Programa de Pós Graduação em Bioinformática

Total de orientações em andamento


Número total de itens: 201

2024

1.   Guilherme Wenceslau de Lima Cardoso. Monitoramento de alterações transcritômicas durante a infecção bacteriana por fagos.. Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: Aline Maria da Silva.

2023

1.   Ana Beatriz Mendes de Oliveira. Treinamento de bacteriófagos líticos de Pseudomonas aeruginosa para superar a resistência bacteriana. Iniciação científica (Graduando em Medicina Veterinária) - Universidade de Santo Amaro, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2023.
Orientador: Aline Maria da Silva.
2.   André Ferreira Cunha. Integration of publicly available multi-cohort human gut microbiome data for the stratification of patients with inflammatory bowel diseases. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2023.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.
3.   Bruno Celso Feltrin Genevcius. . Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.. Início: 2023.
Supervisor: Tatiana Teixeira Torres.
4.   Chiara Mascitelli. Evolution of monogeny in Chrysomya albiceps. Dissertação (Mestrado profissional em EV - Evolutionary Biology) - Leiden University, . Início: 2023.
Orientador: Tatiana Teixeira Torres.
5.   Darion Samir Longhi Cervantes. Estudo do mecanismo de regulação pós-transcricional mediada por microRNAs na formação do aerênquima em raízes de cana-de-açúcar.. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Interunidades em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, . Início: 2023.
Orientador: Marcos Silveira Buckeridge.
6.   Estela Duarte da Conceição Alves. Perfis de expressão gênica de genes quimissensoriais em espécies da família Calliphoridae. Iniciação científica (Graduando em Abi - Ciências Biológicas) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2023.
Orientador: Tatiana Teixeira Torres.
7.   Felipe de Mello Martins. . Instituto Israelita de Ensino e Pesquisa Albert Einstein., . Início: 2023.
Supervisor: Helder Takashi Imoto Nakaya.
8.   Felipe Del Bianco Soares. Isolamento e caracterização bacteriófagos contra Klebsiella pneumoniae e associação da N-acetilcisteína no potencial terapêutico. Iniciação científica (Graduando em Química Com Atribuições em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2023.
Orientador: Aline Maria da Silva.
9.   Francisco Alvaro Vasquez Cunya. Análise comparativa e bioinformática do genoma completo de um isolado pertencente ao gênero Sergeia. Dissertação (Mestrado em Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro) - Departamento de Parasitologia do Instituto de Ciências Biomédicas da USP, . Início: 2023.
Orientador: Joao Marcelo Pereira Alves.
10.   Gabriel Goldstein. . Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.. Início: 2023.
Supervisor: Helder Takashi Imoto Nakaya.
11.   Gabriel Marques Leal. Desenvolvimento de estratégias in vitro que auxiliam na investigação do aumento de rendimento da cana-de-açúcar. Orientação de outra natureza. Universidade de São Paulo. Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, . Início: 2023.
Orientador: Marcos Silveira Buckeridge.
12.   Gabriel Ronconi Prada. Multiclassificação por Aprendizagem de Máquina baseado em Segmentos de Reta. Iniciação científica (Graduando em Matemática Computacional) - Universidade Federal de São Paulo, . Início: 2023.
Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto.
13.   Giullia Luiza Takahashi Rodrigues. Isolamento de bacteriófagos líticos de Pseudomonas aeruginosa de diversos ambientes naturais. Iniciação científica (Graduando em Abi - Ciências Biológicas) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2023.
Orientador: Aline Maria da Silva.
14.   Gustavo Wenzel Sainatto. Predição de novos genes marcadores de câncer hereditário. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Universidade de São Paulo, . Início: 2023.
Orientador: Joao Carlos Setubal.
15.   Henry Bonilla Bruno. O papel dos territórios cromossômicos na evolução da regulação transcricional do cromossomo X durante a espermatogênese em Drosophila. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, . Início: 2023.
Orientador: Maria Dulcetti Vibranovski.
16.   Kelly da Silva e Souza. . Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.. Início: 2023.
Supervisor: Tatiana Teixeira Torres.
