Programa de Pós Graduação em Bioinformática

João Eduardo Ferreira

Professor titular junto ao Departamento de Ciência da Computação do Instituto de Matemática e Estatística da Universidade de São Paulo. Bolsista CNPq Produtividade em Pesquisa nível 2. Graduação Bacharelado em Física - Opção Física-Computacional pela Universidade de São Paulo (1988); mestrado (1991) e doutorado (1996) em Fisica-Computacional pela Universidade de São Paulo; graduação em Pedagogia pela Universidade Federal de São Carlos (1989). Pós-doutorado pela Georgia Tech, Atlanta-USA (2010). É editor associado do periódico IEEE Transactions on Services Computing e tem participado de vários comitês de programas incluindo IEEE Web Services, WISE, ICSOC, ICWS, ICDE, IEEE Big Data, ENASE e SBBD. Publicou mais de 100 artigos nas áreas de bancos de dados e e-Science e tem recebido apoio regular das agências de fomento FAPESP, CNPq, CAPES, Ministério da Saúde e NIH-USA para financiamento de suas pesquisas. Os principais temas de interesse são: integração de bancos de dados; modelagem, análise e implementação de sistemas de informação cientes de processos; data warehouse; qualidade de dados; transações assíncronas; recuperação de informação e sistemas baseados em conhecimento ao vivo. Membro da Sociedade Brasileira de Computação (SBC), da IEEE-CS e da ACM. (Texto informado pelo autor)

http://lattes.cnpq.br/0131770792108992 (04/04/2024)

Rótulo/Grupo:

Bolsa CNPq: Nível 2

Período de análise:

Endereço: Universidade de São Paulo, Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação. Rua do Matão 1010 Butanta 05508900 - São Paulo, SP - Brasil Telefone: (11) 30916134 Ramal: 6134 Fax: (11) 30916135 URL da Homepage: http://www.ime.usp.br

