Programa de Pós Graduação em Bioinformática

Carlos Frederico Martins Menck

Possui graduação em Ciencias Biológicas pela Universidade de São Paulo (1977) e doutorado em Bioquímica pela Universidade de São Paulo (1982). Atualmente é professor titular do Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo. Tem experiência na área de Genética, com ênfase em Genética Molecular e Mutagênese, atuando principalmente nos seguintes temas: reparo de DNA, mutagenese, ultravioleta e transferência gênica em células humanas. Como modelo emprega basicamente células provenientes de pacientes com síndromes com deficiência em reparo de DNA. Seu trabalho busca compreender os processos de carcinogênese e envelhecimento. Esse conhecimento também tem sido empregado na busca de melhores processos terapeuticos para cancer. (Texto informado pelo autor)

  • http://lattes.cnpq.br/8043136069525312 (24/02/2024)
  • Rótulo/Grupo:
  • Bolsa CNPq: Nível 1A - CA GE - Genética
  • Período de análise:
  • Endereço: Universidade de São Paulo, Instituto de Ciências Biomédicas, Departamento de Microbiologia. Av. Prof. Lineu Prestes No 1374 Cid. Universitária 05508-900 - Sao Paulo, SP - Brasil Telefone: (011) 30917499 Fax: (011) 30917354 URL da Homepage: http://www.icb.usp.br/~mutagene/
  • Grande área: Ciências Biológicas
  • Área: Genética
  • Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Produção técnica

