Voltar

Programa de Pós Graduação em Bioinformática

2012

25.	CINTHO, MINA ; MARCONDES CESAR, ROBERTO ; Ferreira, Joao Eduardo. Data-intensive analysis of HIV mutations. Em: 2012 IEEE 8th International Conference on EScience (eScience), p. 1, 2012. Qualis: Não identificado (2012 IEEE 8th International Conference on EScience (eScience))
26.	COFIEL, L. ; BASSI, D. ; PIETROBON, R. ; BRENTANI. H. Detecting dissonance in clinical and research workflows for translational psychiatric registries. Em: IADIS multi conference on Computer Science and information systems, 2012, Liboa. IADIS International Conference e-Health 2012, p. 273-275, 2012.
27.	da Silva, Aline M.; SETUBAL, J. C.. Microbial community composition dynamics and gene diversity from São Paulo Zoo composting operation assessed by shotgun pyrosequencing. 2012. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
28.	Damásio, André R.L. ; Ribeiro, Liliane F.C. ; Ribeiro, Lucas F. ; Furtado, Gilvan P. ; Segato, Fernando ; Almeida, Fausto B.R. ; Crivellari, Augusto C. ; BUCKERIDGE, M. S. ; Souza, Tatiana A.C.B. ; Murakami, Mário T. ; Ward, Richard J. ; Prade, Rolf A. ; Polizeli, Maria L.T.M.. Functional characterization and oligomerization of a recombinant xyloglucan-specific endo-ß-1,4-glucanase (GH12) from Aspergillus niveus. Biochimica et Biophysica Acta. Proteins and Proteomics. v. 1824, p. 461-467, 2012. Qualis: Não identificado (PROTEINS AND PROTEOMICS)
29.	de Mendonça, Patrícia Calligioni ; Bertoni, Bianca Waléria ; Amui, Saulo França ; Giuliatti, Silvana ; Corrêa, Valéria Sieiro Conde ; França, Suzelei de Castro ; Pereira, Ana Maria Soares. Genetic diversity of Stryphnodendron adstringens (Mart.) Coville determined by AFLP molecular markers. Biochemical Systematics and Ecology. v. 41, p. 16-20, 2012. Qualis: B1
30.	de SOUZA, Robson Francisco; Aravind, L.. Identification of novel components of NAD-utilizing metabolic pathways and prediction of their biochemical functions. Molecular Biosystems (Print). v. 8, p. 1661, 2012. Qualis: A3
31.	DIAS, Z. ; DIAS, U. M. ; HEATH, L. ; SETUBAL, J. C.. Sorting Genomes Using Almost-Symmetric Inversions. Em: 27th ACM Symposium on Applied Computing, 2012. Qualis: Não identificado (27th ACM Symposium on Applied Computing)
32.	Dias, Zanoni ; Dias, Ulisses ; Setubal, Joao C. SIS: a program to generate draft genome sequence scaffolds for prokaryotes. BMC Bioinformatics. v. 13, p. 96, 2012. Qualis: A1
33.	do Nascimento, N. C. ; GUIMARAES, A. M. S. ; Santos, A. P. ; SanMiguel, P. J. ; MESSICK, J. B.. Complete Genome Sequence of Mycoplasma haemocanis Strain Illinois. Journal of Bacteriology (Print). v. 194, p. 1605-1606, 2012. Qualis: A3
34.	do Nascimento, Naila C ; Santos, A. P. ; Guimaraes, A.M.S. ; SanMiguel, P. J. ; Messick, J.B.. Comparative genomic analyses of Mycoplasma haemocanis and Mycoplasma haemofelis: so close but yet so far away. Em: ACVP/ASVCP Combined Meeting, 2012, Seattle. Veterinary Clinical Pathology, v. 41, p. E63, 2012.
35.	do Nascimento, Naila C ; Santos, Andrea P ; Guimaraes, Ana MS ; SanMiguel, Phillip J ; Messick, Joanne B. Mycoplasma haemocanis -- the canine hemoplasma and its feline counterpart in the genomic era. Veterinary Research. v. 43, p. 66, 2012. Qualis: A1
36.	Domingues, Douglas S ; Cruz, Guilherme MQ ; Metcalfe, Cushla J ; Nogueira, Fabio TS ; Vicentini, Renato ; de S Alves, Cristiane ; Van Sluys, Marie-Anne. Analysis of plant LTR-retrotransposons at the fine-scale family level reveals individual molecular patterns. BMC GENOMICS. v. 13, p. 137, 2012. Qualis: A2
37.	Dos Santos, Patricia C ; Fang, Zhong ; Mason, Steven W ; Setubal, João C ; Dixon, Ray. Distribution of nitrogen fixation and nitrogenase-like sequences amongst microbial genomes. BMC Genomics. v. 13, p. 162, 2012. Qualis: A2
38.	dos Santos, W.D ; LOPES, A. F. ; BARONI, A. M. ; ALCÂNTARA, P. H. N. ; BUCKERIDGE, M. S.. Penicilium citrinum polysaccharidases. Journal of Agronomical Sciences. v. 1, p. 139-152, 2012.Qualis: C (JOURNAL OF AGRONOMIC SCIENCES)
39.	DRIEMEIER, C. ; Driemeier, Carlos ; Santos, Wanderley D. ; BUCKERIDGE, M. S.. Cellulose crystals in fibrovascular bundles of sugarcane culms: orientation, size, distortion, and variability. Cellulose (London). v. 19, p. 1-1508, 2012. Qualis: A1
40.	Duraisingham, Sai S. ; Rouphael, Nadine ; Cavanagh, Mary M. ; Nakaya, Helder I. ; Goronzy, Jorg J. ; Pulendran, Bali. Systems Biology of Vaccination in the Elderly. Current Topics in Microbiology and Immunology. 363ed. Em: . : Springer Berlin Heidelberg. 2012.p. 117-142.
41.	FERREIRA, J. E.; ARAUJO, L. V. ; BRAGHETTO, K. R. ; ITALIANO, I. C. ; OIKAWA, M. K. ; Takecian, P. L.. Long Lived Transaction Processing for Business Processes and Scientific Workflows. Journal of Information and Data Management - JIDM. v. 3, p. 33-50, 2012.Qualis: B3
42.	FERREIRA, JOAO E.; BRAGHETTO, KELLY R. ; TAKAI, OSVALDO K. ; Pu, Calton. Transactional Recovery Support for Robust Exception Handling in Business Process Services. Em: 2012 IEEE 19th International Conference on Web Services (ICWS), p. 303, 2012. Qualis: Não identificado (2012 IEEE 19th International Conference on Web Services (ICWS))
43.	Ferreira, Joao Eduardo. Transactional Recovery Support for Robust Exception Handling in Business Process Services. 2012. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
44.	Ferreira, Joao Eduardo. Transaction Processing for e-Science Applications. 2012. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
45.	Fettweis, J.M. ; SERRANO, M. G. ; Nihar Sheth ; Carly Mayer ; Abigail L. Glascock ; Brooks, J.P. ; Jefferson, Kimberly K ; Alves, João M. P. ; Vaginal Microbiome Consortium ; BUCK, G. A.. Species-level classification of the vaginal microbiome. BMC Genomics. v. 13, p. S17, 2012.Qualis: A2
46.	Florence, G. ; SAMESHIMA, K. ; Fonoff, E. T. ; GONCALVES, B. S. B. ; Teixeira, M. J.. A computational modeling approach to analyze the effects of extracellular potassium concentration on the deep brain stimulation in Parkinson?s disease. Em: Society for Neuroscience Meeting 2012, 2012, New Orleans. Abstracts of 2012 Society for Neuroscience Meeting. Washington: Society for Neuroscience, 2012.
47.	Fonseca, MAS ; ZARAMELA, L. S. ; Koide, Tie ; Vencio, R. Z. N.. Prediction of RNA-Protein Interactions: Exploring different representation and classifier combination strategies. 2012. Apresentação de Trabalho/Congresso
48.	Freire, M. A. ; Morya, E. ; Faber, J. ; SANTOS, J. ; Lemos, A.M.N. ; SAMESHIMA, K. ; Nicolelis, M. A. L.. Recording quality, distribution and morphometric analysis of interneurons following chronic multielectrode implants. Em: Society for Neuroscience Meeting, 2012, New Orleans. Abstracts of 2012 Society for Neuroscience Meeting, 2012.
49.	GARCIA, M. O. ; BRAGHETTO, K. R. ; PU, C. ; FERREIRA, J. E.. An Implementation of a Transaction Model for Business Process Systems. Journal of Information and Data Management - JIDM. v. 3, p. 271, 2012.Qualis: B3
50.	Garcia, M.O. ; SILVA, P. P. S. B. ; BRAGHETTO, K. R. ; FERREIRA, J. E.. WED-tool: uma ferramenta para o controle de execução de processos de negócio transacionais. Em: Simpósio Brasileiro de Bancos de Dados, 2012, São Paulo. Proceedings of the 27th Brazilian Symposium on Databases - Demos and Applications. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação, v. 1, p. 19-24, 2012. Qualis: Não identificado (SIMPÓSIO BRASILEIRO DE BANCOS DE DADOS, 2012, SÃO PAULO. PROCEEDINGS OF THE 27TH BRAZILIAN SYMPOSIUM ON DATABASES - DEMOS AND APPLICATIONS. PORTO ALEGRE: SOCIEDADE BRASILEIRA DE COMPUTAÇÃO)
51.	GOMEZ-VALDES, J. ; HÜNEMEIER, T. ; Contini V ; ACUNA-ALONZO, V. ; MACIN, G. ; Ballesteros, M ; CORRAL-MONTANES, P. ; RUIZ-LINARES, A ; SANCHEZ-MEJORADA, G. ; CANIZALES-QUINTEROS, S. ; MARTINEZ-ABADIAS, N. ; SALZANO, F. M. ; GONZALEZ-JOSE, R. ; BORTOLINI, M. C.. Fibroblast growth factor receptor 1 ( FGFR1 ) variants and craniofacial variation in Amerindians and related populations. American Journal of Human Biology. v. 1, p. n/a-n/a, 2012. Qualis: A1
52.	Goncalez, Thelma T. ; Sabino, Ester C. ; Capuani, Ligia ; Liu, Jing ; Wright, David J. ; Walsh, Judy H. ; FERREIRA, JOAO E. ; Chamone, Dalton A. ; Busch, Michael P. ; Custer, Brian. Blood transfusion utilization and recipient survival at Hospital das Clinicas in São Paulo, Brazil. Transfusion (Arlington, Va.). v. 52, p. 729-738, 2012. Qualis: A3
53.	GRANDIS, A. ; Arenque, Bruna C. ; BUCKERIDGE, M. S.. Senna reticulate: A promising feedstock for bioenergy use in Amazon. 2012. Apresentação de Trabalho/Congresso
54.	GUIMARAES, A. M. S.; Toth, B. ; Santos, A. P. ; do Nascimento, N. C. ; KRITCHEVSKY, J. E. ; MESSICK, J. B.. Genome Sequence of 'Candidatus Mycoplasma haemolamae' Strain Purdue, a Red Blood Cell Pathogen of Alpacas (Vicugna pacos) and Llamas (Lama glama). Journal of Bacteriology (Print). v. 194, p. 6312-6313, 2012. Qualis: A3
55.	Guimaraes, A.M.S.; Santos, A. P. ; Messick, Joanne Belle. Mycoplasma suis antigens: from discovery to a multiplex microbead immunoassay. Em: 112th General Meeting of the American Society for Microbiology, 2012, San Francisco. Proceedings of the 112th General Meeting of the ASM, v. 1, p. 12-A-1287, 2012.
56.	Guimaraes, A.M.S.; Santos, A. P. ; Timenetsky, Jorge ; Messick, Joanne B. The Mycoplasma genus: have the hemoplasmas crossed the line?. Em: 19th Congress of the International Organisation for Mycoplasmology 2012, 2012, Toulouse, France. Proceedings of the 19th Congress of the International Organisation for Mycoplasmology, v. 1, 2012.
57.	Harwich, Michael D ; Serrano, Myrna G. ; Fettweis, J.M. ; Alves, João M. P. ; Mark A. Reimers ; Vaginal Microbiome Consortium ; Buck, Gregory A ; Jefferson, Kimberly K. Genomic sequence analysis and characterization of Sneathia amnii sp. nov. BMC Genomics. v. 13, p. S4, 2012. Qualis: A2
58.	HIGA, C. H. A. ; HASHIMOTO, R. F. ; MONTE, J. C. M.. Inferring Robust Boolean Networks of the Early Embryonic Stage in Kidney Organogenesis. Em: Brazilian Symposium on Bioinformatics 2012 (BSB 2012), 2012, Campo Grande. Brazilian Symposium on Bioinformatics 2012 (BSB 2012), p. 56-61, 2012.
59.	HORIMOTO, ANDRÉA RVR ; OLIVEIRA, CAMILA M ; GIOLO, SUELY R ; SOLER, JÚLIA P ; DE ANDRADE, MARIZA ; KRIEGER, JOSÉ E ; PEREIRA, ALEXANDRE C. Genetic analyses of smoking initiation, persistence, quantity, and age-at-onset of regular cigarette use in Brazilian families: the Baependi Heart Study. BMC Medical Genetics (Online). v. 13, p. 9, 2012. Qualis: A4
60.	HÜNEMEIER, T.; Amorim, CEG ; AZEVEDO, S. ; Contini V ; Rothhammer F ; Dugoujon JM ; Mazières S ; BARRANTES, R. ; Villarreal-Molina MT ; PAIXAO-CORTES, V. R. ; SALZANO, F. M. ; CANIZALES-QUINTEROS, S. ; RUIZ-LINARES, A ; BORTOLINI, M. C.. Evolutionary Responses to a Constructed Niche: Ancient Mesoamericans as a Model of Gene-Culture Coevolution. Plos One. v. 7, p. e38862-e38862, 2012. Qualis: A1
61.	HÜNEMEIER, T.; GOMEZ-VALDES, J. ; Ballesteros, M ; AZEVEDO, S. ; MARTINEZ-ABADIAS, N. ; Esparza, M ; SJOVOLD, T. ; BONATTO, S. L. ; SALZANO, F. M. ; BORTOLINI, M. C. ; GONZALEZ-JOSE, R.. Cultural diversification promotes rapid phenotypic evolution in Xavante Indians. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. v. 109, p. 73-77, 2012. Qualis: A1
62.	Jesus, Erika M. ; Ochoa Cruz, Edgar A. ; Cruz, Guilherme M. Q. ; Van Sluys, Marie-Anne. Diversification of hAT transposase paralogues in the sugarcane genome. MOLECULAR GENETICS AND GENOMICS. v. 287, p. 205-219, 2012. Qualis: A4
63.	JOLY, C. A. ; BERLINCK, R. G. S. ; BOLZANI, V. S. ; HADDAD, C. F. B. ; OLIVEIRA, M. C. ; SLUYS MAV. ; SOUZA, G. M. ; VERDADE, L. M. ; VICTORIA, R. L.. Principais conclusões do workshop conjunto dos programas FAPESP BIOTA-BIOEN-Mudanças Climáticas: ciência e políticas públicas para uma economia mais verde, no contexto da RIO+20. Biota Neotropica. v. 12(2), p. 19-21, 2012.Qualis: B1
64.	Jones, Crystal L. ; Sampson, Timothy R. ; Nakaya, Helder I. ; Pulendran, Bali ; Weiss, David S.. Repression of Bacterial Lipoprotein Production by F. novicida Facilitates Evasion of Innate Immune Recognition. Cellular Microbiology (Print). v. 15, p. n/a-n/a, 2012. Qualis: A2
65.	JORGE, D. M. M. ; GIULIATTI, S. Study In Silico and In Vitro Inhibition of BVPLA2. Em: III Workshop do Programa de Pós-Graduação em Genética FMRP/USP e Simpósio Comemorativo em Homenagem à Profª Drª Catarina Satie Takahashi, 2012, Ribeirão Preto, SP. Anais, 2012.
66.	KAJIHARA, D. ; Godoy F ; Hamaji TA ; BLANCO, S. R. ; VANSLUYS, M A ; SLUYS MAV. ; ROSSI, M.. Functional characterization of sugarcane mustang domesticated transposases and comparative diversity in sugarcane, rice, maize and sorghum. Genetics and Molecular Biology (Impresso). v. 35, p. 632-639, 2012.Qualis: A4
67.	KAVANISHI, R. K. ; GIULIATTI, S.. Estudo das Interações Proteína-Proteína usando Estruturas Primárias. Em: 20º SIICUSP: Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo, 2012, Ribeirão Preto, SP. Anais, 2012.
68.	Koide, Tie; Vencio, R. Z. N. ; ZARAMELA, L. S. ; ten-Caten, F ; Pontelli, MC ; GOMES-FILHO, J. V.. ntegrating molecular information to understand life in extreme environments. 2012. Apresentação de Trabalho/Outra
69.	Krepischi, Ana C V ; Achatz, Maria Isabel W ; Santos, Erika M M ; Costa, Silvia S ; Lisboa, Bianca C G ; Brentani, Helena ; Santos, Tiago M ; Goncalves, Amanda ; Nobrega, Amanda F ; Pearson, Peter L ; Vianna-Morgante, Angela M ; Carraro, Dirce M ; Brentani, Ricardo R ; Rosenberg, Carla. Germline DNA copy number variation in familial and early-onset breast cancer. Breast Cancer Research (Print). v. 14, p. R24, 2012. Qualis: A1
70.	Kwissa, M. ; NAKAYA, H. I. ; Oluoch, H. ; Pulendran, B.. Distinct TLR adjuvants differentially stimulate systemic and local innate immune responses in non-human primates. Blood (Philadelphia, PA). v. 119, p. n/a, 2012. Qualis: A1
71.	LEITE, D.C.C. ; GRANDIS, A. ; SOUZA, A. P. ; TAVARES, E. Q. P. ; AVCI, U. ; PATTATHIL, S. ; HAHN, M. ; BUCKERIDGE, M. S.. Cell wall changes in developing roots of sugarcane as a model to understand cell wall degradation. 2012. Apresentação de Trabalho/Congresso
72.	LEOTTI, F. C. ; AZEREDO-ESPIN, A.M.L. ; TORRES, T. T. ; CARDOSO, G.A.. New World screw-worm Genomics: a First Step Towards Understanding the Evolution of Parasitism in Calliphoridae. Em: 58o Congresso Brasileiro de Genética, 2012, Foz do Iguaçu, PR. 58o Congresso Brasileiro de Genetica, 2012.
73.	LEOTTI, F. C. ; CARDOSO, G.A. ; AZEREDO-ESPIN, A.M.L. ; TORRES, T. T.. New World screw-worm Genomics: a First Step Towards Understanding the Evolution of Parasitism in Calliphoridae. Em: 6th Annual Arthropod Genomics Symposium, 2012, Kansas City MO, Estados Unidos. 6th Annual Arthropod Genomics Symposium - Poster abstracts, 2012.
74.	LEOTTI, F. C. ; TORRES, T. T.. Conteúdo repetitivo do genoma de Cochliomyia hominivorax. Em: Simpósio Internacional de Iniciação Científica, 2012, Ribeirão Preto. Resumos do 20o SIIC USP, 2012. Qualis: Não identificado (SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 2012, RIBEIRÃO PRETO. RESUMOS DO 20O SIIC USP)
75.	LIMA, L. A. ; RIS, M. ; BARRERA, J. ; BRENTANI, M. M. ; Brentani, Helena. Computing a predictor set influence zone through a multi-laser genetic network to explore the role of estrogen in breast cance. Advances in Breast Cancer Research. v. 1, p. 29-29, 2012.Qualis: Não identificado (ADVANCES IN BREAST CANCER RESEARCH)
76.	Lima, Luciana ; Ortiz, Paola A. ; da Silva, Flávia Maia ; Alves, João Marcelo P. ; Serrano, Myrna G. ; Cortez, Alane P. ; Alfieri, Silvia C. ; Buck, Gregory A. ; Teixeira, Marta M. G.. Repertoire, Genealogy and Genomic Organization of Cruzipain and Homologous Genes in Trypanosoma cruzi, T. cruzi-Like and Other Trypanosome Species. Plos One. v. 7, p. e38385, 2012. Qualis: A1
77.	LONG, M. ; VIBRANOVSKI, M. D. ; ZHANG, Y. E.. Evolutionary interactions between sex chromosomes and autosomes. Em: Rama S. Singh; Jianping Xu; Rob J. Kulathinal. (Org.). Evolutionary interactions between sex chromosomes and autosomes. 1ed.Oxford. : Oxford University Press. 2012.p. 101-113.
78.	LOUZADA, V. H. P. ; LOPES, F. M. ; HASHIMOTO, R. F.. A Monte Carlo Approach to Measure the Robustness of Boolean Networks. Em: 1st International Workshop on Robustness and Stability of Biological Systems and Computational Solutions, p. 696-699, 2012. Qualis: Não identificado (1st International Workshop on Robustness and Stability of Biological Systems and Computational Solutions)
79.	MACHADO, BIRAJARA SOARES ; KUNICKI, ANA CAROLINA BIONE ; MORYA, EDGARD ; Sameshima, Koichi. Spectral characteristics of the hippocampal LFP during contextual fear conditioning. Einstein (São Paulo). v. 10, p. 140-144, 2012. Qualis: B1
80.	Manetti, M. E. ; ROSSI, M. ; CRUZ, G. M. Q. ; SACCARO, N. L. ; NAKABASHI, M. ; ALTEBARMAKIAN, V. ; RODIER-GOUD, M. ; DOMINGUES, D. ; D?HONT, A. ; SLUYS, M. A.. Mutator System Derivatives Isolated from Sugarcane Genome Sequence. Tropical Plant Biology. v. 5, p. 233-243, 2012. Qualis: A3
81.	Manque, Patricio A. ; Woehlbier, Ute ; Lara, Ana M. ; Tenjo, Fernando ; Alves, João M. ; Buck, Gregory A.. Identification and Characterization of a Novel Calcium-Activated Apyrase from Cryptosporidium Parasites and Its Potential Role in Pathogenesis. Plos One. v. 7, p. e31030, 2012. Qualis: A1
82.	MARTINS, ALINE REDONDO ; CARMELLO-GUERREIRO, SANDRA MARIA ; BUCKERIDGE, MARCOS SILVEIRA ; SILVA, CLOVIS OLIVEIRA ; APPEZZATO-DA-GLÓRIA, BEATRIZ. Seed ontogeny and endosperm chemical analysis in Smilax polyantha (Smilacaceae). Australian Journal of Botany (Print). v. 60, p. 693-699, 2012. Qualis: A4
83.	MARTINS, CAMILA MARINELLI ; Mohamed, Ahmed ; GUIMARÃES, ANA MARCIA SÁ ; DE BARROS, CRISTIANE DA CONCEIÇÃO ; PAMPUCH, RAQUEL DOS SANTOS ; SVOBODA, WALFRIDO ; GARCIA, RITA DE CASSIA MARIA ; FERREIRA, FERNANDO ; Biondo, Alexander Welker. Impact of demographic characteristics in pet ownership: Modeling animal count according to owners income and age. Preventive Veterinary Medicine (Print). v. 107, p. 1, 2012. Qualis: A1
84.	Maschietto, Mariana ; Silva, Aderbal R. ; Puga, Renato D. ; Lima, Leandro ; Pereira, Carlos B. ; Nakano, Eduardo Y. ; Mello, Barbara ; Gama, Clarissa S. ; Belmonte-de-Abreu, Paulo ; Carraro, Dirce M. ; Palha, Joana A. ; Brentani, Helena. Gene expression of peripheral blood lymphocytes may discriminate patients with schizophrenia from controls. Psychiatry Research (Print). v. 200, p. 1018-1021, 2012. Qualis: A4
85.	MASSARO, J. D. ; EVANGELISTA, A. F. ; CASTELLI, E. C. ; Giuliatti, S. ; DONADI, E. A.. In Silico Analysis of HLA-G Promoter Region to Identify DNA Elements Near to SNPS and Transcription Alterations Evidences. Tissue Antigens. v. 80, p. 100-100, 2012.Qualis: Não identificado (TISSUE ANTIGENS)
86.	MATOS, A. R. ; COUTINHO-CAMILO, C. ; DAMASCENO, A. S. ; SILVA, E. A. ; BRENTANI, H. P. ; FONSECA, F. P. ; Soares, F A ; GIMBA, E. R. P.. Trombospondin 2 Expression Profile in Prostate Cancer and Benign Prostatic Hyperplasia Tissues. Em: 22nd Biennial Congress of the European-Association-for-Cancer-Research, 2012, Barcelona. European Journal of Cancer, v. 48, p. S35-S36, 2012.
87.	MIRANDA, T. A. B. ; Morya, E. ; CRISTANTE, A. F. ; SAMESHIMA, K. ; Nicolelis, M. A. L.. Sensorimotor cortical spike activity of spinal cord injured Wistar rats during treadmill training. Em: Society for Neuroscience Meeting 2012, 2012, New Orleans. Abstracts of 2012 Society for Neuroscience Meeting. Washington: Society for Neuroscience, 2012.
88.	MORAIS, ENYARA R. ; Oliveira, Katia C. ; MAGALHÃES, LIZANDRA G. ; MOREIRA, ÉRIKA B.C. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; RODRIGUES, Vanderlei. Effects of curcumin on the parasite Schistosoma mansoni: A transcriptomic approach. Molecular and Biochemical Parasitology (Print). v. 187, p. 91-97, 2012. Qualis: A4
89.	Nakaya, Helder I. (Emory University) Palestra: MicroRNA signatures of vaccination in humans. 2012. Apresentação de Trabalho/Seminário
90.	Nakaya, Helder I. (UNIFESP) Palestra: Systems Vaccinology: Learning to compute the behavior of vaccine induced immunity. 2012. Apresentação de Trabalho/Seminário
91.	Nakaya, Helder I. (International Conference of the American Thoracic Society @ San Francisco) Palestra: INFLUENZA AND SYSTEMS BIOLOGY. 2012. Apresentação de Trabalho/Congresso
92.	Nakaya, Helder I. (Human Immunology Project Consortium @ Washington DC) Poster: HIPC Data Standards. 2012. Apresentação de Trabalho/Simpósio
93.	Nakaya, Helder I.; Pulendran, Bali. Systems vaccinology. Current Opinion in HIV and AIDS (Print). v. 7, p. 24-31, 2012. Qualis: Não identificado (CURRENT OPINION IN HIV AND AIDS)
94.	Nakaya, Helder I; Gardner, Joy ; Poo, Yee-Suan ; Major, Lee ; Pulendran, Bali ; Suhrbier, Andreas. Gene profiling of chikungunya virus arthritis reveals significant overlap with rheumatoid arthritis. Arthritis and Rheumatism. v. 64, p. n/a-n/a, 2012. Qualis: Não identificado (ARTHRITIS AND RHEUMATISM)
95.	NICOLAU JUNIOR, N. ; JUNTA, C. M. ; GIULIATTI, S. Macromolecular modeling of the E7 Protein from the human papilloma virus type 16 (HPV16). 2012. Apresentação de Trabalho/Outra
96.	Novaes, Jeniffer ; RANGEL, L. T. L. D. ; FERRO, M. ; Abe, Ricardo Y. ; Manha, Alessandra P.S. ; de Mello, Joana C.M. ; Varuzza, Leonardo ; DURHAM, A. M. ; Madeira, Alda Maria B.N. ; Gruber, Arthur. A comparative transcriptome analysis reveals expression profiles conserved across three Eimeria spp. of domestic fowl and associated with multiple developmental stages. International Journal for Parasitology. v. 42, p. 39-48, 2012. Qualis: A1
97.	Oliveira, Katia C. ; Carvalho, Mariana L.P. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; LoVerde, Philip T.. Effect of human TGF-β on the gene expression profile of Schistosoma mansoni adult worms. Molecular and Biochemical Parasitology (Print). v. 183, p. 132-139, 2012. Qualis: A4
98.	OLIVEIRA, L. S. ; GRUBER, A. ; DURHAM, A. M.. Development of integrated for analysis and annotation of DNA sequences. 2012. Apresentação de Trabalho/Outra
99.	Oliveira, M. ; BUCKERIDGE, M. S.. Entre açúcares e genes. Pesquisa FAPESP (Impresso), São Paulo, p. 86-91, 01 out. 2012.
100.	OLIVEIRA, S. T. ; Messick, J.B. ; Biondo, Alexander W. ; Santos, A. P. ; STEDILE, R. ; DALMOLIN, M. L. ; Guimaraes, A.M.S. ; MOHAMED, A. ; RIEDIGER, I. ; GONZALEZ, F. H. D.. Exposure to Leptospira spp. in sick dogs, shelter dogs and dogs from an endemic area: points to consider. Acta Scientiae Veterinariae (Online). v. 40, p. 1056, 2012.Qualis: Não identificado (IN SICK DOGS, SHELTER DOGS AND DOGS FROM AN ENDEMIC AREA: POINTS TO CONSIDER. ACTA SCIENTIAE VETERINARIAE)
101.	PAIXAO-CORTES, V. R. ; VISCARDI, L. ; SALZANO, F. M. ; HÜNEMEIER, T. ; BORTOLINI, M. C.. Homo sapiens, Homo neanderthalensis and the Denisova specimen: new insights on their evolutionary histories using whole-genome comparisons. Genetics and Molecular Biology (Impresso). v. 35, p. 904-911, 2012. Qualis: A4
102.	Palhares, Alessandra C ; Maccheroni, Walter ; Souza, Anete P ; Marconi, Thiago G ; Mollinari, Marcelo ; Gazaffi, Rodrigo ; Garcia, Antonio Augusto F ; Vieira, Maria Lucia Carneiro ; Rodrigues-Morais, Taislene B ; Jordão, Hamilton ; Van Sluys, Marie-Anne ; Domingues, Douglas S ; et.al. A novel linkage map of sugarcane with evidence for clustering of retrotransposon-based markers. BMC Genetics (Online). v. 13, p. 51, 2012. Qualis: A3
103.	Patavino, Giuseppina Maria ; De Almeida-Neto, Cesar ; Liu, Jing ; Wright, David J. ; Mendrone-Junior, Alfredo ; Ferreira, Maria Inês Lopes ; de Freitas Carneiro, Anna Bárbara ; Custer, Brian ; Ferreira, João Eduardo ; Busch, Michael P. ; Sabino, Ester Cerdeira. Number of recent sexual partners among blood donors in Brazil: associations with donor demographics, donation characteristics, and infectious disease markers. Transfusion (Arlington, Va.). v. 52, p. 151-159, 2012. Qualis: A3
104.	PIOVEZANI, A. ; BRENTANI, H. P. ; MACHADO-LIMA, A.. MicroRNAs targets predictions in complex diseases. Em: microRNA 2012 International Symposium, 2012, Sõ Paulo. microRNA 2012 International Symposium, p. 42-42, 2012.
105.	REICH, D. ; Patterson, N ; Campbell D ; Mazières S ; Ray, N ; Parra, Maria V. ; Rojas, W ; Duque, Constanza ; Mesa, N ; García, LF ; Triana, O ; Blair, S ; Maestre, A ; Dib, JC ; Bravi, CM ; Bailliet, G ; Corach, D ; HÜNEMEIER, T. ; BORTOLINI, M. C. ; SALZANO, F. M. ; et.al. Reconstructing Native American population history. Nature (London). v. 00, p. 00-00, 2012. Qualis: A1
106.	Reis, Eduardo M. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S.. Perspectives of Long Non-Coding RNAs in Cancer Diagnostics. Frontiers in Genetics. v. 3, p. 32, 2012. Qualis: A2
107.	RODRIGUES, M. G. F. ; MARTINS, A.B.G. ; BERTONI, B. W. ; FIGUEIRA, A. ; GIULIATTI, S. Análise da Metilação do DNA de Seleções de Mutantes de Figueira por Marcadores Moleculares. Em: XXII Congresso Brasileiro de Fruticultura, 2012, Bento Gonçalves, RS. Anais. Vitória da Conquista, BA: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2012.
108.	RODRIGUES, M. G. F. ; MARTINS, A.B.G. ; BERTONI, B. W. ; FIGUEIRA, A. ; GIULIATTI, S.. Search for Methylation-Sensitive Amplification Polymorphisms in Selections of Mutant Figs. Em: 58º Congresso Brasileiro de Genética, 2012, Foz do Iguaçu, PR. Anais, 2012.
109.	RODRIGUES, T. C. ; CARVALHO, F. ; Verjovski-Almeida, S. ; Krepischi, A. C. V. ; Rosenberg, C.. Abstract 1168: Identification of CNA signatures in prostate cancer: Narrowing chromosome regions related with occurrence, prognosis and recurrence after treatment. Cancer Research (Chicago, Ill.). v. 72, p. 1168, 2012. Qualis: A1
110.	Sabino, Ester C. ; Gonçalez, Thelma T. ; Carneiro-Proietti, Anna Bárbara ; Sarr, Moussa ; Ferreira, João Eduardo ; Sampaio, Divaldo A. ; Salles, Nanci A. ; Wright, David J. ; Custer, Brian ; Busch, Michael ; FOR THE NHLBI RETROVIRUS EPIDEMIOLOGY DONOR STUDY-II (REDS-II), INTERNATIONAL COMPONENT. Human immunodeficiency virus prevalence, incidence, and residual risk of transmission by transfusions at Retrovirus Epidemiology Donor Study-II blood centers in Brazil. Transfusion (Arlington, Va.). v. 52, p. 870-879, 2012. Qualis: A3
111.	SALDANHA, H. ; RIBEIRO, E. ; BORGES, C. ; ARAUJO, A. ; GALLON, R. ; HOLANDA, M. ; WALTER, M. E. ; TOGAWA, R. ; Setubal, J.C.. Towards a hybrid federated cloud platform to efficiently execute bioinformatics workflows. Bioinformatics. Rijeka. Em: . : InTech. 2012.p. 1-25.
112.	SALLES, IVAN S. ; BUCKERIDGE, MARCOS S.. Cronobiologia vegetal: aspectos fisiológicos de um relógio verde. Revista da Biologia. v. 9, p. 45-49, 2012. Qualis: B4
113.	SALLES, IVAN S. ; BUCKERIDGE, MARCOS S.. Coordenação temporal da degradação das reservas dos cotilédones de jatobá (Himenaea courbaril L.). Revista da Biologia. v. 9, p. 50-52, 2012. Qualis: B4
114.	Sameshima, K. Testemunho de segunda geração de médico brasileiro sobrevivente da bomba atômica. Em: 20th IPPNW World Congress, v. 2176, p. 31-33, 2012.Qualis: Não identificado (20th IPPNW World Congress)
115.	Sameshima, K. Testimony of Physician of 2nd Generation Hibakusha from Brazil. 2012. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
116.	Santana, W.O. ; Pierry, P.M. ; Coletta-Filho H.D. ; ZAINI, Paulo A. ; Kitajima, J.P. ; MARTINS-JUNIOR, J. ; Almeida, L.G. ; de Souza, A. A. ; VASCONCELOS, A. T. R. ; ALMEIDA, R. R. ; Machado, M.A. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; da Silva, Aline M. Whole genome comparison reveals significant diversity among different Xylella fastidiosa strains and highlights host specificity determinants. 2012. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
117.	Santos, A. P. ; Guimaraes, A.M.S. ; do Nascimento, Naila C ; SanMiguel, P. J. ; Messick, J.B.. Complete Genome Sequence of Mycoplasma wenyonii strain Massachusettes. Em: ACVP/ASVCP Combined Meeting, 2012, Seattle. Veterinary Clinical Pathology, v. 41, p. E63, 2012.
118.	Santos, A. P. ; GUIMARÃES, A. M. S. ; do Nascimento, Naila C ; SanMiguel, Phillip ; Messick, Joanne B. Complete Genome Sequence of Mycoplasma wenyonii Strain Massachusetts. Journal of Bacteriology (Print). v. 194, p. 5458-5459, 2012.Qualis: A3
119.	SANTOS, W. D. ; Adriana Froutman Lopes ; BARONI, A. M. ; Alcântara, P. H. N. ; BUCKERIDGE, M. S.. Penicillium citrinum Polysaccharidases. Journal of Agronomical Sciences. v. 1, p. 139-152-152, 2012.Qualis: C (JOURNAL OF AGRONOMIC SCIENCES)
120.	SATO, F. ; VADASZ, E. ; BRENTANI. H ; MERCADANTE, M. T.. Transtorno do espectro autista: autismo infantil. Em: Guilherme Vanoni Polanczyk; Maria Teresa Martins Ramos Lamberte. (Org.). Psiquiatria da Infância e Adolescência - Coleção Pediatria do Instituto da Criança HC-FMUSP. 1ªed.Barueri. : Manole. 2012.p. 222-229.
121.	SCHWERZ, ANDRE LUIS ; LIBERATO, RAFAEL ; WIESE, IGOR SCALIANTE ; STEINMACHER, IGOR ; GEROSA, MARCO AURELIO ; Ferreira, Joao Eduardo. Prediction of Developer Participation in Issues of Open Source Projects. Em: Simpósio Brasileiro de Sistemas Colaborativos (SBSC 2012), p. 109, 2012. Qualis: Não identificado (Simpósio Brasileiro de Sistemas Colaborativos (SBSC 2012))
122.	SEBOLLELA, A. ; FREITAS-CORREA, L. ; Oliveira, F. F. ; Paula-Lima, A. C. ; Saraiva, L. M. ; Martins, S. M. ; Carvalho Mota, L. D. ; Torres, C. ; Alves-Leon, S. ; de Souza, J. M. ; CARRARO, D. M. ; BRENTANI, H. ; De Felice, F. G. ; FERREIRA, S. T.. Amyloid- oligomers induce differential gene expression in adult human brain slices. The Journal of Biological Chemistry (Print). v. 287, p. 7436-7445, 2012. Qualis: A1
123.	Setta, Nathalia ; METCALFE, CUSHLA J. ; Cruz, Guilherme M. Q. ; Ochoa, Edgar A. ; Sluys, Marie-Anne. Noise or Symphony: Comparative Evolutionary Analysis of Sugarcane Transposable Elements with Other Grasses. Topics in Current Genetics. 1ed. Em: . : Springer Berlin Heidelberg. 2012.p. 169-192.
124.	SILVA, ADERBAL R. T. ; GRINBERG, LEA T. ; FARFEL, JOSE M. ; DINIZ, BRENO S. ; LIMA, LEANDRO A. ; SILVA, PAULO J. S. ; FERRETTI, RENATA E. L. ; ROCHA, RAFAEL M. ; FILHO, WILSON JACOB ; Carraro, Dirce M. ; BRENTANI, HELENA ; GINSBERG, STEPHEN D.. Transcriptional Alterations Related to Neuropathology and Clinical Manifestation of Alzheimer¿s Disease. Plos One. v. 7, p. e48751, 2012. Qualis: A1
125.	SILVA, J. S. ; SARAIVA, A. M. ; STOPPE, N. C. ; TORRES, T.T. ; OTTOBONI, LMM. Social Network Analysis metrics and its application in microbiological Interaction Networks studies. Em: 8th Internacional Conference on Ecological Informatics (ISEI8), 2012, Brasilia. Abstract and Proceedings of 8th ISEI, 2012. Qualis: Não identificado (8TH INTERNACIONAL CONFERENCE ON ECOLOGICAL INFORMATICS , 2012, BRASILIA. ABSTRACT AND PROCEEDINGS OF 8TH ISEI)
126.	SILVA, P. P. S. B. ; BRAGHETTO, K. R. ; FERREIRA, J. E.. Uma abordagem ad hoc para o tratamento de exceções em processos transacionais. Em: Simpósio Brasileiro de Bancos de Dados, 2012, São Paulo. Proceedings of the 27th Brazilian Symposium on Databases - Short Papers. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação, v. 1, p. 153-160, 2012. Qualis: Não identificado (SIMPÓSIO BRASILEIRO DE BANCOS DE DADOS, 2012, SÃO PAULO. PROCEEDINGS OF THE 27TH BRAZILIAN SYMPOSIUM ON DATABASES - SHORT PAPERS. PORTO ALEGRE: SOCIEDADE BRASILEIRA DE COMPUTAÇÃO)
127.	SIMOES, S. N. ; MARTINS, D. C. ; SAMAIA, H. P. B. ; HASHIMOTO, R. F.. Shortest Paths Ranking Methodology to Identify Alterations in PPI Networks of Complex Diseases. Em: ACM International Conference on Bioinformatics, p. 561-563, 2012. Qualis: Não identificado (ACM International Conference on Bioinformatics)
128.	SIMÕES, SÉRGIO NERY ; MARTINS-JR, DAVID CORREA ; BRENTANI, HELENA ; FUMIO, RONALDO. Shortest paths ranking methodology to identify alterations in PPI networks of complex diseases. Em: the ACM Conference, 2012, Orlando. Proceedings of the ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology and Biomedicine - BCB '12. New York: ACM Press, p. 561-563, 2012.
129.	SLATER, S. ; Setubal, Joao C ; HOUMIEL, K. ; SUN, J. ; KAUL, R. ; GOLDMAN, B. ; FARRAND, S. ; Almeida, Nalvo F ; BURR, T. ; NESTER, E. W. ; RHOADS, D. ; WELCH, R. ; WOOD, Derek W.. The Genome of Agrobacterium tumefaciens C58: Reconciliation of sequence data, updated annotation, and distribution of linear chromosome in genus Agrobacterium.. Applied and Environmental Microbiology (Print),. p. 1414-1417, 2012. Qualis: A1 (APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY)
130.	SOUZA, A. P. ; CALDANA, C. ; WILLMITZER, L. ; BUCKERIDGE, M. S.. Changes in primary metabolites in sugarcane tissues during a diurnal cycle. 2012. Apresentação de Trabalho/Congresso
131.	TAKECIAN, P. L. ; FERREIRA, J. E.. Methodological Guidelines and Adaptive Statistical Data Validation to Build Effective DataWarehouses. Em: Simpósio Brasileiro de Bancos de Dados, 2012, São Paulo. Proceedings of the 27th Brazilian Symposium on Databases - Thesis and Dissertation Workshop. Sâo Paulo: Sociedade Brasileira de Computação, v. 1, p. 61-68, 2012. Qualis: Não identificado (SIMPÓSIO BRASILEIRO DE BANCOS DE DADOS, 2012, SÃO PAULO. PROCEEDINGS OF THE 27TH BRAZILIAN SYMPOSIUM ON DATABASES - THESIS AND DISSERTATION WORKSHOP. SÂO PAULO: SOCIEDADE BRASILEIRA DE COMPUTAÇÃO)
132.	TAVARES, E. Q. P. ; GRANDIS, A. ; LEITE, D.C.C. ; Souza, Amanda P. ; BUCKERIDGE, M. S.. Cell Wall degradation in sugarcane roots: Is it a constitutive process?. 2012. Apresentação de Trabalho/Congresso
133.	TORRES, T.T. Evolution of gene expression. 2012. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
134.	Ullmann, Leila Sabrina ; Hoffmann, Juliano Leônidas ; de Moraes, Wanderlei ; Cubas, Zalmir Silvino ; dos Santos, Leonilda Correia ; da Silva, Rodrigo Costa ; MOREIRA, N. ; GUIMARÃES, A. M. S. ; CAMOSSI, L. G. ; Langoni, Helio ; Biondo, Alexander W.. Serologic Survey for Leptospira spp. in Captive Neotropical Felids in Foz do Iguaçu, Paraná, Brazil. Journal of Zoo and Wildlife Medicine. v. 43, p. 223-228, 2012.Qualis: Não identificado (IN CAPTIVE NEOTROPICAL FELIDS IN FOZ DO IGUAÇU, PARANÁ, BRAZIL. JOURNAL OF ZOO AND WILDLIFE MEDICINE)
135.	Varani, Alessandro M. ; MONTEIRO-VITORELLO, CLAUDIA B. ; ALMEIDA, LUIZ G.P. DE ; SOUZA, RANGEL C. ; CUNHA, OBERDAN L. ; Lima, Wanessa C. ; Civerolo, Edwin ; SLUYS, MARIE-ANNE VAN ; VASCONCELOS, ANA T.R.. Xylella fastidiosa comparative genomic database is an information resource to explore the annotation, genomic features, and biology of different strains. Genetics and Molecular Biology (Impresso). v. 35, p. 149-152, 2012. Qualis: A4
136.	VARANI, ALESSANDRO M. ; MONTEIRO-VITORELLO, CLAUDIA BARROS ; Nakaya, Helder I. ; Van Sluys, Marie-Anne. The Role of Prophage in Plant-Pathogenic Bacteria. Annual Review of Phytopathology (Print). v. 51, p. 130531172133008, 2012. Qualis: A1
137.	Verjovski-Almeida, S.; Paschoal, Alexandre Rossi ; Maracaja-Coutinho, Vinicius ; Setubal, João Carlos ; Simões, Zilá Luz Paulino ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Durham, Alan Mitchell. Non-coding transcription characterization and annotation: A guide and web resource for non-coding RNA databases. RNA Biology. v. 9, p. 274-282, 2012. Qualis: A2
138.	VIBRANOVSKI, M. D. Genetic Analyses of the Gene Movement between Sex Chromosomes and Autosomes. 2012. Apresentação de Trabalho/Seminário
139.	VIBRANOVSKI, M. D. Genetic Analyses of the Gene Movement between Sex Chromosomes and Autosomes. 2012. Apresentação de Trabalho/Seminário
140.	VIBRANOVSKI, M. D. Análise genética do movimento de genes entre os cromossomos sexuais e os autossomos. 2012. Apresentação de Trabalho/Seminário
141.	VIBRANOVSKI, M. D. Análise genética do movimento de genes entre os cromossomos sexuais e os autossomos. 2012. Apresentação de Trabalho/Seminário
142.	VIBRANOVSKI, M. D. Análise genética do movimento de genes entre os cromossomos sexuais e os autossomos. 2012. Apresentação de Trabalho/Seminário
143.	VIBRANOVSKI, M. D.; WANG, J. ; KARR, T. L. ; ZHANG, Y.. Methodological studies on development and duplicate datasets revealed new evidence for Meiotic Sex Chromosomal Inactivation. 2012. Apresentação de Trabalho/Congresso
144.	VIBRANOVSKI, M. D.; ZHANG, Y. ; KEMKEMER, C. ; LOPES, H. F. ; KARR, T. L. ; LONG, M.. Re-analysis of the larval testis data on meiotic sex chromosome inactivation revealed evidence for tissue-specific gene expression related to the drosophila X chromosome. BMC Biology. v. 10, p. 49, 2012. Qualis: A1
145.	VIBRANOVSKI, M. D.; ZHANG, Y. ; KEMKEMER, C. ; VANKUREN, N. W. ; LOPES, H. F. ; Karr T.L. ; LONG, M.. Segmental dataset and whole body expression data do not support the hypothesis that non-random movement is an intrinsic property of Drosophila retrogenes. BMC Evolutionary Biology (Online). v. 12, p. 169, 2012. Qualis: A1
146.	VICENTE, F. F. R. ; LOPES, F. M. ; HASHIMOTO, R. F. ; CESAR JUNIOR, R. M.. Assessing the Gain of Biological Data Integration in Gene Networks Inference. BMC Genomics. v. 13, p. 1-12, 2012. Qualis: A2
147.	VICENTINI, R. ; NOGUEIRA, F. T. S. ; Vincentz, M. ; BEM, L. E. V. ; SLUYS, M. A.. Gene Content Analysis of Sugarcane Public ESTs Reveals Thousands of Missing Coding-Genes and an Unexpected Pool of Grasses Conserved ncRNAs. Tropical Plant Biology (Online). v. 1, p. 1, 2012. Qualis: A3
148.	Vieira, Rafael F.C. ; VIDOTTO, O. ; VIEIRA, T. S. ; Guimaraes, A.M.S. ; NASCIMENTO, D. ; Santos, A.P. ; do Nascimento, Naila C ; Biondo, Alexander W. ; Messick, J.B.. Molecular Investigation of Hemotrophic Mycoplasma Species in Dogs, Horses and Humans in a Rural Settlement from Southern Brazil. Em: ACVP/ASVCP Combined Meeting, 2012, Seattle. Veterinary Clinical Pathology, v. 41, p. E64, 2012.
149.	VIRGINIO JUNIOR, L. A. ; WOLF, A. E. ; TAMASHIRO, E. ; GIULIATTI, S.. Desenvolvimento de Programa Informatizado de Gerenciamento e Pesquisa em Laringologia e Voz. Em: 20º SIICUSP: Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo, 2012, Ribeirão Preto, SP. Anais, 2012.
150.	WANG, JUN ; LONG, MANYUAN ; VIBRANOVSKI, MARIA D.. Retrogenes Moved Out of the Z Chromosome in the Silkworm. Journal of Molecular Evolution. v. 74, p. 113-126, 2012. Qualis: A3
151.	Warren, A. ; Setubal, Joao C. Using Entropy Estimates for DAG-Based Ontologies. Em: 15th Bio-Ontologies Special Interest Group Meeting of ISMB 2012, v. 1, p. 1-6, 2012.Qualis: Não identificado (15th Bio-Ontologies Special Interest Group Meeting of ISMB 2012)
152.	Wattam, A. R. ; INZANA, T. J. ; Williams, K. P. ; Mane, S. P. ; Shukla, M. ; Almeida, N. F. ; Dickerman, A. W. ; MASON, S. ; MORIYON, I. ; O'CALLAGHAN, D. ; WHATMORE, A. M. ; Sobral, B. W. ; Tiller, R. V. ; Hoffmaster, A. R. ; Frace, M. A. ; DE CASTRO, C. ; MOLINARO, A. ; Boyle, S. M. ; De, B. K. ; SETUBAL, J. C. ; et.al. Comparative Genomics of Early-Diverging Brucella Strains Reveals a Novel Lipopolysaccharide Biosynthesis Pathway. MBIO. v. 3, p. e00246-12-e00246-12, 2012. Qualis: A1
153.	WILSON, M. L. ; CAI, Y. ; HANLON, R. ; TAYLOR, S. ; CHEVREUX, B. ; SETUBAL, J. C. ; Tyler, B. M. ; PECCOUD, J.. Sequence verification of synthetic DNA by assembly of sequencing reads. Nucleic Acids Research (Online). v. 41, p. e25-e25, 2012. Qualis: A1
154.	ZARAMELA, L. S. ; WURTMANN, E. ; ten-Caten, F ; Vencio, R. Z. N. ; Baliga, Nitin S ; Koide, Tie. Searching for functional ncRNAs in the archaeon Halobacterium salinarum by genetic perturbation: Lsm chaperone knockout strain transcriptome. 2012. Apresentação de Trabalho/Congresso
155.	ZHANG, DAPENG ; De Souza, Robson F ; Anantharaman, Vivek ; Iyer, Lakshminarayan M ; Aravind, L. Polymorphic toxin systems: Comprehensive characterization of trafficking modes, processing, mechanisms of action, immunity and ecology using comparative genomics. BIOL DIRECT. v. 7, p. 18, 2012. Qualis: Não identificado (BIOL DIRECT)
156.	ZHANG, YONG E. ; LANDBACK, PATRICK ; VIBRANOVSKI, MARIA ; LONG, MANYUAN. New genes expressed in human brains: Implications for annotating evolving genomes. BioEssays (Cambridge). v. 34, p. 982-991, 2012. Qualis: A1
157.	ZPEVAK, FRANCISCO ANTONIO ; PEREZ, SÔNIA CRISTINA JULIANO GÜALTIERI DE ; BUCKERIDGE, MARCOS SILVEIRA. Isothermal seed germination of Adenanthera pavonina. Brazilian Journal of Botany. v. 35, p. 401-408, 2012. Qualis: B1

