Programa de Pós Graduação em Bioinformática

2023

1.	ALNOCH, ROBSON C. ; SALGADO, JOSE C. S. ; ALVES, GABRIELA S. ; DE ANDRADES, DIANDRA ; MELEIRO, LUANA P. ; SEGATO, FERNANDO ; BERTO, GABRIELA LEILA ; WARD, RICHARD J. ; Buckeridge, Marcos S. ; Polizeli, Maria de Lourdes T. M.. Biochemical Characterization of an Endoglucanase GH7 from Thermophile Thermothielavioides terrestris Expressed on Aspergillus nidulans. Catalysts. v. 13, p. 582, issn: 2073-4344, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: A2
2.	ALVES, EDUARDO ; NAKAYA, HELDER ; GUIMARÃES, EUZÉBIO ; GARCIA, CÉLIA R.S.. Combining IP3 affinity chromatography and bioinformatics reveals a novel protein-IP3 binding site on Plasmodium falciparum MDR1 transporter. Current Research in Microbial Sciences. v. 4, p. 100179, issn: 2666-5174, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: Não identificado (CURRENT RESEARCH IN MICROBIAL SCIENCES)
3.	BARRETO, MATHEUS QUINTANA ; GARBELOTTI, CAROLINA VICTAL ; DE MOURA SOARES, JÉSSICA ; GRANDIS, Adriana ; BUCKERIDGE, MARCOS SILVEIRA ; LEONE, FRANCISCO ASSIS ; WARD, RICHARD JOHN. Xylose isomerase from Piromyces sp. E2 is a promiscuous enzyme with epimerase activity. ENZYME AND MICROBIAL TECHNOLOGY. v. 166, p. 110230, issn: 0141-0229, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: A2
4.	BOETTGER, BRUNO C. ; PIROUPO, CARLOS M. ; Setubal, João C. ; GIRARDELLO, RAQUEL ; PIGNATARI, ANTÔNIO C. C.. Co-carriage of Plasmid NDM and Chromosomal KPC in Klebsiella pneumoniae ST255 Human Wound Isolate in Brazil. CURRENT MICROBIOLOGY. v. 80, p. 394, issn: 0343-8651, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: B1
5.	BRITO, ANITA ; FRANCO, FELIPE ; BRENTANI, HELENA ; BELTRÃO-BRAGA, PATRÍCIA CRISTINA BALEEIRO. Assessment of vulnerability dimensions considering Family History and environmental interplay in Autism Spectrum Disorder. BMC Psychiatry. v. 23, p. 254, issn: 1471-244X, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: A3
6.	BUZZO, B. B. ; Giuliatti, Silvana ; PEREIRA, P. A. M. ; GOMES-PEPE, E. S. ; LEMOS, E. G. M.. Molecular Docking of Lac_CB10: Highlighting the Great Potential for Bioremediation of Recalcitrant Chemical Compounds by One Predicted Bacteroidetes CopA-Laccase. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES. v. 24, p. 9785, issn: 1422-0067, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: A2
7.	CANABARRO, N.I. ; SILVA-ORTIZ, P. ; NOGUEIRA, L.A.H. ; CANTARELLA, H. ; MACIEL-FILHO, R. ; SOUZA, G.M.. Sustainability assessment of ethanol and biodiesel production in Argentina, Brazil, Colombia, and Guatemala. RENEWABLE & SUSTAINABLE ENERGY REVIEWS. v. 171, p. 113019, issn: 1364-0321, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: A1
8.	CANTARELLA, HEITOR ; LEALSILVA, JEAN FELIPE ; Nogueira, Luiz Augusto Horta ; MACIELFILHO, RUBENS ; ROSSETTO, RAFFAELLA ; EKBOM, TOMAS ; SOUZA, GLAUCIA MENDES ; MUELLER'LANGER, FRANZISKA. Biofuel technologies: Lessons learned and pathways to decarbonization. Global Change Biology Bioenergy. v. 2023, p. 1-14, issn: 1757-1693, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: A1
