Programa de Pós Graduação em Bioinformática

Tese de doutorado


Número total de itens: 95

2023

1.   André Ferreira Cunha. Integration of publicly available multi-cohort human gut microbiome data for the stratification of patients with inflammatory bowel diseases. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2023.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.
2.   Gustavo Wenzel Sainatto. Predição de novos genes marcadores de câncer hereditário. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Universidade de São Paulo, . Início: 2023.
Orientador: Joao Carlos Setubal.
3.   Henry Bonilla Bruno. O papel dos territórios cromossômicos na evolução da regulação transcricional do cromossomo X durante a espermatogênese em Drosophila. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, . Início: 2023.
Orientador: Maria Dulcetti Vibranovski.
4.   Kevim Bordignon Guterres. Influência do cobre no aparecimento de persistência ou tolerância a drogas em e Mycobacterium tuberculosis e Mycobacterium africanum L6. Tese (Doutorado em Epidemiologia Experimental Aplicada Às Zoonoses) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2023.
Orientador: Ana Marcia de Sá Guimarães.
5.   Luciana Madanelo. "Stanford Social Dimensions Scale (SSDS): Confiabilidade, validação e aplicação". Tese (Doutorado em Psiquiatria) - Departamento de Psiquiatria da Faculdade de Medicina da USP, . Início: 2023.
Orientador: Helena Paula Brentani.
6.   Maria Eduarda Mazzi Esquinca. Avaliação funcional do papel de lncRNAs oncogênicos no adenocarcinoma pancreático ductal (PCA) através de abordagens ômicas integrativas. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, . Início: 2023.
Orientador: Eduardo Moraes Rego Reis.
7.   Tiago Silva Oliveira. Estudos sobre a interação de fagos-Xanthomonas citri. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2023.
Orientador: Aline Maria da Silva.

2022

1.   Adriana Simizo. Transcriptômica espacial como ferramenta complementar prognóstica do câncer de mama. Tese (Doutorado em Ciências da Saúde) - Instituto Israelita de Ensino e Pesquisa Albert Einstein, . Início: 2022.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.
2.   Felipe James de Almeida Vasquez. Pequenos Compostos Moleculares direcionados a RNAs Longos não Codificadores como Terapia. Tese (Doutorado em Genética) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto - USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2022.
Orientador: Silvana Giuliatti.
3.   Fábio Pinato Sato. Serotonina, ocitocina e arginina-vasopressina como biomarcadores de comportamento agressivo em pacientes com Transtorno do Espectro Autista. Tese (Doutorado em Psiquiatria) - Departamento de Psiquiatria da Faculdade de Medicina da USP, . Início: 2022.
Orientador: Helena Paula Brentani.
4.   Gianluca Major Machado da Silva. Análise de peptídeos obtidos por phage display. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2022.
Orientador: Joao Carlos Setubal.
5.   Levy Bueno Alves. Ensaios Estruturais sobre o Mecanismo de Ativação e Inativação das Rab GTPases. Tese (Doutorado em Genética) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto - USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2022.
Orientador: Silvana Giuliatti.
6.   Luiza Helena Halas Covre. A participação do estresse crônico na disfunção mitocondrial observada na depressão e em modelo de isolamento social. Tese (Doutorado em Farmacologia) - Universidade de São Paulo. (Coorientador)., . Início: 2022.
Supervisor: Joao Carlos Setubal.
7.   Marcos Freitas Parra. Modeling Biological Systems from Single Cell Sequencing Data. Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2022.
Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto.
8.   Maria Laura Gabriel Kuniyoshi. Avaliacao de COVID19 na gestação e neurodesenvolvimento usando Bioinformatica. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Instituto de Matemática e Estatística da Universidade de São Paulo, . Início: 2022.
Orientador: Helena Paula Brentani.
9.   Rafael Teixeira do Nascimento. Análise de expressão de pequenas ORFs em eucariotos. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2022.
Orientador: Joao Carlos Setubal.
10.   Rafaela Reis Vieira. Investigação dos mecanismos moleculares de ação de RNAs nãocodificadores longos oncogênicos expressos em tumores de pâncreas. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2022.
Orientador: Eduardo Moraes Rego Reis.
11.   Rauni Borges Marques. Construção e anotação funcional de redes de interações do ceRNoma no câncer de pâncreas. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2022.
Orientador: Eduardo Moraes Rego Reis.