2011

1.	ABREU, P. S. B. ; PAULSEN, B. D. S. ; REHEN, S. K. ; MACIEL, R. M. ; GALINA, A. ; BONAMINO, M. ; CHICAYBAM, L. ; MARINHO, P. ; MASSUDA, R. ; BRENTANI, H.. Neurogenesis derived from induced pluripotent stem cells from skin biopsy of patients with schizophrenia and normal controls. Em: 24th Congress Meeting of European College of Neuropsychopharmacology, 2011, Paris. European Neuropsychopharmacology, v. 21, p. S525-S525, 2011.
2.	ALVES, J. M. P.; Logan Voegtly ; Andrey V. Matveyev ; Ana M. Lara ; Flávia Maia da Silva ; SERRANO, M. G. ; BUCK, G. A. ; Teixeira, M. M. G. ; Erney P. Camargo. Identification and phylogenetic analysis of heme biosynthesis genes in trypanosomatids and their bacterial endosymbionts. 2011. Apresentação de Trabalho/Comunicação
3.	ALVES, J. M. P.; Logan Voegtly ; Andrey V. Matveyev ; Ana M. Lara ; Flávia Maia da Silva ; Teixeira, M. M. G. ; Erney P. Camargo ; SERRANO, M. G. ; BUCK, G. A.. Full genome and phylogenetic analyses of Kinetoplastibacterium, the bacterial endosymbiont from insect-infecting trypanosomatids. 2011. Apresentação de Trabalho/Comunicação
4.	Alves, João M. P.; Voegtly, Logan ; Matveyev, Andrey V. ; Lara, Ana M. ; da Silva, Flávia Maia ; Serrano, Myrna G. ; Buck, Gregory A. ; Teixeira, Marta M. G. ; Camargo, Erney P.. Identification and Phylogenetic Analysis of Heme Synthesis Genes in Trypanosomatids and Their Bacterial Endosymbionts. Plos One. v. 6, p. e23518, 2011. Qualis: A1
5.	Amorim, Henrique V. ; Lopes, Mário Lucio ; Castro Oliveira, Juliana Velasco ; Buckeridge, Marcos S. ; BUCKERIDGE, M. S. ; Goldman, Gustavo Henrique. Scientific challenges of bioethanol production in Brazil. Applied Microbiology and Biotechnology. v. 91, p. 1267-1275, 2011. Qualis: A2
6.	Amui, Saulo França ; Puga, Renato David ; Martins Soares, Andreimar ; Giuliatti, Silvana. Plant-antivenom: Database of anti-venom medicinal plants. Electronic Journal of Biotechnology. v. 14, p. 1-9, 2011. Qualis: A4
7.	Andrey V. Matveyev ; ALVES, J. M. P. ; Nihar Sheth ; SERRANO, M. G. ; Carly Mayer ; BUCK, G. A.. The new search for the key RNAi system components in a variety of trypanosomatids. 2011. Apresentação de Trabalho/Comunicação
8.	Anghinah, R. ; Kanda, Paulo Afonso Medeiros ; Lopes, Helder Frederico ; Basile, Luis Fernando Hindi ; Machado, Sérgio ; Ribeiro, Pedro ; Velasques, Bruna ; Sameshima, K. ; Takahashi, D. Y. ; Pinto, Lécio Figueira ; Caramelli, P. ; Caramelli, Paulo. Alzheimer's disease qEEG: spectral analysis versus coherence. which is the best measurement?. Arquivos de Neuro-Psiquiatria (Impresso). v. 69, p. 871-874, 2011. Qualis: B2
9.	ARAUJO, G. ; LERNER, R. ; BRENTANI, H. ; SATO, F. ; SANTOS, L. S. ; HOFFMANN, C.. Resultados iniciais de estudo sobre o desenvolvimento de irmãos de crianças autistas. Em: II Séminaire International Transdisciplinaire sur le bébé compétences du bébé et intervencion précoce ,, 2011, Paris. II Séminaire International Transdisciplinaire sur le bébé compétences du bébé et intervencion précoce, 2011.
10.	ARAUJO, G. ; LERNER, R. ; Brentani, Helena ; SATO, F. ; SANTOS, L. S. ; HOFFMANN, C.. Resultados iniciais de estudo sobre o desenvolvimento de irmãos de crianças autistas. 2011. Apresentação de Trabalho/Seminário
11.	Araujo-Montoya, B.O. ; Rofatto, H.K. ; Tararam, C.A. ; Farias, L.P. ; Oliveira, K.C. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S. ; Wilson, R.A. ; Leite, L.C.C.. Schistosoma mansoni: Molecular characterization of Alkaline Phosphatase and expression patterns across life cycle stages. Experimental Parasitology,. p. 284-291, 2011. Qualis: A4 (EXPERIMENTAL PARASITOLOGY)
12.	Araújo, Luciano V ; Malkowski, Simon ; Braghetto, Kelly R ; Passos-Bueno, Maria R ; Zatz, Mayana ; Pu, Calton ; FERREIRA, JOÃO E. A rigorous approach to facilitate and guarantee the correctness of the genetic testing management in human genome information systems. BMC Genomics. v. 12, p. S13-8, 2011. Qualis: A2
13.	Bando, Silvia Y. ; Alegro, Maryana C. ; Amaro, Edson ; Silva, Alexandre V. ; Castro, Luiz H. M. ; Wen, Hung-Tzu ; Lima, Leandro de A. ; Brentani, Helena ; Brentani, H ; Moreira-Filho, Carlos Alberto. Hippocampal CA3 Transcriptome Signature Correlates with Initial Precipitating Injury in Refractory Mesial Temporal Lobe Epilepsy. Plos One. v. 6, p. e26268, 2011. Qualis: A1
14.	Batista, M.J. ; Giolo, S.R. ; PEREIRA, A. C. ; SOLER, J. M. P.. Mapeamento Genético via Modelos de Simetria em Dados de Trios. Em: XII Escola de Modelos de Regressão, 2011, Fortaleza. Resumos da XII EMR, 2011. Qualis: Não identificado (XII ESCOLA DE MODELOS DE REGRESSÃO, 2011, FORTALEZA. RESUMOS DA XII EMR)
15.	Begnami, Maria D. ; Fregnani, José Humberto T G ; Brentani, Helena ; Torres, Cesar ; Costa, Wilson Luiz ; Montagnini, Andre ; Nonogaki, Suely ; Soares, Fernando A. IDENTIFICATION OF PROTEIN EXPRESSION SIGNATURES IN GASTRIC CARCINOMAS USING CLUSTERING ANALYSIS. Journal of Gastroenterology and Hepatology. v. 27, p. 378-384, 2011. Qualis: A2
16.	Boes, Katie M. ; Goncarovs, Kristina O. ; Thompson, Craig A. ; Halik, Lindsay A. ; Santos, Andrea P. ; Guimaraes, Ana M. S. ; Feutz, Marybeth Miskovic ; Holman, Patricia J. ; Vemulapalli, Ramesh ; Messick, Joanne B.. Identification of a Mycoplasma ovis-like organism in a herd of farmed white-tailed deer (Odocoileus virginianus) in rural Indiana. Veterinary Clinical Pathology. v. 40, p. n/a-n/a, 2011. Qualis: A3
17.	Bogdanove, A. J. ; Koebnik, R. ; Lu, H. ; Furutani, A. ; Angiuoli, S. V. ; Patil, P. B. ; Van Sluys, M.-A. ; Ryan, R. P. ; Meyer, D. F. ; Han, S.-W. ; Aparna, G. ; Rajaram, M. ; Delcher, A. L. ; Phillippy, A. M. ; Puiu, D. ; Schatz, M. C. ; Shumway, M. ; Sommer, D. D. ; Trapnell, C. ; Benahmed, F. ; et.al. Two new complete genome sequences offer insight into host and tissue specificity of plant pathogenic Xanthomonas spp.. Journal of Bacteriology (Print). v. 193, p. 5450-5464, 2011. Qualis: A3
18.	Bousquet, Jean ; Anto, Josep M ; Sterk, Peter J ; Adcock, Ian M ; Chung, Kian ; Roca, Josep ; Agusti, Alvar ; Brightling, Chris ; Cambon-Thomsen, Anne ; Cesario, Alfredo ; Abdelhak, Sonia ; Antonarakis, Stylianos E ; Avignon, Antoine ; Ballabio, Andrea ; Baraldi, Eugenio ; Baranov, Alexander ; Bieber, Thomas ; Bockaert, Joël ; Brahmachari, Samir ; Verjovski-Almeida, S. ; et.al. Systems medicine and integrated care to combat chronic noncommunicable diseases. Genome Medicine. v. 3, p. 43, 2011. Qualis: A1
19.	BRAGHETTO, K. R. ; FERREIRA, J. E. ; VINCENT, J.. Performance Evaluation of Business Processes through a Formal Transformation to SAN.. In:. Em: 8th European Performance Engineering Workshop, p. 42-56, 2011.Qualis: Não identificado (8th European Performance Engineering Workshop)
20.	BRENTANI, H. ; CABALLERO, O. ; CAMARGO, A. ; DASILVA, A. ; DASILVA, W. ; DIASNETO, E ; 11_other_authors ; RIGGINS, G. ; SIMPSON, A. J. ; SOUZA, S. ; STEVENSON, B. ; STRAUSBERG, R. ; TAJARA, E ; Verjovski-Almeida, S. ; AND.HCGP.CGAP.ANNOTATION.CONSORTIUM,. The generation and utilization of a cancer-oriented representation of the human transcriptome by using expressed sequence tags. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. v. 100, p. 13418-13423, 2011. Qualis: A1
21.	BRENTANI, H.; VALLADA, H.. Metodologia para estudos de alterações do DNA em Transtornos Psiquiátricos. Em: Miguel EC, Gentil V, Gattaz WF. (Org.). Clínica `Psiquiátrica. Barueri. : Manole. 2011.p. 2073-2079.
22.	Brentani, Helena; Nakano, Eduardo Y ; Martins, Camila B ; Izbicki, Rafael ; Pereira, Carlos Alberto. Disequilibrium Coefficient: A Bayesian Perspective. Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology. v. 10, p. art.22, 2011. Qualis: B1
23.	BRENTANI. H; VALLADA, H. P.. Aspectos genéticos e epigenéticos do desenvolvimento. Em: Miguel EC, Gentil V, Gattaz WF. (Org.). Clínica Psiquiátrica. Barueri. : Manole. 2011.p. 116-125.
24.	BUCKERIDGE, M. S. Floresta intercalada a plantações de cana reduz emissões de CO2; Árvores seqüestram 17 vezes mais carbono por hectare do que a produção agrícola. Folha de São Paulo, São Paulo, SP. Brasil, p. C11-C11, 17 ago. 2011.
25.	BUCKERIDGE, M. S. Paulo Nogueira-Neto, um ?traidor?. Revista Pesquisa Fapesp, São Paulo, SP. Brasil, p. 94-95, 01 abr. 2011.
26.	BUCKERIDGE, M. S. Antiga, pequena e notável. Revista Pesquisa FAPESP, São Paulo, 01 abr. 2011.
27.	BUCKERIDGE, M. S. Sustainable Bioenergy in Brazil: Problems anda Prospectives. 2011. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
28.	BUCKERIDGE, M. S. Biochemistry for 2nd Generation Biofuels. 2011. Apresentação de Trabalho/Simpósio
29.	BUCKERIDGE, M. S. Immunological approaches to plant cell wall/biomass monitoring and characterization. 2011. Apresentação de Trabalho/Simpósio
30.	BUCKERIDGE, M. S. Understanding carbon metabolism in sugarcane to improve bioethanol production. 2011. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
31.	BUCKERIDGE, M. S. How may plants respond to the Global Climate Changes in the Neotropics?. 2011. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
32.	BUCKERIDGE, M. S.; GOLDMAN, G. H. (Org.). Routes to cellulosic ethanol. 1 ed. Nova Iorque: Springer, 2011. v. 1, p. 263.
33.	Cai, Rongman ; Lewis, James ; Yan, Shuangchun ; Liu, Haijie ; Clarke, Christopher R. ; Campanile, Francesco ; Almeida, Nalvo F. ; Studholme, David J. ; Lindeberg, Magdalen ; Schneider, David ; Zaccardelli, Massimo ; Setubal, Joao C. ; Morales-Lizcano, Nadia P. ; Bernal, Adriana ; Coaker, Gitta ; Baker, Christy ; Bender, Carol L. ; Leman, Scotland ; Vinatzer, Boris A.. The Plant Pathogen Pseudomonas syringae pv. tomato Is Genetically Monomorphic and under Strong Selection to Evade Tomato Immunity. PLoS Pathogens. v. 7, p. e1002130, 2011. Qualis: A1
34.	Cappi, C. ; MARIANI, D. ; SILVA, A. R. ; SHAVITT, R. G. ; Miguel, E. C. ; BRENTANI, H. P.. Identification of Genomic Copy number Variations (CNVs) in Obsessive Compulsive Disorder (OCD). Em: 66th Annual Convention of the Society of Biological Psychiatry, 2011, São Francisco. Biological Psychiatry, v. 69, p. 57S-57S, 2011.
35.	Cardoso-Cruz, H. ; Sameshima, K. ; Lima, D. ; Galhardo, V.. Dynamics of circadian thalamocortical flow of information during a peripheral neuropathic pain condition. Frontiers in Integrative Neuroscience. v. 5, p. 1-19, 2011. Qualis: A2
36.	Carraro, Dirce Maria ; Ferreira, Elisa Napolitano ; Molina, Gustavo de Campos ; Puga, Renato David ; Abrantes, Eduardo Fernandes ; Trapé, Adriana Priscila ; Ekhardt, Bedrich L. ; Nunes, Diana Noronha ; Brentani, Maria Mitzi ; Arap, Wadih ; Pasqualini, Renata ; Brentani, Helena ; Dias-Neto, Emmanuel ; Brentani, Ricardo Renzo. Poly (A)+ Transcriptome Assessment of ERBB2-Induced Alterations in Breast Cell Lines. Plos One. v. 6, p. e21022, 2011. Qualis: A1
37.	Carvalho, A. C. M. ; Bevilacqua, M. C. ; Sameshima, K. ; Costa Filho, O. A.. Auditory neuropathy/auditory dyssynchrony in children with cochlear implants. Brazilian Journal of Otorhinolaryngology (Impresso). v. 77, p. 481-487, 2011. Qualis: B1
38.	CERQUEIRA, C. C. S. ; PAIXAO-CORTES, V. R. ; HÜNEMEIER, T. ; SALZANO, F. M. ; BORTOLINI, M. C.. Análise de Marcadores Genéticos e Predição de Características Físicas: o caso do Homo neandertalensis e do espécime Denisova. Em: II Jornada Internacional de Genética Forense, 2011, Porto Alegre. II Jornada Internacional de Genética Forense, 2011.
39.	CHEN, MING ; ZOU, MING ; FU, BEIDE ; LI, XIN ; VIBRANOVSKI, MARIA D. ; GAN, XIAONI ; WANG, DENGQIANG ; WANG, WEN ; LONG, MANYUAN ; HE, SHUNPING. Evolutionary Patterns of RNA-Based Duplication in Non-Mammalian Chordates. Plos One. v. 6, p. e21466, 2011. Qualis: A1
40.	CHEN, Z. ; ZHANG, Y. ; VIBRANOVSKI, M. D. ; LUO, J. ; GAO, G. ; LONG, M.. Deficiency of X-Linked Inverted Duplicates with Male-Biased Expression and the Underlying Evolutionary Mechanisms in the Drosophila Genome. Molecular Biology and Evolution. v. 28, p. 2823-2832, 2011. Qualis: A1
41.	COLLEN, J. ; COLLEN, P. N. ; REIS, Marcelo da Silva ; PEDERSEN, M. ; SETUBAL, J. C. ; Varani, A. ; Colepicolo, P. ; OLIVEIRA, Mariana Cabral de. Analysis of expressed sequence tags from the agarophyte Gracilaria tenuistipitata (Rhodophyta). Journal of Applied Phycology. v. 24, p. 641-647, 2011. Qualis: A2
42.	Contini V ; BERTUZZI, G. P. ; Polina, Evelise R ; HÜNEMEIER, T. ; Hendler, Elisa M ; Hutz, M. ; Bau, CD. A haplotype analysis is consistent with the role of functional HTR1B variants in alcohol dependence. Drug and Alcohol Dependence. v. 00, p. 00000-00000, 2011. Qualis: A1
43.	De Almeida-Neto, Cesar ; Liu, Jing ; Wright, David J. ; Mendrone-Junior, Alfredo ; Takecian, Pedro L. ; Sun, Yu ; Ferreira, Joao Eduardo ; de Alencar Fischer Chamone, Dalton ; Busch, Michael P. ; Sabino, Ester Cerdeira ; FOR THE NHLBI RETROVIRUS EPIDEMIOLOGY DONOR STUDY-II (REDS-II), INTERNATIONAL COMPONENT. Demographic characteristics and prevalence of serologic markers among blood donors who use confidential unit exclusion (CUE) in São Paulo, Brazil: implications for modification of CUE polices in Brazil. Transfusion (Arlington, Va.). v. 51, p. 191-197, 2011. Qualis: A3
44.	DENTILLO, D. B. ; MEOLA, J. ; ROSA E SILVA, J. C. ; MELATO, L. C. ; BARBUZANO, F. G. ; PINHEIRO, D. G. ; SILVA JUNIOR, W. A. ; GIULIATTI, S ; FERRIANI, R. A. ; MARTELLI, L. R.. Triagem de Genes relacionados a Câncer em Pacientes com Endometriose. Em: 8º ENDOFEMININA: Encontro de Endocrinologia Feminina, 2011, Porto Alegre, 2011.
45.	DENTILLO, D. B. ; MEOLA, J. ; ROSA E SILVA, J. C. ; MELATO, L. C. ; BARBUZANO, F. G. ; PINHEIRO, D. G. ; SILVA JUNIOR, W. A. ; GIULIATTI, S ; FERRIANI, R. A. ; MARTELLI, L. R.. Triagem de Genes Relacionados a Câncer em Pacientes com Endometriose. 2011. Apresentação de Trabalho/Outra
46.	DIAS, Z. ; DIAS, U. M. ; Setubal, Joao C.. Using inversion signatures to generate draft genome sequence scaffolds. Em: ACM Interantional Conference on Bioinformatics, 2011.Qualis: Não identificado (ACM Interantional Conference on Bioinformatics)
47.	DOMINGUES, H. ; Kon, F ; FERREIRA, J. E.. Asynchronous Replication for Evolutionary Database Development: A Design for the Experimental Assessment of a Novel Approach. Em: OnTheMove Federated Conferences - ODBASE, v. II, p. 816-823, 2011.Qualis: Não identificado (OnTheMove Federated Conferences - ODBASE)
48.	dos Santos, W.D ; Gómez, E.O. ; BUCKERIDGE, M. S.. Bioenergy and the sustainable revolution. Em: Marcos S Buckeridge;Gustavo H Goldman. (Org.). Routes to Cellulosic Ethanol. 1ed.Nova Iorque. : Springer. 2011.p. 15-26.
49.	Duraiswamy, J. ; Ibegbu, C. C. ; Masopust, D. ; Miller, J. D. ; Araki, K. ; Doho, G. H. ; Tata, P. ; Gupta, S. ; Zilliox, M. J. ; NAKAYA, H. I. ; Pulendran, B. ; Haining, W. N. ; Freeman, G. J. ; Ahmed, R.. Phenotype, Function, and Gene Expression Profiles of Programmed Death-1hi CD8 T Cells in Healthy Human Adults. The Journal of Immunology (1950). v. 186, p. 4200-4212, 2011. Qualis: A1
50.	FARIA JUNIOR, S. R. ; Silva, R.R. ; Giolo, S.R. ; Leandro, R.A. ; Garcia, A.A.F. ; SOLER, J. M. P.. Genotipagem de SNPs em Populações Poliplóides. Em: 56a Reunião Anual da Região Brasileira da Sociedade de Biometria e 14o Simpósio de Estatística Aplicada à Experimentação Agronômica, 2011, Maringá. 56a RBRAS e 14o SEAGRO, 2011.
51.	Farias, Leonardo P. ; Tararam, Cibele A. ; Miyasato, Patricia A. ; Nishiyama, Milton Y. ; Oliveira, Katia C. ; KAWANO, Toshie ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; Leite, Luciana Cezar de Cerqueira. Screening the Schistosoma mansoni transcriptome for genes differentially expressed in the schistosomulum stage in search for vaccine candidates. Parasitology Research (1987. Print). v. 108, p. 123-135, 2011. Qualis: Não identificado (PRINT))
52.	Fettweis, J.M. ; Alves, J. M. ; Borzelleca, J.F. ; Brooks, J.P. ; Christopher J. Friedline ; Yuan Gao ; Xi Gao ; Girerd, Philippe H ; Michael D. Harwich ; Stephanie L. Hendricks ; Kimberly K. Jefferson ; Vladimir Lee ; Michael C. Neale ; Federico A. Puma ; Mark A. Reimers ; Maria C. Rivera ; Seth B. Roberts ; SERRANO, M. G. ; Nihar Sheth ; Judy L. Silberg ; et.al. The Vaginal Microbiome: Disease, Genetics and the Environment. Nature Publishing Group. 2011. Marker paper
53.	Freire, M. A.M. ; Morya, E. ; Fabre, J. ; Santos, J. R. ; Guimaraes, J. S. ; Lemos, A.M.N. ; Sameshima, K. ; Pereira, A. ; Ribeiro, S. ; Nicolelis, M. A. L.. Comprehensive Analysis of Tissue Preservation and Recording Quality from Chronic Multielectrode Implants. Plos One. v. 6, p. e27554, 2011. Qualis: A1
54.	Garsmeur, Olivier ; Charron, Carine ; Bocs, Stéphanie ; Jouffe, Vincent ; Samain, Sylvie ; Couloux, Arnaud ; Droc, Gaëtan ; Zini, Cyrille ; Glaszmann, Jean-Christophe ; Van Sluys, Marie-Anne ; D¿Hont, Angélique. High homologous gene conservation despite extreme autopolyploid redundancy in sugarcane. New Phytologist (Print). v. 189, p. 629-642, 2011. Qualis: A1
55.	Gazarini, Marcos L. ; Beraldo, Flávio H. ; Almeida, Fabiana M. ; Bootman, Martin ; da Silva, Aline M. ; Garcia, Célia R. S.. Melatonin triggers PKA activation in the rodent malaria parasite Plasmodium chabaudi. Journal of Pineal Research. v. 50, p. 64-70, 2011. Qualis: A1
56.	Genick, U. K. ; Kutalik, Z. ; Ledda, M. ; Destito, M. C. S. ; Cirillo, C. A. ; Godinot, N. ; Martin, N. ; Morya, E. ; Sameshima, K. ; Bergmann, S. ; Le Coutre, J.. Sensitivity of Genome-Wide-Association Signals to Phenotyping Strategy: The PROP-TAS2R38 Taste Association as a Benchmark. Plos One. v. 6, p. e27745, 2011. Qualis: A1
57.	Giolo, S.R. ; SOLER, J. M. P. ; Batista, M.J. ; ALMEIDA, M. A. A. ; Pereira, A.C.. Evidence of SNP effect on the risk of rheumatoid arthritis: effects of covariate adjustment upon association results. Revista Brasileira de Biometria. v. 29, p. 47-59, 2011.Qualis: C
58.	GIOLO, SUELY R ; SOLER, JÚLIA M P ; GREENWAY, STEVEN C ; ALMEIDA, MARCIO A A ; DE ANDRADE, MARIZA ; SEIDMAN, J G ; SEIDMAN, CHRISTINE E ; KRIEGER, JOSÉ E ; PEREIRA, ALEXANDRE C. Brazilian urban population genetic structure reveals a high degree of admixture. European Journal of Human Genetics. v. 20, p. 111-116, 2011. Qualis: A3
59.	GOMES, E. S. ; SCHUCH, V. ; PADILLA, G. ; KISHI, L. T. ; GIULIATTI, S ; LEMOS, E. G. M.. In Silico Prediction of Novel Genes from Metagenomic Aromatic PKS. Em: 4th Congress of European Microbiologists, 2011, Genebra. Abstracts, 2011.
60.	Grazziotin, Ana Laura ; Santos, Andrea Pires ; Guimaraes, Ana Marcia Sa ; Mohamed, Ahmed ; Cubas, Zalmir Silvino ; Oliveira, Marcos Jose de ; Santos, Leonilda Correia dos ; de Moraes, Wanderlei ; Vieira, Rafael Felipe da Costa ; Donatti, Lucelia ; Filho, Ivan Roque de Barros ; Biondo, Alexander Welker ; Messick, Joanne Belle. Mycoplasma ovis in captive cervids: prevalence, molecular characterization and phylogeny. Veterinary Microbiology (Amsterdam. Print),. p. 1, 2011. Qualis: Não identificado (PRINT),)
61.	GRAZZIOTTIN, A. L. ; DUARTE, J. M. B. ; SZABO, M. P. J. ; Santos, A.P. ; GUIMARAES, A. M. S. ; Mohamed, Ahmed ; Vieira, Rafael F.C. ; BARROS FILHO, I. R. ; BIONDO, A. W. ; Messick, J.B.. Prevalence and molecular characterization of Mycoplasma ovis in selected free-ranging Brazilian deer populations. Journal of Wildlife Diseases. v. 47, p. 1005-1011, 2011.Qualis: A3
62.	GUIMARAES, A. M. S.; Santos, A. P. ; SanMiguel, Phillip ; Walter, Thomas ; Timenetsky, Jorge ; Messick, Joanne B.. Mycoplasma suis: the Genome of an Uncultivable Hemotropic Bacteria. Em: ASM Conference, 2011, New Orleans. ASM Abstracts, 2011.
63.	Guimaraes, A.M.S.; Vieira, R.F.C. ; Poletto, R. ; VEMULAPALLI, R. ; Santos, A.P. ; de Moraes, W. ; Cubas, Z.S. ; Santos, L.C. ; Marchant-Forde, J.N. ; TIMENETSKY, J. ; Biondo, A.W. ; Messick, J.B.. A quantitative TaqMan PCR assay for the detection of Mycoplasma suis. Journal of Applied Microbiology (Print),. p. no-no, 2011. Qualis: A3 (JOURNAL OF APPLIED MICROBIOLOGY)
64.	Guimaraes, Ana M. S.; Santos, Andrea P. ; SanMiguel, Phillip ; Walter, Thomas ; Timenetsky, Jorge ; Messick, Joanne B.. Complete Genome Sequence of Mycoplasma suis and Insights into Its Biology and Adaption to an Erythrocyte Niche. Plos One. v. 6, p. e19574, 2011. Qualis: A1
65.	Hamilton, T. L. ; LUDWIG, M. ; DIXON, R. ; Boyd, E. S. ; dos SANTOS, P. C. ; SETUBAL, J. C. ; BRYANT, D. A. ; Dean, D. R. ; PETERS, J. W.. Transcriptional Profiling of Nitrogen Fixation in Azotobacter vinelandii. Journal of Bacteriology (Print). v. 193, p. 4477-4486, 2011. Qualis: A3
66.	Higa, Carlos HA ; Louzada, Vitor HP ; Andrade, Tales P ; Hashimoto, Ronaldo F. Constraint-based analysis of gene interactions using restricted boolean networks and time-series data. BMC Proceedings. v. 5, p. S5, 2011. Qualis: Não identificado (BMC PROCEEDINGS)
67.	HORIMOTO, ANDREA R V R ; GIOLO, SUELY R ; OLIVEIRA, CAMILA M ; ALVIM, RAFAEL O ; SOLER, JULIA P ; DE ANDRADE, MARIZA ; KRIEGER, JOSE E ; PEREIRA, ALEXANDRE C. Heritability of physical activity traits in Brazilian families: the Baependi Heart Study. BMC Medical Genetics (Online). v. 12, p. 155, 2011. Qualis: A4
68.	Italiani, VCS ; KOIDE, T.. Detection of non-coding RNas in the halophilic archaeon Halobacterium salinarum. 2011. Apresentação de Trabalho/Congresso
69.	JACINTO, DANIELE S. ; MUNIZ, HELOISA DOS SANTOS ; Venancio, Thiago M. ; Wilson, R. Alan ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; DEMARCO, Ricardo. Curupira-1 and Curupira-2, two novel Mutator-like DNA transposons from the genomes of human parasites Schistosoma mansoni and Schistosoma japonicum. Parasitology (London. Print). v. 138, p. 1124-1133, 2011. Qualis: Não identificado (PRINT))
70.	Jalan, N. ; Aritua, V. ; Kumar, D. ; Yu, F. ; Jones, J. B. ; Graham, J. H. ; SETUBAL, J. C. ; Wang, N.. Comparative Genomic Analysis of Xanthomonas axonopodis pv. citrumelo F1, Which Causes Citrus Bacterial Spot Disease, and Related Strains Provides Insights into Virulence and Host Specificity. Journal of Bacteriology (Print). v. 193, p. 6342-6357, 2011. Qualis: A3
71.	JORGE, D. M. M. ; SILVA, V. B. ; SILVA, C. H. T. P. ; GIULIATTI, S. In Silico Screening for Phospholipase A2 of Apis Mellifera with Diverset Library. Em: Computer Aided Drug Design, 2011, West Dover, Vermont. Poster Presentation, p. 1-1, 2011.
72.	Kasturi, Sudhir Pai ; Skountzou, Ioanna ; Albrecht, Randy A. ; Koutsonanos, Dimitrios ; Hua, Tang ; Nakaya, Helder I. ; Ravindran, Rajesh ; Stewart, Shelley ; Alam, Munir ; Kwissa, Marcin ; Villinger, Francois ; Murthy, Niren ; Steel, John ; Jacob, Joshy ; Hogan, Robert J. ; García-Sastre, Adolfo ; Compans, Richard ; Pulendran, Bali. Programming the magnitude and persistence of antibody responses with innate immunity. Nature (London). v. 470, p. 543-547, 2011. Qualis: A1
73.	KOIDE, T. Desvendando a complexidade do transcritoma: em busca de modelos mecanísticos. 2011. Apresentação de Trabalho/Seminário
74.	KOIDE, T. Biologia Sistêmica: desvendando a complexidade do transcriptoma. 2011. Apresentação de Trabalho/Seminário
75.	KOIDE, T. Vivendo no limite: biologia molecular de extremófilos. 2011. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
76.	KOIDE, T. Desvendando a complexidade do transcritoma em procariotos. 2011. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
77.	KOIDE, T. Unraveling the transcriptome complexity in prokaryotes. 2011. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
78.	KOIDE, T. Desvendando a complexidade do transcritoma em procariotos. 2011. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
79.	LEITE, D.C.C. ; GRANDIS, A. ; SOUZA, A. P. ; PATTATHI, S. ; HAHN, M.G. ; BUCKERIDGE, M. S.. Characterisation of th cell walls from roots of sugarcane: a first step to achieve 2nd generation bioethanol using plant cell wall degradation mechanisms. 2011. Apresentação de Trabalho/Congresso
80.	Lima, F. A. ; Moreira-Filho, C. A. ; Ramos, P. L. ; BRENTANI, H. ; Lima, L. d. A. ; Arrais, M. ; Bento-de-Souza, L. C. ; Bento-de-Souza, L. ; Duarte, M. I. ; Coutinho, A. ; Carneiro-Sampaio, M.. Decreased AIRE Expression and Global Thymic Hypofunction in Down Syndrome. The Journal of Immunology (1950). v. 187, p. 3422-3430, 2011. Qualis: A1
81.	LIMA, L. A. ; Puga, Renato David ; Brentani, H. Interactomegraf: a free Web tool to improve the interactome databases analysis. 2011. Apresentação de Trabalho/Congresso
82.	LOUZADA, V. H. P. ; LOPES, F. M. ; HASHIMOTO, R. F.. The effect of certain Boolean functions in stability of networks with varying topology. Em: 9th IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics (GENSIPS), p. 1-4, 2011. Qualis: Não identificado (9th IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics (GENSIPS))
83.	Manque, P. A. ; Fernando A. Tenjo ; Ute Woehlbier ; Ana M. Lara ; SERRANO, M. G. ; XU, P. ; Alves, Joao M ; Ronald Smeltz ; Daniel Conrad ; BUCK, G. A.. Identification and immunological characterization of three potential vaccinogens against Cryptosporidium. Clinical and Vaccine Immunology. v. 18, p. 1796-1802, 2011. Qualis: A3
84.	Manque, P. A. ; Probst, C. ; PEREIRA, M. C. S. ; RAMPAZZO, R. C. P. ; OZAKI, L. S. ; PAVONI, D. P. ; Silva Neto, D. T. ; CARVALHO, M. R. ; XU, P. ; SERRANO, M. G. ; ALVES, J. M. P. ; Meirelles, M. d. N. S. L. ; GOLDENBERG, S. ; KRIEGER, M. A. ; BUCK, G. A.. Trypanosoma cruzi Infection Induces a Global Host Cell Response in Cardiomyocytes. Infection and Immunity (Print). v. 79, p. 1855-1862, 2011. Qualis: A2
85.	Marques, Fernanda ; Sousa, João C ; Coppola, Giovanni ; Gao, Fuying ; Puga, Renato ; Brentani, Helena ; Geschwind, Daniel H ; Sousa, Nuno ; Correia-Neves, Margarida ; Palha, Joana A. Transcriptome signature of the adult mouse choroid plexus. Fluids and Barriers of the CNS. v. 8, p. 10, 2011. Qualis: A3
86.	Marques, L.M. ; BUZINHANI, M. ; Guimaraes, A.M.S. ; Marques, R.C.P. ; Farias, S.T. ; Neto, R.L. ; YAMAGUTI, M. ; Oliveira, R.C. ; TIMENETSKY, J.. Intraspecific sequence variation in 16S rRNA gene of Ureaplasma diversum isolates. Veterinary Microbiology (Amsterdam. Print),. p. 2, 2011. Qualis: Não identificado (PRINT),)
87.	Maschietto, M ; Trapé, A P ; Piccoli, F S ; Ricca, T I ; Dias, A A M ; Coudry, R A ; Galante, P A ; Torres, C ; Fahhan, L ; Lourenço, S ; Grundy, P E ; de Camargo, B ; de Souza, S ; Neves, E J ; Soares, F A ; Brentani, H ; Carraro, D M. Temporal blastemal cell gene expression analysis in the kidney reveals new Wnt and related signaling pathway genes to be essential for Wilms' tumor onset. CELL DEATH DIS. v. 2, p. e224, 2011. Qualis: Não identificado (CELL DEATH DIS)
88.	Maschietto, Mariana ; Piccoli, Fabio S. ; Costa, Cecilia M.L. ; Camargo, Luiz P. ; Neves, Jose I. ; Grundy, Paul E. ; Brentani, Helena ; Soares, Fernando A. ; Camargo, Beatriz de ; Carraro, Dirce M.. Gene expression analysis of blastemal component reveals genes associated with relapse mechanism in Wilms tumour. European Journal of Cancer. v. 47, p. 2715-2722, 2011. Qualis: A1
89.	Massaroppe, L. ; Baccalá, L. A. ; Sameshima, K.. Semiparametric detection of nonlinear causal coupling using partial directed coherence. Em: 33rd Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, p. 5927-5930, 2011. Qualis: Não identificado (33rd Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society)
90.	Mayworm, M.A.S., ; BUCKERIDGE, M. S. ; Marquez, U.M.L. ; Salatino A. Nutritional reserves of Vochysiaceae seeds: chemical diversity and potential economic uses. Anais da Academia Brasileira de Ciências (Impresso). v. 83, p. 523-531, 2011. Qualis: A2
91.	MESSICK, J. B. ; Santos, A. P. ; GUIMARAES, A. M. S.. Complete Genome Sequences of Two Hemotropic Mycoplasmas, Mycoplasma haemofelis Strain Ohio2 and Mycoplasma suis Strain Illinois. Journal of Bacteriology (Print). v. 193, p. 2068-2069, 2011. Qualis: A3
92.	MESSICK, J. B. ; SANTOS, A. P. ; GUIMARÃES, A. M. S. ; NASCIMENTO, N. C.. From their genomes, the hemoplasmas speak. 2011. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
93.	NAKAYA, H. I. Teste diz se vacina da gripe funcionou após uma semana. Folha de S. Paulo, 13 jul. 2011.
94.	NAKAYA, H. I. Pesquisa de brasileiro pode prever eficácia de vacina contra gripe. Diário Oficial da União. Seção 3 (Online), 12 jul. 2011.
95.	Nakaya, Helder I. (XIII Reunião Científica Annual @ Instituto Butantan) Palestra: Systems Vaccinology: Learning to compute the behavior of vaccine induced immunity. 2011. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
96.	Nakaya, Helder I. (Human Immunology Project Consortium @ Stanford University) Palestra: MicroRNA signatures of vaccination in humans. 2011. Apresentação de Trabalho/Simpósio
97.	Nakaya, Helder I. (ISMB @ Vienna, Austria) Poster: Systems biology analysis of vaccination for seasonal influenza in humans. 2011. Apresentação de Trabalho/Congresso
98.	Nakaya, Helder I. (2nd HIPC bioinformatics meeting @ Yale University) Palestra: Systems Vaccinology: Learning to compute the behavior of vaccine induced immunity. 2011. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
99.	Nakaya, Helder I.; Li, Shuzhao ; Pulendran, Bali. Systems vaccinology: learning to compute the behavior of vaccine induced immunity. WIRES SYST BIOL MED. v. 19, p. n/a-n/a, 2011. Qualis: Não identificado (WIRES SYST BIOL MED)
100.	Nakaya, Helder I; Wrammert, Jens ; Lee, Eva K ; Racioppi, Luigi ; Marie-Kunze, Stephanie ; Haining, W Nicholas ; Means, Anthony R ; Kasturi, Sudhir P ; Khan, Nooruddin ; Li, Gui-Mei ; McCausland, Megan ; Kanchan, Vibhu ; Kokko, Kenneth E ; Li, Shuzhao ; Elbein, Rivka ; Mehta, Aneesh K ; Aderem, Alan ; Subbarao, Kanta ; Ahmed, Rafi ; Pulendran, Bali ; et.al. Systems biology of vaccination for seasonal influenza in humans. Nature Immunology (Print). v. 12, p. 786-795, 2011. Qualis: A1
101.	NASCIMENTO, N. C. ; Santos, A.P. ; GUIMARAES, A. M. S. ; BREUR, J. B. ; MESSICK, J. B.. PCR detection of Mycoplasma ovis and ' Candidatus Mycoplasma haemovis' in sheep. Em: 46th ACVP/ASVCP Combined Annual Meeting, 2011, Nashville, TN. Veterinary Clinical Pathology, v. 40, p. 16-16, 2011.
102.	NICOLAU JUNIOR, N. ; JUNTA, C. M. ; GIULIATTI, S. Macromolecular Modeling of the E7 Protein from the Human Papillomavirus Type 16 (HPV16). Em: II Workshop e Reunião dos 40 Anos do Programa de Pós-Graduação em Genética, 2011, Ribeirão Preto, SP. Anais, p. 1-1, 2011.
103.	NORONHA, M. F. ; NETTO, O. V. C. ; CARAZZOLLE, M. F. ; PEREIRA, G. A. G. ; HASHIMOTO, R. F.. Comparison of Boolean Networks from Yeast Strain on Fermentative Process. Em: 7th Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology (X-Meeting), 2010, Florianópolis. 7th Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology (X-Meeting 2011), 2011.
104.	Oliveira, K. C. ; Nery, F. G. ; Ferreti, R. E. L. ; Lima, M. C. ; Cappi, C. ; MACHADO-LIMA, A. ; Polichiso, L. ; Carreira, L. L. ; Ávila, C. ; Alho, A. T. D. L. ; BRENTANI, H. P. ; Miguel, E. C. ; Heinsen, H. ; Jacob-Filho, W. ; Pasqualucci, C. A. ; Lafer, B. ; Grinberg, L. T.. Brazilian psychiatric brain bank: a new contribution tool to network studies. Cell and Tissue Banking. v. 13, p. 315-326, 2011. Qualis: A4
105.	Oliveira, Katia C. ; Carvalho, Mariana L. P. ; Maracaja-Coutinho, V. ; KITAJIMA, J. P. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S.. Non-coding RNAs in schistosomes: an unexplored world. Anais da Academia Brasileira de Ciências (Impresso). v. 83, p. 673-694, 2011. Qualis: A2
106.	ONUCHIC, V. ; Durham, Alan Mitchell. Using gene prediction models in order to improve the quality of multiple sequence alignments of homologous genes. 2011. Apresentação de Trabalho/Outra
107.	PALACIOS JARA, C.E. ; GRANDIS, A. ; BUCKERIDGE, M. S. ; Salatino A. Efeito do aumento de temperatura e concentração de CO2, sob a composição química dos grãos de soja (Glycine Max (L.) Merrill). 2011. Apresentação de Trabalho/Congresso
108.	PAULSEN, B. D. S. ; MACIEL, R. M. ; GALINA, A. ; SILVEIRA, M. S. ; SOUZA, C. S. ; DRUMMOND, H. ; POZZATTO, E. N. ; SILVA JUNIOR, H. ; CHICAYBAM, L. ; MASSUDA, R. ; SETTI-PERDIGAO, P. ; BONAMINO, M. ; ABREU, P. S. B. ; CASTRO, N. G. ; BRENTANI, H. ; REHEN, S. K.. Altered oxygen metabolism associated to neurogenesis of induced pluripotent stem cells derived from a schizophrenic patient. Cell Transplantation. v. XXX, p. XXX-XXX, 2011. Qualis: A2
109.	PINTO, B. J. ; GIULIATTI, S.. ProGen AP: a Pipeline for the Automatic Proteogenomic Annotation to AID in the Discovery of new Potential Genes for Biotechnological Intervention Applied to Health. Em: II Workshop e Reunião dos 40 Anos do Programa de Pós-Graduação em Genética, 2011, Ribeirão Preto, SP. Anais, 2011.
110.	PINTO, B. J. ; PEREIRA-FACA, S. R. ; FACA, V. M. ; GIULIATTI, S. ProGen AP: a Pipeline for the Automatic Proteogenomic Annotation to Aid in the Discovery of new Potential Genes for Biotechnological Intervention Applied to Health. Em: 7th International Conference ofth Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology -X-Meeting, 2011, Florianópolis, SC. Abstract Book, v. 1, p. 224-224, 2011.
111.	PIOVEZANI, A. ; BASTOS, E. P. ; BRENTANI, M. M. ; BRENTANI. H ; MACHADO-LIMA, A.. Target prediction of mirna in breast cancer. 2011. Apresentação de Trabalho/Congresso
112.	Potnis, Neha ; Krasileva, Ksenia ; Chow, Virginia ; Almeida, Nalvo F ; Patil, Prabhu B ; Ryan, Robert P ; Sharlach, Molly ; Behlau, Franklin ; Dow, J Max ; Momol, MT ; White, Frank F ; Preston, James F ; Vinatzer, Boris A ; Koebnik, Ralf ; Setubal, João C ; Norman, David J ; Staskawicz, Brian J ; Jones, Jeffrey B. Comparative genomics reveals diversity among xanthomonads infecting tomato and pepper. BMC Genomics. v. 12, p. 146, 2011. Qualis: A2
113.	RODRIGUES, M. G. F. ; MARTINS, A. B. G. ; GIULIATTI, S. Search for Methylation-Sensitive Amplification Polymorphisms in Selections of Mutants Figs (Ficus carica L.). Em: II Workshop e Reunião dos 40 Anos do Programa de Pós-Graduação em Genética, 2011, Ribeirão Preto, SP. Anais, p. 1-1, 2011.
114.	RODRIGUEZ, R. M. ; HASHIMOTO, R. F.. Combining Dialectical Optimization and Gradient Descent Methods for Improving the Accuracy of Straight Line Segment Classifiers. Em: 24th SIBGRAPI Conference on Graphics, p. 321-328, 2011. Qualis: Não identificado (24th SIBGRAPI Conference on Graphics)
115.	Ryan, Robert P. ; Vorhölter, Frank-Jörg ; Potnis, Neha ; Jones, Jeffrey B. ; Van Sluys, Marie-Anne ; Bogdanove, Adam J. ; Dow, J. Maxwell. Pathogenomics of Xanthomonas: understanding bacterium¿plant interactions. Nature Review, Microbiology (Print). v. 9, p. 344-355, 2011. Qualis: A1
116.	Sameshima, K.; Morya, E.. Estado da arte na tecnologia da neuroprótese. Em: Sandra Regina Schewinsky; Cristianne Akie Kawamoto; Flávia Rodrigo Xavier Pires Cichon; Francisco Nogueira de Oliveira Filho; Linamara Rizzo Battistella. (Org.). Atrofia de Mútliplos Sistemas: Neurologia e Reabilitação. São Paulo. : Livraria Médica Paulista Editora Ltda. 2011.p. 255-270.
117.	SANTOS, A. C. F. ; SILVA, A. R. ; Grinberg, L. T. ; FARFEL, J. M. ; FERRETTI, R. E. ; Jacob-Filho, W. ; CARRARO, D. M. ; BRENTANI, H. P.. Differences in Gene Expression with Normal Elderly individuals and Symptomatic or Asymptomatic Alzheimer Disease, Suggest a Neuropathological Expression Pattern. Em: 66th Annual Convention of the Society of Biological Psychiatry, 2011, São Francisco. Biological Psychiatry, v. 69, p. 31S-31S, 2011.
118.	Santos, Andrea P ; Guimaraes, Ana MS ; do Nascimento, Naila C ; SanMiguel, Phillip J ; Martin, Samuel W ; Messick, Joanne B. Genome of Mycoplasma haemofelis, unraveling its strategies for survival and persistence. Veterinary Research. v. 42, p. 102, 2011. Qualis: A1
119.	Santos, Rosângela Portilho Costa ; Benvenuti, Ticiana Thomazine ; Honda, Suzana Terumi ; Valle, Paulo Roberto ; Katayama, Maria Lucia Hirata ; Brentani, Helena Paula ; Carraro, Dirce Maria ; Rozenchan, Patrí ; Brentani, Maria Mitzi ; Lyra, Eduardo Carneiro ; Torres, César Henrique ; Salzgeber, Marcia Batista ; Kaiano, Jane Haruko Lima ; Góes, João Carlos Sampaio ; Folgueira, Maria Aparecida Azevedo Koike. Influence of the interaction between nodal fibroblast and breast cancer cells on gene expression. Tumor Biology. v. 32, p. 145-157, 2011. Qualis: A4
120.	Schlesinger, D ; Grinberg, L T ; Alba, J G ; Naslavsky, M S ; Licinio, L ; Farfel, J M ; Suemoto, C K ; de Lucena Ferretti, R E ; Leite, R E P ; de Andrade, M P ; dos Santos, A C F ; Brentani, H ; Pasqualucci, C A ; Nitrini, R ; Jacob-Filho, W ; Zatz, M. African ancestry protects against Alzheimer's disease-related neuropathology. Molecular Psychiatry. v. 18, p. 79-85, 2011. Qualis: A1
121.	Setta, Nathalia ; Sluys, Marie-Anne ; Capy, Pierre ; Carareto, Claudia Marcia Aparecida. Copia Retrotransposon in the Zaprionus Genus: Another Case of Transposable Element Sharing with the Drosophila melanogaster Subgroup. Journal of Molecular Evolution. v. 72, p. 326-338, 2011. Qualis: A3
122.	SILVA, A. R. ; Grinberg, L. T. ; FARFEL, J. M. ; FERRETTI, R. E. ; ROCHA, R. M. ; BRENTANI, H.. Evaluation of Cdk5 Expression pattern in Symptomatic and Asymtomatic Alzheimer´s Disease and Normal Elderly individuals. Em: 66th Annual Convention of the Society of Biological Psychiatry, 2011, São Francisco. Biological Psychiatry, v. 69, p. 31S-32S, 2011.
123.	Silva, Giovanna B. ; Ionashiro, Mari ; Carrara, Thalita B. ; Crivellari, Augusto C. ; Tine, M. A. S. ; Prado, Jefferson ; Carpita, Nicholas C. ; BUCKERIDGE, MARCOS S.. Cell wall polysaccharides from fern leaves: Evidence for a mannan-rich Type III cell wall in Adiantum raddianum. Phytochemistry. v. 72, p. 2352-2360, 2011. Qualis: A2
124.	SILVA, T. M. ; ALMEIDA, M. R. ; POPPI, R. J. ; TORRES, T.T. ; OTTOBONI, LMM. Estudo por Espectroscopia Raman de Alterações Metabólicas em Acidithiobacillus ferrooxidans na Presença de NaCl. Em: 26o Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2011, Foz do Iguaçu, PR. Anais do 26o Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2011.
125.	Sousa, C.R. ; SOUZA, A. P. ; GRANDIS, A. ; BUCKERIDGE, M. S.. Carbohydrate dissassemble of sugarcane straw in the Field. 2011. Apresentação de Trabalho/Congresso
126.	SOUZA, GLAUCIA MENDES ; BERGES, HELENE ; BOCS, STEPHANIE ; CASU, ROSANNE ; D'HONT, ANGELIQUE ; FERREIRA, JOÃO EDUARDO ; HENRY, ROBERT ; Ming, Ray ; POTIER, BERNARD ; Sluys, Marie-Anne ; VINCENTZ, Michel ; PATERSON, ANDREW H.. The Sugarcane Genome Challenge: Strategies for Sequencing a Highly Complex Genome. Tropical Plant Biology (Online). v. 4, p. 145-156, 2011. Qualis: A3
127.	Staquicini, F. I. ; Cardo-Vila, M. ; Kolonin, M. G. ; Trepel, M. ; Edwards, J. K. ; Nunes, D. N. ; Sergeeva, A. ; Efstathiou, E. ; Sun, J. ; Almeida, N. F. ; Tu, S.-M. ; Botz, G. H. ; Wallace, M. J. ; O'Connell, D. J. ; Krajewski, S. ; Gershenwald, J. E. ; Molldrem, J. J. ; Flamm, A. L. ; Koivunen, E. ; SETUBAL, J. C. ; et.al. Vascular ligand-receptor mapping by direct combinatorial selection in cancer patients. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. v. 108, p. 1-6, 2011. Qualis: A1
128.	Tahira, Ana C ; Kubrusly, Márcia S ; Faria, Michele F ; Dazzani, Bianca ; Fonseca, Rogério S ; Maracaja-Coutinho, Vinicius ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; Machado, Marcel CC ; REIS, Eduardo M. Long noncoding intronic RNAs are differentially expressed in primary and metastatic pancreatic cancer. Molecular Cancer. v. 10, p. 141, 2011. Qualis: A1
129.	Trape, A. P. ; KATAYAMA, M. L. H. ; ROELA, R. A. ; BRENTANI, H. ; Ravacci, G. R. ; Lima, L. A. ; BRENTANI, M. M.. Gene expression profile in response to doxorubicin-rapamycin combined treatment of HER-2 overexpressing human mammary epithelial cell lines. Molecular Cancer Therapeutics. v. 11, p. 464-474, 2011. Qualis: A1
130.	Verjovski-Almeida, S.; Verjovski-Almeida, S. ; DEMARCO, Ricardo. Gene structure and splicing in schistosomes. Journal of Proteomics. v. 74, p. 1515-1518, 2011. Qualis: A1
131.	VIBRANOVSKI, M. D. Spermatogenesis and the Evolutionary Reorganization of the Genome. 2011. Apresentação de Trabalho/Seminário
132.	VIBRANOVSKI, M. D. Spermatogenesis and the Evolutionary Reorganization of the Genome. 2011. Apresentação de Trabalho/Seminário
133.	VIBRANOVSKI, M. D. Spermatogenesis and the Evolutionary Reorganization of the Genome. 2011. Apresentação de Trabalho/Seminário
134.	VIBRANOVSKI, M. D.; WANG, J. ; LONG, M.. Retrogenes out of the Z chromosome in Silkworm. 2011. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
135.	VIBRANOVSKI, M. D.; WANG, J. ; LONG, M.. Genomic Distribution of Sex-biased Genes and its Implication for the Evolution of Sex Chromosomes. 2011. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
136.	VICENTE, F. F. R. ; LOPES, F. M. ; HASHIMOTO, R. F.. Improvement of GNs inference through biological data integration. Em: 9th IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics (GENSIPS), p. 1-4, 2011. Qualis: Não identificado (9th IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics (GENSIPS))
137.	VIEIRA, R. F. C. ; BIONDO, A. W. ; GUIMARAES, A. M. S. ; Santos, A.P. ; SANTOS, R. P. ; DUTRA, L. H. ; DINIZ, P. P. ; de Morais, H. A. ; MESSICK, J. B. ; LABRUNA, M. B. ; VIDOTTO, O.. Ehrlichiosis in Brazil. Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária (Impresso). v. 20, p. 1-12, 2011.Qualis: A2
138.	VIEIRA, R. F. C. ; Molento, M.B. ; GUIMARAES, A. M. S. ; Santos, A.P. ; Bonat, Marcelo ; JAVOROUSKI, M. L. ; POPP, L. ; SANTOS, L. C. ; MORAES, W. ; CUBAS, Z. S. ; VIEIRA, T. S. W. J. ; VIDOTTO, O. ; BARROS FILHO, I. R. ; BIONDO, A. W. ; MESSICK, J. B.. Use of a Mycoplasma suis-PCR protocol for screening a population of captive peccaries (Tayassu tajacu and Tayassu pecari). Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária (Impresso). v. 20, p. 75-77, 2011.Qualis: A2
139.	Wibberg, Daniel ; Blom, Jochen ; Jaenicke, Sebastian ; Kollin, Florian ; Rupp, Oliver ; Scharf, Birgit ; Schneiker-Bekel, Susanne ; Sczcepanowski, Rafael ; Goesmann, Alexander ; Setubal, Joao Carlos ; Schmitt, Rüdiger ; Pühler, Alfred ; Schlüter, Andreas. Complete genome sequencing of Agrobacterium sp. H13-3, the former Rhizobium lupini H13-3, reveals a tripartite genome consisting of a circular and a linear chromosome and an accessory plasmid but lacking a tumor-inducing Ti-plasmid. Journal of Biotechnology. v. 155, p. 50-62, 2011. Qualis: A3
140.	YEPES, A. ; BUCKERIDGE, M. S.. Respuestas de las plantas ante los factores ambientales del cambio climático global. Revista IDEAS (Online). v. 14, p. 213-232, 2011.Qualis: C
141.	Zhang, Hongtao ; Setubal, Joao Carlos ; Zhan, Xiaobei ; Zheng, Zhiyong ; Yu, Lijun ; Wu, Jianrong ; Chen, Dingqiang. Component identification of electron transport chains in curdlan-producing Agrobacterium sp. ATCC 31749 and its genome-specific prediction using comparative genome and phylogenetic trees analysis. Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology. v. 38, p. 667-677, 2011. Qualis: A3
142.	ZHANG, Y. E. ; VIBRANOVSKI, M. D. ; KRINSKY, B. H. ; LONG, M.. A cautionary note for retrocopy identification: DNA-based duplication of intron-containing genes significantly contributes to the origination of single exon genes. Bioinformatics (Oxford. Print). v. 27, p. 1749-1753, 2011. Qualis: Não identificado (PRINT))
143.	ZHANG, YONG E. ; LANDBACK, PATRICK ; VIBRANOVSKI, MARIA D. ; LONG, MANYUAN. Accelerated Recruitment of New Brain Development Genes into the Human Genome. PLoS Biology (Online). v. 9, p. e1001179, 2011. Qualis: A1

