Departamento de Ciência da Computação

Junior Barrera

possui graduação em Engenharia Elétrica pela Escola Politécnica da Universidade de São Paulo (1983); mestrado em Computação Aplicada pelo Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais (1987); doutorado em Engenharia Elétrica pela Escola Politécnica da Universidade de São Paulo (1992) - parte da pesquisa realizada na École National des Mines de Paris; livre docência pelo Instituto de Matemática e Estatística da USP (1998); titularidade em Ciência da Computação pelo Instituto de Matemática e Estatística da USP (2005) e pela Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto (2008). Atualmente, é professor titular do Departamento de Ciência da Computação do IME-USP. Tem experiência na área de Ciência da Computação, com ênfase em Matemática da Computação, tendo realizado desenvolvimentos teóricos nos seguintes temas: morfologia matemática, aprendizado de operadores morfológicos, modelagem e identificação de sistemas dinâmicos de reticulado. Ainda, tem realizado aplicações dessas técnicas em processamento e análise de imagens, vídeo digital, análise de expressão gênica, modelagem de sistemas biológicos e esportes coletivos de invasão. (Texto informado pelo autor)

http://lattes.cnpq.br/0362417828475021 (16/03/2022)

Rótulo/Grupo:

Bolsa CNPq:

Período de análise:

Endereço: Universidade de São Paulo, Instituto de Matemática e Estatística. Rua do Matão Butantã 05508090 - São Paulo, SP - Brasil Telefone: (11) 30916135 Fax: (11) 30916134 URL da Homepage: www.esience.ime.usp.br