2021

1.   Alexandre Junio Borges Araujo. Alterações na síntese de parede celular de cana-de-açúcar (Saccharum spp.) mediadas pelos efeitos das mudanças climáticas.. Tese (Doutorado em Interunidades em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, . Início: 2021.
Orientador: Marcos Silveira Buckeridge.
2.   Catarina dos Santos Gomes. Determinação do risco poligênico para caracterização de exposição ao estresse gestacional. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Instituto de Matemática e Estatística da Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2021.
Orientador: Helena Paula Brentani.
3.   Daniel Cunha Oliveira. a ser definido. Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2021.
Orientador: André Fujita.
4.   Davi Salles Xavier. Análises metabólicas, genômicas e evolutivas das proteínas de superfície de importância na relação patógeno-hospedeiro em organismos do filo Euglenozoa. Tese (Doutorado em Ciência (Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro)) - Departamento de Parasitologia do Instituto de Ciências Biomédicas da USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2021.
Orientador: Joao Marcelo Pereira Alves.
5.   Diniz Lima Ferreira. Evolução e sequenciamento para entender a especialização trófica em moscas varejeiras. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2021.
Orientador: Tatiana Teixeira Torres.
6.   Débora Guerra Peixe. Systems Immunology of rheumatic autoimmune inflammatory diseases. Tese (Doutorado em Farmácia (Fisiopatologia e Toxicologia)) - Universidade de São Paulo, . Início: 2021.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.
7.   Guillermo Uceda Campos. Sistemas bacterianos de defesa contra bacteriófagos. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Coorientador).. Início: 2021.
Supervisor: Joao Carlos Setubal.
8.   Heitor Baldo. a ser definido. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Coorientador).. Início: 2021.
Supervisor: André Fujita.
9.   Ilyas Grandguillaume. Development of new bioinformatics approaches for designing antibodies adapted to different physico-chemical contexts in targeting viral molecules. Application to flavivirus family.. Tese (Doutorado em BioSpc) - Université Paris Diderot, Agence Nationale de la Recherche. (Coorientador).. Início: 2021.
Supervisor: Fernando Luis Barroso da Silva.
10.   Jonathan Peña Ávila. Análise Integrativa de perfis transcriptômicos de pacientes com COVID-19 usando Biologia de Sistemas. Tese (Doutorado em Farmácia (Fisiopatologia e Toxicologia)) - Universidade de São Paulo, . Início: 2021.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.
11.   Leonardo Sanches. Anotação funcional de RNAs não codificadores em tumores humanos através de redes de coexpressão. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2021.
Orientador: Eduardo Moraes Rego Reis.
12.   Letícia Chiara Baldassio de Paula. Genomic signature of trophic specialization. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2021.
Orientador: Tatiana Teixeira Torres.
13.   Liseth Urpy Segundo Carpio. Abordagem computacional para medir a empatia por meio de gestos e posturas corporais de duas pessoas em vídeos e sua aplicação na análise de sessões de psicoterapia. Tese (Doutorado em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo, . Início: 2021.
Orientador: Ariane Machado Lima.
14.   Mayerli Tatiana Borbón Cortés. Diversidade e interação de bactérias associadas a psilídeos e plantas hospedeiras. Tese (Doutorado em Entomologia) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Coorientador).. Início: 2021.
Supervisor: Joao Carlos Setubal.
15.   Raphael Salles Scortegagna de Medeiros. Computer vision approaches for medical images. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2021.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.
16.   Rauni Borges Marques. Structural Bioinformatic Studies of Flaviviruses envelope proteins and their Molecular Interactions. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2021.
Orientador: Fernando Luis Barroso da Silva.
17.   Rayanna dos Santos Feltrin. Análise de Genes de Reparo Celular. Tese (Doutorado em Interunidades em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Coorientador).. Início: 2021.
Supervisor: Alan Mitchell Durham.
18.   Suzana Eiko Guima. Análise de genomas montados a partir de metagenomas. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo. (Coorientador)., Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2021.
Orientadores: Aline Maria da Silva, Joao Carlos Setubal.
19.   Thalles Souza-Lopes. Identificação de RNAs longos não-codificadores envolvidos no programa de regulação do desenvolvimento celular de trofoblastos humanos. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2021.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.