Produção artística

Orientações em andamento

Supervisões e orientações concluídas

Projetos de pesquisa

Prêmios e títulos

Participação em eventos

Organização de eventos

Lista de colaborações

Produção bibliográfica

Produção técnica

Produção artística

Orientações em andamento

Supervisões e orientações concluídas

Projetos de pesquisa

  • Total de projetos de pesquisa (6)
    1. 2023-2023. The Role of DNA Damage and Mitochondrial Function in Vascular, Immune and Neurological Ageing (DNA MoVINg)
      Descrição: Projeto desenvolvido como pesquisador visitante senior, no Erasmus Medical Center, Erasmus University, Rotterdam, the Netherlands, durante o período de fevereiro a julho de 2023.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Carlos Frederico Martins Menck - Coordenador / Jan HJ Hoeijmakers - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.
      Membro: Carlos Frederico Martins Menck.
    2. 2020-Atual. The role of DNA damage and mitochondrial function in vascular, immune and neurological ageing (DNA MoVINg)
      Descrição: This project is supported under the International Collaboration Research Funding from Sao Paulo Research Foundation (FAPESP, SP, Brazil) and The Netherlands Organization for Scientific Research (NWO, The Netherlands), Grant # 2019/19435-3. The world population is getting older and older. Unfortunately, this increased life expectancy is generally associated by so-called age-related vascular diseases, such as dementia, heart infarct, and stroke, which profoundly compromise the quality of life of the elderly. Age-related disorders are generally viewed as necessary evil. Our project challenges this dogma, as we propose that the aforementioned age-related disorders, despite their very diverse symptom profiles, share vascular ageing as common denominator. Moreover vascular ageing is caused by cumulative by accumulation of unrepaired DNA damage and mitochondrial dysfunction in the vessel wall which both increase with age. These events interplay and induce progressive senescence, inflammation and function loss of the vessel wall, which eventually will manifest as cardiovascular dysfunction or neurodegeneration, two very important hallmarks of ageing. Several of the predominant human diseases, such as obesity, diabetes and cardiovascular diseases, are directly related to this chain of cellular and physiological events that are part of and accelerate the process of ageing. This project joins experts on DNA damage repair, mitochondrial dysfunction, inflammation and cardiovascular disease to deploy and share knowledge and knowhow to unravel this common disease axis. To do so they will combine cutting edge technologies (e.g. scRNASEq, MitoNGS. CRISPR-Cas, organoids, MacroScreen functionomics platform, (intravital or multispectral) imaging and process reporters) with unique cellular and mouse models, deficient in processes that lead to accelerated ageing phenotypes. The insights gained in this project will be harnessed to the design of new (metabolic) biomarkers of vascular ageing and for novel therapeutic measures to revert this deleterious axis. By targeting a unique common mechanism in vascular ageing we expect that this project will help to reduce these age-related diseases thus improving quality of life for the elderly, and bringing the vista of healthy ageing within reach. Among the hypothesis raised to explain the ageing processes, the accumulation of unrepaired DNA damage during life is one of the main explanations and supported by many evidence. In a second part of the project we will investigate several aspects of DNA repair mechanisms and how unrepaired DNA damage may cause aging and cancer. In most of our studies we will use human cells with deficiencies in DNA repair processes, mainly derived from xeroderma pigmentosum (XP) and Cockayne syndrome (CS) patients. Cells from these patients will be employed in order to investigate mutagenesis by DNA damaging agents, including UVA and UVB. Mutations in XP Brazilian patients will also be identified, aiming to know the distribution of these mutations in the country. Also, the DNA damaging action of certain chemotherapeutic drugs drive us to investigate mechanisms of tumor cell resistance to treatments. A pioneer work to investigate how intracellular parasites affect host cells? genome metabolism, including DNA repair, will focus the parasite Trypanosoma cruzi and the human respiratory syncytial virus. Finally, DNA repair processes are extremely conserved, existing in virtually all life forms. The biological processes of defense against DNA damage in prokaryotes will also be studied in model bacteria. DNA damage responses will also be studied in samples from the Antartic continent, understand responses in extreme environments. We hope these more general studies will help us to contribute to the understanding of the aging process, investigated in first part of this project.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Carlos Frederico Martins Menck - Coordenador / Rodrigo Galhardo - Integrante / Niels Olsen Camara - Integrante / Pedro Manoel Mendes de Moraes Vieira - Integrante / Armando Morais Ventura - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
      Membro: Carlos Frederico Martins Menck.
    3. 2014-2019. ?CONSEQUÊNCIAS DE DEFICIÊNCIAS DE REPARO DE LESÕES NO GENOMA.? CORE GENOME