2010

1.	ALMEIDA, F. N. ; SILVA, P. P. S. B. ; Mendrome, A. ; SABINO, E. C. ; FERREIRA, J. E.. Aplicando Procedência de Dados para a Geração e Análise de Perfis de Doadores de Sangue. Em: XXX Congresso da Sociedade Brasileira de Computação, p. 169-176, 2010.Qualis: C
2.	Almeida, Nalvo F. ; Yan, Shuangchun ; Cai, Rongman ; Clarke, Christopher R. ; Morris, Cindy E. ; Schaad, Norman W. ; Schuenzel, Erin L. ; Lacy, George H. ; Sun, Xiaoan ; Jones, Jeffrey B. ; Castillo, Jose A. ; Bull, Carolee T. ; Leman, Scotland ; Guttman, David S. ; Setubal, João C. ; Vinatzer, Boris A.. PAMDB, A Multilocus Sequence Typing and Analysis Database and Website for Plant-Associated Microbes. Phytopathology. v. 100, p. 208-215, 2010. Qualis: A1
3.	ALVES, J. M. P.; S. Baldwin ; L. Bulluck ; Edward Crawford ; Jennifer Fettweis ; Stephen Fong ; J. Hearn ; D. Jennings ; A. Johnson ; A. Joyce ; Karen Kester ; Kelly Lockeman ; MANQUE, P. ; A. Ni'Mary ; A. Padolina ; Susan Polich ; Clint Turbeville ; André Valente ; Brad Windle ; Ryan Woodcock ; et.al. Training 21st century scientists: an undergraduate research program in system biology. 2010. Apresentação de Trabalho/Comunicação
4.	ALVEZ, W. A. L. ; HASHIMOTO, R. F.. Classification of Regions Extracted from Scene Images by Morphological Filters in Text or Non-Text using Decision Tree. Em: 18th International Conference on Computer Graphics, p. 165-172, 2010.Qualis: Não identificado (18th International Conference on Computer Graphics)
5.	ALVEZ, W. A. L. ; HASHIMOTO, R. F.. Text Regions Extracted from Scene Images by Ultimate Attribute Opening and Decision Tree Classification. Em: Graphics, p. 360-367, 2010. Qualis: Não identificado (Graphics)
6.	AMUI, S. F. ; MOREL, L. J. F. ; PEREIRA, A. M. S. ; GIULIATTI, S.. A Based Learning Machine Web System for Selection Medicinal Plants of the Cerrado with Antimicrobial Properties. Em: ISCB Latin America, 2010, Montevideo. Posters, 2010.
7.	AMUI, S. F. ; MOREL, L. J. F. ; PEREIRA, A. M. S. ; GIULIATTI, S.. A Based Learning Machine Web System for Selection Medicinal Plants of the Cerrado with Antimicrobial Properties. 2010. Apresentação de Trabalho/Outra
8.	AMUI, S. F. ; PEREIRA, A. M. S. ; GIULIATTI, S.. Using Decision Trees in the Analysis of the Concentration of Tannins in Stryphnodendron adstringens. Em: X Jornadas de Bioinformática, 2010, Malaga. Posters, 2010.
9.	AMUI, S. F. ; PEREIRA, A. M. S. ; GIULIATTI, S.. Using Decision Trees in the Analysis of the Concentration of Tannins in Stryphnodendron adstringens. 2010. Apresentação de Trabalho/Congresso
10.	AMUI, S. F. ; Pereira, Ana Maria Soares ; GIULIATTI, S.. A Based Learning Machine Web System for Selection Medicinal Plants of the Cerrado with Antimicrobial Properties. Em: I Workshop do Programa de Pós-Graduação em Genética: Genética Básica, Genética Humana e Médica e Bioinformática, 2010, Ribeirão Preto, SP. Anais - CD, 2010.
11.	Anantharaman, Vivek ; Abhiman, Saraswathi ; De Souza, Robson F. ; Aravind, L.. Comparative genomics uncovers novel structural and functional features of the heterotrimeric GTPase signaling system. Gene (Amsterdam). v. 475, p. 63-78, 2010. Qualis: A4
12.	Aravind, L ; De Souza, Robson F ; Iyer, Lakshminarayan M. Predicted class-I aminoacyl tRNA synthetase-like proteins in non-ribosomal peptide synthesis. Biology Direct. v. 5, p. 48, 2010. Qualis: Não identificado (BIOLOGY DIRECT)
13.	Arcuri, Silvia M. ; Amaro, Edson ; Bromme, Matthew R. ; Vieira, G. ; Sato, João R. ; Brammer, M. J. ; Williams, Steve S.C. ; Sameshima, K. ; Baccalá, Luiz ; Morris, Robin G.. FUNCTIONAL DISCONNECTIVITY AND FORMAL THOUGHT DISORDER IN SCHIZOPHRENIA: INTEGRATING CLINICAL, NEUROPSYCHOLOGICAL, NEUROIMAGING AND FUNCTIONAL CONNECTIVTY DATA. Schizophrenia Research (Print). v. 117, p. 232-233, 2010. Qualis: A1
14.	BALAJI, P. ; FENG, W. ; LIN, H. ; ARCHULETA, J. ; MATSUOKA, S. ; Warren, A. ; Setubal, J. ; Lusk, Ewing ; Thakur, R. ; Foster, I. ; Katz, D. S. ; Jha, S. ; Shinpaugh, K. ; Coghlan, S. ; Reed, D.. Global-scale distributed I/O with ParaMEDIC. Concurrency and Computation. v. 22, p. 2266-2281, 2010. Qualis: Não identificado (CONCURRENCY AND COMPUTATION)
15.	Baratti, Mariana O ; Moreira, Yuri B ; Traina, Fabiola ; Costa, Fernando F ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; Olalla-Saad, Sara T. Identification of protein-coding and non-coding RNA expression profiles in CD34+ and in stromal cells in refractory anemia with ringed sideroblasts. BMC Medical Genomics. v. 3, p. 30, 2010. Qualis: A3
16.	Bare, J.C. ; KOIDE, T. ; Reiss, D.J. ; Tenembaum, D. ; Baliga, N.S.. Integration and visualization of systems biology data in context of the genome. BMC Bioinformatics. v. 11, p. 382, 2010. Qualis: A1
17.	BARROS FILHO, M.C. ; KATAYAMA, M.L.H. ; BRENTANI, H. ; ABREU, A.P.S. ; BARBOSA, E.M. ; OLIVEIRA, C.T. ; GÓES, J.C.S. ; BRENTANI, M.M. ; FOLGUEIRA, M.A.A.K.. Gene trio signatures as molecular markers to predict response to doxorubicin cyclophosphamide neoadjuvant chemotherapy in breast cancerpatients. Brazilian journal of medical and biological research. v. 43, p. 1225-1231, 2010. Qualis: A4
18.	Biase, Fernando Henrique ; Martelli, Lúcia ; Puga, Renato ; Giuliatti, Silvana ; Santos-Biase, Weruska Karyna Freitas ; Fonseca Merighe, Giovana Krempel ; Meirelles, Flavio Vieira. Messenger RNA expression of Pabpnl1 and Mbd3l2 genes in oocytes and cleavage embryos. Fertility and Sterility. v. 93, p. 2507-2512, 2010. Qualis: A1
19.	BOCCARDO, E. ; Manzini Baldi, C. V. ; CARVALHO, A. F. ; RABACHINI, T. ; Torres, C. ; BARRETA, L. A. ; BRENTANI, H. ; VILLA, L. L.. Expression of human papillomavirus type 16 E7 oncoprotein alters keratinocytes expression profile in response to tumor necrosis factor- . Carcinogenesis (New York. Print). v. 31, p. 521-531, 2010. Qualis: Não identificado (PRINT))
20.	BORTOLINI, M. C. ; HÜNEMEIER, T. ; ACUNA-ALONZO, V. ; RUIZ-LINARES, A ; CANIZALES-QUINTEROS, S. ; SALZANO, F. M.. Looking for natural selection in the American continent. Em: 79th Annual Meeting of the American Association of Physical Anthropologists, 2010, Albuquerque, NM. AMERICAN JOURNAL OF PHYSICAL ANTHROPOLOGY, p. 71-71, 2010.
21.	BRAGHETTO, KELLY ROSA ; Ferreira, João Eduardo ; VINCENT, JEAN-MARC. Performance analysis modeling applied to business processes. Em: the 2010 Spring Simulation Multiconference, p. 1, 2010. Qualis: Não identificado (the 2010 Spring Simulation Multiconference)
22.	Brito, C. S. N. ; Takahashi, D. Y. ; Baccalá, L. A. ; Sameshima, K.. Asymptotic behavior of generalized partial directed coherence. Em: The 32nd Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, v. 1, p. 1718-1721, 2010. Qualis: Não identificado (The 32nd Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society)
23.	BUCKERIDGE, M. S. Seed Cell Wall Storage Polysaccharides: models to understand cell wall biosynthesis and degradation. Plant Physiology (Bethesda),. p. 1-7, 2010. Qualis: A1 (PLANT PHYSIOLOGY)
24.	BUCKERIDGE, M. S. Introduction to Bio-Energy. Chapter 1. The potencial for first generation biofuels. Em: Coser, T.R.; Davis, M.J.. (Org.). Biofuels: Reazinable Steps Towards a Renewable Energy Future. São Paulo. : Fulbright Commission Brazil. 2010.p. 13-15.
25.	BUCKERIDGE, M. S. Introduction to Bio-Energy. Chapter 2. Science and Technology. Em: Coser, T.R.; Davis, M.J.. (Org.). Biofuels: Reazonable Steps Towards a Renewable Energy Future. São Paulo. : Fulbright Commission Brazil. 2010.p. 17-23.
26.	BUCKERIDGE, M. S. As plantas e os rumos da bioenergia Pan-americana ? Revista Negócios & Sustentabilidade. Orgânicos em Revista, São Paulo, SP. Brasil, p. 48-49, 23 nov. 2010.
27.	BUCKERIDGE, M. S. Menos burocracia, mais empreendedorismo. Revista Pesquisa FAPESP, São Paulo, 27 set. 2010.
28.	BUCKERIDGE, M. S. A corrida mundial em busca de energia renovável: China lidera em energia solar e eólica; Brasil se destaca com etanol. O Estado de São Paulo, São Paulo, 01 set. 2010.
29.	BUCKERIDGE, M. S. A corrida mundial em busca de energia renovável. Jornal O Estado de São Paulo, São Paulo, SP. Brasil, p. 11-11, 01 set. 2010.
30.	BUCKERIDGE, M. S. Cidade precisa melhorar a qualidade de seus dados de clima para decidir melhor. Folha de São Paulo, São Paulo, SP. Brasil, p. c4-c4, 16 jun. 2010.
31.	BUCKERIDGE, M. S. A biologia sintética e a bioenergia. Revista Pesquisa Fapesp, São Paulo, SP. Brasil, p. 50-51, 01 jun. 2010.
32.	BUCKERIDGE, M. S. Perspectives on Biofuels research in Brazil. 2010. Apresentação de Trabalho/Congresso
33.	BUCKERIDGE, M. S. Overview in Biofuel Research in Brazil. 2010. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
34.	BUCKERIDGE, M. S.; GONCALVES, J. F. C. ; LIM, R.B.S. ; FERNANDES, A. V. ; Borges, E.E.L.B.. Physiological and biochemical characterization of the assai palm (Euterpe oleracea Mart.) during seed germination and seedling growth under aerobic and anaerobic conditions. Revista Árvore (Impresso). v. 34, p. 1045-4053, 2010. Qualis: B2
35.	BUCKERIDGE, M. S.; Santos, Wanderley D. ; Crivellari, Augusto César ; DE SOUZA, C.R. ; GARCIA, D. ; De Souza, Amanda Pereira ; CARRARA, T. B. ; PIMENTEL, V.L.. Composition, structure and architecture of the cell walls of sugarcane: A feedstock for second generation ethanol. 2010. Apresentação de Trabalho/Congresso
36.	BUCKERIDGE, M. S.; Santos, Wanderley D. ; SOUZA, A. P.. As rotas para o etanol celulósico no Brasil. Em: Luís Augusto Barbosa Cortez. (Org.). Bioetanol da cana-de-açúcar: P&D para produtividade e sustentabilidade.. São Paulo. : Editora Edgard Blucher. 2010.p. 365-380.
37.	Buckeridge, Marcos S.; A conquista do etanol celulósico: um modelo brasileiro de inovação. . Opiniões, Ribeirão Preto, p. 74-76, 15 maio 2010.
38.	Buckeridge, Marcos S.; A força que vem dos vegetais: do fogo ao etanol celulósico, o home continua dependendo das plantas para ober energia. . Revista Pesquisa FAPESP on line, São Paulo, 18 maio 2010.
39.	Camargo, E.L.O. ; SALAZAR, M.M. ; LEPIKSON-NETO, J. ; GRANDIS, A. ; MARQUES, W.L. ; MEYER, L.E. ; RIO, M.C.M. ; BUCKERIDGE, M. S. ; PEREIRA, G.A.G.. The effects of nitrogen fertilization on Eucalyptus tension wood formation. 2010. Apresentação de Trabalho/Congresso
40.	Campos, A ; Silva, A ; MOTA, L. D. C. ; OLIVIERI, E. ; PATRÃO, D. F. C. ; SOARES, F. A. ; BRENTANI, R. R. ; BRENTANI. H. The value of a tumor bank in the development of cancer research in Brazil: 12 years. Em: Biopreservation and biobanking, 2010, Rotterdam. Abtstracts Diversity in Biobanking: Embracing Differences, Harnessing Commonalities, v. 7, p. 189, 2010.
41.	CANTÃO, MAURICIO E. ; DE ARAÚJO, LUCIANO V. ; LEMOS, ELIANA G. M. ; Ferreira, João E.. Algebraic approach to optimal clone selection applied in metagenomic projects. Em: the International Symposium, p. 1, 2010. Qualis: Não identificado (the International Symposium)
42.	CARDOSO, G.A. ; MATIOLLI, C. C. ; AZEREDO-ESPIN, A.M.L. ; TORRES, T. T.. Análise da expressão de genes relacionados ao comportamento alimentar na família Calliphoridae. Em: 56º Congresso Brasileiro de Genética, 2010, Guarujá, SP. Anais do 56º Congresso Brasileiro de Genética, 2010.
43.	CARDOSO, K. C. ; SILVA, M. J. ; COSTA, G. G. L. ; TORRES, T. T. ; DEL BEM, L. E. V. ; VIDAL, R. O. ; MENOSSI, M. ; HYSLOP, S.. A transcriptomic analysis of gene expression in the venom gland of the snake Bothrops alternatus (urutu). BMC Genomics. v. 11, p. 605, 2010. Qualis: A2
44.	CARNEIRO-PROIETTI, A. B. ; SABINO, E. C. ; Sampaio, Divaldo ; Proietti, Fernando A. ; GONCALVES, T. T. ; OLIVEIRA, C. D. L. ; FERREIRA, J. E. ; Liu, Jing ; Schreiber, George B. ; Murphy, Edward L. ; BUSCH, M. P.. Demographic profile of blood donors at three major Brazilian blood centers: results from the International REDS-II study, 2007 to 2008. TRANSFUSION (ONLINE). v. 50, p. 918-925, 2010. Qualis: A3
45.	CARVALHO, R.A. ; AZEREDO-ESPIN, A.M.L. ; TORRES, T.T.. Deep sequencing of New World screw-worm transcripts to discover genes involved in insecticide resistance. BMC GENOMICS. v. 11, p. 695, 2010. Qualis: A2
46.	Cordenunsi, Beatriz ; Saura-Calixto, Fulgêncio ; Diaz-Rubio, Maria Elena ; Zuleta, Angela ; Tiné, Marco Aurélio ; Buckeridge, Marcos Silveira ; BUCKERIDGE, M. S. ; Silva, Giovanna Bezerra da ; Carpio, Cecilia ; Giuntini, Eliana Bistriche ; Menezes, Elizabete Wenzel de ; Lajolo, Franco. Carbohydrate composition of ripe pineapple (cv. perola) and the glycemic response in humans. Ciência e Tecnologia de Alimentos (Impresso). v. 30, p. 282-288, 2010. Qualis: B1 (CIENCIA E TECNOLOGIA DE ALIMENTOS)
47.	Crivellari, Augusto César ; DE SOUZA, C.R. ; GARCIA, D. ; LEITE, D.C.C. ; Santos, Wanderley D. ; SOUZA, A. P. ; CARRARA, T. B. ; BUCKERIDGE, M. S.. Sugarcane Cell walls for second generation ethanol. 2010. Apresentação de Trabalho/Congresso
48.	da Silva Neto, Jose F ; Koide, Tie ; Gomes, Suely L ; Marques, Marilis V. Global gene expression under nitrogen starvation in Xylella fastidiosa: contribution of the sigma54 regulon. BMC Microbiology (Online). v. 10, p. 231, 2010. Qualis: A2
49.	DaMatta, Fábio M. ; Grandis, Adriana ; Arenque, Bruna C. ; Buckeridge, Marcos S. ; BUCKERIDGE, M. S.. Impacts of climate changes on crop physiology and food quality. Food Research International. v. 43, p. 1814-1823, 2010. Qualis: A1
50.	De Souza, Amanda Pereira ; ARUNDALE, R.A. ; DOHLEMAN, F.G. ; LONG, S.P. ; BUCKERIDGE, M. S.. Photosynthesis and carbohydrate metabolism of Miscanthus x Giganteus cultivated at Soyface. 2010. Apresentação de Trabalho/Congresso
51.	De Souza, Amanda Pereira ; BUCKERIDGE, M. S.. A fotossíntese em cana-de-açúcar e sua importância estratégica para enfrentar as mudanças climáticas globais. Em: Luís Augusto Barbosa Cortez. (Org.). Bioetanol da cana-de-açúcar: P&D para produtividade e sustentabilidade.. São Paulo. : Editora Edgard Blucher. 2010.p. 359-364.
52.	De Souza, Amanda Pereira ; BUCKERIDGE, M. S.. Growing a C4 plant under elevated CO2 atmospheric concentration: A tool to understand the photosynthesis and source-sink relationship in sugarcane. 2010. Apresentação de Trabalho/Congresso
53.	DE SOUZA, C.R. ; SOUZA, A. P. ; GRANDIS, A. ; BUCKERIDGE, M. S.. Carbohydrate degradation of sugacane straw in the Field. 2010. Apresentação de Trabalho/Congresso
54.	de Souza, R. F.; Aravind, L.. UMA and MABP domains throw light on receptor endocytosis and selection of endosomal cargoes. Bioinformatics (Oxford). v. 26, p. 1477-1480, 2010. Qualis: A1
55.	De Souza, Robson F.; Iyer, Lakshminarayan M. ; Aravind, L.. Diversity and evolution of chromatin proteins encoded by DNA viruses. BBA-GENE REGUL MECH. v. 1799, p. 302-318, 2010. Qualis: Não identificado (BBA-GENE REGUL MECH)
56.	DEMARCO, R. ; Mathieson, W. ; Manuel, S. J. ; Dillon, G. P. ; Curwen, R. S. ; Ashton, P. D. ; Ivens, A. C. ; Berriman, M. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S. ; Wilson, R. A.. Protein variation in blood-dwelling schistosome worms generated by differential splicing of micro-exon gene transcripts. Genome Research. v. 20, p. 1112-1121, 2010. Qualis: A1
57.	DENTILLO, D. B. ; Meola, J. ; Rosa e Silva, J. C. ; GIULIATTI, S. ; SILVA, W. A. ; FERRIANI, R. A. ; Martelli, L. ; MARTELLI, L.. Deregulation of LOXL1 and HTRA1 Gene Expression in Endometriosis. Reproductive Sciences (Thousand Oaks, Calif.). v. 17, p. 1016-1023, 2010. Qualis: A2
58.	DIAS, U. M. ; DIAS, Z. ; Setubal, Joao C. A Simulation Tool for the Study of Symmetric Inversions in Bacterial Genomes. Em: RECOMB - Comparative Genomics, p. 1-10, 2010.Qualis: Não identificado (RECOMB - Comparative Genomics)
59.	DUARTE G. L. ; CORREIA, R. ; DOMINGUES, H. ; Kon, F ; KON, R. ; FERREIRA, J. E.. Borboleta and SaguiSaúde - Open Source Mobile Telehealth for Public. Em: 8th International eHealth,Telemedicine and Health ICT Forum, p. 567-571, 2010.Qualis: Não identificado (8th International eHealth,Telemedicine and Health ICT Forum)
60.	Duarte, N.E. ; Giolo, S.R. ; de Andrade, M. ; SOLER, J. M. P.. Mixed models in genetic mapping using family-based designs. Em: XXVth International Biometric Conference, 2010, Florianópolis. Proceeedings of the XXVth IBC, 2010.
61.	Facciotti, Marc T ; Pang, Wyming L ; Lo, Fang-yin ; Whitehead, Kenia ; KOIDE, T. ; Masumura, Ken-ichi ; Pan, Min ; Kaur, Amardeep ; Larsen, David J ; Reiss, David J ; Hoang, Linh ; Kalisiak, Ewa ; Northen, Trent ; Trauger, Sunia A ; Siuzdak, Gary ; Baliga, Nitin S. Large scale physiological readjustment during growth enables rapid, comprehensive and inexpensive systems analysis. BMC Systems Biology. v. 4, p. 64, 2010. Qualis: A1
62.	Ferreira, Elisa N. ; Maschietto, Mariana ; Silva, Sabrina D. ; BRENTANI, HELENA ; Carraro, Dirce M.. Evaluation of Quantitative RT-PCR Using Nonamplified and Amplified RNA. Diagnostic Molecular Pathology (Print). v. 19, p. 45-53, 2010. Qualis: Não identificado (DIAGNOSTIC MOLECULAR PATHOLOGY)
63.	FERREIRA, J. E.; TAKAI, O. K. ; MALKOWSKI, S. ; PU, C.. Reducing Exception Handling Complexity in Business Process Modeling and Implementation: the WED-Flow Approach. Em: OTM Conferences, v. 6426, p. 150-167, 2010.Qualis: Não identificado (OTM Conferences)
64.	Ferreira, Joao Eduardo. Fourth International Workshop on Scientific Workflows. 2010. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
65.	Ferreira, Joao Eduardo. Reducing Exception Handling Complexity in Business Process Modeling and Implementation: the WED-Flow Approach. 2010. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
66.	Ferreira, João E.; WU, QINYI ; Malkowski, Simon ; Pu, Calton. Towards Flexible Event-Handling in Workflows through Data States. Em: 2010 IEEE Congress on Services (SERVICES), p. 344, 2010. Qualis: Não identificado (2010 IEEE Congress on Services (SERVICES))
67.	Fogaça, Andréa C. ; ZAINI, Paulo A. ; Wulff, Nelson A. ; da Silva, Patrícia I.P. ; Fázio, Marcos A. ; Miranda, Antônio ; Daffre, Sirlei ; da Silva, Aline M.. Effects of the antimicrobial peptide gomesin on the global gene expression profile, virulence and biofilm formation of. FEMS Microbiology Letters. v. 306, p. 152-159, 2010. Qualis: B2
68.	Frederigue-Lopes, N. B. ; Bevilacqua, M. C. ; Sameshima, Koichi ; Costa Filho, O. A.. Desempenho de crianças normais em testes temporais auditivos em campo livre. Pró-Fono (Impresso). v. 22, p. 83-88, 2010. Qualis: Não identificado (PRÓ-FONO)
69.	FREITAS, L. H. ; GIULIATTI, S. ; SOARES, A. E. E. ; REIS, A. C. M. B.. Bee's Life to Deaf: an Interaction between the Biomedical Informatics and the Speech. Em: ICA 2010: XXX International Congress of Audiology e XXV International Meeting of Audiology, 2010, São Paulo, SP. Anais, 2010.
70.	FREITAS, L. H. ; REIS, A. C. M. B. ; SOARES, A. E. E. ; GIULIATTI, S.. Bee's Life to Deaf: an Interaction Between the Biomedical Informatics and the Speech. 2010. Apresentação de Trabalho/Congresso
71.	Freschi, L. ; Rodrigues, M. A. ; Domingues, D. S. ; Purgatto, E. ; Van Sluys, M. A. ; Magalhaes, J. R. ; Kaiser, W. M. ; Mercier, H.. Nitric Oxide Mediates the Hormonal Control of Crassulacean Acid Metabolism Expression in Young Pineapple Plants. Plant Physiology (Bethesda). v. 152, p. 1971-1985, 2010. Qualis: A1
72.	Garcia, M.O. ; ARAÚJO, L. V. ; Passos-Bueno, M. R ; SCHLESINGER, D. ; FERREIRA, J. E.. Indexação de Dados Semi-Estruturados para Apoio a Diagnósticos Médicos. Em: XII Congresso Brasileiro de Informática em Saúde - CBIS, 2010.Qualis: Não identificado (XII Congresso Brasileiro de Informática em Saúde - CBIS)
73.	Gomes, Verônica Souza da Mota ; Buckeridge, Marcos S. ; BUCKERIDGE, M. S. ; Silva, Clóvis Oliveira ; Scarano, Fábio Rubio ; Araujo, Dorothy Sue Dunn ; Alves, Maria Alice S.. Availability peak of caloric fruits coincides with energy-demanding seasons for resident and non-breeding birds in restinga, an ecosystem related to the Atlantic forest, Brazil. Flora (Jena). v. 205, p. 647-655, 2010. Qualis: A3
74.	GRANDIS, A. ; Arenque, Bruna C. ; SOUZA, A. P. ; Pocius, O ; BUCKERIDGE, M. S.. Respostas fotossintéticas e de crescimento da espécie amazônica Senna reticulata (Willd.) Irwin & Barneby (Leguminosae) sob elevada concentração de CO2. 2010. Apresentação de Trabalho/Congresso
75.	Grandis, Adriana ; Godoi, Simone ; Buckeridge, Marcos S. ; BUCKERIDGE, M. S.. Respostas fisiológicas de plantas amazônicas de regiões alagadas às mudanças climáticas globais. Brazilian Journal of Botany. v. 33, p. 1-12, 2010. Qualis: B1
76.	GRAZZIOTTIN, A. L. ; SANTOS, L. C. ; Santos, A.P. ; Guimaraes, A.M.S. ; VIEIRA, R. F. C. ; DONATTI, L. ; MOHAMED, A. ; MORAES, W. ; Cubas, Zalmir Silvino ; OLIVEIRA, M. J. ; BIONDO, A. W. ; MESSICK, J. B.. Molecular Characterization of Hemotropic Mycoplasma From Captive South American Deer (Blastocerus dichotomus, Mazama nana and Mazama americana). Em: ACVP/ASVCP Combined Annual Meeting, 2010, Baltimore, MD, USA. Veterinary Pathology, v. 47, p. Suppl6S, 2010.
77.	Guimaraes, A.M.S.; Brandão, P.E. ; MORAES, W. ; Kiihl, S. ; Santos, L.C. ; FILONI, C. ; Cubas, Z.S. ; Robes, R.R. ; Marques, L.M. ; Neto, R.L.. Detection of Bartonella spp. in neotropical felids and evaluation of risk factors and hematological abnormalities associated with infection. Veterinary Microbiology (Amsterdam. Print). v. 142, p. 346-351, 2010. Qualis: Não identificado (PRINT))
78.	Guimaraes, A.M.S.; Santos, A.P. ; MESSICK, J. B.. A Genomic Survey for Putative Virulence Factors of Mycoplasma suis. Em: ACVP/ASVCP Combined Annual Meeting, 2010, Baltimore, MD, USA. Veterinary Pathology, v. 47, p. Suppl50S, 2010.
79.	Guimaraes, A.M.S.; VIEIRA, R. F. C. ; Poletto, R. ; VEMULAPALLI, R. ; Santos, A.P. ; MORAES, W. ; Cubas, Zalmir Silvino ; SANTOS, L. C. ; MARCHANT-FORDE, J. N. ; BIONDO, A. W. ; MESSICK, J. B.. Quantitative PCR Assay Based on the 16S Ribosomal RNA Gene for the Detection of Mycoplasma suis in Pigs. Em: ACVP/ASVCP Combined Annual Meeting, 2010, Baltimore, MD, USA. Veterinary Pathology, v. 47, p. Suppl47S, 2010.
80.	Harwich, Michael D ; Alves, Joao M ; Buck, Gregory A ; Strauss, Jerome F ; Patterson, Jennifer L ; Oki, Aminat T ; Girerd, Philippe H ; Jefferson, Kimberly K. Drawing the line between commensal and pathogenic Gardnerella vaginalis through genome analysis and virulence studies. BMC Genomics. v. 11, p. 375-387, 2010. Qualis: A2
81.	HIGA, C. H. A. ; LOUZADA, V. H. P. ; HASHIMOTO, R. F.. Analysis of Gene Interactions Using Restricted Boolean Networks and Time-Series Data. Em: 6th International Symposium on Bioinformatics Research and Applications, p. 61-76, 2010. Qualis: Não identificado (6th International Symposium on Bioinformatics Research and Applications)
82.	Hotta, Carlos T. ; Lembke, Carolina G. ; Domingues, Douglas S. ; Ochoa, Edgar A. ; Cruz, Guilherme M. Q. ; Melotto-Passarin, Danila M. ; Marconi, Thiago G. ; Santos, Melissa O. ; Mollinari, Marcelo ; Margarido, Gabriel R. A. ; Crivellari, Augusto César ; Santos, Wanderley D. ; Souza, Amanda P. ; Hoshino, Andrea A. ; Carrer, Helaine ; Souza, Anete P. ; Garcia, Antônio A. F. ; Buckeridge, Marcos S. ; BUCKERIDGE, M. S. ; Menossi, Marcelo ; Sluys, Marie-Anne ; et.al. The Biotechnology Roadmap for Sugarcane Improvement. Tropical Plant Biology (Online). v. 3, p. 75-87, 2010. Qualis: A3
83.	HÜNEMEIER, T. SNPs Datasets: Busca, obtenção e utilização de dados de varredura genômica. 2010. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
84.	HÜNEMEIER, T. Coevolução Gene-Cultura e o Genótipo Frugal em Nativos Americanos. 2010. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
85.	HÜNEMEIER, T.; ACUNA-ALONZO, V. ; CANIZALES-QUINTEROS, S. ; SALZANO, F. M. ; BORTOLINI, M. C.. 230C: EVOLUTIONARY HISTORY OF AN ALLELE AND ITS RELATIONSHIP WITH AMERICAN PEOPLING. Em: http://www.primerosamericanos.com.ar/index.php?option=com_content&view=article&id=59&Itemid=74&lang=en, 2010, La Plata. El Poblamiento Temprano de América, 2010.
86.	HÜNEMEIER, T.; ACUNA-ALONZO, V. ; RUIZ-LINARES, A ; CANIZALES-QUINTEROS, S. ; SALZANO, F. M. ; BORTOLINI, M. C.. 230C: EVOLUTIONARY HISTORY OF AN ALLELE AND ITS RELATIONSHIP WITH AMERICAN PEOPLING. 2010. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
87.	HÜNEMEIER, T.; ACUNA-ALONZO, V. ; SALZANO, F. M. ; BORTOLINI, M. C. ; CANIZALES-QUINTEROS, S.. A functional ABCA1 gene variant is associated with low HDL-cholesterol levels and shows evidence of positive selection in Native Americans. Human Molecular Genetics (Print). v. 19, p. 2877-2885, 2010. Qualis: A1
88.	HÜNEMEIER, T.; Ruiz-Linares, Andres ; Silveira, Álvaro ; Paixão-Côrtes, Vanessa Rodrigues ; Salzano, Francisco M. ; Bortolini, Maria Cátira. Brief communication: Population data support the adaptive nature of HACNS1 sapiens/neandertal-chimpanzee differences in a limb expression domain. American Journal of Physical Anthropology,. p. n/a-n/a, 2010. Qualis: A2 (AMERICAN JOURNAL OF PHYSICAL ANTHROPOLOGY)
89.	Iyer, L. M. ; Abhiman, S. ; de Souza, R. F. ; Aravind, L.. Origin and evolution of peptide-modifying dioxygenases and identification of the wybutosine hydroxylase/hydroperoxidase. Nucleic Acids Research,. p. gkq265, 2010. Qualis: A1 (NUCLEIC ACIDS RESEARCH)
90.	JORGE, D. M. M. ; SILVA, V. B. ; SILVA, C. H. T. P. ; GIULIATTI, S.. In Silico Screening for Phospholipase A2 of Apis mellifera with HitFinder Library. Em: ISCB2010, 2010, Boston. Posters, p. 44-44, 2010.
91.	JORGE, D. M. M. ; SILVA, V. B. ; SILVA, C. H. T. P. ; GIULIATTI, S.. Virtual Screening to Discover Synthetic Inhibitors Against Phospholipase A2 of Apis mellifera. Em: X Jornadas de Bioinformática, 2010, Malaga. Anais da X Jornadas de Bioinformática, 2010.