2020

1.   Amanda Pereira Vasconcelos. Integração de dados de transcriptoma com dados clínicos e imunológicos. Tese (Doutorado em Farmácia (Fisiopatologia e Toxicologia)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2020.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.
2.   Ana Beatriz Stein Machado Ferretti. Conteúdo molecular, padrões de modificações epigenéticas e interferência dos cromossomos supranumerários em Drosophila melanogaster. Tese (Doutorado em Ciencias Biologicas (Genetica)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Coorientador).. Início: 2020.
Supervisor: Maria Dulcetti Vibranovski.
3.   Ariosvaldo Pereira dos Santos Junior. Caracterização molecular de bacteriófagos de Pseudomonas aeruginosa e dos determinantes de interação fago-bactéria. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, . Início: 2020.
Orientador: Aline Maria da Silva.
4.   Beatriz Adas Picinato. IDENTIFICAÇÃO E COMPARAÇÃO DE RNAS CIRCULARES EM DADOS DE TRANSCRITOMA DE ARQUEIAS. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2020.
Orientador: Tie Koide.
5.   Heitor Baldo. a ser definido. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Coorientador).. Início: 2020.
Supervisor: André Fujita.
6.   Hermon Faria de Araújo. Abordagem computacional para quantificação de similaridade entre sequências emocionais a partir de expressões faciais e sua aplicação na análise de sessões de psicoterapia. Tese (Doutorado em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2020.
Orientador: Ariane Machado Lima.
7.   Juan Carlo Santos e Silva. Aplicação de Ferramentas Genômicas para o Estudo de Bases de Dados Epidemiológicos. Tese (Doutorado em Farmácia (Fisiopatologia e Toxicologia)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2020.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.
8.   Maria Joana Nunes de Azevedo. Isolamento e caracterização genômica de fagos de Klebsiella pneumoniae com potencial de aplicação terapêutica. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2020.
Orientador: Aline Maria da Silva.
9.   Percy Omar Túllume Vergara. Genômica comparativa e filogenômica da seção Paraleishmania (gênero Endotrypanum). Tese (Doutorado em Ciência (Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro)) - Departamento de Parasitologia do Instituto de Ciências Biomédicas da USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2020.
Orientador: Joao Marcelo Pereira Alves.
10.   Ronaldo Nogueira de Sousa. Seleção Bayesiana de modelos dinâmicos de vias não isoladas de sinalização celular.. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Coorientador).. Início: 2020.
Supervisor: Ronaldo Fumio Hashimoto.
11.   Taiana Tainá Silva Pereira. Desenvolvimento de um modelo animal de infecção e doença por SARS-CoV-2 e ensaios pré-clínicos de candidatos vacinais.. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2020.
Orientador: Ana Marcia de Sá Guimarães.
12.   Tiago Lubiana Alves. Criando um grafo de conhecimento biológico através do Wikidata com foco no projeto Human Cell Atlas. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2020.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.
13.   Ícaro Maia Santos de Castro. Interação de microrganismos e hospedeiros humanos associados ao desfecho clínico de pacientes com doenças infecciosas. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2020.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.