Grande área: Ciências Exatas e da Terra

Área: Ciência da Computação

Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Artigos completos publicados em periódicos (46)
1. DREZNER, RENE ; LAMAS, L. ; DE FARIAS, CLÉVER R.G. ; BARRERA, Junior ; Dantas, Luis. A method for classifying and evaluating the efficiency of offensive playing styles in soccer. JOURNAL OF PHYSICAL EDUCATION AND SPORT. v. 20, p. 1284-1294, 2020.Qualis: B3
2. ATASHPAZ-GARGARI, ESMAEIL ; Reis, Marcelo S. ; BRAGA-NETO, ULISSES M. ; BARRERA, JUNIOR ; DOUGHERTY, EDWARD R.. A fast Branch-and-Bound algorithm for U-curve feature selection. PATTERN RECOGNITION. v. 73, p. 172-188, 2018. Qualis: A1
3. MARCONDES, DIEGO ; SIMONIS, ADILSON ; BARRERA, JUNIOR. Feature Selection based on the Local Lift Dependence Scale. Entropy. v. 20, p. 97, 2018. Qualis: A4
4. LAMAS, LEONARDO ; DREZNER, RENE ; OTRANTO, GUILHERME ; BARRERA, JUNIOR ; DENG, YONG. Analytic method for evaluating players’ decisions in team sports: Applications to the soccer goalkeeper. PLoS One. v. 13, p. e0191431, 2018. Qualis: A1
5. Reis, Marcelo S. ; Estrela, G. ; FERREIRA, C. E. ; BARRERA, Junior. Optimal Boolean lattice-based algorithms for the U-curve optimization problem. INFORMATION SCIENCES. v. 471, p. 97-114, 2018. Qualis: A1
6. REIS, MARCELO S. ; ESTRELA, GUSTAVO ; FERREIRA, CARLOS EDUARDO ; BARRERA, JUNIOR. featsel: A framework for benchmarking of feature selection algorithms and cost functions. SoftwareX. v. 6, p. 193-197, 2017. Qualis: A2
7. BARRERA ; FONSECA, ANDRÉ ; GUBITOSO, MARCO ; REIS, MARCELO ; de Souza SJ ; BARRERA, Junior. A New Approach for Identification of Cancer-related Pathways using Protein Networks and Genomic Data. Cancer Informatics. v. 14, p. 139-149, 2016. Qualis: B2
8. Santana, F. ; ROSTAISER, E. ; SHERZER, E. ; UGRINOWITSCH, C. ; BARRERA, Junior ; LAMAS, L.. Space protection dynamics validation in basketball and innovative teams' evaluation.. Motriz : Revista de Educação Física (Online). v. 21, p. 34-44, 2015.Qualis: B1
9. CUBAS, CARLOS FERNANDO MONTOYA ; MARTINS-JR, DAVID CORREA ; SANTOS, CARLOS SILVA ; BARRERA, JUNIOR. Linear grouping of predictor instances to infer gene networks. Network Modeling Analysis in Health Informatics and Bioinformatics. v. 4, p. 34, 2015. Qualis: Não identificado (NETWORK MODELING ANALYSIS IN HEALTH INFORMATICS AND BIOINFORMATICS)
10. LAMAS, L. ; BARRERA, Junior ; Otranto, G. ; UGRINOWITSCH, C.. Invasion team sports: strategy and match modelling. International Journal of Performance Analysis in Sport. v. 14, p. 307-329, 2014.Qualis: A4
11. Lopes, Fabrício M. ; MARTINS JR, David Corrêa ; BARRERA, Junior ; Cesar, Roberto M.. A feature selection technique for inference of graphs from their known topological properties: Revealing scale-free gene regulatory networks. Information Sciences. v. 272, p. 1-15, 2014. Qualis: A1
12. TREPODE, NESTOR W. ; DE FARIAS, CLÉVER R.G. ; BARRERA, JUNIOR. A pattern-oriented specification of gene network inference processes. Computers in Biology and Medicine. v. 43, p. 1415-1427, 2013. Qualis: A2
13. LIMA, L. A. ; Lima, Leandro de A. ; BARRERA, Junior ; RIS, M. ; BRENTANI, M. M. ; BRENTANI, H.. Computing a Predictor Set Influence Zone through a Multi-Layer Genetic Network to Explore the Role of Estrogen in Breast Cancer. Advances in Breast Cancer Research. v. 01, p. 21-29, 2012. Qualis: Não identificado (ADVANCES IN BREAST CANCER RESEARCH)
14. LAMAS, L. ; BARRERA, Junior ; Otranto, G. ; UGRINOWITSCH, C.. Elementos estruturais de um modelo formal dos esportes coletivos de invasão.. Revista Brasileira de Educacao Fisica e Esporte. v. 26, p. 765-778, 2012.Qualis: B3 (REVISTA BRASILEIRA DE EDUCAÇÃO FÍSICA E ESPORTE)
15. NAJMAN, LAURENT ; BARRERA, JUNIOR ; SAGAR, B. S. DAYA ; MARAGOS, PETROS ; SCHONFELD, DAN. Introduction to the Issue on Filtering and Segmentation With Mathematical Morphology. IEEE Journal of Selected Topics in Signal Processing. v. 6, p. 737-738, 2012. Qualis: A1
16. DANTAS, D. O. ; BARRERA, Junior. Automatic generation of wrapper code for vídeo processing functions. Learning and Nonlinear Models. v. 9, p. 130-137, 2011. Qualis: B2
17. RIS, Marcelo ; BARRERA, Junior ; MARTINS JR, D C. U-curve: A branch-and-bound optimization algorithm for U-shaped cost functions on Boolean lattices applied to the feature selection problem. Pattern Recognition. v. 43, p. 557-568, 2010.Qualis: A1
18. DELLAMONICA, D. ; SILVA, P J S ; Humes Jr ; HIRATA, N. S. T. ; BARRERA, Junior. An Exact Algorithm for Optimal MAE Stack Filter Design. IEEE Transactions on Image Processing. v. 16, p. 453-462, 2007.Qualis: A1
19. TREPODE, N. W. ; ARMELIN, H. A. ; BITTNER, M ; BARRERA, Junior ; GUBITOSO, M. D. ; HASHIMOTO, R.F.. A Robust Structural PGN Model for Control of Cell-Cycle Progression Stabilized by Negative Feedbacks. EURASIP Journal on Bioinformatics and Systems Biology (Online). v. 2007, p. 73109-73120, 2007. Qualis: Não identificado (EURASIP JOURNAL ON BIOINFORMATICS AND SYSTEMS BIOLOGY)
20. BARRERA, Junior; CESAR JR, Roberto Marcondes ; Humes Jr ; MARTINS JR, David Corrêa ; PATRAO, D. F. C. ; SILVA, Paulo J S ; Bretani, H.. A feature selection approach for identification of signature genes from SAGE data. BMC Bioinformatics. v. 8, p. 1, 2007.Qualis: A1
21. Stransky, B. ; MACHADO, Lucila Ohno ; BARRERA, Junior ; Souza, S. J.. MODELING CANCER: INTEGRATION OF OMICS INFORMATION IN DYNAMIC SYSTEMS. Journal of Bioinformatics and Computational Biology. v. 5, p. 977-986, 2007.Qualis: B1
22. MARTINS JR, D C ; CESAR JR, Roberto M ; BARRERA, Junior. W-operator window design by minimization of mean conditional entropy. Pattern Analysis and Applications. v. 9, p. 139-153, 2006.Qualis: A4
23. SILVA, Paulo J S ; HASHIMOTO, Ronaldo F ; KIM, Seungchan ; BARRERA, Junior ; BRANDÃO, Leônidas O ; SUH, Edward ; DOUGHERTY, Edward R. Feature selection algorithms to find strong genes. Pattern Recognition Letters. v. 26, p. 1444-1453, 2005.Qualis: A2
24. HIRATA, N. S. T. ; BARRERA, Junior. A Unifying View for Stack Filter Design Based on Graph Search Methods. Pattern Recognition. v. 38, p. 2088-2098, 2005.Qualis: A1
25. BARRERA, Junior; CESAR JUNIOR, R. M. ; FERREIRA, J. E. ; GUBITOSO, M. D.. An environment for knowledge discovery in Biology. COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE, Washington, DC ,USA, July 2004. v. 34, n. 5, p. 427-447, 2004.Qualis: Não identificado (COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE, WASHINGTON, DC ,USA, JULY 2004)
26. BRUN, Marcel ; HIRATA JR, Roberto ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R. Nonlinear filter design using envelopes. Journal Of Mathematical Image And Vision, Estados Unidos. v. 21, n. 1, p. 81-97, 2004.Qualis: Não identificado (JOURNAL OF MATHEMATICAL IMAGE AND VISION, ESTADOS UNIDOS)
27. BARRERA, Junior; TORRES, Martha. A parallel algorithm for finding small sets of genes that are enough to distinguish two biological states. Genetics and Molecular Biology, Brasil. v. 27, n. 4, p. 686-690, 2004.Qualis: Não identificado (GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, BRASIL)
28. COSTA, Luciano da Fontoura ; CESAR JR, Roberto Marcondes ; BARRERA, JUNIOR. Editorial - Special section on Bioinformatics. Genetics and Molecular Biology (Impresso). v. 27, p. 604-604, 2004. Qualis: A4
29. HASHIMOTO, R. F. ; BARRERA, Junior. A greedy algorithm for decomposing convex structuring elements. Journal of Mathematical Imaging and Vision. v. 8, p. 269-289, 2003.Qualis: A1
30. BRUN, Marcel ; DOUGHERTY, Edward R ; HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior. Design of optimal binary filters under joint multiresolution-envelope constraint.. Pattern recognition letters. v. 24, p. 937-945, 2003.Qualis: A2
31. HASHIMOTO, R. F. ; BARRERA, Junior. A note on Park and Chin algorithm. IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence. v. 24, n. 1, p. 139-144, 2002.Qualis: Não identificado (IEEE TRANSACTIONS ON PATTERN ANALYSIS AND MACHINE INTELLIGENCE)
32. DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior ; BRUN, Marcel ; KIM, S ; CESAR JR, Roberto Marcondes ; CHEN, Y. ; BITNER, M. ; TRENT, J.. Inference from clustering with application to gene expression microarrays. Journal of Computational Biology, Estados Unidos. v. 9, n. 1, p. 105-126, 2002.Qualis: Não identificado (JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY, ESTADOS UNIDOS)
33. KIM, S ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R ; CHEN, Y. ; BITNER, M. ; TRENT, J.. Strong feature sets from small samples. Journal of Computational Biology. v. 9, n. 1, p. 127-146, 2002.Qualis: A4
34. HIRATA JR, R. ; BRUN, Marcel ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R. Multiresolution design of aperture operators. Journal of Mathematical Image and Vision. v. 19, p. 199-222, 2002.Qualis: A1 (JOURNAL OF MATHEMATICAL IMAGING AND VISION)
35. HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior ; HASHIMOTO, Ronaldo F ; DANTAS, D. O. ; ESTEVES, G. P.. Segmentation of microarray images by mathematical morphology. Real time imaging, Estados Unidos. v. 8, p. 491-505, 2002. Qualis: Não identificado (REAL TIME IMAGING, ESTADOS UNIDOS)
36. DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior. Pattern recognition theory in nonlinear signal processing. Journal of Mathematical Imaging and Vision. v. 16, p. 181-197, 2002.Qualis: A1
37. DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior ; MOZELLEL, Gerard ; BRUN, Marcel. Multiresolution Analysis for Optimal Binary Filters. Journal Of Mathematical Image And Vision. v. 14, n. 1, p. 53-72, 2001.Qualis: A1 (JOURNAL OF MATHEMATICAL IMAGING AND VISION)
38. BARRERA, Junior; HASHIMOTO, R. F.. From the sup-decomposition to sequential decompositions. Journal of Mathematical Imaging And Vision. v. 15, n. 3, p. 197-216, 2001. Qualis: A1
39. BARRERA, Junior; HASHIMOTO, R. F.. Sub-compact and inf-compact representations of W-operators. Fundamenta Informaticae. v. 45, n. 4, p. 283-294, 2001.Qualis: A2
40. TOMITA, N. S. ; DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior. Iterative Design of Morphological Binary Image Operators. Optical Engineering (Bellingham). v. 39, n. 12, p. 3106-3123, 2000.Qualis: A3
41. HASHIMOTO, Ronaldo F ; BARRERA, Junior ; FERREIRA, C. E.. A combinatorial optimization technique for the sequential decomposition of erosions and dilations. Journal of Mathematical Imaging and Vision. v. 14, n. 1, p. 17-33, 2000. Qualis: A1
42. BARRERA, Junior; DOUGHERTY, Edward R ; BRUN, Marcel. Hybrid human-machine binary morphological operator design. Signal Processing. v. 80, p. 1469-1487, 2000.Qualis: A1
43. TOMITA, N. S. T. ; DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior. A switching algorithm for design of optimal increasing binary filters over large windows. Pattern Recognition. v. 33, n. 6, p. 1059-1081, 2000.Qualis: A1
44. BARRERA, Junior; DOUGHERTY, Edward R ; HIRATA JR, R.. Aperture filters. Signal Processing. v. 80, n. 4, p. 697-721, 2000.Qualis: A1
45. BARRERA, Junior; TERADA, R. ; HIRATA JR, R. ; TOMITA, N. S. T.. Automatic programming of morphological machines by PAC learning. Fundamenta Informaticae. v. 41, p. 229-258, 2000.Qualis: A2
46. KAMAT, V. ; DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior. Multiresolution Bayesian design of binary filters. Electronic Imaging. v. 9, n. 3, p. 283-295, 2000. Qualis: Não identificado (ELECTRONIC IMAGING)
Livros publicados/organizados ou edições (3)
1. BANON, G. J. F. (Org.) ; BARRERA, Junior (Org.) ; BRAGA NETO, U. M. (Org.). Mathematical Morphology and its applications to Signal and Image Processing. 1 ed. São José dos Campos: INPE, 2007. v. 200, p. 475.
2. COSTA, Luciano da Fontoura (Org.) ; BARRERA, Junior (Org.) ; KOSLOW, Steven (Org.) ; CESAR JR, Roberto M (Org.). Real-Time Imaging. Special Issue on Image Processing for Molecular Biology. Elsevier. Real-Time Imaging. Special Issue on Image Processing for Molecular Biology. Elsevier, 2004. .
3. COSTA, Luciano da Fontoura (Org.) ; CESAR JR, Roberto Marcondes (Org.) ; BARRERA, Junior (Org.). Genetics and Molecular Biology. Special Section on Bioinformatics.. Brazilian Society for Genetics. Genetics and Molecular Biology. Special Section on Bioinformatics.. Brazilian Society for Genetics, 2004. .
Capítulos de livros publicados (7)
1. Reis, Marcelo S. ; Noël, Vincent ; Dias, Matheus H. ; Albuquerque, Layra L. ; Guimarães, Amanda S. ; Wu, Lulu ; BARRERA, JUNIOR ; Armelin, Hugo A.. An Interdisciplinary Approach for Designing Kinetic Models of the Ras/MAPK Signaling Pathway. Em: Paul Huang; Aik Choon Tan. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York. : Springer New York. 2017.v. 1636, p. 455-474.
2. DURHAM, A. ; SETUBAL, J. C. ; BARRERA, Junior. Interdisciplinaridade em ação na pesquisa e pós-graduação em bioinformática. Em: Arlindo Phillippi Jr; Valdir Fernandes. (Org.). Práticas da Interdisciplinaridade no Ensino e Pesquisa. 1ed.Editora Manole. : Brueri, São Paulo. 2015.p. 619-642.
3. LAMAS, L. ; BARRERA, Junior ; Santana, F. ; UGRINOWITSCH, C.. Team sports modeling: building a framework for quantitative approaches. Em: Juarez Vieira do Nascimento; Valmor Ramos; Fernando Tavares. (Org.). Jogos Desportivos: Formação e Investigação. 1ed.Florianópolis. : EUDESC. 2013.v. 2013, p. 439-462.
4. BARRERA, Junior; BANON, G. J. F. ; DOUGHERTY, Edward R. Automatic design of morphological operators. Em: Michel Bilodeau, Fernand Meyer, Michel Schimitt. (Org.). Space, Structure and Randomness. : Springer. 2007.v. 1, .
5. BARRERA, Junior; CESAR JUNIOR, R. M. ; MARTINS JR, David Corrêa ; VÊNCIO, R Z ; MERINO, E F ; YAMAMOTO, M M ; LEONARDI, Florência G ; PEREIRA, C A B ; Obano, H. P.. Constructing probabilistic genetic networks of Plasmodium falciparum from dynamical expression signals of the intraerythrocytic development cycle. In:. Em: J Shoemaker et al. (Org.).. (Org.). Methods of Microarray Data Analysis. : Springer Verlag. 2006.v. 5, .
6. HIRATA JR, Roberto ; BARRERA, Junior ; BRUN, Marcel ; DOUGHERTY, E R. Aperture filtures: theory, application and multi-resolution analysis. Em: Stephen Marshall; Giovanni L. Sicuranza.. (Org.). ADVANCES ON NONLINEAR SIGNAL AND IMAGE PROCESSING.. 1ed. : Hindawi Publishing Corporation. 2005.v. 6, p. 15-45.
7. BARRERA, Junior; TERADA, R. ; HIRATA JR, R. ; HIRATA, N. S. T.. Automatic Programming of Morphological Machines. Em: Henk Heijmans; John Goutsias. (Org.). Mathematical Morphology. 2000.p. 229-258.
Textos em jornais de notícias/revistas (4)
1. BARRERA, Junior. O ingresso de estudantes na USP: um problema estratégico para o desenvolvimento nacional. Jornal da USP, USP - São Paulo, p. 2-2, 01 fev. 2016.
2. DIAS, L. A. V. ; C NETO, G. ; BARRERA, Junior ; SOUZA, R. C. M.. Imagens e computadores: uma nova fronteira. Ciência Hoje, , v. 7 - 37, p. 35-44, .
3. BARRERA, Junior. Equívoco na Definição das faixas etárias na base. Cidade do Futebol, Cidade do Futebol, .
4. BARRERA, Junior. Um modelo de inteligência do jogador de futebol. Cidade do Futebol, .
Trabalhos completos publicados em anais de congressos (45)
1. LAMAS, L. ; Otranto, G. ; BARRERA, Junior. Computational system for strategy design and match simulation in team sports. Em: 10th International Symposium on Computer Science in Spor, p. xx-xx, 2015. Qualis: Não identificado (10th International Symposium on Computer Science in Spor)
2. LAMAS, L. ; Santana, F. ; Otranto, G. ; BARRERA, Junior. Inference of team sports strategies based on a library of states: application to basketball. Em: In KDDD 2014 - Workshop on Large Scale Sports Analytics, v. 1, p. 1-8, 2014.Qualis: Não identificado (In KDDD 2014 - Workshop on Large Scale Sports Analytics)
3. Montoya Cubas, C. F. ; MARTINS JR, David C ; Santos, C. S. ; BARRERA, Junior. Gene network Inference through linear grouping of variables. Em: Conference on Bioinformatics and Bioengineering, p. 243, 2014.Qualis: Não identificado (Conference on Bioinformatics and Bioengineering)
4. REIS, M. S. ; BARRERA, Junior. Solving problems in mathematical morphology through reduction to the U-curve problem. Em: ISMM - Mathematical Morphology and its applications to Signal and Image Processing, v. 11, p. 49-60, 2013.Qualis: Não identificado (ISMM - Mathematical Morphology and its applications to Signal and Image Processing)