Grande área: Ciências Exatas e da Terra

Área: Ciência da Computação

Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Artigos completos publicados em periódicos (56)
1. E S NARDI, EDNILZA ; PADILHA, BRUNO ; TADASHI KAMAURA, LEONARDO ; Ferreira, João Eduardo. Improved generalization of cyclist detection on security cameras with the OpenImages Cyclists dataset. Journal of Information and Data Management - JIDM. v. 14, p. 1, 2023. Qualis: B3
2. LEVIN, ANNA S. ; COSTA, SILVIA F. ; RAZZOLINI, MARIA TEREZA P. ; PADOVEZE, MARIA CLARA ; NUNES, FATIMA L.S. ; OLIVEIRA, MAURA S. ; FREIRE, MARISTELA P. ; TAVARES, BRUNO M. ; ASSIS, DENISE B. ; DE OLIVEIRA, VITOR F. ; LEAL, FABIO E. ; MARCONDES, MARTA A. ; DROPA, MILENA ; CONDE, MÔNICA T.R.P. ; OIKAWA, MARCIO K. ; Ferreira, João E. ; SABINO, ESTER ; MANULI, ERIKA R. ; RAYMUNDO, SUELI F.. Launch of the São Paulo Wellcome Trust-funded multidisciplinary research program on optimising antimicrobial use in highly populated urban environments. Lancet Regional Health-Americas. v. 25, p. 100574, 2023. Qualis: Não identificado (LANCET REGIONAL HEALTH-AMERICAS)
3. GONCALVES, VINICIUS P. M. ; SILVA, LOURIVAL P. ; NUNES, FATIMA L. S. ; Ferreira, João E. ; ARAÚJO, LUCIANO V.. Concept drift adaptation in video surveillance: a systematic review. MULTIMEDIA TOOLS AND APPLICATIONS. v. I, p. 1, 2023. Qualis: A2
4. DA PAIXÃO, VINICIUS FERREIRA ; SOSA, OMAR JULIO ; DA SILVA PELLEGRINA, DIOGO VIEIRA ; DAZZANI, BIANCA ; CORRÊA, THALITA BUENO ; RISÉRIO BERTOLDI, ESTER ; DA CRUZ E ALVES-DE-MORAES, LUÍS BRUNO ; DE OLIVEIRA PESSOA, DIOGO ; DE PAIVA OLIVEIRA, VICTORIA ; ALBERTO CHIONG ZEVALLOS, RICARDO ; RUSSO, LILIAN CRISTINA ; LUIS FORTI, FABIO ; EDUARDO FERREIRA, JOÃO ; CARIOCA FREITAS, HELANO ; JUKEMURA, JOSÉ ; MACHADO, MARCEL CERQUEIRA CÉSAR ; DIRLEI BEGNAMI, MARIA ; SETUBAL, JOÃO CARLOS ; BASSÈRES, DANIELA SANCHEZ ; MORAES REIS, EDUARDO. Annotation and functional characterization of long noncoding RNAs deregulated in pancreatic adenocarcinoma. CELLULAR ONCOLOGY. v. 45, p. 479-504, 2022. Qualis: A1
5. LEVIN, ANNA S. ; FREIRE, MARISTELA P. ; OLIVEIRA, MAURA SALAROLI DE ; NASTRI, ANA CATHARINA S. ; HARIMA, LEILA S. ; PERDIGÃO-NETO, LAURO VIEIRA ; MAGRI, MARCELLO M. ; FIALKOVITZ, GABRIEL ; FIGUEIREDO, PEDRO H. M. F. ; SICILIANO, RINALDO FOCACCIA ; Sabino, Ester C. ; CARLOTTI, DANILO P. N. ; RODRIGUES, DAVI SILVA ; NUNES, FÁTIMA L. S. ; Ferreira, João Eduardo ; FILHO, GERALDO BUSATTO ; BONFÁ, ELOISA ; UTIYAMA, EDIVALDO ; SEGURADO, ALUISIO ; PERONDI, BEATRIZ. Correlating drug prescriptions with prognosis in severe COVID-19: first step towards resource management. BMC Medical Informatics and Decision Making. v. 22, p. 1, 2022. Qualis: A2
6. RODRIGUES, DAVI SILVA ; NASTRI, ANA CATHARINA S. ; MAGRI, MARCELLO M. ; OLIVEIRA, MAURA SALAROLI DE ; Sabino, Ester C. ; FIGUEIREDO, PEDRO H. M. F. ; LEVIN, ANNA S. ; FREIRE, MARISTELA P. ; HARIMA, LEILA S. ; NUNES, FÁTIMA L. S. ; Ferreira, João Eduardo ; BUSATTO, GERALDO ; BONFÁ, ELOISA ; UTIYAMA, EDIVALDO ; SEGURADO, ALUISIO ; PERONDI, BEATRIZ ; MORAIS, ANNA M. ; MONTAL, AMANDA ; FUSCO, SOLANGE ; FREGONESI, MARJORIE. Predicting the outcome for COVID-19 patients by applying time series classification to electronic health records. BMC Medical Informatics and Decision Making. v. 22, p. 1, 2022. Qualis: A2
7. DE ANDRÉ, CARMEN DIVA SALDIVA ; BIERRENBACH, ANA LUIZA ; BARROSO, LUCIA PEREIRA ; DE ANDRÉ, PAULO AFONSO ; JUSTO, LISIE TOCCI ; PEREIRA, LUIZ ALBERTO AMADOR ; TANIGUCHI, MAURO T. ; MINTO, CÁTIA MARTINEZ ; TAKECIAN, PEDRO LOSCO ; KAMAURA, LEONARDO TADASHI ; Ferreira, João Eduardo ; HAZARD, RILEY H. ; MCLAUGHLIN, DEIRDRE ; RILEY, IAN ; LOPEZ, ALAN D. ; RAMOS, ANA MARIA DE OLIVEIRA ; DE SOUZA, MARIA DE FATIMA MARINHO ; FRANÇA, ELISABETH BARBOZA ; SALDIVA, PAULO HILÁRIO NASCIMENTO ; DA SILVA, LUIZ FERNANDO FERRAZ. Validation of physician certified verbal autopsy using conventional autopsy: a large study of adult non-external causes of death in a metropolitan area in Brazil. BMC PUBLIC HEALTH. v. 22, p. 1, 2022. Qualis: A2
8. CARLOTTI, D. ; FERREIRA, J.E.. TEXT SUMMARIZATION AS AN EMPIRICAL LEGAL RESEARCH TOOL BASED ON MACHINE LEARNING ALGORITHMS. REVISTA DE ESTUDOS EMPÍRICOS EM DIREITO. v. 1, p. 1, 2022. Qualis: B1
9. CATARINO, MARINO HILARIO ; PADILHA, BRUNO ; Ferreira, João Eduardo. DataUSP: Conjunto de serviços analíticos para apoio à tomada de decisões em uma instituição de ensino superior. Latin American Journal of Development. v. 3, p. 2495-2500, 2021. Qualis: Não identificado (LATIN AMERICAN JOURNAL OF DEVELOPMENT)
10. BOROVINA JOSKO, JOÃO MARCELO ; Ferreira, João Eduardo. Using visual-interactive properties to support data quality visual assessment on abstract and timeless data. Journal of Information and Data Management - JIDM. v. 12, p. 1, 2021. Qualis: B3
11. Capuani, Ligia ; BIERRENBACH, ANA LUIZA ; ALENCAR, AIRLANE PEREIRA ; MENDRONE, ALFREDO ; Ferreira, João Eduardo ; Custer, Brian ; RIBEIRO, ANTONIO LUIZ P. ; SABINO, ESTER CERDEIRA. Correction: Mortality among blood donors seropositive and seronegative for Chagas disease (1996-2000) in São Paulo, Brazil: A death certificate linkage study. PLoS Neglected Tropical Diseases. v. 14, p. e0008871, 2020. Qualis: A1
12. SUPREM, ABHIJIT ; ARULRAJ, JOY ; Pu, Calton ; FERREIRA, JOAO. ODIN. Proceedings of the VLDB Endowment. v. 13, p. 2453-2465, 2020. Qualis: A1 (PROCEEDINGS OF THE VLDB ENDOWNMENT)
13. Pu, Calton ; SUPREM, ABHIJIT ; LIMA, RODRIGO ALVES ; Musaev, Aibek ; WANG, DE ; IRANI, DANESH ; WEBB, STEVE ; Ferreira, Joao Eduardo. Beyond Artificial Reality. ACM Transactions on Internet Technology. v. 20, p. 1-21, 2020. Qualis: A2
14. CINTHO OZAHATA, MINA ; PAGE, GRIER P. ; GUO, YUELONG ; FERREIRA, J. E. ; DINARDO, CARLA LUANA ; Carneiro-Proietti, A. B. ; Loureiro, Paula ; MOTA, ROSIMERE AFONSO ; RODRIGUES, DANIELA O.W. ; BELISARIO, ANDRÉ ROLIM ; MAXIMO, CLAUDIA ; FLOR-PARK, MIRIAM V. ; Custer, Brian ; KELLY, SHANNON ; SABINO, ESTER CERDEIRA. Clinical and Genetic Predictors of Priapism in Sickle Cell Disease: Results from the Recipient Epidemiology and Donor Evaluation Study III Brazil Cohort Study. Journal of Sexual Medicine. v. 16, p. 1988-1999, 2019. Qualis: A1 (THE JOURNAL OF SEXUAL MEDICINE)
15. YANCY-CABALLERO, DAISON ; LING, LIU Y. ; Fujita, André ; FERREIRA, JOÃO E. ; DRIEMEIER, CARLOS. Intraparticle Connectivity in Sugarcane Bagasse Unveiled by Pore Network Modeling. BioEnergy Research. v. 12, p. 546-557, 2019. Qualis: A1
16. SCHWERZ, ANDRE LUIS ; LIBERATO, RAFAEL ; Pu, Calton ; Ferreira, Joao Eduardo. Robust and Reliable Process-Aware Information Systems. IEEE Transactions on Services Computing. v. 1, p. 1-1, 2018. Qualis: A1
17. DIGIAMPIETRI, LUCIANO ANTONIO ; Ferreira, João Eduardo. Desambiguação de nomes de autores para a identificação automática de perfis acadêmicos. EM QUESTÃO. v. 24, p. 37, 2018. Qualis: A3
18. CARNEIRO-PROIETTI, ANNA B. F. ; KELLY, SHANNON ; MIRANDA TEIXEIRA, CAROLINA ; Sabino, Ester C. ; ALENCAR, CECILIA S. ; Capuani, Ligia ; SALOMON SILVA, TASSILA P. ; ARAUJO, ADERSON ; LOUREIRO, PAULA ; MÁXIMO, CLÁUDIA ; LOBO, CLARISSE ; FLOR-PARK, MIRIAM V. ; RODRIGUES, DANIELA O. W. ; MOTA, ROSIMERE A. ; Gonçalez, Thelma T. ; HOPPE, CAROLYN ; Ferreira, João E. ; OZAHATA, MINA ; PAGE, GRIER P. ; GUO, YUELONG. Clinical and genetic ancestry profile of a large multi-centre sickle cell disease cohort in Brazil. BRITISH JOURNAL OF HAEMATOLOGY. v. 1, p. bjh.15462, 2018. Qualis: A2
19. YANCY-CABALLERO, DAISON ; LING, LIU Y. ; ARCHILHA, NATHALY L. ; FERREIRA, J. E. ; DRIEMEIER, C.. Mineral Particles in Sugar Cane Bagasse: Localization and Morphometry Using Microtomography Analysis. ENERGY & FUELS (ONLINE). v. 31, p. 12288-12296, 2017. Qualis: A1
20. Capuani, Ligia ; BIERRENBACH, ANA LUIZA ; PEREIRA ALENCAR, AIRLANE ; Mendrone, Alfredo ; FERREIRA, J. E. ; Custer, Brian ; P. RIBEIRO, ANTONIO LUIZ ; SABINO, Ester Cerdeira. Mortality among blood donors seropositive and seronegative for Chagas disease (1996-2000) in São Paulo, Brazil: A death certificate linkage study. PLoS Neglected Tropical Diseases. v. 11, p. e0005542, 2017. Qualis: A1
21. BOROVINA JOSKO, J. M. ; FERREIRA, J. E.. Visualization properties for data quality visual assessment: An exploratory case study. Information Visualization (Print). v. 1, p. 1-20, 2016. Qualis: B1
22. CARDOSO, CLARECI SILVA ; Sabino, Ester Cerdeira ; OLIVEIRA, CLAUDIA DI LORENZO ; DE OLIVEIRA, LEA CAMPOS ; FERREIRA, ARIELA MOTA ; CUNHA-NETO, EDÉCIO ; BIERRENBACH, ANA LUIZA ; Ferreira, João Eduardo ; HAIKAL, DESIRÉE SANT'ANA ; REINGOLD, ARTHUR L ; RIBEIRO, ANTONIO LUIZ P. Longitudinal study of patients with chronic Chagas cardiomyopathy in Brazil (SaMi-Trop project): a cohort profile. BMJ Open. v. 6, p. e011181, 2016. Qualis: A1
23. DRIEMEIER, CARLOS ; LING, LIU YI ; SANCHES, GUILHERME M. ; PONTES, ANGÉLICA O. ; MAGALHÃES, PAULO S. GRAZIANO ; Ferreira, João E.. A computational environment to support research in sugarcane agriculture. Computers and Electronics in Agriculture. v. 130, p. 13-19, 2016. Qualis: A1
24. ALMEIDA, FERNANDA NASCIMENTO ; TUNES, GISELA ; DA COSTA, JULIO CEZAR BRETTAS ; Sabino, Ester Cerdeira ; MENDRONE-JÚNIOR, ALFREDO ; Ferreira, João Eduardo. A provenance model based on declarative specifications for intensive data analyses in hemotherapy information systems. Future Generation Computer Systems. v. 59, p. 105-113, 2016. Qualis: A1