2019

1.   Bruno Iha. Aprendizado de Máquina em Bioinformática. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2019.
Orientador: Joao Carlos Setubal.
2.   Catia Michele Tondolo. Integração de bancos de dados em observações correlacionadas-. Tese (Doutorado em Estatística) - Instituto de Matemática e Estatística, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2019.
Orientador: Júlia Maria Pavan Soler.
3.   Denis Calandriello Calio. Plasticidade Fenotípica na Genitália de Machos de um Percevejo Neotropical (Hemiptera: Pentatomidae) em Resposta à Competição Espermática. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2019.
Orientador: Tatiana Teixeira Torres.
4.   Diana Suzana Martinez Corcino. Arquitetura molecular do Locus Xa21 em resposta à infecção por Xanthomonas em cana de açúcar. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2019.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
5.   Felipe de Oliveira Franco. Desenvolvimento de uma ferramenta de auxílio diagnóstico para o transtorno do espectro autista,. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Instituto de Matemática e Estatística da Universidade de São Paulo, . Início: 2019.
Orientador: Helena Paula Brentani.
6.   Fernando Pacheco Nobre Rossi. Busca de determinantes de especificidade de bacteriófagos de Pseudomonas aeruginosa. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2019.
Orientador: Aline Maria da Silva.
7.   Guillermo Uceda Campos. Desenvolvimento de uma ferramenta computacional para predição de sistemas de defesa anti-fagos em genomas e metagenomas. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2019.
Orientador: Aline Maria da Silva.
8.   Heitor Baldo. Heitor Baldo. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2019.
Orientador: Koichi Sameshima.
9.   Jeevan Giddaluru. Study of Transmission of Diseases Using Cell Phone from Infected People. Tese (Doutorado em Farmácia (Fisiopatologia e Toxicologia)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2019.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.
10.   Rafael Luiz Testa. Síntese de expressões faciais com diferentes intensidades para representação de emoções. Tese (Doutorado em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Coorientador).. Início: 2019.
Supervisor: Ariane Machado Lima.
11.   Rodolfo Alvarenga Ribeiro. Genômica comparativa de Leptospira interrogais e outras espiroquetas. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Ciencias Biomedicas - USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2019.
Orientador: Robson Francisco de Souza.
12.   Rodrigo Alves Lima. Systematic Construction, Execution, and Reproduction of Complex Performance Benchmarks. Tese (Doutorado em Graduate in Computer Science) - Georgia Institute of Technology, Georgia Tech. (Coorientador).. Início: 2019.
Supervisor: João Eduardo Ferreira.
13.   Salvador Sánchez Vinces. Redes Neurais Gerativas Adversárias para uma abordagem multiômica e a sua aplicação no estudo do Complexo Mycobacterium tuberculosis. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo. (Coorientador)., . Início: 2019.
Supervisor: Ana Marcia de Sá Guimarães.
14.   Vanessa Escolano Maso. Meta-análise de redes gênicas associadas às infecções virais humanas. Tese (Doutorado em Farmácia (Fisiopatologia e Toxicologia)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2019.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.
15.   Vinicius Godoi Fernandes. Análise de conectividade cerebral em reabilitação. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2019.
Orientador: Koichi Sameshima.

2018

1.   Alicia Lie de Melo. Elementos regulatórios do metabolismo de carbono em cana-de-açúcar. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Coorientador).. Início: 2018.
Orientadores: Alan Mitchell Durham, Glaucia Mendes Souza.
2.   Aline Rodrigheri Ioste. Aprendizado Federado. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2018.
Orientador: Alan Mitchell Durham.
3.   Bruno Padilha. Computational Framework for Complex Events Detection and Handling in Automated Video Analysis. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, Fundação de Apoio à Universidade de São Paulo. Início: 2018.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
4.   Caio Matheus Prates Batalha Faria. a ser definido. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Coorientador).. Início: 2018.
Supervisor: André Fujita.
5.   Camila Araújo. Análise comparativa da maturação e do escape do fagossomo de diferentes espécies do complexo Mycobacterium tuberculosis em macrófagos.. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2018.
Orientador: Ana Marcia de Sá Guimarães.
6.   Camila Corradi. Análise da mutagênese basal e dos danos induzidos por luz UVA em células de pacientes com Xeroderma Pigmentosum Variante. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2018.
Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
7.   Camila Correia Avelino. Estudo da Inativação meiótica do cromossomo X através da análise de expressão de genes da espermatogênese de Drosophila melanogaster. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2018.
Orientador: Maria Dulcetti Vibranovski.
8.   Daisy Woellner Santos. Caracterização das proteínas de Schistosoma mansoni que são alvos da resposta de macacos rhesus que levam à auto-cura destes primatas. Tese (Doutorado em Quimica Bioquimica) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2018.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
9.   Dennis José da Silva. Árvores Morfológicas aplicadas a compressão e vetorização de imagens. Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2018.
Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto.
10.   Gilbert de Oliveira Silveira. Caracterização funcional de RNAs longos não codificadores em Schistosoma mansoni. Tese (Doutorado em Quimica Bioquimica) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2018.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
11.   Henrique Moura Dias. INVESTIGANDO OS ASPECTOS BIOLÓGICOS DE THI1 EM PLANTAS. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências, . Início: 2018.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
12.   Irina Yuri Kawashima. Host Prediction Based on Virus-host Genetic Features. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2018.
Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto.
13.   Lauana Pereira de Oliveira. Respostas mediadas por carboidratos durante o desenvolvimento da cana-de-açúcar frente às mudanças climáticas. Tese (Doutorado em Interunidades em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2018.
Orientador: Marcos Silveira Buckeridge.
14.   Maria Claudia Negret Lopez. Protein Docking Prediction using Graph Convolutional Networks. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2018.
Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto.
15.   Naila Cristina Soler Camargo. Análise genômica da diversidade genética intra-paciente de estirpes de Mycobacterium tuberculosis isoladas de granulomas humanos em diferentes estágios de desenvolvimento. Tese (Doutorado em Epidemiologia Experimental Aplicada Às Zoonoses) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2018.
Orientador: Ana Marcia de Sá Guimarães.
16.   Salvador Sánchez Vinces. Redes Neurais Generativas Adversárias para uma abordagem multiômica e a sua aplicação no estudo do Complexo Mycobacterium Tuberculosis. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2018.
Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto.
17.   Vanessa Araujo Soares da Cunha. Associação califorídeos-tripanosomatídeos e seus efeitos fenotípicos. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2018.
Orientador: Tatiana Teixeira Torres.
18.   Vania Gabriela Sedano. Metabolismo de sacarose e a interação planta microrganismos. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências, . Início: 2018.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
19.   Vitor Trinca. Replicação diferencial e transcrição nas glândulas salivares de Bradysia hygida (Diptera, Sciaridae).. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Coorientador).. Início: 2018.
Supervisor: Tatiana Teixeira Torres.
20.   Waldir Edson Farfan Caro. Implementando de Deep Learning no arcabouço probabilisitico ToPS. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2018.
Orientador: Alan Mitchell Durham.