92.	JORGE, D. M. M. ; SILVA, V. B. ; SILVA, C. H. T. P. ; GIULIATTI, S.. Virtual Screening to Discover Synthetic Inhibitors Against Phospholipase A2 of Apis mellifera. 2010. Apresentação de Trabalho/Congresso
93.	JORGE, D. M. M. ; SILVA, V. B. ; SILVA, C. H. T. P. ; GIULIATTI, S.. In Silico Screening for Phospholipase A2 of Apis mellifera with HitFinder Library. 2010. Apresentação de Trabalho/Congresso
94.	JORGE, D. M. M. ; SILVA, V. B. ; SILVA, C. H. T. P. ; SOARES, A. M. ; GIULIATTI, S.. In Silico Screening for Phospholipase A2 of Apis mellifera with Fragment Library. Em: ISCB Latin America, 2010, Montevideo. Posters, 2010.
95.	JORGE, D. M. M. ; SILVA, V. B. ; SILVA, C. H. T. P. ; SOARES, A. M. ; GIULIATTI, S.. In silico Screening for Phospholipase A2 of Apis mellifera with Fragment Library. Em: I Workshop do Programa de Pós-Graduação em Genética: Genética Básica, Genética Humana e Médica e Bioinformática, 2010, Ribeirão Preto, SP. Anais - CD, 2010.
96.	JORGE, D. M. M. ; SILVA, V. B. ; SILVA, C. H. T. P. ; SOARES, A. M. ; GIULIATTI, S.. In Silico Screening for Phospholipase A2 of Apis mellifera with Fragment Library. 2010. Apresentação de Trabalho/Congresso
97.	JUNQUEIRA, R. ; VALLADA, H. ; BRENTANI, H.. Genética dos Transtornos Ansiosos. Em: Fernando Ramos Asbahr. (Org.). Ansiedade na Infância e Adolescência. Transtornos de Ansiedade na Infância e Adolescência. 2ed. : Casa Leitura Médica. 2010.v. II, p. 55-67.
98.	Kamenetzky, L. ; Asis, R. ; Bassi, S. ; de Godoy, F. ; Bermudez, L. ; Fernie, A. R. ; Van Sluys, M. A. ; Vrebalov, J. ; Giovannoni, J. J. ; ROSSI, M. ; Carrari, F.. Genomic Analysis of Wild Tomato Introgressions Determining Metabolism- and Yield-Associated Traits. Plant Physiology (Bethesda). v. 152, p. 1772-1786, 2010. Qualis: A1
99.	KOIDE, T. Biologia Sistêmica: cominando 'omics' para o avanço da microbiologia. 2010. Apresentação de Trabalho/Outra
100.	KOIDE, T. Towards mechanistic gene regulatory models: unraveling the transcriptome complexity. 2010. Apresentação de Trabalho/Outra
101.	Lang, Jillian M. ; Hamilton, John P. ; Diaz, Maria Genaleen Q. ; Van Sluys, Marie Anne ; Burgos, Ma. Ruby G. ; Vera Cruz, Casiana M. ; Buell, C. Robin ; Tisserat, Ned A. ; Leach, Jan E.. Genomics-Based Diagnostic Marker Development for pv. and pv.. Plant Disease. v. 94, p. 311-319, 2010. Qualis: A2
102.	LEITE, D.C.C. ; Santos, Wanderley D. ; BUCKERIDGE, M. S.. Effects of phenylpropanoid synthesis inhibition on sugarcane development. 2010. Apresentação de Trabalho/Congresso
103.	Machado, B. S. ; Miranda, T. B. ; Morya, E. ; Amaro Jr., E. ; Sameshima, K. Algorithmic complexity measure of EEG for staging brain state. Em: 29th International Congress of Clinical Neurophysiology, 2010, Kobe. Clinical Neurophysiology. New York: Elsevier, v. 210, 2010.
104.	MACHADO, B.S. ; MIRANDA, T.B. ; Morya, E. ; AMARO, E. ; Sameshima, K.. P24-23 Algorithmic complexity measure of EEG for staging brain state. Clinical Neurophysiology. v. 121, p. S249-S250, 2010. Qualis: A2
105.	MACHADO-LIMA, A. ; KASHIWABARA, A. Y. ; DURHAM, A. M.. Decreasing the number of false positives in sequence classification. BMC GENOMICS. v. 11, p. S7, 2010. Qualis: A2
106.	Manicassamy, S. ; Reizis, B. ; Ravindran, R. ; Nakaya, H. ; Salazar-Gonzalez, R. M. ; Wang, Y.-c. ; Pulendran, B.. Activation of -Catenin in Dendritic Cells Regulates Immunity Versus Tolerance in the Intestine. Science (New York, N.Y.). v. 329, p. 849-853, 2010. Qualis: A1
107.	Marques, Lucas ; Ueno, Priscilla M ; Buzinhani, Melissa ; Cortez, Beatriz A ; Neto, Renata L ; Yamaguti, Maurício ; Oliveira, Rosângela C ; GUIMARAES, A. M. S. ; Monezi, Telma A ; Braga, Antonio ; Machado-Santelli, Gláucia M ; Timenetsky, Jorge. Invasion of Ureaplasma diversum in Hep-2 cells. BMC Microbiology (Online). v. 10, p. 83, 2010. Qualis: A2
108.	MARQUES, M. M. ; OCTACILIO-SILVA, S. ; EVANGELISTA, A. F. ; PIGNATA, L. F. M ; GIULIATTI, S ; Passos, Geraldo A. S.. Autoantigen Messenger RNAs in the Thymus of Nod Mic are Under Control of Micro RNA-mRNA Interaction Network. Em: 7th International Congress on Autoimmunity, 2010, Ljubljana. Abstracts, 2010.
109.	MARTINS, D. C. ; OLIVEIRA, E. A. ; LOUZADA, V. H. P. ; HASHIMOTO, R. F.. Inference of Restricted Stochastic Boolean GRN's by Bayesian Error and Entropy Based Criteria. Em: 15th Iberoamerican Congress on Pattern Recognition, v. 6419, p. 144-152, 2010. Qualis: Não identificado (15th Iberoamerican Congress on Pattern Recognition)
110.	Matos, G. ; Tsai, R. ; Baldo, M. V. C. ; Castro, I. ; Sameshima, K ; Valle, A. C.. The sleep?wake cycle in adult rats following pilocarpine-induced temporal lobe epilepsy. Epilepsy & Behavior. v. 17, p. 324-331, 2010. Qualis: A3
111.	Meola, Juliana ; Rosa e Silva, Júlio César ; Dentillo, Daniel Blassioli ; da Silva, Wilson Araújo ; Veiga-Castelli, Luciana Caricati ; de Souza Bernardes, Luciano Angelo ; Ferriani, Rui Alberto ; de Paz, Claudia Cristina Paro ; Giuliatti, Silvana ; Martelli, Lúcia. Differentially expressed genes in eutopic and ectopic endometrium of women with endometriosis. Fertility and Sterility. v. 93, p. 1750-1773, 2010. Qualis: A1
112.	Moreira, Leandro M ; Almeida, Nalvo F ; Potnis, Neha ; DIGIAMPIETRI, L. A. ; Adi, Said S ; Bortolossi, Julio C ; da Silva, Ana C ; da Silva, Aline M ; de Moraes, Fabricio E ; de Oliveira, Julio C ; de SOUZA, Robson Francisco ; Fancincani, Agda P ; Ferraz, Andre L ; Ferro, Maria I ; Furlan, Luiz R ; Gimenez, Daniele F ; Jones, Jeffrey B ; Kitajima, Elliot W ; Laia, Marcelo L ; Leite, Rui P ; et.al. Novel insights into the genomic basis of citrus canker based on the genome sequences of two strains of Xanthomonas fuscans subsp. aurantifolii. BMC GENOMICS. v. 11, p. 238, 2010. Qualis: A2
113.	Moreira, Leandro M ; de Laia, Marcelo L ; De Souza, Robson F ; Zaini, Paulo A ; da Silva, Ana CR ; da Silva, Aline M ; Ferro, Jesus A. Development and validation of a Xanthomonas axonopodis pv. citri DNA microarray platform (XACarray) generated from the shotgun libraries previously used in the sequencing of this bacterial genome. BMC Research Notes. v. 3, p. 150, 2010. Qualis: B1
114.	MYERS, E. ; FISHER, P. S. ; IRWIN, K. ; Baek, J. ; Setubal, Joao C. The Complexity and Application of Syntactic Pattern Recognition Using Finite Inductive Strings. Em: Pattern Recognition in Bioinformatics 2010, 2010.Qualis: Não identificado (Pattern Recognition in Bioinformatics 2010)
115.	Nakaya, Helder I. (NIAID COOPERATIVE CENTERS ON HUMAN IMMUNOLOGY @ Baylor University Medical Center) Palestra: Systems Biology of Flu Vaccines. 2010. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
116.	NAVARRO, F.N. ; EVANGELISTA, A. F. ; MASSARO, J. D. ; MARTELLI-PALOMINO, G. ; CASTELLI, E. C. ; PASSOS, G. A. S. ; GIULIATTI, S. ; DONADI, E. A.. Sequence Analysis to Find microRNAs Binding Sites in HLA-G 3?UTR Region. Em: 56º Congresso Brasileiro de Genética, 2010, Guarujá, SP. Anais, p. 95-95, 2010.
117.	NICOLAU JUNIOR, N. ; GIULIATTI, S.. Modelling and Evaluation of the Tridimensional Strutucture of E5 an Oncoprotein from the Human Papillomavirus (HPV) Types 06 and 16. Em: ISCB Latin America, 2010, Montevideo. Posters, 2010.
118.	NICOLAU JUNIOR, N. ; GIULIATTI, S.. Modelling and Evaluation of the tridimensional Strutucture of E5 an Oncoprotein from the Human Papillomavirus (HPV) Types 06 and 16. 2010. Apresentação de Trabalho/Congresso
119.	NICOLAU JUNIOR, N. ; JUNTA, C. M. ; GIULIATTI, S.. Ab Initio Prediction of E5 Protein Strutucture from Cervical Human Papillomavirus (HPV). Em: ISMB 2010, 2010, Boston. Posters, 2010.
120.	NICOLAU JUNIOR, N. ; JUNTA, C. M. ; GIULIATTI, S.. Ab initio Prediction of E5 Protein Structure from Cervical Human Papillomavirus (HPV). Em: I Workshop do Programa de Pós-Graduação em Genética: Genética Básica, Genética Humana e Médica e Bioinformática, 2010, Ribeirão Preto, SP. Anais - CD, 2010.
121.	NICOLAU JUNIOR, N. ; JUNTA, C. M. ; GIULIATTI, S.. Ab Initio Prediction of E5 Protein Strutucture from Cervical Human Papillomavirus (HPV). 2010. Apresentação de Trabalho/Congresso
122.	NORONHA, M. F. ; CARAZZOLLE, M. F. ; PEREIRA, G. A. G. ; HASHIMOTO, R. F.. Gene connection probability patern analysis in yeast diauxic shift process. Em: 6th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology X-Meeting, 2010, Ouro Preto. 6th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology X-Meeting 2010, 2010.
123.	OIKAWA, M. K. ; MERINO, E. F. ; FERNANDEZ-BECERRA, C. ; WUNDERLICH, G. ; VILLALOBOS, J. M. ; SILVA, P. P. S. B. ; BARRERA, J. ; DURHAM, A. M. ; DELPORTILLO, H. A. ; FERREIRA, J. E.. CLINMALDB: A Clinical Field-Research Oriented Relational Database to Study Human Malaria. IADIS International Journal on WWWInternet. v. 8, p. 181-191, 2010.Qualis: C (IADIS INTERNATIONAL JOURNAL ON WWW/INTERNET)
124.	Oliveira Júnior, Clóvis J. F. ; Cavalari, Aline A. ; Carpita, Nicholas C. ; Buckeridge, Marcos S. ; BUCKERIDGE, M. S. ; Braga, Marcia R.. Cell wall polysaccharides from cell suspension cultures of the Atlantic Forest tree Rudgea jasminoides (Rubiaceae). Trees (Berlin. Print). v. 24, p. 713-722, 2010. Qualis: Não identificado (PRINT))
125.	OLIVEIRA, L. S. ; PASCHOAL, A. R. ; Durham, Alan Mitchell. Identification of non-coding RNA from Mycobacterium pathogenic strains. 2010. Apresentação de Trabalho/Congresso
126.	OLIVEIRA, LARIZA L. DE ; PERSINOTI, GABRIELA F. ; Giuliatti, Silvana ; TINÓS, RENATO. Feature Selection via Genetic Algorithms in the Classification of Anti-Snake Venom Medicinal Plants. LEARNING AND NONLINEAR MODELS. v. 8, p. 125-134, 2010. Qualis: B2
127.	Oliveira, S.T. ; MESSICK, J. B. ; BIONDO, A. W. ; Santos, A.P. ; GUIMARAES, A. M. S. ; MOHAMED, A. ; Pires Neto, J.A.S. ; Dalmonin, M.L. ; GONZALEZ, F. H. D.. Serum and Urinary C-Reactive Protein Concentrations in Dogs with Leptospirosis. Acta Scientiae Veterinariae (Online). v. 38, p. 243-247, 2010.Qualis: B1
128.	Oliveira, S.T. ; MESSICK, J. B. ; Santos, A.P. ; STEDILE, R. ; Guimaraes, A.M.S. ; MOHAMED, A. ; RIEDIGER, I. ; DALMOLIN, M. L. ; GONZALEZ, F. H. D. ; BIONDO, A. W.. Serum and urinary C reactive protein concentrations in dogs with leptospirosis. Em: ACVP/ASVCP Combined Annual Meeting, 2010, Baltimore, MD, USA. Veterinary Clinical Pathology, v. Suppl, p. 16, 2010.
129.	ONUCHIC, V. ; MACHADO-LIMA, A. ; Durham, Alan Mitchell. Procura de Padrões Estruturais em RNAs Utilizando Grafos. 2010. Apresentação de Trabalho/Comunicação
130.	PEREIRA, F. D. ; WICKERT, E. ; GIULIATTI, S. ; GOES, A.. Uso de Marcadores PCR-RFLP como Ferramenta na Diferenciação de Isolados de Guignardia Ciitricarpa e de Guignardia Mangiferae Provenientes de Tecidos Assintomáticos de Laranja Azeda (Citrus Aurantium). Em: 56º Congresso Brasileiro de Genética, 2010, Guarujá, SP. Anais, 2010.
131.	PEREIRA, F. D. ; WICKERT, E. ; GIULIATTI, S. ; GOES, A.. Uso de Marcadores PCR-RFLP como Ferramenta na Diferenciação de Isolados de Guignardia citricarpa e Guignardia mangiferae, Provenientes de Tecidos Assintomáticos de Laranja Azeda (Citrus aurantium). 2010. Apresentação de Trabalho/Congresso
132.	PEREIRA, R. D ; ALBUQUERQUE, L. A. R. S ; FERRIANI, V. P. L. ; GIULIATTI, S.. Histórico Familiar como Fator de Risco para o Desenvolvimento de Asma entre Crianças de 9 a 11 Anos. Em: 56º Congresso Brasileiro de Genética, 2010, Guarujá, SP. Anais, 2010.
133.	PEREIRA, R. D ; ALBUQUERQUE, L. A. R. S ; FERRIANI, V. P. L. ; GIULIATTI, S.. Histórico Familiar como Fator de Risco para o Desenvolvimento de Asma entre Crianças de 9 a 11 Anos. 2010. Apresentação de Trabalho/Congresso
134.	PETENATE, M. M. ; Giolo, S.R. ; SOLER, J. M. P.. Characterizing population genetic structure in outbred and inbred groups. Em: XXVth International Biometric Conference, 2010, Florianópolis. Proceedings of the XXVth IBC, 2010.
135.	Piedade, M. T. F. ; FERREIRA, C. ; OLIVEIRA-WITTMANN, A. ; BUCKERIDGE, M. S. ; Parolin, P.. Biochemistry of Amazonian Floodplain Vegetation. Em: Junk W.J., Piedade M.T.F., Parolin P., Wittmann F. & Schöngart J.. (Org.). Amazonian Floodplain Forests: Ecophysiology, Biodiversity and Sustainable Management: Ecological Studies. Heidelberg. : Springer. 2010.p. 127-139.
136.	PIGNATA, L. F. M ; DONAIRES, F. S. ; JUNTA, C. M. ; PASSOS JUNIOR, G. A. S. ; GIULIATTI, S.. Differentially Expressed Genes in Microarray Analysis of Rheumatoid Arthritis Disease. 2010. Apresentação de Trabalho/Congresso
137.	PIGNATA, L. F. M ; NICOLAU JUNIOR, N. ; DONAIRES, F. S. ; JUNTA, C. M. ; PASSOS, G. A. S. ; GIULIATTI, S.. Differentially Expressed Genes in Microarray Analysis of Rheumatoid Arthritis Disease. Em: I Workshop do Programa de Pós-Graduação em Genética: Genética Básica, Genética Humana e Médica e Bioinformática, 2010, Ribeirão Preto, SP. Anais - CD, 2010.
138.	PIGNATA, L. F. M ; NICOLAU-JUNIOR, NILSON ; DONAIRES, F. S. ; JUNTA, C. M. ; PASSOS JUNIOR, G. A. S. ; GIULIATTI, S.. Differentially Expressed Genes in Microarray Analysis of Rheumatoid Arthritis Disease. Em: ISCB Latin America, 2010, Montevideo. Posters, 2010.
139.	PINTO, B. J. ; PEREIRA-FACA, S. R. ; FACA, V. M. ; TOMAZELA, D.M. ; GIULIATTI, S.. ProGen Ap: a Pipeline for Automatic Proteogenomic Annotation of Important Organism Seeking the Discovery of New Potential Genes for Biotechnological Intervention Applied to Health. Em: I Workshop do Programa de Pós-Graduação em Genética: Genética Básica, Genética Humana e Médica e Bioinformática, 2010, Ribeirão Preto, SP. Anais - CD, 2010.
140.	Pulendran, Bali ; Li, Shuzhao ; Nakaya, Helder I.. Systems Vaccinology. Immunity (Cambridge, Mass.). v. 33, p. 516-529, 2010. Qualis: A1
141.	RIBEIRO, J. H. B. ; HASHIMOTO, R. F.. Pattern Recognition Based on Straight Line Segments. Em: Adam Herout. (Org.). Pattern Recognition, Recent Advances. Vienna. 2010.p. 167-188.
142.	RODRIGUES, I. G. S. ; FERRIANI, V. P. L. ; MELO, J. M. L. ; GIULIATTI, S.. Sistema de Auxílio a Análise de Dados de Doenças Reumáticas Pediátricas. Em: 56º Congresso Brasileiro de Genética, 2010, Guarujá, SP. Anais, 2010.
143.	RODRIGUES, M. G. F. ; MARTINS, A.B.G. ; GIULIATTI, S.. Análise da Metilação de DNA de Seleções de Figueira por MSAP e Sequenciamento. Em: I Workshop do Programa de Pós-Graduação em Genética: Genética Básica, Genética Humana e Médica e Bioinformática, 2010, Ribeirão Preto, SP. Anais - CD, 2010.
144.	ROZENCHAN, P. B. ; CARRARO, D. M. ; BRENTANI, H. P. ; MOTA, L. D. ; BASTOS, E. P. ; FERREIRA, E. N. E. ; TORRES, C. H. ; KATAYAMA, M. L. H. ; ROELA, R. A. ; LYRA, E. C. ; SOARES, F. A. ; FOLGUEIRA, M. A. A. K. ; GOES, J. C. G. S. ; BRENTANI, M. M.. Reciprocal changes in gene expression profiles of cocultured breast epithelial cells and primary fibroblasts. International Journal of Cancer (Print). v. 125, p. 2767-2777, 2010. Qualis: A1
145.	Sameshima, K; Brito, C. S. N. ; Takahashi, D. Y. ; Jorge, C. L. ; Castro, L. H. M. ; Baccalá, L. A.. Connectivity characterization of mesial temporal epileptic seizures using generalized Partial Directed Coherence with asymptotic statistics. Em: 29th International Congress of Clinical Neurophysiology, 2010, Kobe. Clinical Neurophysiology. New York: Elsevier, v. 121, 2010.
146.	Santos, A.P. ; Guimaraes, A.M.S. ; SAN MIGUEL, P ; MESSICK, J. B.. Complete Genomic Sequence and Annotation of the Feline Pathogen Mycoplasma haemofelis. Em: ACVP/ASVCP Combined Annual Meeting, 2010, Baltimore, MD, USA. Veterinary Pathology, v. 47, p. Suppl 11S, 2010.
147.	Sebollela, Adriano ; Freitas-Corrêa, Léo ; Oliveira, Fábio F. ; Mendes, Camila T. ; Wasilewska-Sampaio, Ana Paula ; Camacho-Pereira, Juliana ; Galina, Antonio ; BRENTANI, HELENA ; Passetti, Fabio ; Felice, Fernanda G. ; Dias-Neto, Emmanuel ; Ferreira, Sérgio T.. Expression Profile of Rat Hippocampal Neurons Treated with the Neuroprotective Compound 2,4-Dinitrophenol: Up-Regulation of cAMP Signaling Genes. Neurotoxicity Research. v. 18, p. 112-123, 2010. Qualis: A3
148.	Shulaev, Vladimir ; Sargent, Daniel J ; Crowhurst, Ross N ; Mockler, Todd C ; Folkerts, Otto ; Delcher, Arthur L ; Jaiswal, Pankaj ; Mockaitis, Keithanne ; Liston, Aaron ; Mane, Shrinivasrao P ; Burns, Paul ; Davis, Thomas M ; Slovin, Janet P ; Bassil, Nahla ; Hellens, Roger P ; Evans, Clive ; Harkins, Tim ; Kodira, Chinnappa ; Desany, Brian ; SETUBAL, J. C. ; et.al. The genome of woodland strawberry (Fragaria vesca). Nature Genetics (Print). v. 43, p. 109-116, 2010. Qualis: A1
149.	Simões, C. S. ; Vianney, P. V. R. ; Moura, M. M. ; Freire, M. A.M. ; Mello, L. E. ; Araújo, J. F. ; Sameshima, Koichi ; Mello, C. V. ; Ribeiro, S.. Activation of frontal neocortical areas by vocal production in marmosets. Frontiers in Integrative Neuroscience. v. 4, p. 1-12, 2010. Qualis: A2
150.	Soccol, Carlos Ricardo ; Vandenberghe, Luciana Porto de Souza ; Medeiros, Adriane Bianchi Pedroni ; Karp, Susan Grace ; Buckeridge, Marcos ; BUCKERIDGE, M. S. ; Ramos, Luiz Pereira ; Pitarelo, Ana Paula ; Ferreira-Leitão, Viridiana ; Gottschalk, Leda Maria Fortes ; Ferrara, Maria Antonieta. Bioethanol from lignocelluloses: Status and perspectives in Brazil. Bioresource Technology. v. 101, p. 4820-4825, 2010. Qualis: A1
151.	SOLER, J. M. P.; Giolo, S.R. ; de Andrade, M. ; Duarte, N.E.. Explorando a Flexibilidade do Modelo Misto no Mapeamento de Genes. Em: XVIII Congresso Anual da Sociedade Portuguesa de Estatística, 2010, São Pedro do Sul. XVIII Congresso Anual da Sociedade Portuguesa de Estatística, 2010.
152.	SOLER, J. M. P.; Giolo, S.R. ; Duarte, N.E. ; SOUZA, M.. A method to teach genetic variability to undergraduate students. Em: 8th International Conference on Teaching Statistics, 2010, Ljubljana. Proceedings ICOTS8, 2010. Qualis: Não identificado (8TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON TEACHING STATISTICS, 2010, LJUBLJANA. PROCEEDINGS ICOTS8)
153.	SOLER, J. M. P.; Giolo, S.R. ; PEREIRA, A. C. ; de Andrade, M. ; KRIEGER, J. E.. Evaluating gene by sex and age interactions on cardiovascular risk factors in Brazilian families. BMC Medical Genetics (Online). v. 11, p. 132, 2010. Qualis: A4
154.	SOLER, J. M. P.; Giolo, S.R. ; PEREIRA, A. C. ; PETENATE, M. M.. Estudando o Efeito de Medicamentos Através do Gráfico da Variável Adicionada em Modelos Mistos. Em: XVIII Congresso Anual da SPE, 2010, São Pedro do Sul. Anais do XVIII Congresso Anual da SPE - SPE2010, 2010.
155.	SOLER, J. M. P.; NEVES, C. E. ; Giolo, S.R. ; ANDRADE, D. ; de Andrade, M. ; MIYAKAWA, A.. Analyzing gene expression data through quantitative and categorical approaches in congenic rat strains. Em: XXVth International Biometric Conference, 2010, Florianópolis. Proceedings of the XXVth IBC, 2010.
156.	SOLER, J. M. P.; SOLER, A. M. ; ANDRADE, D.. Measuring Luck with a Questionary. Em: 8th International Conference on Teaching Statistics, 2010, Ljubljana. Proceedings ICOTS8, 2010. Qualis: Não identificado (8TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON TEACHING STATISTICS, 2010, LJUBLJANA. PROCEEDINGS ICOTS8)
157.	Souza, Beatriz M. ; Molfetta-Machado, Jeanne B. ; Freschi, Luciano ; Figueira, Antonio ; Purgatto, Eduardo ; Buckeridge, Marcos S. ; BUCKERIDGE, M. S. ; Sluys, Marie-Anne ; Mercier, Helenice. Axillary bud development in pineapple nodal segments correlates with changes on cell cycle gene expression, hormone level, and sucrose and glutamate contents. In Vitro Cellular & Developmental Biology. Plant. v. 46, p. 281-288, 2010. Qualis: C
158.	SOUZA, I. ; FERRIANI, V. P. L. ; MELO, J. M. L. ; GIULIATTI, S.. Sistema de Auxilio a Análise de Dados de Doenças Reumáticas Pediátricas. 2010. Apresentação de Trabalho/Congresso
159.	Takahashi, D. Y. ; Baccalá, L. A. ; Sameshima, K.. Frequency domain connectivity: An information theoretic perspective. Em: the 32nd Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, p. 1726-1729, 2010. Qualis: Não identificado (the 32nd Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society)
160.	Takahashi, D. Y. ; Baccalá, L. A. ; Sameshima, Koichi. Information theoretic interpretation of frequency domain connectivity measures. Biological Cybernetics. v. 103, p. 463-469, 2010. Qualis: A2
161.	Takecian, Pedro L. ; Ferreira, João E. ; Malkowski, Simon ; Pu, Calton. Using LOTOS for rigorous specifications of workflow patterns. Em: 6th International ICST Conference on Collaborative Computing: Networking, 2010. Qualis: Não identificado (6th International ICST Conference on Collaborative Computing: Networking)
162.	TANAKA, E. A. ; JUNTA, C. M. ; VAGNINI, L ; BARANAUSKAS, J. A. ; GIULIATTI, S. Um Sistema Computacional Integrando Suporte à Decisão na Área de Reprodução Humana. Em: CBIS 2010: XII Congresso Brasileiro de Informática em Saúde, 2010, Porto de Galinhas, PE. Anais, 2010.
163.	Tang, Hua ; Cao, Weiping ; Kasturi, Sudhir Pai ; Ravindran, Rajesh ; Nakaya, Helder I ; Kundu, Kousik ; Murthy, Niren ; Kepler, Thomas B ; Malissen, Bernard ; Pulendran, Bali. The T helper type 2 response to cysteine proteases requires dendritic cell¿basophil cooperation via ROS-mediated signaling. Nature Immunology. v. 11, p. 608-617, 2010. Qualis: A1
164.	Tiller, R. V. ; Gee, J. E. ; Frace, M. A. ; Taylor, T. K. ; SETUBAL, J. C. ; Hoffmaster, A. R. ; De, B. K.. Characterization of novel Brucella strains originating from wild native rodent species in North Queensland, Australia. Applied and Environmental Microbiology (Print). v. 76, p. 5837-5845, 2010. Qualis: A1
165.	TONINI, P. P. ; Purgatto, E. ; BUCKERIDGE, M. S.. Effects of abscisic acid, ethylene and sugars on the mobilization of storage proteins and carbohydrates in seeds of the tropical tree Sesbania virgata (Leguminosae). Annals of Botany (Print). v. 106, p. 607-616, 2010. Qualis: A1
166.	Tonini, Patricia P. ; Carrara, Thalita B. ; Buckeridge, Marcos S. ; BUCKERIDGE, M. S.. Storage proteins and cell wall mobilisation in seeds of Sesbania virgata (Cav.) Pers. (Leguminosae). Trees (Berlin. Print). v. 24, p. 675-684, 2010. Qualis: Não identificado (PRINT))
167.	TORRES, T.T. New World screw-worm fly functional genomics: a first step towards understanding the evolution of parasitism in Calliphoridae. 2010. Apresentação de Trabalho/Congresso
168.	TORTO-ALALIBO, T. ; Collmer, C. W. ; GWINN-GIGLIO, M. ; Lindeberg, M. ; Meng, S. ; Chibucos, M. C. ; Tseng, T.-T. ; Lomax, J. ; Biehl, B. ; Ireland, A. ; Bird, D. ; Dean, R. A. ; Glasner, J. D. ; PERNA, N. ; SETUBAL, J. C. ; COLLMER, A. ; Tyler, B. M.. Unifying Themes in Microbial Associations with Animal and Plant Hosts Described Using the Gene Ontology. Microbiology and Molecular Biology Reviews. v. 74, p. 479-503, 2010. Qualis: Não identificado (MICROBIOLOGY AND MOLECULAR BIOLOGY REVIEWS)
169.	Ullmann, Leila Sabrina ; da Silva, Rodrigo Costa ; de Moraes, Wanderlei ; Cubas, Zalmir Silvino ; dos Santos, Leonilda Correia ; Hoffmann, Juliano Leônidas ; Moreira, Nei ; Guimaraes, Ana Marcia Sa ; Montaño, Patrícia ; Langoni, Helio. Serological survey of Toxoplasma gondii in captive Neotropical felids from Southern Brazil. Veterinary Parasitology (Print). v. 172, p. 144-146, 2010. Qualis: A1
170.	Venancio, Thiago M. ; Wilson, R. Alan ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; DEMARCO, Ricardo. Bursts of transposition from non-long terminal repeat retrotransposon families of the RTE clade in Schistosoma mansoni. International Journal for Parasitology. v. 40, p. 743-749, 2010. Qualis: A1
171.	VIBRANOVSKI, M. D. Genome Evolution Seeing Through the Gametogenesis. 2010. Apresentação de Trabalho/Seminário
172.	VIBRANOVSKI, M. D. Evolucao Genomica vista atraves da gametogeneses. 2010. Apresentação de Trabalho/Seminário
173.	VIBRANOVSKI, M. D. Evolucao Genomica vista atraves da gametogeneses. 2010. Apresentação de Trabalho/Seminário
174.	VIBRANOVSKI, M. D.; CHALOPIN, D.S. ; LOPES, H. F. ; LONG, M. ; KARR, T. L.. Direct Evidence for Postmeiotic Transcription During Drosophila melanogaster Spermatogenesis. Genetics (Austin, Tex.). v. 186, p. 431-433, 2010. Qualis: A2
175.	Wang, Jianping ; Roe, Bruce ; Macmil, Simone ; Yu, Qingyi ; Murray, Jan ; Tang, Haibao ; Chen, Cuixia ; Najar, Fares ; Wiley, Graham ; Bowers, John ; Van Sluys, Marie-Anne ; Rokhsar, Daniel S ; Hudson, Matthew E ; Moose, Stephen P ; Paterson, Andrew H ; Ming, Ray. Microcollinearity between autopolyploid sugarcane and diploid sorghum genomes. BMC Genomics. v. 11, p. 261, 2010. Qualis: A2
176.	Warren, Andrew S ; Archuleta, Jeremy ; Feng, Wu-chun ; Setubal, Joao Carlos. Missing genes in the annotation of prokaryotic genomes. BMC BIOINFORMATICS. v. 11, p. 131, 2010. Qualis: A1
177.	WU, QINYI ; Pu, Calton ; Ferreira, Joao Eduardo. A partial persistent data structure to support consistency in real-time collaborative editing. p. 776, 2010. Qualis: Não identificado ()
178.	YANG, K. ; Setubal, Joao C. Homology prediction refinement and reconstruction of gene content and order of ancestral bacterial genomes. Em: ACM International Conference on Bioinformatics and Computational Biology 2010, 2010.Qualis: Não identificado (ACM International Conference on Bioinformatics and Computational Biology 2010)
179.	ZHANG, Y. E. ; VIBRANOVSKI, M. D. ; KRINSKY, B. H. ; LONG, M.. Age-dependent chromosomal distribution of male-biased genes in Drosophila. Genome Research. v. 20, p. 1526-1533, 2010. Qualis: A1
180.	ZHANG, YONG E. ; VIBRANOVSKI, MARIA D. ; LANDBACK, PATRICK ; MARAIS, GABRIEL A. B. ; LONG, MANYUAN. Chromosomal Redistribution of Male-Biased Genes in Mammalian Evolution with Two Bursts of Gene Gain on the X Chromosome. PLoS Biology (Online). v. 8, p. e1000494, 2010. Qualis: A1