25. Busch, Michael P. ; Sabino, Ester C. ; BRAMBILLA, DONALD ; LOPES, MARIA ESTHER ; Capuani, Ligia ; CHOWDHURY, DHULY ; MCCLURE, CHRISTOPHER ; LINNEN, JEFFREY M. ; PRINCE, HARRY ; SIMMONS, GRAHAM ; LEE, TZONG-HAE ; KLEINMAN, STEVEN ; CUSTER, BRIAN. Duration of Dengue Viremia in Blood Donors and Relationships Between Donor Viremia, Infection Incidence and Clinical Case Reports During a Large Epidemic. JOURNAL OF INFECTIOUS DISEASES. v. 214, p. 49-54, 2016. Qualis: A1 (THE JOURNAL OF INFECTIOUS DISEASES)
26. Sabino, Ester C. ; LOUREIRO, PAULA ; LOPES, MARIA ESTHER ; Capuani, Ligia ; MCCLURE, CHRISTOPHER ; CHOWDHURY, DHULY ; DI-LORENZO-OLIVEIRA, CLAUDIA ; OLIVEIRA, LEA C. ; LINNEN, JEFFREY M. ; LEE, TZONG-HAE ; GONÇALEZ, THELMA ; BRAMBILLA, DONALD ; KLEINMAN, STEVE ; Busch, Michael P. ; CUSTER, BRIAN. Transfusion-Transmitted Dengue and Associated Clinical Symptoms During the 2012 Epidemic in Brazil. JOURNAL OF INFECTIOUS DISEASES. v. 213, p. 694-702, 2016. Qualis: A1 (THE JOURNAL OF INFECTIOUS DISEASES)
27. DIAZ, RICARDO SOBHIE ; INOCÊNCIO, LILIAN A. ; SUCUPIRA, Maria Cecilia Araripe ; PEREIRA, ANDERSON ALVARENGA ; HUNTER, JAMES ; FERREIRA, J. E. ; ARAÚJO, LUCIANO V. ; SOUZA, DENISE F. C. ; SABINO, Ester Cerdeira. The Virological and Immunological Characteristics of the HIV-1-Infected Population in Brazil: From Initial Diagnosis to Impact of Antiretroviral Use. Plos One. v. 10, p. e0139677, 2015. Qualis: A1
28. OZAHATA, MINA CINTHO ; Sabino, Ester Cerdeira ; DIAZ, R. S. ; CESAR-JR, ROBERTO M ; FERREIRA, J. E.. Data-intensive analysis of HIV mutations. BMC Bioinformatics. v. 16, p. PMC4344997, 2015. Qualis: A1
29. FERREIRA, S. C. ; DE ALMEIDA-NETO, C. ; NISHIYA, A. S. ; OLIVEIRA, C. D. L. ; FERREIRA, J. E. ; ALENCAR, C. S. ; LEVI, J. E. ; SALLES, N. A. ; MENDRONE JR., A. ; SABINO, E. C.. Demographic, risk factors and motivations among blood donors with reactive serologic tests for syphilis in São Paulo, Brazil. Transfusion Medicine (Print). v. 24, p. 169-175, 2014. Qualis: B1
30. Capuani, Ligia ; BIERRENBACH, ANA LUIZA ; ABREU, FATIMA ; TAKECIAN, PEDRO LOSCO ; FERREIRA, J. E. ; SABINO, Ester Cerdeira. Accuracy of a probabilistic record-linkage methodology used to track blood donors in the Mortality Information System database. Cadernos de Saúde Pública (ENSP. Impresso). v. 30, p. 1623-1632, 2014. Qualis: Não identificado (IMPRESSO))
31. STEINMACHER, Igor Fábio ; WIESE, Igor Scaliante ; SCHWERZ, André Luís ; ROBERTO, Rafael Liberato ; FERREIRA, J. E. ; GEROSA, Marco Aurélio. HISTORICAL ANALYSIS OF MESSAGE CONTENTS TO RECOMMEND ISSUES TO OPEN SOURCE SOFTWARE CONTRIBUTORS. REVISTA ELETRÔNICA DE SISTEMAS DE INFORMAÇÃO (RESI). v. 13, p. 6, 2014. Qualis: B3
32. LOUREIRO, PAULA ; ALMEIDA-NETO, CESAR DE ; PROIETTI, ANNA BÁRBARA CARNEIRO ; Capuani, Ligia ; GONÇALEZ, THELMA TEREZINHA ; OLIVEIRA, CLAUDIA DI LORENZO DE ; Leão, Silvana Carneiro ; LOPES, MARIA INÊS ; Sampaio, Divaldo ; Patavino, Giuseppina Maria ; Ferreira, João Eduardo ; Blatyta, Paula Fraiman ; LOPES, MARIA ESTHER DUARTE ; MENDRONE-JUNIOR, ALFREDO ; Salles, Nanci Alves ; KING, MELISSA ; MURPHY, EDWARD ; Busch, Michael ; Custer, Brian ; Sabino, Ester Cerdeira. Contribution of the Retrovirus Epidemiology Donor Study (REDS) to research on blood transfusion safety in Brazil. Revista Brasileira de Hematologia e Hemoterapia. v. 36, p. 152-158, 2014. Qualis: C
33. FERREIRA, S. C. ; DE ALMEIDA-NETO, C. ; NISHIYA, A. S. ; DI-LORENZO-OLIVEIRA, C. ; FERREIRA, J. E. ; ALENCAR, C. S. ; LEVI, J. E. ; SALLES, N. A. ; MENDRONE-JUNIOR, A. ; SABINO, E. C.. Prevalence of Treponema pallidum DNA among blood donors with two different serologic tests profiles for syphilis in São Paulo, Brazil. Vox Sanguinis (Basel. 1956). v. 106, p. 376-378, 2014. Qualis: Não identificado (1956))
34. Takecian, Pedro L. ; OIKAWA, MARCIO K. ; BRAGHETTO, KELLY R. ; ROCHA, PAULO ; LUCENA, FRED ; KAVOUNIS, KATHERINE ; SCHLUMPF, KAREN S. ; ACKER, SUSAN ; CARNEIRO-PROIETTI, ANNA B.F. ; Sabino, Ester C. ; Custer, Brian ; Busch, Michael P. ; Ferreira, João E.. Methodological guidelines for reducing the complexity of data warehouse development for transactional blood bank systems. Decision Support Systems. v. 55, p. 728-739, 2013. Qualis: A1
35. De Almeida-Neto, Cesar ; Sabino, Ester Cerdeira ; Liu, Jing ; Blatyta, Paula Fraiman ; Mendrone-Junior, Alfredo ; Salles, Nanci Alves ; Leão, Silvana Carneiro ; Wright, David J. ; Basques, Fernando Valadares ; Ferreira, João Eduardo ; Busch, Michael P. ; Murphy, Edward L. ; NHLBI RETROVIRUS EPIDEMIOLOGY DONOR STUDY-II (REDS-II), INTERNATIONAL COMPONENT. Prevalence of serologic markers for hepatitis B and C viruses in Brazilian blood donors and incidence and residual risk of transfusion transmission of hepatitis C virus. Transfusion (Arlington, Va.). v. 53, p. 827-834, 2013. Qualis: A3
36. Gonçalez, Thelma T. ; Sabino, Ester C. ; SCHLUMPF, KAREN S. ; Wright, David J. ; MENDRONE, ALFREDO ; LOPES, MARIA ; LEÃO, SILVANA ; MIRANDA, CAROLINA ; Capuani, Ligia ; CARNEIRO-PROIETTI, ANNA BARBARA F. ; BASQUES, FERNANDO ; Ferreira, João E. ; Busch, Michael ; Custer, Brian ; NHLBI RETROVIRUS EPIDEMIOLOGY DONOR STUDY-II (REDS-II), INTERNATIONAL COMPONENT. Analysis of donor deferral at three blood centers in Brazil. Transfusion (Arlington, Va.). v. 53, p. 531-538, 2013. Qualis: A3
37. ALMEIDA, FERNANDA N. ; Sabino, Ester C. ; TUNES, GISELA ; Schreiber, George B. ; B. DA SILVA, PEDRO PAULO S. ; CARNEIRO-PROIETTI, ANNA BARBARA F. ; Ferreira, João Eduardo ; Mendrone-Junior, Alfredo. Predictors of low haematocrit among repeat donors in São Paulo, Brazil: eleven year longitudinal analysis. Transfusion and Apheresis Science. v. 49, p. 553-559, 2013. Qualis: B1
38. BRAGHETTO, K. R. ; FERREIRA, J. E. ; VINCENT, J.. Performance evaluation of resource-aware business processes using stochastic automata networks. INTERNATIONAL JOURNAL OF INNOVATIVE COMPUTING, INFORMATION & CONTROL. v. v.8, p. 5295-5316, 2012.Qualis: A4
39. Patavino, Giuseppina Maria ; De Almeida-Neto, Cesar ; Liu, Jing ; Wright, David J. ; Mendrone-Junior, Alfredo ; Ferreira, Maria Inês Lopes ; de Freitas Carneiro, Anna Bárbara ; Custer, Brian ; Ferreira, João Eduardo ; Busch, Michael P. ; Sabino, Ester Cerdeira. Number of recent sexual partners among blood donors in Brazil: associations with donor demographics, donation characteristics, and infectious disease markers. Transfusion (Arlington, Va.). v. 52, p. 151-159, 2012. Qualis: A3
40. Sabino, Ester C. ; Gonçalez, Thelma T. ; Carneiro-Proietti, Anna Bárbara ; Sarr, Moussa ; Ferreira, João Eduardo ; Sampaio, Divaldo A. ; Salles, Nanci A. ; Wright, David J. ; Custer, Brian ; Busch, Michael ; FOR THE NHLBI RETROVIRUS EPIDEMIOLOGY DONOR STUDY-II (REDS-II), INTERNATIONAL COMPONENT. Human immunodeficiency virus prevalence, incidence, and residual risk of transmission by transfusions at Retrovirus Epidemiology Donor Study-II blood centers in Brazil. Transfusion (Arlington, Va.). v. 52, p. 870-879, 2012. Qualis: A3
41. Goncalez, Thelma T. ; Sabino, Ester C. ; Capuani, Ligia ; Liu, Jing ; Wright, David J. ; Walsh, Judy H. ; FERREIRA, JOAO E. ; Chamone, Dalton A. ; Busch, Michael P. ; Custer, Brian. Blood transfusion utilization and recipient survival at Hospital das Clinicas in São Paulo, Brazil. Transfusion (Arlington, Va.). v. 52, p. 729-738, 2012. Qualis: A3
42. GARCIA, M. O. ; BRAGHETTO, K. R. ; PU, C. ; FERREIRA, J. E.. An Implementation of a Transaction Model for Business Process Systems. Journal of Information and Data Management - JIDM. v. 3, p. 271, 2012.Qualis: B3
43. FERREIRA, J. E.; ARAUJO, L. V. ; BRAGHETTO, K. R. ; ITALIANO, I. C. ; OIKAWA, M. K. ; Takecian, P. L.. Long Lived Transaction Processing for Business Processes and Scientific Workflows. Journal of Information and Data Management - JIDM. v. 3, p. 33-50, 2012.Qualis: B3
44. Souza, Glaucia Mendes ; Berges, Helene ; Bocs, Stephanie ; Casu, Rosanne ; D?HONT, ANGELIQUE ; Ferreira, João Eduardo ; Henry, Robert ; Ming, Ray ; Potier, Bernard ; Sluys, Marie-Anne ; Vincentz, Michel ; Paterson, Andrew H.. The Sugarcane Genome Challenge: Strategies for Sequencing a Highly Complex Genome. Tropical Plant Biology (Print). v. 4, p. 145-156, 2011. Qualis: A3
45. Araújo, Luciano V ; Malkowski, Simon ; Braghetto, Kelly R ; Passos-Bueno, Maria R ; Zatz, Mayana ; Pu, Calton ; FERREIRA, JOÃO E. A rigorous approach to facilitate and guarantee the correctness of the genetic testing management in human genome information systems. BMC Genomics. v. 12, p. S13-8, 2011. Qualis: A2
46. De Almeida-Neto, Cesar ; Liu, Jing ; Wright, David J. ; Mendrone-Junior, Alfredo ; Takecian, Pedro L. ; Sun, Yu ; Ferreira, Joao Eduardo ; de Alencar Fischer Chamone, Dalton ; Busch, Michael P. ; Sabino, Ester Cerdeira ; FOR THE NHLBI RETROVIRUS EPIDEMIOLOGY DONOR STUDY-II (REDS-II), INTERNATIONAL COMPONENT. Demographic characteristics and prevalence of serologic markers among blood donors who use confidential unit exclusion (CUE) in São Paulo, Brazil: implications for modification of CUE polices in Brazil. Transfusion (Arlington, Va.). v. 51, p. 191-197, 2011. Qualis: A3