17.   Ketly Naiany Almeida Nascimento. Associação entre estresse pré-natal materno e programação da metilação dos genes NR3C1, FKBP5 e OXTR e comprimento telomérico aos 12 meses de idade. Dissertação (Mestrado em pós-graduação) - Departamento de Psiquiatria da Faculdade de Medicina da USP, . Início: 2023.
Orientador: Helena Paula Brentani.
18.   Kevim Bordignon Guterres. Influência do cobre no aparecimento de persistência ou tolerância a drogas em e Mycobacterium tuberculosis e Mycobacterium africanum L6. Tese (Doutorado em Epidemiologia Experimental Aplicada Às Zoonoses) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2023.
Orientador: Ana Marcia de Sá Guimarães.
19.   Livia Cavalcanti de Morais Gama. Alterações da microbiota na infância contribuem para transtornos psíquicos na vida adulta?. Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformatica) - Instituto de Matemática e Estatística da Universidade de São Paulo. (Coorientador)., Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2023.
Orientadores: Helena Paula Brentani, Joao Carlos Setubal.
20.   Lucas Cardoso dos Santos. Programa de Monitoria em Programação Orientada a Objetos. Orientação de outra natureza. Universidade de São Paulo. Universidade de São Paulo, . Início: 2023.
Orientador: Cléver Ricardo Guareis de Farias.
21.   Lucca Ciriac Vilhena Oliveira. Aprendizagem de Máquina baseado em Segmentos de Reta pelo método da máxima verossimilhança. Iniciação científica (Graduando em Ciências de Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2023.
Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto.
22.   Luciana Madanelo. "Stanford Social Dimensions Scale (SSDS): Confiabilidade, validação e aplicação". Tese (Doutorado em Psiquiatria) - Departamento de Psiquiatria da Faculdade de Medicina da USP, . Início: 2023.
Orientador: Helena Paula Brentani.
23.   Maiara Mascarenhas Moro Valenciano. Caracterização evolutiva e de rede dos genes envolvidos na resposta imune em mamíferos. Dissertação (Mestrado em Programa Interunidades de Pós-Graduação em Bioinformática) - Departamento de Parasitologia do Instituto de Ciências Biomédicas da USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2023.
Orientador: Joao Marcelo Pereira Alves.
24.   Maria Carolina del Valle Sisco Zerpa. . Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.. Início: 2023.
Supervisor: Ana Marcia de Sá Guimarães.
25.   Maria Eduarda Mazzi Esquinca. Avaliação funcional do papel de lncRNAs oncogênicos no adenocarcinoma pancreático ductal (PCA) através de abordagens ômicas integrativas. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, . Início: 2023.
Orientador: Eduardo Moraes Rego Reis.
26.   Matheus Farinaro Vesco. USO DE REDES ADVERSARIAIS GENERATIVAS PARA GERAÇÃO DE IMAGENS SINTÉTICAS DE TOMOGRAFIA COMPUTADORIZADA A PARTIR DE RADIOGRAFIAS CONVENCIONAIS. Dissertação (Mestrado profissional em Ciências da Saúde) - Instituto Israelita de Ensino e Pesquisa Albert Einstein, . Início: 2023.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.
27.   Nathan Nahas. Integração de dados para identificação de regiões genômicas de risco para alterações no neurodesenvolvimento. Iniciação científica (Graduando em Iniciação Cientifica) - Departamento de Psiquiatria da Faculdade de Medicina da USP, . Início: 2023.
Orientador: Helena Paula Brentani.
28.   Pedro de Andrade Franco. Construção de um pipeline de montagem, anotação e classificação taxonômica de genomas de fagos.. Iniciação científica (Graduando em Ciências Moleculares) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2023.
Orientador: Aline Maria da Silva.
29.   Peter Park. . Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.. Início: 2023.
Supervisor: Helder Takashi Imoto Nakaya.
30.   Stephan Lloyd Watkins. . Instituto Israelita de Ensino e Pesquisa Albert Einstein., . Início: 2023.
Supervisor: Helder Takashi Imoto Nakaya.
31.   Suelen Rossi. . Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.. Início: 2023.
Supervisor: Ana Marcia de Sá Guimarães.
32.   Thomas Wittmann Cezar Santos. Caracterização de proteínas de competição microbiana em archaeas. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2023.
Orientador: Robson Francisco de Souza.
33.   Tiago Silva Oliveira. Estudos sobre a interação de fagos-Xanthomonas citri. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2023.
Orientador: Aline Maria da Silva.

