Programa de Pós Graduação em Bioinformática

Dissertação de mestrado


Número total de itens: 48

2025

1.   Guilherme Wenceslau de Lima Cardoso. Desvendando a interação entre bactérias e fagos por meio do monitoramento das alterações transcritômicas durante a infecção por fagos. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2025.
Orientador: Joao Carlos Setubal.

2024

1.   Agatha Morgana Bertoti da Silva. Influência da Exposição ao Cobre na Indução da Dormência e Estado Não-Replicativo em bactérias do complexo Mycobacterium tuberculosis. Dissertação (Mestrado profissional em Epidemiologia Experimental Aplicada Às Zoonoses) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: Ana Marcia de Sá Guimarães.
2.   Agustina Belén Pauer. Análise genômica comparativa do clado aquático para melhor compreensão da variabilidade e evolução no gênero Trypanosoma. Dissertação (Mestrado em Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro) - Departamento de Parasitologia do Instituto de Ciências Biomédicas da USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2024.
Orientador: Joao Marcelo Pereira Alves.
3.   Alice Bontempi Bispo. Homeostase do cobre em micobactérias tuberculosas e sua influência na susceptibilidade à moxifloxacina e à bedaquilina. Dissertação (Mestrado profissional em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2024.
Orientador: Ana Marcia de Sá Guimarães.
4.   Ana Luisa Elias Zavataro. Caracterização e correspondência genômica entre os gêneros de tripanossomatídeos Kentomonas sp. e comparação com outros organismos da subfamília Strigomonadinae. Dissertação (Mestrado em Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro) - Departamento de Parasitologia do Instituto de Ciências Biomédicas da USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2024.
Orientador: Joao Marcelo Pereira Alves.
5.   Anderson Cardoso Gonçalves. Algoritmos para exploração da matérias escura microbiana. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: Joao Carlos Setubal.
6.   Caio Felipe Freire de Sousa. Identificação de novos RNAs longos não codificadores em Schistosoma mansoni e mapeamento na versão 10 do genoma. Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2024.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
7.   Carmen Rodriguez Cueva. Filogenômica de Xanthomonas citri. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: Joao Carlos Setubal.
8.   Emanuell Rodrigues de Souza. Investigação do Imunometabolismo e Reprogramação Metabólica com scRNA-Seq no Câncer Pancreático. Dissertação (Mestrado profissional em Ciências da Saúde) - Instituto Israelita de Ensino e Pesquisa Albert Einstein, . Início: 2024.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.
9.   Felipe Antonio Camoezi Silva. Associação entre perfil inflamatório materno, número de exossomos placentários e desfechos de neurodesenvolvimento aos 12 meses de idade. Dissertação (Mestrado em pós-graduação) - Departamento de Psiquiatria da Faculdade de Medicina da USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2024.
Orientador: Helena Paula Brentani.
10.   Felipe Farinelli. Uso da inteligência artificial para o desenvolvimento de coqueteis enzimáticos para degradação de biomassa vegetal. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: Marcos Silveira Buckeridge.
11.   Fernanda Ferrari. Ferramenta para descoberta de novas CAZymes. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: Joao Carlos Setubal.
12.   Guilherme Wenceslau de Lima Cardoso. Monitoramento de alterações transcritômicas durante a infecção bacteriana por fagos.. Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: Aline Maria da Silva.
13.   Gustavo de Souza Morozi. Otimização de bancos de dados não relacionais para análise de dados. Dissertação (Mestrado profissional em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
14.   Isabel Cristine Costa Garcia. Aprendizado de máquina para possíveis drogas com ação em angiogênese. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo. (Coorientador)., . Início: 2024.
Supervisor: Joao Carlos Setubal.
15.   Jordana Luiza Caixeta. Uso de modelagem matemática para compreender os efeitos das Mudanças Climáticas Globais sobre a cultura de soja. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: Marcos Silveira Buckeridge.
16.   Luis David Pabon Rodriguez. Genômica de bactérias degradadoras de cianeto. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: Joao Carlos Setubal.
17.   Maria Giovana Cavalcante. Estruturas alternativas de DNA em Halobacterium salinarum: estudos in silico. Dissertação (Mestrado profissional em Bioquímica) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2024.
Orientador: Tie Koide.
18.   Marianna Arbia. Inteligência Artificial para Conformidade Ética (IACE): Assistente de Preparação para Submissão de Projetos ao Comitê de Ética usando LLM. Dissertação (Mestrado profissional em Ciências da Saúde) - Instituto Israelita de Ensino e Pesquisa Albert Einstein, . Início: 2024.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.
19.   Mateus Violante Pacheco. Engenharia de dados para processos de aprendizado profundo. Dissertação (Mestrado profissional em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
20.   Nathalia dos Santos Oliveira. RNAs internos: transcritomica comparativa em procariotos. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: Tie Koide.
21.   Santiago Ramos Fagundes. Engenharia de dados para análise de textos jurídicos. Dissertação (Mestrado profissional em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
22.   Sarah Peixoto Rodrigues Freire. Análise do Impacto da Obesidade nos Desfechos Clínicos Utilizando Machine Learning em Dados do MIMIC-IV. Dissertação (Mestrado profissional em Ciências da Saúde) - Instituto Israelita de Ensino e Pesquisa Albert Einstein, . Início: 2024.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.
23.   Vitoria Stavis de Araujo. Modelagem da Estrutura LILRB1 e Analise de sua interacao com SHP1. Dissertação (Mestrado em Pós graduacao em Bioinformatica) - Faculdade de Medicina de Ribeirao Preto, . Início: 2024.
Orientador: Silvana Giuliatti.
24.   Érico Tiago Meireles. Engenharia de dados para textos jurídicos. Dissertação (Mestrado profissional em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: João Eduardo Ferreira.