      Descrição: The genetic material is under constant assault from the environment or by-products of cell metabolism, inducing damage in the DNA molecule. Cells exhibit several responses, which protect from these lesions, including removal by DNA repair mechanisms, or DNA damage tolerance, where the genetic material can be replicated or transcribed, despite the damage. Our group has been working on scientific questions that try to understand how these mechanisms and cellular responses operate maintaining genomic stability, as well as what are the consequences of unrepaired DNA damage for cells and organisms. The importance of these systems for cell function is attested by the high degree of evolutionary conservation and, in humans, dramatically illustrated by genetic syndromes related to defects in DNA repair mechanisms or impairment of responses to DNA injuries. These defects result in clinical phenotypes such as high frequency of carcinogenesis, development problems, neurodegeneration and premature aging. Thus, an important part of this project focus studies in human cells, especially those derived from patients with deficiencies in DNA repair mechanisms, such as xeroderma pigmentosum (XP), Cockayne syndrome (CS), trichothiodystrophy (TTD), and other syndromes identified more recently. In one of the subprojects, we propose to investigate the damaging effects of the UV components of sunlight. The mechanism of DNA damage formation by UVA irradiation, for example, is not fully understood, nor the cellular responses to these lesions, especially in relation to death or mutagenesis. Given the importance of oxidative processes in the generation of cellular endogenous damage, the different types of cell death induced by oxidative stress will be investigated in cells with different defects in DNA repair, searching cellular different responses, that may mimic the different clinical phenotypes observed in patients with neurodegeneration/premature aging. In this project we also intend to investigate the cellular processes that allow the replication of damaged genome. Approaches of next-generation sequencing (NGS) are proposed for studies of mutagenesis and also the identification of mutations and molecular diagnosis of Brazilian patients with XP or other DNA repair related diseases. These studies can provide interesting data on the causes of certain clinical phenotypes, and help patients and their families, with the recognition of the disease, made possible by the molecular diagnosis. XP patients include those from the region of Goiás, due to the high frequency of XP patients observed in Faina, where the incidence is the highest in the world due to geographical isolation and consanguineous marriage. Yet, this project also intends to study how human cells respond to anti-tumor chemotherapeutic agents, aiming to understand the repair mechanisms involved in the repair of DNA damage induced by them and seeking alternative therapies that may enhance the fight against cancer. Finally, we also plan to study genes related to DNA repair in bacteria of basic (Caulobacter crescentus) or medical (Pseudomonas aeruginosa) interest. In the first case, it is an excellent model for studies of bacterial genetics, and we will continue to identify the function of new genes involved in the response to DNA damage. With the model of P. aeruginosa, we aim to investigate the involvement of DNA repair and damage tolerance genes in the responses to antimicrobial compounds, as well as mutagenesis that leads to the emergence of antibiotic resistance.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Carlos Frederico Martins Menck - Coordenador / Carlos F. M. Menck - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
      Membro: Carlos Frederico Martins Menck.
    4. 2009-Atual. Respostas celulares a lesões no genoma
      Descrição: O material genético celular está constantemente sujeito a agressões, gerando lesões na molécula de DNA. Estas afetam diretamente a replicação do DNA e transcrição do RNA, desencadeando respostas que interferem em vários processos metabólicos, inclusive ciclo celular. Para as células, lesões não removidas no DNA podem resultar em mutagênese ou morte celular e, para organismos multicelulares, as conseqüências são carcinogênese e envelhecimento. Este projeto busca estudar as respostas celulares após a indução de lesões no genoma, visando compreender os processos genéticos envolvidos na remoção (reparo de DNA), ou na tolerância aos danos. Empregamos vários modelos biológicos para esse estudo, eucariontes e procariontes, graças ao alto grau de conservação evolutiva dessas respostas, e que, por outro lado, nos dá uma visão abrangente do tema.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (7) . Integrantes: Carlos Frederico Martins Menck - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
      Membro: Carlos Frederico Martins Menck.
    5. 2004-2009. Evolução e função de genes de reparo de DNA
      Descrição: Este projeto visa o estudo de sistemas de proteção ao material genético celular, assim como a evolução, com a busca de genes novos relacionados a esses sistemas. Quatro subprojetos são apresentados. Nos dois primeiros propomos o estudo mecanismos de reparo de DNA em células animais com prioridade para estudos com células humanas primárias. Pretendemos empregar vetores genéticos, sobretudo derivados de adenovírus, para transduzir genes de reparo de DNA em células humanas, sobretudo relacionados a síndromes humanas com deficiência nesse processo (síndromes conhecidas como xeroderma pigmentosum). Esses vetores estão sendo previstos para serem usados em processos de diagnóstico que identificam o defeito celular e no estudo da dinâmica dessas proteínas dentro das células. Pretendemos também continuar a decifrar os sinais apoptóticos que são induzidos pela presença de lesões no genoma. Em outro subprojeto, buscamos compreender os sistemas pelos quais os vegetais protegem seu genoma de lesões no seu genoma. Como alvo, pretendemos estudar a função e a expressão de dois genes clonados por nós (AtXPB e Thi1). Finalmente, pretendemos realizar uma investigação de genômica funcional, para identificar genes envolvidos em reparo de DNA na bactéria modelo Caulobacter crescentus. Este subprojeto é exploratório e pretende a construção e o estudo de mutantes bacterianos. A facilidade de sincronização do ciclo celular nessas bactérias também pode ser útil na determinação efeito do ciclo em funções de reparo nessa célula.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (9) . Integrantes: Carlos Frederico Martins Menck - Coordenador / KM Lima-Bessa - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T & A: 2
      Membro: Carlos Frederico Martins Menck.
    6. 2003-2009. GENES DE REPARO DE DNA: ANÁLISE FUNCIONAL E EVOLUÇÃO.
      Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (9) . Integrantes: Carlos Frederico Martins Menck - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
      Membro: Carlos Frederico Martins Menck.