2022

1.   Adriana Simizo. Transcriptômica espacial como ferramenta complementar prognóstica do câncer de mama. Tese (Doutorado em Ciências da Saúde) - Instituto Israelita de Ensino e Pesquisa Albert Einstein, . Início: 2022.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.
2.   Ana Carolina Damasceno Sanches. Aprendizagem de Máquinas na Identificação de Resíduos-Chave de Variantes na Interação das Proteínas ACE2 e TMPRSS2 com Spike do SARS-CoV2. Iniciação científica (Graduando em Informática Biomédica) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto - USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2022.
Orientador: Silvana Giuliatti.
3.   Arthur Vanni Lopes. Caracterização do perfil transcricional da Trealose-6-fosfato sintase (TPS) catalítica ao longo do desenvolvimento de cana-de-açúcar. Iniciação científica (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade de São Paulo, . Início: 2022.
Orientador: Marcos Silveira Buckeridge.
4.   Carolina Kurotusch Canettieri. Evolução das famílias gênicas de receptores olfatórios, CAZymes e peptidases em moscas Calliphoridae. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, . Início: 2022.
Orientador: Tatiana Teixeira Torres.
5.   Debora Pagliuso. . Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo, FUSP - Fundação de Apoio à Universidade de São Paulo.. Início: 2022.
Supervisor: Marcos Silveira Buckeridge.
6.   Dora Takyia Bonadio. Descrição de nova partícula viral encontrada em linhagem fitopatogênica de Xanthomonas albilineans.. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências (USP), Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2022.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
7.   Fabio Nunes de Mello. Análise dos mecanismos de regulação transcricional mediados pelo lincRNA PVT1 em modelo de câncer de próstata.. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2022.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
8.   Felipe James de Almeida Vasquez. Pequenos Compostos Moleculares direcionados a RNAs Longos não Codificadores como Terapia. Tese (Doutorado em Genética) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto - USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2022.
Orientador: Silvana Giuliatti.
9.   Fernanda Mendes de Rezende. . Universidade de São Paulo, Projetos Integrados de Pesquisa em Áreas Estratégicas.. Início: 2022.
Supervisor: Marcos Silveira Buckeridge.
10.   Fábio Pinato Sato. Serotonina, ocitocina e arginina-vasopressina como biomarcadores de comportamento agressivo em pacientes com Transtorno do Espectro Autista. Tese (Doutorado em Psiquiatria) - Departamento de Psiquiatria da Faculdade de Medicina da USP, . Início: 2022.
Orientador: Helena Paula Brentani.
11.   Gabriel Pinheiro Strini Piedade. Análise do Grafo Neutral de Redes Booleanas. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2022.
Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto.
12.   Gabriela Gomes de Matos. ANÁLISE ECOFISIOLÓGICA DO JERIVÁ (Syagrus romanzoffiana (Cham.) Glassman). Iniciação científica (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de São Paulo, . Início: 2022.
Orientador: Marcos Silveira Buckeridge.
13.   Gianluca Major Machado da Silva. Análise de peptídeos obtidos por phage display. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2022.
Orientador: Joao Carlos Setubal.
14.   Grayce Hellen Romim Silva. O papel da ?-1,3 glucanase (GH17) na formação do aerênquima na raiz da cana-de-açúcar. Orientação de outra natureza. Universidade de São Paulo. Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, . Início: 2022.
Orientador: Marcos Silveira Buckeridge.
15.   Guilherme Yudi Aiabe Sagawa. Xanthomonas albilineans e Gluconacetobacter diazotrophicus: influência no microbioma da cana de açúcar. Iniciação científica (Graduando em Ciências Moleculares) - Instituto de Biociências (USP), . Início: 2022.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
16.   Janaina da Silva Fortirer. Bioinformática e modelagem estátistica do impacto das mudanças climáticas na produção de soja no Brasil. Orientação de outra natureza. Universidade de São Paulo. Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, . Início: 2022.
Orientador: Marcos Silveira Buckeridge.
17.   João Paulo Facio de Almeida. Identificação de sítios de processamento da RNAse VNG1503 em Halobacterium salinarum. Dissertação (Mestrado profissional em Bioquímica) - Universidade de São Paulo, . Início: 2022.
