Programa de Pós Graduação em Bioinformática

Dissertação de mestrado


Número total de itens: 58

2025

1.   Beatriz Toledo Akiti. Metagenômica de Lagoas Hipersalinas. Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2025.
Orientador: Joao Carlos Setubal.
2.   Caio Sóter de Barros Mota. A ser definido. Dissertação (Mestrado profissional em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2025.
Orientador: André Fujita.
3.   Fernanda Gabrielly Dias da Costa. Interação das vesículas de gás com RNAs associados a IS200/IS605. Dissertação (Mestrado profissional em Bioquímica) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2025.
Orientador: Tie Koide.
4.   Francisco Martins Degiovani. Análise Computacional da Metilação na Região Promotora do Gene IL-6 e seu Papel na Patogênese da Diabetes Mellitus Tipo 2. Dissertação (Mestrado em Interunidades em Bioinformática) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto - USP, CNPq. Início: 2025.
Orientador: Silvana Giuliatti.
5.   Guilherme Wenceslau de Lima Cardoso. Desvendando a interação entre bactérias e fagos por meio do monitoramento das alterações transcritômicas durante a infecção por fagos. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2025.
Orientador: Joao Carlos Setubal.
6.   Guilherme Yudi Aiabe Sagawa. Investigando o Endomicrobioma da Cana-de-Açúcar: Estratégias, Desafios e Novas Abordagens. Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2025.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
7.   Igor Augusto Felipe. Investigação sistêmica da regulação gênica por excludons em procariotos. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2025.
Orientador: Tie Koide.
8.   Joao Victor Costa da Silva. Tunelamento Quântico na Ativação de Microglia por Aβ Doença de Alzheimer. Dissertação (Mestrado em Pós graduacao em Bioinformatica) - Faculdade de Medicina de Ribeirao Preto, . Início: 2025.
Orientador: Silvana Giuliatti.
9.   RAFAEL OLIVEIRA COSTA SAVINO. ESTUDO DA FORMAÇÃO DE COACERVADOS: UMA ABORDAGEM COMPUTACIONAL UTILIZANDO ALBUMINA-ÁCIDO HIALURÔNICO. Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2025.
Orientador: Fernando Luis Barroso da Silva.
10.   Raphaella Brandão Jacques. A ser definido. Dissertação (Mestrado profissional em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2025.
Orientador: André Fujita.
11.   Thais Sena de Paula Domingues. Estudo de associação genômica Ampla na avaliação do risco individual de malária na Amazônia brasileira. Dissertação (Mestrado em Estatística) - Instituto de Matemática e Estatística, . Início: 2025.
Orientador: Júlia Maria Pavan Soler.
12.   Victor Hugo Oliveira de Andrade. Análise Computacional da Interação Molecular entre beta-amiloide e Isoformas de Apolipoproteína E e suas Implicações para a Doença de Alzheimer. Dissertação (Mestrado em Interunidades em Bioinformática) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto - USP, CNPq. Início: 2025.
Orientador: Silvana Giuliatti.
13.   Vinicius E. de Araujo. Predição de Genes com Modelos Múltiplos. Dissertação (Mestrado em Interunidades em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2025.
Orientador: Alan Mitchell Durham.
14.   Vitoria Stavis de Araujo. Investigação de Metabólitos da Microbiota Oral na Depressão pela Ativação da Microglia. Dissertação (Mestrado em Pós graduacao em Bioinformatica) - Faculdade de Medicina de Ribeirao Preto, CNPq. Início: 2025.
Orientador: Silvana Giuliatti.