Prêmios e títulos

  • Total de prêmios e títulos (6)
    1. Eleito para a TWAS , "The World Academy of Sciences", The World Academy of Sciences.. 2018.
      Membro: Carlos Frederico Martins Menck.
    2. Membro da Ordem do Mérito Científico Nacional, Classe Comendador, Presidência da República.. 2007.
      Membro: Carlos Frederico Martins Menck.
    3. Eleito Membro Titular da Academia Brasileira de Ciências, Academia Brasileira de Ciências.. 2005.
      Membro: Carlos Frederico Martins Menck.
    4. Homenageado no VII Congresso Brasileiro de Mutagênese, Carcinogênese e Teratogênese Ambiental, Sociedade Brasileira de Mutagênese, Carcinogênese e Teratogênese Ambiental- SBMCTA.. 2005.
      Membro: Carlos Frederico Martins Menck.
    5. Guggenheim Fellowship Award, John Simon Guggenheim Memorial Foundation, New York, USA.. 2005.
      Membro: Carlos Frederico Martins Menck.
    6. Prêmio Mérito Científico e Tecnológico do Estado de São Paulo, pela sua participação no sequenciamento completo do Genoma da bactéria Xylella fastidiosa., Governo do Estado de São Paulo.. 2000.
      Membro: Carlos Frederico Martins Menck.

Participação em eventos

  • Total de participação em eventos (22)
    1. Responses to DNA damage meeting. Mutational signatures and landscape of Xeroderma Pigmentosum variant (XP-V) skin tumours.. 2022. (Congresso).
    2. IX International Congress of Human Genetics and XV Colombian Congress of Human Genetics. Mechanisms of tumor resistance to genotoxic chemotherapeutic agents. 2018. (Congresso).
    3. 17th European Society for Photobiology Congress,. FILLING GAPS IN TRANSLESION DNA SYNTHESIS IN HUMAN CELLS. 2017. (Congresso).
    4. 16th IUBMB Conference. Mechanisms protecting tumor cells from DNA damage induced by chemotherapeutic agents. 2016. (Congresso).
    5. X CONGRESO ALAMCTA e II Congreso de la Sociedad Uruguaya de Radioprotección. REPLICATION DNA DAMAGE IN HUMAN CELLS. 2016. (Congresso).
    6. Xth Quinquennal Conference on responses to DNA damage: from Molecule to Diseases. Gap-filling for the bypass of 6-4PP lesions depends on Rev3L in ultraviolet-irradiated human cells. 2016. (Congresso).
    7. European Environmental Mutagen And Genome Society EMGS 2015. Death defense by autophagy in a three-dimensional cell culture model. 2015. (Congresso).
    8. 20th International Charles Heidelberger Symposium on Cancer Research (20ICHSCR). MECHANISMS OF RESISTANCE OF GLIOMA CELLS TO CHEMOTHERAPY. 2014. (Congresso).
    9. The 16th International Congress of Photobiology. Dissecting mutations that lead to xeroderma pigmentosum in a tropical and sunny country. 2014. (Congresso).
    10. Nucleotide Excision Repair and Interstrand crosslink repair: from molecules to man. Evaluation of nucleotide excision repair role on photosensitized methylene blue-induced DNA damage. 2013. (Congresso).
    11. 6th International Conference on Environmental Mutagens in Human Population. DNA damage and apoptotic signaling following sunlight. 2012. (Congresso).
    12. XVII Alexander Hollaender Course.DNA damage and cell killing?. 2012. (Seminário).
    13. 2011 Annual Meeting Of the Environmental Mutagenesis Society. Two Novel Mutations On The XPG Gene Affect Two Brazilian Xeroderma Pigmentosum Patients. 2011. (Congresso).
    14. Keystone Symposia: Genomic Instability and DNA Repair. ATR and Polymerase η interaction in response to UVB. 2011. (Congresso).
    15. Aplicações das Ciências Biomédicas Implicações da Transferencia Gênica na Pesquisa Translacional e Inovação Terapêutica.Matando Células de Glioma O papel dos mecanismos de reparo de DNA depois de tratamento quimioterápico. 2010. (Simpósio).
    16. Dia Darwin II - Origens.Origem da vida. 2010. (Simpósio).
    17. VIIIth Congress of ALAMCTA (Asociación Latinoamericana de Mutagénesis, Carcinogénesis y Teratogénesis Ambiental. Ultraviolet cell killing in human cells. 2010. (Congresso).
    18. XV Meeting of the Brazilian Society For Cell Biology.Using RNA interference to modulate DNA repair and induce cancer cell Death. 2010. (Simpósio).
    19. 10th International Conference on Environmental Mutagens-. Cell-Cycle Blockage Affects DNA Damage Responses That Lead To Death in Human Primary Fibroblasts.. 2009. (Congresso).
    20. 15th International Congress on Photobiology. The Biological relevance of CPDs and 6-4 PPs induced by UVA and direct sunlight. 2009. (Congresso).
    21. 46th Congress of The European Societies of Toxicology- Safety for people and Environment, EUROTOX 2009. Ultraviolet Light induced DNA damage that triggers apoptosis pathways.. 2009. (Congresso).
    22. 39th Annual Meeting da Environmental Mutagen Society. Gene and the Environment: From Molecular Mechanisms To Risk. DNA Repair in Caulobacter crescentus. 2008. (Congresso).

