Programa de Pós-Graduação em Probabilidade e Estatística

Ricardo Zorzetto Nicoliello Vêncio

Lattes completo: http://goo.gl/zK5Ea --- Graduado em Física pelo IF-USP, mestre em Estatística pelo IME-USP, doutor em Bioinformática pela USP e livre-docênte em Probabilidade e Estatística pela USP - Universidade de São Paulo; venho trabalhando na criação de métodos matemáticos e computacionais para solução de problemas em Biologia e em Medicina. Em meados de 2008 integrei-me ao corpo docente da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto - Universidade de São Paulo (FMRP-USP) como Professor Doutor MS-3 para atuar na área de Bioinformática do Departamento de Genética. Naquele momento, fundei o LabPIB - Laboratório de Processamento de Informação Biológica (http://labpib.openwetware.org). No fim de 2010 fui convidado a me unir ao recém criado Departamento de Computação e Matemática (DCM) dentro da Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP-USP) e transferi o LabPIB. No início de 2013 me tornei Professor Associado MS-5 no mesmo departamento. Questões, pedido de cópias dos trabalhos publicados (http://scholar.google.com/citations?user=4N0TeRkAAAAJ) e comentários diversos são sempre bem-vindos: rvencio@usp.br ******* BSc. in Physics, MSc. in Statistics, PhD. in Bioinformatics and Dr Hab. in Probability & Statistics by the University of São Paulo (USP), I have been working on the creation of mathematical and computational methods for the solution of problems in Biology and Medicine. In late 2008 I joined the University of São Paulo's Medical School at Ribeirão Preto (FMRP-USP) as Assistant Professor to conduct research and teaching activities on bioinformatics at the Genetics Department. At that moment I founded the LabPIB (acronym that stands for Biological Information Processing Lab, in Portuguese http://labpib.openwetware.org). In late 2010 I was invited to join the newly created Department of Computing and Mathematics (DCM) at University of Sao Paulo's Ribeirao Preto campus, to where I moved the LabPIB. In early 2013 I became Associate Professor in the same department. Questions or reprint requisitions of my published works (http://scholar.google.com/citations?user=4N0TeRkAAAAJ) or even random comments are always welcome: rvencio@usp.br (Texto informado pelo autor)

  • http://lattes.cnpq.br/3278315914566734 (14/07/2024)
  • Rótulo/Grupo:
  • Bolsa CNPq:
  • Período de análise:
  • Endereço: Universidade de São Paulo, Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, Departamento de Computação e Matemática. Av. Bandeirantes, 3900 Monte Alegre 14040901 - Ribeirão Preto, SP - Brasil Telefone: (16) 33150429 Fax: (16) 33150407 URL da Homepage: http://labpib.openwetware.org/ - - - http://dcm.ffclrp.usp.br/
  • Grande área: Ciências Exatas e da Terra
  • Área: Probabilidade e Estatística
  • Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Produção técnica