47. CARNEIRO-PROIETTI, A. B. ; SABINO, E. C. ; Sampaio, Divaldo ; Proietti, Fernando A. ; GONCALVES, T. T. ; OLIVEIRA, C. D. L. ; FERREIRA, J. E. ; Liu, Jing ; Schreiber, George B. ; Murphy, Edward L. ; BUSCH, M. P.. Demographic profile of blood donors at three major Brazilian blood centers: results from the International REDS-II study, 2007 to 2008. TRANSFUSION (ONLINE). v. 50, p. 918-925, 2010. Qualis: A3
48. OIKAWA, M. K. ; MERINO, E. F. ; FERNANDEZ-BECERRA, C. ; WUNDERLICH, G. ; VILLALOBOS, J. M. ; SILVA, P. P. S. B. ; BARRERA, J. ; DURHAM, A. M. ; DELPORTILLO, H. A. ; FERREIRA, J. E.. CLINMALDB: A Clinical Field-Research Oriented Relational Database to Study Human Malaria. IADIS International Journal on WWWInternet. v. 8, p. 181-191, 2010.Qualis: C (IADIS INTERNATIONAL JOURNAL ON WWW/INTERNET)
49. CANTAO, M. ; FERREIRA, J. E. ; LEMOS, E. G. M.. Optimal Clones Identifier for Genomic Shotgun Libraries: OC Identifier Tool. GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH. v. 6, p. 743-755, 2007.Qualis: B3
50. ITALIANO, I. ; FERREIRA, J. E.. Synchronization Options for Data Warehouse Designs. COMPUTER. v. 39, p. 53-57, 2006. Qualis: A2
51. ARAÚJO, L. V. ; SOARES, M. A. ; TANURI, A. ; OLIVEIRA, S. M. ; CHEQUER, P. ; SABINO, E. C. ; FERREIRA, J. E.. DBCollHIV: A Database System for Collaborative HIV analysis in Brazil. GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH. v. 5, p. 203-215, 2006. Qualis: B3
52. BARRETO, C. C. ; ARAÚJO, L. V. ; FERREIRA, J. E. ; SABINO, E. C.. Trends in Antiretroviral Drug Resistance and Clade Distributions Among HIV-1--Infected Blood Donors in Sao Paulo, Brazil. JAIDS-JOURNAL OF ACQUIRED IMMUNE DEFICIENCY SYNDROMES. v. 41, n. 3, p. 388-341, 2006. Qualis: A1 (JOURNAL OF ACQUIRED IMMUNE DEFICIENCY SYNDROMES)
53. MERINO, E. F. ; FERNANDEZ-BECERRA, C. ; DURHAM, A. M. ; FERREIRA, J. E. ; TUMILASCI, V. F. ; DARC-NEVES, J. ; DADARIO, A. ; SILVA-NUNES, M. ; FERREIRA, M. U. ; WICKRAMARACHCHI, T. A. ; PORTILLO, H. A.. Multi-character population study of the vir subtelomeric multigene superfamily of Plasmodium vivax, a major human malaria parasite. Molecular and Biochemical Parasitology (Print). v. 149, p. 10-16, 2006. Qualis: A4
54. DURHAM, A. M.; ALBRECHT, L. ; Emilio F. Merino ; HOFFMANN, E. H. ; URBANO, M. ; de Mattos Ferreira, R.G. ; OSAKABE, A. L. ; Dalla Martha, R.C. ; Ramharter, M. ; FERREIRA, J. E. ; Hernando A. del Portillo ; WUNDERLICH, G.. Extense variant gene family repertoire overlap in Western Amazon Plasmodium falciparum isolates. Molecular and Biochemical Parasitology (Print). v. 150, p. 157-165, 2006. Qualis: A4
55. BARRERA, J. ; CESAR JUNIOR, R. M. ; FERREIRA, J. E. ; GUBITOSO, M. D.. An environment for knowledge discovery in biology. COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE, Washington, DC ,USA, July 2004. v. 34, n. 5, p. 371-459, 2004.Qualis: Não identificado (COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE, WASHINGTON, DC ,USA, JULY 2004)
56. OIKAWA, M. K. ; BROINIZI, M. E. ; DERMAGOS, A. ; ARMELIN, H. A. ; FERREIRA, J. E.. GenFlow: generic flow for integration, management and analysis of molecular biology data. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, http://www.scielo.br/. v. 27, n. 4, p. 691-695, 2004. Qualis: Não identificado (GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, HTTP://WWW.SCIELO.BR/)
Livros publicados/organizados ou edições (9)
1. Ferreira, Joao Eduardo; Palanisamy, Balaji (Org.) ; Ye, Kejiang (Org.) ; Kantamneni, Siva (Org.) ; Zhang, Liang-Jie (Org.). Lecture Notes in Computer Science. 1 ed. Switzerland: Springer International Publishing, 2020. v. 1, p. 76.
2. Ferreira, Joao Eduardo; Musaev, Aibek (Org.) ; Zhang, Liang-Jie (Org.). Lecture Notes in Computer Science. 1 ed. San Diego, CA, USA: Springer International Publishing, 2019. v. 1, p. 123.
3. Ferreira, João Eduardo; Spanoudakis, George (Org.) ; Ma, Yutao (Org.) ; Zhang, Liang-Jie (Org.). Lecture Notes in Computer Science. 1 ed. Switzerland: Springer International Publishing, 2018. v. 10969, p. 192.
4. Marcovitch, Jacques ; Goldemberg, José ; Axel-Berg, Justin ; Righetti, Sabine ; Santos, Solange Maria dos ; Oliveira, Luiz Nunes de ; Grácio, Maria Cláudia Cabrini ; Rosas, Fábio Sampaio ; Ranieri, Nina ; Pedrosa, Renato ; Pereira, Micael Waldhelm ; Cruz, Carlos Henrique de Brito ; Shimizu, Karen ; Ferreira, João Eduardo ; Machado, Raul ; Segurado, Aluisio Cotrim ; Beppu, Marisa Masumi ; Holland, Helber ; Guimarães, José Augusto Chaves. Repensar a universidade: desempenho acadêmico e comparações internacionais. 1a ed. Universidade de São Paulo. Escola de Comunicações e Artes, 2018. .
5. MUSAEV, A. (Org.) ; FERREIRA, J. E. (Org.) ; HIGASHINO, T. (Org.). 37th IEEE International Conference on Distributed Computing Systems Workshops - ICDCSW 2017. 1 ed. Atlanta-GA: IEEE Computer Society, 2017. v. 1, p. 101.
6. MORO, M. M. (Org.) ; GALANTE, R. (Org.) ; HARA, C. S. (Org.) ; MARTINS, V. (Org.) ; MACEDO, J. A. (Org.) ; SOUZA, F. R. C. (Org.) ; FERREIRA, J. E. (Org.) ; PORTO, F. (Org.) ; BRAGANHOLO, V. (Org.). Proceedings of the 29th Brazilian Symposium on Databases. 29 ed. Porto Alegre, RS: Sociedade Brasileira de Computação, 2014. v. 1, p. 465.
7. CASANOVA, M. A. (Org.) ; FERREIRA, J. E. (Org.) ; GALANTE, R. (Org.) ; MONTEIRO FILHO, J. M. S. (Org.) ; MACHADO, J. C. (Org.) ; PORTO, F. (Org.) ; MOURA, A. M. C. (Org.) ; CIFERRI, C. D. A. (Org.) ; OIKAWA, M. K. (Org.). Proceedings of the 27th Brazilian Symposium on Databases. 1 ed. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação, 2012. v. 1, p. 464.
8. MATTOSO, M. L. Q. (Org.) ; FERREIRA, J. E. (Org.) ; BRAGANHOLO, V. P. (Org.). e-Science Workshop. 1 ed. Sociedade Brasileira de Computação, 2007. v. 1, p. 82.
9. FERREIRA, J. E.; FINGER, M.. Controle de Concorrência e Distribuição de Dados: a teoria clássica, suas limitações e extensões modernas. 1a ed. Sao Paulo: Escola Brasileira de Computaçao 2000, 2000. p. 180.
Capítulos de livros publicados (4)
1. FERREIRA, J.E.; Segurado, Aluisio Cotrim. Interoperabilidade de Dados, Desempenho Acadêmico e Impacto Social: USP no Horizonte 2022. Em: Marcovitch, Jacques. (Org.). Repensar a Universidade II: Impactos para a Sociedade. 1ed.São Paulo. : EDUSP. 2019.v. II, p. 43-60.
2. FERREIRA, J. E.; FRANCO, B. D. G. M. ; CATARINO, M. H. ; TAKECIAN, P. L. ; AGOPYAN, V.. Datausp-PosGrad: Um Conjunto de Serviços Analíticos para Apoio à Tomada de Decisão da PRPG da USP. Em: José Goldemberg. (Org.). USP 80 anos. 1ed.São Paulo - SP. : EDUSP. 2015.v. 1, p. 431-452.
3. BRAGHETTO, K. R. ; FERREIRA, J. E. ; PU, C.. NPTool: Towards Scalability and Reliability of Business Process Management (preprint). Em: Joaquim Filipe; Mohammad S. Obaidat. (Org.). (Org.). e-Business and Telecommunications, Communications in Computer and Information Science.. 1ed.Berlin, Heidelberg. : Springer. 2009.v. 48, p. 99-112.
4. FERREIRA, J. E.; TAKAI, O. K.. Understanding database modeling. Em: NCBI bookshelf. (Org.). Bioinformatics Tropical Disease Research: A Pratical Approach. : NCBI. 2008..
Textos em jornais de notícias/revistas (1)
1. FERREIRA, J. E. E-Science e workflows científicos: uma nova onda ou de fato um novo desafio ?. Computação Brasil, Porto Alegre RS, p. 3-3, 01 jan. 2007.
Trabalhos completos publicados em anais de congressos (68)
1. NARDI, EDNILZA EVANGELISTA DA SILVA ; PADILHA, BRUNO ; KAMAURA, LEONARDO TADASHI ; Ferreira, João Eduardo. OpenImages Cyclists: Expandindo a Generalização na Detecção de Ciclistas em Câmeras de Segurança. Em: Simpósio Brasileiro de Banco de Dados, p. 229, 2022. Qualis: Não identificado (Simpósio Brasileiro de Banco de Dados)
2. FREIRE, D. L. ; CARVALHO, A. C. P. L. F. ; FELTRAN, L. C. ; NAGAMATSU, L. A. ; SILVA, K. C. R. ; FIRMINO, C. ; Ferreira, João Eduardo ; TAKECIAN, P. L. ; CARLOTTI, D. ; LIMA, F. A. C. ; PORTELA, R. M.. Content-Based Lawsuits Document Image Retrieval. Em: Progress in Artificial Intelligence 21st EPIA Conference on Artificial Intelligence, v. 1, p. 1, 2022.Qualis: Não identificado (Progress in Artificial Intelligence 21st EPIA Conference on Artificial Intelligence)
3. FREIRE, D. L. ; CARVALHO, A. C. P. L. F. ; FELTRAN, L. C. ; NAGAMATSU, L. A. ; SILVA, K. C. R. ; FIRMINO, C. ; FERREIRA, J.E. ; TAKECIAN, P. L. ; CARLOTTI, D. ; LIMA, F. A. C. ; PORTELA, R. M.. Lawsuits Document Images Processing Classification. Em: Progress in Artificial Intelligence 21st EPIA Conference on Artificial Intelligence, v. 1, p. 1, 2022.Qualis: Não identificado (Progress in Artificial Intelligence 21st EPIA Conference on Artificial Intelligence)
4. SUPREM, ABHIJIT ; VAIDYA, SANJYOT ; CHERKADI, SUMA ; SINGH, PURVA ; Ferreira, Joao Eduardo ; Pu, Calton. Constructive Interpretability with CoLabel: Corroborative Integration, Complementary Features, and Collaborative Learning. Em: 2022 IEEE 4th International Conference on Cognitive Machine Intelligence (CogMI), p. 74, 2022. Qualis: Não identificado (2022 IEEE 4th International Conference on Cognitive Machine Intelligence (CogMI))
5. PADILHA, BRUNO ; TAKECIAN, PEDRO LOSCO ; LAURO SOARES, DECIO ; SCHWERZ, ANDRE LUIS ; TADASHI KAMAURA, LEONARDO ; Ferreira, Joao Eduardo. Metricam: Fast and Reliable Social Distancing Analysis in Online Security Cameras. Em: 2021 International Conference on Computational Science and Computational Intelligence (CSCI), p. 1567, 2021. Qualis: Não identificado (2021 International Conference on Computational Science and Computational Intelligence (CSCI))