9.	CARRAU, ANALÍA ; TANO, JOSEFINA ; MOYANO, LAURA ; RIPA, MARÍA BELÉN ; PETROCELLI, SILVANA ; PISKULIC, LAURA ; MOREIRA, LEANDRO MARCIO ; PATANÉ, JOSÉ SALVATORE LEISTER ; SETUBAL, JOÃO CARLOS ; ORELLANO, ELENA GRACIELA. A novel BLUF photoreceptor modulates the Xanthomonas citri subsp. citri-host plant interaction. PHOTOCHEMICAL SCIENCES (ONLINE). v. 1, p. 1, issn: 1474-9092, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: A3
10.	CASTILLO-ORDONEZ1, W. O. ; ARISTIZABAL-PACHON, A. F. ; ALVES, L. B. ; Giuliatti, Silvana. Epigenetic Regulation exerted by Caliphruria subedentata and Galantamine: An In Vitro and In Silico Approach for Mimic Alzheimer?s Disease. Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. v. 1, p. 3N-11, issn: 1538-0254, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: A3
11.	CONTATO, ALEX GRAÇA ; NOGUEIRA, KAROLINE MARIA VIEIRA ; BUCKERIDGE, MARCOS SILVEIRA ; SILVA, ROBERTO NASCIMENTO ; POLIZELI, MARIA DE LOURDES TEIXEIRA DE MORAES. Trichoderma longibrachiatum and thermothelomyces thermophilus co-culture: improvement the saccharification profile of different sugarcane bagasse varieties. BIOTECHNOLOGY LETTERS. v. 1, p. 1, issn: 0141-5492, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: A4
12.	CORRADI, CAMILA ; VILAR, JULIANA B ; BUZATTO, VANESSA C ; DE SOUZA, TIAGO A ; CASTRO, LIGIA P ; MUNFORD, VERIDIANA ; DE VECCHI, RODRIGO ; GALANTE, PEDRO A F ; ORPINELLI, FERNANDA ; MILLER, THIAGO L A ; BUZZO, JOSÉ L ; SOTTO, MIRIAN N ; SALDIVA, PAULO ; DE OLIVEIRA, JOCELÂNIO W ; CHAIBUB, SULAMITA C W ; Sarasin, Alain ; MENCK, CARLOS F M. Mutational signatures and increased retrotransposon insertions in xeroderma pigmentosum variant skin tumors. CARCINOGENESIS. v. 44, p. 511-524, issn: 0143-3334, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: A1
13.	CORREIA, BANNY SILVA BARBOSA ; DE MORAES PONTES, JOÃO GUILHERME ; NANI, JOÃO VICTOR SILVA ; VILLALTA, FABIAN ; MOR, NATALIA CRISTINA ; BORDINI, DANIELA ; BRUNONI, DÉCIO ; BRENTANI, HELENA ; MARI, JAIR JESUS ; HAYASHI, MIRIAN A. F. ; TASIC, LJUBICA. 1 H NMR Metabolomics and Lipidomics To Monitor Positive Responses in Children with Autism Spectrum Disorder Following a Guided Parental Intervention: A Pilot Study. ACS Chemical Neuroscience. v. 14, p. 1137-1145, issn: 1948-7193, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: A1
14.	COUTO-SILVA, C. M. ; NUNES, K. ; VENTURINI, G. ; CASTRO E SILVA, MARCOS ARAÚJO ; PEREIRA, L. V. ; COMAS, D. ; PEREIRA, A. C. ; HÜNEMEIER, T.. Indigenous people from Amazon show genetic signatures of pathogen-driven selection. SCIENCE ADVANCES. v. 00, p. 000, issn: 2375-2548, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: A1
15.	CUEVAS, S. A. P. ; Barroso da Silva, Fernando Luís ; ETCHEBEST, CATHERINE. NS1 from Two Zika Virus Strains Differently Interact with a Membrane: Insights to Understand their Differential Virulence. Journal of Chemical Information and Modeling. v. 63, p. 1386-1400, issn: 1549-9596, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: A1