5. CASTRO, J. E. S. ; HASHIMOTO, Ronaldo F ; BARRERA, Junior. Analytical Solutions for Minkowski Addition Equation. Em: ISMM 2013 - Mathematical Morphology and its applications to Signal and Image Processing, v. 11, p. 61-72, 2013.Qualis: Não identificado (ISMM 2013 - Mathematical Morphology and its applications to Signal and Image Processing)
6. MIRANDA, G. ; SOARES, E. ; BARRERA, Junior ; Felipe, J. C.. Method to Support Diagnosis of Cervical Intraepithelial Neoplasia (CIN) Based on Structural Analysis of Histological Images. Em: 25th IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems, v. 1, 2012.Qualis: Não identificado (25th IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems)
7. MIRANDA, G. ; BARRERA, Junior ; SOARES, E. ; Felipe, J. C.. Method for Computational Analysis of histopathological images to Support the Diagnosis of Cervical Cancer. Em: SIBGRAPI, v. 1, 2012.Qualis: Não identificado (SIBGRAPI)
8. LOPES, Fabrício M. ; MARTINS JR, David ; BARRERA, Junior ; CESAR JR, Roberto M. SFFS-MR: a floating search strategy for GRNs inference. Em: 5th IAPR International Conference on Pattern Recognition in Bioinformatics (PRIB, v. 6282, p. 407-418, 2010.Qualis: Não identificado (5th IAPR International Conference on Pattern Recognition in Bioinformatics (PRIB)
9. HIRATA, N. S. T. ; HIRATA JR, Roberto ; BARRERA, Junior. Basis Computation Algorithm. Em: International Symposium on Mathematical Morphology, p. 15-26, 2007.Qualis: Não identificado (International Symposium on Mathematical Morphology)
10. BARRERA, Junior; HASHIMOTO, R F. Binary Decision Diagrams as a New Paradigm for Morphological Machines. Em: International Symposium on Mathematical Morphology, p. 3-12, 2005.Qualis: Não identificado (International Symposium on Mathematical Morphology)
11. VAQUERO, Daniel André ; BARRERA, Junior ; HIRATA JR, R.. A maximum likelyhood approach for multi-resolution W-operator design. Em: SIBGRAPI, 2005.Qualis: Não identificado (SIBGRAPI)
12. MARTINS JR, David Corrêa ; CESAR JR, Roberto Marcondes ; BARRERA, Junior. Automatic window design for gray-scale image processing based on entropy minimization. Em: CIARP, 2005.Qualis: Não identificado (CIARP)
13. RIS, Marcelo ; BARRERA, Junior ; Bretani, H.. U-curve search for biological state characterization and genetic network design. Em: GENSIPS, 2005.Qualis: Não identificado (GENSIPS)
14. TREPODE, Nestor W ; ARMELIN, H. A. ; BITNER, M. ; BARRERA, Junior ; GUBITOSO, M. D. ; HASHIMOTO, R. F.. Modeling cell cycle regulation by discrete dynamical systems. Em: GENSIPS, 2005.Qualis: Não identificado (GENSIPS)
15. MARTINS JR, David Corrêa ; CESAR JR, Roberto Marcondes ; BARRERA, Junior. W-operator window design by maximization of training data information. Em: Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing, p. 162-169, 2004.Qualis: Não identificado (Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing)
16. BARRERA, Junior; CESAR JR, Roberto Marcondes ; MERINO, E F ; PEREIRA, C A B ; VÊNCIO, R Z ; LEONARDI, F G ; YAMAMOTO, M M ; PORTILLO, H A. A new annotation tool for malaria based on inference of probabilistic genetic networks. Em: Critical Assessment of Microarray Data Analysis (CAMDA 2004), p. 36-40, 2004.Qualis: Não identificado (Critical Assessment of Microarray Data Analysis (CAMDA 2004))
17. BARRERA, Junior; CESAR JR, Roberto M ; DANTAS, Daniel de O ; MARTINS JR, David C ; TREPODE, Nestor W. From microarray images to biological knowledge. Em: Simpósio Brasileiro em Matemática e Biologia Computacional, 2003.Qualis: Não identificado (Simpósio Brasileiro em Matemática e Biologia Computacional)
18. TORRES, Martha ; BARRERA, Junior ; GOLDMAN, A.. A parallel Algorithm for enumerating combinations. Em: International Conference on Parallel Processing (ICPP'03), v. 1, p. 581-588, 2003.Qualis: Não identificado (International Conference on Parallel Processing (ICPP'03))
19. HIRATA, N. S. T. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R ; TERADA, R.. The incremental splitting of intervals algorithm for the design of binary image operators. Em: international Symposium of Mathematical Morphology, p. 219-227, 2002.Qualis: Não identificado (international Symposium of Mathematical Morphology)
20. BARRERA, Junior; MARTIN, P. A. ; DOUGHERTY, Edward R ; GUBITOSO, M. D.. Identification of input-free finite lattice dynamical systems under envelope constraints. Em: International Symposium on Mathematical Morphology, p. 337-345, 2002.Qualis: Não identificado (International Symposium on Mathematical Morphology)
21. TORRES, Martha ; BARRERA, Junior ; HIRATA, N. S. T.. A high performance algorithm for Boolean function minimization: the partioned incremental splitting of intervals (PISI). Em: SPIE 2002, v. 4667, p. 386-395, 2002.Qualis: Não identificado (SPIE 2002)
22. BRUN, Marcel ; BALAGURUNATHAN, Y. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, E.R.. Clustering granulometric features. Em: SPIE 2002, v. 4667, p. 36-42, 2002.Qualis: Não identificado (SPIE 2002)
23. BALAGURUNATHAN, Y. ; HASHIMOTO, R.F. ; KIM, S. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, E.R.. Granulometric classifiers from small samples. Em: SPIE 2002, v. 4667, p. 100-108, 2002.Qualis: Não identificado (SPIE 2002)
24. DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior ; BRUN, Marcel ; KIM, S ; CESAR JUNIOR, R. M. ; CHEN, Y. ; BITNER, M. ; TRENT, J.. Time series inference from clustering. Em: SPIE Microarrays: Optical Technologies and Informatics, v. 4266, p. 222-227, 2001.Qualis: Não identificado (SPIE Microarrays: Optical Technologies and Informatics)
25. KIM, S ; DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior ; CHEN, Y. ; BITNER, M. ; TRENT, J.. Finding Robust Linear Expression-Based Classifiers. Em: SPIE Microarrays: Optical Technologies and Informatics, v. 4266, p. 207-212, 2001.Qualis: Não identificado (SPIE Microarrays: Optical Technologies and Informatics)
26. ARMELIN, H. A. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R ; GUBITOSO, M. D. ; FERREIRA, J. E. ; HIRATA, N. S. T. ; NEVES, E. J.. A simulator for gene expression networks. Em: SPIE Microarrays: Optical Technologies and Informatics, v. 4266, p. 248-259, 2001.Qualis: Não identificado (SPIE Microarrays: Optical Technologies and Informatics)
27. HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior ; HASHIMOTO, Ronaldo F ; DANTAS, D. O.. Microarray gridding by mathematical morphology. Em: SIBGRAPI, p. 112-119, 2001.Qualis: Não identificado (SIBGRAPI)
28. BRUN, Marcel ; HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R. Hybrid human-machine non-linear filter design using envelopes. Em: SIBGRAPI, p. 106-111, 2001.Qualis: Não identificado (SIBGRAPI)
29. HIRATA JR, R. ; BRUN, Marcel ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R. Image restoration by multiresolution aperture filters. Em: NonLinear Image Processing and Pattern Analysis XII, v. 4304, p. 256-264, 2001.Qualis: Não identificado (NonLinear Image Processing and Pattern Analysis XII)
30. BRUN, Marcel ; BARRERA, Junior ; HIRATA, N. S. T. ; TREPODE, N. W. ; DANTAS, D. O. ; TERADA, R.. Multiresolution classification trees in OCR design. Em: SIBGRAPI, p. 59-66, 2001.Qualis: Não identificado (SIBGRAPI)
31. DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior ; GUBITOSO, M. D. ; HIRATA, N. S. T.. Dynamical systems with morphological transitions. Em: NSIP, 2001.Qualis: Não identificado (NSIP)
32. BARRERA, Junior; DOUGHERTY, Edward R ; GUBITOSO, M. D. ; HIRATA, N. S. T.. Modeling temporal morphological systems via lattice dynamical systems. Em: Non Linear Image Processing and Pattern Analysis XII - SPIE, v. 4304, p. 265-276, 2001.Qualis: Não identificado (Non Linear Image Processing and Pattern Analysis XII - SPIE)
33. DOUGHERTY, E R ; BARRERA, Junior. Nonlinear filtering and pattern recognition: are they the same?. Em: Nonlinear Image Processing and Pattern Analysis XII, v. 4304, p. 1-6, 2001.Qualis: Não identificado (Nonlinear Image Processing and Pattern Analysis XII)
34. BARRERA, Junior; BRUN, Marcel ; TERADA, R.. Boosting OCR classifier by optimal edge noise filtering. Em: International Simposium on Mathematical Morphology, p. 371-380, 2000.Qualis: Não identificado (International Simposium on Mathematical Morphology)
35. HIRATA JR, R. ; DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior. Some applications of aperture filters. Em: International Simposium on Mathematical Morphology, p. 119-128, 2000.Qualis: Não identificado (International Simposium on Mathematical Morphology)
36. DOUGHERTY, Edward R ; KIM, S ; MOZELLE, G. ; BARRERA, Junior ; BRUN, Marcel. Multiresolution filter design. Em: Conference of the International Society for Optical Engineering, v. 3961, p. 12-21, 2000.Qualis: Não identificado (Conference of the International Society for Optical Engineering)
37. KAMAT, V. ; DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior. Bayesian Multiresolution filter design. Em: SPIE Nonlinear Image processing, v. 3961, p. 22-33, 2000.Qualis: Não identificado (SPIE Nonlinear Image processing)
38. BARRERA, Junior; DOUGHERTY, Edward R. Design of Statistically Optimal Morphological Operators. Em: European Signal Processing Conference, 2000.Qualis: Não identificado (European Signal Processing Conference)
39. HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R. Design of Gray-Scale Nonlinear filters via multiresolution apertures. Em: European Signal Processing Conference, 2000.Qualis: Não identificado (European Signal Processing Conference)
40. HIRATA, N. S. T. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R. Bayesian Switching algorithm for the optimal increasing binary filter. Em: European Signal Processing Conference, v. IV, p. 1889-1892, 2000.Qualis: Não identificado (European Signal Processing Conference)
41. MADEIRA, H. M. ; BARRERA, Junior. Incremental evaluation of BDD-represented set operaators. Em: Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing, p. 308-315, 2000.Qualis: Não identificado (Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing)
42. HIRATA, N. S. T. ; BARRERA, Junior ; TERADA, R.. Text segmentation by automatically designed morphological operators. Em: Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing, p. 284-291, 2000.Qualis: Não identificado (Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing)
43. HIRATA JR, R. ; FLORES, F. C. ; BARRERA, Junior ; LOTUFO, R. A. ; MEYER, F.. Color Image Gradients for Morphological Segmentation. Em: Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing, p. 316-323, 2000.Qualis: Não identificado (Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing)
44. BARRERA, Junior; FLORES, F. C. ; HIRATA JR, R. ; LOTUFO, R. A. ; MEYER, F.. Morphological operators for segmentation of color images. Em: Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing, p. 300-307, 2000.Qualis: Não identificado (Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing)
45. HASHIMOTO, R F ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, E R. From the sup-decomposition to a sequential decomposition. Em: International Simposium on Mathematical Morphology, p. 13-22, 2000.Qualis: Não identificado (International Simposium on Mathematical Morphology)
Resumos expandidos publicados em anais de congressos (1)
1. NOEL, V. ; REIS, M. S. ; Dias, M.H.S ; Nakano, F. ; BARRERA, Junior ; ARMELIN, H A. Design and analysis of dynamical models of biochemical reaction networks. Em: Symmetry and Dynamics in Biology: From experimental analysis to mathematical modeling, 2015, São Paulo., 2015, São Paulo. Proceedings of SDB 2015,, 2015. Qualis: Não identificado (SYMMETRY AND DYNAMICS IN BIOLOGY: FROM EXPERIMENTAL ANALYSIS TO MATHEMATICAL MODELING, 2015, SÃO PAULO., 2015, SÃO PAULO. PROCEEDINGS OF SDB 2015,)
Resumos publicados em anais de congressos (16)
1. NOEL, V. ; REIS, MARCELO ; Dias, M.H.S ; Wu, L. ; G. S., Amanda ; REVERBEL, D. F. ; BARRERA, Junior ; ARMELIN, H. A.. A web-based framework for designing kinetic models of molecular signaling networks. Em: COMBINE 2016, 2016, 2016, 2016.
2. REIS, MARCELO ; Dias, M.H.S ; NOEL, V. ; FONSECA, C. S. ; ALBUQUERQUE, L. L. ; Nakano, F. ; BARRERA, Junior ; ARMELIN, H A. Mathematical modeling of the K-Ras switch in the K-Ras-driven mouse Y1 adrenocortical tumor cells provides insights into molecular mechanisms of FGF2-induced cell cycle arrest. Em: 17th International Conference on Systems Biology (ICSB 2016), 2016, 2016, Barcelona. Proceedings of the 17th International Conference on Systems Biology, 2016.
3. REIS, M. S. ; DIAS, M. ; Nakano, F. ; BARRERA, Junior ; ARMELIN, H A. Mathematical Modeling of RAs/MAPK signalling network kinetics provides insights into mechanisms of FGF2-induced cell cycle arrest in the K-K-ras-driven mouse Y1 adrenocortical timor cells. Em: RECOMB 2014, 2014, p. 126-126, 2014.
4. REIS, M. S. ; NISHYAMA, M. Y. ; SILVA, D. F. ; JUNQUEIRA-DE-AZEVEDO, I. L. M. ; DA-CUNHA, J. P. C. ; BARRERA, Junior ; IWAI, L. K. ; SERRANO, S. ; ARMELIN, H A. CeTICSdb: a plataform for interdisciplinary research that allows quantitative and qualitative-omics analyses and mathematical modelling of signalling networks. Em: RECOMB 2014, 2014, Pittsburgh. Book of Abstracts, p. 128-128, 2014.
5. REIS, M. S. ; NOEL, V. ; DIAS, M. H. S. ; ALBUQUERQUE, L. L. ; Nakano, F. ; BARRERA, Junior ; ARMELIN, H. A.. Mathematical modelling of the cross talk between Ras/MAPK and P13K/Akt signalling pathways in the K-Ras-driven mouse Y1 adrenocortical tumor cells provides insights into de mechanism of FGF2-driven cell cycle arrest. Em: The 15th international conference on System Biology (ICSB 2014), 2014, Melbourne. Proceedings of the ICSB 2014, 2014.
6. REIS, M. S. ; BARRERA, Junior. Estimation of Probabilistic Gene Networks using the UCS feature selection algorithm. Em: X-meeting, 2010, p. SBN15-SBN15, 2010.
7. Reis, Marcelo ; BARRERA, Junior. Assessment of prediction methods for the estimation of Probabilistic Gene Networks. Em: X-meeting, 2009, Angra dos Reis. International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, p. 68-68, 2009.
8. MARTINS JR, D C ; CESAR JR, R M ; BARRERA, Junior. Genetic network architecture identification by conditional entropy analysis. Em: 1o International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, Ribeirão Preto, 2003.
9. TREPODE, N W ; ARMELIN, H A ; BITTNER, M ; BARRERA, Junior ; GUBITOSO, M D. An approach for studying genetic networks: discreted dynamical system simulation. A case study: the cell cycle. Em: 1º International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, Ribeirão Preto, 2003.
10. TORRES, M ; BARRERA, Junior. A parallel algorithm to find small sets of genes that are enough to distinguish two biological states. Em: International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, Ribeirão Preto. Icobicobi 2003, 2003.
11. TORRES, M ; BARRERA, Junior. A parallel algorithm for agglomerative hierarchical clustering using complete link. Em: International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, Ribeirão Preto, 2003.
12. SILVA, P J S ; HASHIMOTO, R F ; KIM, S ; BARRERA, Junior ; BRANDÃO, L O ; SUH, E ; DOUGHERTY, E R. Feature Selection Algorithms to Find Strong Genes. Em: International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, Ribeirão Preto, 2003.
13. CAREZZATO, C J ; BARRERA, Junior ; SOUZA, S J ; COSTA, L F. Classification of genomic regions by chaos game representation images and fractal dimension. Em: International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, 2003.
14. SOUZA, J e S ; SAKABE, N J ; BARRERA, Junior ; SOUZA, S J. A large-scale study of SNPs in regulatory elements of alternative splicing and their possible relation to human diseases. Em: International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, Ribeirão Preto. Icobicobi 2003, 2003.
15. COSTA, L F ; FABBRI, R ; BARRERA, Junior. Simple Microarray Gridding by a Minimization Procedure on Image Projections. Em: International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, Ribeirão Preto, 2003.
16. BARRERA, Junior; CESAR JR, R M ; FERREIRA, J E ; GUBITOSO, M D. An environment for knowlegde discovery in bioinformatics applications. Em: International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, Ribeirão Preto, 2003.
Artigos aceitos para publicação (1)
1. ATASHPAZ-GARGARI, E. ; REIS, MARCELO ; BRAGA NETO, U. M. ; BARRERA, JUNIOR ; DOUGHERTY, E.R.. A fast branch-and-bound algorithm for U-curve feature selection. PATTERN RECOGNITION. 2017. Qualis: A1
Apresentações de trabalho (0)
Demais tipos de produção bibliográfica (0)