2009

1.	ACUNA-ALONZO, V. ; HÜNEMEIER, T.. La variante R230C del gen ABCA1 en América. 2009. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
2.	ALMEIDA, F. M. ; BONINI, B. M. ; BETON, Daniela ; Jorge, J.A. ; TERENZI, H. F. ; DA SILVA, A. M.. Heterologous expression in Escherichia coli of Neurospora crassa neutral trehalase as an active enzyme. Protein Expression and Purification. v. 65, p. 185-189, 2009. Qualis: B2
3.	Almeida, Nalvo F. ; Yan, Shuangchun ; Lindeberg, Magdalen ; Studholme, David J. ; Schneider, David J. ; Condon, Bradford ; Liu, Haijie ; Viana, Carlos J. ; Warren, Andrew ; Evans, Clive ; Kemen, Eric ; MacLean, Dan ; Angot, Aurelie ; Martin, Gregory B. ; Jones, Jonathan D. ; Collmer, Alan ; Setubal, Joao C. ; Vinatzer, Boris A.. A Draft Genome Sequence of Pseudomonas syringae pv. tomato T1 Reveals a Type III Effector Repertoire Significantly Divergent from That of Pseudomonas syringae pv. tomato DC3000. Molecular Plant-Microbe Interactions. v. 22, p. 52-62, 2009. Qualis: A1
4.	AMARAL, L. I. V. ; Cortelazzo, Ângelo L. ; CORTELAZZO, A. L. ; BUCKERIDGE, M. S. ; PEREIRA, L. A. R.. Anatomical and biochemical changes in the composition of developing seed coats of annatto (Bixa orellana L.). Trees (Berlin). v. 23, p. 287-293, 2009. Qualis: A2
5.	ANEAS, I. ; Rodrigues, MV ; Pauletti, BA ; Silva, GJJ ; Carmona, R ; Cardoso, L ; Kwitek, AE ; Jacob, HJ ; SOLER, J. M. P. ; KRIEGER, J. E.. Congenic strains provide evidence that four mapped loci in chromosomes 2, 4, and 16 influence hypertension in the SHR. Physiological Genomics (Print). v. 3, p. 52-57, 2009.Qualis: A3
6.	Arashiro, P. ; Eisenberg, I. ; Kho, A. T. ; Cerqueira, A. M. P. ; Canovas, M. ; Silva, H. C. A. ; Pavanello, R. C. M. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S. ; Kunkel, L. M. ; ZATZ, M.. Transcriptional regulation differs in affected facioscapulohumeral muscular dystrophy patients compared to asymptomatic related carriers. PNAS. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. v. 106, p. 6220-6225, 2009. Qualis: A1
7.	BETTONI, F. ; CAMARGO FILHO, F. ; GROSSO, D. M. ; GALANTE, P. A. F. ; PARMIGIANI, R. B. ; GERALDO, M. V. ; SILVA, F. H. ; OBA-SHINJO, S. M. ; MARIE, S. K. M. ; SOARES, F. A. ; BRENTANI, H. P. ; SIMPSON, A. J. G. ; DE SOUZA, S. J. ; CAMARGO, A. A.. Identification of FAM46D as a novel cancer/testis antigen using EST data and serological analysis. Genomics (San Diego). v. 94, p. 153-160, 2009. Qualis: A3
8.	BIONDO, A. W. ; Santos, A.P. ; GUIMARAES, A. M. S. ; VIEIRA, R. F. C. ; VIDOTTO, O. ; MACIEIRA, D. ; Almosny, N.R.P. ; Molento, Marcelo B. ; TIMENETSKY, J. ; de Morais, H. A. ; GONZALEZ, F. H. D. ; MESSICK, J. B.. A review of the occurrence of hemoplasmas (hemotrophic mycoplasmas) in Brazil.. Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária. v. 18, p. 1-7, 2009.Qualis: A2
9.	BITARELLO, B.D. ; TORRES, T.T. ; LYRA, M.L. ; AZEREDO-ESPIN, A.M.L.. Development of polymorphic microsatellite markers for the human botfly, Dermatobia hominis (Diptera: Oestridae). Molecular Ecology Resources (Online). v. 9, p. 409-411, 2009. Qualis: A1
10.	BOES, K. ; GONKAROVCS, ; HALIK, L. ; THOMPSON, C. A. ; Santos, A.P. ; GUIMARAES, A. M. S. ; MISKOVIC, M. ; MESSICK, J. B.. Identification of a Mycoplasma ovis-like organism in white-tailed deer (Odocoileus virginianus). Em: ASVCP/ACVP Meeting, 2009, Monterrey. Veterinary Pathology, v. 46, p. 1024, 2009.
11.	BRAGHETTO, K. R. ; FERREIRA, J. E. ; PU, C.. NPTool: Towards Scalability and Reliability of Business Process Management (preprint). Em: Joaquim Filipe; Mohammad S. Obaidat. (Org.). (Org.). e-Business and Telecommunications, Communications in Computer and Information Science.. 1ed.Berlin, Heidelberg. : Springer. 2009.v. 48, p. 99-112.
12.	BRENTANI, H. P. Seminários avançados em tecnologia de microarrays. 2009. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
13.	BUCKERIDGE, M. S. Programa BIOEN/FAPESP. 2009. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
14.	BUCKERIDGE, M. S. Bioenergia: um desafio científico e tecnológico para o Brasil. 2009. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
15.	BUCKERIDGE, M. S. Perspectivas e Investimentos da FAPESP em Bioenergia. 2009. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
16.	BUCKERIDGE, M. S. Overview in Biofuels Research in Brasil. 2009. Apresentação de Trabalho/Outra
17.	BUCKERIDGE, M. S. Feedstock Biochemistry Applied to Biofuels. 2009. Apresentação de Trabalho/Outra
18.	BUCKERIDGE, M. S. Florestas ou etanol? Um dilema brasileiro para o século XXI. 2009. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
19.	BUCKERIDGE, M. S. Science and Technology: Overview in Biofuels Research in Brazil. 2009. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
20.	BUCKERIDGE, M. S. Entraves e facilitadores para a pesquisa multidisciplinar. 2009. Apresentação de Trabalho/Outra
21.	BUCKERIDGE, M. S. Respostas Fisiológicas, Bioquímicas e Moleculares de Plantas do Brasil às Mudanças Climáticas Globais. 2009. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
22.	BUCKERIDGE, M. S. Perspectivas e investimentos da FAPESP em Bioenergia. 2009. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
23.	Buckeridge, Marcos S.; A bioenergia que nos aproxima: num exemplo de maturidade, governos, empresas e entidades se uniram para bancar a pesquisa que pode nos manter como líderes em biocombustíveis renováveis. . Revista Pesquisa FAPESP online, São Paulo, 04 jun. 2009.
24.	Buckeridge, Marcos S.; Terra, água e biocombustíveis Brasileiros, argentinos e americanos vão discutir os impactos da produção de energia renovável em workshop em Atibaia. . Revista Pesquisa FAPESP online, São Paulo, 09 ago. 2009.
25.	Buckeridge, Marcos S.; Uma sopa que dá ciência: misturando saberes de distintas disciplinas, a pesquisa transdisciplinar ganha terreno. . Revista Pesquisa FAPESP online, 23 jun. 2009.
26.	CALMON, M. F. ; RODRIGUES, R. V. ; KANETO, C. M. ; MOURA, R. P. ; SILVA, S. D. ; MOTA, L. D. C. ; PINHEIRO, D. G. ; TORRES, C. H. ; CARVALHO, A. F. ; CURY, P. M. ; NUNES, F. D. ; NISHIMOTO, I. N. ; SOARES, F. A. ; SILVA, A. M. ; KOWALSKI, L. P. ; BRENTANI, H. ; ZANELLI, C. ; SILVA, W. A. ; RAHAL, P. ; TAJARA, H. H. ; et.al. Epigenetic silencing of CRABP2 and MX1 in head and neck tumors. Neoplasia (New York, N.Y.). v. 11, p. 1329-1339, 2009. Qualis: A2
27.	CANTAO, M. ; ARAÚJO, L. V. ; LEMOS, E. G. M. ; FERREIRA, J. E.. Optimal Clone Identifier based on Dynamic Rules and Process Algebra. Em: International Conference on Bioinformatics, p. 13-16, 2009.Qualis: Não identificado (International Conference on Bioinformatics)
28.	CARDOSO, G.A. ; CARVALHO, R.A. ; AZEREDO-ESPIN, A.M.L. ; TORRES, T.T.. Análise da expressão de genes relacionados ao comportamento alimentar na família Calliphoridae. Em: 9o. Congresso Nacional de Iniciação Científica, 2009, São Paulo, SP. Anais do 9o. Congresso Nacional de Iniciação Científica, 2009. Qualis: Não identificado (9O. CONGRESSO NACIONAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 2009, SÃO PAULO, SP. ANAIS DO 9O. CONGRESSO NACIONAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA)
29.	CARVALHO, R.A. ; AZEREDO-ESPIN, A.M.L. ; TORRES, T. T.. High-throughput gene discovery in the New World screwworm fly, Cochliomyia hominivorax (Diptera: Calliphoridae) using the 454 sequencing technology. Em: 55o. Congresso Brasileiro de Genética, 2009, Águas de Lindóia, SP. Resumos do 55o. Congresso Brasileiro de Genética, 2009.
30.	CARVALHO, R.A. ; TORRES, T. T. ; PANIAGO, M.D.G. ; AZEREDO-ESPIN, A.M.L.. Molecular characterization of esterase E3 gene associated with organophosphorus insecticide resistance in the New World screwworm fly,. Medical and Veterinary Entomology. v. 23, p. 86-91, 2009. Qualis: A2
31.	Castelli, Erick C. ; Moreau, Philippe ; Chiromatzo, Alynne Oya e ; Mendes-Junior, Celso Teixeira ; Veiga-Castelli, Luciana C. ; Yaghi, Layale ; Giuliatti, Silvana ; Carosella, Edgardo D. ; Donadi, Eduardo Antonio. In silico analysis of microRNAS targeting the HLA-G 3⿲ untranslated region alleles and haplotypes. Human Immunology. v. 70, p. 1020-1025, 2009. Qualis: B1
32.	Chibucos, Marcus C. ; Tseng, Tsai-Tien ; Setubal, João C.. Describing commonalities in microbial effector delivery using the Gene Ontology. Trends in Microbiology. v. 17, p. 312-319, 2009. Qualis: A1
33.	COCIO, T. A. ; NASCIMENTO, E. ; MARQUES, E. R. ; BRAGA, G. U. L. ; GIULIATTI, S. Contagem In Silico de Dímeros de Pirimidina do Tipo Ciclobutano (CPD) no Genoma de Aspergillus nidulans e Aspergillus fumigatus. Em: 17º SIICUSP: Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo, 2009, Ribeirão Preto, SP. Anais, 2009.
34.	Corrêa Soares, Juliana B. R. ; Menezes, Diego ; Vannier-Santos, Marcos A. ; Ferreira-Pereira, Antonio ; Almeida, Giulliana T. ; Venancio, Thiago M. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; Zishiri, Vincent K. ; Kuter, David ; Hunter, Roger ; Egan, Timothy J. ; Oliveira, Marcus F.. Interference with Hemozoin Formation Represents an Important Mechanism of Schistosomicidal Action of Antimalarial Quinoline Methanols. Plos Neglected Tropical Diseases. v. 3, p. e477, 2009. Qualis: A1
35.	da Cunha, J. P. C. ; Old, L. J. ; Caballero, O. ; de SOUZA, Robson Francisco ; de Souza, J. E. ; de Souza, S. J. ; Ohara, D. T. ; Gama-Rodrigues, J. ; Oba-Shinja, S. M. ; Galante, P. A. F. ; Stransky, B. ; Simpson, A. J. ; Carvalho, P. M. ; SILVA, W. A. ; Moura, R. P. ; Moore, J. ; marie sk ; MARIE, S. K. N. ; Habr-Gama, A. ; Pieprzyk, M. ; et.al. Bioinformatics construction of the human cell surfaceome. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (Online). v. 106, p. 16752-16757, 2009. Qualis: A1
36.	DE ARAÚJO, LUCIANO V. ; SANABANI, SABRI S. ; Sabino, Ester C. ; Ferreira, João E.. HIVSetSubtype. Em: the 2009 ACM symposium, p. 811, 2009. Qualis: Não identificado (the 2009 ACM symposium)
37.	de Setta, Nathalia ; Van Sluys, Marie-Anne ; Capy, Pierre ; Carareto, Claudia MA. Multiple invasions of Gypsy and Micropia retroelements in genus Zaprionus and melanogaster subgroup of the genus Drosophila. BMC Evolutionary Biology (Online). v. 9, p. 279, 2009. Qualis: A1
38.	De Souza, Robson F; Iyer, Lakshminarayan M ; Aravind, L. The Anabaena sensory rhodopsin transducer defines a novel superfamily of prokaryotic small-molecule binding domains. Biology Direct. v. 4, p. 25, 2009. Qualis: Não identificado (BIOLOGY DIRECT)
39.	DEMARCO, Ricardo ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S.. Schistosomes - proteomics studies for potential novel vaccines and drug targets. Drug Discovery Today. v. 14, p. 472-478, 2009. Qualis: A1
40.	DIAS-NETO, Emmanuel ; Nunes, Diana N. ; Giordano, Ricardo J. ; Sun, Jessica ; Botz, Gregory H. ; Yang, Kuan ; Setubal, João C. ; Pasqualini, Renata ; Arap, Wadih ; HO, Paulo Lee. Next-Generation Phage Display: Integrating and Comparing Available Molecular Tools to Enable Cost-Effective High-Throughput Analysis. Plos One. v. 4, p. e8338, 2009. Qualis: A1
41.	Diogo, Luciana C. ; Fernandes, Renata S. ; Marcussi, Silvana ; Menaldo, Danilo L. ; Roberto, Patrí­cia G. ; Matrangulo, Paula V. F. ; Pereira, Paulo S. ; França, Suzelei C. ; Giuliatti, Silvana ; Soares, Andreimar M. ; Lourenço, Miriam V.. Inhibition of Snake Venoms and Phospholipases A 2 by Extracts from Native and Genetically Modified Eclipta alba : Isolation of Active Coumestans. Basic & Clinical Pharmacology & Toxicology (Print). v. 104, p. 293-299, 2009. Qualis: A3
42.	DOMINGUES, H. ; Kon, F ; FERREIRA, J. E.. Replicação assíncrona em bancos de dados evolutivos. Em: Simpósio Brasileiro de Banco de Dados, 2009.Qualis: Não identificado (Simpósio Brasileiro de Banco de Dados)
43.	DUARTE G. L. ; DOMINGUES, H. ; Kon, F ; FERREIRA, J. E.. Heterogeneidade como solução para bancos de dados móveis em um sistema de saúde. Em: Workshop de Informática Médica, p. 2025-2034, 2009.Qualis: Não identificado (Workshop de Informática Médica)
44.	Duarte, N.E. ; Giolo, S.R. ; Pereira, A.C. ; SOLER, J. M. P.. Controlando o efeito de estratificação através de variáveis latentes no mapeamento de genes. Em: XI Escola de Modelos de Regressão, 2009.Qualis: Não identificado (XI Escola de Modelos de Regressão)
45.	DURHAM, A. M.; ARAUJO, F.M. ; MACHADO-LIMA, A. ; TEIXEIRA, R. ; OLIVEIRA, G.. Sequence and structural analysis of the 5- noncoding region of hepatitis C virus in patients with chronic infection. Journal of Medical Virology. v. 81, p. 1212-1219, 2009. Qualis: B1
46.	Dzirasa, K. ; Ramsey, A.J. ; Takahashi, D. Y. ; Stapleton, J. ; Potes, J. M. ; Williams, J.K. ; Gainetdinov, R. R. ; Sameshima, K ; Caron, M. G. ; Nicolelis, M. A. L.. Hyperdopaminergia and NMDA receptor hypofunction disrupt neural phase signaling. The Journal of Neuroscience. v. 29, p. 8215-8224, 2009. Qualis: A1
47.	EVANGELISTA, A. F. ; FONTANA, V ; DERNOWSEK, J.A. ; JUNTA, C. M. ; MARQUES, M. M. ; BERNARDES, L. A. S. ; SIMÕES, B.P. ; BOMBONATO-PRADO, K.F. ; OLIVEIRA, P.T. ; ROSA, A. L. ; SAKAMOTO-HOJO, E. T. ; GIULIATTI, S. ; PASSOS, G. A. S.. Transcriptional Gene Network Regulation and Transcription Factors in the Control of Cell Fate of Human Mesenchymal Stem Cells to Normal Osteogenic Differentiation or Carcinogenesis. Em: 55º Congresso Brasileiro de Genética, 2009, Águas de Lindóia, SP. Anais, p. 313-313, 2009.
48.	Ferreira, C. d. S. ; Piedade, M. T. F. ; Tine, M. A. S. ; Rossatto, D. R. ; Parolin, P. ; BUCKERIDGE, M. S.. The role of carbohydrates in seed germination and seedling establishment of Himatanthus sucuuba, an Amazonian tree with populations adapted to flooded and non-flooded conditions. Annals of Botany (Print). v. 104, p. 1111-1119, 2009. Qualis: A1
49.	FOLGUEIRA, M. A. A. K. ; BRENTANI, H. P. ; CARRARO, D. M. ; BARROS FILHO, M. C. ; KATAYAMA, M. L. H. ; ABREU, A. P. S. ; BARBOSA, E. M. ; OLIVEIRA, C. T. ; PATRÃO, D. F. C. ; MOTA, L. D. ; MOURÃO NETO, M. ; CALDEIRA, J. R. F. ; BRENTANI, M. M.. Gene expression profile of residual breast cancer after doxorubicin and cyclophosphamide neoadjuvant chemotherapy. Oncology Reports. v. 22, p. 805-813, 2009. Qualis: A3
50.	Freschi, Luciano ; Nievola, Catarina Carvalho ; Rodrigues, Maria Aurineide ; DOMINGUES, Douglas Silva ; Van Sluys, Marie-Anne ; Mercier, Helenice. Thermoperiod affects the diurnal cycle of nitrate reductase expression and activity in pineapple plants by modulating the endogenous levels of cytokinins. Physiologia plantarum (Kobenhavn. 1948). v. 137, p. 201-212, 2009. Qualis: Não identificado (1948))
51.	Gillespie, Joseph J. ; Ammerman, Nicole C. ; Dreher-Lesnick, Sheila M. ; Rahman, M. Sayeedur ; Worley, Micah J. ; Setubal, Joao C. ; Sobral, Bruno S. ; Azad, Abdu F.. An Anomalous Type IV Secretion System in Rickettsia Is Evolutionarily Conserved. Plos One. v. 4, p. e4833, 2009. Qualis: A1
52.	Giolo, S.R. ; SOLER, J. M. P. ; de Andrade, M. ; KRIEGER, J. E. ; PEREIRA, A. C.. Population Structure in Brazilian and other Worldwide Human Populations Revealed by SNP arrays. Em: 59th American Society of Human Genetics Annual Meeting, 2009, Honolulu, Hawaii. Proceedings, ASHG 59th Annual Meeting, 2009.
53.	Giolo, S.R. ; SOLER, J. M. P. ; de Andrade, M. ; KRIEGER, J. E. ; Pereira, A.C.. Population Structure in Brazilian and other Wordwide Human Populations Revealed by SNP Arrays. Em: 54a RBRAS e 13o SEAGRO, 2009. Qualis: Não identificado (54a RBRAS e 13o SEAGRO)
54.	GODOY, J. R. L. DE ; MARABESI, M. ; MORTARI L.C. ; AIDAR, M. P. M. ; BUCKERIDGE, M. S.. A dinâmica da floresta neotropical e as mudanças climáticas globais. Naturalia (São José do Rio Preto). v. 32, p. 53-66, 2009.Qualis: Não identificado (NATURALIA)
55.	Guerreiro-Junior, V ; HÜNEMEIER, T. ; Marrero, AR ; SALZANO, F. M. ; BORTOLINI, M. C.. Genetic signatures of parental contribution in black and white populations in Brazil. Genetics and Molecular Biology (Impresso). v. 32, p. 1-11, 2009. Qualis: A4
56.	GUIMARAES, A. M. S.; BRANDAO, P. ; MORAES, W. ; CUBAS, Z. S. ; SANTOS, L. C. ; VILLAREAL, L. Y. B. ; ROBES, R. ; COELHO, F. ; RESENDE, M. ; SANTOS, R. C. F. ; OLIVEIRA, R. C. ; YAMAGUTI, M. ; MARQUES, L. M. ; LOPES NETO, R. ; BUZINHANI, M. ; Marques R. ; MESSICK, J. B. ; BIONDO, A. W. ; TIMENETSKY, J.. Survey of feline leukemia virus and feline coronaviruses in captive neotropical wild felids from Southern Brazil. Journal of Zoo and Wildlife Medicine. v. 40, p. 360-364, 2009.Qualis: A3
57.	HASHIMOTO, R. F.; STAGNI, H. ; HIGA, C. H. A.. Budding Yeast Cell Cycle Modeled by Context-Sensitive Probabilistic Boolean Network. Em: IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics, p. 1-4, 2009. Qualis: Não identificado (IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics)
58.	HIGA, C. H. A. ; HASHIMOTO, R. F. ; HIRATA JR., R. ; HIRATA, Nina S. T. ; SANTOS, C. S.. Inference of Gene Regulatory Network using Temporal Coefficient of Determination Obtained from Ergodic Markov Chains. Em: IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics, p. 1-4, 2009. Qualis: Não identificado (IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics)
59.	HÜNEMEIER, T. La Historia y Estrutura Genética de la Población Brasilena. 2009. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
60.	HÜNEMEIER, T.; SALZANO, F. M. ; BORTOLINI, M. C.. TCOF1 T / Ser variant and brachycephaly in dogs. Animal Genetics. v. 40, p. 357-358, 2009. Qualis: A1
61.	Jucimara Colombo ; Fachel, Ângela A. ; Calmon, Marilia Freitas ; Patricia M. Cury ; Érica Erina Fukuyama ; Eloiza Helena Tajara ; Jose Antonio Cordeiro ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S. ; Reis, Eduardo M. ; Paula Rahal. Gene expression profiling reveals molecular marker candidates of laryngeal squamous cell carcinoma. Oncology Reports. v. 21, p. 649-663, 2009. Qualis: A3
62.	Junta, Cristina Moraes ; Sandrin-Garcia, Paula ; Fachin-Saltoratto, Ana Lúcia ; Mello, Stephano Spanó ; Oliveira, Rene D. R. ; Rassi, Diane Meyre ; Giuliatti, Silvana ; Sakamoto-Hojo, Elza Tiemi ; Louzada-Junior, Paulo ; Donadi, Eduardo Antonio ; Passos, Geraldo A. S.. Differential gene expression of peripheral blood mononuclear cells from rheumatoid arthritis patients may discriminate immunogenetic, pathogenic and treatment features. Immunology (Oxford. Print). v. 127, p. 365-372, 2009. Qualis: Não identificado (PRINT))
63.	KOFLER, R. ; Teixeira Torres, Tatiana ; LELLEY, T. ; SCHLÖTTERER, C.. PanGEA: Identification of allele specific gene expression using the 454 technology. BMC Bioinformatics. v. 10, p. 143, 2009. Qualis: A1
64.	KOIDE, T. O papel do transcriptoma em Biologia Sistêmica: microarrays e sequenciamento. 2009. Apresentação de Trabalho/Outra
65.	KOIDE, T. Biologia sistêmica do extremófilo Halobacterium salinarum: estrutura e dinâmica do transcriptoma. 2009. Apresentação de Trabalho/Seminário
66.	KOIDE, T. Biologia sistêmica do extremófilo Halobacterium salinarum: estrutura e dinâmica do transcriptoma. 2009. Apresentação de Trabalho/Outra
67.	KOIDE, T.; Pang, W.L. ; Baliga, N.S.. The role of predictive modeling in rationally reengeneering biological systems. Nature Review, Microbiology. v. 7, p. 297-305, 2009. Qualis: A1
68.	KOIDE, T.; Reiss, D.J. ; Bare, J.C. ; Pang, W.L. ; Facciotti, M.T. ; Schmid, A.K. ; Pan, M. ; Marzolf, B. ; Van, P.T. ; LO, F. ; PRATAP, A. ; DEUTSCH, E. W. ; PETERSON, A. ; MARTIN, D. ; Baliga, N.S.. Prevalence of transcription promoters within archaeal operons and coding sequences. Molecular Systems Biology. v. 5, p. 285, 2009. Qualis: Não identificado (MOLECULAR SYSTEMS BIOLOGY)
69.	Kunicki, A. ; Morya, E. ; Nicolelis, M. A. L. ; Ribeiro, S. ; Sameshima, Koichi. Multiunit recording of cortico-hippocampal system of rats. Em: 41st European Brain and Behaviour Society Meeting, 2010, Island of Rhodes. Front. Behav. Neurosci. Conference Abstract: 41st European Brain and Behaviour Society Meeting, 2009.
70.	LOURO, R. ; SMIRNOVA, A. S. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S.. Long intronic noncoding RNA transcription: Expression noise or expression choice?. Genomics (San Diego). v. 93, p. 291-298, 2009. Qualis: A3
71.	MACHADO, A. F. ; HASHIMOTO, R. F.. Jump-Miss Binary Erosion Algorithm. Em: XXII Brazilian Symposium on Computer Graphics and Image Processing, p. 149-155, 2009. Qualis: Não identificado (XXII Brazilian Symposium on Computer Graphics and Image Processing)
72.	MACHADO, A. F. ; HASHIMOTO, R. F.. Erosões e Dilatações Morfológicas Binárias Seqüenciais Rápidas. Em: XXIX Congresso da Sociedade Brasileira de Computação, 2009, Bento Gonçaves. Anais do CSBC 2009 - CTD, 2009. Qualis: Não identificado (XXIX CONGRESSO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE COMPUTAÇÃO, 2009, BENTO GONÇAVES. ANAIS DO CSBC 2009 - CTD)
73.	Manetti, M. E. ; ROSSI, M. ; NAKABASHI, M. ; GRANDBASTIEN, M. A. ; Sluys, Marie Anne. The Tnt1 family member Retrosol copy number and structure disclose retrotransposon diversification in different Solanum species. Molecular Genetics and Genomics. v. 281, p. 261-271, 2009. Qualis: A4
74.	MARQUES, L. M. ; BUZINHANI, M. ; Neto, R. L. ; OLIVEIRA, R. C. ; YAMAGUTI, M. ; GUIMARAES, A. M. S. ; TIMENETSKY, J.. Detection of Ureaplasma diversum in bovine semen straws for artificial insemination. Veterinary Record. v. 165, p. 572-573, 2009. Qualis: A1
75.	MARQUES, M. M. ; FORNARI, T.A. ; OCTACILIO-SILVA, S. ; EVANGELISTA, A. F. ; JUNTA, C. M. ; PIGNATA, L. F. M ; GIULIATTI, S. ; Passos, Geraldo A. S.. MicroRNA-mRNA Network Controlling the Promiscuous Gene Expression in the Thymus of NOD (Non Obese Diabetic) Mice: Implications in the Emergence of Type 1 Diabetes Mellitus. Em: 55º Congresso Brasileiro de Genética, 2009, Águas de Lindóia, SP. Anais, p. 284-284, 2009.
76.	MARTINS, D. C. ; OLIVEIRA, E. A. ; SILVA, P. J. S. ; HASHIMOTO, R. F. ; CESAR JUNIOR, R. M.. Revealing Temporal Genetic Regulatory Networks from Steady-State Distributions. Em: IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics, p. 1-4, 2009. Qualis: Não identificado (IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics)
77.	Martins, M.T.B. ; SOUZA, A. P. ; Arenque, Bruna C. ; Goulart, M.O. ; Goulart, A.M. ; Quirino, B.F. ; BUCKERIDGE, M. S. ; Molinari, H.B.C.. Caracterização da parede celular de Saccharum spp. em diferentes estádios de senescência foliar. 2009. Apresentação de Trabalho/Congresso
78.	Matos, G. ; Kinjo, E. R. ; Pestana, R. R. ; Vicente, E. ; Santos, A. A. ; SAMESHIMA, K. ; Xavier, G.F. ; Britto, L. R. G. ; Valle, A. C.. The effects of paradoxical sleep deprivation on pilocarpine-induced temporal lobe epilepsy: A possible protective effect?. Em: The 2009 Annual Meeting of the American Epilepsy Society, 2009, Boston. Epilepsia (Copenhagen. Online). Nova Iorque: Wiley InterScience, v. 50, p. 467-467, 2009.
79.	MELLO, B. P. ; ABRANTES, E. F. ; TORRES, C. H. ; FONSECA, R. S. ; CARRARO, D. M. ; BRENTANI, R. R. ; REIS, L. F. L. ; Brentani, Helena. No-match ORESTES explored as tumor markers. Nucleic Acids Research. v. 37, p. 2607-2617, 2009. Qualis: A1
80.	Meola, Juliana ; Dentillo, Daniel Blassioli ; Rosa e Silva, Júlio César ; Ferriani, Rui Alberto ; Veiga, Luciana Caricati ; Paro de Paz, Claudia Cristina ; Giuliatti, Silvana ; Martelli, Lúcia. Glycodelin expression in the endometrium of healthy women and in the eutopic and ectopic endometrium of women with endometriosis. Fertility and Sterility. v. 91, p. 1676-1680, 2009. Qualis: A1
81.	Nakaya, Helder I. (IPIRC Advisory Board Meeting @ Emory University) Palestra: Transcriptome Analysis of Flu Vaccine. 2009. Apresentação de Trabalho/Seminário
82.	OIKAWA, M. K. ; FERREIRA, J. E. ; MALKOWSKI, S. ; PU, C.. Towards Algorithmic Generation of Business Processes: From Business Step Dependencies to Process Algebra Expressions. Em: Business Process Management Conference, v. 1, p. 80-96, 2009.Qualis: Não identificado (Business Process Management Conference)
83.	OIKAWA, M. K. ; FERREIRA, J. E. ; MALKOWSKI, S. ; PU, C.. Towards Algorithmic Generation of Business Processes: From Business Step Dependencies to Process Algebra Expressions. 2009. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
84.	OIKAWA, M.K. ; SILVA, P. ; MERINO, E. F. ; FERNANDEZ-BECERRA, C. ; WUNDERLICH, G. ; BARRERA, J. ; DURHAM, A. M. ; Hernando A. del Portillo ; del PORTILLO, H. ; FERREIRA, J. E.. . ClinMaldb: a clinical field-research oriented relational database to study human malaria. Em: IADIS International Conference e-Health 2009, v. 1, p. 1-9, 2009.Qualis: Não identificado (IADIS International Conference e-Health 2009)
85.	Oliveira, Katia C. ; Carvalho, Mariana L. P. ; Venancio, Thiago M. ; Miyasato, Patricia A. ; KAWANO, Toshie ; DEMARCO, Ricardo ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S.. Identification of the Schistosoma mansoni TNF-Alpha Receptor Gene and the Effect of Human TNF-Alpha on the Parasite Gene Expression Profile. Plos Neglected Tropical Diseases. v. 3, p. e556, 2009. Qualis: A1
86.	Quiapim, A. C. ; BRITO, M. S. ; Bernardes, L. A.S. ; daSilva, I. ; MALAVAZI, I. ; DEPAOLI, H. C. ; MOLFETTA-MACHADO, J. B. ; Giuliatti, S. ; GOLDMAN, G. H. ; GOLDMAN, M. H. S.. Analysis of the Nicotiana tabacum Stigma/Style Transcriptome Reveals Gene Expression Differences between Wet and Dry Stigma Species. Plant Physiology (Bethesda). v. 149, p. 1211-1230, 2009. Qualis: A1
87.	RODRIGUES, MAURICIO CHUI ; Malkowski, Simon ; Ferreira, João Eduardo. Implementing rigorous web services with process algebra. Em: the 2009 ACM symposium, p. 625, 2009. Qualis: Não identificado (the 2009 ACM symposium)
88.	RODRIGUES, R.A. ; AZEREDO-ESPIN, A.M.L. ; TORRES, T.T.. Microsatellite markers for population genetic studies of the blowfly Chrysomya putoria (Diptera: Calliphoridae). Memórias do Instituto Oswaldo Cruz (Impresso). v. 104, p. 1047-1050, 2009. Qualis: A2
89.	Santos, Ramon F. ; Pôssa, Marcela A. S. ; Bastos, Matheus S. ; Guedes, Paulo M. M. ; Almeida, Márcia R. ; DEMARCO, Ricardo ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; Bahia, Maria T. ; Fietto, Juliana L. R.. Influence of Ecto-Nucleoside Triphosphate Diphosphohydrolase Activity on Trypanosoma cruzi Infectivity and Virulence. PLoS Neglected Tropical Diseases (Online). v. 3, p. e387, 2009. Qualis: A1
90.	Sato, J. R. ; Takahashi, D. Y. ; Arcuri, S. M. ; Sameshima, Koichi ; Morettin, P. A. ; Baccalá, L. A.. Frequency domain connectivity identification: An application of partial directed coherence in fMRI. Human Brain Mapping. v. 30, p. 452-461, 2009. Qualis: A1
91.	SCHLÖTTERER, C. ; TORRES, T.T. ; METTA, M. ; OTTENWÄLDER, B.. Expression profiling by massively parallel sequencing. Em: 49th Annual Drosophila Research Conference, 2008, San Diego, CA. Program and abstracts of the 49th Annual Drosophila Research Conference, 2009.
92.	Schmid, A.K. ; Reiss, D.J. ; Pan, M. ; KOIDE, T. ; Baliga, N.S.. A single transcription factor regulates evolutionarily diverse but functionally linked metabolic pathways in response to nutrient availability. Molecular Systems Biology. v. 5, p. 282, 2009. Qualis: Não identificado (MOLECULAR SYSTEMS BIOLOGY)
93.	Secco, Mariane ; Moreira, Yuri B. ; Zucconi, Eder ; Vieira, Natassia M. ; Jazedje, Tatiana ; Muotri, Alysson R. ; Okamoto, Oswaldo K. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; Zatz, Mayana. Gene Expression Profile of Mesenchymal Stem Cells from Paired Umbilical Cord Units: Cord is Different from Blood. Stem Cell Reviews. v. 5, p. 387-401, 2009. Qualis: A3
94.	SETUBAL, J. C.; dos Santos, P. ; Goldman, B. S. ; Ertesvag, H. ; Espin, G. ; Rubio, L. M. ; Valla, S. ; Almeida, N. F. ; Balasubramanian, D. ; Cromes, L. ; Curatti, L. ; Du, Z. ; Godsy, E. ; GOODNER, B. ; Hellner-Burris, K. ; Hernandez, J. A. ; Houmiel, K. ; Imperial, J. ; Kennedy, C. ; Larson, T. J. ; et.al. Genome Sequence of Azotobacter vinelandii, an Obligate Aerobe Specialized To Support Diverse Anaerobic Metabolic Processes. Journal of Bacteriology (Print). v. 191, p. 4534-4545, 2009. Qualis: A3
95.	Slater, S. C. ; Goldman, B. S. ; GOODNER, B. ; SETUBAL, J. C. ; Farrand, S. K. ; NESTER, E. W. ; Burr, T. J. ; Banta, L. ; Dickerman, A. W. ; Paulsen, I. ; OTTEN, L. ; Suen, G. ; Welch, R. ; Almeida, N. F. ; Arnold, F. ; Burton, O. T. ; Du, Z. ; Ewing, A. ; Godsy, E. ; Heisel, S. ; et.al. Genome Sequences of Three Agrobacterium Biovars Help Elucidate the Evolution of Multichromosome Genomes in Bacteria. Journal of Bacteriology (Print). v. 191, p. 2501-2511, 2009. Qualis: A3
96.	SOLER, J. M. P.; Giolo, S.R.. Epidemiologia Genética: estudos de associação no mapeamento genético de doenças complexas. 2009. Curso de curta duração ministrado/Extensão
97.	SOLER, J. M. P.; NEVES, C. E. ; Giolo, S.R. ; ANDRADE, D. ; de Andrade, M. ; MIYAKAWA, A. ; KRIEGER, J. E.. Use of the Item Response Theory to Evaluate Gene Expression in Congenic Rat Strains. Em: Eastern North American Region of the International Biometric Society, 2009, San Antonio, TX, USA. Proceedings ENAR, 2009.
98.	TANAKA, E. A. ; GUIDUGLI, M. C. ; ALZATE-MARIN, A. L. ; MESTRINER, M. A. ; GIULIATTI, S. Análise Computacional de Sequências Genômicas de Cariniana estrellensis revela Similaridade com Espécies de Importância Econômica. Em: 17º SIICUSP: Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo, 2009, Ribeirão Preto, SP. Anais, 2009.
99.	TANAKA, E. A. ; GUIDUGLI, M. C. ; ALZATE-MARIN, A. L. ; MESTRINER, M. A. ; GIULIATTI, S.. Análise Computacional de Sequências Genômicas da Espécie Arbórea Cariniana estrellensis revela Similaridade com Espécies Vegetais de Importância Econômica. Em: 55º Congresso Brasileiro de Genética, 2009, Águas de Lindóia, SP. Anais, 2009.
100.	TANAKA, E. A. ; GUIDUGLI, M. C. ; ALZATE-MARIN, A. L. ; MESTRINER, M. A. ; GIULIATTI, S.. Análise Computacional de Sequências Genômicas da Espécie Arbórea Cariniana estrellensis Revela Similaridade com Espécies Vegetais de Importância Econômica. 2009. Apresentação de Trabalho/Congresso
101.	TORRES, T. T.; AZEREDO-ESPIN, A.M.L.. Population genetics of New World screwworm from the Caribbean: insights from microsatellite data. Medical and Veterinary Entomology. v. 23, p. 23-31, 2009. Qualis: A2
102.	TORRES, T. T.; DOLEZAL, M. ; SCHLÖTTERER, C. ; OTTENWÄLDER, B.. Expression profiling of Drosophila mitochondrial genes via deep mRNA sequencing. Nucleic Acids Research. v. 37, p. 7509-7518, 2009. Qualis: A1
103.	Tseng, Tsai-Tien ; Tyler, Brett M ; Setubal, João C. Protein secretion systems in bacterial-host associations, and their description in the Gene Ontology. BMC Microbiology (Online). v. 9, p. S2, 2009. Qualis: A2
104.	VENANCIO, Thiago M ; Cristofoletti, P. T. ; Ferreira, C. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S. ; Terra, W. R.. The Aedes aegypti larval transcriptome: a comparative perspective with emphasis on trypsins and the domain structure of peritrophins. Insect Molecular Biology. v. 18, p. 33-44, 2009. Qualis: A1
105.	VIBRANOVSKI, M. D.; DORUS, S. ; LONG, M. ; KARR, T. L.. The sperm proteome footprint of the Drosophila testis transcriptome. 2009. Apresentação de Trabalho/Congresso
106.	VIBRANOVSKI, M. D.; LOPES, H. F. ; KARR, T. L. ; LONG, M.. Stage-Specific Expression Profiling of Drosophila Spermatogenesis Suggests that Meiotic Sex Chromosome Inactivation Drives Genomic Relocation of Testis-Expressed Genes. PLOS Genetics (Online). v. 5, p. e1000731, 2009. Qualis: A1
107.	VIBRANOVSKI, M. D.; LOPES, H. F. ; KARR, T. L. ; LONG, M.. INATIVAÇÃO DO CROMOSSOMO X DURANTE A ESPERMATOGÊNESE DE DROSOPHILA E SEU IMPACTO SOBRE EVOLUÇÃO DOS GENES SEXUAIS. 2009. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
108.	VIBRANOVSKI, M. D.; LOPES, H. F. ; KARR, T. L. ; LONG, M.. Male Germline X inactivation Impacting Evolution of Male Genes in Drosophila. 2009. Apresentação de Trabalho/Seminário
109.	VIBRANOVSKI, M. D.; LOPES, H. F. ; KARR, T. L. ; LONG, M.. Post-meiotic transcription in Drosophila spermatogenesis. 2009. Apresentação de Trabalho/Congresso
110.	VIBRANOVSKI, M. D.; ZHANG, Y. ; LONG, M.. General gene movement off the X chromosome in the Drosophila genus. Genome Research. v. 19, p. 897-903, 2009. Qualis: A1
111.	Vicente, E. ; Matos, G. ; SAMESHIMA, K. ; Valle, A. C.. The effects of paradoxical sleep deprivation on absence seizures in rats. Em: The 2009 Annual Meeting of the American Epilepsy Society, 2009, Boston. Epilepsia (Copenhagen. Online). Nova Iorque: Wiley InterScience, v. 50, p. 476-476, 2009.
112.	VIEIRA, R. F. C. ; Molento, M.B. ; SANTOS, L. C. ; MORAES, W. ; CUBAS, Z. S. ; Santos, A.P. ; GUIMARAES, A. M. S. ; MOHAMED, A. ; BARROS-FILHO, I. R. ; BIONDO, A. W. ; MESSICK, J. B.. Detection of a novel hemoplasma based on 16S rRNA gene DNA in captive and free ranging capybaras (Hydrochaeris hydrochaeris). Em: ASVCP/ACVP Meeting, 2009, Monterrey. Veterinary Pathology, v. 46, p. 1030, 2009.
113.	Vieira, Rafael F.C. ; Molento, Marcelo B. ; dos Santos, Leonilda C. ; Moraes, Wanderlei ; Cubas, Zalmir S. ; Santos, Andrea P. ; Guimaraes, Ana M.S. ; Mohamed, Ahmed ; Barros Filho, Ivan R. ; Biondo, Alexander W.. Detection of a novel hemoplasma based on 16S rRNA gene DNA in captive and free-ranging capybaras (Hydrochaeris hydrochaeris). Veterinary Microbiology (Amsterdam. Print). v. 139, p. 410-413, 2009. Qualis: Não identificado (PRINT))
114.	Warren, Andrew S ; Setubal, João. The Genome Reverse Compiler: an explorative annotation tool. BMC Bioinformatics. v. 10, p. 35, 2009. Qualis: A1
115.	Wattam, A. R. ; Williams, K. P. ; Snyder, E. E. ; Almeida, N. F. ; Shukla, M. ; Dickerman, A. W. ; Crasta, O. R. ; Kenyon, R. ; Lu, J. ; Shallom, J. M. ; Yoo, H. ; Ficht, T. A. ; Tsolis, R. M. ; Munk, C. ; Tapia, R. ; Han, C. S. ; Detter, J. C. ; Bruce, D. ; Brettin, T. S. ; SETUBAL, J. C. ; et.al. Analysis of Ten Brucella Genomes Reveals Evidence for Horizontal Gene Transfer Despite a Preferred Intracellular Lifestyle. Journal of Bacteriology (Print). v. 191, p. 3569-3579, 2009. Qualis: A3
116.	YEPES, A. ; Buckeridge, Marcos S. ; BUCKERIDGE, M. S.. Higher temperatures rather than elevated CO2 concentration enhance growth and biomass allocation during establishment of late-successional specie Hymenaea courbaril L seedlings. 2009. Apresentação de Trabalho/Congresso
117.	YEPES, A. ; Ionashiro, M. ; BUCKERIDGE, M. S.. A combinação de elevado CO2 e temperatura altera o fluxo de carbono em jatobá (Hymenaea courbaril L.). 2009. Apresentação de Trabalho/Congresso