Orientador: Tie Koide.
18.   Juan Pablo Portilla Llerena. . Universidade de São Paulo., . Início: 2022.
Supervisor: Marcos Silveira Buckeridge.
19.   Larissa Fernanda Quintino. Identificação e análise de expressão de bactéria endofítica isolada de cana de açúcar.. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Instituto de Biociências (USP), . Início: 2022.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
20.   Levy Bueno Alves. Ensaios Estruturais sobre o Mecanismo de Ativação e Inativação das Rab GTPases. Tese (Doutorado em Genética) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto - USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2022.
Orientador: Silvana Giuliatti.
21.   Lucas Farina Lima. Papel regulatório dos elementos transponíveis sobre a rede de coexpressão gênica na Doença de Alzheimer. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2022.
Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto.
22.   Luiza Gomes de Oliveira. EVOLUÇÃO NO NÚMERO DE CÓPIAS DO GENE DA AMILASE SALIVAR EM POPULAÇÕES NATIVAS AMERICANAS COM DIFERENTES MODOS DE SUBSISTÊNCIA. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2022.
Orientador: Tabita Hunemeier.
23.   Luiza Helena Halas Covre. A participação do estresse crônico na disfunção mitocondrial observada na depressão e em modelo de isolamento social. Tese (Doutorado em Farmacologia) - Universidade de São Paulo. (Coorientador)., . Início: 2022.
Supervisor: Joao Carlos Setubal.
24.   Marcos Freitas Parra. Modeling Biological Systems from Single Cell Sequencing Data. Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2022.
Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto.
25.   Maria Júlia Pasian Ferreira. Produção heteróloga de arabinofuranosidase de cana-de-açúcar em Pichia pastoris para a fabricação de bioetanol de segunda geração. Iniciação científica (Graduando em Ciências Biológicas) - Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo, . Início: 2022.
Orientador: Marcos Silveira Buckeridge.
26.   Maria Laura Gabriel Kuniyoshi. Avaliacao de COVID19 na gestação e neurodesenvolvimento usando Bioinformatica. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Instituto de Matemática e Estatística da Universidade de São Paulo, . Início: 2022.
Orientador: Helena Paula Brentani.
27.   Miguel Pereira Ostrowski. Caracterização Topológica de Dinâmica de Redes Biológicas Modeladas por Redes Booleanas. Iniciação científica (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2022.
Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto.
28.   Naiara Almeida de Toledo. Capacitação em técnicas moleculares e crescimento controlado de plantas. Orientação de outra natureza. Instituto de Biociências (USP), . Início: 2022.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
29.   Nícolas Quessada Gimenes. Atualização da ferramenta BioNetStat.. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2022.
Orientador: Marcos Silveira Buckeridge.
30.   Rafael Mecheseregian Razeira. Inteligência Artificial Explicável aplicada a decisões judiciais relacionadas ao Transtorno do Espectro Autista. Dissertação (Mestrado em Computação Aplicada) - Universidade de São Paulo, . Início: 2022.
Orientador: Cléver Ricardo Guareis de Farias.
31.   Rafael Teixeira do Nascimento. Análise de expressão de pequenas ORFs em eucariotos. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2022.
Orientador: Joao Carlos Setubal.
32.   Rafaela Reis Vieira. Investigação dos mecanismos moleculares de ação de RNAs nãocodificadores longos oncogênicos expressos em tumores de pâncreas. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2022.
Orientador: Eduardo Moraes Rego Reis.
33.   Rauni Borges Marques. Construção e anotação funcional de redes de interações do ceRNoma no câncer de pâncreas. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2022.
Orientador: Eduardo Moraes Rego Reis.
34.   Thayariane Lira Mendes. Programação epigenética associada à exposição ao estresse gestacional e suas implicações sobre desfechos do neurodesenvolvimento. Dissertação (Mestrado profissional em pós-graduação) - Departamento de Psiquiatria da Faculdade de Medicina da USP, . Início: 2022.
Orientador: Helena Paula Brentani.
35.   Willian Liu. Desenvolvimento de uma aplicação de recomendação móvel sensível ao contexto. Iniciação científica (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2022.
Orientador: Cléver Ricardo Guareis de Farias.

