Programa de Pós Graduação em Bioinformática

Dissertação de mestrado


Número total de itens: 57

2024

1.   Caio Felipe Freire de Sousa. Identificação de novos RNAs longos não codificadores em Schistosoma mansoni e mapeamento na versão 10 do genoma. Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2024.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
2.   Carmen Rodriguez Cueva. Filogenômica de Xanthomonas citri. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: Joao Carlos Setubal.
3.   Felipe Farinelli. Uso da inteligência artificial para o desenvolvimento de coqueteis enzimáticos para degradação de biomassa vegetal. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: Marcos Silveira Buckeridge.
4.   Fernanda Ferrari. Ferramenta para descoberta de novas CAZymes. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: Joao Carlos Setubal.
5.   Guilherme Wenceslau de Lima Cardoso. Monitoramento de alterações transcritômicas durante a infecção bacteriana por fagos.. Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: Aline Maria da Silva.
6.   Isabel Cristine Costa Garcia. Aprendizado de máquina para possíveis drogas com ação em angiogênese. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo. (Coorientador)., . Início: 2024.
Supervisor: Joao Carlos Setubal.
7.   Jordana Luiza Caixeta. Uso de modelagem matemática para compreender os efeitos das Mudanças Climáticas Globais sobre a cultura de soja. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: Marcos Silveira Buckeridge.
8.   Luis David Pabon Rodriguez. Genômica de bactérias degradadoras de cianeto. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: Joao Carlos Setubal.
9.   Maria Giovana Cavalcante. Estruturas alternativas de DNA em Halobacterium salinarum: estudos in silico. Dissertação (Mestrado profissional em Bioquímica) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2024.
Orientador: Tie Koide.
10.   Nathalia dos Santos Oliveira. RNAs internos: transcritomica comparativa em procariotos. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: Tie Koide.

2023

1.   Ana Julia Fonseca da Luz Giacometti Lemes. Créditos Voluntários de Biodiversidade como alternativa para a contribuição das cidades para as metas globais de biodiversidade. Dissertação (Mestrado profissional em Ambiente, Saúde e Sustentabilidade) - Universidade de São Paulo. Início: 2023.
Orientador: Marcos Silveira Buckeridge.
2.   Bruna Farias. Investigação da associação entre ancestralidade genética e mutações somáticas prevalentes em pacientes com adenocarcinoma de pâncreas da população brasileira. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2023.
Orientador: Eduardo Moraes Rego Reis.
3.   Bruna Sayuri Cardoso Ogusku. Grenômica comparativa de espécies de Acinetobacter. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas - USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2023.
Orientador: Robson Francisco de Souza.
4.   Chiara Mascitelli. Evolution of monogeny in Chrysomya albiceps. Dissertação (Mestrado profissional em EV - Evolutionary Biology) - Leiden University, . Início: 2023.
Orientador: Tatiana Teixeira Torres.
5.   Darion Samir Longhi Cervantes. Estudo do mecanismo de regulação pós-transcricional mediada por microRNAs na formação do aerênquima em raízes de cana-de-açúcar.. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Interunidades em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, . Início: 2023.
Orientador: Marcos Silveira Buckeridge.
6.   Francisco Alvaro Vasquez Cunya. Análise comparativa e bioinformática do genoma completo de um isolado pertencente ao gênero Sergeia. Dissertação (Mestrado em Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro) - Departamento de Parasitologia do Instituto de Ciências Biomédicas da USP, . Início: 2023.
Orientador: Joao Marcelo Pereira Alves.
7.   Ketly Naiany Almeida Nascimento. Associação entre estresse pré-natal materno e programação da metilação dos genes NR3C1, FKBP5 e OXTR e comprimento telomérico aos 12 meses de idade. Dissertação (Mestrado em pós-graduação) - Departamento de Psiquiatria da Faculdade de Medicina da USP, . Início: 2023.
Orientador: Helena Paula Brentani.
8.   Livia Cavalcanti de Morais Gama. Alterações da microbiota na infância contribuem para transtornos psíquicos na vida adulta?. Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformatica) - Instituto de Matemática e Estatística da Universidade de São Paulo. (Coorientador)., Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2023.
Orientadores: Helena Paula Brentani, Joao Carlos Setubal.
9.   Maiara Mascarenhas Moro Valenciano. Caracterização evolutiva e de rede dos genes envolvidos na resposta imune em mamíferos. Dissertação (Mestrado em Programa Interunidades de Pós-Graduação em Bioinformática) - Departamento de Parasitologia do Instituto de Ciências Biomédicas da USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2023.
Orientador: Joao Marcelo Pereira Alves.
10.   Matheus Farinaro Vesco. USO DE REDES ADVERSARIAIS GENERATIVAS PARA GERAÇÃO DE IMAGENS SINTÉTICAS DE TOMOGRAFIA COMPUTADORIZADA A PARTIR DE RADIOGRAFIAS CONVENCIONAIS. Dissertação (Mestrado profissional em Ciências da Saúde) - Instituto Israelita de Ensino e Pesquisa Albert Einstein, . Início: 2023.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.
11.   Rafaela Barberis Canjani. Descoberta de novas vias de síntese de antibióticos por análises in-silico. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2023.
Orientador: Robson Francisco de Souza.
12.   Thomas Wittmann Cezar Santos. Caracterização de proteínas de competição microbiana em archaeas. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2023.
Orientador: Robson Francisco de Souza.