2023

1.   Bruna Sayuri Cardoso Ogusku. Grenômica comparativa de espécies de Acinetobacter. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas - USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2023.
Orientador: Robson Francisco de Souza.
2.   Chiara Mascitelli. Evolution of monogeny in Chrysomya albiceps. Dissertação (Mestrado profissional em EV - Evolutionary Biology) - Leiden University, . Início: 2023.
Orientador: Tatiana Teixeira Torres.
3.   Darion Samir Longhi Cervantes. Estudo do mecanismo de regulação pós-transcricional mediada por microRNAs na formação do aerênquima em raízes de cana-de-açúcar.. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Interunidades em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, . Início: 2023.
Orientador: Marcos Silveira Buckeridge.
4.   Francisco Alvaro Vasquez Cunya. Análise comparativa e bioinformática do genoma completo de um isolado pertencente ao gênero Sergeia. Dissertação (Mestrado em Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro) - Departamento de Parasitologia do Instituto de Ciências Biomédicas da USP, . Início: 2023.
Orientador: Joao Marcelo Pereira Alves.
5.   Ketly Naiany Almeida Nascimento. Associação entre estresse pré-natal materno e programação da metilação dos genes NR3C1, FKBP5 e OXTR e comprimento telomérico aos 12 meses de idade. Dissertação (Mestrado em pós-graduação) - Departamento de Psiquiatria da Faculdade de Medicina da USP, . Início: 2023.
Orientador: Helena Paula Brentani.
6.   Livia Cavalcanti de Morais Gama. Alterações da microbiota na infância contribuem para transtornos psíquicos na vida adulta?. Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformatica) - Instituto de Matemática e Estatística da Universidade de São Paulo. (Coorientador)., Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2023.
Orientadores: Helena Paula Brentani, Joao Carlos Setubal.
7.   Maiara Mascarenhas Moro Valenciano. Caracterização evolutiva e de rede dos genes envolvidos na resposta imune em mamíferos. Dissertação (Mestrado em Programa Interunidades de Pós-Graduação em Bioinformática) - Departamento de Parasitologia do Instituto de Ciências Biomédicas da USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2023.
Orientador: Joao Marcelo Pereira Alves.
8.   Matheus Farinaro Vesco. USO DE REDES ADVERSARIAIS GENERATIVAS PARA GERAÇÃO DE IMAGENS SINTÉTICAS DE TOMOGRAFIA COMPUTADORIZADA A PARTIR DE RADIOGRAFIAS CONVENCIONAIS. Dissertação (Mestrado profissional em Ciências da Saúde) - Instituto Israelita de Ensino e Pesquisa Albert Einstein, . Início: 2023.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.
9.   Rafaela Barberis Canjani. Descoberta de novas vias de síntese de antibióticos por análises in-silico. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2023.
Orientador: Robson Francisco de Souza.
10.   Thomas Wittmann Cezar Santos. Caracterização de proteínas de competição microbiana em archaeas. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2023.
Orientador: Robson Francisco de Souza.