2021

1.   Alexandre Junio Borges Araujo. Alterações na síntese de parede celular de cana-de-açúcar (Saccharum spp.) mediadas pelos efeitos das mudanças climáticas.. Tese (Doutorado em Interunidades em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, . Início: 2021.
Orientador: Marcos Silveira Buckeridge.
2.   Ana Luisa Rodrigues de Avila. Análise do Comportamento Dinâmico na Interface entre Polimorfismos do Hospedeiro e Variantes do SARS-CoV2. Dissertação (Mestrado em Genética) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto - USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2021.
Orientador: Silvana Giuliatti.
3.   Camilla de Oliveira Fonseca. a ser definido. Iniciação científica (Graduando em Estatística) - Universidade de São Paulo, Pró-Reitoria de Pesquisa da USP. Início: 2021.
Orientador: André Fujita.
4.   Caroline Perez Camilo. . Departamento de Psiquiatria da Faculdade de Medicina da USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.. Início: 2021.
Supervisor: Helena Paula Brentani.
5.   Catarina dos Santos Gomes. Determinação do risco poligênico para caracterização de exposição ao estresse gestacional. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Instituto de Matemática e Estatística da Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2021.
Orientador: Helena Paula Brentani.
6.   Daniel Cunha Oliveira. a ser definido. Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2021.
Orientador: André Fujita.
7.   Daniel Oliveira Dantas. . Universidade de São Paulo, Pró-Reitoria de Pesquisa da USP.. Início: 2021.
Supervisor: André Fujita.
8.   Davi Salles Xavier. Análises metabólicas, genômicas e evolutivas das proteínas de superfície de importância na relação patógeno-hospedeiro em organismos do filo Euglenozoa. Tese (Doutorado em Ciência (Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro)) - Departamento de Parasitologia do Instituto de Ciências Biomédicas da USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2021.
Orientador: Joao Marcelo Pereira Alves.
9.   Diniz Lima Ferreira. Evolução e sequenciamento para entender a especialização trófica em moscas varejeiras. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2021.
Orientador: Tatiana Teixeira Torres.
10.   Débora Guerra Peixe. Systems Immunology of rheumatic autoimmune inflammatory diseases. Tese (Doutorado em Farmácia (Fisiopatologia e Toxicologia)) - Universidade de São Paulo, . Início: 2021.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.
11.   Eduarda Figueiredo Ribeiro. Análise do impacto de genes presentes em elementos genéticos móveis do genoma de Xanthomonas albilineans em seus perfis patogênicos. Iniciação científica (Graduando em Ciências Biomédicas) - Instituto de Ciência Biomédicas (USP), . Início: 2021.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
12.   Guillermo Uceda Campos. Sistemas bacterianos de defesa contra bacteriófagos. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Coorientador).. Início: 2021.
Supervisor: Joao Carlos Setubal.
13.   Heitor Baldo. a ser definido. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Coorientador).. Início: 2021.
Supervisor: André Fujita.
14.   Ilyas Grandguillaume. Development of new bioinformatics approaches for designing antibodies adapted to different physico-chemical contexts in targeting viral molecules. Application to flavivirus family.. Tese (Doutorado em BioSpc) - Université Paris Diderot, Agence Nationale de la Recherche. (Coorientador).. Início: 2021.
Supervisor: Fernando Luis Barroso da Silva.
15.   Joel Nunes Junior. Detecção e quantificação de long non-coding RNA e elementos de transposição em experimento piloto da interação cana e Xanthomonas albilineans. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Instituto de Biociências (USP), Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2021.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
16.   Jonathan Peña Ávila. Análise Integrativa de perfis transcriptômicos de pacientes com COVID-19 usando Biologia de Sistemas. Tese (Doutorado em Farmácia (Fisiopatologia e Toxicologia)) - Universidade de São Paulo, . Início: 2021.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.
17.   Leonardo Sanches. Anotação funcional de RNAs não codificadores em tumores humanos através de redes de coexpressão. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2021.
Orientador: Eduardo Moraes Rego Reis.
18.   Letícia Chiara Baldassio de Paula. Genomic signature of trophic specialization. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2021.
Orientador: Tatiana Teixeira Torres.
19.   Liseth Urpy Segundo Carpio. Abordagem computacional para medir a empatia por meio de gestos e posturas corporais de duas pessoas em vídeos e sua aplicação na análise de sessões de psicoterapia. Tese (Doutorado em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo, . Início: 2021.
Orientador: Ariane Machado Lima.
20.   Lucas de Matos Vasconcelos. Análise de textos de diálogos para mensuracão de empatia. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2021.
Orientador: Ariane Machado Lima.
21.   Lucas Nunes Sequeira. Identificação de comportamentos complexos. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2021.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
22.   Lyang Higa Cano. Plasmodium ubiquitin proteasome system network. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2021.
Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto.
23.   Marcelo Henrique de Paula dos Santos. Bancos de dados e aprendizado de máquina. Dissertação (Mestrado profissional em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2021.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
24.   Marcelo Meireles dos Santos. . Universidade de São Paulo, Pró-Reitoria de Pesquisa da USP.. Início: 2021.
Supervisor: André Fujita.
25.   Marcos Severo. . Universidade de São Paulo, Pró-Reitoria de Pesquisa da USP.. Início: 2021.
Supervisor: André Fujita.
26.   Marina Cristina Blume. Estudo transversal retrospectivo sobre o impacto da pandemia de COVID-19 nas notificações e mortes por tuberculose no estado de São Paulo. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2021.
Orientador: Ana Marcia de Sá Guimarães.
27.   Mario Muramatsu Junior. a ser definicido. Dissertação (Mestrado profissional em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2021.
Orientador: André Fujita.
28.   Mauro de Medeiros Oliveira. Bioinformática de Cana de Açúcar. Orientação de outra natureza. Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo. Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, . Início: 2021.
Orientador: Marcos Silveira Buckeridge.
29.   Mayerli Tatiana Borbón Cortés. Diversidade e interação de bactérias associadas a psilídeos e plantas hospedeiras. Tese (Doutorado em Entomologia) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Coorientador).. Início: 2021.
Supervisor: Joao Carlos Setubal.
30.   Omar Rodrigues da Silva. Reconhecimento de padrões de som em sessões de psicoterapia. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2021.
Orientador: Ariane Machado Lima.
31.   Paulo de Paiva Rosa Amaral. . Universidade de São Paulo., . Início: 2021.
Supervisor: Helder Takashi Imoto Nakaya.
32.   Pedro Mariano Martins. Seleção Natural nos Genomas e Transcriptomas de Moscas Varejeiras. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2021.
Orientador: Tatiana Teixeira Torres.
33.   Raphael Salles Scortegagna de Medeiros. Computer vision approaches for medical images. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2021.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.
34.   Rauni Borges Marques. Structural Bioinformatic Studies of Flaviviruses envelope proteins and their Molecular Interactions. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2021.
Orientador: Fernando Luis Barroso da Silva.
35.   Rayanna dos Santos Feltrin. Análise de Genes de Reparo Celular. Tese (Doutorado em Interunidades em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Coorientador).. Início: 2021.
Supervisor: Alan Mitchell Durham.
36.   Robson Pontes de Oliveira. Análise global de MAGs. Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa ao Desenvolv. Científico e Tecnológico - MA. Início: 2021.
Orientador: Joao Carlos Setubal.
37.   Shantanu Gupta. . Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.. Início: 2021.
Supervisor: Ronaldo Fumio Hashimoto.
38.   Suzana Eiko Guima. Análise de genomas montados a partir de metagenomas. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo. (Coorientador)., Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2021.
Orientadores: Aline Maria da Silva, Joao Carlos Setubal.
39.   Thalles Souza-Lopes. Identificação de RNAs longos não-codificadores envolvidos no programa de regulação do desenvolvimento celular de trofoblastos humanos. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2021.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
40.   Verônica Luiza Vale Euclydes Colovati. . Faculdade de Medicina da USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.. Início: 2021.
Supervisor: Helena Paula Brentani.
41.   Victor Chavauty Villela. a ser definido. Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2021.
Orientador: André Fujita.