Produção artística

Orientações em andamento

Supervisões e orientações concluídas

Projetos de pesquisa

Prêmios e títulos

Participação em eventos

Organização de eventos

Lista de colaborações

Produção bibliográfica

Produção técnica

Produção artística

Orientações em andamento

Supervisões e orientações concluídas

Projetos de pesquisa

Prêmios e títulos

Participação em eventos

  • Total de participação em eventos (26)
    1. 7th Workshop Thermodynamics, Disequilibrium and Evolution.Evolutionary implications of non-coding RNAs inside coding mRNAs: insights from archaea, the third domain of life. 2014. (Encontro).
    2. Dia de Bioinformática - UFScar.O papel da Bioinformática na Biologia Sistêmica. 2014. (Encontro).
    3. IV Dia da Informática Biomédica.P: O que acontece se juntamos Informática com Biologia? R: Bioinformática.. 2014. (Outra).
    4. Seminários do Programa de Pós-graduação em Física Aplicada a Biologia e Medicina FFCLRP-USP.Searching for biology's 'dark matter': insights from archaea, the third domain of life. 2014. (Seminário).
    5. Colóquio do Departamento de Computação e Matemática FFCLRP-USP.O papel da Bioinformática na Biologia Sistêmica. 2013. (Outra).
    6. III Dia da Informática Biomédica.P: O que acontece se juntamos Informática com Biologia? R: Bioinformática. 2013. (Encontro).
    7. Seminários Avançados em Tecnologia de Microarrays e Next Generation Sequencing - Hospital Israelita Albert Einstein.RNAseq e Tiling-array sob a ótica de séries-temporais: o que é o sinal?. 2013. (Seminário).
    8. USP e as Profissões.P: O que acontece se juntamos Informática com Biologia? R: Bioinformática. 2013. (Encontro).
    9. Workshop on Probabilistic and Statistical Methods.A Bayesian model and its R package implementation for sugar-cane metabolite probabilistic identification. 2013. (Outra).
    10. 8th Internacional Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. Comitê científico - avaliação de apresentações orais. 2012. (Congresso).
    11. Congresso de Oncologia Clínica. A Bioinformática como intrumento de estudo do câncer de próstata. 2012. (Congresso).
    12. Molecular Simulation 2012 - 4a edição.Protein-RNA interaction prediction a using ensemble learning. 2012. (Simpósio).
    13. Perspectivas sobre aplicações de Sistemas Complexos em Ciências Biomoleculares.Expressão Gênica: é complexo mesmo ou só estão faltando partes?. 2012. (Outra).
    14. Seminários do Departamento de Genética e Biologia Evolutiva IB-USP.O papel da Bioinformática na Biologia Sistêmica. 2012. (Seminário).
    15. Workshop de Pesquisa BIOEN - Divisão de Biomassa.Tecnologia da Informação aplicada a genômica para bioenergia: anotação probabilística usando Inteligência Artificial. 2012. (Outra).
    16. Adote um Cientista - Casa da Ciência do Hemocentro-FMRP-USP.P: O que acontece se juntamos Informática com Biologia? R: Bioinformática. 2011. (Outra).
    17. Conferência de Estatística Indutiva.SimCluster: Reconhecimento de Padrões em Dados Composicionais. 2011. (Encontro).
    18. I Dia da Informática Biomédica.P: O que acontece se juntamos Informática com Biologia? R: Bioinformática. 2011. (Encontro).
    19. Seminários do Departamento de Bioquímica e Imunologia FMRP-USP.O papel da Bioinformática na Biologia Sistêmica. 2011. (Seminário).
    20. 26th Conference on Uncertainty in Artificial Intelligence. 2010. (Congresso).
    21. Adote um Cientista - Casa da Ciência do Hemocentro-FMRP-USP.P: O que acontece se juntamos Informática com Biologia? R: Bioinformática!. 2010. (Outra).
    22. Microsoft Research Faculty Summit 2010. Information Technology Applied to Bioenergy Genomics. 2010. (Congresso).
    23. Seminários Avançados em Tecnologia de Microarrays e Next Generation Sequencing - Hospital Israelita Albert Einstein.Algumas respostas da bioinformática para: O que fazer se a amostra é pequena?. 2010. (Seminário).
    24. 5th Internacional Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. Pattern recognition in quantitative transcriptome sequencing: clustering and signatures. 2009. (Congresso).
    25. Seminários Avançados em Tecnologia de Microarrays - Hospital Israelita Albert Einstein.Aspectos práticos e perspectivas em análise de expressão gênica. 2009. (Seminário).
    26. 1st Internacional Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. Bayboots: a model-free Bayesian tool to identify class markers from gene expression data. 2005. (Congresso).