Produção técnica

Programas de computador com registro (0)
Programas de computador sem registro (1)
1. Otranto, G. ; Gomes, T. R. ; GUBITOSO, M. D. ; BARRERA, Junior . Strategy Soccer. 2007.
Produtos tecnológicos (0)
Processos ou técnicas (2)
1. BRUN, Marcel ; BARRERA, Junior ; KIM, Seungchang ; DOUGHERTY, Edward R. Evaluating Data Clustering Procedures. Patente USP/Texas A&M. 2003.
2. SILVA, Paulo J S ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R. Generating Feature Sets Using Linear Programming. Patente: USP/Texas A&M. 2002.
Trabalhos técnicos (0)
Demais tipos de produção técnica (2)
1. BARRERA, Junior; CESAR JR, Roberto M. Análise de Expressão Gênica. 2007. Curso de curta duração ministrado/Outra
2. BARRERA, Junior; CESAR JR, R M ; SILVA, Paulo J S. Microarrays. 2003. Curso de curta duração ministrado/Outra

Produção artística

Total de produção artística (0)

Orientações em andamento

Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (2)
1. André Mello. Identificação de Vias de Sinalização de Proteínas. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística da USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2018.
  Orientador: Junior Barrera.
2. André Fonseca. Métodos de Bioinformática em Câncer. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte. (Coorientador)., . Início: 2018.
  Supervisor: Junior Barrera.
Dissertação de mestrado (0)
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (0)