6. GONEALVES, VINICIUS P. M. ; SILVA, LOURIVAL P. ; NUNES, FATIMA L. S. ; FERREIRA, JOAO E. ; ARAUJO, LUCIANO V.. Evaluation of Traditional and Deep Learning Human Detection Techniques Applied to Surveillance: A Performance Comparison at Distinct Object Sizes. Em: 2021 IEEE International Conference on Signal Processing, p. 1, 2021. Qualis: Não identificado (2021 IEEE International Conference on Signal Processing)
7. LIMA, R. A. ; KIMBALL, J. ; Ferreira, João E. ; Pu, Calton. Wise Toolkit: Enabling Microservice-Based System Performance Experiments. Em: International Conference on Cloud Computing, v. 1, p. 152-163, 2020.Qualis: Não identificado (International Conference on Cloud Computing)
8. SUPREM, ABHIJIT ; Pu, Calton ; Ferreira, João E.. Small, Accurate, and Fast Re-ID on the Edge: The SAFR Approach. Em: International Conference on Edge Computing, v. 1, p. 33-49, 2020.Qualis: Não identificado (International Conference on Edge Computing)
9. LIMA, R. A. ; KIMBALL, J. ; FERREIRA, J.E. ; Pu, Calton. Systematic Construction, Execution, and Reproduction of Complex Performance Benchmarks. Em: International Conference on Cloud Computing, v. 1, p. 45-67, 2019.Qualis: Não identificado (International Conference on Cloud Computing)
10. SUPREM, ABHIJIT ; LIMA, RODRIGO ALVES ; PADILHA, BRUNO ; Ferreira, Joao Eduardo ; Pu, Calton. Robust, Extensible, and Fast: Teamed Classifiers for Vehicle Tracking in Multi-Camera Networks. Em: 2019 IEEE First International Conference on Cognitive Machine Intelligence (CogMI), p. 23, 2019. Qualis: Não identificado (2019 IEEE First International Conference on Cognitive Machine Intelligence (CogMI))
11. LIMA, R. A. ; Pu, Calton ; TAKECIAN, P. L. ; KAMAURA, L. T. ; FERREIRA, J. E.. Modeling Time-Critical Processes with WED-Flow. Em: International Conference on Web Services, v. 10966, p. 34-48, 2018.Qualis: Não identificado (International Conference on Web Services)
12. PADILHA, BRUNO ; ROBERTO, R. L. ; SCHWERZ, A. L. ; PU, C. ; FERREIRA, J. E.. WED-SQL: an intermediate declarative language for PAIS execution. Em: International Conference on Web Services, v. 10966, p. 407-421, 2018.Qualis: Não identificado (International Conference on Web Services)
13. Ferreira, Joao Eduardo; ANTONIO VISINTIN, JOSE ; OKAMOTO, JUN ; CESAR BERNARDES, MAURO ; PATERLINI, ADRIANO ; ROQUE, ALEXANDER CSOKA ; RAMALHO MIGUEL, MOISES. Integrating the University of São Paulo Security Mobile App to the Electronic Monitoring System. Em: 2018 IEEE International Conference on Big Data (Big Data), p. 1377, 2018. Qualis: Não identificado (2018 IEEE International Conference on Big Data (Big Data))
14. Ferreira, Joao Eduardo; LOSCO TAKECIAN, PEDRO ; KAMAURA, LEONARDO TADASHI ; PADILHA, BRUNO ; Pu, Calton. Dependency Management with WED-flow Techniques and Tools: A Case Study. Em: 2017 IEEE 3rd International Conference on Collaboration and Internet Computing (CIC), p. 379, 2017. Qualis: Não identificado (2017 IEEE 3rd International Conference on Collaboration and Internet Computing (CIC))
15. FERREIRA, J. E.; OKAMOTO JUNIOR, J. ; VISINTIN, J. A. ; PU, C.. Smart Services: A Case Study on Smarter Public Safety by a Mobile App for University of São Paulo. Em: IEEE Smart City Innovations 2017, p. 1218-1223, 2017.Qualis: Não identificado (IEEE Smart City Innovations 2017)
16. BOROVINA JOSKO, J. M. ; OIKAWA, M. K. ; FERREIRA, J. E.. A Formal Taxonomy to Improve Data Defect Description. Em: Database Systems for Advanced Applications, v. 9645, p. 307-320, 2016.Qualis: Não identificado (Database Systems for Advanced Applications)
17. HÜBLER, PATRICIA ; RUIZ, DUNCAN ; Ferreira, João Eduardo ; DE SOUZA, OSMAR NORBERTO. P-SaMI. Em: the 30th Annual ACM Symposium, p. 54, 2015. Qualis: Não identificado (the 30th Annual ACM Symposium)
18. BROINIZI, MARCOS EDUARDO BOLELLI ; MUTTI, DANILO ; Ferreira, Joao Eduardo. Application Configuration Repository for Adaptive Service-Based Systems: Overcoming Challenges in an Evolutionary Online Advertising Environment. Em: 2014 IEEE International Conference on Web Services (ICWS), v. 1, p. 670-28, 2014. Qualis: Não identificado (2014 IEEE International Conference on Web Services (ICWS))
19. LIBERATO, R. ; SCHWERZ, A. L. ; FERREIRA, J. E.. Gerenciador de Dados Compartilhados entre Processos de Negócio: Data-Control Process para WED-Tool. Em: VIII Workshop Brasileiro em Gestão de Processos de Negócios., v. 2, p. 26-33, 2014.Qualis: Não identificado (VIII Workshop Brasileiro em Gestão de Processos de Negócios.)
20. JOSKO, J. M. B. ; FERREIRA, JOAO E.. Data quality assessment of very large database through visualization system. Em: Workshop de Teses e Dissertações do XXIX SBBD, v. 1, p. 295-303, 2014.Qualis: Não identificado (Workshop de Teses e Dissertações do XXIX SBBD)
21. ALMEIDA, FERNANDA NASCIMENTO ; TUNES, GISELA ; Sabino, Ester Cerdeira ; MENDRONE-JUNIOR, ALFREDO ; Ferreira, Joao Eduardo. A Provenance Model Based on Declarative Specifications for Intensive Data Analyses in Hemotherapy Information Systems. Em: 2014 IEEE 10th International Conference on eScience (eScience), p. 92, 2014. Qualis: Não identificado (2014 IEEE 10th International Conference on eScience (eScience))
22. DRIEMEIER, CALROS EDUARDO ; LING, LIU YI ; PONTES, ANGELICA O. ; SANCHES, GUILHERME M. ; FRANCO, HENRIQUE C.J. ; MAGALHAES, PAULO S.G. ; FERREIRA, JOAO E.. Data Analysis Workflow for Experiments in Sugarcane Precision Agriculture. Em: 2014 IEEE 10th International Conference on eScience (eScience), p. 163, 2014. Qualis: Não identificado (2014 IEEE 10th International Conference on eScience (eScience))
23. CASIMIRO, A. ; BROINIZI, M. E. ; FERREIRA, J.E.. Principais componentes na ordenação de anúncios: um experimento em ambiente real de publicidade computacional. Em: Simpósio Brasileiro de Bancos de Dados, v. 1, p. 147-156, 2014.Qualis: Não identificado (Simpósio Brasileiro de Bancos de Dados)
24. SCHWERZ, A. L. ; LIBERATO, R. ; WIESE, I. S. ; STEINMACHER, I. F. ; GEROSA, M. A. ; FERREIRA, J. E.. Predizendo a Participação de Desenvolvedores em Discussões em Projetos de Software Livre. Em: XIV Workshop de Software Livre, 2013.Qualis: Não identificado (XIV Workshop de Software Livre)
25. RODRIGUES, MAURICIO CHUI ; Ferreira, Joao Eduardo ; Pu, Calton. Web Services Composition through Data Events Approach. Em: 2013 IEEE International Conference on Services Computing (SCC), p. 320, 2013. Qualis: Não identificado (2013 IEEE International Conference on Services Computing (SCC))
26. FERREIRA, JOAO E.; BRAGHETTO, KELLY R. ; TAKAI, OSVALDO K. ; Pu, Calton. Transactional Recovery Support for Robust Exception Handling in Business Process Services. Em: 2012 IEEE 19th International Conference on Web Services (ICWS), p. 303, 2012. Qualis: Não identificado (2012 IEEE 19th International Conference on Web Services (ICWS))
27. CINTHO, MINA ; MARCONDES CESAR, ROBERTO ; Ferreira, Joao Eduardo. Data-intensive analysis of HIV mutations. Em: 2012 IEEE 8th International Conference on EScience (eScience), p. 1, 2012. Qualis: Não identificado (2012 IEEE 8th International Conference on EScience (eScience))
28. SCHWERZ, ANDRE LUIS ; LIBERATO, RAFAEL ; WIESE, IGOR SCALIANTE ; STEINMACHER, IGOR ; GEROSA, MARCO AURELIO ; Ferreira, Joao Eduardo. Prediction of Developer Participation in Issues of Open Source Projects. Em: Simpósio Brasileiro de Sistemas Colaborativos (SBSC 2012), p. 109, 2012. Qualis: Não identificado (Simpósio Brasileiro de Sistemas Colaborativos (SBSC 2012))
29. DOMINGUES, H. ; Kon, F ; FERREIRA, J. E.. Asynchronous Replication for Evolutionary Database Development: A Design for the Experimental Assessment of a Novel Approach. Em: OnTheMove Federated Conferences - ODBASE, v. II, p. 816-823, 2011.Qualis: Não identificado (OnTheMove Federated Conferences - ODBASE)
30. BRAGHETTO, K. R. ; FERREIRA, J. E. ; VINCENT, J.. Performance Evaluation of Business Processes through a Formal Transformation to SAN.. In:. Em: 8th European Performance Engineering Workshop, p. 42-56, 2011.Qualis: Não identificado (8th European Performance Engineering Workshop)
31. DUARTE G. L. ; CORREIA, R. ; DOMINGUES, H. ; Kon, F ; KON, R. ; FERREIRA, J. E.. Borboleta and SaguiSaúde - Open Source Mobile Telehealth for Public. Em: 8th International eHealth,Telemedicine and Health ICT Forum, p. 567-571, 2010.Qualis: Não identificado (8th International eHealth,Telemedicine and Health ICT Forum)
32. ALMEIDA, F. N. ; SILVA, P. P. S. B. ; Mendrome, A. ; SABINO, E. C. ; FERREIRA, J. E.. Aplicando Procedência de Dados para a Geração e Análise de Perfis de Doadores de Sangue. Em: XXX Congresso da Sociedade Brasileira de Computação, p. 169-176, 2010.Qualis: C
33. Garcia, M.O. ; ARAÚJO, L. V. ; Passos-Bueno, M. R ; SCHLESINGER, D. ; FERREIRA, J. E.. Indexação de Dados Semi-Estruturados para Apoio a Diagnósticos Médicos. Em: XII Congresso Brasileiro de Informática em Saúde - CBIS, 2010.Qualis: Não identificado (XII Congresso Brasileiro de Informática em Saúde - CBIS)
34. FERREIRA, J. E.; TAKAI, O. K. ; MALKOWSKI, S. ; PU, C.. Reducing Exception Handling Complexity in Business Process Modeling and Implementation: the WED-Flow Approach. Em: OTM Conferences, v. 6426, p. 150-167, 2010.Qualis: Não identificado (OTM Conferences)