Organização de eventos

  • Total de organização de eventos (7)
    1. VENCIO, R; KOIDE, T. ; DURHAM, A. M. ; HASHIMOTO, R. F.. II Workshop do Programa de Pós Graduação em Bioinformática. 2012. Outro
    2. SILVA JUNIOR, W. A. ; VENCIO, R. VII Curso de Verão em Bioinformática. 2011. Outro
    3. MITROWSKY, R. R. ; LOPEZ, A. G. ; BOSCO, G. G. ; EBERT, M. R. ; AZEVEDO, K. A. G. ; VENCIO, R. VI Olimpíada Regional de Matemática de Ribeirão Preto (ORMRP). 2011. Concurso
    4. SILVA, F. L. B. ; VENCIO, R. I workshop em Biologia Computacional, do DCM/FFCLRP - USP. 2011. Outro
    5. VENCIO, R; DURHAM, A. M.. I Workshop do Programa de Pós Graduação em Bioinformática. 2010. Outro
    6. VENCIO, R; et.al.. 5th Internacional Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. 2009. Congresso
    7. VENCIO, R; et.al.. VII Semana da Informática Biomédica. 2009. Outro

Lista de colaborações

  • Colaborações endôgenas (1)
    • Ricardo Zorzetto Nicoliello Vêncio ⇔ Ricardo Zorzetto Nicoliello Vêncio (136.0)
      1. MARRERO-GUTIÉRREZ, JUNIER ; BUENO, ANA CAROLINA ; MARTINS, CLARISSA SILVA ; COELI-LACCHINI, FERNANDA BORCHERS ; SILVA-JÚNIOR, RUI M PATRÍCIO ; MARQUES GONÇALVES, GABRIEL HENRIQUE ; OZAKI, JORGE GUILHERME OKANOBO ; DE ALMEIDA E SILVA, DANILLO C ; WILDEMBERG, LUIZ EDUARDO ; DA SILVA ANTUNES, XIMENE LIMA ; DOS SANTOS, ANTÔNIO CARLOS ; MACHADO, HELIO RUBENS ; SANTOS, MARCELO VOLPON ; MOREIRA, AYRTON CUSTODIO ; GADELHA, MONICA R ; VÊNCIO, RICARDO ZORZETTO NICOLIELLO ; ANTONINI, SONIR ROBERTO R ; DE CASTRO, MARGARET. Epigenetic control of adamantinomatous craniopharyngiomas. JOURNAL OF CLINICAL ENDOCRINOLOGY & METABOLISM. v. 1, p. 1, 2024. Qualis: A1 (THE JOURNAL OF CLINICAL ENDOCRINOLOGY AND METABOLISM)
      2. LORENZETTI, ALAN P. R. ; KUSEBAUCH, ULRIKE ; ZARAMELA, LÍVIA S. ; WU, WEI-JU ; DE ALMEIDA, JOÃO P. P. ; TURKARSLAN, SERDAR ; L. G. DE LOMANA, ADRIÁN ; GOMES-FILHO, JOSÉ V. ; VÊNCIO, RICARDO Z. N. ; MORITZ, ROBERT L. ; KOIDE, TIE ; BALIGA, NITIN S.. A Genome-Scale Atlas Reveals Complex Interplay of Transcription and Translation in an Archaeon. mSystems. v. 1, p. 1, 2023. Qualis: A1
      3. SILVA-JÚNIOR, RUI M PATRÍCIO DA ; BUENO, ANA CAROLINA ; MARTINS, CLARISSA SILVA ; COELLI-LACCHINI, FERNANDA ; OZAKI, JORGE GUILHERME OKANOBO ; ALMEIDA-E-SILVA, DANILLO CUNHA DE ; MARRERO-GUTIÉRREZ, JUNIER ; SANTOS, ANTÔNIO CARLOS DOS ; GARCIA-PERAL, CARLOS ; MACHADO, HÉLIO RUBENS ; SANTOS, MARCELO VOLPON DOS ; ELIAS, PAULA LAMPARELLI ; MOREIRA, AYRTON C ; COLLI, LEANDRO M ; VÊNCIO, RICARDO Z N ; ANTONINI, SONIR R ; DE CASTRO, MARGARET. Integrating Methylome and Transcriptome Signatures Expands the Molecular Classification of the Pituitary Tumors. JOURNAL OF CLINICAL ENDOCRINOLOGY & METABOLISM. v. 108, p. 1452-1463, 2023. Qualis: A1 (THE JOURNAL OF CLINICAL ENDOCRINOLOGY AND METABOLISM)