Supervisões e orientações concluídas

Supervisão de pós-doutorado (4)
1. Marcelo da Siva Reis. . Instituto de Matemática e Estatística da USP, . 2013.
  Supervisor: Junior Barrera.
2. Beatriz Stransky. Modelagem multi-resolução de tecidos. Instituto de Matemática e Estatística da USP, Fundação de Apoio à Pesquisa do Estado da Paraíba. 2009.
  Supervisor: Junior Barrera.
3. Nestor Walter Trepode. . Faculdade de Flosofia Ciências e Letras da USP de Ribeirão Preto, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2008.
  Supervisor: Junior Barrera.
4. Martha Ximena Torres Delgado. . Instituto de Matemática e Estatística Usp, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2001.
  Supervisor: Junior Barrera.
Tese de doutorado (12)

Joel Edu Sanches Castro. Model Selection for Learning Boolean Hypothesis. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística da USP, . 2018.
Supervisor: Junior Barrera.
Guilherme Fernades Otranto. A formal model for strategic planning in cooperative and competitive environments case study: design and implementation of a basketball simulator. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística da USP, . 2017.
Orientador: Junior Barrera.
Marcelo da Silva Reis. Minimização de funções decomponíveis em curvas em U definidas sobre cadeias de posets - algoritmos e aplicações. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística da USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2012.
Orientador: Junior Barrera.
Leonardo Lamas Leandro Ribeiro. Modelagem estratégico-tática em esportes coletivos de invasão: aplicação ao basquetebol. Tese (Doutorado em Educação Física) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2012.
Supervisor: Junior Barrera.
Daniel de Oliveira Dantas. Segmentação e reconhecimento de gestos em tempo real com câmeras e aceleração gráfica. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística Usp, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2010.
Orientador: Junior Barrera.
David Corrêa Martins Jr. Identificação de redes de expressão gênica em malária. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística Usp, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2008.
Supervisor: Junior Barrera.
Marcelo Ris. Representação de sistemas biológicos a partir de sistemas dinâmicos: controle da transcrição a partir do estrógeno. Tese (Doutorado em Doutorado em Bioinformática) - Departamento de Ciência da Computação Bioinfo Usp, . 2008.
Orientador: Junior Barrera.
Nestor Walter Trepode. Modelagem do controle gênico do ciclo celular por redes genéticas probabilísticas. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Instituto de Matemática e Estatística da USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2007.
Orientador: Junior Barrera.
Marcel Brun. Projetos de operadores morfológicos multi-escala por otimização estatística. Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2002.
Orientador: Junior Barrera.
Roberto Hirata Jr. Projeto de operadores morfológicos para imagens e sinais: abordagem de reticulados finitos. Tese - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2001.
Orientador: Junior Barrera.
Ronaldo Fumio Hashimoto. Mudança de estrutura de representação de operadores em morfologia matemática. Tese - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2000.
Orientador: Junior Barrera.
Nina S. T. Hirata. Projeto automático de operadores explorando conhecimento a priori. Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2000.
Orientador: Junior Barrera.
Dissertação de mestrado (13)

Luiz Paulo Medina de Lima. Identificação de Sistemas Dinâmicos em dados de estoque imobiliário. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computaçao) - Instituto de Matemática e Estatística da USP, . 2018.
Orientador: Junior Barrera.
Paulo Roberto Branco Lins. Desenvolvimento de uma abordagem quantitativa para o estudo de recorrências de módulos topológicos em redes biológicas. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, . 2018.
Orientador: Junior Barrera.
Amanda Sayuri Guimaraes. Um algoritmo para simplificar sistemas de equações diferenciais que descrevem a cinética de reações químicas. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computaçao) - Instituto de Matemática e Estatística da USP, . 2016.
Orientador: Junior Barrera.
Lulu Wu. Um método para modificar vias de sinalização molecular por meio de análise de banco de dados de interatomas. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2015.
Orientador: Junior Barrera.
Ubiratan Augusto Lima. Análise de uma Rede Genética Probabilística que representa o controle do ciclo celular. Dissertação (Mestrado em Mestrado em Bioinformática) - Instituto de Matemática e Estatística da USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2012.
Orientador: Junior Barrera.
Leandro Lima. Identificação de redes de expressão gênica no contexto de malária. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística da USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2009.
Orientador: Junior Barrera.
Daniel André Vaqueri. Projeto multi-resolução de operadores morfológicos a partir de exemplos. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2006.
Orientador: Junior Barrera.
Gustavo P. Esteves. Validação de medidas de expressão gênica em imagens de microarray. Dissertação - Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o Câncer, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2004.
Supervisor: Junior Barrera.
Daniel O. Dantas. Uma técnica automática para medida de sinal de imagens de cDNA. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . 2004.
Orientador: Junior Barrera.
Caetano Giminez Carezato. Análise de classificadores de seqüências projetados por aprendizado computacional supervisionado e não supervisionado. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2004.
Orientador: Junior Barrera.
Nestor Walter Trepode. Identificação de sistemas dinâmicos finitos: aplicações para a modelagem de redes genéticas. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . 2002.
Orientador: Junior Barrera.
David Martins Jr. Redução de dimensionalidade baseada na entropia condicional média. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . 2002.
Supervisor: Junior Barrera.
Franklin Cesar Flores. Segmentação de vídeo digital por morfologia matemática. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2000.
Orientador: Junior Barrera.
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (1)

Guilherme Otranto e Thomaz Rodrigues Gomes. Projeto e desenvolvimento de um simulador para jogos de futebol. (Graduação em CIência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística Usp, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2008.
Orientador: Junior Barrera.
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (0)

Projetos de pesquisa

Total de projetos de pesquisa (12)