2022

1.   Carolina Kurotusch Canettieri. Evolução das famílias gênicas de receptores olfatórios, CAZymes e peptidases em moscas Calliphoridae. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, . Início: 2022.
Orientador: Tatiana Teixeira Torres.
2.   Dora Takyia Bonadio. Descrição de nova partícula viral encontrada em linhagem fitopatogênica de Xanthomonas albilineans.. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências (USP), Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2022.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
3.   João Paulo Facio de Almeida. Identificação de sítios de processamento da RNAse VNG1503 em Halobacterium salinarum. Dissertação (Mestrado profissional em Bioquímica) - Universidade de São Paulo, . Início: 2022.
Orientador: Tie Koide.
4.   Lucas Farina Lima. Papel regulatório dos elementos transponíveis sobre a rede de coexpressão gênica na Doença de Alzheimer. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2022.
Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto.
5.   Luiza Gomes de Oliveira. EVOLUÇÃO NO NÚMERO DE CÓPIAS DO GENE DA AMILASE SALIVAR EM POPULAÇÕES NATIVAS AMERICANAS COM DIFERENTES MODOS DE SUBSISTÊNCIA. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2022.
Orientador: Tabita Hunemeier.
6.   Thayariane Lira Mendes. Programação epigenética associada à exposição ao estresse gestacional e suas implicações sobre desfechos do neurodesenvolvimento. Dissertação (Mestrado profissional em pós-graduação) - Departamento de Psiquiatria da Faculdade de Medicina da USP, . Início: 2022.
Orientador: Helena Paula Brentani.

2021

1.   Pedro Mariano Martins. Seleção Natural nos Genomas e Transcriptomas de Moscas Varejeiras. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2021.
Orientador: Tatiana Teixeira Torres.

2020

1.   André Tomas Vilela Hermann. Desenvolvimento de Promotores Sintéticos para Cana de Açuar. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo. (Coorientador)., . Início: 2020.
Supervisor: Alan Mitchell Durham.
2.   Camila Alves de Souza. Mapeamento e estudo de associação de Variações no Número de Cópias de DNA (CNVs) e de Regiões com Perda de Heterozigozidade (LOH) com Fenótipos Complexos. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Instituto de Matemática e Estatística, . Início: 2020.
Orientador: Júlia Maria Pavan Soler.
3.   Gustavo da Silveira Gomes. Herdabilidade multivariada. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Instituto de Matemática e Estatística, . Início: 2020.
Orientador: Júlia Maria Pavan Soler.
4.   Lucas Ramalho Anderson. Comparações metodológicas na estimação da herdabilidade da expressão de genes HLA. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Instituto de Matemática e Estatística, . Início: 2020.
Orientador: Júlia Maria Pavan Soler.

2019

1.   Francisco Venicius Ferreria da Silva. Implementação CUDA de Modelos Probabilísticos. Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2019.
Orientador: Alan Mitchell Durham.
2.   Maiumy Maria Galvão Honda. Padrões de duplicação do genoma de Rhipicephalus microplus. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2019.
Orientador: Tatiana Teixeira Torres.


(*) Relatório criado com produções desde 2000 até 2025
Data de processamento: 18/02/2025 12:52:38