      4. BUENO, ANA CAROLINA ; STECCHINI, MONICA F. ; MARRERO-GUTIÉRREZ, JUNIER ; MORE, CANDY BELLIDO ; LEAL, LETICIA FERRO ; GOMES, DÉBORA CRISTIANE ; DE LIMA NETO, DANIEL FERREIRA ; BRANDALISE, SILVIA REGINA ; CARDINALLI, IZILDA APARECIDA ; YUNES, JOSÉ ANDRES ; JUNQUEIRA, THAIS ; SCRIDELI, CARLOS ALBERTO ; MOLINA, CARLOS AUGUSTO FERNANDES ; RAMALHO, FERNANDO SILVA ; TUCCI, SILVIO ; COELI-LACCHINI, FERNANDA BORCHERS ; MOREIRA, AYRTON CUSTODIO ; RAMALHO, LEANDRA ; VÊNCIO, RICARDO ZORZETTO NICOLIELLO ; DE CASTRO, MARGARET. Vitamin D receptor hypermethylation as a biomarker for pediatric adrenocortical tumors. EUROPEAN JOURNAL OF ENDOCRINOLOGY. v. 1, p. 1, 2022. Qualis: A1
      5. ALVES, INGRID R. ; VÊNCIO, RICARDO Z. ; GALHARDO, RODRIGO S.. Whole genome analysis of UV-induced mutagenesis in Caulobacter crescentus. MUTATION RESEARCH-FUNDAMENTAL AND MOLECULAR MECHANISMS OF MUTAGENESIS. v. 825, p. 111787, 2022. Qualis: Não identificado (MUTATION RESEARCH-FUNDAMENTAL AND MOLECULAR MECHANISMS OF MUTAGENESIS)
      6. BUENO, ANA CAROLINA ; DA SILVA, RUI M. P. ; STECCHINI, MÔNICA F. ; MARRERO-GUTIÉRREZ, JUNIER ; DE ALMEIDA E SILVA, DANILLO C. ; CARDINALLI, IZILDA ; SCRIDELI, CARLOS ALBERTO ; JUNQUEIRA, THAIS ; MOLINA, CARLOS A. F. ; RAMALHO, FERNANDO SILVA ; TUCCI JUNIOR, SILVIO ; COELI-LACCHINI, FERNANDA BORCHERS ; MOREIRA, AYRTON CUSTODIO ; RAMALHO, LEANDRA N Z ; BRANDALISE, SILVIA ; YUNES, JOSÉ ANDRES ; DE CASTRO, MARGARET ; VÊNCIO, RICARDO ZORZETTO NICOLIELLO ; ANTONINI, SONIR R R. DNA methylation is a comprehensive marker for pediatric adrenocortical tumors. ENDOCRINE-RELATED CANCER. v. 1, p. 1, 2022. Qualis: A1
      7. ONGA, EVELYN AYUMI ; VÊNCIO, RICARDO Z. N. ; KOIDE, TIE. Low Salt Influences Archaellum-Based Motility, Glycerol Metabolism, and Gas Vesicles Biogenesis in Halobacterium salinarum. Microorganisms. v. 10, p. 2442, 2022. Qualis: B1
      8. BUENO, ANA CAROLINA ; MORE, CANDY BELLIDO ; MARRERO-GUTIÉRREZ, JUNIER ; DE ALMEIDA E SILVA, DANILLO C. ; LEAL, LETICIA FERRO ; MONTALDI, ANA PAULA ; RAMALHO, FERNANDO SILVA ; VÊNCIO, RICARDO ZORZETTO NICOLIELLO ; DE CASTRO, MARGARET ; ANTONINI, SONIR ROBERTO R.. Vitamin D receptor activation is a feasible therapeutic target to impair adrenocortical tumorigenesis. MOLECULAR AND CELLULAR ENDOCRINOLOGY. v. 1, p. 111757, 2022. Qualis: A2