2024

1.   Agatha Morgana Bertoti da Silva. Influência da Exposição ao Cobre na Indução da Dormência e Estado Não-Replicativo em bactérias do complexo Mycobacterium tuberculosis. Dissertação (Mestrado profissional em Epidemiologia e Saúde Única) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: Ana Marcia de Sá Guimarães.
2.   Agustina Belén Pauer. Análise genômica comparativa do clado aquático para melhor compreensão da variabilidade e evolução no gênero Trypanosoma. Dissertação (Mestrado em Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro) - Departamento de Parasitologia do Instituto de Ciências Biomédicas da USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2024.
Orientador: Joao Marcelo Pereira Alves.
3.   Alice Bontempi Bispo. Homeostase do cobre em micobactérias tuberculosas e sua influência na susceptibilidade à moxifloxacina e à bedaquilina. Dissertação (Mestrado profissional em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2024.
Orientador: Ana Marcia de Sá Guimarães.
4.   Ana Luisa Elias Zavataro. Caracterização e correspondência genômica entre os gêneros de tripanossomatídeos Kentomonas sp. e comparação com outros organismos da subfamília Strigomonadinae. Dissertação (Mestrado em Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro) - Departamento de Parasitologia do Instituto de Ciências Biomédicas da USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2024.
Orientador: Joao Marcelo Pereira Alves.
5.   Beno de Andrade Tauil. Novo Protocolo de Predição de Genes. Dissertação (Mestrado profissional em Interunidades em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2024.
Orientador: Alan Mitchell Durham.
6.   Carlos Alberto Cortez Junior. A ser definido. Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: André Fujita.
7.   Carmen Rodriguez Cueva. Filogenômica de Xanthomonas citri. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: Joao Carlos Setubal.
8.   Daniel Moura Fernandez. A ser definido. Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2024.
Orientador: André Fujita.
9.   Fabiane Pohlmann de Athayde Tossato. Novos Promotores Sintécos em Cana de Açúcar. Dissertação (Mestrado profissional em Interunidades em Bioinformática) - Universidade de São Paulo. (Coorientador)., . Início: 2024.
Supervisor: Alan Mitchell Durham.
10.   Felipe Antonio Camoezi Silva. Associação entre perfil inflamatório materno, número de exossomos placentários e desfechos de neurodesenvolvimento aos 12 meses de idade. Dissertação (Mestrado em pós-graduação) - Departamento de Psiquiatria da Faculdade de Medicina da USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2024.
Orientador: Helena Paula Brentani.
11.   Felipe Farinelli. Uso da inteligência artificial para o desenvolvimento de coqueteis enzimáticos para degradação de biomassa vegetal. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: Marcos Silveira Buckeridge.
12.   Guilherme Wenceslau de Lima Cardoso. Monitoramento de alterações transcritômicas durante a infecção bacteriana por fagos.. Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: Aline Maria da Silva.
13.   Gustavo de Souza Morozi. Otimização de bancos de dados não relacionais para análise de dados. Dissertação (Mestrado profissional em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
14.   Isabel Cristine Costa Garcia. Aprendizado de máquina para possíveis drogas com ação em angiogênese. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo. (Coorientador)., . Início: 2024.
Supervisor: Joao Carlos Setubal.
15.   Jordana Luiza Caixeta. Uso de modelagem matemática para compreender os efeitos das Mudanças Climáticas Globais sobre a cultura de soja. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: Marcos Silveira Buckeridge.
16.   Lucas Stehling. A ser definido. Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: André Fujita.
17.   Luis David Pabon Rodriguez. Genômica de bactérias degradadoras de cianeto. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: Joao Carlos Setubal.
18.   Maiara Borges Andrade. Mapeamento de genes com efeito de interação com o ambiente - Efeitos fixos e aleatórios. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2024.
Orientador: Júlia Maria Pavan Soler.
19.   Maria Eduarda De Oliveria Silva. Anotação de Genomas Latino Americanos. Dissertação (Mestrado em Interunidades em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2024.
Orientador: Alan Mitchell Durham.
20.   Maria Giovana Cavalcante. Estruturas alternativas de DNA em Halobacterium salinarum: estudos in silico. Dissertação (Mestrado profissional em Bioquímica) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2024.
Orientador: Tie Koide.
21.   Mateus Violante Pacheco. Engenharia de dados para processos de aprendizado profundo. Dissertação (Mestrado profissional em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
22.   Nicholas Brown. Busca de Novos Alvos no Melanoma através de Inferência de Ortólogos por Redes de Coexpressão. Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: Eduardo Moraes Rego Reis.
23.   Santiago Ramos Fagundes. Engenharia de dados para análise de textos jurídicos. Dissertação (Mestrado profissional em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
24.   Sarah Peixoto Rodrigues Freire. Análise do Impacto da Obesidade nos Desfechos Clínicos Utilizando Machine Learning em Dados do MIMIC-IV. Dissertação (Mestrado profissional em Ciências da Saúde) - Instituto Israelita de Ensino e Pesquisa Albert Einstein, . Início: 2024.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.
25.   Érico Tiago Meireles. Engenharia de dados para textos jurídicos. Dissertação (Mestrado profissional em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
Orientador: João Eduardo Ferreira.