Organização de eventos

  • Total de organização de eventos (3)
    1. MENCK, CARLOS FM; SOUZA-PINTO, N. ; GALHARDO, R.. VI Fundamental Aspects of DNA Repair and Mutagenesis- FARM-DNA. 2018. Congresso
    2. Menck, CF; RIBEIRO, L. R. ; TAKAHASHI, C. ; SAKAMOTO-HOJO, E. ; SALVADORI, D. ; SOUZA-PINTO, N. ; MACHADO, C. R.. 11th International Conference on Environmental Mutagens. 2013. Congresso
    3. Menck, CF; GALHARDO, R. ; SOUZA-PINTO, N.. Vth Fundamental Aspects of DNA Repair and Mutagenesis. 2013. Congresso

Lista de colaborações

  • Colaborações endôgenas (8)
    • Carlos Frederico Martins Menck ⇔ Marie-Anne Van Sluys (16.0)
      1. MASUDA, HANA PAULA ; NAKABASHI, MYNA ; MORGANTE, PATRICIA G ; KAJIHARA, DANIELA ; DE SETTA, NATHALIA ; MENCK, Carlos Frederico Martins ; Van Sluys, Marie-Anne. Evidence for sub-functionalization of tandemly duplicated XPB nucleotide excision repair genes in Arabidopsis thaliana. GENE. v. 754, p. 144818, 2020. Qualis: A4
      2. LIMA, W. ; PAQUOLA, A. C. ; VARANI, A. M. ; VANSLUYS MA ; MENCK, C. F. M.. Laterally transferred genomic islands in Xanthomonadales related to pathogenicity and primary metabolism.. FEMS Microbiology Letters. v. 281, p. 87-97, 2008. Qualis: B2
      3. Godoi, P. H. C. ; Galhardo, R. S. ; LUCHE, D. D. ; Van Sluys, M.-A. ; MENCK CF ; Oliva, G.. Structure of the Thiazole Biosynthetic Enzyme THI1 from Arabidopsis thaliana. The Journal of Biological Chemistry. v. 281, p. 30957-30966, 2006. Qualis: A1
      4. MORGANTE, P. G. ; BERRA, C. M. ; NAKABASHI, M. ; COSTA, R. M. A. ; MENCK CF ; M.A. VanSluys. Functional XPB/RAD25 redundancy in Arabidopsis genome: characterization of AtXPB2 and expression analysis.. Gene (Amsterdam), Netherlands. v. 344, p. 93-103, 2005. Qualis: Não identificado (GENE , NETHERLANDS)
      5. RIBEIRO, D. ; FARIAS, L. P. ; ALMEIDA, J. D. ; KASHIWABARA, P. M. ; RIBEIRO, A. F. C. ; SILVA FILHO, M. C. ; MENCK, C. F. M. ; SLUYS MAV.. Functional characterization of the thi1 promoter region from Arabidopsis thaliana. Journal of Experimental Botany, England. v. 56, n. 417, p. 1797-1804, 2005. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY, ENGLAND)
      6. LIMA, W. ; Lima, Wanessa C. ; Menck, C. F. M. ; Sluys, Marie-Anne Van ; Menck, Carlos F.M.. Non-gamma-proteobacteria gene islands contribute to the Xanthomonas genome. Journal of Integrative Biology / Omics (Larchmont). v. 9, n. 2, p. 160-172, 2005. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOLOGY / OMICS)
      7. VINCENTZ, Michel ; CARA, F A ; OKURA, V K ; SILVA, F R da ; et al ; SLUYS MAV. ; NOBREGA, Francisco Gorgonio da ; ARRUDA, Paulo ; MENCK, Carlos Frederico Martins. Evaluation of monocot and eudicot divergence using the sugarcane transcriptome.. Plant Physiology (Bethesda), Estados Unidos. v. 134, n. 3, p. 951-959, 2004. Qualis: Não identificado (PLANT PHYSIOLOGY , ESTADOS UNIDOS)
      8. NASCIMENTO, A. L. T. O. ; KO, A. I. ; MARTINS, E. A. L. ; MONTEIRO-VITORELLO, C. B. ; HO, P. L. ; HAAKE, D. A. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S. ; HARTSKEERL, R. A. ; MARQUES, M. V. ; OLIVEIRA, M. C. ; MENCK, C. F. M. ; LEITE, L. C. C. ; CARRER, H. ; COUTINHO, L. L. ; DEGRAVE, W. M. ; DELLAGOSTIN, O. A. ; EL-DORRY, H. ; FERRO, E. S. ; FERRO, M. I. T.. Comparative genomics of two Leptospira interrogans serovars reveals novel insights into physiology and pathogenesis.. Journal of Bacteriology, estados unidos. v. 186, n. 7, p. 2164-2172, 2004. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF BACTERIOLOGY, ESTADOS UNIDOS)
      9. MONTEIRO-VITORELLO, Claudia B. ; Camargo, Luis E. A. ; Van Sluys, Marie A. ; Kitajima, João P. ; Truffi, Daniela ; do Amaral, Alexandre M. ; Harakava, Ricardo ; de Oliveira, Julio C. F. ; Wood, Derek ; de Oliveira, Mariana C. ; Miyaki, Cristina ; Takita, Marco A. ; da Silva, Ana C. R. ; Furlan, Luis R. ; Carraro, Dirce M. ; Camarotte, Giovana ; Almeida, Nalvo F. ; Carrer, Helaine ; Coutinho, Luiz L. ; SETUBAL, J. C.. The genome sequence of the gram-positive sugarcane pathogen Leifsonia xyli subsp. xyli. Molecular Plant-Microbe Interactions, United States. v. 17, n. 8, p. 827-836, 2004. Qualis: Não identificado (MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS, UNITED STATES)
      10. VETTORE, A. L. ; da SILVA, F. R. ; KEMPER, E. L. ; SOUZA, G. M. ; DA SILVA, A. M. ; FERRO, M. I. T. ; HENRIQUE-SILVA, F. ; GIGLIOTI, E. A. ; LEMOS, M. V. F. ; Coutinho, L. L. ; NOBREGA, M. P. ; Carrer, H. ; FRANCA, S. C. ; BACCI, M. ; GOLDMAN, M. H. S. ; GOMES, S. L. ; NUNES, L. R. ; Camargo, L. E. A. ; SIQUEIRA, W. J. ; VAN SLUYS, M. A.. Analysis and functional annotation of an expressed sequence tag collection for tropical crop sugarcane.. Genome Research, United States. v. 13, n. 12, p. 2725-2735, 2003. Qualis: Não identificado (GENOME RESEARCH, UNITED STATES)
      11. CHABREGAS, S. M. ; LUCHE, D. D. ; MENCK, Carlos Frederico Martins ; SLUYS MAV. ; SILVA FILHO, M. C.. Differential usage of two in-frame translational start codons regulates subcellular localization of Arabidopsis thaliana THI1. Journal of Cell Science, England. v. 116, p. 285-291, 2003. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF CELL SCIENCE, ENGLAND)
      12. PAPINITERZI, F. S. ; GALHARDO, R. ; FARIAS, L. P. ; MENCK, C. F. M. ; SLUYS MAV.. Point Mutation is Responsible for Arabidopsis tz-201 Mutant Phenotype Affecting Thiamin Biosynthesis.. Plant and Cell Physiology, Japan. v. 44, n. 8, p. 865-860, 2003.Qualis: Não identificado (PLANT AND CELL PHYSIOLOGY, JAPAN)
      13. da Silva, A. C. R. ; Ferro, J. A. ; Reinach, F. C. ; Farah, C. S. ; Furlan, L. R. ; Quaggio, R. B. ; Monteiro-Vitorello, C. B. ; Sluys, M. A. Van ; Almeida, N. F. ; Alves, L. M. C. ; do Amaral, A. M. ; Bertolini, M. C. ; Camargo, L. E. A. ; Camarotte, G. ; Cannavan, F. ; Cardozo, J. ; Chambergo, F. ; Ciapina, L. P. ; Cicarelli, R. M. B. ; de SOUZA, Robson Francisco. Comparison of the genomes of two Xanthomonas pathogens with differing host specificities.. Nature (London), Estados Unidos. v. 417, n. 6887, p. 459-463, 2002. Qualis: Não identificado (NATURE , ESTADOS UNIDOS)
      14. SLUYS MAV.; VITORELLO, C. B. M. ; CAMARGO, L E A ; MENCK, Carlos Frederico Martins ; SILVA, A. C. R. ; FERRO, J. A. ; OLIVEIRA, Mariana Cabral de ; SETUBAL, J. C. ; KITAJIMA, J. P. ; SIMPSON, A. J.. Comparative genomic analysis of plant-associated bacteria.. Annual Review of Phytopathology (Print), Estados Unidos. v. 40, p. 169-189, 2002. Qualis: Não identificado (ANNUAL REVIEW OF PHYTOPATHOLOGY , ESTADOS UNIDOS)
      15. COSTA, R. M. A. ; MORGANTE, P. G. ; BERRA, C. M. ; NAKABASHI, M. ; BRUNEAU, D. ; BOUCHEZ, D. ; SWEDER, K. ; M.A. VanSluys ; MENCK CF. The participation of AtXPB1, the XPB/RAD25 homologue gene from Arabidopsis thaliana, in DNA repair and plant development.. Plant J, Inglaterra. v. 28, n. 4, p. 385-395, 2001. Qualis: Não identificado (PLANT J, INGLATERRA)
      16. Simpson, A. J. G. ; Reinach, F.C. ; Arruda, P. ; Abreu, F. A. ; Acencio, M. ; Alvarenga, R. ; Alves, L. M. C. ; Araya, J. E. ; Baia, G. S. ; Baptista, C. S. ; Barros, M. H. ; Bonaccorsi, E. D. ; Bordin, S. ; Bové, J. M. ; Briones, M. R. S. ; Bueno, M. R. P. ; CAMARGO, A. A. ; Camargo, L. E. A. ; Carraro, D. M. ; DA SILVA, A. M.. The genome sequence of the plant pathogen Xylella fastidiosa.. Nature (London), Londres. v. 406, p. 151-157, 2000. Qualis: Não identificado (NATURE , LONDRES)