      9. IBRAHIM, AMR GALAL ABD EL-RAHEEM ; VÊNCIO, RICARDO Z. N. ; LORENZETTI, ALAN P. R. ; KOIDE, TIE. Halobacterium salinarum and Haloferax volcanii Comparative Transcriptomics Reveals Conserved Transcriptional Processing Sites. Genes. v. 12, p. 1018, 2021. Qualis: A2
      10. NERI DE SOUZA REIS, VIVIANE ; TAHIRA, ANA CAROLINA ; DAGUANO GASTALDI, VINÍCIUS ; MARI, PAULA ; PORTOLESE, JOANA ; FEIO DOS SANTOS, ANA CECILIA ; LISBOA, BIANCA ; MARI, JAIR ; CAETANO, SHEILA C. ; BRUNONI, DÉCIO ; BORDINI, DANIELA ; SILVESTRE DE PAULA, CRISTIANE ; VÊNCIO, RICARDO Z. N. ; QUACKENBUSH, JOHN ; BRENTANI, HELENA. Environmental Influences Measured by Epigenetic Clock and Vulnerability Components at Birth Impact Clinical ASD Heterogeneity. Genes. v. 12, p. 1433, 2021. Qualis: A2
      11. FERNANDEZ-BECERRA, CARMEN ; BERNABEU, MARIA ; CASTELLANOS, ANGÉLICA ; CORREA, BRUNA R. ; OBADIA, THOMAS ; RAMIREZ, MIRIAM ; RUI, EDMILSON ; HENTZSCHEL, FRANZISKA ; LÓPEZ-MONTAÑÉS, MARIA ; AYLLON-HERMIDA, ALBERTO ; MARTIN-JAULAR, LORENA ; ELIZALDE-TORRENT, ALEIX ; SIBA, PETER ; VÊNCIO, RICARDO Z. ; AREVALO-HERRERA, MYRIAM ; HERRERA, SÓCRATES ; ALONSO, PEDRO L. ; MUELLER, IVO ; DEL PORTILLO, HERNANDO A.. spleen-dependent genes encode antigens associated with cytoadhesion and clinical protection. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA. v. 1, p. 201920596, 2020. Qualis: A1
      12. DE ALMEIDA, JOÃO PAULO PEREIRA ; VÊNCIO, RICARDO Z. N. ; LORENZETTI, ALAN P. R. ; CATEN, FELIPE TEN- ; GOMES-FILHO, JOSÉ VICENTE ; KOIDE, TIE. The Primary Antisense Transcriptome of Halobacterium salinarum NRC-1. Genes. v. 10, p. 280, 2019. Qualis: A2
      13. KANAN, ADELLE D. ; COREY, EVA ; VÊNCIO, RICARDO Z. N. ; ISHWAR, ARJUN ; Liu, Alvin Y.. Lineage relationship between prostate adenocarcinoma and small cell carcinoma. BMC CANCER. v. 19, p. 518, 2019. Qualis: A2
      14. TEN-CATEN, FELIPE ; VÊNCIO, RICARDO Z. N. ; LORENZETTI, ALAN PÉRICLES R. ; ZARAMELA, LÍVIA SOARES ; SANTANA, ANA CAROLINA ; KOIDE, TIE. Internal RNAs overlapping coding sequences can drive the production of alternative proteins in archaea. RNA Biology. v. 1, p. 1, 2018. Qualis: A2
      15. Pascal, Laura E ; MASOODI, KHALID Z ; LIU, JUNE ; QIU, XIAONAN ; SONG, QIONG ; WANG, YUJUAN ; ZANG, YACHEN ; YANG, TIEJUN ; WANG, YAO ; RIGATTI, LORA H ; CHANDRAN, UMA ; COLLI, LEANDRO M ; VENCIO, RICARDO Z N ; LU, YI ; ZHANG, JIAN ; Wang, Zhou. Conditional deletion of ELL2 induces murine prostate intraepithelial neoplasia. JOURNAL OF ENDOCRINOLOGY. v. 235, p. 123-136, 2017. Qualis: A1