2023

1.   Bruna Farias. Investigação da associação entre ancestralidade genética e mutações somáticas prevalentes em pacientes com adenocarcinoma de pâncreas da população brasileira. Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2023.
Orientador: Eduardo Moraes Rego Reis.
2.   Bruna Sayuri Cardoso Ogusku. Grenômica comparativa de espécies de Acinetobacter. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas - USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2023.
Orientador: Robson Francisco de Souza.
3.   Francisco Alvaro Vasquez Cunya. Análise comparativa e bioinformática do genoma completo de um isolado pertencente ao gênero Sergeia. Dissertação (Mestrado em Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro) - Departamento de Parasitologia do Instituto de Ciências Biomédicas da USP, . Início: 2023.
Orientador: Joao Marcelo Pereira Alves.
4.   Gabriel Monteiro Lauria. História Evolutiva dos Antigos Cães Domésticos da Patagônia Atlântica. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2023.
Orientador: Tabita Hunemeier.
5.   Guilherme da Silva. Influência da linhagem das aves e dos parâmetros de estocagem e incubação de ovos no desempenho industrial farmacêutico na produção de monovalentes virais. Dissertação (Mestrado profissional em Mestrado Profissional em Bioprocessos e Biotecnologia) - Instituto Butantan, . Início: 2023.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
6.   Ketly Naiany Almeida Nascimento. Associação entre estresse pré-natal materno e programação da metilação dos genes NR3C1, FKBP5 e OXTR e comprimento telomérico aos 12 meses de idade. Dissertação (Mestrado em pós-graduação) - Departamento de Psiquiatria da Faculdade de Medicina da USP, . Início: 2023.
Orientador: Helena Paula Brentani.
7.   Lívia Cavalcanti de Morais Gama. Alterações da microbiota na infância contribuem para transtornos psíquicos na vida adulta?. Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformatica) - Instituto de Matemática e Estatística da Universidade de São Paulo. (Coorientador)., . Início: 2023.
Supervisor: Helena Paula Brentani.
8.   Maiara Mascarenhas Moro Valenciano. Caracterização evolutiva e de rede dos genes envolvidos na resposta imune em mamíferos. Dissertação (Mestrado em Programa Interunidades de Pós-Graduação em Bioinformática) - Departamento de Parasitologia do Instituto de Ciências Biomédicas da USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2023.
Orientador: Joao Marcelo Pereira Alves.
9.   Maruan Bakri Ottoni. A ser definido. Dissertação (Mestrado profissional em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2023.
Orientador: André Fujita.
10.   Matheus Farinaro Vesco. USO DE REDES ADVERSARIAIS GENERATIVAS PARA GERAÇÃO DE IMAGENS SINTÉTICAS DE TOMOGRAFIA COMPUTADORIZADA A PARTIR DE RADIOGRAFIAS CONVENCIONAIS. Dissertação (Mestrado profissional em Ciências da Saúde) - Instituto Israelita de Ensino e Pesquisa Albert Einstein, . Início: 2023.
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya.
11.   Rafaela Barberis Canjani. Descoberta de novas vias de síntese de antibióticos por análises in-silico. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2023.
Orientador: Robson Francisco de Souza.
12.   Thomas Wittmann Cezar Santos. Caracterização de proteínas de competição microbiana em archaeas. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2023.
Orientador: Robson Francisco de Souza.

2022

1.   Dora Takyia Bonadio. Descrição de nova partícula viral encontrada em linhagem fitopatogênica de Xanthomonas albilineans.. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências (USP), Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2022.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
2.   Henrique Apocalypse. A ser definido. Dissertação (Mestrado profissional em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2022.
Orientador: André Fujita.
3.   Lucas Farina Lima. Papel regulatório dos elementos transponíveis sobre a rede de coexpressão gênica na Doença de Alzheimer. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2022.
Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto.
4.   Thayariane Lira Mendes. Programação epigenética associada à exposição ao estresse gestacional e suas implicações sobre desfechos do neurodesenvolvimento. Dissertação (Mestrado profissional em pós-graduação) - Departamento de Psiquiatria da Faculdade de Medicina da USP, . Início: 2022.
Orientador: Helena Paula Brentani.

2020

1.   André Tomas Vilela Hermann. Desenvolvimento de Promotores Sintéticos para Cana de Açuar. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo. (Coorientador)., . Início: 2020.
Supervisor: Alan Mitchell Durham.
2.   Gustavo da Silveira Gomes. Herdabilidade multivariada. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Instituto de Matemática e Estatística, . Início: 2020.
Orientador: Júlia Maria Pavan Soler.

2019

1.   Francisco Venicius Ferreria da Silva. Implementação CUDA de Modelos Probabilísticos. Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2019.
Orientador: Alan Mitchell Durham.


(*) Relatório criado com produções desde 2000 até 2025
Data de processamento: 27/01/2026 13:30:34