2016-Atual. torage, Modeling and Analysis of Dynamical Systems for e-Science Applications.
Descrição: The astonishing fast rate of technology evolution has given rise to a new era of scientific knowledge discovery. This new age of science, known as e-Science, is described as the new great computational and multidisciplinary team science requiring novel methodologies for data storage, modeling and analysis. In particular, the development of transactional and analytical software systems for e-Science applications when viewed from a dynamic systems perspective, presents a number of new computational challenges. Among them are the scientific knowledge discovery processes, which involve frequent changes of requirements for data storage, modeling and analysis. The need to address scientific dynamic systems in order to cope with complex applications of e-Science has woken up the scientific community for the development of robust and evolutionary software systems to meet these new challenges. Dynamical system is the classical mathematical formalism to represent phenomena that evolute with time, which are of great interest in science. In this project, our main goal is to develop computational models and methodologies to support e-Science applications viewed as dynamic systems. Our fundamental research covers three key research areas, namely storage, modeling, and analysis of dynamic systems. These research areas are significant and relevant to the FAPESP e-Science Program since many of the present e-Science challenges are related to the proper treatment of dynamic systems. Hence, we plan to develop and apply computational methodologies that will ease the development of e-Science applications, thereby contributing to the improvement of worldwide scientific knowledge, while respecting legal and ethical restrictions in data management... Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Junior Barrera - Integrante / João eduardo Ferreira - Coordenador.
Membro: Junior Barrera.
Descrição: The astonishing fast rate of technology evolution has given rise to a new era of scientific knowledge discovery. This new age of science, known as e-Science, is described as the new great computational and multidisciplinary team science requiring novel methodologies for data storage, modeling and analysis. In particular, the development of transactional and analytical software systems for e-Science applications when viewed from a dynamic systems perspective, presents a number of new computational challenges. Among them are the scientific knowledge discovery processes, which involve frequent changes of requirements for data storage, modeling and analysis. The need to address scientific dynamic systems in order to cope with complex applications of e-Science has woken up the scientific community for the development of robust and evolutionary software systems to meet these new challenges. Dynamical system is the classical mathematical formalism to represent phenomena that evolute with time, which are of great interest in science. In this project, our main goal is to develop computational models and methodologies to support e-Science applications viewed as dynamic systems. Our fundamental research covers three key research areas, namely storage, modeling, and analysis of dynamic systems. These research areas are significant and relevant to the FAPESP e-Science Program since many of the present e-Science challenges are related to the proper treatment of dynamic systems. Hence, we plan to develop and apply computational methodologies that will ease the development of e-Science applications, thereby contributing to the improvement of worldwide scientific knowledge, while respecting legal and ethical restrictions in data management.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (2) . Integrantes: João Eduardo Ferreira - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: João Eduardo Ferreira.
2016-Atual. INCT da Internet do Futuro para Cidades Inteligentes
Descrição: bjetivo: Desenvolvimento de modelos, técnicas, métodos e sistemas de software visando à melhoria da vida da população urbana por meio da utilização da tecnologia da informação e da comunicação. Essa pesquisa envolve técnicas avançadas de Computação em Nuvem, Internet das Coisas, Computação de Alto Desempenho, Engenharia de Software, Big Data e Aprendizado de Máquina... Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Junior Barrera - Integrante / Fabio Kon - Coordenador.
Membro: Junior Barrera.
Descrição: Objetivo: Desenvolvimento de modelos, técnicas, métodos e sistemas de software visando à melhoria da vida da população urbana por meio da utilização da tecnologia da informação e da comunicação. Essa pesquisa envolve técnicas avançadas de Computação em Nuvem, Internet das Coisas, Computação de Alto Desempenho, Engenharia de Software, Big Data e Aprendizado de Máquina.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (10) / Mestrado acadêmico: (20) / Doutorado: (10) . Integrantes: Fabio Kon - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / (FAPESP) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.
Membro: Fabio Kon.
Descrição: Desenvolvimento de modelos, técnicas, métodos e sistemas de software visando à melhoria da vida da população urbana por meio da utilização da tecnologia da informação e da comunicação. Essa pesquisa envolve técnicas avançadas de Computação em Nuvem, Internet das Coisas, Computação de Alto Desempenho, Engenharia de Software, Big Data e Aprendizado de Máquina.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (10) / Mestrado acadêmico: (20) / Doutorado: (10) . Integrantes: Alfredo Goldman vel Lejbman - Integrante / Fabio Kon - Coordenador / Otto Carlos Muniz Bandeira Duarte - Integrante. Financiador(es): CAPES - Centro Anhanguera de Promoção e Educação Social - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de SP - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Alfredo Goldman vel Lejbman.
2014-Atual. Biologia Sistêmica do Câncer
Descrição: Rede de pesquisa, extensão e ensino financiada pela Capes. Para maiores detalhes, ver http://neuro.ufrn.br/bsc. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Junior Barrera - Integrante / Sandro José de Souza - Coordenador / Dirce M Carraro - Integrante / José Miguel Ortega - Integrante.
Membro: Junior Barrera.
2013-Atual. CeTICS - Centro de Toxinas, Imuno-Resposta e Sinalização Celulkar
Descrição: No Instituto Butantan toxinologia e regulação da resposta imune são, tradicionalmente, áreas conexas de pesquisa científica e desenvolvimento biotecnológico, através das quais o Instituto, historicamente, construiu sua reputação internacional de excelência. Na cultura do Instituto, venenos são misturas complexas de toxinas, selecionadas ao longo da evolução para sinergicamente exercerem efeitos biológicos sistêmicos, através de mecanismos bioquímicos, moleculares e celulares altamente específicos. Portanto, a análise química de venenos tem boas chances de levar à descoberta de novas moléculas de toxinas com potencial terapêutico. Essas premissas foram seguidas com sucesso por pesquisadores do Centro de Toxinologia Aplicada (CAT CEPID-FAPESP), projeto iniciado há 10 anos, que isolaram, caracterizaram quimicamente e patentearam diversas toxinas de natureza proteica, que se tornaram pontos de partida para desenvolvimento de inovação farmacêutica em parceria com indústrias locais. A ênfase em proteínas e peptídeos levou o CAT CEPID a instalar laboratórios no estado da arte para transcriptômica, proteômica, biologia molecular do DNA recombinante e síntese de peptídeos. Mais recentemente, estudos dos mecanismos de ação, bioquímicas, moleculares e celulares, dessas promissoras moléculas foram iniciados com o objetivo de estabelecer provas de conceito. Assim, o CAT estabeleceu, no Instituto Butantan, as condições iniciais para a criação de um centro de toxinas e resposta imune fundamentado nas abordagens atuais da biologia sistêmica. Por conseguinte, 10 pesquisadores, entre os mais competitivos do Instituto Butantan, propõem a criação do novo Centro de Toxinas, Resposta-imune e Sinalização Celular, com aspirações a centro de excelência de classe mundial, aproveitando a histórica reputação internacional do Butantan e o sucesso recente do CAT CEPID. O Plano de pesquisa do Centro Integra subprojetos voltados para a pesquisa científica com subprojetos de vocação para a inovação tecnológica. Um grande grupo de cientistas seniores do Instituto Butantan, de outras instituições brasileiras e de renomadas instituições estrangeiras serão colaboradores do Centro proposto. (AU). Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Junior Barrera - Integrante / Hugo Aguirre Armelin - Coordenador.
Membro: Junior Barrera.
2012-Atual. NAP ESCIENCE
Descrição: Análise e nodelagem de fenômenos naturais mensuráveis por técnicas matemático computacionais.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Junior Barrera - Integrante / Roberto Marcondes Cesar Junior - Coordenador. Financiador(es): Proreitoria de Pesquisas da USP - Cooperação.
Membro: Junior Barrera.
2009-2010. Modelagem do ciclo celular
Descrição: Este projeto visa construir modelos quantitativos que permitam prever fenõmenos relacionados com o ciclo celular.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Junior Barrera - Integrante / Hugo Aguirre Armelin - Coordenador.
Membro: Junior Barrera.
2005-2010. Modelagem por redes (grafos) e técnicas de reconhecimento de padrões: estrutura, dinâmica e aplicações
Descrição: Dentre os desafios enfrentados atualmente pela pesquisa em reconhecimento de padrões, cabe ressaltar três linhas fundamentais: (a) problemas em que elementos devem ser descritos estruturalmente através de uma rede indicando conexões entre tais elementos; (b) problemas envolvendo a evolução da informação ao longo de alguma variável independente (e.g. tempo, no caso de sequências de vídeo); (c) problemas envolvendo ambos aspectos, i.e. uma rede de elementos cuja dinâmica evolui ao longo de alguma variável independente. O presente projeto temático, unindo os grupos de visão do IME-USP e IFSC-USP, além de pesquisadores colaboradores de outras instituições, prevê o estudo, desenvolvimento e aplicação de técnicas de reconhecimento de padrões com esses três ítens formando o tema de integração da pesquisa. Além da área de reconhecimento de padrões, o projeto inclui técnicas e problemas de visão computacional, processamento de imagens e de sinais e bioinformática, todas sendo áreas de trabalho dos pesquisadores proponentes.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Junior Barrera - Integrante / COSTA - Integrante / R M Cesar Jr - Coordenador.
Membro: Junior Barrera.
2004-Atual. Biomedical Research Informatics for Global Health Training Program - BRIGHT
Descrição: Projeto conjunto com o IME-USP, MIT e Harvard Medical School, no qual aplicaremos técnicas de análise de imagens por nós desenvolvidas para resolução de problemas em expressão gênica e bioinformática.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Junior Barrera - Coordenador / Lucila Ohno Machado - Integrante / Richard Maas - Integrante / Eduardo Massad - Integrante.
Membro: Junior Barrera.
2002-2007. Aproximação Genômica e Pós-Genômica ao Estudo da Malária Humana na Amazônia Brasileira
Descrição: Análise de dados de biologia molecular, particularmente de expressão gênica, para entender mecanismos biológicos presentes no parasita da malária.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Junior Barrera - Coordenador / Hernando A del Portillo Obando - Integrante.
Membro: Junior Barrera.
2002-2004. Cursos / Organização Mundial da Saúde
Descrição: Organização de cursos de Bioinformática de curta duração para alunos latino-americanos.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Junior Barrera - Coordenador / Hernando A del Portillo Obando - Integrante.
Membro: Junior Barrera.
2002-2004. Identificação de Genes que Regulam Fenótipos de Interesse em Agropecuária através da Análise Computacional de Seqüências de Expressão
Descrição: Análise de dados de biologia molecular, particularmente de expressão gênica, para pesquisar melhorias vegetais e animais.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Junior Barrera - Coordenador.
Membro: Junior Barrera.
2000-2005. Cooperation for Gene Analysis Expression
Descrição: Desenvolver técnicas de análise de expressão gênica e aplica-las ao entendimento de Problemas biológicos, como o controle do ciclo celular.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Junior Barrera - Coordenador / Hugo Aguirre Armelin - Integrante.
Membro: Junior Barrera.

Prêmios e títulos

Total de prêmios e títulos (7)

Professor Titular da Faculdade de Filosofia Ciências e Letras da USP de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Matemática da FFCLRP.. 2008.
Membro: Junior Barrera.
Presidente da Assoicação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional.. 2007.
Membro: Junior Barrera.
Professor Titular do Instituto de Matemática e Estatística da USP, Depto de Ciência da Computação do IME-USP.. 2005.
Membro: Junior Barrera.
Melhor apresentação no CAMDA 2004, Critical Assessment of Microarray Data Analysis / Duke University.. 2004.
Membro: Junior Barrera.
Membro do Comitê Assessor Externo da EMBRAPA Informática Agropecuária, CNPTIA - EMBRAPA.. 2004.
Membro: Junior Barrera.
Vice-presidente da AB3C, Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional.. 2004.
Membro: Junior Barrera.
Participação de duas bancas de doutorado na Universidade de Amsterdam, Universidade de Amsterdam, Holanda.. 2002.
Membro: Junior Barrera.

Participação em eventos

Total de participação em eventos (27)

Latin America eScience Workshop 2013. 2013. (Seminário).
Workshop do projeto de Modelagem do Ciclo Celular.Modeling and inference of genes network. 2009. (Seminário).
Workshop on Gene Regulation and Noise.Design of PGNs for malaria parasite and cell cycle control. 2008. (Seminário).
Seminários da EMBRAPA Informática.Design of PGNs for malaria parasite and cell cycle control. 2007. (Seminário).
Seminários de Bioinformática na Université Claude Bernard, Lyon I.Cell cycle control modeling. 2007. (Seminário).
Seminários do Barcelona Centre for International Health.Anotating malare genes by genetic network estimation. 2007. (Seminário).
51 Congresso Brasileiro de Genética. Design of PGNs for malaria parasite and cell cycle control system. 2005. (Congresso).
Seminários de Computação Gráfica do IMPA.Futebol: inteligência do jogo. 2005. (Seminário).
Critical Assesment of Microarray Data Analysis - CAMDA 2004. A New Annotation Tool For Malaria Based On Inference Of Probabilistic Genetic Networks. 2004. (Congresso).
Seminários do Tgen Institute.A new anotation tool for malaria based on inference of PGN. 2004. (Seminário).
II Latin American Course on Bioinformatics for Tropical Disease Research. Data mining and dynamical modeling in Biology: a semiotic view. 2003. (Congresso).
Programa de Seminários em Biologia Computacional - USP/ Ínformática Médica.Dos sinais de Microarrays à descoberta de conhecimento biológico. 2003. (Encontro).
Encontro França-Brasil de Bioinformática.An integrated environment for analysis of genetic data. 2002. (Encontro).
II Simpósio Brasileiro de Biologia Matemática e computacional. From Microarray images to biological knowledge. 2002. (Congresso).
IMPA 50 anos - Seção Especial de Computação Gráfica. Automatic programming of morphological machines by PAC learning. 2002. (Congresso).
Meeting of the American Mathematical Society.Modeling of genetic networks form microarray data. 2002. (Seminário).
Seminários de Parasitologia do ICB-USP.Análise de dados de microarray. 2002. (Seminário).
Seminários do curso de pós-graduação do Programa de Fisiopatologia Experimental da MED-USP.Bioinformática. 2002. (Seminário).
VI Brazilian School of Probability - Session Probability in Genetics.Microarray data analysis. 2002. (Outra).
Pesquisa científica e internet" - 14o Reunião Anual do Instituto Biológico.Descoberta de conhecimento em biologia molecular através da bioinformática. 2001. (Seminário).
Série de Seminários do Instituto de Computação da UNICAMP.Um ambiente integrado para a análise de dados de genética. 2001. (Seminário).
VI Encontro Regional de Matemática Aplicada e Computacional.Design of morphological operators by computational learning. 2001. (Encontro).
SBMAC. Automatic Programing of morphological machines. 2000. (Congresso).
Seminários do Departamento de Informática da Universidade de Amsterdam.Genomic Signal Processing. 2000. (Seminário).
Seminários do departamento de informática da universidade de Groningen.Genomic Signal Processing. 2000. (Seminário).
Seminários do Grupo de Morfologia Matemática do CWI.Automatic programming of morphological machines. 2000. (Seminário).
SIAM Annual Conference. Model-Based Design of Optimal Morphological Filters. 2000. (Congresso).