2020

1.   Amanda Pereira Vasconcelos. Integração de dados de transcriptoma com dados clínicos e imunológicos. Tese (Doutorado em Farmácia (Fisiopatologia e Toxicologia)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2020.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.
2.   Ana Beatriz Stein Machado Ferretti. Conteúdo molecular, padrões de modificações epigenéticas e interferência dos cromossomos supranumerários em Drosophila melanogaster. Tese (Doutorado em Ciencias Biologicas (Genetica)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Coorientador).. Início: 2020.
Supervisor: Maria Dulcetti Vibranovski.
3.   André Tomas Vilela Hermann. Desenvolvimento de Promotores Sintéticos para Cana de Açuar. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo. (Coorientador)., . Início: 2020.
Supervisor: Alan Mitchell Durham.
4.   Antonia Beatriz da Silva Sousa. Avaliação do nível de expressão da proteína OGT na placenta em relação ao sexo do embrião.. Iniciação científica (Graduando em Iniciação Cientifica) - Departamento de Psiquiatria da Faculdade de Medicina da USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2020.
Orientador: Helena Paula Brentani.
5.   Ariosvaldo Pereira dos Santos Junior. Caracterização molecular de bacteriófagos de Pseudomonas aeruginosa e dos determinantes de interação fago-bactéria. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, . Início: 2020.
Orientador: Aline Maria da Silva.
6.   Arthur Peixoto Berselli. ESTUDO DA COLONIZAÇÃO DE DIFERENTES VARIANTES DE XANTHOMONAS ALBILINEANS ?EM ?SACCHARUM ?SPP. Dissertação (Mestrado em Pos Graduação em Botânica) - Instituto de Biociências, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2020.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
7.   Beatriz Adas Picinato. IDENTIFICAÇÃO E COMPARAÇÃO DE RNAS CIRCULARES EM DADOS DE TRANSCRITOMA DE ARQUEIAS. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2020.
Orientador: Tie Koide.
8.   Camila Alves de Souza. Mapeamento e estudo de associação de Variações no Número de Cópias de DNA (CNVs) e de Regiões com Perda de Heterozigozidade (LOH) com Fenótipos Complexos. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Instituto de Matemática e Estatística, . Início: 2020.
Orientador: Júlia Maria Pavan Soler.
9.   Carolina Correa Giron. Desenvolvimento in Silico de Anticorpos para Inibição de Proteínas do SARS-CoV-2. Iniciação científica (Graduando em Medicina) - Universidade Federal do Triângulo Mineiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2020.
Orientador: Fernando Luis Barroso da Silva.
10.   Danilo Carlotti. . Universidade de São Paulo, Tribunal de Justiça de São Paulo.. Início: 2020.
Supervisor: João Eduardo Ferreira.
11.   Diego Trindade de Souza. . Universidade de São Paulo, Pró-Reitoria de Pesquisa da USP.. Início: 2020.
Supervisor: André Fujita.
12.   Fabio Rosindo Daher de Barros. Classificação multirrótulo. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2020.
Orientador: Ariane Machado Lima.
13.   Gustavo da Silveira Gomes. Herdabilidade multivariada. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Instituto de Matemática e Estatística, . Início: 2020.
Orientador: Júlia Maria Pavan Soler.
14.   Heber Gustavo Xavier de Castro. Geração de consultas SPARQL a partir de linguagem natural. Dissertação (Mestrado em Computação Aplicada) - Universidade de São Paulo, . Início: 2020.
Orientador: Cléver Ricardo Guareis de Farias.
15.   Heitor Baldo. a ser definido. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Coorientador).. Início: 2020.
Supervisor: André Fujita.
16.   Hermon Faria de Araújo. Abordagem computacional para quantificação de similaridade entre sequências emocionais a partir de expressões faciais e sua aplicação na análise de sessões de psicoterapia. Tese (Doutorado em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2020.
Orientador: Ariane Machado Lima.
17.   Juan Carlo Santos e Silva. Aplicação de Ferramentas Genômicas para o Estudo de Bases de Dados Epidemiológicos. Tese (Doutorado em Farmácia (Fisiopatologia e Toxicologia)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2020.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.
18.   Kaique Dias de Oliveira. Gene expression validation of genes related to the development and accumulation of biomass in sugarcane. Iniciação científica (Graduando em Química) - Instituto de Química - USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2020.
Orientador: Glaucia Mendes Souza.
19.   Kouao Jean Vincent Mea. Identificação de eventos complexos. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2020.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
20.   Lucas Ramalho Anderson. Comparações metodológicas na estimação da herdabilidade da expressão de genes HLA. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Instituto de Matemática e Estatística, . Início: 2020.
Orientador: Júlia Maria Pavan Soler.
21.   Luiz Fernando Cardoso dos Santos Durão. Desenvolvedor. Orientação de outra natureza. Universidade de São Paulo, . Início: 2020.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.
22.   Maria Gabriela Berzoti Coelho. . Instituto Butantan, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.. Início: 2020.
Supervisor: Sergio Verjovski Almeida.
23.   Maria Joana Nunes de Azevedo. Isolamento e caracterização genômica de fagos de Klebsiella pneumoniae com potencial de aplicação terapêutica. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2020.
Orientador: Aline Maria da Silva.
24.   Mauro Cafundó de Morais. . Universidade de São Paulo., . Início: 2020.
Supervisor: Helder Takashi Imoto Nakaya.
25.   Naiara Domingos da Silveira. Análise do acúmulo de açúcares mediante a alta expressão de ScRAV1 em cana-de-açúcar.. Orientação de outra natureza. Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo. Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, . Início: 2020.
Orientador: Marcos Silveira Buckeridge.
26.   Pedro Losco. . Universidade de São Paulo, Tribunal de Justiça de São Paulo.. Início: 2020.
Supervisor: João Eduardo Ferreira.
27.   Percy Omar Túllume Vergara. Genômica comparativa e filogenômica da seção Paraleishmania (gênero Endotrypanum). Tese (Doutorado em Ciência (Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro)) - Departamento de Parasitologia do Instituto de Ciências Biomédicas da USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2020.
Orientador: Joao Marcelo Pereira Alves.
28.   Robson Pontes de Oliveira. Estudo e comparação de genomas recuperados de metagenomas. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo. (Coorientador)., . Início: 2020.
Supervisor: Aline Maria da Silva.
29.   Ronaldo Nogueira de Sousa. Seleção Bayesiana de modelos dinâmicos de vias não isoladas de sinalização celular.. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Coorientador).. Início: 2020.
Supervisor: Ronaldo Fumio Hashimoto.
30.   Taiana Tainá Silva Pereira. Desenvolvimento de um modelo animal de infecção e doença por SARS-CoV-2 e ensaios pré-clínicos de candidatos vacinais.. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2020.
Orientador: Ana Marcia de Sá Guimarães.
31.   Tiago Lubiana Alves. Criando um grafo de conhecimento biológico através do Wikidata com foco no projeto Human Cell Atlas. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2020.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.
32.   Vinicius Mussak. Suporte à modelagem gráfica de consultas SPARQL. Dissertação (Mestrado em Computação Aplicada) - Universidade de São Paulo, . Início: 2020.
Orientador: Cléver Ricardo Guareis de Farias.
33.   Vitor Antonio Costa Zaninotto. Modelo transacional para tratamento de eventos complexos. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2020.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
34.   Ícaro Maia Santos de Castro. Interação de microrganismos e hospedeiros humanos associados ao desfecho clínico de pacientes com doenças infecciosas. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2020.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.