16.	CUNHA, VANESSA A. S. ; TANDONNET, SOPHIE ; FERREIRA, DINIZ LIMA ; RODRIGUES, ANDRE V. ; Torres, Tatiana Teixeira. Exploring Life History Choices: Using Temperature and Substrate Type as Interacting Factors for Blowfly Larval and Female Preferences. Jove-Journal of Visualized Experiments. v. 201, p. e65835, issn: 1940-087X, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: B1
17.	DA MATTA, VANIA LUCIA R. ; GONÇALVES, ANDRÉ N. ; GOMES, CLÁUDIA MARIA C. ; CHOUMAN, ISLAM H. ; FERREIRA, FREDERICO M. ; CAMPOS, MARLIANE B. ; LIMA, LUCIANA V. ; VASCONCELOS DOS SANTOS, THIAGO ; RAMOS, PATRÍCIA KARLA ; FURTADO, RODRIGO R. ; LAURENTI, MARCIA D. ; CORBETT, CARLOS EDUARDO P. ; Nakaya, Helder I. ; SILVEIRA, FERNANDO T.. Gene Signatures of Symptomatic and Asymptomatic Clinical-Immunological Profiles of Human Infection by Leishmania (L.) chagasi in Amazonian Brazil. Microorganisms. v. 11, p. 653, issn: 2076-2607, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: B1
18.	DA SILVA, JOVANDERSON J.B. ; DE ABREU, LUÍS G.F. ; FERRARI, ALLAN J.R. ; DE CARVALHO, LUCAS M. ; Grandis, Adriana ; Buckeridge, Marcos S. ; FILL, TAÍCIA P. ; PEREIRA, GONÇALO A.G. ; CARAZZOLLE, MARCELO F.. Diurnal metabolism of energy-cane and sugarcane: A metabolomic and non-structural carbohydrate analysis. INDUSTRIAL CROPS AND PRODUCTS. v. 202, p. 117056, issn: 0926-6690, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: A1
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20.	DE ALMEIDA, LARISSA COSTA ; CALIL, FELIPE ANTUNES ; MORENO, NATÁLIA CESTARI ; REZENDE-TEIXEIRA, PAULA ; DE MORAES, LUIZ ALBERTO BERALDO ; JIMENEZ, PAULA CHRISTINE ; Menck, Carlos Frederico Martins ; MACHADO-NETO, JOÃO AGOSTINHO ; COSTA-LOTUFO, LETICIA VERAS. Exploring pradimicin-IRD antineoplastic mechanisms and related DNA repair pathways. CHEMICO-BIOLOGICAL INTERACTIONS. v. 371, p. 110342, issn: 0009-2797, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: A2
21.	DE SOUZA XAVIER COSTA, NATÁLIA ; RIBEIRO JÚNIOR, GABRIEL ; DO NASCIMENTO, ELLEN CAROLINE TOLEDO ; DE BRITO, JÔSE MARA ; ANTONANGELO, LEILA ; FARIA, CAROLINE SILVÉRIO ; MONTEIRO, JHONATAS SIRINO ; SETUBAL, JOÃO CARLOS ; PINHO, JOÃO RENATO REBELLO ; PEREIRA, ROBERTA VERCIANO ; SEELAENDER, MARILIA ; DE CASTRO, GABRIELA SALIM ; LIMA, JOANNA D. C. C. ; DE ALMEIDA MONTEIRO, RENATA APARECIDA ; DUARTE-NETO, AMARO NUNES ; SALDIVA, PAULO HILÁRIO NASCIMENTO ; FERRAZ DA SILVA, LUIZ FERNANDO ; DOLHNIKOFF, MARISA ; MAUAD, THAIS. COVID-19 induces more pronounced extracellular matrix deposition than other causes of ARDS. RESPIRATORY RESEARCH. v. 24, p. 281, issn: 1465-993X, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: A1