      16. BORGES, GISELY T. ; Vêncio, Eneida F. ; QUEK, SUE-ING ; CHEN, ADELINE ; SALVANHA, DIEGO M. ; Vêncio, Ricardo Z.N. ; NGUYEN, HOLLY M. ; VESSELLA, ROBERT L. ; Cavanaugh, Christopher ; Ware, Carol B. ; TROISCH, PAMELA ; Liu, Alvin Y.. Conversion of Prostate Adenocarcinoma to Small Cell Carcinoma-Like by Reprogramming. Journal of Cellular Physiology (Print). v. 1, p. n/a-n/a, 2016. Qualis: A2
      17. JIANG, YUXIANG ; ORON, TAL RONNEN ; CLARK, WYATT T. ; BANKAPUR, ASMA R. ; D?ANDREA, DANIEL ; LEPORE, ROSALBA ; FUNK, CHRISTOPHER S. ; KAHANDA, INDIKA ; VERSPOOR, KARIN M. ; BEN-HUR, ASA ; KOO, DA CHEN EMILY ; PENFOLD-BROWN, DUNCAN ; SHASHA, DENNIS ; YOUNGS, NOAH ; BONNEAU, RICHARD ; LIN, ALEXANDRA ; SAHRAEIAN, SAYED M. E. ; MARTELLI, PIER LUIGI ; PROFITI, GIUSEPPE ; VENCIO, R. An expanded evaluation of protein function prediction methods shows an improvement in accuracy. GENOME BIOLOGY. v. 17, p. 184, 2016. Qualis: Não identificado (GENOME BIOLOGY)
      18. BORGES, G. T. ; VENCIO, E. F. ; VENCIO, R. Z. N. ; Vessella, Robert L ; Ware, Carol B ; Liu, Alvin Y. Reprogramming of Prostate Cancer Cells - Technical Challenges. Current Urology Reports (Print). v. 16, p. 468, 2015. Qualis: A3
      19. SILVA, D. C. A. E. ; VENCIO, R. Z. N.. SIFTER-T: A scalable and optimized framework for the SIFTER phylogenomic method of probabilistic protein domain annotation. BioTechniques. v. 58, p. 140, 2015. Qualis: A4
      20. ERNST, MADELEINE ; SILVA, DENISE B. ; SILVA, RICARDO ; MONGE, MARCELO ; SEMIR, JOÃO ; Vêncio, Ricardo Z.N. ; LOPES, NORBERTO P.. A metabolomic protocol for plant systematics by matrix-assisted laser-desorption/ionization time-of flight mass spectrometry. Analytica Chimica Acta (Print). v. 859, p. 46-58, 2015. Qualis: A1
      21. KHAN, ATLAS ; XUE, LI ZHENG ; WEI, WU ; QU, YANPENG ; HUSSAIN, AMIR ; VENCIO, RICARDO Z. N.. Convergence Analysis of a New Self Organizing Map Based Optimization (SOMO) Algorithm. Cognitive Computation. v. 7, p. 1, 2015. Qualis: A2
      22. GOMES-FILHO, J. V. ; ZARAMELA, LIVIA S. ; ITALIANI, V. C. S. ; BALIGA, NITIN S. ; VENCIO, R. Z. N. ; KOIDE, TIE. Sense overlapping transcripts in IS 1341 -type transposase genes are functional non-coding RNAs in archaea. RNA Biology. v. 12, p. 490-500, 2015. Qualis: A2
      23. GUARDIA, GABRIELA D. A. ; PIRES, LUÍS FERREIRA ; VÊNCIO, RICARDO Z. N. ; MALMEGRIM, KELEN C. R. ; DE FARIAS, CLÉVER R. G.. A Methodology for the Development of RESTful Semantic Web Services for Gene Expression Analysis. Plos One. v. 10, p. e0134011, 2015. Qualis: A1
      24. QUEK, SUE-ING ; WONG, OLIVIA M. ; CHEN, ADELINE ; BORGES, GISELY T. ; ELLIS, WILLIAM J. ; SALVANHA, DIEGO M. ; Vêncio, Ricardo Z.N. ; WEAVER, BRANDI ; ENCH, YASMIN M. ; LEACH, ROBIN J. ; THOMPSON, IAN M. ; Liu, Alvin Y.. Processing of voided urine for prostate cancer RNA biomarker analysis. The Prostate (Print). v. 1, p. n/a-n/a, 2015. Qualis: A2