2019

1.   Adriana Grandis. . Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.. Início: 2019.
Supervisor: Marcos Silveira Buckeridge.
2.   Bruno Iha. Aprendizado de Máquina em Bioinformática. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2019.
Orientador: Joao Carlos Setubal.
3.   Bruno Viana Navarro. . Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior.. Início: 2019.
Supervisor: Marcos Silveira Buckeridge.
4.   Catia Michele Tondolo. Integração de bancos de dados em observações correlacionadas-. Tese (Doutorado em Estatística) - Instituto de Matemática e Estatística, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2019.
Orientador: Júlia Maria Pavan Soler.
5.   Denis Calandriello Calio. Plasticidade Fenotípica na Genitália de Machos de um Percevejo Neotropical (Hemiptera: Pentatomidae) em Resposta à Competição Espermática. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2019.
Orientador: Tatiana Teixeira Torres.
6.   Diana Suzana Martinez Corcino. Arquitetura molecular do Locus Xa21 em resposta à infecção por Xanthomonas em cana de açúcar. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2019.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
7.   Edinilza E. da S. Nardi. Limites da abordagem da Análise Retrospectiva. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2019.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
8.   Felipe Antonio Camoezi Silva. Avaliação de exossomos placentários de gestantes de um ensaio clínico randomizado para testar a efetividade de um programa intensivo de visita domicilia. Iniciação científica (Graduando em Iniciação Cientifica) - Faculdade de Medicina da USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2019.
Orientador: Helena Paula Brentani.
9.   Felipe de Oliveira Franco. Desenvolvimento de uma ferramenta de auxílio diagnóstico para o transtorno do espectro autista,. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Instituto de Matemática e Estatística da Universidade de São Paulo, . Início: 2019.
Orientador: Helena Paula Brentani.
10.   Fernando Pacheco Nobre Rossi. Busca de determinantes de especificidade de bacteriófagos de Pseudomonas aeruginosa. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2019.
Orientador: Aline Maria da Silva.
11.   Francisco Venicius Ferreria da Silva. Implementação CUDA de Modelos Probabilísticos. Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2019.
Orientador: Alan Mitchell Durham.
12.   Guillermo Uceda Campos. Desenvolvimento de uma ferramenta computacional para predição de sistemas de defesa anti-fagos em genomas e metagenomas. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2019.
Orientador: Aline Maria da Silva.
13.   Hector Montenegro Terceros. Reutilizando dicionários para aprofundar a interpretabilidade das definições. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2019.
Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto.
14.   Heitor Baldo. Heitor Baldo. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2019.
Orientador: Koichi Sameshima.
15.   Jeevan Giddaluru. Study of Transmission of Diseases Using Cell Phone from Infected People. Tese (Doutorado em Farmácia (Fisiopatologia e Toxicologia)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2019.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.
16.   Joana Teixeira Portolese Pascalicchio. Fatores Fenotípicos que contribuem para a gravidade no Transtorno do Espectro Autista. Dissertação (Mestrado em Mestrado) - Instituto de Psiquiatria do Hospital das Clinicas da FMUSP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2019.
Orientador: Helena Paula Brentani.
17.   Maiumy Maria Galvão Honda. Padrões de duplicação do genoma de Rhipicephalus microplus. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2019.
Orientador: Tatiana Teixeira Torres.
18.   Mauricio L. Casagrande. Comparação de redes de coexpressão gênica em circuitos neurais relacionados ao Transtorno Obsessivo Compulsivo. Dissertação (Mestrado em Bioinformatica) - Instituto de Matemática e Estatística da Universidade de São Paulo, . Início: 2019.
Orientador: Helena Paula Brentani.
19.   Rafael Luiz Testa. Síntese de expressões faciais com diferentes intensidades para representação de emoções. Tese (Doutorado em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Coorientador).. Início: 2019.
Supervisor: Ariane Machado Lima.
20.   Rodolfo Alvarenga Ribeiro. Genômica comparativa de Leptospira interrogais e outras espiroquetas. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Ciencias Biomedicas - USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2019.
Orientador: Robson Francisco de Souza.
21.   Rodrigo Alves Lima. Systematic Construction, Execution, and Reproduction of Complex Performance Benchmarks. Tese (Doutorado em Graduate in Computer Science) - Georgia Institute of Technology, Georgia Tech. (Coorientador).. Início: 2019.
Supervisor: João Eduardo Ferreira.
22.   Salvador Sánchez Vinces. Redes Neurais Gerativas Adversárias para uma abordagem multiômica e a sua aplicação no estudo do Complexo Mycobacterium tuberculosis. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo. (Coorientador)., . Início: 2019.
Supervisor: Ana Marcia de Sá Guimarães.
23.   Vanessa Escolano Maso. Meta-análise de redes gênicas associadas às infecções virais humanas. Tese (Doutorado em Farmácia (Fisiopatologia e Toxicologia)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2019.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.
24.   Vinicius Godoi Fernandes. Análise de conectividade cerebral em reabilitação. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2019.
Orientador: Koichi Sameshima.
25.   Youvika Singh. . Universidade de São Paulo., . Início: 2019.
Supervisor: Helder Takashi Imoto Nakaya.