2008

1.	AMUI, S. F. ; FACHIN, A. L. ; PEREIRA, A. M. S. ; GIULIATTI, S. Artificial Intelligence applied in the Selection of Medicinal Plants of Cerrado with Antimicrobial Activity. Em: X-meeting and 4st Annual AB3C Conference, 2008, Salvador, BA. Anais, 2008.
2.	AMUI, S. F. ; FACHIN, A. L. ; PEREIRA, A.M.S. ; GIULIATTI, S.. Artificial Intelligence Applied in the Selection of Medicinal Plants of Cerrado with Antimicrobial Activity. 2008. Apresentação de Trabalho/Congresso
3.	BALAJI, P. ; FENG, W. ; LIN, H. ; ARCHULETA, J. ; MATSUOKA, S. ; Warren, A. ; Setubal, J.C.. Distributed I/O with ParaMEDIC: Experiences with a Worldwide Supercomputer. Em: International Supercomputing Conference, 2008.Qualis: Não identificado (International Supercomputing Conference)
4.	Batista, M.J. ; Giolo, S.R. ; PEREIRA, A. C. ; SOLER, J. M. P.. Evidence for SNP effect through supervised association analysis. Em: Genetic Analysis Workshop 16, p. 3-6-3-8, 2008.Qualis: Não identificado (Genetic Analysis Workshop 16)
5.	Bermudez, L. ; Urias, U. ; Milstein, D. ; Kamenetzky, L. ; Asis, R. ; Fernie, A. R. ; VAN SLUYS, M A ; Carrari, F. ; ROSSI, M.. A candidate gene survey of quantitative trait loci affecting chemical composition in tomato fruit. Journal of Experimental Botany. v. 59, p. 2875-2890, 2008. Qualis: A1
6.	Bona, TM ; SOLER, J. M. P. ; Giolo, S.R. ; PEREIRA, A. C.. Análise de Correlações Intra e Inter-Classe em Dados de Famílias - Projeto Corações de Baependi. Em: 18o. SINAPE, 2008, Estância de São Pedro. Resumos do 18o. SINAPE, 2008. Qualis: Não identificado (18O. SINAPE, 2008, ESTÂNCIA DE SÃO PEDRO. RESUMOS DO 18O. SINAPE)
7.	Bosso, J. ; FerrariI, D. V. ; SAMESHIMA, K.. Comparison of REAR prescriptions based on PTA and ASSR. Em: Audiology Now, 2008, Charlotte. Audilogy Now ! 2008. Reston: American Academy of Audiology, 2008.
8.	BRAGHETTO, K. R. ; FERREIRA, J. E. ; PU, C.. Business Processes Management using Process Algebra and Relational Database Model. Em: International Conference on e-Business, v. 1, p. 323-333, 2008.Qualis: Não identificado (International Conference on e-Business)
9.	BRAGHETTO, KELLY ROSA ; Ferreira, João Eduardo ; Pu, Calton. Using process algebra to control the execution of business processes. Em: 23rd Annual ACM Symposium on Applied Computing, p. 128, 2008. Qualis: Não identificado (23rd Annual ACM Symposium on Applied Computing)
10.	Brandao, A. D. ; Del Bem, L. E. V. ; Vincentz, M. ; BUCKERIDGE, M. S.. Expression pattern of four storage xyloglucan mobilization-related genes during seedling development of the rain forest tree Hymenaea courbaril L.. Journal of Experimental Botany. v. 60, p. 1191-1206, 2008. Qualis: A1
11.	BRENTANI, H. P. Para que serve a bioinformática?. 2008. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
12.	BREVE, A. L. S. ; PASSOS JUNIOR, G. A. S. ; GIULIATTI, S. In silico prediction of microorganism motifs with identity to human autoantigens. Em: XXXIII Congress of the Brazilian Society for Immunology e II Extra Section of Clinical Immunology, 2008, Ribeirão Preto, SP. Abstracts, 2008.
13.	BREVE, A. L. S. ; PASSOS JUNIOR, G. A. S. ; GIULIATTI, S.. In Silico Prediction of Microorganism Motifs with Identity to Human Autoantigens. 2008. Apresentação de Trabalho/Congresso
14.	Brito, Glauber Costa ; Fachel, Ângela A. ; Vettore, Andre Luiz ; VIGNAL, Giselle M ; Gimba, Etel R.P. ; Campos, Franz S. ; Barcinski, Marcello A. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; Reis, Eduardo M.. Identification of protein-coding and intronic noncoding RNAs down-regulated in clear cell renal carcinoma. Molecular Carcinogenesis. v. 47, p. 757-767, 2008. Qualis: A3
15.	BROINIZI, MARCOS E. B. ; Ferreira, João Eduardo ; GOLDMAN, ALFREDO. Using annotations in the naked objects framework to explore data requirements. Em: the 2008 ACM symposium, p. 630, 2008. Qualis: Não identificado (the 2008 ACM symposium)
16.	BUCKERIDGE, M. S. A nova energia das plantas: enquanto o Brasil investe no etanol de cana-de-açúcar, outros países cogitam usar gramíneas gigantes ou a planta da tequila para fazer álcool. Revista Pesquisa FAPESP, São Paulo, 31 jul. 2008.
17.	BUCKERIDGE, M. S. Rotas para o etanol celulósico em um cenário de mudanças climáticas. Opiniões, Ribeirão Preto, p. 62, 01 jul. 2008.
18.	BUCKERIDGE, M. S. Uma pizza de fotossíntese, por favor: para saborear uma redonda de mussarela, o cliente consome a bioenergia das moléculas de carbono armazenadas em vários processos. Revista Pesquisa FAPESP, São Paulo, 13 jun. 2008.
19.	BUCKERIDGE, M. S. Deus fez, Lineu organizou: o tricentenário do nascimento do brilhante e imodesto pai da moderna taxonomia passou quase despercebido. Revista Pesquisa FAPESP, São Paulo, 06 mar. 2008.
20.	BUCKERIDGE, M. S. Esqueceram nossas ?florestas marinhas? Pouca gente lembra que o aquecimento global também põe em risco os corais, inclusive os da costa brasileira. Revista Pesquisa FAPESP, São Paulo, 30 jan. 2008.
21.	BUCKERIDGE, M. S. Biocombustíveis líquidos. 2008. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
22.	BUCKERIDGE, M. S. Bioquímica e biotecnologia de carboidratos de plantas. 2008. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
23.	BUCKERIDGE, M. S. Mobilização de reservas em parede celular de sementes. 2008. Apresentação de Trabalho/Outra
24.	BUCKERIDGE, M. S. Respostas de matapasto e açaí às mudanças climáticas globais e as possibilidades de produção de bioenergia. 2008. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
25.	BUCKERIDGE, M. S. Contribuições do IB para o entendimento das causas e consequencias das mudanças climáticas. 2008. Apresentação de Trabalho/Outra
26.	BUCKERIDGE, M. S. Respostas da cana-de-açúcar às mudanças climáticas e as perspectivas para a produção de etanol celulósico. 2008. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
27.	BUCKERIDGE, M. S. Biodiversidade no futuro. 2008. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
28.	BUCKERIDGE, M. S. Inteligência em plantas. 2008. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
29.	BUCKERIDGE, M. S. Routes for the production of cellulosic ethanol in Brazil. 2008. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
30.	BUCKERIDGE, M. S. Resposta de plantas às mudanças climáticas globais. 2008. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
31.	BUCKERIDGE, M. S. Disassembling the plant cell wall to obtain energy. 2008. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
32.	BUCKERIDGE, M. S. Respostas de Plantas às Mudanças Climáticas Globais. 2008. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
33.	BUCKERIDGE, M. S. Climate Change & the Environment. 2008. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
34.	BUCKERIDGE, M. S. A novel alpha-galactosidase from coffee is likely to control mannan fine structure in developing seeds. 2008. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
35.	BUCKERIDGE, M. S.; CAVALARI, A. A. ; SILVA, G. B. DA. Parede Celular. Em: Gilberto Barbante Kerbauy. (Org.). Fisiologia Vegetal. Rio de Janeiro. : Guanabara Koogan. 2008..
36.	Buckeridge, Marcos S.; AIDAR, M. P. M. ; Emerson Alves Silva ; MARTINEZ, C. A.. Respostas de Plantas às Mudanças Climáticas Globais. Em: Marcos Silveira Buckeridge. (Org.). Biologia & Mudanças Climáticas no Brasil. 1ed.São Carlos. : Rima Editora. 2008.v. 1, p. 77-91.
37.	Buckeridge, Marcos S.; Biologia & Mudanças Climáticas no Brasil. . 1 ed. São Carlos: Rima Editora, 2008. v. 1, p. 295.
38.	Buckeridge, Marcos S.; Um passo além da engenharia genética. . Revista Pesquisa FAPESP online, São Paulo, 02 dez. 2008.
39.	CAMPOS, Patrícia Danieli ; ALVARENGA, Kátia de Freitas ; FREDERIGUE, Natália Barreto ; NASCIMENTO, Leandra Tabanez Do ; Sameshima, K. ; Costa Filho, Orozimbo Alves ; COSTA, O. A. ; Bevilacqua, Maria Cecília. Habilidades de ordenação temporal em usuários de implante coclear multicanal. Revista Brasileira de Otorrinolaringologia (Impresso). v. 74, p. 884-889, 2008. Qualis: Não identificado (REVISTA BRASILEIRA DE OTORRINOLARINGOLOGIA)
40.	CARDOSO, F. C. ; Gilson C. Macedo ; Elisandra Gava ; Gregory T. Kitten ; Vitor L. Mati ; Alan L. de Melo ; Marcelo V. Caliari ; Giulliana T. Almeida ; Thiago M. Venancio ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S. ; Sergio C. Oliveira. Schistosoma mansoni Tegument Protein Sm29 Is Able to Induce a Th1-Type of Immune Response and Protection against Parasite Infection. PLoS Neglected Tropical Diseases (Online). v. 2, p. e308, 2008. Qualis: A1
41.	CASTRO, N. P. ; OSÓRIO, C. A. B. T. ; TORRES, C. H. ; BASTOS, E. P. ; MOURÃO NETO, M. ; SOARES, F. A. ; BRENTANI. HP ; CARRARO, D. M.. Evidence that molecular changes in cells occur before morphological alterations during the progression of breast ductal carcinoma. Breast Cancer Research. v. 10, p. R85, 2008. Qualis: A1
42.	Charchat-Fichman, H. ; Nitrini, R. ; Caramelli, P. ; Sameshima, K.. A new brief computerized cognitive screening battery (CompCogs) for early diagnosis of Alzheimer´s disease. Dementia & Neuropsychologia. v. 2, p. 13-19, 2008.Qualis: B3
43.	CORREIA, R. ; Kon, F ; FERREIRA, J. E.. Um Sistema de Software Livre para Gerenciamento de Centros de Saúde. Em: Anais do III Simpósio de Iniciação Científica e Pós-Graduação do IME-USP, 2008, Sao Paulo. Anais do III Simpósio de Iniciação Científica e Pós-Graduação do IME-USP, v. 1, 2008. Qualis: Não identificado (ANAIS DO III SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DO IME-USP, 2008, SAO PAULO. ANAIS DO III SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DO IME-USP)
44.	Correia-Pinto, J. B. ; Ojopi, E. B. O. ; Ribeiro, S. ; Nicolelis, M. A. L. ; SAMESHIMA, K.. Egr1 and Arc modulation during post-novelty sleep. Em: The 38th Annual Meeting of the Society for Neuroscience, 2008, Washington, DC. Abstract of The 38th Annual Meeting of the Society for Neuroscience. Washington DC: Society for Neuroscience, 2008.
45.	Correia-Pinto, J. B. ; Ojopi, E. B. O. ; Ribeiro, S. ; Nicolelis, M. A. L. ; Sameshima, Koichi. Egr1 and Arc modulation during post-novelty sleep. 2008. Apresentação de Trabalho/Comunicação
46.	da Silva, F.C. ; Diaz-Ambrona, C.G.H. ; BUCKERIDGE, M. S. ; SOUZA, A. P. ; De Souza, Amanda Pereira ; Barbieri, V. ; Dourado Neto, D.. Sugarcane and Climate Change: effects of CO2 on potential growth and development. Acta Horticulturae. v. 802, p. 331-336, 2008.Qualis: B4
47.	DE ARAÚJO, LUCIANO VIEIRA ; Sabino, Ester C. ; Ferreira, João Eduardo. HIV drug resistance analysis tool based on process algebra. Em: the 2008 ACM symposium, p. 1358, 2008. Qualis: Não identificado (the 2008 ACM symposium)
48.	de Mello Varani, Alessandro ; Souza, Rangel Celso ; Nakaya, Helder I. ; de Lima, Wanessa Cristina ; Paula de Almeida, Luiz Gonzaga ; Kitajima, Elliot Watanabe ; Chen, Jianchi ; Civerolo, Edwin ; Vasconcelos, Ana Tereza Ribeiro ; Van Sluys, Marie-Anne. Origins of the Xylella fastidiosa Prophage-Like Regions and Their Impact in Genome Differentiation. Plos One. v. 3, p. e4059, 2008. Qualis: A1
49.	de Souza, R. F.; Anantharaman, V. ; de Souza, S. J. ; Aravind, L. ; Gueiros-Filho, F. J.. AMIN domains have a predicted role in localization of diverse periplasmic protein complexes. Bioinformatics (Oxford). v. 24, p. 2423-2426, 2008. Qualis: A1
50.	DEMARCO, Ricardo ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S.. Expressed Sequence Tags (ESTs) and Gene Discovery: Schistosoma mansoni. Em: Gruber, A.; Durham, A.M.; Huynh, C.; del Portillo, H.A.. (Org.). Bioinformatics in Tropical Disease Research: A Practical and Case-Study Approach. Bethesda, MD. : National Library of Medicine. 2008..
51.	Dhivya Arasappan ; Aurelien Mazurie ; Alves, J. M. ; Danail Bonchev ; BUCK, G. A.. Path-a-Way: A Strategy for Network Analysis of Microarray Data. IEEE Transactions on Biomedical Engineering (Print). v. 1, p. 432-436, 2008.Qualis: A1
52.	DOMINGUES, H. ; CORREIA, R. ; Kon, F ; KON, R. ; FERREIRA, J. E.. Análise e Modelagem Conceitual de um Sistema de Prontuário Eletrônico para Centros de Saúde. In: VIII Workshop de Informática Médica. Em: VIII Workshop de Informática Médica (WIM´2008), v. 1, p. 31-40, 2008.Qualis: Não identificado (VIII Workshop de Informática Médica (WIM´2008))
53.	DOMINGUES, H. ; Kon, F ; FERREIRA, J. E.. Banco de dados evolutivos e metodos ageis. 2008. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
54.	DURHAM, A. M.; Chimara, E. ; FERRAZOLI, L. ; UEKY, S. Y. M. ; MARTINS, M. C. ; ARBEIT, R. D. ; LEAO, S. C.. Reliable identification of mycobacterial species by PCR-restriction enzyme analysis (PRA)-hsp65 in a reference laboratory and elaboration of a sequence-based extended algorithm of PRA-hsp65 patterns. BMC Microbiology (Online). v. 8, p. 48, 2008. Qualis: A2
55.	DURHAM, A. M.; LIMA, K. ; VIANA-NIERO, C. ; da Silva RABELLO, M. C. ; L.R.MARSOLA, ; LEAO, S. C.. Molecular Characterization of Mycobacterium massiliense and Mycobacterium bolletii in Isolates Collected from Outbreaks of Infections after Laparoscopic Surgeries and Cosmetic Procedures. Journal of Clinical Microbiology (Print). v. 46, p. 850-855, 2008. Qualis: A2
56.	Dzirasa, K. ; Takahashi, D. Y. ; Stapleton, J. ; Gainetdinov, R. R. ; Lavine, M. ; SAMESHIMA, K. ; Caron, M. G. ; Nicolelis, M. A. L.. Persistent hyperdopaminergia alters activity across the hippocampal-prefrontal cortex pathway. Em: 63rd Annual Convention of the Society-of-Biological-Psychiatry, 2008, Washington. BIOLOGICAL PSYCHIATRY. Washington-DC: Society-of-Biological-Psychiatry, v. 63, p. 332S-332S, 2008.
57.	FERREIRA, J. E. The RiverFish Approach to Business Process Modeling: Linking Business Steps to Control-Flow Patterns. 2008. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
58.	FERREIRA, J. E.; TAKAI, O. K.. Understanding database modeling. Em: NCBI bookshelf. (Org.). Bioinformatics Tropical Disease Research: A Pratical Approach. : NCBI. 2008..
59.	FERREIRA-RAMOS, R. ; BERNARDES, L. A. S. ; MESTRINER, M. A. ; GIULIATTI, S ; ALZATE-MARIN, A. L.. Sequenciamento de Fragmentos Genômicos de Eugenia uniflora L. Revela Similaridade com Sequências ESTs de Eucalyptus sp. Em: 54º Congresso Brasileiro de Genética, 2008, Salvador, BA. Anais, 2008.
60.	FERREIRA-RAMOS, R. ; BERNARDES, L. A. S. ; MESTRINER, M. A. ; GIULIATTI, S. ; ALZATE-MARIN, A. L.. Sequenciamento de Fragmentos Genômicos de Eugenia uniflora L. Revela Similaridade com Sequências ESTs de Eucalyptus sp. 2008. Apresentação de Trabalho/Congresso
61.	Freire, M. A. ; Morya, E. ; Sameshima, Koichi ; Lemos, N.A.M. ; Pereira Jr., A. ; Nicolelis, M. A. L.. Comprehensive characterization of molecular and cellular changes after chronic multielectrode implants in rats. 2008. Apresentação de Trabalho/Comunicação
62.	Gillespie, Joseph J. ; Williams, Kelly ; Shukla, Maulik ; Snyder, Eric E. ; Nordberg, Eric K. ; Ceraul, Shane M. ; Dharmanolla, Chitti ; Rainey, Daphne ; Soneja, Jeetendra ; Shallom, Joshua M. ; Vishnubhat, Nataraj Dongre ; Wattam, Rebecca ; Purkayastha, Anjan ; Czar, Michael ; Crasta, Oswald ; SETUBAL, J. C. ; Azad, Abdu F. ; Sobral, Bruno S.. Rickettsia Phylogenomics: Unwinding the Intricacies of Obligate Intracellular Life. Plos One. v. 3, p. e2018, 2008. Qualis: A1
63.	Giolo, S.R. ; SOLER, J. M. P. ; de Andrade, M. ; Oliveira. C.M. ; Pereira, A.C. ; KRIEGER, J. E.. Modeling Correlated Data from a Study of Brazilian Families. Em: XXIV International Biometric Conference, 2008.Qualis: Não identificado (XXIV International Biometric Conference)
64.	Giolo, S.R. ; SOLER, J. M. P. ; de Andrade, M. ; PEREIRA, A. C. ; KRIEGER, J. E.. Modeling Correlated Data From A Study Of Brazilian Families. Em: International Biometric Conference - IBC, 2008.Qualis: Não identificado (International Biometric Conference - IBC)
65.	Giolo, S.R. ; SOLER, J. M. P. ; PEREIRA, A. C. ; Oliveira. C.M. ; KRIEGER, J. E.. Modelo de Cox de Efeitos-Mistos na Análise Genética de Dados Correlacionados de Famílias Brasileiras. Em: 18o. SINAPE, 2008, Estância de São Pedro. Resumos do 18o. SINAPE, 2008. Qualis: Não identificado (18O. SINAPE, 2008, ESTÂNCIA DE SÃO PEDRO. RESUMOS DO 18O. SINAPE)
66.	Giolo, S.R. ; SOLER, J. M. P. ; PEREIRA, A. C. ; Oliveira. C.M. ; KRIEGER, J. E.. Herdabilidade de Fatores de Risco Cardiovascular em Famílias Brasileiras. Em: 18o. SINAPE, 2008, Estância de São Pedro. Resumos do 18o. SINAPE, 2008. Qualis: Não identificado (18O. SINAPE, 2008, ESTÂNCIA DE SÃO PEDRO. RESUMOS DO 18O. SINAPE)
67.	GIULIATTI, S. Proteomics and Bioinformatics. Em: Carlton A. Taft; Carlos H. T. P. Silva. (Org.). Current Methods in Medicinal Chemistry and Biological Physics. 1ed.Kerala, India. : Research Signpost. 2008.v. 2, p. 142-166.
68.	GIULIATTI, S. Venom. Jornal da USP On Line, 28 ago. 2008.
69.	GIULIATTI, S.; BRAUN, G. H. ; JORGE, D. M. M. ; RAMOS, H. P. ; ALVES, R. M. ; SILVA, V. B. ; VILELA, S. ; TAFT, C. A. ; SILVA, C. H. T. P.. Molecular Dynamics, Flexible Docking, Virtual Screening, ADMET Predictions, and Molecular Interaction Field Studies to Design Novel Potential MAO-B Inhibitors. Journal of Biomolecular Structure & Dynamics. v. 25, p. 347-355, 2008. Qualis: A3
70.	GIULIATTI, S; PUGA, R. D.. De Cobras, Escorpiões e outros Bichos. Jornal da USP Online, Ribeirão Preto, SP, 24 ago. 2008.
71.	Gonzalez-Kristeller, D.C. ; FARAGE, L. ; FIORINI, L.C. ; LOOMIS, W. F. ; DASILVA, A.M.. The P450 oxidoreductase, RedA, controls development beyond the mound stage in Dictyostelium discoideum. BMC Developmental Biology (Online). v. 8, p. 1-10, 2008. Qualis: B1
72.	GUIMARAES, A. M. S.; ALTHAUS, Lilian Karenina ; TULLIO, D. ; DECONTO, Ivan ; SILVA, A. W. ; FERRARI, Marcus Vinícius ; BIONDO, A. W. ; ALBERTON, Geraldo Camilo. Laminitis in culled sows from commercial swine farms of Southern Brazil. Archives of Veterinary Science. v. 13, p. 140-144, 2008.Qualis: B2
73.	GUIMARAES, A. M. S.; BAUMANN, A. ; SILVA, C. C. ; VIEIRA, R. F. C. ; KOZEMJAKIM, D. A. ; MESSICK, J. B. ; BIONDO, A. W. ; TIMENETSKY, J.. Comparison between two diagnostic methods for Mycoplasma haemofelis and "Candidatus Mycoplasma haemominutum" detection in blood from anemic cats. Em: XV Congresso Brasileiro de Parasitologia Veterinária, 2008, Curitiba. Anais do XV Congresso Brasileiro de Parasitologia Veterinária, v. cd, p. cd, 2008.
74.	GUIMARAES, A. M. S.; FILONI, C. ; CATAO-DIAS, J. L. ; BRANDAO, P. E. ; Moraes, Wanderlei ; CUBAS, Z. S. ; SANTOS, L. C. ; RICHTZENHAIN, L. J. ; MESSICK, J. B. ; BIONDO, A. W.. Detection of Bartonella spp in the blood of a Brazilian Jaguar. 2008. Apresentação de Trabalho/Congresso
75.	GUIMARÃES, A. M. S.; BRANDAO, P. ; MORAES, W. ; KIIHL, S. F. ; CUBAS, Z. S. ; SANTOS, L. C. ; MARQUES, L. M. ; LOPES NETO, R. ; YAMAGUTI, M. ; OLIVEIRA, R. C. ; RICHTZENHAIN, L. J. ; MESSICK, J. B. ; BIONDO, A. W. ; TIMENETSKY, J.. PCR detection of Bartonella spp in small neotropical felids and evaluation of risk factors and hematological abnormalities associated with infection. Em: 2008 ASVCP/ACVP Meeting, 2008, San Antonio, Texas. 2008 ASVCP Annual Meeting Abstracts, v. 1-12, p. 8, 2008.
76.	GUIMARÃES, A. M. S.; FILONI, C. ; CATAO-DIAS, J. L. ; BRANDAO, P. ; MORAES, W. ; CUBAS, Z. S. ; SANTOS, L. C. ; RICHTZENHAIN, L. J. ; MESSICK, J. B. ; BIONDO, A. W. ; TIMENETSKY, J.. PCR detection of Bartonella spp in a captive Brazilian jaguar. Em: 2008 ASVCP/ACVP Meeting, 2008, San Antonio, Texas. 2008 ASVCP Annual Meeting Abstracts, v. 1-12, p. 4, 2008.
77.	HÜNEMEIER, T.; SALZANO, F. M. ; BORTOLINI, M. C.. ESTIMATIVA DA FREQÜÊNCIA DO SNP FUNCIONAL -346C>T DA REGIÃO PROMOTORA DO GENE TCOF1 EM POPULAÇÕES NATIVO AMERICANAS E SUA CONSERVAÇÃO DENTRO DA ORDEM PRIMATES. Em: X Congreso de la Asociación Latinoamericana de Antropología, 2008, La Plata. X Congreso de la Asociación Latinoamericana de Antropología Biológica, 2008.
78.	JORGE, D. M. M. ; SILVA, V. B. ; SILVA, C. H. T. P. ; SOARES, A. M. ; GIULIATTI, S.. Virtual Screening of Phospholipase A2 Inhibition of Apis mellifera. Em: ISMB 2008, 2008, Toronto. Proceedings, 2008.
79.	KATAYAMA, M. L. H. ; GROSSO, D. M. ; TRAPE, A. ; ROELA, R. A. ; BRENTANI, H. P. ; TORRES, C. H. ; BRENTANI, M. M.. Changes in gene expression profile after rapamycin treatment of ErbB2-positive/ErbB2-negative breast carcinoma in organ culture. Em: 99th AACR Annual Meeting, 2008, San Diego-CA. Proceedings of the American Association for Cancer Research. Oakland: AACR, v. 49, p. 880, 2008.
80.	KOIDE, T.; Facciotti, M.T. ; Reiss, D.J. ; Masumura, K. ; Bare, J.C. ; Pan, M. ; Baliga, N.S.. Transcriptome structure of Halobacterium salinarum and its dynamic changes during growth. Em: DOE Genomics GTL: Systems Biology for Energy and Environment, 2008, Bethesda. DOE Genomics GTL: Systems Biology for Energy and Environment, 2008.
81.	LIMA, W. ; PAQUOLA, A. C. ; VARANI, A. M. ; VANSLUYS MA ; MENCK, C. F. M.. Laterally transferred genomic islands in Xanthomonadales related to pathogenicity and primary metabolism.. FEMS Microbiology Letters. v. 281, p. 87-97, 2008. Qualis: B2
82.	LOURO, R ; ELJUNDI, T ; NAKAYA, H ; REIS, E ; VERJOVSKIALMEIDA, S ; Verjovski-Almeida, S.. Conserved tissue expression signatures of intronic noncoding RNAs transcribed from human and mouse loci. Genomics (San Diego). v. 92, p. 18-25, 2008. Qualis: A3
83.	Lu, Hong ; Patil, Prabhu ; Van Sluys, Marie-Anne ; White, Frank F. ; Ryan, Robert P. ; Dow, J. Maxwell ; Rabinowicz, Pablo ; Salzberg, Steven L. ; Leach, Jan E. ; Sonti, Ramesh ; Brendel, Volker ; Bogdanove, Adam J.. Acquisition and Evolution of Plant Pathogenesis¿Associated Gene Clusters and Candidate Determinants of Tissue-Specificity in Xanthomonas. . v. 3, p. e3828, 2008. Qualis: Não identificado ()
84.	MARQUES, L. M. ; BUZINHANI, M. ; LOPES NETO, R. ; GUIMARAES, A. M. S. ; OLIVEIRA, R. C. ; YAMAGUTI, M. ; TIMENETSKY, J.. Ureaplasma diversum detection in frozen semen straws for bovine artificial insemination. Em: 17th Congress of the International Organization for Mycoplasmology, 2008, Tianjin, China. Abstracts of the 17th IOM Congress, v. 1, p. 69, 2008.
85.	MARQUES, L. M. ; BUZINHANI, M. ; LOPES NETO, R. ; OLIVEIRA, R. C. ; YAMAGUTI, M. ; GUIMARAES, A. M. S. ; ARANA-CHAVEZ, V. E. ; TIMENETSKY, J.. Evidence of a capsule-like structure on Ureaplasma diversum. Em: 17th Congress of the International Organization for Mycoplasmology, 2008, Tianjin, China. Abstracts of the 17th IOM Congress, v. 1, p. 62, 2008.
86.	MARTINS, D. C. ; BRAGA-NETO, U. ; BITTNER, M. L. ; HASHIMOTO, R. F. ; DOUGHERTY, E. R.. Intrinsically Multivariate Predictive Genes. IEEE Journal of Selected Topics in Signal Processing. v. 2, p. 424-439, 2008. Qualis: A1
87.	MASCHIETTO, M. ; BASTOS, E. P. ; DIAS, A. A. M. ; PICCOLI, F. S. ; COUDRY, R. ; SOARES, F. A. ; BRENTANI, H. P. ; DE CAMARGO, B. ; CARRARO, D. M.. Gene expression characterization of WNT signaling pathway during kidney embryogenesis and their implications in Wilms tumors. 2008. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
88.	MASCHIETTO, M. ; DE CAMARGO, B. ; BRENTANI. HP ; GRUNDY, P. ; SREDNI, S. T. ; TORRES, C. H. ; MOTA, L. D. ; CUNHA, I. W. ; PATRÃO, D. F. C. ; COSTA, C. M. L. ; SOARES, F. A. ; BRENTANI, R. R. ; CARRARO, D. M.. Molecular profiling of isolated histological components of wilms tumor implicates a common role for the Wnt signaling pathway in kidney and tumor development. Oncology (Basel). v. 75, p. 81-91, 2008. Qualis: A4
89.	MASCHIETTO, M. ; PICCOLI, F. S. ; FAHHAM, L. V. ; BASTOS, E. P. ; DE CAMARGO, B. ; COUDRY, R. ; DIAS, A. A. M. ; BRENTANI, H. P. ; NEVES, E. J. ; CARRARO, D. M.. Characterization of common regulation of genes belonged to transduction signaling pathway that include p13K embryogenesis and Wilms tumors. 2008. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
90.	MASCHIETTO, M. ; PICCOLI, F. S. ; FAHHAM, L. V. ; BASTOS, E. P. ; DE CAMARGO, B. ; COUDRY, R. ; DIAS, A. A. M. ; BRENTANI, H. P. ; NEVES, E. J. ; CARRARO, D. M.. Caracterização dos genes da via de sinalização celular WNT regulados durante a embriogênese do rim e no tumor de Wilms. 2008. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
91.	MASCHIETTO, M. ; TRAPE, A. ; TORRES, C. H. ; GALANTE, P. A. F. ; DE SOUZA, S. J. ; BRENTANI, H. P. ; CARRARO, D. M.. Establishment of cross-species hybridization of human and mouse transcriptomes on a platform of cDNA microarray. 2008. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
92.	Matos, G. ; Vicente, E. ; Botte, S. ; Santos, A.M. ; Sameshima, Koichi ; Baldo, M. V. C. ; Valle, A. C.. Análise dos processos epileptogênicos em ratos submetidos a privação de sono paradoxal (modelo da pilocarpina). Em: I IBRO/LARC Congress of Neurosciences of Latin America, the Caribbean and Iberian Peninsula, 2008, Búzios. Annals of I IBRO/LARC Congress of Neurosciences of Latin America, the Caribbean and Iberian Peninsula, 2008.
93.	MENOSSI, M. ; SILVA-FILHO, M. C. ; Vincentz, M. ; Van-Sluys, M.-A. ; Souza, G. M.. Sugarcane Functional Genomics: Gene Discovery for Agronomic Trait Development. . v. 2008, p. 1-12, 2008. Qualis: Não identificado ()
94.	MEOLA, J. ; DENTILLO, D. B. ; ROSA E SILVA, J. C. ; FERRIANI, R. A. ; VEIGA-CASTELLI, L. C. ; PARO DE PAZ, C. C. ; GIULIATTI, S. ; MARTELLI, L. R.. Expressão da Glicodelina em Endometriose. Em: IX Simpósio Nacional de Biologia Molecular Aplicada à Medicina, 2008, São Paulo, SP. Anais, 2008.
95.	MONTEIROVITORELLO, C B ; ZERILLO, M. M. ; VAN SLUYS, M A ; CAMARGO, Luis Eduardo Aranha. Genome Sequence-based Insights into the Biology of the Sugarcane Pathogen Leifsonia xyli subsp. xyli. Em: Robert W. Jackson. (Org.). Plant Pathogenic Bacteria: Genomics and Molecular Biology |. Reading. : Caister Academic Press. 2008.v. prelo, p. 2009.
96.	NARDI, A. ; NASCIMENTO, D. R. B. ; PONTES, M. R. ; SEIXAS, T. T. ; GRACAS, F. A. F. ; FERREIRA, J. E.. Um Padrão Canônico para Controle de Paralelização em Aplicações de e-Science. Em: Simposio Brasileiro de Banco de Dados, v. 1, p. 268-279, 2008.Qualis: Não identificado (Simposio Brasileiro de Banco de Dados)
97.	Nobre, J.S. ; SOLER, J. M. P. ; PEREIRA, A. C. ; KRIEGER, J. E.. Heritability and covariate effects in a Brazilian family study. Em: International Biometric Conference, 2008, Dublin. Proceedings of the International Biometric Conference, 2008.
98.	OLIVEIRA, G ; FRANCO, G ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S.. The Brazilian contribution to the study of the Schistosoma mansoni transcriptome. Acta Tropica. v. 108, p. 179-182, 2008. Qualis: A1
99.	OLIVEIRA, L. L. ; GIULIATTI, S ; TINÓS, R.. Construção de um Sistema Computacional de Auxílio ao Estudo de Proteínas de Venenos de Serpentes. Em: 16º SIICUSP: Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo, 2008, Ribeirão Preto, SP. Anais, 2008.
100.	OLIVEIRA, L. L. ; GIULIATTI, S. ; TINÓS, R.. Algoritmos Genéticos para Seleção de Atributos no Problema de Classificação de Plantas Medicinais com Propriedades Antivenenos. Em: II Workshop on Computational Intelligence, p. 99-104, 2008.Qualis: Não identificado (II Workshop on Computational Intelligence)
101.	OLIVEIRA, L. L. ; GIULIATTI, S. ; TINÓS, R.. Construção de um Sistema Computacional de Auxílio ao Estudo de Proteínas de Venenos de Serpentes. 2008. Apresentação de Trabalho/Simpósio
102.	OLIVEIRA, L. L. ; MIRANDA, G. H. B. ; YNOUE, K. C. ; PEREIRA, V. S. ; SOUZA, M. L. ; BERNARDES, L. A. S. ; SANCHES, P. R. ; GIULIATTI, S. Desenvolvimento de uma Ferramenta Web para Análise Automática de Cromatogramas. Em: XI Congresso Brasileiro de Informática em Saúde, 2008, Campos do Jordão, SP. Anais, 2008.
103.	OLIVEIRA, L. L. ; TINÓS, R. ; GIULIATTI, S. Algoritmos Genéticos para Seleção de Atributos no Problema de Classificação de Plantas Medicinais com Propriedades Antivenenos. Em: 19th Brazilian Symposium on Artificial Intelligence e 10th Brazilian Symposium on Artificial Neural Networks, 2008, Salvador, BA. Anais, 2008.
104.	OLIVEIRA, L. L. ; TINÓS, R. ; GIULIATTI, S.. Algoritmos Genéticos para Seleção de Atributos no Problema de Classificação de Plantas Medicinais com Propriedades Antivenenos. 2008. Apresentação de Trabalho/Simpósio
105.	Oliveira, P.T.M. ; SOLER, J. M. P. ; PEREIRA, A. C.. Aplicação do Algoritmo Genético no Mapeamento de Genes Epistáticos em Cruzamentos Controlados. Em: 18o. SINAPE, 2008, Estância de São Pedro. Resumos do 18o. SINAPE, 2008. Qualis: Não identificado (18O. SINAPE, 2008, ESTÂNCIA DE SÃO PEDRO. RESUMOS DO 18O. SINAPE)
106.	OLIVEIRA, R. C. ; YAMAGUTI, M. ; GUIMARAES, A. M. S. ; BUZINHANI, M. ; MARQUES, L. M. ; RIZZO, H. ; GREGORY, L. ; TIMENETSKY, J.. Genotypic variation of Ureaplasma species isolated from bovine and ovine samples. Em: 17th Congress of the International Organization for Mycoplasmology, 2008, Tianjin, China. Abstracts of the 17th IOM Congress, v. 1, p. 104, 2008.
107.	Oliveira. C.M. ; PEREIRA, A. C. ; de Andrade, M. ; SOLER, J. M. P. ; KRIEGER, J. E.. Heritability of cardiovascular risk factors in a Brazilian population: Baependi Heart Study. BMC Medical Genetics. v. 32, p. 1-8, 2008. Qualis: A4
108.	OSORIO, F. ; SOLER, J. M. P. ; PEREIRA, A. C.. Local influence in pedigree data. Em: International Biometric Conference - IBC, 2008, Dublin. Proceedings of the International Biometric Conference, 2008.
109.	PEREIRA, V. S. ; GIULIATTI, S. Desenvolvimento de um Sistema Web para Integração dos Dados Referentes ao Banco de Conservação Ex-Situ da USP-RP. Em: 16º SIICUSP: Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo, 2008, Ribeirão Preto, SP. Anais, 2008.
110.	PERSINOTI, G. F. ; JUNTA, C. M. ; PASSOS JUNIOR, G. A. S. ; LOUZADA-JUNIOR, P. ; GIULIATTI, S.. Sistema ARIA: Artrite Reumatóide e Inteligência Artificial na Análise de Dados Clínicos e de Expressão Gênica. 2008. Apresentação de Trabalho/Congresso
111.	PERSINOTI, G. F. ; JUNTA, C. M. ; Passos, Geraldo A. S. ; LOUZADA-JUNIOR, P. ; GIULIATTI, S. Sistema ARIA: Artrite Reumatóide e Inteligência Artificial na Análise de Dados e de Expressão Gênica. Em: 54º Congresso Brasileiro de Genética, 2008, Salvador, BA. Anais, 2008.
112.	PICCOLI, F. S. ; MASCHIETTO, M. ; FAHHAM, L. V. ; BASTOS, E. P. ; DE CAMARGO, B. ; SOARES, F. A. ; BRENTANI, H. P. ; NEVES, E. J. ; CARRARO, D. M.. Characterization of expression profile of genes belonged to transdiction signaling pathway that included PI3K in relapsed and non-realapsed blastemas Wilms tumors. 2008. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
113.	PICCOLI, F. S. ; MASCHIETTO, M. ; FAHHAM, L. V. ; MOTA, L. D. ; SOARES, F. A. ; BRENTANI, H. P. ; NEVES, E. J. ; DE CAMARGO, B. ; CARRARO, D. M.. Molecular markers as predictors of adverse outcome in Wilms tumors. 2008. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
114.	PINTO, B. J. ; JUNTA, C. M. ; PASSOS JUNIOR, G. A. S. ; GIULIATTI, S.. Machine Learning's Techniques Applied in the Study of the Profiles of Particular and Common Gene Expression of Autoimmune Diseases and Cancer. Em: ISMB 2008, 2008, Toronto. ISMB 2008 Proceedings, 2008.
115.	Pires dos Santos, Andrea ; SANTOS, R. P. ; BIONDO, A. W. ; DORA, J. M. ; GOLDANI, L. Z. ; OLIVEIRA, S. T. ; GUIMARAES, A. M. S. ; TIMENETSKY, J. ; de Morais, H. A. ; GONZALEZ, F. H. D. ; MESSICK, J. B.. Hemoplasma Infection in HIV-positive Patient, Brazil. Emerging Infectious Diseases (Print). v. 14, p. 1922-1924, 2008. Qualis: A1
116.	Proença, R. P. ; SAMESHIMA, K. ; Garzon, E. ; LANA, Luiz Henrique Vargas de ; Takahashi, D. Y.. Characterization of the effective connectivity networks inferred through partial directed coherence during episodes of mesial temporal epileptic seizure. Em: I IBRO/LARC Congress of Neurosciences of Latin America, the Caribbean and Iberian Peninsula, 2008, Buzios. Annals of I IBRO/LARC Congress of Neurosciences of Latin America, the Caribbean and Iberian Peninsula, 2008.
117.	Purkayastha, A. ; Crasta, Oswald R ; Eckart, J. D. ; Czar, M. J. ; Meng, X. J. ; Setubal, Joao C. ; Sobral, B. W.. Bioinformatics resources for the study of viruses at the Virginia Bioinformatics Institute. Em: R. Holland Cheng; Tatsuo Miyamura. (Org.). Structure-based Study of Virus Replication. Stockholm. : World Scientific Publishing Company. 2008.p. 267-288.
118.	Querec, Troy D ; Akondy, Rama S ; Lee, Eva K ; Cao, Weiping ; Nakaya, Helder I ; Teuwen, Dirk ; Pirani, Ali ; Gernert, Kim ; Deng, Jiusheng ; Marzolf, Bruz ; Kennedy, Kathleen ; Wu, Haiyan ; Bennouna, Soumaya ; Oluoch, Herold ; Miller, Joseph ; Vencio, Ricardo Z ; Mulligan, Mark ; Aderem, Alan ; Ahmed, Rafi ; Pulendran, Bali ; et.al. Systems biology approach predicts immunogenicity of the yellow fever vaccine in humans. Nature Immunology. v. 10, p. 116-125, 2008. Qualis: A1
119.	RAM, Rossetti ; JCC, Lorenzi ; S, Giuliatti ; CL, Silva ; AAM, Coelho-Castelo. In Silico Prediction of the Tertiary Structure of M. leprae Hsp65 Protein Shows an Unusual Structure in Carboxy-terminal Region. Journal of Computer Science and Systems Biology (Online). v. 01, p. 126-131, 2008. Qualis: Não identificado (LEPRAE HSP65 PROTEIN SHOWS AN UNUSUAL STRUCTURE IN CARBOXY-TERMINAL REGION. JOURNAL OF COMPUTER SCIENCE AND SYSTEMS BIOLOGY)
120.	RANGEL, M. M. C. ; FERREIRA, E. M. ; BASTOS, E. P. ; KIRSHBAUM-SLAGER, N. S. ; CAMPOS, A. H. ; CAMARGO, L. P. ; DE SOUZA, S. J. ; BRENTANI, H. P. ; CARRARO, D. M.. Variantes de splicing de BRRN1, MK-STYX Y TRIM37 son potenciales marcadores moleculares em câncer de mama. Em: 13º Congreso Latinoamericano de Genética/VI Congreso Peruano de Genética, Associação Latinoamericana de Genética, 2008, Peru. Revista Latinoamericana de Genética. Peru, v. 1, p. 129, 2008.
121.	RANGEL, M. M. C. ; FERREIRA, E. N. E. ; BASTOS, E. P. ; KIRSHBAUM-SLAGER, N. S. ; CAMARGO, L. P. ; DE SOUZA, S. J. ; BRENTANI, H. P. ; CARRARO, D. M.. Splicing variants of TRIM37 and MK-STYX are potential molecular markers in breast cancer. Em: 99th AACR Annual Meeting, 2008, San Diego-CA. Proc Amer Assoc Cancer Res. Oakland: AACR, v. 49, p. A195, 2008.
122.	RIBEIRO, J. H. B. ; HASHIMOTO, R. F.. A New Training Algorithm for Pattern Recognition Technique Based on Straight Line Segments. Em: SIBGRAPI 2008, 2008. Qualis: Não identificado (SIBGRAPI 2008)
123.	RINCONES, J. ; SCARPARI, L. M. ; CARAZZOLLE, M. F. ; MONDENGO, J. M. C. ; FORMIGHIERI, E. F. ; Barau, J. G. ; COSTA, G. G. L. ; CARRARO, D. M. ; Brentani, Helena P. ; VILAS-BOAS, L. A. ; OLIVEIRA, B. V. ; SABHA, M. ; DIAS, R. ; CASCARDO, J. M. ; AZEVEDO, R. A. ; MEINHARDT, L. W. ; PEREIRA, G. A. G.. Differential Gene Expression Between the Biotrophic-Like and Saprotrophic Mycelia of the Witches' Broom Pathogen. Molecular Plant-Microbe Interactions. v. 21, p. 891-908, 2008. Qualis: A1
124.	Rodrigues, P. A. L. ; Sameshima, Koichi ; Zaidan, E.. Perfil de desempenho em teste de triagem de processamento auditivo (SCAN) em crianças de sete e oito anos residentes em Cuiabá. Revista da Sociedade Brasileira de Fonoaudiologia. v. 13, p. 173-178, 2008. Qualis: Não identificado (REVISTA DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE FONOAUDIOLOGIA)
125.	ROSA, A.C. ; LESSINGER, A.C. ; AZEREDO-ESPIN, A.M.L. ; TORRES, T.T.. Isolation and characterization of polymorphic microsatellite loci for the horn fly, Haematobia irritans (L.) (Diptera: Muscidae). Molecular Ecology Notes. v. 8, p. 971-973, 2008. Qualis: Não identificado (MOLECULAR ECOLOGY NOTES)
126.	ROSSETTI, R. A. M. ; LORENZI, J. C. C. ; GIULIATTI, S ; COELHO-CASTELO, A. A.. Determination In Silico of the Hsp65 Protein Tertiary Structure and the its mRNA Secondary Structure to Improved Hsp65DNA Vaccine. Em: X-meeting and 4st Annual AB3C Conference, 2008, Salvador, BA. Anais, 2008.
127.	ROSSETTI, R. A. M. ; LORENZI, J. C. C. ; GIULIATTI, S. ; COELHO-CASTELO, A. A.. Determination In Silico of the HSP65 Protein Tertiary Structure and its mRNA Secondary Structure to Improved HSP65DNA Vaccine. 2008. Apresentação de Trabalho/Congresso
128.	ROSSETTI, R. A. M. ; LORENZI, J. C. C. ; SILVA, R. L. L. ; GIULIATTI, S ; SILVA, C. L. ; COELHO-CASTELO, A. A.. Determinação da Estrutura 3D da Proteína Hsp65 e da Estrutura 2D de seu RNA Mensageiro, usando Análise in silico. Em: 16º SIICUSP: Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo, 2008, Ribeirão Preto, SP. Anais, 2008.
129.	ROSSETTI, R. A. M. ; LORENZI, J. C. C. ; SILVA, R. L. L. ; GIULIATTI, S. ; SILVA, C. L. ; COELHO-CASTELO, A. A.. Determinação da Estrutura 3D da Proteína OSP65 e da Estrutura 2D de seu RNA Mensageiro, usando Análise In Silico. 2008. Apresentação de Trabalho/Simpósio
130.	ROZENCHAN, P. B. ; KATAYAMA, M. L. H. ; BRENTANI, H. P. ; TORRES, C. H. ; LYRA, E. C. ; ROELA, R. A. ; FOLGUEIRA, M. A. A. K. ; BROMBERG, N. ; SANTOS, M. M. S. ; SILVA JUNIOR, W. A. ; BRENTANI, M. M.. Molecular characterization of carcinoma associated fibroblasts and those derived from normal breast tissue. Em: 99th AACR Annual Meeting, 2008, San Diego-CA. Proceedings of the American Association for Cancer Research. Oakland: AACR, v. 49, p. 3712, 2008.
131.	Salem-Izacc, S. M. ; KOIDE, T. ; Vencio, R. Z. N. ; Gomes, S. L.. Global Gene Expression Analysis during Germination in the Chytridiomycete Blastocladiella emersonii. Eukaryotic Cell. v. 8, p. 170-180, 2008. Qualis: Não identificado (EUKARYOTIC CELL)
132.	Salzberg, Steven L ; Sommer, Daniel D ; Schatz, Michael C ; Phillippy, Adam M ; Rabinowicz, Pablo D ; Tsuge, Seiji ; Furutani, Ayako ; Ochiai, Hirokazu ; Delcher, Arthur L ; Kelley, David ; Madupu, Ramana ; Puiu, Daniela ; Radune, Diana ; Shumway, Martin ; Trapnell, Cole ; Aparna, Gudlur ; Jha, Gopaljee ; Pandey, Alok ; Patil, Prabhu B ; SLUYS MAV. ; et.al. Genome sequence and rapid evolution of the rice pathogen Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A. BMC Genomics. v. 9, p. 204, 2008. Qualis: A2
133.	SAMAIA, H. B.; VÊNCIO, R. Z. N.. Statistical methods in serial analisys of gene expression (SAGE). Em: Wei Zhang; Ilya Shmulevich. (Org.). Computational and statistical spproaches to genomics genomics. 2nded.New York. : Springer. 2008.v. 1, p. 209-234.
134.	Sameshima, Koichi; Takahashi, D. Y. ; Baccalá, L. A.. Confidence intervals and statistical tests for some multivariate parametric neural connectivity inference methods in frequency domain: coherence, partial coherence, directed coherence, and partial directed coherence. Em: The 38th Annual Meeting of the Society for Neuroscience, 2008, Washington, DC. Abstract of The 38th Annual Meeting of the Society for Neuroscience. Washington DC: Society for Neuroscience, 2008.
135.	Sameshima, Koichi; Takahashi, D. Y. ; Baccalá, L. A.. Confidence intervals and statistical tests for some multivariate parametric neural connectivity inference methods in frequency domain: coherence, partial coherence, directed coherence, and partial directed coherence. 2008. Apresentação de Trabalho/Comunicação
136.	SAMPAIO, C. ; GIULIATTI, S. Análise In Silico de Biblioteca de cDNA de Glândula de Peçonha da Aranha Parawixia bistriata. Em: 8º Congresso Nacional de Iniciação Científica e 6º Congresso Internacional de Iniciação Científica, 2008, Botucatu, SP. Anais, 2008.
137.	Santos, L. M. ; Dzirasa, K. ; Kubo, R. ; Silva, M. T. A. ; Ribeiro, S. ; Sameshima, Koichi ; Valle, A. C. ; Timo-Iaria, C.. Baseline hippocampal theta oscillation speeds correlate with rate of operant task acquisition. Behavioural Brain Research. v. 190, p. 152-155, 2008. Qualis: A2
138.	Sato, J. R. ; Amaro Jr., E. ; Takahashi, D. Y. ; Arcuri, S. M. ; Morettin, P. A. ; SAMESHIMA, K. ; Baccalá, L. A.. Identifying stimulus-induced functional connectivity using partial directed coherence. Em: The 14th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, 2008, Melbourne. Neuroimage (Orlando, Fla. Print). Nova Iorque: Elsevier, v. 41, p. S126-S126, 2008.
139.	Sato, J. R. ; Baccalá, L. A. ; SAMESHIMA, K. ; Amaro Jr., E.. Identificação de redes de conectividade cerebral em dados de EEG-RMf utilizando a coerência parcial direcionada. Em: LL Min; PT Fenandes; RJM Covolan; F Cendes. (Org.). Neurociência e Epilepsia. São Paulo. : Plêiades. 2008..
140.	Schefer, D. ; SOLER, J. M. P. ; PEREIRA, A. C.. Modelagem de Equações Estruturais no Mapeamento Genético em Cruzamentos Controlados. Em: 18o. SINAPE, 2008, Estância de São Pedro. Resumos do 18o. SINAPE, 2008. Qualis: Não identificado (18O. SINAPE, 2008, ESTÂNCIA DE SÃO PEDRO. RESUMOS DO 18O. SINAPE)
141.	Serafini, C. A. V. ; ROSA, G. A. ; GUIMARAES, A. M. S. ; de Morais, H. A. ; BIONDO, A. W.. Survey of Owned Feline and Canine Populations in Apartments from a Neighbourhood in Curitiba, Brazil. Zoonoses and Public Health (Print). v. 55, p. 402-405, 2008. Qualis: A1
142.	Setubal, J.C. Similarity Search (theory). Em: A. Gruber; A. M. Durham; C. Huynhtop; and H. del Portillo. (Org.). Bioinformatics in Tropical Disease Research: A Practical and Case-Study Approach. Bethesda, MD. : National Library of Medicine. 2008..
143.	Setubal, J.C.; Wood, Derek ; BURR, T. ; FARRAND, S. ; GOLDMAN, B. ; GOODNER, B. ; OTTEN, L. ; SLATER, S.. The Genomics of Agrobacterium: Insights into Pathogenicity, Biocontrol, and Evolution. Em: R. Jackson. (Org.). Plant Pathogenic Bacteria: Genomics and Molecular Biology. London. : Caister Academic Press. 2008..
144.	SILVA, A. R. T. ; BRENTANI. H. Biologia molecular da doença de Alzheimer. Em: Macedo, EC, Mendonça LIZ, Schlecht BBG, Ortiz KZ, Azambuja DA. (Org.). Avanços em neuropsicologia: das pesquisas à aplicação clínica. Santos. : Livraria Santos. 2008.p. 99-110.
145.	SLATER, S. ; GOODNER, B. ; Setubal, J.C. ; GOLDMAN, B. ; Wood, Derek ; NESTER, E. W.. The Agrobacterium tumefaciens C58 genome. Em: T. Tzfira and V. Citovsky. (Org.). Agrobacterium. New York. : Springer. 2008..
146.	SOBRAL, R. A. ; HONDA, S. T. ; KATAYAMA, M. L. H. ; BRENTANI. HP ; BRENTANI, M. M. ; PATRÃO, D. F. C. ; FOLGUEIRA, M. A. A. K.. Tumor slices as a model to evaluate doxorubicin in vitro treatment and expression of trios of genes PRSS11, MTSS1, CLPTM1 and PRSS11, MTSS1, SMYD2 in canine mammary gland cancer. Acta Veterinaria Scandinavica. v. 50, p. 27, 2008. Qualis: A2
147.	SOLER, J. M. P.; Neves, E.J. ; Giolo, S.R. ; ANDRADE, D. ; de Andrade, M. ; MIYAKAWA, A. ; KRIEGER, J. E.. Use of the Item Response Theory to Evaluate Gene Expression in Congenic Rat Strains. 2008. Apresentação de Trabalho/Outra
148.	SOUZA, A. P. ; Gaspar M. ; Emerson Alves Silva ; Eugênio Cesar Ulian ; Alessandro Jaquiel Waclawovsky ; MILTON YUTAKA NISHIYAMA-JR ; Renato Vicentini dos Santos ; Marcelo Menossi Teixeira ; Glaucia Mendes Souza ; BUCKERIDGE, M. S.. Elevated CO2 increases photosynthesis, biomass and productivity, and modifies gene expression in sugarcane. Plant, Cell and Environment. v. 31, p. 1116-1127, 2008. Qualis: A1
149.	SOUZA, A. P. ; Gaspar M. ; TINÉ, M. A. S. ; Buckeridge, Marcos S. ; BUCKERIDGE, M. S.. Ajustando os botões: como as plantas lidam com o aumento do CO2 atmosférico. Em: Marcos Silveira Buckeridge. (Org.). Biologia & Mudanças Climáticas no Brasil. 1ed.São Carlos. : Rima Editora. 2008.v. 1, p. 101-113.
150.	SOUZA, M. L. ; JORGE, D. M. M. ; GIULIATTI, S. Modelagem In Silico da Proteína Melittin II de Apis mellifera. Em: 16º SIICUSP: Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo, 2008, Ribeirão Preto, SP. Anais, 2008.
151.	Takahashi, D. Y. ; Baccalá, L. A. ; Sameshima, K.. Partial directed coherence asymptotics for VAR processes of infinite order. International Journal of Bioelectromagnetism. v. 10, p. 31-36, 2008.Qualis: Não identificado (INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOELECTROMAGNETISM)
152.	Tavares, J. R. ; de Souza, R. F. ; Meira, G. L. S. ; Gueiros-Filho, F. J.. Cytological Characterization of YpsB, a Novel Component of the Bacillus subtilis Divisome. Journal of Bacteriology (Print). v. 190, p. 7096-7107, 2008. Qualis: A3
153.	TORRES, T.T.; AZEREDO-ESPIN, A.M.L.. Characterization of polymorphic microsatellite markers for the blowfly Chrysomya albiceps (Diptera: Calliphoridae). Molecular Ecology Resources (Print). v. 8, p. 208-210, 2008. Qualis: A1
154.	TORRES, T.T.; METTA, M. ; OTTENWÄLDER, B. ; SCHLÖTTERER, C.. Gene expression profiling by massively parallel sequencing.. Genome Research. v. 18, p. 172-177, 2008. Qualis: A1
155.	Van, P.T. ; Schmid, A.K. ; King, N.L. ; Kaur, A. ; Pan, M. ; Whitehead, K. ; KOIDE, T. ; Facciotti, M.T. ; Goo, Y.A. ; Deutsch, E.W. ; Reiss, D.J. ; Mallick, P. ; Baliga, N.S.. Halobacterium salinarum NRC-1 PeptideAtlas: toward strategies for targeted proteomics and improved proteome coverage.. Journal of Proteome Research. v. 7, p. 3755-3764, 2008. Qualis: A1
156.	VARANI, A. M. ; LIMA, W. ; MOREIRA, L. M. ; OLIVEIRA, M. C. ; SOUZA, R. ; CIVEROLO, E. L. ; VASCONCELOS, Ana Tereza ; VAN SLUYS, M A. Common Genes and Genomic Breaks: A Detailed Case Study of the Xylella fastidiosa Genome Backbone and Evolutionary Insights. Em: Robert W. Jackson. (Org.). Plant Pathogenic Bacteria: Genomics and Molecular Biology. Reading. : Caister Academic Press. 2008.v. prelo, p. 2009.
157.	Verjovski-Almeida, S.; Verjovski-Almeida, S. ; DEMARCO, R. Current developments on Schistosoma proteomics. Acta Tropica. v. 108, p. 183-185, 2008. Qualis: A1
158.	VIBRANOVSKI, M. D.; KOERICH, L. B. ; CARVALHO, A. B.. Two New Y-Linked Genes in Drosophila melanogaster. Genetics (Austin, Tex.). v. 179, p. 2325-2327, 2008. Qualis: A2
159.	VIBRANOVSKI, M. D.; LOPES, H. F. ; KARR, T. L. ; LONG, M.. Male germline X inactivation and its consequences on the evolution of male related genes in Drosophila. 2008. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
160.	VIBRANOVSKI, M. D.; LOPES, H. F. ; KARR, T. L. ; LONG, M.. Male germline X inactivation and its consequences on the evolution of male related genes in Drosophila. 2008. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
161.	VIBRANOVSKI, M. D.; LOPES, H. F. ; KARR, T. L. ; LONG, M.. Male Germline X inactivation and the Evolution of Male Genes in Drosophila. 2008. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
162.	Yan, S. ; Liu, H. ; Mohr, T. J. ; Jenrette, J. ; Chiodini, R. ; Zaccardelli, M. ; SETUBAL, J. C. ; Vinatzer, B. A.. Role of Recombination in the Evolution of the Model Plant Pathogen Pseudomonas syringae pv. tomato DC3000, a Very Atypical Tomato Strain. Applied and Environmental Microbiology. v. 74, p. 3171-3181, 2008. Qualis: A1
163.	ZAIDAN, L. B. P. ; CHU, E. P. ; AIDAR, M. P. M. ; BUCKERIDGE, M. S.. Crescimento e Propagação de Plantas de Caesalpinia echinata Lam. Em: RIBEIRO, R.C.L.F.; BARBEDO, C.L.; ALVES, E.S.; DOMINGOS, M.; BRAGA, M.R.. (Org.). Pau-Brasil, da semente à madeira: conhecer para conservar. São Paulo. : Instituto de Botânica/SMA. 2008.p. 57-66.
164.	ZAINI, Paulo A. ; FOGAÇA, A.C. ; LUPO, F.N. G. ; NAKAYA, Helder I ; VENCIO, Ricardo Z N ; DASILVA, A.M.. The Iron Stimulon of Xylella fastidiosa Includes Genes for Type IV Pilus and Colicin V-Like Bacteriocins. Journal of Bacteriology. v. 190, p. 2368-2378, 2008. Qualis: A3
165.	Zerillo, Marcelo M ; VAN SLUYS, M A ; Camargo, Luis ; Monteiro-Vitorello, Claudia B. Characterization of new IS elements and studies of their dispersion in two subspecies of Leifsonia xyli. BMC Microbiology (Online). v. 8, p. 127, 2008. Qualis: A2
166.	ZULIANI, D. ; OIKAWA, M. K. ; MALKOWSKI, S. ; PEREZ-ALCAZAR, J. J. ; FERREIRA, J. E.. The RiverFish Approach to Business Process Modeling: Linking Business Steps to Control-Flow Patterns. Em: The 4th International Conference on Collaborative Computing, v. 1, p. 45-56, 2008.Qualis: Não identificado (The 4th International Conference on Collaborative Computing)