2017

1.   Davi Mendes. ANÁLISE DO PAPEL DA ENDONUCLEASE XPG NA TRANSCRIÇÃO NUCLEAR E NA INTEGRIDADE DO GENOMA MITOCONDRIAL. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas - USP, . Início: 2017.
Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
2.   Eduardo Lira. A ser definido. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2017.
Orientador: André Fujita.
3.   Ester Risério Matos Bertoldi. Análise computacional de marcas epigenéticas associadas ao silenciamento de supressores tumorais no câncer de pâncreas. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2017.
Orientador: Eduardo Moraes Rego Reis.
4.   Francisco José de Almeida Fernandes. Determinação das regiões de dependência do genoma humano usando modelos com correlação entre indivíduos. Tese (Doutorado em Estatística) - Instituto de Matemática e Estatística, . Início: 2017.
Orientador: Júlia Maria Pavan Soler.
5.   Hugo Kenji Pereira Harada. Equivalência entre Modelos de Equações Estruturais e da teoria da Resposta ao Item - Caso Longitudinal. Tese (Doutorado em Estatística) - Instituto de Matemática e Estatística, . Início: 2017.
Orientador: Júlia Maria Pavan Soler.
6.   Maira Rodrigues de Camargo Neves. Avaliação transcricional de células pluripotentes induzidas e neuro-precursoras provenientes de pacientes com síndrome de Cockayne após indução de dano ao DNA. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2017.
Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
7.   Mariana Verzaro. Efeitos do a?lcool sob condic?o?es de desafios cognitivos investigados por testes psicofi?sicos aplicados através de tecnologia móvel. Tese (Doutorado em Neurociências e Comportamento) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2017.
Orientador: Koichi Sameshima.
8.   Matheus Molina Silva. Impacto do ciclo circadiano no reparo e indução de danos no DNA por agentes quimioterápicos. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas - USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2017.
Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
9.   Nancy Lo Man Hung. Evolução e desenvolvimento de fiandeiras em aranhas (Arachnida: Araneae). Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2017.
Orientador: Tatiana Teixeira Torres.

2016

1.   David Abraham Morales Vicente. RNAs longos não-codificadores envolvidos na regulação do desenvolvimento embrionário. Tese (Doutorado em Quimica Bioquimica) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2016.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.


(*) Relatório criado com produções desde 2000 até 2024
Data de processamento: 22/04/2024 12:46:18