2022

1.   Carolina Kurotusch Canettieri. Evolução das famílias gênicas de receptores olfatórios, CAZymes e peptidases em moscas Calliphoridae. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, . Início: 2022.
Orientador: Tatiana Teixeira Torres.
2.   Dora Takyia Bonadio. Descrição de nova partícula viral encontrada em linhagem fitopatogênica de Xanthomonas albilineans.. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências (USP), Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2022.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
3.   Fabio Nunes de Mello. Análise dos mecanismos de regulação transcricional mediados pelo lincRNA PVT1 em modelo de câncer de próstata.. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2022.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
4.   Gabriel Pinheiro Strini Piedade. Análise do Grafo Neutral de Redes Booleanas. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2022.
Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto.
5.   João Paulo Facio de Almeida. Identificação de sítios de processamento da RNAse VNG1503 em Halobacterium salinarum. Dissertação (Mestrado profissional em Bioquímica) - Universidade de São Paulo, . Início: 2022.
Orientador: Tie Koide.
6.   Larissa Fernanda Quintino. Identificação e análise de expressão de bactéria endofítica isolada de cana de açúcar.. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Instituto de Biociências (USP), . Início: 2022.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
7.   Lucas Farina Lima. Papel regulatório dos elementos transponíveis sobre a rede de coexpressão gênica na Doença de Alzheimer. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2022.
Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto.
8.   Luiza Gomes de Oliveira. EVOLUÇÃO NO NÚMERO DE CÓPIAS DO GENE DA AMILASE SALIVAR EM POPULAÇÕES NATIVAS AMERICANAS COM DIFERENTES MODOS DE SUBSISTÊNCIA. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2022.
Orientador: Tabita Hunemeier.
9.   Rafael Mecheseregian Razeira. Inteligência Artificial Explicável aplicada a decisões judiciais relacionadas ao Transtorno do Espectro Autista. Dissertação (Mestrado em Computação Aplicada) - Universidade de São Paulo, . Início: 2022.
Orientador: Cléver Ricardo Guareis de Farias.
10.   Thayariane Lira Mendes. Programação epigenética associada à exposição ao estresse gestacional e suas implicações sobre desfechos do neurodesenvolvimento. Dissertação (Mestrado profissional em pós-graduação) - Departamento de Psiquiatria da Faculdade de Medicina da USP, . Início: 2022.
Orientador: Helena Paula Brentani.