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23.	DOURADO, M. N. ; PIERRY, PAULO M. ; FEITOSA-JUNIOR, OSEIAS R. ; UCEDA-CAMPOS, GUILLERMO ; BARBOSA, D. ; ZAINI, Paulo A. ; DANDEKAR, A. M. ; A M da Silva ; ARAUJO, W. L.. Transcriptome and Secretome Analyses of Endophyte Methylobacterium mesophilicum and Pathogen Xylella fastidiosa Interacting Show Nutrient Competition. Microorganisms. v. 11, p. ARTN 2755, issn: 2076-2607, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: B1
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29.	FRANCO, FELIPEO. ; OLIVEIRA, JESSICAS. ; PORTOLESE, JOANA ; SUMIYA, FERNANDOM. ; SILVA, ANDRÉIAF. ; Machado-Lima, Ariane ; NUNES, FATIMAL.S. ; Brentani, Helena. Computer-aided autism diagnosis using visual attention models and eye-tracking: replication and improvement proposal. BMC Medical Informatics and Decision Making. v. 23, p. 285, issn: 1472-6947, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: A2
30.	GALHARDO, JULIANA ARENA ; BARBOSA, DAVID SOEIRO ; KMETIUK, LOUISE BACH ; DE CARVALHO, OTÁVIO VALÉRIO ; TEIXEIRA, ANA IZABEL PASSARELLA ; FONSECA, PAULA LUIZE CAMARGOS ; DE ARAÚJO E SANTOS, LUIZA CAMPOS GUERRA ; QUEIROZ, DANIEL COSTA ; MIRANDA, JOÃO VICTOR OLIVEIRA ; DA SILVA FILHO, ALUISIO PEREIRA ; CASTILLO, ANISLEIDY PÉREZ ; ARAUJO, RICARDO NASCIMENTO ; DA SILVEIRA, JULIA ANGELICA GONÇALVES ; RISTOW, LUIZ EDUARDO ; BRANDESPIM, DANIEL FRIGUGLIETTI ; PETTAN-BREWER, CHRISTINA ; DE SÁ GUIMARÃES, ANA MARCIA ; DUTRA, VALÉRIA ; DE MORAIS, HELIO AUTRAN ; DOS SANTOS, ANDREA PIRES. Molecular detection and characterization of SARS-CoV-2 in cats and dogs of positive owners during the first COVID-19 wave in Brazil. Scientific Reports. v. 13, p. x, issn: 2045-2322, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: A2
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37.	GUZMAN, GROVER E C ; Fujita, André. A fast algorithm to approximate the spectral density of locally tree-like networks with assortativity. Journal Of Complex Networks. v. 11, p. cnad005, issn: 2051-1329, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: A1
38.	INAGUE, ALEX ; ALECRIM, LILIAN COSTA ; MONTEIRO, JHONATAS SIRINO ; YOSHINAGA, MARCOS YUKIO ; SETUBAL, JOÃO CARLOS ; MIYAMOTO, SAYURI ; GIORDANO, RICARDO JOSÉ. Oxygen-induced pathological angiogenesis promotes intense lipid synthesis and remodeling in the retina. Iscience. v. 26, p. 106777, issn: 2589-0042, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: Não identificado (ISCIENCE)
39.	LAUX, MARCELE ; PIROUPO, CARLOS MORAIS ; SETUBAL, JOÃO CARLOS ; GIANI, ALESSANDRA. The Raphidiopsis (= Cylindrospermopsis) raciborskii pangenome updated: Two new metagenome-assembled genomes from the South American clade. HARMFUL ALGAE. v. 129, p. 102518, issn: 1568-9883, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: A1
40.	LAVEZZO, G. M. ; LAURETTO, M. ; ANDRIOLI, L. P. ; MACHADO-LIMA, A.. Position Weight Matrix or Acyclic Probabilistic Finite Automaton: Which model to use? A decision rule inferred for the prediction of transcription factor binding sites. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY (ONLINE VERSION). v. 46, p. e20230048, issn: 1678-4685, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: Não identificado (GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY (ONLINE VERSION))