    • Carlos Frederico Martins Menck ⇔ Sergio Verjovski Almeida (8.0)
      1. BECKEDORFF, FELIPE C. ; AYUPE, ANA C. ; CROCCI-SOUZA, RENAN ; AMARAL, MURILO S. ; Nakaya, Helder I. ; SOLTYS, DANIELA T. ; MENCK, CARLOS F. M. ; Reis, Eduardo M. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio. The Intronic Long Noncoding RNA ANRASSF1 Recruits PRC2 to the RASSF1A Promoter, Reducing the Expression of RASSF1A and Increasing Cell Proliferation. PLOS Genetics (Online). v. 9, p. e1003705, 2013. Qualis: A1
      2. NENE, V. ; WORTMAN, J. R. ; SEVERALAUTHORS, O. ; MENCK CF ; VERJOVSKI-ALMEIDA, S. ; SEVERSON, D.. Genome Sequence of Aedes aegypti, a Major Arbovirus Vector. Science. v. 316, p. 1718-1723, 2007. Qualis: A1
      3. OJOPI, E ; OLIVEIRA, P. S. L. ; NUNES, D. N. ; PAQUOLA, A ; DEMARCO, Ricardo ; GREGORIO, S. ; AIRES, K. ; MENCK, C. F. M. ; LEITE, Luciana C ; Verjovski-Almeida, S. ; DIAS NETO, E.. A quantitative view of the transcriptome of Schistosoma mansoni adult-worms using SAGE. BMC Genomics. v. 8, p. 186, 2007. Qualis: A2
      4. NASCIMENTO, A. L. T. O. ; KO, A. I. ; MARTINS, E. A. L. ; MONTEIRO-VITORELLO, C. B. ; HO, P. L. ; HAAKE, D. A. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S. ; HARTSKEERL, R. A. ; MARQUES, M. V. ; OLIVEIRA, M. C. ; MENCK, C. F. M. ; LEITE, L. C. C. ; CARRER, H. ; COUTINHO, L. L. ; DEGRAVE, W. M. ; DELLAGOSTIN, O. A. ; EL-DORRY, H. ; FERRO, E. S. ; FERRO, M. I. T.. Comparative genomics of two Leptospira interrogans serovars reveals novel insights into physiology and pathogenesis.. Journal of Bacteriology, estados unidos. v. 186, n. 7, p. 2164-2172, 2004. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF BACTERIOLOGY, ESTADOS UNIDOS)
      5. Verjovski-Almeida, S.; Verjovski-Almeida, Sergio ; LEITE, LUCIANA C.C. ; DIAS-NETO, EMMANUEL ; MENCK, CARLOS F.M. ; WILSON, R.ALAN. Schistosome transcriptome: insights and perspectives for functional genomics. Trends in Parasitology, England. v. 20, n. 7, p. 304-308, 2004. Qualis: Não identificado (TRENDS IN PARASITOLOGY, ENGLAND)
      6. DEMARCO, R. ; KOWALTOWSKI, A. T. ; MACHADO, A. A. ; SOARES, M. B. ; GARGIONI, C. ; KAWANO, T. ; RODRIGUES, V. ; MADEIRA, A. M. B. N. ; Wilson, R. A. ; MENCK, C. F. M. ; SETUBAL, J. C. ; DIAS-NETO, E. ; LEITE, L. C. C. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S.. Saci-1, -2, and -3 and Perere, Four Novel Retrotransposons with High Transcriptional Activities from the Human Parasite Schistosoma mansoni. Journal of Virology, estados unidos. v. 78, n. 6, p. 2967-2978, 2004. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF VIROLOGY, ESTADOS UNIDOS)
      7. VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; DEMARCO, Ricardo ; MARTINS, Elizabeth A.l. ; GUIMARÃES, Pedro E.m ; OJOPI, Elida P.b ; PAQUOLA, Apua C. M. ; PIAZZA, João Paulo ; NISHYIAMA JR., Milton Yutaka ; KITAJIMA, João Paulo ; ADAMSON, Rachel E. ; ASHTON, Peter D ; BONALDO, Maria F ; COULSON, Patricia S ; DILLON, Gary P ; FARIAS, Leonardo P ; GREGORIO, Sheila P ; HO, Paulo L ; LEITE, Ricardo A ; MAQUIAS, Cosme C ; REIS, EM. Transcriptome analysis of the acoelomate human parasite Schistosoma mansoni. Nature Genetics, Grã-Bretanha. v. 35, n. 2, p. 148-157, 2003. Qualis: Não identificado (NATURE GENETICS, GRÃ-BRETANHA)
      8. Simpson, A. J. G. ; Reinach, F.C. ; Arruda, P. ; Abreu, F. A. ; Acencio, M. ; Alvarenga, R. ; Alves, L. M. C. ; Araya, J. E. ; Baia, G. S. ; Baptista, C. S. ; Barros, M. H. ; Bonaccorsi, E. D. ; Bordin, S. ; Bové, J. M. ; Briones, M. R. S. ; Bueno, M. R. P. ; CAMARGO, A. A. ; Camargo, L. E. A. ; Carraro, D. M. ; DA SILVA, A. M.. The genome sequence of the plant pathogen Xylella fastidiosa.. Nature (London), Londres. v. 406, p. 151-157, 2000. Qualis: Não identificado (NATURE , LONDRES)