2021

1.   Joel Nunes Junior. Detecção e quantificação de long non-coding RNA e elementos de transposição em experimento piloto da interação cana e Xanthomonas albilineans. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Instituto de Biociências (USP), Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2021.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
2.   Lucas de Matos Vasconcelos. Análise de textos de diálogos para mensuracão de empatia. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2021.
Orientador: Ariane Machado Lima.
3.   Lucas Nunes Sequeira. Identificação de comportamentos complexos. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2021.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
4.   Lyang Higa Cano. Plasmodium ubiquitin proteasome system network. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2021.
Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto.
5.   Marcelo Henrique de Paula dos Santos. Bancos de dados e aprendizado de máquina. Dissertação (Mestrado profissional em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2021.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
6.   Marina Cristina Blume. Estudo transversal retrospectivo sobre o impacto da pandemia de COVID-19 nas notificações e mortes por tuberculose no estado de São Paulo. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2021.
Orientador: Ana Marcia de Sá Guimarães.
7.   Mario Muramatsu Junior. a ser definicido. Dissertação (Mestrado profissional em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2021.
Orientador: André Fujita.
8.   Omar Rodrigues da Silva. Reconhecimento de padrões de som em sessões de psicoterapia. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2021.
Orientador: Ariane Machado Lima.
9.   Pedro Mariano Martins. Seleção Natural nos Genomas e Transcriptomas de Moscas Varejeiras. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2021.
Orientador: Tatiana Teixeira Torres.
10.   Victor Chavauty Villela. a ser definido. Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2021.
Orientador: André Fujita.

2020

1.   André Tomas Vilela Hermann. Desenvolvimento de Promotores Sintéticos para Cana de Açuar. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo. (Coorientador)., . Início: 2020.
Supervisor: Alan Mitchell Durham.
2.   Arthur Peixoto Berselli. ESTUDO DA COLONIZAÇÃO DE DIFERENTES VARIANTES DE XANTHOMONAS ALBILINEANS ​EM ​SACCHARUM ​SPP. Dissertação (Mestrado em Pos Graduação em Botânica) - Instituto de Biociências, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2020.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
3.   Camila Alves de Souza. Mapeamento e estudo de associação de Variações no Número de Cópias de DNA (CNVs) e de Regiões com Perda de Heterozigozidade (LOH) com Fenótipos Complexos. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Instituto de Matemática e Estatística, . Início: 2020.
Orientador: Júlia Maria Pavan Soler.
4.   Gustavo da Silveira Gomes. Herdabilidade multivariada. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Instituto de Matemática e Estatística, . Início: 2020.
Orientador: Júlia Maria Pavan Soler.
5.   Heber Gustavo Xavier de Castro. Geração de consultas SPARQL a partir de linguagem natural. Dissertação (Mestrado em Computação Aplicada) - Universidade de São Paulo, . Início: 2020.
Orientador: Cléver Ricardo Guareis de Farias.
6.   Kouao Jean Vincent Mea. Identificação de eventos complexos. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2020.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
7.   Lucas Ramalho Anderson. Comparações metodológicas na estimação da herdabilidade da expressão de genes HLA. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Instituto de Matemática e Estatística, . Início: 2020.
Orientador: Júlia Maria Pavan Soler.
8.   Vinicius Mussak. Suporte à modelagem gráfica de consultas SPARQL. Dissertação (Mestrado em Computação Aplicada) - Universidade de São Paulo, . Início: 2020.
Orientador: Cléver Ricardo Guareis de Farias.
9.   Vitor Antonio Costa Zaninotto. Modelo transacional para tratamento de eventos complexos. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2020.
Orientador: João Eduardo Ferreira.

2019

1.   Edinilza E. da S. Nardi. Limites da abordagem da Análise Retrospectiva. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2019.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
2.   Francisco Venicius Ferreria da Silva. Implementação CUDA de Modelos Probabilísticos. Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2019.
Orientador: Alan Mitchell Durham.
3.   Hector Montenegro Terceros. Reutilizando dicionários para aprofundar a interpretabilidade das definições. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2019.
Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto.
4.   Joana Teixeira Portolese Pascalicchio. Fatores Fenotípicos que contribuem para a gravidade no Transtorno do Espectro Autista. Dissertação (Mestrado em Mestrado) - Instituto de Psiquiatria do Hospital das Clinicas da FMUSP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2019.
Orientador: Helena Paula Brentani.
5.   Maiumy Maria Galvão Honda. Padrões de duplicação do genoma de Rhipicephalus microplus. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2019.
Orientador: Tatiana Teixeira Torres.

2017

1.   Gabriel Torres G. Pato. Análise de mutações e suas correlações com fenótipos. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2017.
Orientador: João Eduardo Ferreira.


(*) Relatório criado com produções desde 2000 até 2024
Data de processamento: 08/08/2024 13:09:19