35. Takecian, Pedro L. ; Ferreira, João E. ; Malkowski, Simon ; Pu, Calton. Using LOTOS for rigorous specifications of workflow patterns. Em: 6th International ICST Conference on Collaborative Computing: Networking, 2010. Qualis: Não identificado (6th International ICST Conference on Collaborative Computing: Networking)
36. WU, QINYI ; Pu, Calton ; Ferreira, Joao Eduardo. A partial persistent data structure to support consistency in real-time collaborative editing. p. 776, 2010. Qualis: Não identificado ()
37. Ferreira, João E.; WU, QINYI ; Malkowski, Simon ; Pu, Calton. Towards Flexible Event-Handling in Workflows through Data States. Em: 2010 IEEE Congress on Services (SERVICES), p. 344, 2010. Qualis: Não identificado (2010 IEEE Congress on Services (SERVICES))
38. BRAGHETTO, KELLY ROSA ; Ferreira, João Eduardo ; VINCENT, JEAN-MARC. Performance analysis modeling applied to business processes. Em: the 2010 Spring Simulation Multiconference, p. 1, 2010. Qualis: Não identificado (the 2010 Spring Simulation Multiconference)
39. CANTÃO, MAURICIO E. ; DE ARAÚJO, LUCIANO V. ; LEMOS, ELIANA G. M. ; Ferreira, João E.. Algebraic approach to optimal clone selection applied in metagenomic projects. Em: the International Symposium, p. 1, 2010. Qualis: Não identificado (the International Symposium)
40. OIKAWA, M.K. ; SILVA, P. ; MERINO, E. F. ; FERNANDEZ-BECERRA, C. ; WUNDERLICH, G. ; BARRERA, J. ; DURHAM, A. M. ; Hernando A. del Portillo ; del PORTILLO, H. ; FERREIRA, J. E.. . ClinMaldb: a clinical field-research oriented relational database to study human malaria. Em: IADIS International Conference e-Health 2009, v. 1, p. 1-9, 2009.Qualis: Não identificado (IADIS International Conference e-Health 2009)
41. CANTAO, M. ; ARAÚJO, L. V. ; LEMOS, E. G. M. ; FERREIRA, J. E.. Optimal Clone Identifier based on Dynamic Rules and Process Algebra. Em: International Conference on Bioinformatics, p. 13-16, 2009.Qualis: Não identificado (International Conference on Bioinformatics)
42. DUARTE G. L. ; DOMINGUES, H. ; Kon, F ; FERREIRA, J. E.. Heterogeneidade como solução para bancos de dados móveis em um sistema de saúde. Em: Workshop de Informática Médica, p. 2025-2034, 2009.Qualis: Não identificado (Workshop de Informática Médica)
43. DOMINGUES, H. ; Kon, F ; FERREIRA, J. E.. Replicação assíncrona em bancos de dados evolutivos. Em: Simpósio Brasileiro de Banco de Dados, 2009.Qualis: Não identificado (Simpósio Brasileiro de Banco de Dados)
44. OIKAWA, M. K. ; FERREIRA, J. E. ; MALKOWSKI, S. ; PU, C.. Towards Algorithmic Generation of Business Processes: From Business Step Dependencies to Process Algebra Expressions. Em: Business Process Management Conference, v. 1, p. 80-96, 2009.Qualis: Não identificado (Business Process Management Conference)
45. RODRIGUES, MAURICIO CHUI ; Malkowski, Simon ; Ferreira, João Eduardo. Implementing rigorous web services with process algebra. Em: the 2009 ACM symposium, p. 625, 2009. Qualis: Não identificado (the 2009 ACM symposium)
46. DE ARAÚJO, LUCIANO V. ; SANABANI, SABRI S. ; Sabino, Ester C. ; Ferreira, João E.. HIVSetSubtype. Em: the 2009 ACM symposium, p. 811, 2009. Qualis: Não identificado (the 2009 ACM symposium)
47. NARDI, A. ; NASCIMENTO, D. R. B. ; PONTES, M. R. ; SEIXAS, T. T. ; GRACAS, F. A. F. ; FERREIRA, J. E.. Um Padrão Canônico para Controle de Paralelização em Aplicações de e-Science. Em: Simposio Brasileiro de Banco de Dados, v. 1, p. 268-279, 2008.Qualis: Não identificado (Simposio Brasileiro de Banco de Dados)
48. DOMINGUES, H. ; CORREIA, R. ; Kon, F ; KON, R. ; FERREIRA, J. E.. Análise e Modelagem Conceitual de um Sistema de Prontuário Eletrônico para Centros de Saúde. In: VIII Workshop de Informática Médica. Em: VIII Workshop de Informática Médica (WIM´2008), v. 1, p. 31-40, 2008.Qualis: Não identificado (VIII Workshop de Informática Médica (WIM´2008))
49. ZULIANI, D. ; OIKAWA, M. K. ; MALKOWSKI, S. ; PEREZ-ALCAZAR, J. J. ; FERREIRA, J. E.. The RiverFish Approach to Business Process Modeling: Linking Business Steps to Control-Flow Patterns. Em: The 4th International Conference on Collaborative Computing, v. 1, p. 45-56, 2008.Qualis: Não identificado (The 4th International Conference on Collaborative Computing)
50. BRAGHETTO, K. R. ; FERREIRA, J. E. ; PU, C.. Business Processes Management using Process Algebra and Relational Database Model. Em: International Conference on e-Business, v. 1, p. 323-333, 2008.Qualis: Não identificado (International Conference on e-Business)
51. BRAGHETTO, KELLY ROSA ; Ferreira, João Eduardo ; Pu, Calton. Using process algebra to control the execution of business processes. Em: 23rd Annual ACM Symposium on Applied Computing, p. 128, 2008. Qualis: Não identificado (23rd Annual ACM Symposium on Applied Computing)
52. BROINIZI, MARCOS E. B. ; Ferreira, João Eduardo ; GOLDMAN, ALFREDO. Using annotations in the naked objects framework to explore data requirements. Em: the 2008 ACM symposium, p. 630, 2008. Qualis: Não identificado (the 2008 ACM symposium)
53. DE ARAÚJO, LUCIANO VIEIRA ; Sabino, Ester C. ; Ferreira, João Eduardo. HIV drug resistance analysis tool based on process algebra. Em: the 2008 ACM symposium, p. 1358, 2008. Qualis: Não identificado (the 2008 ACM symposium)
54. NETTO, F. S. ; FERREIRA, J. E. ; GOUVEA, M. A.. The use of Multidimensional Scaling as Applied to the BPM Performance in Brazilian e-Government Administration. Em: Database and Expert Systems Applications - DEXA, v. 1, p. 229-240, 2007.Qualis: Não identificado (Database and Expert Systems Applications - DEXA)
55. NARDI, A. ; FERREIRA, J. E.. Padrões para Controle de Fluxo e sua Execução em Grade. Em: E-Science Workshop, v. 1, p. 20-28, 2007.Qualis: Não identificado (E-Science Workshop)
56. BRAGHETTO, KELLY ROSA ; Ferreira, João Eduardo ; Pu, Calton. Using control-flow patterns for specifying business processes in cooperative environments. Em: The 22nd Annual ACM Symposium on Applied Computing, p. 1234, 2007. Qualis: Não identificado (The 22nd Annual ACM Symposium on Applied Computing)
57. NETTO, F. S. ; GOUVEA, M. A. ; FERREIRA, J. E.. Normative Attributes in Business Process Management Performance. Em: 18th Annual Conference of the POMS, v. 1, p. 20-30, 2007.Qualis: Não identificado (18th Annual Conference of the POMS)
58. NETTO, F. S. ; GOUVEA, M. A. ; FERREIRA, J. E.. Avaliação de Desempenho de BPM na Administração Pública Brasileira com o Uso de Análise Multivariada. Em: XXX ENANPAD - Encontro Nacional da ANPAD - Brasil, v. 1, p. 231-240, 2006.Qualis: Não identificado (XXX ENANPAD - Encontro Nacional da ANPAD - Brasil)
59. GOUVEA, M. A. ; NETTO, F. S. ; FERREIRA, J. E.. Evaluation of BPM in the context of a National Support Program for the State Exchequer. In: 17th Annual World Conference on Production and Operations Management, POM´S, 2006, Boston. 17th Annual World Conference on Production and Operations Management, POM´S. Boston:. Em: OM in the New World Uncertainties, v. 1, p. 107-118, 2006.Qualis: Não identificado (OM in the New World Uncertainties)
60. FERREIRA, JOAO; TAKAI, OSVALDO ; BRAGHETTO, KELLY ; Pu, Calton. Large Scale Order Processing through Navigation Plan Concept. Em: IEEE International Conference on Services Computing (SCC 2006), p. 297, 2006. Qualis: Não identificado (IEEE International Conference on Services Computing (SCC 2006))
61. FERREIRA, J.E.; TAKAI, O.K. ; PU, C.. Integration of Collaborative Information System in Internet Applications using RiverFish Architecture. Em: 2005 International Conference on Collaborative Computing: Networking, p. 1, 2005. Qualis: Não identificado (2005 International Conference on Collaborative Computing: Networking)
62. GONCALVES, B.M.M.T. ; ITALIANO, I.C. ; FERREIRA, J.E.. Data Updating Between the Operational and Analytical Databases Through DW-Log Algorithm. Em: International Database Engineering & Application Symposium (IDEAS'05), p. 77, 2005. Qualis: C (IDEAS)
63. FERREIRA, J.E.; TAKAI, O.K. ; PU, C.. Integration of Business Processes with Autonomous Information Systems: A Case Study in Government Services. Em: Seventh IEEE International Conference on ECommerce Technology (CEC'05), p. 471, 2005. Qualis: Não identificado (Seventh IEEE International Conference on ECommerce Technology (CEC'05))
64. FERREIRA, J. E.; ZULIANI, D. ; NETTO, F. S.. The unified interface for the government business registration through unified model. Em: 1st. International Conference on Information Systems and Technology Management. Local: FEA/USP, p. 14-23, 2004.Qualis: Não identificado (1st. International Conference on Information Systems and Technology Management. Local: FEA/USP)
65. NETTO, F. S. ; ZULIANI, D. ; FERREIRA, J. E.. O Processo Unificado de Cadastramento de Empresas: um estudo de caso. Em: CONIP-2004 SUCESU-SP e IDETI, p. 1-10, 2004.Qualis: Não identificado (CONIP-2004 SUCESU-SP e IDETI)
66. GIL, M. ; FERREIRA, J. E. ; GONCALVES, B. M. T. ; GONZALES, C. J. ; MEDINA, A. G.. O uso de Banco de Dados na disponibilização Digital de Informações para Portadores de Deficiências. Em: Fórum de Informática Aplicada a Pessoas Portadoras de Necessidades Especiais, v. 1, p. 143-152, 2003.Qualis: Não identificado (Fórum de Informática Aplicada a Pessoas Portadoras de Necessidades Especiais)