2007

1.	ABRANTES, E. F. ; CAMARGO, L. P. ; SANTOS, E. M. M. ; CANDIDO, P. M. ; FERREIRA, F. O. ; ROSSI, B. M. ; BRENTANI, H. P.. Development of a Web applications suitable for widespread familial cancer registry initiatives. 2007. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
2.	ABRANTES, E. F. ; CAMARGO, L. P. ; SANTOS, E. M. M. ; CANDIDO, P. M. ; ROSSI, B. M. ; BRENTANI, H. P.. Development of a web application suitable for widespread familial cancer registry initiatives. 2007. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
3.	AGUIAR JÚNIOR, S. ; CUNHA, I. W. ; MARTINS, W. K. ; BRENTANI, H. P. ; FERREIRA, F. O. ; ROSSI, B. M. ; LOPES, A.. Análise do perfil da expressão gênica em sarcomas de partes moles submetidos a quimioterapia neoadjuvante com Doxorrubicina e Ifosfamida. 2007. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
4.	ALVES, J. M. P.; BUCK, G. A.. Automated System for Gene Annotation and Metabolic Pathway Reconstruction Using General Sequence Databases. Chemistry & Biodiversity (Print). v. 4, p. 2593-2602, 2007. Qualis: A4
5.	AMARAL, L. I. V. DO ; Gaspar M. ; COSTA, P. F. ; AIDAR, M. P. M. ; BUCKERIDGE, M. S.. Novo método enzimático rápido e sensível de extração e dosagem de amido em materiais vegetais.. Hoehnea (São Paulo). v. 34, p. 425-431, 2007.Qualis: B4
6.	AMUI, S. F. ; PUGA, R. D. ; SOARES, A. M. ; GIULIATTI, S.. Biovenom: Database of Brazilian Serpents Venom and a Computational Analysis of Phospholipases A2 Primary Structures. Em: ISMB/ECCB 2007, 2007, Vienna. Conference Proceedings, 2007.
7.	ANDRIOLI, Luiz Paulo ; SOUZA, Glaucia Mendes ; DA SILVA, A. M.. Staurosporine induces tyrosine phosphorylation in Dictyostelium discoideum proteins. Cell Biochemistry and Function. v. 25, p. 555-561, 2007. Qualis: B1
8.	Baccalá, L. A. ; SAMESHIMA, K. ; Takahashi, D. Y.. Generalized partial directed coherence. Em: 15th International Conference on Digital Signal Processing (DSP 2007), v. 1, p. 163-166, 2007. Qualis: Não identificado (15th International Conference on Digital Signal Processing (DSP 2007))
9.	BARRERA, J. ; CESAR JÚNIOR, R. M. ; HUMES JUNIOR, C. ; MARTINS JÚNIOR, D. C. ; PATRÃO, D. F. C. ; SILVA, P. J. ; BRENTANI. HP. A feature selection approach for identification of signature genes from SAGE data.. BMC Bioinformatics. v. 8, p. 169, 2007. Qualis: A1
10.	Batista, M.J. ; SOLER, J. M. P. ; PEREIRA, A. C.. Seleção de genes via modelos de regressão logística uniloco e multiloco. Em: III SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 2007, São Paulo. ATAS DO III SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 2007. Qualis: Não identificado (III SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 2007, SÃO PAULO. ATAS DO III SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO)
11.	Batista, M.J. ; SOLER, J. M. P. ; PEREIRA, A. C.. Multiloci Model Selection in Genetic Association Analysis. Em: X Meeting - The Third Annual Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2007, São Paulo. Proceedings of the X-Meeting, 2007.
12.	Batista, M.J. ; SOLER, J. M. P. ; PEREIRA, A. C.. Multiloci Model Selection in Genetic Association Analysis. 2007. Apresentação de Trabalho/Comunicação
13.	Batista, M.J. ; SOLER, J. M. P. ; PEREIRA, A. C.. Seleção de Genes via Modelos de Regressão Logística Uni e Multi-locos. 2007. Apresentação de Trabalho/Comunicação
14.	BEGNANI, M. D. ; FREGNANI, J. H. ; NONOGAKI, S. ; TORRES, C. H. ; BRENTANI, H. P. ; SOARES, F. A.. Classificação molecular dos carcinomas gástricos. Em: XXVI Congresso Brasileiro de Patologia, 2007, Bento Gonçalves-RS. Jornal Brasileiro Patolologia Medicina Laboratorio. São Paulo: Sociedade Brasileira de Patologia, v. 43, p. 84-84, 2007.
15.	BERNARDES, L. A. S. ; GOLDMAN, G. H. ; GOLDMAN, M. H. S. ; GIULIATTI, S.. Correlation between Microarray Experiments and Gene Promoters of Aspergillus spp. Em: X-meeting 2007: AB3C International Conference, 2007, São Paulo, SP. Papers and Posters, 2007.
16.	Bisso-Machado, R ; HÜNEMEIER, T. ; SALZANO, F. M. ; BORTOLINI, M. C.. ESTIMATIVA DE DIVERSIDADE DO GENE TCOF1 EM POPULAÇÕES HUMANAS E DENTRO DA ORDEM PRIMATES: POSSÍVEIS IMPLICAÇÕES NA MORFOLOGIA DO CRÂNIO. Em: XIXI SALÃO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 2007, Porto Alegre. XIX SALÃO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 2007.
17.	BITARELLO, B.D. ; TORRES, T.T. ; AZEREDO-ESPIN, A.M.L.. Isolamento e Caracterização de Marcadores Microssatélites para a Mosca do Berne, Dermatobia hominis (Diptera: Oestridae). Em: 53o Congresso Brasileiro de Genética, 2007, Águas de Lindóia. Resumos do 53o Congresso Brasileiro de Genética, p. 348, 2007.
18.	BITARELLO, B.D. ; TORRES, T.T. ; AZEREDO-ESPIN, A.M.L.. Desenvolvimento de Marcadores Microssatélites Polimórficos para a Mosca do Berne, Dermatobia hominis (Diptera: Oestridae). Em: XV Congresso Interno de Iniciação Científica, 2007, Campinas. Caderno de Resumos do XV Congresso Interno de Iniciação Científica, p. 82, 2007.
19.	BRAGHETTO, KELLY ROSA ; Ferreira, João Eduardo ; Pu, Calton. Using control-flow patterns for specifying business processes in cooperative environments. Em: The 22nd Annual ACM Symposium on Applied Computing, p. 1234, 2007. Qualis: Não identificado (The 22nd Annual ACM Symposium on Applied Computing)
20.	BRANDAO, P. E. ; GUIMARAES, A. M. S. ; VILLAREAL, L. ; MORAES, W. ; CUBAS, Z. S. ; SANTOS, L. C. ; TIMENETSKY, J. ; BIONDO, A. W.. Feline coronavirus surveillance on a captive population of neotropical cats in Brazil based on polymerase chain reaction. Em: XVI Encontro da Associação Brasileira de Veterinários de Animais Selvagens, 2007, São Paulo. Anais do XVI Encontro da Associação Brasileira de Veterinários de Animais Selvagens, v. 1, 2007.
21.	BRENTANI, H. P. Estatística em bioinformática. 2007. Apresentação de Trabalho/Comunicação
22.	BREVE, A. L. S. ; PASSOS JUNIOR, G. A. S. ; GIULIATTI, S.. Prediction In Silico of Molecular Mimicry between Microorganisms Epitope and Human Autoantigens. Em: X-meeting 2007: AB3C International Conference, 2007, São Paulo, SP. Papers and Posters, 2007.
23.	BUCKERIDGE, M. S. Mudanças climáticas, biodiversidade e sociedade: como a teoria de redes pode ajudar a compreender o presente e planejar o futuro?. Multiciência (UNICAMP). v. 8, p. 88-107, 2007.Qualis: Não identificado (MULTICIÊNCIA)
24.	BUCKERIDGE, M. S. Etanol de quê?A cana é hoje a melhor opção para produzir álcool, mas o milho e sobretudo a mandioca também têm bom potencial. Revista Pesquisa FAPESP, 28 nov. 2007.
25.	BUCKERIDGE, M. S. Abrindo o guarda-chuva verde. As cidades precisam de mais árvores, mas há prós e contras em plantar mais exemplares no meio urbano. Revista Pesquisa FAPESP, São Paulo, 04 out. 2007.
26.	BUCKERIDGE, M. S. Aquecimento global "engorda" as plantas. Mudanças climáticas podem, em tese, acelerar os processos ecológicos e gerar vegetais obesos e que vivem menos. Revista Pesquisa FAPESP, São Paulo, 03 set. 2007.
27.	BUCKERIDGE, M. S. Seqüestro de carbono, cana-de-açúcar e o efeito Cinderela. ComCiencia Revista Eletrônica de Jornalismo Científico, Campinas, 10 abr. 2007.
28.	BUCKERIDGE, M. S. Canavial versus floresta, um dilema estratégico para o Brasil no século 21. Jornal da USP, São Paulo, p. 6-7, 12 mar. 2007.
29.	BUCKERIDGE, M. S.; MORTARI L.C. ; MACHADO, M. R.. Respostas fisiológicas de plantas às mudanças climáticas: alterações no balanço de carbono nas plantas podem afetar o ecossistema?. Em: Rego, G.M.; Negrelle, R.R.n; Morellato, L.P.C.. (Org.). Fenologia - Ferramenta pra a conservação e manejo de recursos vegetais arbóreos. Colombo, PR. : Embrapa. 2007.p. 1-13.
30.	CALMON, M. F. ; RODRIGUES, R. V. ; MOURA, R. P. ; COSTA, M. C. F. ; KANETO, C. M. ; KAIANO, J. ; MELATO, L. ; MOLFETTA, G. A. ; ZANELLI, C. ; BRENTANI, H. P. ; TAJARA, H. H. ; CAMARGO, A. A. ; CAMARGO, D. M. ; SILVA JUNIOR, W. A. ; RAHAL, P. ; VALENTINI, S. R.. Analysis of gene expression and DNA methylation of biomarkers candidates for head and neck tumors. Em: VIII São Paulo Research Conference ? Cancer Today from Molecular Biology to Treatment, 2007, São Paulo-SP. Applied cancer Research. São Paulo: Fundação Antonio Prudente (FAP), v. 27, p. 87-87, 2007.
31.	CAMINITI, G. B. ; FARIA JUNIOR, M. ; MESTRINER, M. A. ; ALZATE-MARIN, A. L. ; GIULIATTI, S.. A Development of a Geographic Information Web Sustem of USP-RP Germoplasm Database. Em: ISMB/ECCB 2007, 2007, Vienna. Conference Proceedings, 2007.
32.	CANTAO, M. ; FERREIRA, J. E. ; LEMOS, E. G. M.. Optimal Clones Identifier for Genomic Shotgun Libraries: OC Identifier Tool. GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH. v. 6, p. 743-755, 2007.Qualis: B3
33.	CARRARO, D. M. ; SAMAIA, H. B. ; SOARES, F. A. ; REIS, L. F. L. ; BRENTANI, R. R.. From tissue sample to tumor markers. Em: Appasani K. (Org.). BioArrays: from basics to diagnostics. New Jersey. : Human Press. 2007.p. 17-28.
34.	CARREIRA, A. C. O. ; BASTOS, C. ; Verjovski-Almeida, S.. Probing SERCA1a sarcoplasmic reticulum Ca2+-ATPase phosphorylation-site mutant D351E with inorganic phosphate. Brazilian Journal of Medical and Biological Research. v. 40, p. 1323-1332, 2007. Qualis: A4
35.	CASTRO, N. P. ; OSÓRIO, C. A. B. T. ; BASTOS, E. P. ; TORRES, C. H. ; MOURÃO NETO, M. ; SOARES, F. A. ; BRENTANI, H. P. ; CARRARO, D. M.. Evidence of molecular program of ductal carcinoma magnization process taking place before its morphological alterations. 2007. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
36.	CASTRO, N. P. ; OSÓRIO, C. A. B. T. ; KAIANO, J. ; PATRÃO, D. F. C. ; CAMARGO, A. A. ; SOARES, F. A. ; BRENTANI, H. P. ; CARRARO, D. M.. Identification of putative genes involved in the transition from in situ to invasive ductal carcinoma of the breast by combining laser capture microdissection and microarray. Em: VIII São Paulo Research Conference ? Cancer Today from Molecular Biology to Treatment, 2007, São Paulo-SP. Applied Cancer Research. São Paulo: Fundação Antonio Prudente (FAP), v. 27, p. 111-111, 2007.
37.	CHIROMATZO, A. O. ; OLIVEIRA, T. Y. K. ; PEREIRA, G. ; COSTA, A. Y. ; MONTESCO, C. A. E. ; GRAS, D. E. ; YOSETAKE, F. ; CERVATO, M. C. ; PRADO, P. R. R. ; CARDENAS, R. G. C. C. L. ; CERRI, R. ; BORGES, R. L. ; LEMOS, R. N. ; ALVARENGA, S. M. ; PERALLIS, V. R. C. ; PINHEIRO, D. G. ; SILVA, I. T. ; BRANDÃO, R. M. ; CUNHA, M. A. V. ; GIULIATTI, S. ; et.al. miRNApath: a database of miRNAs, target genes and metabolic pathways. Genetics and Molecular Research. v. 6, p. 859-865, 2007.Qualis: B3
38.	da Rosa, GA ; Serafin, CA ; GUIMARAES, A. M. S. ; Ultime, R. ; BIONDO, A. W.. Levantamento populacional de cães e gatos em apartamentos de um bairro em Curitiba, Brasil. Em: 15 Evinci - UFPR, 2007, Curitiba. Livro de Resumos do 15 EVINCI, p. 66, 2007.
39.	da Silva Neto, J. F. ; KOIDE, T. ; Abe, C.M. ; Gomes, S. L. ; MARQUES, M. V.. Role of sigma54 in the regulation of genes involved in type I and type IV pili biogenesis in Xylella fastidiosa. Archives of Microbiology. v. 189, p. 249-261, 2007. Qualis: B2
40.	da Silva Neto, J. F. ; KOIDE, T. ; Gomes, S. L. ; MARQUES, M. V.. Regulation of fimbrial genes by sigma54 factor in Xylella fastidiosa. Em: XXXVI Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology (SBBq) and 10th International Union of Biochemistry and Molecular Biology (IUBMB) Conference, 2007, Salvador. XXXVI Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology (SBBq) and 10th International Union of Biochemistry and Molecular Biology (IUBMB) Conference, p. 70, 2007.
41.	da Silva Neto, J. F. ; KOIDE, T. ; MARQUES, M. V. ; Gomes, S. L.. The single extracytoplasmic-function sigma factor of Xylella fastidiosa is involved in the heat shock response and presents an unusual regulatory mechanism.. Journal of Bacteriology. v. 189, p. 551-560, 2007. Qualis: A3
42.	da Silva, Aline M; ZAINI, Paulo A. ; FOGAÇA, A.C.. The iron stimulon of Xylella fastidiosa. 2007. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
43.	DASILVA, J ; FERNANDES, R ; TICLI, F ; OLIVEIRA, C ; MAZZI, M ; FRANCO, J ; GIULIATTI, S ; PEREIRA, P ; SOARES, A ; SAMPAIO, S. Triterpenoid saponins, new metalloprotease snake venom inhibitors isolated from Pentaclethra macroloba. Toxicon (Oxford). v. 50, p. 283-291, 2007. Qualis: A4
44.	de Morais, H. A. ; GUIMARAES, A. M. S. ; VIDOTTO, O ; BAUMANN, A ; BIONDO, A. W. ; MESSICK, J. B.. Co-infection with Mycoplasma haemofelis and `Candidatus Mycoplasma haemominutum¿ in three cats from Brazil?. Journal of Feline Medicine and Surgery. v. 9, p. 518-520, 2007. Qualis: A1
45.	de Souza, R. F.; de Souza, S. J. ; Gueiros-Filho, F. J.. IN-SILICO CHARACTERIZATION OF A NOVEL DOMAIN OF THE CELL DIVISION PROTEIN AMIC. 2007. Apresentação de Trabalho/Congresso
46.	De Souza, Robson F; de Souza, S. J. ; Gueiros-Filho, F. J.. tAMIC: A new conserved domain of Periplasmic Proteins. 2007. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
47.	De Souza, Robson F; de Souza, S. J. ; Gueiros-Filho, F. J.. IN-SILICO CHARACTERIZATION OF A NOVEL DOMAIN OF THE CELL DIVISION PROTEIN AMIC. 2007. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
48.	DEMARCO, Ricardo ; Verjovski-Almeida, S.. Schistosome DNA transposons. Em: PJ Brindley. (Org.). Mobile genetic elements in metazoan parasites. Austin, Tx. : Eurekah Press/Landesbioscience. 2007..
49.	DIGIAMPIETRI, Luciano A. ; MEDEIROS, Claudia Maria Bauzer ; Setubal, J.C. ; BARGA, R.. Traceability Mechanisms for Bioinformatics Scientific Workflows. Em: Workshop on Semantic e-Science, 2007.Qualis: Não identificado (Workshop on Semantic e-Science)
50.	Duarte, N.E. ; SOLER, J. M. P. ; PEREIRA, A. C.. Análise univariada e multivariada no mapeamento genético da pressão arterial. Em: III SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 2007, São Paulo. ATAS DO III SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 2007. Qualis: Não identificado (III SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 2007, SÃO PAULO. ATAS DO III SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO)
51.	Duarte, N.E. ; SOLER, J. M. P. ; PEREIRA, A. C.. Uni and Multi-variate Analysis in the Genetic Mapping of Blood Pressure. Em: X Meeting - The Third Annual Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2007, São Paulo. Proceedings of the X-Meeting, 2007.
52.	DURHAM, A. M.; GUBITOSO, M. D.. Using Linux. Em: Gruber, A.;Durham A.M;Huynh, C.; del Portillo, H.. (Org.). Bioinformatics in Tropical Disease Research: A Practical and Case-Study Approach. Bethesda, Estados Unidos. : National Center for Biotechnology Information. 2007..
53.	DURHAM, A. M.; Ling KH ; MA, R. ; RIVAILLER, P. ; IVENS, A. ; MADEIRA, A. M. ; Mungall K. ; Novaes, J. ; Sobreira, T.J. ; GRUBER, A. ; BERRIMAN, M. ; Tomley, F. ; DEAR, P. H. ; WAN, K. L.. Sequencing and analysis of chromosome 1 of Eimeria tenella reveals a unique segmental organization. Genome Research. v. 17, p. 311-319, 2007. Qualis: A1
54.	DURHAM, A. M.; MACHADO-LIMA, A. ; Hernando A. del Portillo. Computational methods in noncoding RNA research. Journal of Mathematical Biology (Print). v. 56, p. 15-49, 2007. Qualis: A4
55.	FAN, C. ; VIBRANOVSKI, M. D. ; CHEN, Y. ; LONG, M.. A Microarray Based Genomic Hybridization Method for Identification of New Genes in Plants: Case Analyses of Arabidopsis and Oryza. Journal of Integrative Plant Biology. v. 49, p. 915-926, 2007. Qualis: A1
56.	Fanganiello RD ; Sertie AL ; REIS, E. M. ; Yeh, E ; OLIVEIRA, N. A. ; Bueno DF ; Kerkis I ; Alonso N ; Cavalheiro S ; Matsushita H ; Freitas R ; Verjovski-Almeida, S. ; Passos-Bueno MR. Apert p.Ser252Trp mutation in FGFR2 alters osteogenic potential and gene expression of cranial periosteal cells. Molecular Medicine (Cambridge). v. 13, p. 422-442, 2007. Qualis: Não identificado (MOLECULAR MEDICINE)
57.	FERREIRA, J. E. E-Science e workflows científicos: uma nova onda ou de fato um novo desafio ?. Computação Brasil, Porto Alegre RS, p. 3-3, 01 jan. 2007.
58.	FERREIRA, J. E. The use of Multidimensional Scaling as Applied to the BPM Performance in Brazilian e-Government Administration. 2007. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
59.	FERREIRA, J. E. Using Control-Flow Patterns for Specifying Business Processes in Cooperative Environments. 2007. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
60.	GIULIATTI, S.; JORGE, D. M. M. ; LAUREANO, M.. Análise In Silico de Estruturas Terciárias de Proteínas de Veneno de Apis Mellifera. 2007. Apresentação de Trabalho/Simpósio
61.	GIULIATTI, S.; ROSSETTI, R. A. M. ; LORENZI, J. C. C. ; SILVA, R. L. L. ; SILVA, C. L. ; COELHO-CASTELO, A. A.. Uso de Análise In Silico para Determinar a Estrutura 3D da Proteína Hsp65 de Mycobacterium Leprae. 2007. Apresentação de Trabalho/Simpósio
62.	GIULIATTI, S.; TINÓS, R. ; OLIVEIRA, L. L.. Seleção de Atributos no Problema de Classificação entre Venenos e Plantas Medicinais. 2007. Apresentação de Trabalho/Simpósio
63.	Gonçalves EG ; Mayo SJ ; SLUYS MAV. ; Salatino A. Combined genotypic-phenotypic phylogeny of the tribe Spathicarpeae (Araceae) with reference to independent events of invasion to Andean regions.. Molecular Phylogenetics and Evolution. v. jan, p. in press, 2007. Qualis: A1
64.	GROSSO, D. M. ; KATAYAMA, M. L. H. ; ROELA, R. A. ; TRAPE, A. ; BRENTANI, H. P. ; TORRES, C. H. ; BRENTANI, M. M.. Effects of rapamycin in gene expression profile on ErbB-2-Positive/ErbB2-Negative breast tissues in organ culture. Em: VIII São Paulo Research Conference ? Cancer Today from Molecular Biology to Treatment, 2007, São Paulo-SP. Applied cancer ResearchSupplement. São Paulo-SP: Fundação Antonio Prudente (FAP), v. 27, p. 80, 2007.
65.	GRUBER, A. (Org.) ; DURHAM, A. M. (Org.) ; HUYNH, C. (Org.) ; Hernando A. del Portillo (Org.). Bioinformatics in Tropical Disease Research: A Practical and Case-Study Approach. Bethesda, Estados Unidos: National Center for Biotechnology Information. Bioinformatics in Tropical Disease Research: A Practical and Case-Study Approach. Bethesda, Estados Unidos: National Center for Biotechnology Information, 2007. v. 1, p. 340.
66.	GUIMARAES, A. M. S.; BIONDO, A. W. ; LARA, A. C. ; MESSICK, J. B.. Exploratory study of Mycoplasma suis (Eperythrozoon suis) on four commercial pig farms in southern Brazil. Veterinary Record. v. 160, p. 50-53, 2007. Qualis: A1
67.	GUIMARAES, A. M. S.; JAVOROUSKI, M. L. ; Prosser, CS ; BONAT, M. ; LACERDA, O. ; TIMENETSKY, J. ; BIONDO, A. W. ; MESSICK, J. B.. Detection of " Candidatus Mycoplasma haemominutum" in a lion (Panthera leo) from a brazilian zoological garden. Em: Regional Feline Congress - Conpafel, 2007, Guarujá. Anais do Conpafel, v. aceito, p. aceito, 2007.
68.	GUIMARAES, A. M. S.; Javorouski, Manoel L. ; Bonat, Marcelo ; Lacerda, Oneida ; Balbinotti, Bruna ; Queiroz, Lucyenne G.P.B. ; Timenetsky, Jorge ; Biondo, Alexander W. ; Messick, Joanne B.. Molecular detection of "Candidatus Mycoplasma haemominutum" in a lion (Panthera leo) from a brazilian zoological garden. Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo (Impresso). v. 49, p. 195-196, 2007. Qualis: B1
69.	HASHIMOTO, R. F.; HIGA, C. H. A.. Modeling Yeast Cell-Cycle with Context Probabilistic Boolean Network. 2007. Apresentação de Trabalho/Congresso
70.	HAVLIOGLU, N. ; WANG, J. ; FUSHIMI, K. ; VIBRANOVSKI, M. D. ; KAN, Z. ; GISH, W. ; FEDOROV, A. ; LONG, M. ; WU, J. Y.. An Intronic Signal for Alternative Splicing in the Human Genome. PLoS One. v. 2, p. e1246, 2007. Qualis: A1
71.	HÜNEMEIER, T.; Carvalho, CB ; Marrero, AR ; SALZANO, F. M. ; BORTOLINI, M. C.. Niger-Congo speaking populations and the formation of the Brazilian gene pool: mtDNA and Y-chromosome data. American Journal of Physical Anthropology. v. 133, p. 854-867, 2007. Qualis: A2
72.	JORGE, D. M. M. ; PUGA, R. D. ; SOARES, A. M. ; GIULIATTI, S.. BeeVenom: a Venom Apoidea (Hymenoptera) and Medicinal Plant Relatioinship. Em: ISMB/ECCB 2007, 2007, Vienna. Conference Proceedings, 2007.
73.	JORGE, D. M. M. ; SOARES, A. M. ; GIULIATTI, S.. Phylogeny of the Venom Group III Phospholipase A2 Gene. Em: X-meeting 2007: AB3C International Conference, 2007, São Paulo, SP. Papers and Posters, 2007.
74.	JUNTA, C. M. ; FONTANA, V ; SANDRIN-GARCIA, P. ; FACHIN, A. L. ; MIELO, S. S. ; LOUZADA-JUNIOR, P. ; OLIVEIRA, R. D. R. ; RASSI, D. M. ; GIULIATTI, S. ; SAKAMOTO-HOJO, E. T. ; PASSOS JUNIOR, G. A. S.. A Gene Expression Signatures in Peripheral Blood Mononuclear Cells (PBMC) of Rheumatoid Arthritis Patients According Shared Epitope HLA Allele Dosage. Em: 53º Congresso Brasileiro de Genética, 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais, 2007.
75.	KASHIWABARA, A. Y. ; VIEIRA, D. ; LIMA, A. M. ; DURHAM, A. M.. Splice site prediction using stochastic regular grammars. GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH. v. 6, p. 105-115, 2007.Qualis: B3
76.	LEVANOGARCIA, Julio ; MORTARA, Renato A ; Verjovski-Almeida, S. ; DEMARCO, Ricardo. Characterization of Schistosoma mansoni ATPDase2 gene, a novel apyrase family member. Biochemical and Biophysical Research Communications. v. 352, p. 384-389, 2007. Qualis: A3
77.	LIMA, V. C. C. ; MARQUES, M. M. ; SPILBORGHS, G. M. ; MARQUES, S. M. ; HASHIMOTO, V. L. ; LANDMAN, G. ; RIBEIRO, K. C. B. ; TORRES, C. H. ; BRENTANI, H. P. ; CARVALHO, A. F. ; DIAS, A. A. M. ; REIS, L. F. L.. Towards the identification of TNF ad melphalan molecular targets in melanoma. Em: VIII São Paulo Research Conference ? Cancer Today from Molecular Biology to Treatment, 2007, São Paulo-SP. Applied Cancer Research. São Paulo: Fundação Antonio Prudente (FAP), v. 27, p. 124-125, 2007.
78.	LORENZI, J. C. C. ; PUGA, R. D. ; GIULIATTI, S. ; TROMBONE, A. P. F. ; ROCHA, C. D. ; GREMBRA, A. F. ; COELHO-CASTELO, A. A.. First Studies on Molecular Structure of hsp65 Protein and mRNA from Mycobacterium Leprae Based on In Silico Analysis. 2007. Apresentação de Trabalho/Simpósio
79.	LORENZI, J. C. C. ; ROSSETTI, R. A. M. ; GIULIATTI, S. ; TROMBONE, A. P. F. ; ROCHA, C. D. ; GREMBRA, A. F.. First Studies on Molecular Structure of hsp65 Protein and mRNA from Mycobacterium Leprae Based on In Silico Analysis. Em: Keystone Symposia on Molecular and Celular Biology - Challenges of Global Vaccine Development (T1), 2007, Cape Town. Abstract Book, 2007.
80.	LOURO, Rodrigo ; NAKAYA, Helder I ; AMARAL, P. P. ; FESTA, Fernanda ; SOGAYAR, Mari C ; DA SILVA, A. M. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; REIS, Eduardo M.. Androgen responsive intronic non-coding RNAs. BMC BIOLOGY. v. 5:4, p. 1-14, 2007. Qualis: A1
81.	MACHADO, A. F. ; HASHIMOTO, R. F. ; LAGO, A. P.. Efficient Binary Erosion Algorithm Based on a String-Matching-Like Technique. Em: International Symposium on Mathematical Morphology, 2007, Rio de Janeiro. International Symposium on Mathematical Morphology, 2007. Qualis: Não identificado (INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON MATHEMATICAL MORPHOLOGY, 2007, RIO DE JANEIRO. INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON MATHEMATICAL MORPHOLOGY)
82.	MALVAR, D. C. ; OLIVEIRA, C. ; KANASHIRO, A. ; MELO, G. O. ; JORGE, D. M. M. ; COSTA, S. S. ; GIULIATTI, S ; ROCHA, F. F. ; VANDERLINE, F. A.. Inibição de Fosfolipases A isoladas dos Venenos de Abelha Apis mellifera e de Serpente Bothrops jararacussu pelo Sumo de Sedum dendroideum. Em: 39º Congresso Brasileiro de Farmacologia e Terapêutica Experimental, 2007, Ribeirão Preto, SP. Anais, 2007.
83.	MALVAR, D. C. ; OLIVEIRA, C. ; KANASHIRO, A. ; MELO, G. O. ; JORGE, D. M. M. ; COSTA, S. S. ; GIULIATTI, S. ; ROCHA, F. F. ; VANDERLINE, F. A. ; SOARES, A. M.. Inibição de Fosfolipase A2 Isoladas dos Venenos de Abelha Apis mellifera e de Serpente Bothrops jararacussu pelo Sumo de Sedum Dendroideum. 2007. Apresentação de Trabalho/Congresso
84.	MANETTI, Maria Elisa ; ROSSI, M. ; COSTA, A. P. P. ; Clausen AM ; SLUYS MAV.. Radiation of the Tnt1 retrotransposon superfamily in three Solanaceae genera.. BMC Evolutionary Biology (Online). v. 7, p. 34, 2007. Qualis: A1
85.	MASCHIETTO, M. ; PICCOLI, F. S. ; MOTA, L. D. ; FAHHAM, L. V. ; SIMOES, A. C. Q. ; BRENTANI, H. P. ; NEVES, E. J. ; DE CAMARGO, B. ; CARRARO, D. M.. Identification of genes candidate to predict adverse outcome in Wilms tumor. Em: VIII São Paulo Research Conference ? Cancer Today from Molecular Biology to Treatment, 2007, São Paulo-SP. Applied Cancer Research. São Paulo: Fundação Antonio Prudente (FAP), v. 27, p. 102-103, 2007.
86.	MATTOSO, M. L. Q. (Org.) ; FERREIRA, J. E. (Org.) ; BRAGANHOLO, V. P. (Org.). e-Science Workshop. 1 ed. Sociedade Brasileira de Computação, 2007. v. 1, p. 82.
87.	MELLO, B. P. ; TORRES, C. H. ; ABRANTES, E. F. ; CARVALHO, A. F. ; REIS, L. F. L. ; BRENTANI, H. P.. Search for tissue-associated molecular markers in non-characterized transcribed regions of the human genome. Em: VIII São Paulo Research Conference ? Cancer Today from Molecular Biology to Treatment, 2007, São Paulo-SP. Applied Cancer Research. São Paulo: Fundação Antonio Prudente (FAP), v. 27, p. 108-108, 2007.
88.	MESSICK, J. B. ; GUIMARAES, A. M. S. ; MACIEIRA, D. ; TIMENETSKY, J. ; VIEIRA, R. F. C. ; BIONDO, A. W.. A novel haemoplasma in pigs. Em: ASVCP/ACVP Combined Annual Meeting, 2007, Savannah. Veterinary Pathology, v. 44, p. 769, 2007.
89.	MOURA, R. P. ; PARMIGIANI, R. B. ; PIRES, L. C. ; COSTA, M. C. F. ; MOTA, L. D. ; CARVALHO, A. L. ; CUNHA, I. W. ; SOARES, F. A. ; CAMARGO, L. P. ; CARRARO, D. M. ; BRENTANI, H. P. ; CAMARGO, A. A.. NDRG4 is epigenetically silenced in breast tumors. Em: VIII São Paulo Research Conference ? Cancer Today from Molecular Biology to Treatment, 2007, São Paulo-SP. Applied cancer Research. São Paulo: Fundação Antonio Prudente (FAP), v. 27, p. 91-91, 2007.
90.	NAKAYA, Helder I ; AMARAL, P. P. ; LOURO, Rodrigo ; LOPES, A. ; FACHEL, A. A. ; Moreira, Y.B. ; El-Jundi, T.A. ; DA SILVA, A. M. ; REIS, Eduardo M. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio. Genome mapping and expression analyses of human intronic noncoding RNAs reveal tissue-specific patterns and enrichment in genes related to regulation of transcription. Genome Biology. v. 8, p. 1-25, 2007. Qualis: Não identificado (GENOME BIOLOGY)
91.	NAKAYA, Helder I ; BECKEDORFF, Felipe Cesar F ; Baldini, ML ; FACHEL, A. ; REIS, Eduardo M ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S.. Splice Variants of TLE Family Genes and Up-Regulation of a TLE3 Isoform in Prostate Tumors.. Biochemical and Biophysical Research Communications. v. 364, p. 918-923, 2007. Qualis: A3
92.	Nakaya, Helder I.; Reis, Eduardo M. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio. Concepts on microarray design for genome and transcriptome analyses. Em: Anton A. Buzdin; Sergey A. Lukyanov. (Org.). Nucleic Acids Hybridization Modern Applications. 1ed.Berlim. : Springer Netherlands. 2007.p. 265-307.
93.	NARDI, A. ; FERREIRA, J. E.. Padrões para Controle de Fluxo e sua Execução em Grade. Em: E-Science Workshop, v. 1, p. 20-28, 2007.Qualis: Não identificado (E-Science Workshop)
94.	NENE, V. ; ETALII ; Verjovski-Almeida, S. ; ETAL ; 92otherauthors ; Severson, D.. Genome Sequence of Aedes aegypti, a Major Arbovirus Vector. Science. v. 316, p. 1718-1723, 2007. Qualis: A1
95.	NETTO, F. S. ; FERREIRA, J. E. ; GOUVEA, M. A.. The use of Multidimensional Scaling as Applied to the BPM Performance in Brazilian e-Government Administration. Em: Database and Expert Systems Applications - DEXA, v. 1, p. 229-240, 2007.Qualis: Não identificado (Database and Expert Systems Applications - DEXA)
96.	NETTO, F. S. ; GOUVEA, M. A. ; FERREIRA, J. E.. Normative Attributes in Business Process Management Performance. Em: 18th Annual Conference of the POMS, v. 1, p. 20-30, 2007.Qualis: Não identificado (18th Annual Conference of the POMS)
97.	OJOPI, E ; OLIVEIRA, P. S. L. ; NUNES, D. N. ; PAQUOLA, A ; DEMARCO, Ricardo ; GREGORIO, S. ; AIRES, K. ; MENCK, C. F. M. ; LEITE, Luciana C ; Verjovski-Almeida, S. ; DIAS NETO, E.. A quantitative view of the transcriptome of Schistosoma mansoni adult-worms using SAGE. BMC Genomics. v. 8, p. 186, 2007. Qualis: A2
98.	OLIVEIRA, L. L. ; GIULIATTI, S ; TINÓS, R.. Seleção de Atributos no Problema de Classificação entre Venenos e Plantas Medicinas. Em: 15º SIICUSP: Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo, 2007, Ribeirão Preto, SP. Anais, 2007.
99.	OLIVEIRA, L. L. ; SANTOS, G. F. ; TINÓS, R. ; GIULIATTI, S.. Investigation of the Classification of Snake Venom-Neutralizing Effects of Medicinal Plants via Artificial Intelligence Techniques. Em: X-meeting 2007: AB3C International Conference, 2007, São Paulo, SP. Papers and Posters, 2007.
100.	Oliveira, P.T.M. ; SOLER, J. M. P. ; PEREIRA, A. C.. Epistasis Model Selection using the Genetic Algorithm. 2007. Apresentação de Trabalho/Comunicação
101.	Oliveira, P.T.M. ; SOLER, J. M. P. ; PEREIRA, A. C.. Aplicação do Algoritmo Genético na Seleção de Modelos com Epistasia. 2007. Apresentação de Trabalho/Comunicação
102.	Oliveira, P.T.M.S ; SOLER, J. M. P. ; PEREIRA, A. C.. Aplicação do algoritmo genético na seleção de modelos com epistasia. Em: III SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 2007, São Paulo. ATAS DO III SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 2007. Qualis: Não identificado (III SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 2007, SÃO PAULO. ATAS DO III SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO)
103.	Oliveira, P.T.M.S ; SOLER, J. M. P. ; PEREIRA, A. C.. Application of the Genetic Algorithm in the Epistasis Models Selection. Em: X Meeting - The Third Annual Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2007, São Paulo. Proceedings of the X-Meeting, 2007.
104.	PUGA, R. D. ; AMUI, S. F. ; SOARES, A. M. ; GIULIATTI, S.. Integration of Animal Venoms and Medicinal Plant. Em: ISMB/ECCB 2007, 2007, Vienna. Conference Proceedings, 2007.
105.	RANGEL, M. M. C. ; FERREIRA, E. N. E. ; BASTOS, E. P. ; CAMPOS, L. T. ; KIRSHBAUM-SLAGER, N. S. ; CAMARGO, L. P. ; PANDOVANI, R. ; CARVALHO, A. F. ; DE SOUZA, S. J. ; BRENTANI, H. P. ; CARRARO, D. M.. Identification of splicing variants associated to breast tumor througth microarray and qRTPCR technology. Em: VIII São Paulo Research Conference ? Cancer Today from Molecular Biology to Treatment, 2007, São Paulo-SP. Applied Cancer Research. São Paulo: Fundação Antonio Prudente (FAP), v. 27, p. 113-113, 2007.
106.	RIS, M. ; BRENTANI, H. P. ; BARREA, J.. Dynamical system modeling of the estrogen transcription control network. 2007. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
107.	ROELA, R. A. ; CARRARO, D. M. ; BRENTANI. HP ; KAIANO, J. ; SIMÃO, D. F. ; GUARNIEIRO, R. ; LOPES, L. F. ; BOROJEVIC, R. ; BRENTANI, M. M.. Gene stage-specific expression in the microenvironment of pediatric myelodysplastic syndromes. Leukemia Research. v. 31, p. 579-589, 2007. Qualis: A3
108.	ROSSETTI, R. A. M. ; LORENZI, J. C. C. ; SILVA, R. L. L. ; GIULIATTI, S. ; COELHO-CASTELO, A. A.. Determinação da Estrutura 3D da Proteína Hsp65, usando Análise In Silico. Em: 53º Congresso Brasileiro de Genética, 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais, 2007.
109.	ROSSETTI, R. A. M. ; LORENZI, J. C. C. ; SILVA, R. L. L. ; SILVA, C. L. ; GIULIATTI, S ; COELHO-CASTELO, A. A.. Uso de Análise In Silico para Determinar a Estrutura 3D da Proteína HSP65 de Mycobacterium leprae. Em: 15º SIICUSP: Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo, 2007, Ribeirão Preto, SP. Anais, 2007.
110.	SALIM, A. C. M. ; CAMARGO, L. P. ; PATRÃO, D. F. C. ; WANG, Y. ; CARRARO, D. M. ; BRENTANI, H. P. ; MCCLELLAND, M. ; CAMARGO, A. A.. Global DNA methylation analysis in breast tumors using promoter microarray. Em: VIII São Paulo Research Conference ? Cancer Today from Molecular Biology to Treatment, 2007, São Paulo-SP. Applied Cancer Research. São Paulo: Fundação Antonio Prudente (FAP), v. 27, p. 91-92, 2007.
111.	Sameshima, K.; Helene, A. F. ; Takahashi, D. Y. ; Morya, E. ; Garzon, E. ; Inuzuka, L.M. ; Guauranha, M. B. ; Sakamoto, A. C.. Characterizaing connectivity pattern during pre and post ictal on focal seizure events - A preliminary study. Em: 2007 Annula Meeting of American Epilepsy Society, v. 48, p. 200-201, 2007.
112.	SANTOS, G. F. ; JUNTA, C. M. ; PASSOS JUNIOR, G. A. S. ; GIULIATTI, S.. Gene Expression Analysis using Artificial Intelligent Techniques. Em: X-meeting 2007: AB3C International Conference, 2007, São Paulo, SP. Papers and Posters, 2007.
113.	SANTOS, G. F. ; MISIARA, F. P. ; LOUZADA-JUNIOR, P. ; JUNTA, C. M. ; PASSOS JUNIOR, G. A. S. ; TINÓS, R. ; GIULIATTI, S.. Computer-Aided Diagnosis to Rheumatoid Arthritis Via Artificial Intelligence. Em: ISMB/ECCB 2007, 2007, Vienna. Conference Proceedings, 2007.
114.	Schefer, D. ; SOLER, J. M. P. ; PEREIRA, A. C.. Modelagem de equações estruturais baseada no mapeamento genético de cruzamentos. Em: III SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 2007, São Paulo. ATAS DO III SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 2007. Qualis: Não identificado (III SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 2007, SÃO PAULO. ATAS DO III SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO)
115.	Schefer, D. ; SOLER, J. M. P. ; PEREIRA, A. C.. Structural Equation Model based on Genome Scan in Intercross Population. Em: X Meeting - The Third Annual Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2007, São Paulo. Proceedings of the X-Meeting, 2007.
116.	Scheffer, K.D. ; SOLER, J. M. P. ; PEREIRA, A. C.. Structural Equation Model based on Genome Scan in Intercross Population. 2007. Apresentação de Trabalho/Comunicação
117.	SETTA, N. ; COSTA, A. P. P. ; Lopes FR ; SLUYS MAV. ; CARARETO, C. M.. Transposon Display supports transpositional activity of P element in species of the saltans group of Drosophila. Journal of Genetics. v. 86, p. 37-43, 2007.Qualis: B3
118.	SETUBAL, J C ; Verjovski-Almeida, S.. Brazilian Symposium on Bioinformatics.. Computers in Biology and Medicine. v. 37, p. 113-114, 2007.Qualis: A2
119.	Snyder, E. E. ; Kampanya, N. ; Lu, J. ; Nordberg, E. K. ; Karur, H. R. ; Shukla, M. ; Soneja, J. ; Tian, Y. ; Xue, T. ; Yoo, H. ; Zhang, F. ; Dharmanolla, C. ; Dongre, N. V. ; Gillespie, J. J. ; Hamelius, J. ; Hance, M. ; Huntington, K. I. ; Jukneliene, D. ; Koziski, J. ; SETUBAL, J. C. ; et.al. PATRIC: The VBI PathoSystems Resource Integration Center. Nucleic Acids Research. v. 35, p. D401-D406, 2007. Qualis: A1
120.	SOLER, J. M. P. Métodos Estatísticos em Genética e Genômica. 2007. Curso de curta duração ministrado/Outra
121.	SOUSA-CANAVEZ, J. M. ; BETON, Daniela ; Gonzalez-Kristeller, D.C. ; DA SILVA, A. M.. Identification and domain mapping of Dictyostelium discoideum type-1 protein phosphatase inhibitor-2. Biochimie (Paris). v. 89, p. 692-701, 2007. Qualis: A2
122.	SOUZA, M. L. ; JORGE, D. M. M. ; GIULIATTI, S. Análise In Silico de Estruturas Terciárias de Proteínas de Veneno de Apis mellifera. Em: 15º SIICUSP: Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo, 2007, Ribeirão Preto, SP. Anais, 2007.
123.	Takahashi, D. Y. ; Baccalá, L. A. ; Sameshima, K.. Connectivity inference between neural structures via partial directed coherence. Journal of Applied Statistics. v. 34, p. 1259-1273, 2007. Qualis: B1
124.	Tavares, J. R. ; De Souza, Robson F ; Gueiros-Filho, F. J.. USING COMPARATIVE GENOMICS TO IDENTIFY NOVEL DIVISION PROTEINS IN Bacillus subtilis. 2007. Apresentação de Trabalho/Congresso
125.	TONINI, P. P. ; LISBOA, C. G. ; SILVA, C. O. ; VIVEIROS, S. C. M. ; BUCKERIDGE, M. S.. Testa is involved in the control of storage mobilisation in seeds of Sesbania virgata (Cav.) Pers., a tropical legume tree from the Atlantic Forest. Trees (Berlin). v. 21, p. 13-21, 2007. Qualis: A2
126.	TORRES, T.T.; LYRA, M.L. ; FRESIA, P. ; AZEREDO-ESPIN, A.M.L.. Assessing Genetic Variation in the New World Screwworm Cochliomyia hominivorax Populations from Uruguay. Em: Vreysen, M.J.B.; A.S. Robinson; J. Hendrichs. (Org.). Area-Wide Control of Insect Pests: From Research to Field Implementation.. Dordrecht. : Springer. 2007.p. 183-191.
127.	TORRES, T.T.; METTA, M. ; OTTENWÄLDER, B. ; SCHLÖTTERER, C.. Drosophila gene expression profiling using massively parallel sequencing. Em: 20th European Drosophila Research Conference, 2007, Viena. EDRC 2007 abstract book, 2007.
128.	TORRES, T.T.; METTA, M. ; OTTENWÄLDER, B. ; SCHLÖTTERER, C.. Drosophila gene expression profiling using massively parallel sequencing. 2007. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
129.	TREPODE, N. W. ; ARMELIN, H. A. ; BITTNER, M. L. ; BARRERA, J. ; GUBITOSO, M. D. ; HASHIMOTO, R. F.. A Robust Structural PGN Model for Control of Cell-Cycle Progression Stabilized by Negative Feedbacks. EURASIP Journal on Bioinformatics and Systems Biology (Online). v. 2007, p. 1-11, 2007. Qualis: Não identificado (EURASIP JOURNAL ON BIOINFORMATICS AND SYSTEMS BIOLOGY)
130.	ULLMANN, L. S. ; HOFFMANN, J. ; MORAES, W. ; CUBAS, Z. S. ; SANTOS, L. C. ; SILVA, R. C. ; CAMOSSI, L. G. ; MOREIRA, N. ; GUIMARAES, A. M. S. ; MONTANO, P. ; LANGONI, H. ; BIONDO, A. W.. Prevalence of Leptospira interrogans antibodies in captive wildcats of Southwestern Brazil. Em: XVI Encontro da Associação Brasileira de Veterinários de Animais Selvagens, 2007, Sã Paulo. Anais do XVI Encontro da Associação Brasileira de Veterinários de Animais Selvagens, v. 1, 2007.
131.	ULLMANN, L. S. ; SILVA, R. C. ; MORAES, W. ; CUBAS, Z. S. ; SANTOS, L. C. ; HOFFMANN, J. ; MOREIRA, N. ; GUIMARAES, A. M. S. ; MONTANO, P. ; LANGONI, H. ; BIONDO, A. W.. Prevalence of Toxoplasma gondii antibodies in captive wildcats of southwestern Brazil. Em: XVI Encontro da Associação Brasileira de Animais Selvagens, 2007, São Paulo. Anais do XVI Encontro da Associação Brasileira de Animais Selvagens, v. 1, 2007.
132.	VAN SLUYS, M A. Transposable elements in sugarcane. 2007. Apresentação de Trabalho/Simpósio
133.	VAN SLUYS, M A. Plant genomics in Brazil. 2007. Apresentação de Trabalho/Simpósio
134.	VENANCIO, Thiago M ; DEMARCO, Ricardo ; ALMEIDA, Giulliana T ; OLIVEIRA, Katia C P ; SETUBAL, Joao C ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S.. Analysis of Schistosoma mansoni genes shared with Deuterostomia and with possible roles in host interactions.. BMC Genomics. v. 8, p. 407, 2007. Qualis: A2
135.	Verjovski-Almeida, S.; VENANCIO, Thiago M ; OLIVEIRA, Katia C P ; ALMEIDA, Giulliana T ; DEMARCO, Ricardo. Use of a 44k oligoarray to explore the transcriptome of Schistosoma mansoni adult worms. Experimental Parasitology. v. 117, p. 236-245, 2007. Qualis: A4
136.	VIBRANOVSKI, M. D.; SAKABE, N. J. ; LONG, M.. Birth and evolution of human exons. ENCYCLOPEDIA OF LIFE SCIENCES (ONLINE). v. 1, p. 1, 2007. Qualis: NP
137.	VIBRANOVSKI, M. D.; SAKABE, N. J. ; LONG, M.. Birth and Evolution of Human Exons. ENCYCLOPEDIA OF LIFE SCIENCES. Em: . : John Wiley & Sons, Ltda. 2007..
138.	VINCI, A. ; AMUI, S. F. ; GIULIATTI, S.. In Silico Identification of Conserved Domains of Venom Proteins of Brazilians Snakes. Em: ISMB/ECCB 2007, 2007, Vienna. Conference Proceedings, 2007.
139.	VIVEIROS, S. C. M. ; MAIS, M. G. ; DIETRICH, S.M.C. ; AIDAR, M. P. M. ; BUCKERIDGE, M. S.. Respostas das Plantas aos Fatores Antrópicos: Estudos com Jatobá-de-Mata. Em: Barbosa, L.M.; Santos Junior, N.A. dos. (Org.). A botânica no Brasil: pesquisa, ensino e políticas públicas ambientais. 1ed.São Paulo. : Sociedade Botânica do Brasil. 2007.p. 394-405.
140.	VÊNCIO, R. Z. N. ; VARUZZA, L. ; PEREIRA, C. A. B. ; BRENTANI. HP ; SHMULEVICH, I.. Simcluster: clustering enumeration gene expression data on the simplex space. BMC Bioinformatics. v. 8, p. 246, 2007. Qualis: A1
141.	XU, P. ; ALVES, J. M. P. ; Kitten, T. ; Brown, A. ; Chen, Z. ; OZAKI, L. S. ; MANQUE, P. ; Ge, X. ; SERRANO, M. G. ; PUIU, D. ; Hendricks, S. ; WANG, Y. ; Chaplin, M. D. ; Akan, D. ; Paik, S. ; PETERSON, D. L. ; Macrina, F. L. ; BUCK, G. A.. Genome of the Opportunistic Pathogen Streptococcus sanguinis. Journal of Bacteriology (Print). v. 189, p. 3166-3175, 2007. Qualis: A3
142.	Yu, G.X. ; Snyder, E.E. ; Boyle, S.M. ; Crasta, O.R. ; Czar, M. ; Mane, S.P. ; Purkayastha, A. ; Sobral, B. ; Setubal, J.C.. A versatile computational pipeline for bacterial genome annotation improvement and comparative analysis, with Brucella as a use case. Nucleic Acids Research. v. 35, p. 3953-3962, 2007. Qualis: A1