Organização de eventos

Total de organização de eventos (8)

BARRERA, Junior; HIRATA JR, Roberto. International Symposium on Mathematical Morphology. 2007. Congresso
Falcão, P. K. ; BARRERA, Junior. X-meeting. 2007. Congresso
BARRERA, Junior; CP/IME-USP. III SImpósio de Iniciação Científica e Pós-Graduação do IME-USP. 2007. Congresso
BARRERA, Junior; CP/IME-USP. II Simpósio de Iniciação Científica e Pós-Graduação do IME-USP. 2006. Congresso
BARRERA, Junior; CP/IME-USP. I simpósio de Iniciação Científica e Pós-Graduação do IME-USP. 2005. Congresso
BARRERA, Junior; Goldman, G. ; COSTA, Luciano Fontoura ; CESAR JR, Roberto M. Icobicobi - International Conference on Bioinformatics and Computational Biology. 2003. Congresso
BARRERA, Junior; OBANDO, Hernando A Del Portillo. I Latin American Course on Bioinformatics for Tropical Disease Research. 2002. Congresso
BARRERA, Junior. Mathematical Morphology. 2001. (Congresso).. . 0.

Lista de colaborações

Colaborações endôgenas (9)

Junior Barrera ⇔ Nina Sumiko Tomita Hirata (14.0)
DELLAMONICA JUNIOR, D. ; SILVA, P. J. S. ; HUMES C. ; Hirata, N.S.T. ; BARRERA, J.. An Exact Algorithm for Optimal MAE Stack Filter Design. IEEE Transactions on Image Processing. v. 16, p. 453-462, 2007. Qualis: A1
HIRATA, N. S. T. ; BARRERA, Junior. A unifying view for stack filter design based on graph search methods. Pattern Recognition. v. 38, p. 2088-2098, 2005. Qualis: A1
Hirata, Nina S. T.; Dougherty, Edward R. ; Barrera, Junior. Iterative design of morphological binary image operators. Optical Engineering (Bellingham). v. 39, n. 12, p. 3106-3123, 2000. Qualis: A3
TOMITA, N. S. T. ; DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior. A switching algorithm for design of optimal increasing binary filters over large windows. Pattern Recognition. v. 33, n. 6, p. 1059-1081, 2000. Qualis: A1
BARRERA, Junior; TERADA, R. ; HIRATA JR, R. ; TOMITA, N. S. T.. Automatic Programming of Morphological Machines by PAC Learning. Fundamenta Informaticae. v. 41, n. 1-2, p. 229-258, 2000. Qualis: A2
HIRATA, N. S. T. ; HIRATA JR, Roberto ; BARRERA, Junior. Basis Computation Algorithms. Em: 8th International Symposium on Mathematical Morphology, v. 1, p. 15-26, 2007.Qualis: Não identificado (8th International Symposium on Mathematical Morphology)
HIRATA, N. S. T. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R ; TERADA, R.. The Incremental Splitting of Intervals Algorithm for the Design of Binary Image Operators. Em: International Symposium on Mathematical Morphology, p. 219-227, 2002.Qualis: Não identificado (International Symposium on Mathematical Morphology)
BARRERA, J. ; MARTIN, P. A. ; DOUGHERTY, E. R. ; GUBITOSO, M. D. ; HIRATA, N. S. T. ; TREPODE, N. W.. Identification of Input-free Finite Lattice Dynamical Systems under Envelope Constraints. Em: 6th International Symposium on Mathematical Morphology, p. 337-345, 2002.Qualis: Não identificado (6th International Symposium on Mathematical Morphology)
TORRES, Martha ; BARRERA, Junior ; HIRATA, N. S. T.. High-performance algorithm for Boolean function minimization: the partitioned incremental splitting of intervals (PISI). Em: Photonics West' 2002, v. 4667, p. 386-395, 2002.Qualis: Não identificado (Photonics West' 2002)
ARMELIN, H. A. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R ; GUBITOSO, M. D. ; FERREIRA, J. E. ; HIRATA, N. S. T. ; NEVES, E. J.. A simulator for gene expression networks. Em: SPIE Microarrays: Optical Technologies and Informatics, v. 4266, p. 248-259, 2001.Qualis: Não identificado (SPIE Microarrays: Optical Technologies and Informatics)
BRUN, Marcel ; BARRERA, Junior ; HIRATA, N. S. T. ; TREPODE, N. W. ; DANTAS, D. O. ; TERADA, R.. Multi-resolution Classification Trees in OCR Design. Em: Sibgrapi 2001, p. 59-66, 2001.Qualis: Não identificado (Sibgrapi 2001)
BARRERA, Junior; DOUGHERTY, Edward R ; GUBITOSO, M. D. ; HIRATA, N. S. T.. Modeling Temporal Morphological Systems via Lattice Dynamical Systems. Em: Non Linear Image Processing and Pattern Analysis XII - SPIE, v. 4304, p. 265-276, 2001.Qualis: Não identificado (Non Linear Image Processing and Pattern Analysis XII - SPIE)
HIRATA, N. S. T. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R. Bayesian Switching Algorithm for the Optimal Increasing Binary Filter. Em: European Signal and Image Processing Conference (EUSIPCO), v. IV, p. 1889-1892, 2000.Qualis: Não identificado (European Signal and Image Processing Conference (EUSIPCO))
HIRATA, N. S. T. ; BARRERA, Junior ; TERADA, R.. Text segmentation by Automatically designed Morphological Operators. Em: SIBGRAPI'00 (Brazilian Synposium on Computer Graphics and Image Processing), p. 284-291, 2000.Qualis: Não identificado (SIBGRAPI'00 (Brazilian Synposium on Computer Graphics and Image Processing))

Junior Barrera ⇔ Roberto Hirata Junior (14.0)
Brun, Marcel ; Hirata Jr., Roberto ; Barrera, Junior ; Dougherty, Edward R.. Nonlinear Filter Design Using Envelopes. Journal Of Mathematical Image And Vision, Estados Unidos. v. 21, n. 1, p. 81-97, 2004. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF MATHEMATICAL IMAGE AND VISION, ESTADOS UNIDOS)
BRUN, Marcel ; DOUGHERTY, Edward R ; HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior. Design of optimal binary filters under joint multiresolution-envelope constraint.. Pattern Recognition Letters. v. 24, p. 937-945, 2003. Qualis: A2
Hirata Jr., Roberto; Brun, Marcel ; Barrera, Junior ; Dougherty, Edward R.. Multiresolution Design of Aperture Operators. Journal of Mathematical Imaging and Vision. v. 16, p. 199-222, 2002. Qualis: A1
HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior ; HASHIMOTO, Ronaldo F ; DANTAS, D. O. ; ESTEVES, G. P.. Segmentation of Microarray Images by Mathematical Morphology. Real time imaging, Estados Unidos. v. 8, n. 6, p. 491-505, 2002. Qualis: Não identificado (REAL TIME IMAGING, ESTADOS UNIDOS)
BARRERA, Junior; DOUGHERTY, Edward R ; HIRATA JR, R.. Aperture filters. Signal Processing. v. 80, n. 4, p. 697-721, 2000. Qualis: A1
BARRERA, Junior; TERADA, R. ; HIRATA JR, R. ; TOMITA, N. S. T.. Automatic Programming of Morphological Machines by PAC Learning. Fundamenta Informaticae. v. 41, n. 1-2, p. 229-258, 2000. Qualis: A2
HIRATA, N. S. T. ; HIRATA JR, Roberto ; BARRERA, Junior. Basis Computation Algorithms. Em: 8th International Symposium on Mathematical Morphology, v. 1, p. 15-26, 2007.Qualis: Não identificado (8th International Symposium on Mathematical Morphology)
VAQUERO, Daniel André ; BARRERA, Junior ; HIRATA JR, R.. A maximum likelyhood approach for multi-resolution W-operator design. Em: SIBGRAPI, p. 71-78, 2005.Qualis: Não identificado (SIBGRAPI)
HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior ; HASHIMOTO, Ronaldo F ; DANTAS, D. O.. Microarray Gridding by Mathematical Morphology. Em: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON COMPUTER GRAPHICS, v. 1, p. 112-119, 2001. Qualis: Não identificado (INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON COMPUTER GRAPHICS)
BRUN, Marcel ; HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R. Hybrid Human-machine Non-linear Filter Design Using Envelopes. Em: SIBGRAPI'2001, v. 1, p. 106-111, 2001.Qualis: Não identificado (SIBGRAPI'2001)
HIRATA JR, R. ; BRUN, Marcel ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R. Image restoration by multiresolution aperture filters. Em: Nonlinear Image Processing and Pattern Analysis XII, v. 4304, p. 256-264, 2001.Qualis: Não identificado (Nonlinear Image Processing and Pattern Analysis XII)
HIRATA JR, R. ; DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior. Some applications of aperture filters. Em: International Simposium on Mathematical Morphology, p. 119-128, 2000.Qualis: Não identificado (International Simposium on Mathematical Morphology)
HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R. Design of gray-scale nonlinear filters via multiresolution apertures. Em: European Signal Processing Conference, v. IV, p. 1905-1908, 2000.Qualis: Não identificado (European Signal Processing Conference)
HIRATA JR, R. ; FLORES, F. C. ; BARRERA, Junior ; LOTUFO, R. A. ; MEYER, F.. Color Image Gradients for Morphological Segmentation. Em: Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing, v. 1, p. 316-322, 2000.Qualis: Não identificado (Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing)

