLA FARAGE ; PEREIRA, ROBERTA VERCIANO ; THOMAS, ANDREW MALTEZ ; BARBOSA, DEIBS ; LEMOS, LEANDRO NASCIMENTO ; SILVA, GIANLUCA MAJOR MACHADO ; MOURA, LIVIA MARIA SILVA ; EPAMINO, GEORGE WILLIAN CONDOMITTI ; DIGIAMPIETRI, LUCIANO ANTONIO ; LOMBARDI, KAREN CRISTINA ; RAMOS, PATRICIA LOCOSQUE ; QUAGGIO, RONALDO BENTO ; DE OLIVEIRA, JULIO CEZAR FRANCO ; PASCON, RENATA CASTIGLIONI ; CRUZ, JOÃO BATISTA DA ; DA SILVA, ALINE MARIA ; SETUBAL, JOÃO CARLOS. Microbial community structure and dynamics in thermophilic composting viewed through metagenomics and metatranscriptomics. Scientific Reports. v. 6, p. 38915, 2016. Qualis: A2

(*) Relatório criado com produções desde 2000 até 2025
Data de processamento: 12/02/2025 19:33:35

Relatório gerado por scriptLattes V9. Os resultados podem ser afetados por possíveis falhas decorrentes de inconsistências no preenchimento dos Currículos Lattes. E-mail de contato: webmaster@ime.usp.br