    • Carlos Frederico Martins Menck ⇔ Joao Carlos Setubal (6.0)
      1. NASCIMENTO, A. L. T. O. ; KO, A. I. ; MARTINS, E. A. L. ; MONTEIRO-VITORELLO, C. B. ; HO, P. L. ; HAAKE, D. A. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S. ; HARTSKEERL, R. A. ; MARQUES, M. V. ; OLIVEIRA, M. C. ; MENCK, C. F. M. ; LEITE, L. C. C. ; CARRER, H. ; COUTINHO, L. L. ; DEGRAVE, W. M. ; DELLAGOSTIN, O. A. ; EL-DORRY, H. ; FERRO, E. S. ; FERRO, M. I. T.. Comparative genomics of two Leptospira interrogans serovars reveals novel insights into physiology and pathogenesis.. Journal of Bacteriology, estados unidos. v. 186, n. 7, p. 2164-2172, 2004. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF BACTERIOLOGY, ESTADOS UNIDOS)
      2. MONTEIRO-VITORELLO, Claudia B. ; Camargo, Luis E. A. ; Van Sluys, Marie A. ; Kitajima, João P. ; Truffi, Daniela ; do Amaral, Alexandre M. ; Harakava, Ricardo ; de Oliveira, Julio C. F. ; Wood, Derek ; de Oliveira, Mariana C. ; Miyaki, Cristina ; Takita, Marco A. ; da Silva, Ana C. R. ; Furlan, Luis R. ; Carraro, Dirce M. ; Camarotte, Giovana ; Almeida, Nalvo F. ; Carrer, Helaine ; Coutinho, Luiz L. ; SETUBAL, J. C.. The genome sequence of the gram-positive sugarcane pathogen Leifsonia xyli subsp. xyli. Molecular Plant-Microbe Interactions, United States. v. 17, n. 8, p. 827-836, 2004. Qualis: Não identificado (MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS, UNITED STATES)
      3. DEMARCO, R. ; KOWALTOWSKI, A. T. ; MACHADO, A. A. ; SOARES, M. B. ; GARGIONI, C. ; KAWANO, T. ; RODRIGUES, V. ; MADEIRA, A. M. B. N. ; Wilson, R. A. ; MENCK, C. F. M. ; SETUBAL, J. C. ; DIAS-NETO, E. ; LEITE, L. C. C. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S.. Saci-1, -2, and -3 and Perere, Four Novel Retrotransposons with High Transcriptional Activities from the Human Parasite Schistosoma mansoni. Journal of Virology, estados unidos. v. 78, n. 6, p. 2967-2978, 2004. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF VIROLOGY, ESTADOS UNIDOS)
      4. VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; DEMARCO, Ricardo ; MARTINS, Elizabeth A.l. ; GUIMARÃES, Pedro E.m ; OJOPI, Elida P.b ; PAQUOLA, Apua C. M. ; PIAZZA, João Paulo ; NISHYIAMA JR., Milton Yutaka ; KITAJIMA, João Paulo ; ADAMSON, Rachel E. ; ASHTON, Peter D ; BONALDO, Maria F ; COULSON, Patricia S ; DILLON, Gary P ; FARIAS, Leonardo P ; GREGORIO, Sheila P ; HO, Paulo L ; LEITE, Ricardo A ; MAQUIAS, Cosme C ; REIS, EM. Transcriptome analysis of the acoelomate human parasite Schistosoma mansoni. Nature Genetics, Grã-Bretanha. v. 35, n. 2, p. 148-157, 2003. Qualis: Não identificado (NATURE GENETICS, GRÃ-BRETANHA)
      5. da Silva, A. C. R. ; Ferro, J. A. ; Reinach, F. C. ; Farah, C. S. ; Furlan, L. R. ; Quaggio, R. B. ; Monteiro-Vitorello, C. B. ; Sluys, M. A. Van ; Almeida, N. F. ; Alves, L. M. C. ; do Amaral, A. M. ; Bertolini, M. C. ; Camargo, L. E. A. ; Camarotte, G. ; Cannavan, F. ; Cardozo, J. ; Chambergo, F. ; Ciapina, L. P. ; Cicarelli, R. M. B. ; de SOUZA, Robson Francisco. Comparison of the genomes of two Xanthomonas pathogens with differing host specificities.. Nature (London), Estados Unidos. v. 417, n. 6887, p. 459-463, 2002. Qualis: Não identificado (NATURE , ESTADOS UNIDOS)
      6. Simpson, A. J. G. ; Reinach, F.C. ; Arruda, P. ; Abreu, F. A. ; Acencio, M. ; Alvarenga, R. ; Alves, L. M. C. ; Araya, J. E. ; Baia, G. S. ; Baptista, C. S. ; Barros, M. H. ; Bonaccorsi, E. D. ; Bordin, S. ; Bové, J. M. ; Briones, M. R. S. ; Bueno, M. R. P. ; CAMARGO, A. A. ; Camargo, L. E. A. ; Carraro, D. M. ; DA SILVA, A. M.. The genome sequence of the plant pathogen Xylella fastidiosa.. Nature (London), Londres. v. 406, p. 151-157, 2000. Qualis: Não identificado (NATURE , LONDRES)

