Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação

Suzana de Siqueira Santos

Sou professora adjunta no Centro de Matemática, Computação e Cognição, da UFABC, Universidade Federal do ABC, em Santo André, São Paulo, Brasil. Ministro cursos de computação e trabalho com desenvolvimento de métodos para problemas envolvendo grafos, aprendizado de máquina, principalmente na área de biologia e farmacologia. Cursei bacharelado, mestrado e doutorado em Ciência da Computação no Instituto de Matemática e Estatística (IME) da Universidade de São Paulo (USP), onde desenvolvi métodos estatísticos e computacionais para a análise de grafos aleatórios e estudei suas propriedades assintóticas, com aplicações na análise de redes de co-expressão de genes e de redes funcionais do cérebro. Fiz pós-doutorado na Escola de Matemática Aplicada (EMap) da Fundação Getúlio Vargas, onde trabalhei com biologia computacional, utilizando estratégias de medicina de rede e filtragem colaborativa. (Texto informado pelo autor)

http://lattes.cnpq.br/2334143070581494 (18/12/2024)

Rótulo/Grupo:

Bolsa CNPq:

Período de análise:

Endereço:

Grande área: Ciências Exatas e da Terra

Área: Ciência da Computação

Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Artigos completos publicados em periódicos (9)
1. SANTOS, SUZANA DE SIQUEIRA; TORRES, MATEO ; GALEANO, DIEGO ; SÁNCHEZ, MARÍA DEL MAR ; CERNUZZI, LUCA ; PACCANARO, ALBERTO. Machine learning and network medicine approaches for drug repositioning for COVID-19. Patterns. v. 3, p. 100396, 2022. Qualis: Não identificado (PATTERNS)
2. SACRAMENTO, CAROLINA Q. ; FINTELMAN-RODRIGUES, NATALIA ; DIAS, SUELEN S. G. ; TEMEROZO, JAIRO R. ; DA SILVA, ALINE DE PAULA D. ; DA SILVA, CARINE S. ; BLANCO, CAMILLA ; FERREIRA, ANDRÉ C. ; MATTOS, MAYARA ; SOARES, VINICIUS C. ; PEREIRA-DUTRA, FILIPE ; MIRANDA, MILENE DIAS ; BARRETO-VIEIRA, DEBORA F. ; DA SILVA, MARCOS ALEXANDRE N. ; SANTOS, SUZANA S. ; TORRES, MATEO ; CHAVES, OTÁVIO AUGUSTO ; RAJOLI, RAJITH K. R. ; PACCANARO, ALBERTO ; OWEN, ANDREW ; et.al. Unlike Chloroquine, Mefloquine Inhibits SARS-CoV-2 Infection in Physiologically Relevant Cells. Viruses-Basel. v. 14, p. 374, 2022. Qualis: Não identificado (VIRUSES-BASEL)
3. MOREIRA FRANCO, YOLLANDA E. ; ALVES, MARIA JOSE ; UNO, MIYUKI ; MORETTI, ISABELE FATTORI ; TROMBETTA-LIMA, MARINA ; de Siqueira Santos, Suzana ; DOS SANTOS, ANCELY FERREIRA ; ARINI, GABRIEL SANTOS ; BAPTISTA, MAURICIO S. ; LERARIO, ANTONIO MARCONDES ; OBA-SHINJO, SUELI MIEKO ; MARIE, SUELY KAZUE NAGAHASHI. Glutaminolysis dynamics during astrocytoma progression correlates with tumor aggressiveness. Cancer & Metabolism. v. 9, p. 18, 2021. Qualis: Não identificado (CANCER & METABOLISM)
4. SANTOS, SUZANA DE SIQUEIRA; Fujita, André ; MATIAS, CATHERINE. Spectral density of random graphs: convergence properties and application in model fitting. JOURNAL OF COMPLEX NETWORKS. v. 9, p. cnab041, 2021. Qualis: A1
5. FUJITA, ANDRE ; SILVA LIRA, EDUARDO ; SIQUEIRA SANTOS, SUZANA DE ; BANDO, SILVIA YUMI ; ELEUTERIO SOARES, GABRIELA ; Takahashi, Daniel Yasumasa. A semi-parametric statistical test to compare complex networks. Journal of Complex Networks. v. 8, p. cnz028, 2020. Qualis: A1
6. JARDIM, VINÍCIUS CARVALHO ; SANTOS, SUZANA DE SIQUEIRA ; FUJITA, ANDRE ; BUCKERIDGE, MARCOS SILVEIRA. BioNetStat: A Tool for Biological Networks Differential Analysis. Frontiers in Genetics. v. 10, p. 594, 2019. Qualis: A2
7. SATO, JOAO RICARDO ; VIDAL, MACIEL ; de Siqueira Santos, Suzana ; MASSIRER, KATLIN BRAUER ; FUJITA, ANDRE. Complex network measures in Autism Spectrum Disorders. IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. v. 15, p. 1-1, 2018. Qualis: A1 (IEEE/ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS)
8. SANTOS, S. S.; GALATRO, T. F. A. ; WATANABE, R. A. ; OBA-SHINJO, S. M. ; MARIE, S. K. N. ; FUJITA, A.. CoGA: An R Package to Identify Differentially Co-Expressed Gene Sets by Analyzing the Graph Spectra. Plos One. v. 10, p. e0135831, 2015. Qualis: A1
9. DE SIQUEIRA SANTOS, S.; TAKAHASHI, D. Y. ; NAKATA, A. ; FUJITA, A.. A comparative study of statistical methods used to identify dependencies between gene expression signals. Briefings in Bioinformatics. v. 15, p. 906-918, 2014. Qualis: A1
Livros publicados/organizados ou edições (0)
Capítulos de livros publicados (1)
1. de Siqueira Santos, Suzana; Takahashi, Daniel Yasumasa ; Sato, João Ricardo ; Ferreira, Carlos Eduardo ; Fujita, André. Statistical Methods in Graphs: Parameter Estimation, Model Selection, and Hypothesis Test. Mathematical Foundations and Applications of Graph Entropy. 1ed. Em: . : Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA. 2016.p. 183-202.
Textos em jornais de notícias/revistas (0)
Trabalhos completos publicados em anais de congressos (0)
Resumos expandidos publicados em anais de congressos (0)
Resumos publicados em anais de congressos (0)
Artigos aceitos para publicação (0)
Apresentações de trabalho (0)
Demais tipos de produção bibliográfica (0)