67. ITALIANO, I.C. ; FERREIRA, J.E.. A hybrid model for data synchronism in data warehouse projects. Em: International Database Engineering and Applications Symposium, v. `, p. 12, 2003. Qualis: Não identificado (International Database Engineering and Applications Symposium)
68. ARMELIN, H. H. ; BARRERA, J. ; FERREIRA, J. E. ; GUBITOSO, M. D.. A simulator for gene expression networks In: SPIE Microarrays: Optical Technologies and Informatics. Em: SPIE Microarrays: Optical Technologies and informatics, v. 1, p. 245-254, 2001.Qualis: Não identificado (SPIE Microarrays: Optical Technologies and informatics)
Resumos expandidos publicados em anais de congressos (11)
1. D. FILHO, EDUARDO ; PADILHA, BRUNO ; Ferreira, João E.. Compiladores para as Linguagens da Abordagem WED-flow. Em: Anais Estendidos do Simpósio Brasileiro de Banco de Dados, 2021, Brasil. Anais Estendidos do XXXVI Simpósio Brasileiro de Banco de Dados (SBBD Estendido 2021), p. 75, 2021. Qualis: Não identificado (ANAIS ESTENDIDOS DO SIMPÓSIO BRASILEIRO DE BANCO DE DADOS, 2021, BRASIL. ANAIS ESTENDIDOS DO XXXVI SIMPÓSIO BRASILEIRO DE BANCO DE DADOS)
2. BOROVINA JOSKO, J. M. ; FERREIRA, J. E.. Vis4DD: A visualization system that supports Data Quality Visual Assessment. Em: 32nd Brazilian Symposium on Databases, 2017, Uberlândia. Demos and Applications Session. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação, v. 1, p. 46-51, 2017. Qualis: Não identificado (32ND BRAZILIAN SYMPOSIUM ON DATABASES, 2017, UBERLÂNDIA. DEMOS AND APPLICATIONS SESSION. PORTO ALEGRE: SOCIEDADE BRASILEIRA DE COMPUTAÇÃO)
3. SILVA, P. P. S. B. ; BRAGHETTO, K. R. ; FERREIRA, J. E.. Uma abordagem ad hoc para o tratamento de exceções em processos transacionais. Em: Simpósio Brasileiro de Bancos de Dados, 2012, São Paulo. Proceedings of the 27th Brazilian Symposium on Databases - Short Papers. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação, v. 1, p. 153-160, 2012. Qualis: Não identificado (SIMPÓSIO BRASILEIRO DE BANCOS DE DADOS, 2012, SÃO PAULO. PROCEEDINGS OF THE 27TH BRAZILIAN SYMPOSIUM ON DATABASES - SHORT PAPERS. PORTO ALEGRE: SOCIEDADE BRASILEIRA DE COMPUTAÇÃO)
4. Garcia, M.O. ; SILVA, P. P. S. B. ; BRAGHETTO, K. R. ; FERREIRA, J. E.. WED-tool: uma ferramenta para o controle de execução de processos de negócio transacionais. Em: Simpósio Brasileiro de Bancos de Dados, 2012, São Paulo. Proceedings of the 27th Brazilian Symposium on Databases - Demos and Applications. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação, v. 1, p. 19-24, 2012. Qualis: Não identificado (SIMPÓSIO BRASILEIRO DE BANCOS DE DADOS, 2012, SÃO PAULO. PROCEEDINGS OF THE 27TH BRAZILIAN SYMPOSIUM ON DATABASES - DEMOS AND APPLICATIONS. PORTO ALEGRE: SOCIEDADE BRASILEIRA DE COMPUTAÇÃO)
5. TAKECIAN, P. L. ; FERREIRA, J. E.. Methodological Guidelines and Adaptive Statistical Data Validation to Build Effective DataWarehouses. Em: Simpósio Brasileiro de Bancos de Dados, 2012, São Paulo. Proceedings of the 27th Brazilian Symposium on Databases - Thesis and Dissertation Workshop. Sâo Paulo: Sociedade Brasileira de Computação, v. 1, p. 61-68, 2012. Qualis: Não identificado (SIMPÓSIO BRASILEIRO DE BANCOS DE DADOS, 2012, SÃO PAULO. PROCEEDINGS OF THE 27TH BRAZILIAN SYMPOSIUM ON DATABASES - THESIS AND DISSERTATION WORKSHOP. SÂO PAULO: SOCIEDADE BRASILEIRA DE COMPUTAÇÃO)
6. CORREIA, R. ; Kon, F ; FERREIRA, J. E.. Um Sistema de Software Livre para Gerenciamento de Centros de Saúde. Em: Anais do III Simpósio de Iniciação Científica e Pós-Graduação do IME-USP, 2008, Sao Paulo. Anais do III Simpósio de Iniciação Científica e Pós-Graduação do IME-USP, v. 1, 2008. Qualis: Não identificado (ANAIS DO III SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DO IME-USP, 2008, SAO PAULO. ANAIS DO III SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DO IME-USP)
7. ARAÚJO, L. V. ; TANURI, A. ; SABINO, E. C. ; DIAZ, R. S. ; BRINDEIRO, R. M. ; FERREIRA, J. E.. Bioinformatic tools for HIV-1 sequences analyses developed for the Brazilian STD/AIDS programme network for genotype testing. Em: XV International AIDS Conference, 2004, BangKok, Thailand 11-16 July 2. In anais XV International AIDS Conference , BangKok, Thailand 11-16 July 2004. BangKok, Thailand 11-16 July 2: In anais XV International AIDS Conference, p. 14-15, 2004. Qualis: Não identificado (XV INTERNATIONAL AIDS CONFERENCE, 2004, BANGKOK, THAILAND 11-16 JULY 2. IN ANAIS XV INTERNATIONAL AIDS CONFERENCE , BANGKOK, THAILAND 11-16 JULY 2004. BANGKOK, THAILAND 11-16 JULY 2: IN ANAIS XV INTERNATIONAL AIDS CONFERENCE)
8. GONCALVES, B. M. T. ; SABINO, E. C. ; ARAÚJO, L. V. ; FERREIRA, J. E.. Data Warehouse Development for the Brazilian STD/AIDS Programme. Em: In anais XV International AIDS Conference, 2004, BangKok, Thailand 11-16 July 2. In anais XV International AIDS Conference. BangKok, Thailand 11-16 July 2: XV International AIDS Conference, p. 15-18, 2004. Qualis: Não identificado (IN ANAIS XV INTERNATIONAL AIDS CONFERENCE, 2004, BANGKOK, THAILAND 11-16 JULY 2. IN ANAIS XV INTERNATIONAL AIDS CONFERENCE. BANGKOK, THAILAND 11-16 JULY 2: XV INTERNATIONAL AIDS CONFERENCE)
9. OIKAWA, M. K. ; FERREIRA, J. E.. Heterogeneous database integration to support data mining. Em: The International Conference on Bioinformatics 2002, 2002, Bangkok, Thailand. Incob 2002. bangkok, Thailand: Incob 2002, v. 1, p. 88-94, 2002. Qualis: Não identificado (THE INTERNATIONAL CONFERENCE ON BIOINFORMATICS 2002, 2002, BANGKOK, THAILAND. INCOB 2002. BANGKOK, THAILAND: INCOB 2002)
10. ARAÚJO, L. V. ; FERREIRA, J. E.. Cache semântico para computação sem fio baseado na abstração de composição de dados. Em: I Workshop SIDAM, 2000, São Paulo. I Workshop SIDAM, 2000. Qualis: Não identificado (I WORKSHOP SIDAM, 2000, SÃO PAULO. I WORKSHOP SIDAM)
11. SOUZA, M. C. ; FERREIRA, J. E.. Integração assíncrona de instâncias de base de dados em esquemas homogêneos. Em: I Workshop SIDAM, 2000, São Paulo. I Workshop SIDAM, 2000. Qualis: Não identificado (I WORKSHOP SIDAM, 2000, SÃO PAULO. I WORKSHOP SIDAM)
Resumos publicados em anais de congressos (0)
Artigos aceitos para publicação (0)
Apresentações de trabalho (14)
1. LIMA, R. A. ; PU, C. ; TAKECIAN, P. L. ; KAMAURA, L. T. ; PADILHA, BRUNO ; FERREIRA, J.E.. Modeling Time-Critical Processes with WED-flow. 2018. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
2. Chui, M. ; FERREIRA, J. E. ; PU, C.. Web Services Composition through Data Events Approach. 2013. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
3. Ferreira, Joao Eduardo. Transactional Recovery Support for Robust Exception Handling in Business Process Services. 2012. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
4. Ferreira, Joao Eduardo. Transaction Processing for e-Science Applications. 2012. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
5. Ferreira, Joao Eduardo. Fourth International Workshop on Scientific Workflows. 2010. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
6. Ferreira, Joao Eduardo. Reducing Exception Handling Complexity in Business Process Modeling and Implementation: the WED-Flow Approach. 2010. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
7. OIKAWA, M. K. ; FERREIRA, J. E. ; MALKOWSKI, S. ; PU, C.. Towards Algorithmic Generation of Business Processes: From Business Step Dependencies to Process Algebra Expressions. 2009. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
8. DOMINGUES, H. ; Kon, F ; FERREIRA, J. E.. Banco de dados evolutivos e metodos ageis. 2008. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
9. FERREIRA, J. E. The RiverFish Approach to Business Process Modeling: Linking Business Steps to Control-Flow Patterns. 2008. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
10. FERREIRA, J. E. The use of Multidimensional Scaling as Applied to the BPM Performance in Brazilian e-Government Administration. 2007. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
11. FERREIRA, J. E. Using Control-Flow Patterns for Specifying Business Processes in Cooperative Environments. 2007. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
12. FERREIRA, J. E. Integration of Business Processes with Autonomous Information Systems: A Case Study. 2005. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
13. FERREIRA, J. E. Data Updating Between the Operational and Analytical Databases Through DW-Log Algorithm. 2005. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
14. FERREIRA, J. E. Mini-curso SBBD 2004: Naked Objects. 2004. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
Demais tipos de produção bibliográfica (4)
1. CARLOTTI, D. ; NUNES, F. L. S. ; FERREIRA, J.E.. Relational data model and programs to use and view data from the FAPESP COVID-19 Data Sharing/BR repository. Repositório de Dados Científicos da USP. 2020. Repositório de Dados Cientíticos
2. MELLO, L. E. ; SUMAN, A. ; MEDEIROS, C. B. ; PRADO, C. ; RIZZATTI, E. ; NUNES, F. L. S. ; BARNABE, G. ; FERREIRA, J. E. ; SA, J. ; REIS, L. F. ; RIZZO, L. V. ; SARNO, L. ; LAMONICA, R. ; MACIEL, R. M. B. ; CESAR JR, R. M. ; CARVALHO, R.. Opening Brazilian COVID-19 patient data to support world research on pandemics. Zenodo. 2020. Open access
3. FERREIRA, J. E.; TAKAI, O. K.. PROJETO E MODELAGEM DE BANCO DE DADOS - revisão técnica. Rio de Janeiro: Editora Campus/Elsevier. 2006. Tradução/Livro
4. TAKAI, O. K. ; FERREIRA, J. E.. Naked Objects. 2004. Tradução/Livro