      25. SILVA, R. R. ; JOURDAN, F. ; SALVANHA, D. M. ; LETISSE, F. ; JAMIN, E. ; GUIDETTI-GONZALEZ, S. ; LABATE, C. A. ; VENCIO, R. Z. N.. ProbMetab: an R package for Bayesian probabilistic annotation of LC-MS based metabolomics. Bioinformatics (Oxford. Print). v. 30, p. 1, 2014. Qualis: Não identificado (PRINT))
      26. ERNST, M. ; SILVA, D. B. ; SILVA, R. R. ; VENCIO, R. Z. N. ; LOPES, N. P.. Mass spectrometry in plant metabolomics strategies: from analytical platforms to data acquisition and processing. Natural Product Reports. v. 1, p. 1, 2014. Qualis: A1
      27. PERSINOTI, G. F. ; PERES, N. T. A. ; JACOB, T. R. ; ROSSI, A. ; VENCIO, R. Z. N. ; MARTINEZ-ROSSI, N. M.. RNA-sequencing analysis of Trichophyton rubrum transcriptome in response to sublethal doses of acriflavine. BMC Genomics. v. 15, p. S1, 2014.Qualis: A2
      28. ZARAMELA, LIVIA S. ; VÊNCIO, RICARDO Z. N. ; TEN-CATEN, FELIPE ; BALIGA, NITIN S. ; KOIDE, TIE. Transcription Start Site Associated RNAs (TSSaRNAs) Are Ubiquitous in All Domains of Life. Plos One. v. 9, p. e107680, 2014. Qualis: A1
      29. SU, F. ; CORREA, B. R. S. ; LUO, J. ; VENCIO, R ; Pascal, Laura E ; WANG, Z.. Gene Expression Profiling Reveals Regulation of ERK Phosphorylation by Androgen-Induced Tumor Suppressor U19/EAF2 in the Mouse Prostate. Cancer Microenvironment. v. 1, p. 23440596-1, 2013. Qualis: A3
      30. MIYAZAKI, F. A. ; GUARDIA, G. D. A. ; VENCIO, R ; FARIAS, C. R. G.. Semantic integration of gene expression analysis tools and data sources using software connectors. BMC Genomics. v. 14, p. S2, 2013. Qualis: A2
      31. LIU, A. Y. ; VENCIO, R ; PAGE, L. S. ; HO, M. ; Loprieno, Michelle A. ; TRUE, L. D.. Bladder expression of CD cell surface antigens and cell type-specific transcriptomes. Cell and Tissue Research (Print). v. 347, p. 1, 2012. Qualis: A2
      32. Vasconcelos, E.J.R. ; Terrão, M.C. ; Ruiz, J.C. ; VENCIO, R ; Cruz, A.K.. In silico identification of conserved intercoding sequences in Leishmania genomes: Unraveling putative cis-regulatory elements. Molecular and Biochemical Parasitology (Print),. p. 1, 2012. Qualis: A4 (MOLECULAR AND BIOCHEMICAL PARASITOLOGY)
      33. GUARDIA, G. D. A. ; VENCIO, R ; FARIAS, C. R. G.. A UML profile for the OBO relation ontology. BMC Genomics. v. 13, p. S3, 2012.Qualis: A2
      34. Vêncio, Eneida F. ; Nelson, Angelique M. ; Cavanaugh, Christopher ; Ware, Carol B. ; Milller, Daniel G. ; Garcia, Julio C.O. ; Vêncio, Ricardo Z.N. ; Loprieno, Michelle A. ; Liu, Alvin Y.. Reprogramming of prostate cancer-associated stromal cells to embryonic stem-like. The Prostate (Print). v. 71, p. n/a-n/a, 2012. Qualis: A2