Produção técnica

Programas de computador com registro (0)
Programas de computador sem registro (2)
1. COSTA, D. R. ; RAMOS, T. C. ; GUZMAN, G. E. C. ; SANTOS, S. S. ; SILVA LIRA, EDUARDO ; FUJITA, A.. statGraph: Statistical Methods for Graphs. 2017.
2. SANTOS, S. S.; GALATRO, T. F. A. ; WATANABE, R. A. ; OBA-SHINJO, S. M. ; MARIE, S. K. N. ; FUJITA, A. . CoGA. 2015.
Produtos tecnológicos (0)
Processos ou técnicas (0)
Trabalhos técnicos (0)
Demais tipos de produção técnica (0)

Produção artística

Total de produção artística (0)

Orientações em andamento

Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (0)
Dissertação de mestrado (0)
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (6)
1. Joana Regina Dias de Souza Andrade. A definir. Iniciação científica (Graduando em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, . Início: 2024.
  Orientador: Suzana de Siqueira Santos.
2. Yago Jacob Alves. Ferramenta computacional para reposicionamento de fármacos contra doenças virais usando medicina de rede. Iniciação científica (Graduando em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, . Início: 2024.
  Orientador: Suzana de Siqueira Santos.
3. Bruno Guaicuru Barbosa. Reposicionamento de drogas baseado em Medicina de Rede. Iniciação científica (Graduando em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, . Início: 2024.
  Orientador: Suzana de Siqueira Santos.
4. Ryan Melo de Oliveira Marques dos Santos. Estudo comparativo e implementação de diferentes kernels de difusão em grafos. Iniciação científica (Graduando em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, . Início: 2024.
  Orientador: Suzana de Siqueira Santos.
5. Pedro Damasceno. A definir. Iniciação científica (Graduando em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, . Início: 2024.
  Orientador: Suzana de Siqueira Santos.
6. Caio Esthevao Ferreira Peixoto. A definir. Iniciação científica (Graduando em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, . Início: 2024.
  Orientador: Suzana de Siqueira Santos.
Orientações de outra natureza (0)

Supervisões e orientações concluídas

Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (0)
Dissertação de mestrado (1)
1. Bruna Fernanda Fistarol. A graph-theoretic approach to predict antibiotic resistance. Dissertação (Mestrado em Modelagem Matemática) - Fundação Getúlio Vargas, . 2023.
  Supervisor: Suzana de Siqueira Santos.
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (4)