    • Carlos Frederico Martins Menck ⇔ Aline Maria da Silva (2.0)
      1. VETTORE, A. L. ; da SILVA, F. R. ; KEMPER, E. L. ; SOUZA, G. M. ; DA SILVA, A. M. ; FERRO, M. I. T. ; HENRIQUE-SILVA, F. ; GIGLIOTI, E. A. ; LEMOS, M. V. F. ; Coutinho, L. L. ; NOBREGA, M. P. ; Carrer, H. ; FRANCA, S. C. ; BACCI, M. ; GOLDMAN, M. H. S. ; GOMES, S. L. ; NUNES, L. R. ; Camargo, L. E. A. ; SIQUEIRA, W. J. ; VAN SLUYS, M. A.. Analysis and functional annotation of an expressed sequence tag collection for tropical crop sugarcane.. Genome Research, United States. v. 13, n. 12, p. 2725-2735, 2003. Qualis: Não identificado (GENOME RESEARCH, UNITED STATES)
      2. Simpson, A. J. G. ; Reinach, F.C. ; Arruda, P. ; Abreu, F. A. ; Acencio, M. ; Alvarenga, R. ; Alves, L. M. C. ; Araya, J. E. ; Baia, G. S. ; Baptista, C. S. ; Barros, M. H. ; Bonaccorsi, E. D. ; Bordin, S. ; Bové, J. M. ; Briones, M. R. S. ; Bueno, M. R. P. ; CAMARGO, A. A. ; Camargo, L. E. A. ; Carraro, D. M. ; DA SILVA, A. M.. The genome sequence of the plant pathogen Xylella fastidiosa.. Nature (London), Londres. v. 406, p. 151-157, 2000. Qualis: Não identificado (NATURE , LONDRES)

    • Carlos Frederico Martins Menck ⇔ Eduardo Moraes Rego Reis (1.0)
      1. VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; DEMARCO, Ricardo ; MARTINS, Elizabeth A.l. ; GUIMARÃES, Pedro E.m ; OJOPI, Elida P.b ; PAQUOLA, Apua C. M. ; PIAZZA, João Paulo ; NISHYIAMA JR., Milton Yutaka ; KITAJIMA, João Paulo ; ADAMSON, Rachel E. ; ASHTON, Peter D ; BONALDO, Maria F ; COULSON, Patricia S ; DILLON, Gary P ; FARIAS, Leonardo P ; GREGORIO, Sheila P ; HO, Paulo L ; LEITE, Ricardo A ; MAQUIAS, Cosme C ; REIS, EM. Transcriptome analysis of the acoelomate human parasite Schistosoma mansoni. Nature Genetics, Grã-Bretanha. v. 35, n. 2, p. 148-157, 2003. Qualis: Não identificado (NATURE GENETICS, GRÃ-BRETANHA)

    • Carlos Frederico Martins Menck ⇔ Glaucia Mendes Souza (1.0)
      1. VETTORE, A. L. ; da SILVA, F. R. ; KEMPER, E. L. ; SOUZA, G. M. ; DA SILVA, A. M. ; FERRO, M. I. T. ; HENRIQUE-SILVA, F. ; GIGLIOTI, E. A. ; LEMOS, M. V. F. ; Coutinho, L. L. ; NOBREGA, M. P. ; Carrer, H. ; FRANCA, S. C. ; BACCI, M. ; GOLDMAN, M. H. S. ; GOMES, S. L. ; NUNES, L. R. ; Camargo, L. E. A. ; SIQUEIRA, W. J. ; VAN SLUYS, M. A.. Analysis and functional annotation of an expressed sequence tag collection for tropical crop sugarcane.. Genome Research, United States. v. 13, n. 12, p. 2725-2735, 2003. Qualis: Não identificado (GENOME RESEARCH, UNITED STATES)

    • Carlos Frederico Martins Menck ⇔ Helder Takashi Imoto Nakaya (1.0)
      1. BECKEDORFF, FELIPE C. ; AYUPE, ANA C. ; CROCCI-SOUZA, RENAN ; AMARAL, MURILO S. ; Nakaya, Helder I. ; SOLTYS, DANIELA T. ; MENCK, CARLOS F. M. ; Reis, Eduardo M. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio. The Intronic Long Noncoding RNA ANRASSF1 Recruits PRC2 to the RASSF1A Promoter, Reducing the Expression of RASSF1A and Increasing Cell Proliferation. PLOS Genetics (Online). v. 9, p. e1003705, 2013. Qualis: A1

    • Carlos Frederico Martins Menck ⇔ Robson Francisco de Souza (1.0)
      1. da Silva, A. C. R. ; Ferro, J. A. ; Reinach, F. C. ; Farah, C. S. ; Furlan, L. R. ; Quaggio, R. B. ; Monteiro-Vitorello, C. B. ; Sluys, M. A. Van ; Almeida, N. F. ; Alves, L. M. C. ; do Amaral, A. M. ; Bertolini, M. C. ; Camargo, L. E. A. ; Camarotte, G. ; Cannavan, F. ; Cardozo, J. ; Chambergo, F. ; Ciapina, L. P. ; Cicarelli, R. M. B. ; de SOUZA, Robson Francisco. Comparison of the genomes of two Xanthomonas pathogens with differing host specificities.. Nature (London), Estados Unidos. v. 417, n. 6887, p. 459-463, 2002. Qualis: Não identificado (NATURE , ESTADOS UNIDOS)




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Data de processamento: 05/12/2024 01:27:53