      35. Pascal, Laura E. ; Ai, Junkui ; VENCIO, R ; Vêncio, Eneida F. ; Zhou, Yong ; Page, Laura S. ; True, Lawrence D. ; Wang, Zhou ; Liu, Alvin Y.. Differential Inductive Signaling of CD90+ Prostate Cancer-Associated Fibroblasts Compared to Normal Tissue Stromal Mesenchyme Cells. Cancer Microenvironment. v. 4, p. 51-59, 2011. Qualis: A3
      36. Pascal, Laura E ; VENCIO, R ; Vessella, Robert L ; Ware, Carol B ; Vencio, Eneida F ; Denyer, Gareth ; Liu, Alvin Y. Lineage relationship of prostate cancer cell types based on gene expression. BMC Medical Genomics. v. 4, p. 46, 2011. Qualis: A3
      37. Toledo, Sílvia Regina Caminada ; Zago, Marco Antonio ; Oliveira, Indhira Dias ; Proto-Siqueira, Rodrigo ; Okamoto, Oswaldo K. ; Severino, Patricia ; VENCIO, R ; Gamba, Francine Tesser ; Silva, Wilson A. ; Moreira-Filho, Carlos A. ; Torre, Cristiane A. Dalla ; Alves, Maria Tereza Seixas ; Garcia-Filho, Reynaldo J. ; Simpson, Andrew J. G. ; Petrilli, Antonio Sergio. Insights on PRAME and osteosarcoma by means of gene expression profiling. Journal of Orthopaedic Science (Print),. p. 4, 2011. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF ORTHOPAEDIC SCIENCE ,)
      38. Cortez, D.A. ; Tonon, A.P. ; Colepicolo, P. ; VENCIO, R. Combining P values to improve classification of differential gene expression in the HTself software. Genetics and Molecular Research. v. 10, p. 1, 2011. Qualis: B3
      39. LIU, A. Y. ; PASCAL, L. E. ; VENCIO, R ; VENCIO, E. F.. Stromal-epithelial interactions in early neoplasia. Cancer Biomarkers. v. 9, p. 141-155, 2011. Qualis: Não identificado (CANCER BIOMARKERS)
      40. SILVA, I. T. ; VENCIO, R ; OLIVEIRA, T. Y. ; MOLFETTA, G. A. ; SILVA JUNIOR, W. A.. ProbFAST: Probabilistic Functional Analysis System Tool. BMC Bioinformatics. v. 11, p. 161, 2010. Qualis: A1
      41. FERNANDEZ-BECERRA, C. ; YAMAMOTO, M. M. ; VENCIO, R ; LACERDA, M. ; ROSANAS-URGELL, A. ; PORTILLO, H. A.. Plasmodium vivax and the importance of the subtelomeric multigene vir superfamily. Trends in Parasitology. v. 25, p. 44-51, 2009. Qualis: A1
      42. LEE, W. ; CUI, D. ; CZESNIKIEWICZ-GUZIK, M. ; VENCIO, R ; SHMULEVICH, I. ; ADEREM, A. ; WEYAND, C. M. ; GORONZY, J. J.. Age-dependent signature of metallothionein expression in primary CD4 T-cell responses is due to sustained zinc signaling. Rejuvenation Research. v. 11, p. 1001-1011, 2009. Qualis: A3
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Data de processamento: 14/02/2025 16:49:18