2018

1.   Alicia Lie de Melo. Elementos regulatórios do metabolismo de carbono em cana-de-açúcar. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Coorientador).. Início: 2018.
Orientadores: Alan Mitchell Durham, Glaucia Mendes Souza.
2.   Aline Rodrigheri Ioste. Aprendizado Federado. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2018.
Orientador: Alan Mitchell Durham.
3.   Bruno Padilha. Computational Framework for Complex Events Detection and Handling in Automated Video Analysis. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, Fundação de Apoio à Universidade de São Paulo. Início: 2018.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
4.   Caio Matheus Prates Batalha Faria. a ser definido. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Coorientador).. Início: 2018.
Supervisor: André Fujita.
5.   Camila Araújo. Análise comparativa da maturação e do escape do fagossomo de diferentes espécies do complexo Mycobacterium tuberculosis em macrófagos.. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2018.
Orientador: Ana Marcia de Sá Guimarães.
6.   Camila Corradi. Análise da mutagênese basal e dos danos induzidos por luz UVA em células de pacientes com Xeroderma Pigmentosum Variante. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2018.
Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
7.   Camila Correia Avelino. Estudo da Inativação meiótica do cromossomo X através da análise de expressão de genes da espermatogênese de Drosophila melanogaster. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2018.
Orientador: Maria Dulcetti Vibranovski.
8.   Daisy Woellner Santos. Caracterização das proteínas de Schistosoma mansoni que são alvos da resposta de macacos rhesus que levam à auto-cura destes primatas. Tese (Doutorado em Quimica Bioquimica) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2018.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
9.   Dennis José da Silva. Árvores Morfológicas aplicadas a compressão e vetorização de imagens. Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2018.
Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto.
10.   Gilbert de Oliveira Silveira. Caracterização funcional de RNAs longos não codificadores em Schistosoma mansoni. Tese (Doutorado em Quimica Bioquimica) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2018.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
11.   Henrique Moura Dias. INVESTIGANDO OS ASPECTOS BIOLÓGICOS DE THI1 EM PLANTAS. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências, . Início: 2018.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
12.   Irina Yuri Kawashima. Host Prediction Based on Virus-host Genetic Features. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2018.
Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto.
13.   Lauana Pereira de Oliveira. Respostas mediadas por carboidratos durante o desenvolvimento da cana-de-açúcar frente às mudanças climáticas. Tese (Doutorado em Interunidades em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2018.
Orientador: Marcos Silveira Buckeridge.
14.   Luciane Santini. . Instituto de Química - USP., . Início: 2018.
Supervisor: Glaucia Mendes Souza.
15.   Maria Claudia Negret Lopez. Protein Docking Prediction using Graph Convolutional Networks. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2018.
Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto.
16.   Naila Cristina Soler Camargo. Análise genômica da diversidade genética intra-paciente de estirpes de Mycobacterium tuberculosis isoladas de granulomas humanos em diferentes estágios de desenvolvimento. Tese (Doutorado em Epidemiologia Experimental Aplicada Às Zoonoses) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2018.
Orientador: Ana Marcia de Sá Guimarães.
17.   Salvador Sánchez Vinces. Redes Neurais Generativas Adversárias para uma abordagem multiômica e a sua aplicação no estudo do Complexo Mycobacterium Tuberculosis. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2018.
Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto.
18.   Vanessa Araujo Soares da Cunha. Associação califorídeos-tripanosomatídeos e seus efeitos fenotípicos. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2018.
Orientador: Tatiana Teixeira Torres.
19.   Vania Gabriela Sedano. Metabolismo de sacarose e a interação planta microrganismos. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências, . Início: 2018.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
20.   Vitor Trinca. Replicação diferencial e transcrição nas glândulas salivares de Bradysia hygida (Diptera, Sciaridae).. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Coorientador).. Início: 2018.
Supervisor: Tatiana Teixeira Torres.
21.   Waldir Edson Farfan Caro. Implementando de Deep Learning no arcabouço probabilisitico ToPS. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2018.
Orientador: Alan Mitchell Durham.

2017

1.   Davi Mendes. ANÁLISE DO PAPEL DA ENDONUCLEASE XPG NA TRANSCRIÇÃO NUCLEAR E NA INTEGRIDADE DO GENOMA MITOCONDRIAL. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas - USP, . Início: 2017.
Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
2.   Eduardo Lira. A ser definido. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2017.
Orientador: André Fujita.
3.   Ester Risério Matos Bertoldi. Análise computacional de marcas epigenéticas associadas ao silenciamento de supressores tumorais no câncer de pâncreas. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2017.
Orientador: Eduardo Moraes Rego Reis.
4.   Francisco José de Almeida Fernandes. Determinação das regiões de dependência do genoma humano usando modelos com correlação entre indivíduos. Tese (Doutorado em Estatística) - Instituto de Matemática e Estatística, . Início: 2017.
Orientador: Júlia Maria Pavan Soler.
5.   Gabriel Torres G. Pato. Análise de mutações e suas correlações com fenótipos. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2017.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
6.   Hugo Kenji Pereira Harada. Equivalência entre Modelos de Equações Estruturais e da teoria da Resposta ao Item - Caso Longitudinal. Tese (Doutorado em Estatística) - Instituto de Matemática e Estatística, . Início: 2017.
Orientador: Júlia Maria Pavan Soler.
7.   Maira Rodrigues de Camargo Neves. Avaliação transcricional de células pluripotentes induzidas e neuro-precursoras provenientes de pacientes com síndrome de Cockayne após indução de dano ao DNA. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2017.
Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
8.   Mariana Verzaro. Efeitos do a?lcool sob condic?o?es de desafios cognitivos investigados por testes psicofi?sicos aplicados através de tecnologia móvel. Tese (Doutorado em Neurociências e Comportamento) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2017.
Orientador: Koichi Sameshima.
9.   Matheus Molina Silva. Impacto do ciclo circadiano no reparo e indução de danos no DNA por agentes quimioterápicos. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas - USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2017.
Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
10.   Nancy Lo Man Hung. Evolução e desenvolvimento de fiandeiras em aranhas (Arachnida: Araneae). Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2017.
Orientador: Tatiana Teixeira Torres.

2016

1.   David Abraham Morales Vicente. RNAs longos não-codificadores envolvidos na regulação do desenvolvimento embrionário. Tese (Doutorado em Quimica Bioquimica) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2016.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.


(*) Relatório criado com produções desde 2000 até 2024
Data de processamento: 22/04/2024 12:46:18