41.	LI, QING CHEN, JIEYI FAUX, PIERRE DELGADO, MIGUEL EDUARDO BONFANTE, BETTY FUENTES-GUAJARDO, MACARENA MENDOZA-REVILLA, JAVIER CHACÓN-DUQUE, J. Automatic landmarking identifies new loci associated with face morphology and implicates Neanderthal introgression in human nasal shape. Communications Biology. v. 6, p. 000-000, issn: 2399-3642, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: C
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44.	LÁZARI, CAROLINA DOS SANTOS ; RAMUNDO, MARIANA SEVERO ; TEN-CATEN, FELIPE ; BRESSAN, CLARISSE S. ; DE FILIPPIS, ANA MARIA BISPO ; MANULI, ERIKA REGINA ; DE MORAES, ISABELLA ; PEREIRA, GEOVANA MARIA ; CÔRTES, MARINA FARREL ; CANDIDO, DARLAN DA SILVA ; GERBER, ALEXANDRA L. ; GUIMARÃES, ANA PAULA ; FARIA, NUNO RODRIGUES ; Nakaya, Helder I. ; VASCONCELOS, ANA TEREZA R. ; BRASIL, PATRÍCIA ; PARANHOS-BACCALÀ, GLÁUCIA ; SABINO, ESTER CERDEIRA. Clinical markers of post-Chikungunya chronic inflammatory joint disease: A Brazilian cohort. PLoS Neglected Tropical Diseases. v. 17, p. e0011037, issn: 1935-2735, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: A1
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46.	MAGRINO, JOSEPH ; MUNFORD, VERIDIANA ; MARTINS, DAVI JARDIM ; HOMMA, THAIS K. ; PAGE, BRENDAN ; GAUBITZ, CHRISTL ; FREIRE, BRUNA L. ; LERARIO, ANTONIO M. ; VILAR, JULIANA BRANDSTETTER ; AMORIN, ANTONIO ; LEÃO, EMÍLIA K.E. ; KOK, FERNANDO ; MENCK, CARLOS FM. ; JORGE, ALEXANDER AL. ; KELCH, BRIAN A.. A thermosensitive PCNA allele underlies an ataxia-telangiectasia-like disorder. JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY. v. 299, p. 104656, issn: 0021-9258, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: A1
47.	MANFRERE, KELLY CRISTINA GOMES ; TORREALBA, MARINA PASSOS ; FERREIRA, FREDERICO MORAES ; DE SOUSA, EMANUELLA SARMENTO ALHO ; MIYASHIRO, DENIS ; TEIXEIRA, FRANCIANE MOURADIAN EMIDIO ; CUSTÓDIO, RICARDO WESLEY ALBERCA ; Nakaya, Helder I. ; RAMOS, YASMIN ALEFE LEUZZI ; SOTTO, MIRIAN NACAGAMI ; WOETMANN, ANDERS ; ØDUM, NIELS ; DUARTE, ALBERTO JOSÉ DA SILVA ; SANCHES, JOSÉ ANTONIO ; SATO, MARIA NOTOMI. Imbalanced IL-1B and IL-18 Expression in Sézary Syndrome. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES. v. 24, p. 4674, issn: 1422-0067, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: A2
48.	MARTINS, DAVI JARDIM ; SINGH, JENNY KAUR ; JAHJAH, TIYA ; VESSONI, ALEXANDRE TEIXEIRA ; LEANDRO, GIOVANA DA SILVA ; SILVA, MATHEUS MOLINA ; BIARD, DENIS SERGE FRANÇOIS ; QUINET, ANNABEL ; Menck, Carlos Frederico Martins. Polymerase iota plays a key role during translesion synthesis of UV -induced lesions in the absence of polymerase eta. PHOTOCHEMISTRY AND PHOTOBIOLOGY. v. 100, p. 4-18, issn: 0031-8655, 2023. [ citações Google Scholar \| citações Microsoft Acadêmico \| busca Google ] Qualis: A4
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