Junior Barrera ⇔ Ronaldo Fumio Hashimoto (13.0)
TREPODE, N. W. ; ARMELIN, H. A. ; BITTNER, M. L. ; BARRERA, J. ; GUBITOSO, M. D. ; HASHIMOTO, R. F.. A Robust Structural PGN Model for Control of Cell-Cycle Progression Stabilized by Negative Feedbacks. EURASIP Journal on Bioinformatics and Systems Biology (Online). v. 2007, p. 73109-73120, 2007. Qualis: Não identificado (EURASIP JOURNAL ON BIOINFORMATICS AND SYSTEMS BIOLOGY)
SILVA, Paulo J S ; HASHIMOTO, Ronaldo F ; KIM, Seungchan ; BARRERA, Junior ; BRANDÃO, Leônidas O ; SUH, Edward ; DOUGHERTY, Edward R. Feature Selection Algorithms to Find Strong Genes. Pattern Recognition Letters. v. 26, n. 10, p. 1444-1453, 2005. Qualis: A2
HASHIMOTO, R. F. ; BARRERA, Junior. A Greedy Algorithm for Decomposing Convex Structuring Elements. Journal of Mathematical Imaging and Vision, USA. v. 18, n. 3, p. 269-289, 2003. Qualis: A1 (JOURNAL OF MATHEMATICAL IMAGING AND VISION)
HASHIMOTO, R. F. ; BARRERA, Junior. A Note on Park and Chin´s Algorithm. IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence. v. 24, n. 1, p. 139-144, 2002. Qualis: Não identificado (IEEE TRANSACTIONS ON PATTERN ANALYSIS AND MACHINE INTELLIGENCE)
HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior ; HASHIMOTO, Ronaldo F ; DANTAS, D. O. ; ESTEVES, G. P.. Segmentation of Microarray Images by Mathematical Morphology. Real time imaging, Estados Unidos. v. 8, n. 6, p. 491-505, 2002. Qualis: Não identificado (REAL TIME IMAGING, ESTADOS UNIDOS)
BARRERA, Junior; HASHIMOTO, R. F.. From the Sup-Decomposition to Sequential Decompositions. Journal of Mathematical Imaging and Vision. v. 15, n. 3, p. 197-216, 2001. Qualis: A1
BARRERA, Junior; HASHIMOTO, R. F.. Sup-Compact and Inf-Compact Representations of W-Operators. Fundamenta Informaticae. v. 45, n. 4, p. 283-294, 2001.Qualis: A2
HASHIMOTO, Ronaldo F ; BARRERA, Junior ; FERREIRA, C. E.. A Combinatorial Optimization Technique for the Sequential Decomposition of Erosions and Dilations. Journal of Mathematical Imaging and Vision. v. 13, n. 1, p. 17-33, 2000. Qualis: A1
CASTRO, J. E. S. ; HASHIMOTO, Ronaldo F ; BARRERA, Junior. Analytical Solutions for the Minkowski Addition Equation. Em: ISMM 2013 - Mathematical Morphology and its applications to Signal and Image Processing, v. 7883, p. 61-72, 2013.Qualis: Não identificado (ISMM 2013 - Mathematical Morphology and its applications to Signal and Image Processing)
BARRERA, Junior; HASHIMOTO, R F. Binary Decision Diagrams as a New Paradigm for Morphological Machines. Em: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON MATHEMATICAL MORPHOLOGY, v. 15, p. 3-12, 2005. Qualis: Não identificado (INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON MATHEMATICAL MORPHOLOGY)
BALAGURUNATHAN, Y. ; HASHIMOTO, R.F. ; KIM, S. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, E.R.. Granulometric Classifiers from Small Samples. Em: PHOTONICS WEST 2002, v. 4667, p. 100-107, 2002. Qualis: Não identificado (PHOTONICS WEST 2002)
HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior ; HASHIMOTO, Ronaldo F ; DANTAS, D. O.. Microarray Gridding by Mathematical Morphology. Em: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON COMPUTER GRAPHICS, v. 1, p. 112-119, 2001. Qualis: Não identificado (INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON COMPUTER GRAPHICS)
HASHIMOTO, R F ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, E R. From the Sup-Decomposition to a Sequential Decomposition. Em: International Symposium on Mathematical Morphology, p. 13-22, 2000. Qualis: Não identificado (International Symposium on Mathematical Morphology)

Junior Barrera ⇔ Roberto Marcondes Cesar Junior (11.0)
Lopes, Fabrício M. ; MARTINS JR, David Corrêa ; BARRERA, Junior ; CESAR JUNIOR, R. M.. A feature selection technique for inference of graphs from their known topological properties: Revealing scale-free gene regulatory networks. Information Sciences. v. 272, p. 1-15, 2014. Qualis: A1
BARRERA, Junior; CESAR JR, Roberto Marcondes ; Humes Jr ; MARTINS JR, David Corrêa ; PATRAO, D. F. C. ; SILVA, Paulo J S ; Bretani, H.. A feature selection approach for identification of signature genes from SAGE data. BMC Bioinformatics. v. 8, p. 1, 2007. Qualis: A1
MARTINS JR, D C ; CESAR JR, Roberto M ; BARRERA, Junior. W-operator Window Design by Minimization of Mean Conditional Entropy. Pattern Analysis and Applications. v. 9, p. 139-153, 2006. Qualis: A4
BARRERA, Junior; CESAR JUNIOR, R. M. ; FERREIRA, J. E. ; GUBITOSO, M. D.. An environment for knowledge discovery in biology. COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE, Washington, DC ,USA, July 2004. v. 34, n. 5, p. 427-447, 2004. Qualis: Não identificado (COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE, WASHINGTON, DC ,USA, JULY 2004)
Dougherty, Edward R. ; Barrera, Junior ; Brun, Marcel ; Kim, Seungchan ; Cesar, Roberto M. ; Chen, Yidong ; Bittner, Michael ; Trent, Jeffrey M.. Inference from Clustering with Application to Gene-Expression Microarrays. Journal of Computational Biology, Estados Unidos. v. 9, n. 1, p. 105-126, 2002. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY, ESTADOS UNIDOS)
BARRERA, Junior; CESAR JUNIOR, R. M. ; MARTINS JR, David Corrêa ; VÊNCIO, R Z ; MERINO, E F ; YAMAMOTO, M M ; LEONARDI, Florência G ; PEREIRA, C A B ; Obano, H. P.. Constructing probabilistic genetic networks of Plasmodium falciparum from dynamical expression signals of the intraerythrocytic development cycle. In:. Em: J Shoemaker et al. (Org.).. (Org.). Methods of Microarray Data Analysis. : Springer-Verlag. 2006.v. 5, .
LOPES, Fabrício Martins ; MARTINS, C. I. O. ; Martins, David C. ; BARRERA, J ; CESAR JUNIOR, R. M.. SFFS-MR: a floating search strategy for GRNs inference. Em: 5th IAPR International Conference on Pattern Recognition in Bioinformatics (PRIB, v. 6282, p. 407-418, 2010.Qualis: Não identificado (5th IAPR International Conference on Pattern Recognition in Bioinformatics (PRIB)
MARTINS JR, David Corrêa ; CESAR JR, Roberto Marcondes ; BARRERA, Junior. Automatic Window Design for Gray-Scale Image Processing Based on Entropy Minimization. Em: X Iberoamerican Congress on Pattern Recognition, v. 3773, p. 813-824, 2005.Qualis: Não identificado (X Iberoamerican Congress on Pattern Recognition)
MARTINS JR, David Corrêa ; CESAR JR, Roberto Marcondes ; BARRERA, Junior. W-operator Window Design by Maximization of Training Data Information. Em: Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing, p. 162-169, 2004.Qualis: Não identificado (Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing)
DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior ; BRUN, Marcel ; KIM, S ; CESAR JUNIOR, R. M. ; CHEN, Y. ; BITNER, M. ; TRENT, J.. Time Series Inference from Clustering. Em: Spie Microarrays: Optical Technologies and Informatics, v. 4266, p. 222-227, 2001.Qualis: Não identificado (Spie Microarrays: Optical Technologies and Informatics)
MARTINS JR, D C ; CESAR JUNIOR, R. M. ; BARRERA, J ; GOLDMAN, G. Genetic network architecture identification by conditional entropy analysis. Em: 1o International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, Ribeirão Preto, 2003.

Junior Barrera ⇔ Carlos Eduardo Ferreira (2.0)
REIS, MARCELO S. ; ESTRELA, GUSTAVO ; FERREIRA, CARLOS EDUARDO ; BARRERA, JUNIOR. featsel: A framework for benchmarking of feature selection algorithms and cost functions. SoftwareX. v. 6, p. 193-197, 2017. Qualis: A2
HASHIMOTO, Ronaldo F ; BARRERA, Junior ; FERREIRA, C. E.. A Combinatorial Optimization Technique for the Sequential Decomposition of Erosions and Dilations. Journal of Mathematical Imaging and Vision. v. 13, n. 1, p. 17-33, 2000. Qualis: A1

Junior Barrera ⇔ Alan Mitchell Durham (1.0)
DURHAM, A. ; SETUBAL, J. C. ; BARRERA, Junior. Interdisciplinaridade em ação na pesquisa e pós-graduação em bioinformática. Em: Arlindo Phillippi Jr; Valdir Fernandes. (Org.). Práticas da Interdisciplinaridade no Ensino e Pesquisa. 1ed.Editora Manole. : Brueri, São Paulo. 2015.p. 619-642.

Junior Barrera ⇔ Alfredo Goldman vel Lejbman (1.0)
TORRES, Martha ; BARRERA, Junior ; GOLDMAN, A.. A parallel Algorithm for enumerating combinations. Em: International Conference on Parallel Processing (ICPP'03), v. 1, p. 581-588, 2003.Qualis: Não identificado (International Conference on Parallel Processing (ICPP'03))

Junior Barrera ⇔ João Eduardo Ferreira (1.0)
BARRERA, Junior; CESAR JUNIOR, R. M. ; FERREIRA, J. E. ; GUBITOSO, M. D.. An environment for knowledge discovery in biology. COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE, Washington, DC ,USA, July 2004. v. 34, n. 5, p. 427-447, 2004. Qualis: Não identificado (COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE, WASHINGTON, DC ,USA, JULY 2004)

Junior Barrera ⇔ Leônidas de Oliveira Brandão (1.0)
SILVA, Paulo J S ; HASHIMOTO, Ronaldo F ; KIM, Seungchan ; BARRERA, Junior ; BRANDÃO, Leônidas O ; SUH, Edward ; DOUGHERTY, Edward R. Feature Selection Algorithms to Find Strong Genes. Pattern Recognition Letters. v. 26, n. 10, p. 1444-1453, 2005. Qualis: A2

(*) Relatório criado com produções desde 2000 até 2025
Data de processamento: 10/07/2025 16:52:44

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