2006

1.	DURHAM, A. M.; ALBRECHT, L. ; Emilio F. Merino ; HOFFMANN, E. H. ; URBANO, M. ; de Mattos Ferreira, R.G. ; OSAKABE, A. L. ; Dalla Martha, R.C. ; Ramharter, M. ; FERREIRA, J. E. ; Hernando A. del Portillo ; WUNDERLICH, G.. Extense variant gene family repertoire overlap in Western Amazon Plasmodium falciparum isolates. Molecular and Biochemical Parasitology (Print). v. 150, p. 157-165, 2006. Qualis: A4
2.	ALCÂNTARA, P. H. N. ; MARTIN, L. ; SILVA, C. O. ; DIETRICH, S. M. C. ; BUCKERIDGE, M. S.. Purification of a beta-galactosidase from cotyledons of Hymenaea courbaril L. (Leguminosae. Enzyme properties and biological function. Plant Physiology and Biochemistry (Paris). v. 44, p. 619-627, 2006. Qualis: A1
3.	Almeida E.M. ; COSTA, P. F. ; BUCKERIDGE, M. S. ; ALVES, M. A. S.. Potential bird dispersers of Psychotria in an area of Atlantic Forest at Ilha Grande, RJ, Southeast Brazil: a biochemical analysis of the fruits. BRAZILIAN JOURNAL OF BIOLOGY, São Paulo. v. 66, n. 1, p. 29-41, 2006. Qualis: Não identificado (BRAZILIAN JOURNAL OF BIOLOGY, SÃO PAULO)
4.	Anghinah, R. ; Basile, L. I. ; Schmidt, M. T. ; Sameshima, Koichi ; Gattaz, W. F.. Artefatos biológicos no EEG quantitativo. Arquivos de Neuro-Psiquiatria, São Paulo, Brasil. v. 64, n. 2a, p. 264-268, 2006. Qualis: Não identificado (ARQUIVOS DE NEURO-PSIQUIATRIA, SÃO PAULO, BRASIL)
5.	ARAÚJO, L. V. ; SOARES, M. A. ; TANURI, A. ; OLIVEIRA, S. M. ; CHEQUER, P. ; SABINO, E. C. ; FERREIRA, J. E.. DBCollHIV: A Database System for Collaborative HIV analysis in Brazil. GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH. v. 5, p. 203-215, 2006.Qualis: B3
6.	Baccal, Luiz Antonio ; Takahashi, Daniel Y. ; Sameshima, Koichi. Computer Intensive Testing for the Influence Between Time Series. Em: Björn Schelter; Matthias Winterhalder; Jens Timmer. (Org.). Handbook of Time Series Analysis: Recent Theoretical Development and Applications. 1ed.Weinheim. : Wiley-VHC Verlarg. 2006.p. 411-436.
7.	Baccalá, L. A. ; Sameshima, K.. Comments on `Is Partial Coherence a Viable Technique for Identifying Generators of Neural Oscillations?¿. Biological Cybernetics, In press. v. 95, p. 135-141, 2006. Qualis: Não identificado (BIOLOGICAL CYBERNETICS, IN PRESS)
8.	BARRETO, C. C. ; ARAÚJO, L. V. ; FERREIRA, J. E. ; SABINO, E. C.. Trends in Antiretroviral Drug Resistance and Clade Distributions Among HIV-1--Infected Blood Donors in Sao Paulo, Brazil. JAIDS-JOURNAL OF ACQUIRED IMMUNE DEFICIENCY SYNDROMES. v. 41, n. 3, p. 388-341, 2006. Qualis: A1 (JOURNAL OF ACQUIRED IMMUNE DEFICIENCY SYNDROMES)
9.	BAUMANN, A. ; GUIMARAES, A. M. S. ; SILVA, C. C. ; YAMAGUTI, M. ; KOZEMJAKIM, D. A. ; MESSICK, J. B. ; BIONDO, A. W. ; TIMENETSKY, J.. Mycoplasma haemofelis and. Em: ASVCP/ACVP Combined Annual Meeting, 2006, Tucson, Arizona, EUA. Veterinary Pathology, v. 43, p. 811, 2006.
10.	BETTONI, F. ; CAMARGO FILHO, F. ; GERALDO, M. V. ; GALANTE, P. A. F. ; PARMIGIANI, R. B. ; DE SOUZA, S. J. ; BRENTANI, H. P. ; CAMARGO, A. A.. Identification of novel cancer/testis antigens by database mining and MRNA expression analysis. 2006. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
11.	BETTONI, F. ; CAMARGO FILHO, F. ; GERALDO, M. V. ; GALANTE, P. A. F. ; PIRES, L. C. ; PARMIGIANI, R. B. ; CARRARO, D. M. ; DE SOUZA, S. J. ; BRENTANI, H. P. ; CAMARGO, A. A.. Identification of novel cancer/testis antigens by database mining and MRNA expression analysis. Em: 97th Annual Meeting 2006, AACR ? American Association for Cancer Research, 2006, Washington-DC. Proceedings of the American Association for Cancer Research. Oakland-DC, v. 47, p. 2221, 2006.
12.	BIASE, F. H. ; SANTOS-BIASE, W. K. F. ; FONSECA MERIGHE, G. K. ; PUGA, R. D. ; GIULIATTI, S ; Martelli, Lúcia ; MEIRELLES, F. V.. Bovine RNA Expression of Oocyte and Embryo Specific Genes. Em: XX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Tecnologia de Embriões, 2006, Araxá, MG. Anais. Porto Alegre, RS: Faculdade de Veterinária, UFRGS, v. 34, p. s303-s303, 2006.
13.	Bisso-Machado, R ; HÜNEMEIER, T. ; Carvalho, CB ; Pena, SJ ; Salzano, FM ; BORTOLINI, M. C.. Negros, mas nem tão africanos. Em: XVIII SALÃO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 2006, Porto Alegre. XVIII SALÃO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 2006.
14.	Bisso-Machado, R ; HÜNEMEIER, T. ; SALZANO, F. M. ; BORTOLINI, M. C.. Caracterização dos Cromossomos Y de Origem Não-africana em Populações Negras Brasileiras. Em: 52 Congresso Brasileiro de Genética 12 Congreso de la Asociación Latinoamericana de Genética, 2006, Foz do Iguaçu. 52 Congresso Brasileiro de Genética 12 Congreso de la Asociación Latinoamericana de Genética, 2006.
15.	BITARELLO, B.D. ; TORRES, T.T. ; AZEREDO-ESPIN, A.M.L.. Desenvolvimento de marcadores microssatélites polimórficos para a mosca do berne, Dermatobia hominis (Diptera: Oestridae). Em: 52o. Congresso Brasileiro de Genética, 2006, Foz do Iguaçu, PR. Resumos do 52o. Congresso Brasileiro de Genética, 2006.
16.	BOCCARDO, E. ; MANZINI, C. ; COLÓ, A. E. L. ; CARVALHO, A. F. ; BRENTANI, H. P. ; REIS, L. F. L. ; VILLA, L. L.. Effect tumor necrosis factor on global gene expression of HPV16 E7 expressing keratinocytes (Poster presentation). 2006. Apresentação de Trabalho/Outra
17.	BRASCHI, Simon ; CURWEN, RACHEL S. ; ASHTON, PETER D. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; WILSON, Alan. The tegument surface membranes of the human blood parasiteSchistosoma mansoni: A proteomic analysis after differential extraction. Proteomics (Weinheim. Print). v. 6, p. 1471-1482, 2006. Qualis: Não identificado (PRINT))
18.	BRENTANI, H. P. Futuro da bioinformática. 2006. Apresentação de Trabalho/Comunicação
19.	BRENTANI, H. P. Registro de pacientes/famílias e banco de dados. 2006. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
20.	BRENTANI, H. P. Banco de tumores. 2006. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
21.	BRENTANI, H. P. Bases genéticas da inteligência. 2006. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
22.	BRENTANI, H. P. Exercícios e discussão. 2006. Apresentação de Trabalho/Comunicação
23.	BRENTANI, H. P. Questões estatísticas no rastreamento do genoma. 2006. Apresentação de Trabalho/Comunicação
24.	BRENTANI, H. P. Bioinformática. 2006. Apresentação de Trabalho/Comunicação
25.	BRENTANI, H. P. Bioinformática prática. 2006. Apresentação de Trabalho/Comunicação
26.	BUCK, G. A. ; Aurelien Mazurie ; Seth Roberts ; Alves, J. M. ; Dhivya Arasappan ; SERRANO, M. G. ; MANQUE, P.. Genomes to networks, pathways and function. Em: Simos T; Maroulis G. (Org.). Lecture Series on Computer amd Computational Sciences. Leiden. : Brill Academic Publishers. 2006.v. 6, p. 758-763.
27.	BUCKERIDGE, M. S. Implications of emergence, degeneracy and redundancy for the modeling of the plant cell wall. Em: Takahisa Hayashi. (Org.). The Science and the Lore of the Plant Cell Wall: Biosynthesis, Structure and Function. Boca Raton. : BrownWalker Press. 2006.p. 41-47.
28.	BUCKERIDGE, M. S. The mechanism of transference of function and the evolution of the plant cell wall. Em: Gordon Research Conference of Plant Cell Wall, 2006. Qualis: Não identificado (Gordon Research Conference of Plant Cell Wall)
29.	BUCKERIDGE, M. S. O mecanismos de transferência de função e a evolução da parede celular. Em: 57 Congresso Nacional de Botânica, 2006, Gramado. Os avanços da Botânica no início do século XXI. Porto Alegre: Sociedade Botânica de São Paulo, p. 64-68, 2006. Qualis: Não identificado (57 CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 2006, GRAMADO. OS AVANÇOS DA BOTÂNICA NO INÍCIO DO SÉCULO XXI. PORTO ALEGRE: SOCIEDADE BOTÂNICA DE SÃO PAULO)
30.	BUCKERIDGE, M. S. As plantas e os efeitos das mudanças climáticas nos trópicos. 2006. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
31.	BUCKERIDGE, M. S. O mecanismo de transferência de funções e a evolução da parede celular em plantas. 2006. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
32.	BUCKERIDGE, M. S. Descobrindo Novos Rumos apra a Pesquisa. 2006. Apresentação de Trabalho/Outra
33.	BUCKERIDGE, M. S.; CAVALARI, A. A. ; SILVA, C. O. ; TINÉ, M. A. S.. Relevância dos processos de biossíntese de polissacarídeos da parede celular para a biotecnologia de frutos. Em: Lajolo FM;Menezes EW. (Org.). Carbohidratos em alimentos regionales iberoamericanos. 1ed.São Paulo. : Edusp. 2006.p. 149-169.
34.	CARVALHO, R.A. ; TORRES, T.T. ; AZEREDO-ESPIN, A.M.L.. A survey of mutations in the Cochliomyia hominivorax (Diptera: Calliphoridae) esterase E3 gene associated with organophosphate resistance and the molecular identification of mutant alleles.. Veterinary Parasitology. v. 140, p. 344-351, 2006. Qualis: A1
35.	CARVALHO, R.A. ; TORRES, T.T. ; PANIAGO, M.D.G. ; AZEREDO-ESPIN, A.M.L.. Isolamento e caracterização do gene da esterase relacionado à resistência a inseticidas organofosforados na mosca praga da pecuária Cochliomyia hominivorax (Diptera: Calliphoridae). Em: 52o. Congresso Brasileiro de Genética, 2006, Foz do Iguaçu, PR. Resumos do 52o. Congresso Brasileiro de Genética, 2006.
36.	CERVATO, M. C. ; SILVA, I. T. ; GIULIATTI, S. ; SILVA JUNIOR, W. A.. Análise das Associações de microRNAs e seus Alvos em Bibliotecas de SAGE. Em: 14º SIICUSP: Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo, 2006, Ribeirão Preto, SP. Resumos, 2006.
37.	da Silva Neto, J. F. ; KOIDE, T. ; Gomes, S. L. ; MARQUES, M. V.. O fator sigma ECF sigmaE de Xylella fastidiosa apresenta um novo sistema de regulação. Em: 25ª Reunião de Genética de Microorganismos, 2006, São Pedro. 25ª Reunião de Genética de Microorganismos. Piracicaba, p. 137-137, 2006.
38.	da Silva, Aline M; REIS, Eduardo Moraes R. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; AMARAL, P.R.A. ; T.I.NAKAYA, H.. Intronic non-coding RNA as molecular markers in prostate tumor. 2006. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
39.	de Morais, H. A. ; GUIMARAES, A. M. S. ; VIDOTTO, O. ; BAUMANN, A. ; BIONDO, A. W. ; MESSICK, J. B.. Coinfecção de Mycoplasma haemofelis e "Candidatus Mycoplasma haemominutum"em três gatos no Brasil. Em: XXVII Congresso Brasileiro da Anclivepa, 2006, Vitória, ES. Anais do XXVII Congresso Brasileiro da Anclivepa, p. 62, 2006.
40.	DE OLIVEIRA, FRANCISCO MEIRELLES BASTOS ; DE ABREU DA SILVA, ISABEL CAETANO ; RUMJANEK, FRANKLIN DAVID ; DIAS-NETO, EMMANUEL ; GUIMARÃES, PEDRO EDSON MOREIRA ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; ?TROS, MICHAL ; FANTAPPIÉ, MARCELO ROSADO. Cloning the genes and DNA binding properties of High Mobility Group B1 (HMGB1) proteins from the human blood flukes Schistosoma mansoni and Schistosoma japonicum. Gene (Amsterdam). v. 377, p. 33-45, 2006. Qualis: A4
41.	De Souza, Robson F; de Souza, S. J. ; Gueiros-Filho, F. J.. Maximum likelihood inference of ancestral gene content for the bacterial septosome. 2006. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
42.	DEMARCO, Ricardo ; Oliveira, Katia C. ; Venancio, Thiago M. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S.. Gender biased differential alternative splicing patterns of the transcriptional cofactor CA150 gene in Schistosoma mansoni. Molecular and Biochemical Parasitology (Print). v. 150, p. 123-131, 2006. Qualis: A4
43.	DEMARCO, Ricardo ; VENANCIO, Thiago M ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S.. SmTRC1, a novel Schistosoma mansoni DNA transposon, discloses new families of animal and fungi transposons belonging to the CACTA superfamily.. BMC Evolutionary Biology (Online). v. 6, p. 89, 2006. Qualis: A1
44.	DENTILLO, D. B. ; MEOLA, J. ; ROSA E SILVA, J. C. ; FERRIANI, R. A. ; MELATO, L. C. ; BARBUZANO, F. G. ; PINHEIRO, D. G. ; SILVA JUNIOR, W. A. ; GIULIATTI, S. ; MARTELLI, L. R.. Triagem de Genes Relacionados a Câncer por meio da Técnica de RaSH em Pacientes com Endometriose. Em: 52º Congresso Brasileiro de Genética, 2006, Foz do Iguaçu, PR. Anais, 2006.
45.	DURHAM, A. M.; HOFFMANN, E. H. ; MALAFRONTE, R. S. ; MORAES-AVILA, S. L. ; OSAKABE, A. L. ; WUNDERLICH, G. ; RIBOLLA, P. E. ; Hernando A. del Portillo ; URBANO, M.. Origins of sequence diversity in the malaria vaccine candidate merozoite surface protein-2 (MSP-2) in Amazonian isolates of Plasmodium falciparum. Gene (Amsterdam). v. 376, p. 224-230, 2006. Qualis: A4
46.	DURHAM, A. M.; Sobreira, T.J. ; GRUBER, A.. TRAP: automated classification, quantification and annotation of tandemly repeated sequences. BIOINFORMATICS, Oxford, Inglaterra. v. 22, n. 3, p. 361-362, 2006. Qualis: Não identificado (BIOINFORMATICS, OXFORD, INGLATERRA)
47.	FEITOSA, FABIANA M. ; CALVO, ERIC ; MERINO, EMILIO F. ; Durham, Alan M. ; JAMES, ANTHONY A. ; DE BIANCHI, ANTONIO G. ; MARINOTTI, OSVALDO ; CAPURRO, MARGARETH L.. A transcriptome analysis of the Aedes aegypti vitellogenic fat body. Journal of Insect Science (Online). v. 6, p. 1-26, 2006. Qualis: C
48.	Ferreira, A. R. J. ; Smulders, T. V. ; Sameshima, Koichi ; Mello, C. V. ; Jarvis, E. D.. VOCALIZATIONS AND ASSOCIATED BEHAVIORS OF THE SOMBRE HUMMINGBIRD (APHANTOCHROA CIRRHOCHLORIS) AND THE RUFOUS-BREASTED HERMIT (GLAUCIS HIRSUTUS). The Auk (Washington, D.C.). v. 123, p. 1129-1148, 2006. Qualis: A1
49.	FERREIRA, J. E.; TAKAI, O. K.. PROJETO E MODELAGEM DE BANCO DE DADOS - revisão técnica. Rio de Janeiro: Editora Campus/Elsevier. 2006. Tradução/Livro
50.	FERREIRA, JOAO; TAKAI, OSVALDO ; BRAGHETTO, KELLY ; Pu, Calton. Large Scale Order Processing through Navigation Plan Concept. Em: IEEE International Conference on Services Computing (SCC 2006), p. 297, 2006. Qualis: Não identificado (IEEE International Conference on Services Computing (SCC 2006))
51.	FOLGUEIRA, M. A. A. K. ; HONDA, S. T. ; BENVENUTI, T. T. ; ROZENCHAN, P. B. ; SANTOS, R. P. ; BRENTANI, H. P. ; CARRARO, D. M. ; KATAYAMA, M. L. H. ; LYRA, E. C. ; BRENTANI, M. M.. Differential gene profiling of malignant cells and fibroblasts from the primary and metastic sites from breast cancer patients upon stroma-epithelial cell interaction. Em: 2006 ASCO Annual Meeting Proceedings, 42nd Annual Meeting, 2006, Atlanta-GA. Journal of Clinical Oncology Supplement. Filadelfia-PA: American Society of Clinical Oncology (ASCO), v. 24, p. 10570, 2006.
52.	FOLGUEIRA, M. A. A. K. ; HONDA, S. T. ; SANTOS, R. P. ; KATAYAMA, M. L. H. ; BRENTANI, H. P. ; CARRARO, D. M. ; ROZENCHAN, P. B. ; KAIANO, J. ; MOTA, L. D. ; PATRÃO, D. F. C. ; BASTOS, E. P. ; LYRA, E. C. ; GOES, J. C. G. S. ; BRENTANI, M. M.. Fibroblasts from involved and uninvolved lymph nodes from breast cancer patients may influence gene expression of malignant breast cells. Em: 97th Annual Meeting 2006, AACR ? American Association for Cancer Research, 2006, Washington-DC. Proceedings of the American Association for Cancer Research. Oakland-CA, v. 47, p. 5016, 2006.
53.	FOLGUEIRA, M. A. A. K. ; SAMAIA, H. B. ; KATAYAMA, M. L. H. ; PATRÃO, D. F. C. ; CARRARO, D. M. ; MOURÃO NETO, M. ; BARBOSA, E. M. ; CALDEIRA, J. R. F. ; ABREU, A. P. S. ; LYRA, E. C. ; KAIANO, J. ; MOTA, L. D. ; CAMPOS, A. H. ; MACIEL, M. S.. Gene expression profiling of clinical stages II and III breast cancer. Brazilian Journal of Medical and Biological Research. v. 39, p. 1101-1103, 2006. Qualis: A4
54.	FONSECA, R. S. ; CARRARO, D. M. ; SAMAIA, H. B.. Mining ORESTES no-match database: can we still contribute to cancer transcriptome?. Genetics and Molecular Research, in press. v. 31, p. 24-32, 2006.Qualis: Não identificado (GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH, IN PRESS)
55.	GODOI, P. ; GALHARDO, R. ; LUCHE, D. D. ; SLUYS MAV. ; MENCK, C. F. M. ; OLIVA, G.. Structure of the Thiazole Biosynthetic Enzyme THI1 from Arabidopsis thaliana. The Journal of Biological Chemistry. v. 281, p. online, 2006. Qualis: A1
56.	GOUVEA, M. A. ; NETTO, F. S. ; FERREIRA, J. E.. Evaluation of BPM in the context of a National Support Program for the State Exchequer. In: 17th Annual World Conference on Production and Operations Management, POM´S, 2006, Boston. 17th Annual World Conference on Production and Operations Management, POM´S. Boston:. Em: OM in the New World Uncertainties, v. 1, p. 107-118, 2006.Qualis: Não identificado (OM in the New World Uncertainties)
57.	ITALIANO, I. ; FERREIRA, J. E.. Synchronization Options for Data Warehouse Designs. COMPUTER. v. 39, p. 53-57, 2006. Qualis: A2
58.	JORGE, D. M. M. ; PUGA, R. D. ; SOARES, A. M. ; SOARES, A. E. E. ; GIULIATTI, S.. Database of Venom of Apoidea (Hymenoptera) and Medicinal Plants Associated. Em: In-Silico Analysis of Proteins Celebrating the 20th anniversary of Swiss-Prot, 2006, Fortaleza, CE. Posters, 2006.
59.	JUNTA, C. M. ; GARCIA, P. S. ; FACHIN, A. L. ; MELLO, S. S. ; LOUZADA-JUNIOR, P. ; OLIVEIRA, R. D. R. ; RASSI, D. M. ; GIULIATTI, S. ; SAKAMOTHOJO, E. T. ; DONADI, A. ; PASSOS JUNIOR, G. A. S.. Shared Epitope Allele Dosage Provides Distinct Gene Expression Signatures Peripheral Blood Mononuclear Cless (PBMC) of Rheumatoid Arthritis Patients. Em: International Conference of Immunogenomics and Immunomics, 2006, Budapeste. Proceedings, 2006.
60.	KOIDE, T.; SALEM-IZACC, S. ; Gomes, S. L. ; Vencio, R.Z.N.. SpotWhatR: a user-friendly microarray data analysis system.. Genetics and Molecular Research. v. 5, p. 93-107, 2006.Qualis: B3
61.	KOIDE, T.; VENCIO, R. ; Gomes, S. L.. Global gene expression analysis of the heat shock response in the phytopathogen Xylella fastidiosa.. Journal of Bacteriology (Print). v. 188, p. 5821-5830, 2006. Qualis: A3
62.	LISBOA, C. G. ; TONINI, P. P. ; TINÉ, M. A. S. ; BUCKERIDGE, M. S.. Endo-beta-mannanase from the endosperm of seeds of Sesbania virgata (Cav.) Pers. (Leguminosae): purification, characterisation and its dual role in germination and early seedling growth. Brazilian Journal of Plant Physiology. v. 18, p. 269-280, 2006. Qualis: A4 (INDIAN JOURNAL OF PLANT PHYSIOLOGY)
63.	LORENZINI, D ; SILVAJR, P ; SOARES, M ; ARRUDA, P ; SETUBAL, J ; DAFFRE, S. Discovery of immune-related genes expressed in hemocytes of the tarantula spider Acanthoscurria gomesiana. Developmental and Comparative Immunology. v. 30, p. 545-556, 2006. Qualis: A2
64.	MARQUES, D. A. ; FOGLIO, M. A. ; MORGANTE, P. G. ; SLUYS MAV. ; SHEPHERD, S. L. K.. Biotechnology approaches for production of antiulcerogenic dihydro-epideoxyarteannin B isolated from Artemisia annua L.. Revista Brasileira de Farmacognosia. v. 16, p. 291-299, 2006.Qualis: A4
65.	MARQUES, M. M. ; HASHIMOTO, V. L. ; CAMARGO, L. P. ; BRENTANI, H. P. ; MARQUES, S. M. ; CARVALHO, A. F. ; REIS, L. F. L. ; DIAS, A. A. M.. Gene expression profile analysis in thioglycollate elicited peritoneal macrophages. 2006. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
66.	MARQUES, M. V. ; KOIDE, T. ; Gomes, S. L. ; da Silva Neto, J. F.. The single ECF sigma factor of Xylella fastidiosa is involved in the heat shock response and presents an unusual regulatory mechanism. Em: Gordon Conference on Microbial Stress Response, 2006, New Hampshire. Gordon Conference on Microbial Stress Response, 2006.
67.	Marques, Maria Rita ; Buckeridge, Marcos S. ; BUCKERIDGE, M. S. ; Braga, Marcia R. ; Dietrich, Sonia M. C.. Characterization of an extracellular endopolygalacturonase from the saprobe Mucor ramosissimus Samutsevitsch and its action as trigger of defensive response in tropical plants. Mycopathologia (1975. Print). v. 162, p. 337-346, 2006. Qualis: Não identificado (PRINT))
68.	MEOLA, J. ; DENTILLO, D. B. ; ROSA E SILVA, J. C. ; MELATO, L. C. ; BARBUZANO, F. G. ; PINHEIRO, D. G. ; SILVA JUNIOR, W. A. ; FERRIANI, R. A. ; GIULIATTI, S. ; MARTELLI, L. R.. Análise de Genes Menos Expressos por Rash (Rapid Subtraction Hybridization) de Pacientes com Endometriose. Em: 52º Congresso Brasileiro de Genética, 2006, Foz do Iguaçu, PR. Anais, 2006.
69.	MERINO, E. F. ; FERNANDEZ-BECERRA, C. ; DURHAM, A. M. ; FERREIRA, J. E. ; TUMILASCI, V. F. ; DARC-NEVES, J. ; DADARIO, A. ; SILVA-NUNES, M. ; FERREIRA, M. U. ; WICKRAMARACHCHI, T. A. ; PORTILLO, H. A.. Multi-character population study of the vir subtelomeric multigene superfamily of Plasmodium vivax, a major human malaria parasite. Molecular and Biochemical Parasitology (Print). v. 149, p. 10-16, 2006. Qualis: A4
70.	NAKANO, F. ; ASPRINO, P. F. ; HIGA, C. H. A. ; HASHIMOTO, R. F. ; ARMELIN, H. A.. Searching for Genes Involved in Novel Mechanisms of Tumor Cell Death Triggered by FGF2: Introducing New Methodological Approaches. Em: International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology, 2006, Fortaleza. International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology, 2006.
71.	NETTO, F. S. ; GOUVEA, M. A. ; FERREIRA, J. E.. Avaliação de Desempenho de BPM na Administração Pública Brasileira com o Uso de Análise Multivariada. Em: XXX ENANPAD - Encontro Nacional da ANPAD - Brasil, v. 1, p. 231-240, 2006.Qualis: Não identificado (XXX ENANPAD - Encontro Nacional da ANPAD - Brasil)
72.	OLIVEIRA JUNIOR, C. F. DE ; BRAGA, M. R. ; BUCKERIDGE, M. S.. Efeitos de oligossacarídeos de xiloglucano sobre o metabolismo extracelular de Rudgea jasminoides durante o crescimento. Hoehnea (São Paulo), São Paulo. v. 33, n. 2, p. 239-246, 2006.Qualis: Não identificado (HOEHNEA , SÃO PAULO)
73.	Oliveira Junior, Clovis José Fernandes de ; Braga, Marcia Regina ; Buckeridge, Marcos Silveira ; BUCKERIDGE, M. S.. Isolamento de oligossacarídeos de xiloglucano de dicotiledôneas através de hidrólise enzimática e cromatografia de exclusão molecular. Brazilian Journal of Botany. v. 29, p. 391-397, 2006. Qualis: B1
74.	OSMAN, Ahmed ; NILES, EDWARD G. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; LoVerde, Philip T.. Schistosoma mansoni TGF-β Receptor II: Role in Host Ligand-Induced Regulation of a Schistosome Target Gene. PLoS Pathogens. v. 2, p. e54, 2006. Qualis: A1
75.	PACHECO, F. H. T. ; SILVA-STENICO, M. E. ; SILVA, D. M. ; Van Sluys, M. A.. Characterization of Agrobacterium tumefaciens Strains Isolated from Brazilian Plant Species. American Journal of Plant Physiology. v. 2, p. 142-150, 2006.Qualis: Não identificado (AMERICAN JOURNAL OF PLANT PHYSIOLOGY)
76.	PARMIGIANI, R. B. ; BETTONI, F. ; VIBRANOVSKI, M. D. ; LOPES, M. H. ; MARTINS, W. K. ; CUNHA, I. W. ; SOARES, F. A. ; SIMPSON, A. J. G. ; DE SOUZA, S. J. ; CAMARGO, A. A.. Characterization of a cancer/testis (CT) antigen gene family capable of eliciting humoral response in cancer patients. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (Online). v. 103, p. 18066-18071, 2006. Qualis: A1
77.	PEIXOTO, BERNARDOR ; VÊNCIO, RICARDOZN ; EGIDIO, CAMILAM ; MOTA-VIEIRA, LUISA ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; REIS, EDUARDOM. Evaluation of reference-based two-color methods for measurement of gene expression ratios using spotted cDNA microarrays. BMC Genomics. v. 7, p. 35, 2006. Qualis: A2
78.	PEREIRA, G. S. P. ; BRANDÃO, R. M. ; GIULIATTI, S. ; ZAGO, M. A. ; SILVA JUNIOR, W. A.. Gene Class Expression: analysis tool of Gene Ontology terms with gene expression data. Genetics and Molecular Research. v. 5, n. 1, p. 108-114, 2006.Qualis: B3
79.	PEREIRA, T. V. ; Rudnichi, M ; SOLER, J. M. P. ; KRIEGER, J. E.. Meta-analysis of aspirin for the prevention of preeclampsia: do the main randomized controlled trials support an association between low-dose aspirin and a reduced risk of developing preeclampsia?. Clinics. v. 61, p. 179-182, 2006. Qualis: B4
80.	PINTO, B. J. ; VINCI, A. ; SANTO, M. C. ; FARIA JUNIOR, M. ; GIULIATTI, S.. A Study of SNPs in Sirtuins Structures. Em: X-meeting 2006: ISBM 2006 and 2nd Annual AB3C Conference, 2006, Fortaleza, CE. Papers e Posters, 2006.
81.	PONTES, E.R. ; MATOS, L.C. ; DA SILVA, E.A. ; XAVIER, L.S. ; DIAZ, B.L. ; SMALL, I.A. ; Reis, E.M. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S. ; BARCINSKI, M.A. ; GIMBA, E.R.P.. Auto-antibodies in prostate cancer: Humoral immune response to antigenic determinants coded by the differentially expressed transcripts FLJ23438 and VAMP3. The Prostate (Print). v. 66, p. 1463-1473, 2006. Qualis: A2
82.	PUGA, R. D. ; AMUI, S. F. ; JORGE, D. M. M. ; FARIA JUNIOR, M. ; SOARES, A. M. ; GIULIATTI, S.. MPVAD: System of Integration of Biological Data. Em: X-meeting 2006: ISBM 2006 and 2nd Annual AB3C Conference, 2006, Fortaleza, CE. Papers e Posters, 2006.
83.	Ramires, D ; SOLER, J. M. P. ; PEREIRA, A. C.. A bayesian mixture model for gene expression heritability. Em: 17 SINAPE, 2006, Caxambú. Anais do 17 Simpósio Nacional de Probabilidade e Estatística, 2006. Qualis: Não identificado (17 SINAPE, 2006, CAXAMBÚ. ANAIS DO 17 SIMPÓSIO NACIONAL DE PROBABILIDADE E ESTATÍSTICA)
84.	Reis LF ; SLUYS MAV. ; Garrat RC ; Pereira HM ; Teixeira MM. GMOs: building the future on the basis of past experience. Anais da Academia Brasileira de Ciências. v. 78, p. 667-686, 2006. Qualis: A2
85.	RIBEIRO, J. H. B. ; HASHIMOTO, R. F.. A New Machine Learning Technique Based on Straight Line Segments. Em: Fifth International Conference on Machine Learning and Applications (ICMLA 2006), p. 10-16, 2006. Qualis: Não identificado (Fifth International Conference on Machine Learning and Applications (ICMLA 2006))
86.	RIBEIRO-DOS-SANTOS, GABRIELA ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; LEITE, LUCIANA C. C.. Schistosomiasis-a century searching for chemotherapeutic drugs. Parasitology Research (1987. Print). v. 99, p. 505-521, 2006. Qualis: Não identificado (PRINT))
87.	ROELA, R. A. ; CARRARO, D. M. ; BRENTANI, H. P. ; KAIANO, J. ; BASTOS, E. P. ; PATRÃO, D. F. C. ; GUARNIEIRO, R. ; LOPES, L. F. ; BRENTANI, M. M.. Identification of candidate genes is stromal bone marrow cells during childhood myelodysplasic syndromes stages. Em: 97th Annual Meeting 2006, AACR ? American Association for Cancer Research, 2006, Washington-DC. Proceedings of the American Association for Cancer Research. Oakland-CA, v. 47, p. 838, 2006.
88.	ROSA, A.C. ; TORRES, T.T. ; AZEREDO-ESPIN, A.M.L. ; LESSINGER, A.C.. Caracterização de marcadores microssatélites polimórficos para a mosca-dos-chifres, Haematobia irritans ( Diptera: Muscidae ). Em: 52o. Congresso Brasileiro de Genética, 2006, Foz do Iguaçu, PR. Resumos do 52o. Congresso Brasileiro de Genética, 2006.
89.	ROZENCHAN, P. B. ; FOLGUEIRA, M. A. A. K. ; BRENTANI, H. P. ; CARRARO, D. M. ; KATAYAMA, M. L. H. ; LOURDES, T. L. ; PATRÃO, D. F. C. ; MOTA, L. D. ; BASTOS, E. P. ; LYRA, E. C. ; GOES, J. C. G. S. ; BRENTANI, M. M.. Influence of fibroblasts originated from breast cancer and normal adjacent tissue from benign diseases on gene expression profile of normal and tumoral epithelial mammary cells. Em: 97th Annual Meeting 2006, AACR ? American Association for Cancer Research, 2006, Washington-DC. Proceedings of the American Association for Cancer Research. Oakland-CA, v. 47, p. 837, 2006.
90.	SACCARO-JUNIOR, N. L. ; SLUYS MAV. ; VARANI, A. M. ; ROSSI, M.. MudrA-like sequences from rice and sugarcane cluster as two bona fide transposon clades and two domesticated transposases.. Gene (Amsterdam). v. 6, p. in press, 2006. Qualis: A4
91.	SALIM, A. C. M. ; CAMARGO, L. P. ; PATRÃO, D. F. C. ; WANG, Y. ; CARRARO, D. M. ; BRENTANI, H. P. ; MCCLELLAND, M. ; CAMARGO, A. A.. Global DNA methylation analysis in breast tumors using promoter microarray. Em: 97th Annual Meeting 2006, AACR ? American Association for Cancer Research, 2006, Washington-DC. Proceedings of the American Association for Cancer Research. Oakland-CA, v. 47, p. 3219, 2006.
92.	SAMAIA, H. B.; CAMARGO, A. A. ; BRENTANI, R. R. ; DE SOUZA, S. J.. The FAPESP/LICR human cancer genome project: perspectives on integration. Em: Sylvia Nagl; Richard Begent. (Org.). Cancer bioinformatics: from therapy design to treatment. Hoboken. : John Wiley & Sons. 2006.p. 171-184.
93.	SANTOS, F. E. C. ; ALVES, N. A. ; GIULIATTI, S. Classificação Vetorial das Sequências Primárias de Proteínas. Em: 14º SIICUSP: Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo, 2006, São Paulo, SP. Anais, 2006.
94.	SANTOS, F. E. C. ; ALVES, N. A. ; GIULIATTI, S.. Classificação Vetorial das Sequências Primárias de Proteínas. Em: X Congresso Brasileiro de Informática em Saúde, 2006, Florianópolis, SC. Anais, 2006.
95.	SANTOS, G. F. ; TINÓS, R. ; GIULIATTI, S.. Classification of Snake Venom-Neutralizing Effects of Medicinal Plants via Artificial Network. Em: X-meeting 2006: ISBM 2006 and 2nd Annual AB3C Conference, 2006, Fortaleza, CE. Papers e Posters, 2006.
96.	Serafin, CA ; da Rosa, GA ; GUIMARAES, A. M. S. ; BIONDO, A. W.. Quem mora em prédios tem mais ou menos cães e gatos?. Revista do Conselho Regional de Medicina Veterinária - Paraná, , v. 21, p. 20, 01 out. 2006.
97.	SETUBAL, J. C. Lipoprotein computational prediction in spirochaetal genomes. Microbiology (Reading). v. 152, p. 113-121, 2006. Qualis: B1
98.	SILVA, A. M. DA ; AIDAR, M. P. M. ; BUCKERIDGE, M. S.. Caracterização parcial dos beta-glucanos ao longo do desenvolvimento foliar em Brachiaria decumbens Stapf. Hoehnea (São Paulo), São Paulo. v. 33, n. 1, p. 99-105, 2006.Qualis: Não identificado (HOEHNEA , SÃO PAULO)
99.	SILVA, N. M. ; TORRES, T.T. ; AZEREDO-ESPIN, A.M.L.. Caracterização de um fragmento do gene para canal de sódio em diferentes espécies de interesse médico/veterinário e forense contendo mutações associadas à resistência à piretróides e DDT. Em: 52o. Congresso Brasileiro de Genética, 2006, Foz do Iguaçu, PR. Resumos do 52o. Congresso Brasileiro de Genética, 2006.
100.	SOLER, J. M. P.; PEREIRA, A. C.. BiostatisticsTeaching in the New Genome Era. Proceedings of the Seventh International Conference on teaching Statistics. v. 4C, p. 1-5, 2006.Qualis: Não identificado (PROCEEDINGS OF THE SEVENTH INTERNATIONAL CONFERENCE ON TEACHING STATISTICS)
101.	SOLER, J. M. P.; PEREIRA, A. C.. BIOSTATISTICS TEACHING IN THE NEW GENOME ERA. Em: Seventh International Conference on Teaching Statistics (ICOTS-7), 2006.Qualis: Não identificado (Seventh International Conference on Teaching Statistics (ICOTS-7))
102.	SOLER, J. M. P.; PEREIRA, A. C. ; TÔRRES, C. H. ; KRIEGER, J. E.. Gene by environment QTL mapping through multiple trait analyses in blood pressure salt-sensitivity: identification of a novel QTL in rat chromosome 5. BMC Medical Genetics. v. 22, p. 10.1186/1471-23, 2006.Qualis: A4
103.	SOLER, J. M. P.; Ramires, D ; PEREIRA, A. C. ; GARCIA, E. P. ; Nojosa, R. A Bayesian Mixture Model for Gene Expression Heritability. Em: Genetic Analysis Workshop 15, 2006.Qualis: Não identificado (Genetic Analysis Workshop 15)
104.	TINÉ, M. A. S. ; SILVA, C. O. ; Carpita NC ; BUCKERIDGE, M. S.. Fine structure of a mixed-oligomer storage xyloglucan from seeds. Em: Plant Biology 2006, 2006, Boston. Livro de resumos. Bethesda: American Society of Plant Biology (ASPB), 2006.
105.	TINÉ, M. A. S. ; SILVA, C. O. ; LIMA, D. U. DE ; Carpita NC ; BUCKERIDGE, M. S.. Fine structure of a mixed-oligomer storage xyloglucan from seeds of Hymenaea courbaril. Carbohydrate Polymers, Irlanda. v. 66, p. 444-454, 2006. Qualis: Não identificado (CARBOHYDRATE POLYMERS, IRLANDA)
106.	TONINI, P. P. ; LISBOA, C. G. ; Frisch L ; Mercier, H. ; VIVEIROS, S. C. M. ; BUCKERIDGE, M. S.. Effect of abscisic acid on galactomannan degradation and endo-beta-mannanase activity in seeds of Sesbania virgata (Cav.) Pers.. Trees (Berlin). v. 20, p. 669-678, 2006. Qualis: A2
107.	TORRES, T.T.; AZEREDO-ESPIN, A.M.L.. Genetic Variability and Population structure of New World screwworm. 2006. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
108.	Totola, A.H. ; Costa, D.A. ; KOIDE, T. ; Gomes, S. L. ; Fietto, L.G. ; Fietto, J.L.R. ; Castro, I.M. ; Brandão, R.L.. Analysis of global gene expression pattern of pkc1delta mutant and wild type W-303 Sacharomyces cerevisiae strains by DNA microarray. Em: XXXV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2006, Águas de Lindóia. XXXV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, p. G-70, 2006.
109.	VAN SLUYS, M A; LIMA, W. ; MENCK, C. F. M. ; BOGDANOVE, A. ; LEACH, J. E.. Comparative genomic analysis among Xanthomonadales. 2006. Apresentação de Trabalho/Simpósio
110.	VAN SLUYS, M A; ROSSI, M. ; SACCARO, Nilo ; JESUS, Erika Maria de ; DOMINGUES, Douglas Silva ; COSTA, Ana Paula Pimentel. A genomic approach to depict transcriptionally active transposable elements in sugarcane. 2006. Apresentação de Trabalho/Simpósio
111.	Vencio, R.Z.N. ; KOIDE, T. ; Gomes, S. L. ; PEREIRA, CA. BayGO: Bayesian analysis of ontology term enrichment in microarray data.. BMC Bioinformatics. v. 7, p. 86, 2006. Qualis: A1
112.	Verjovski-Almeida, S.; DEMARCO, Ricardo. The Schistosome Transcriptome. Em: A.G. Maule; N.J. Marks. (Org.). Parasitic Flatworms: Molecular Biology, Biochemistry, Immunology and Physiology. Wallingford, UK. : CAB International. 2006.p. 138-148.
113.	VIBRANOVSKI, M. D.; SAKABE, N. J. ; de SOUZA, S. J.. A possible role of exon-shuffling in the evolution of signal peptides of human proteins. FEBS LETTERS. v. 580, n. 6, p. 1621-1624, 2006. Qualis: A2
114.	VIBRANOVSKI, M. D.; SAKABE, N. J. ; de SOUZA, S. J.. Intron origin and evolution. 2006. Apresentação de Trabalho/Seminário
115.	VILTORELLO, C. B. M. ; LIMA, W. ; VARANI, A. M. ; SOUZA, R. ; VASCONCELOS, Ana Tereza ; MENCK, C. F. M. ; VAN SLUYS, M A. Plant pathogens comparative genomics: genetic móbile elements as sources of gene diversity. 2006. Apresentação de Trabalho/Simpósio
116.	VINCI, A. ; PINTO, B. J. ; SANTO, M. C. ; FARIA JUNIOR, M. ; GIULIATTI, S.. Comparative Analysis oh Human SIRT Proteins Tertiary Structures. Em: X-meeting 2006: ISBM 2006 and 2nd Annual AB3C Conference, 2006, Fortaleza, 2006.

2005

1.	ALTHAUS, Lilian Karenina ; ALBERTON, Geraldo Camilo ; GUIMARAES, A. M. S. ; FIAMETTI, Amarildo. Exame macroscópcio das articulações de suínos artríticos no abatedouro. Archives of Veterinary Science. v. 10, n. 1, p. 13-19, 2005.Qualis: B2
2.	Anghinah, R. ; Caramelli, P. ; Takahashi, D. Y. ; Nitrini, R. ; Sameshima, Koichi. Estudo da coerência do eletrencefalograma na banda de frequência alfa em indivíduos adultos normais: resultados preliminares em 10 casos. Arquivos de Neuro-Psiquiatria, São Paulo. v. 63, n. 1, p. 83-86, 2005. Qualis: Não identificado (ARQUIVOS DE NEURO-PSIQUIATRIA, SÃO PAULO)
3.	ARAÚJO, P. G. ; ROSSI, M. ; JESUS, Erika Maria de ; SACCARO-JUNIOR, N. L. ; KAJIHARA, D. ; et al ; CHABREGAS, S. M. ; ULIAN, E. C. ; MENOSSI, M. ; SLUYS MAV.. Transcriptionally active transposable elements in recent hybrid sugarcane.. Plant Journal. v. 44, n. 5, p. 707-717, 2005. Qualis: A1

Relatório gerado por scriptLattes V9. Os resultados podem ser afetados por possíveis falhas decorrentes de inconsistências no preenchimento dos Currículos Lattes. E-mail de contato: webmaster@ime.usp.br