Aldo Javier Galeano Alfonso. Reposicionamento de medicamentos para o tratamento da COVID-19 usando Inteligência Artificial. Orientação de outra natureza - Fundação Getúlio Vargas, Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología. 2021.
Orientador: Suzana de Siqueira Santos.
Allan Valin. Introdução à programação. Orientação de outra natureza - Colégio Joana d'Arc, . 2012.
Orientador: Suzana de Siqueira Santos.
Carolina Kasuga. Introdução à programação. Orientação de outra natureza - Colégio Joana d'Arc, . 2012.
Orientador: Suzana de Siqueira Santos.
Stéphannye Menato. Introdução à programação. Orientação de outra natureza - Colégio Joana d'Arc, . 2012.
Orientador: Suzana de Siqueira Santos.

Projetos de pesquisa

Total de projetos de pesquisa (0)

Prêmios e títulos

Total de prêmios e títulos (4)

Pesquisa de destaque FGV, Fundação Getulio Vargas.. 2023.
Membro: Suzana de Siqueira Santos.
Terceiro lugar no XXIII Concurso Latinoamericano de Tese de Mestrado, XLII Conferencia Latinoamericana de Informática - CLEI 2016.. 2016.
Membro: Suzana de Siqueira Santos.
Melhor poster na sessão de Software e Desenvolvimento, X-meeting 2015 - 11th International Conference of the AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics.. 2015.
Membro: Suzana de Siqueira Santos.
Menção Honrosa por ter se destacado no curso de Bacharelado em Ciência da Computação, Instituto de Matemática e Estatística (USP).. 2013.
Membro: Suzana de Siqueira Santos.

Participação em eventos

Total de participação em eventos (15)

12ª Semana de Graduação em Biofísica da UFRJ (SGBiof).Mesa redonda: Intercessão entre a Ciência Biofísica e Inteligência Artificial. 2024. (Encontro).
III Workshop of Molecular Modeling in Drug Discovery and Design (WMMD3).Computational approach for repurposing host-directed drugs against viral diseases. 2024. (Oficina).
III Encontro de mulheres na Estatística e Ciência de Dados - UFRJ.Combinando medicina de rede e filtragem colaborativa para reposicionamento de fármacos contra doenças virais.. 2023. (Encontro).
VII Simpósio de Pesquisa da Fundação Getulio Vargas (FGV). 2023. (Simpósio).
XIX Oktobermat - PUC-Rio.Algoritmos em grafos e de aprendizagem de máquina para predição de medicamentos contra doenças virais. 2022. (Encontro).
São Paulo School of Advanced Science on Learning from Data..Increased association between the default-mode network and the volume of the anterior region of the corpus callosum in individuals with Asperger?s disorder.. 2019. (Outra).
Segundo Encontro Paulista de Pós-Graduandos em Computação (EPPC).statGraph: a statistical tool to analyze biological networks. 2018. (Encontro).
X-meeting 2018 - 14th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology (AB3C).Measuring the association between biological networks and random variables. 2018. (Outra).
X-meeting 2017 - 13th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology (AB3C).statGraph: a statistical tool to analyze biological networks. 2017. (Outra).
XXLII Conferencia Latinoamericana de Informática - CLEI 2016. Computational methods to construct and analyze gene regulatory networks. 2016. (Congresso).
X-meeting 2015 - 11th International Conference of the AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics. CoGA: an R package for differential co-expression analysis based on network spectral and structural properties. 2015. (Congresso).
Advanced Topics in Genomics and Cell Biology.Comparative study of measures of dependence used in gene expression data. 2013. (Encontro).
Precision Medicine: Personal Genomes & Pharmacogenomics.Identification of gene sets associated with oligodendroglioma grade II and astrocytoma grade II by comparing gene regulatory networks. 2013. (Encontro).
13o Fórum Internacional Software Livre. 2012. (Outra).
20o Simpósio Internacional de Iniciação Científica.Estudo comparativo de medidas de dependência e aplicações em dados de expressão gênica. 2012. (Simpósio).

Organização de eventos

Total de organização de eventos (0)

Lista de colaborações

Colaborações endôgenas (0)

(*) Relatório criado com produções desde 2000 até 2025
Data de processamento: 12/02/2025 20:44:31

Relatório gerado por scriptLattes V9. Os resultados podem ser afetados por possíveis falhas decorrentes de inconsistências no preenchimento dos Currículos Lattes. E-mail de contato: webmaster@ime.usp.br