Produção técnica

Programas de computador com registro (0)
Programas de computador sem registro (7)
1. FERREIRA, J. E.; DUARTE G. L. ; LIMA, A. M. ; KAMAURA, L. T. ; MULLER, R. ; CINTHO, M.. DIDB - Diagnostics Interview Database. 2011.
2. ARAÚJO, L. V. ; FERREIRA, J. E. ; Ortega, M. CEGH System: GENETIC TESTING MANAGEMENT IN HUMAN GENOME INFORMATION SYSTEMS. 2010.
3. ARAÚJO, L. V. ; FERREIRA, J. E. ; SABINO, E. C. . HIV Dag. 2010.
4. FERREIRA, J. E.; KAMAURA, L. T. ; MULLER, R. ; COLLI, E. . Colmeia. 2010.
5. FERREIRA, J. E.; OIKAWA, M. K. ; DURHAM, A. M. ; PORTILLO,, H. A. . ClinMalDB. 2006.
6. FERREIRA, J. E.; ARAÚJO, L. V. ; SABINO, E. C. ; ULIANA, R. ; DADARIO, A. . DBCollHIV. 2005.
7. FERREIRA, J. E. Posto Fiscal Eletrônico. 2001.
Produtos tecnológicos (0)
Processos ou técnicas (0)
Trabalhos técnicos (3)
1. BARRERA, J. ; FERREIRA, J. E. ; GUBITOSO, M. D. ; CESAR JUNIOR, R. M.. An Integrated environment for Storage and Analysis of Genetic. 2001.
2. ITALIANO, I. ; FERREIRA, J. E. ; TAKAI, O. K.. Aspectos Conceituais em Data Warehouse. 2001.
3. FERREIRA, J. E.; NETTO, F. S. ; ZULIANI, D.. Arquitetura do Sistema de Informação para os Serviços Eletrônicos da Secretaria da Fazenda do Estado de São Paulo. 2000.
Demais tipos de produção técnica (0)

Produção artística

Total de produção artística (0)

Orientações em andamento

Supervisão de pós-doutorado (2)
1. Pedro Losco. . Universidade de São Paulo, Tribunal de Justiça de São Paulo.. Início: 2020.
  Supervisor: João Eduardo Ferreira.
2. Danilo Carlotti. . Universidade de São Paulo, Tribunal de Justiça de São Paulo.. Início: 2020.
  Supervisor: João Eduardo Ferreira.
Tese de doutorado (2)
1. Rodrigo Alves Lima. Systematic Construction, Execution, and Reproduction of Complex Performance Benchmarks. Tese (Doutorado em Graduate in Computer Science) - Georgia Institute of Technology, Georgia Tech. (Coorientador).. Início: 2019.
  Supervisor: João Eduardo Ferreira.
2. Bruno Padilha. Computational Framework for Complex Events Detection and Handling in Automated Video Analysis. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, Fundação de Apoio à Universidade de São Paulo. Início: 2018.
  Orientador: João Eduardo Ferreira.
Dissertação de mestrado (6)
1. Marcelo Henrique de Paula dos Santos. Bancos de dados e aprendizado de máquina. Dissertação (Mestrado profissional em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2021.
  Orientador: João Eduardo Ferreira.
2. Lucas Nunes Sequeira. Identificação de comportamentos complexos. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2021.
  Orientador: João Eduardo Ferreira.
3. Kouao Jean Vincent Mea. Identificação de eventos complexos. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2020.
  Orientador: João Eduardo Ferreira.
4. Vitor Antonio Costa Zaninotto. Modelo transacional para tratamento de eventos complexos. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2020.
  Orientador: João Eduardo Ferreira.
5. Edinilza E. da S. Nardi. Limites da abordagem da Análise Retrospectiva. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Início: 2019.
  Orientador: João Eduardo Ferreira.
6. Gabriel Torres G. Pato. Análise de mutações e suas correlações com fenótipos. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2017.
  Orientador: João Eduardo Ferreira.
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (0)

Supervisões e orientações concluídas

Supervisão de pós-doutorado (3)
1. Daison Manuel Yancy Caballero. . Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2017.
  Supervisor: João Eduardo Ferreira.
2. Marcelo Ris. . Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2016.
  Supervisor: João Eduardo Ferreira.
3. Helves Humberto Domingues. . Universidade de São Paulo, NIH-USA Fundacao Pro-Sangue. 2012.
  Supervisor: João Eduardo Ferreira.
Tese de doutorado (15)

MINA CINTHO OZAHATA. Mineração de dados de anemia falciforme e priapismo. Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2019.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
André Luis Schwerz. Sistemas de informação cientes de processos, robustos e confiáveis. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2016.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Rafael Liberato Roberto. Aumentando a migração de instâncias não complacentes em sistemas de informação cientes de processos. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2016.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
João Marcelo Borovina Josko. João Marcelo Borovina Josko. Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2016.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Marcos E. B. Broinizi. Ordenação evolutiva de anúncios em publicidade computacional.. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, . 2015.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Milton Y. Nishiyama Jr. Desenvolvimento da Plataforma CaneRegNet para Anotação Funcional e Análise do Transcriptoma da Cana-de-Açucar. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2015.
Supervisor: João Eduardo Ferreira.
Pedro Losco Takecian. Diretrizes metodológicas e validação estatística de dados para a construção de data warehouses. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, NIH-USA Fundacao Pro-Sangue. 2014.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Fernanda Nascimento Almeida. Descrição da proveniência de dados para extração de conhecimento em sistemas de informação de hemoterapia. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2012.
Supervisor: João Eduardo Ferreira.
Kelly Rosa Braghetto. Técnicas de Modelagem para a Análise de Desempenho de Processos de Negócio. Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2011.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Helves Humberto Domingues. Replicação assíncrona em bancos de dados evolutivos. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2010.
Supervisor: João Eduardo Ferreira.
Alexandre Ricardo Nardi. Uma arquitetura de baixo acoplamento para execução de padrões de controle de fluxo em grades. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, . 2009.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Maurício Egidio Cantão. Abordagem algébrica para seleção de clones ótimos em projetos genomas e metagenomas. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2009.
Supervisor: João Eduardo Ferreira.
Márcio Katsumi Oikawa. Geração de expressões algébricas para processos de negócio usando reduções de digrafos série-paralelo. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, NIH-USA Fundacao Pro-Sangue. 2008.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Luciano Vieira de Araújo. Sistema colaborativo para armazenamento e análise de dados de HIV. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, NIH-USA Fundacao Pro-Sangue. 2008.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Francisco Sobreira Netto. Medição de desempenho do gerenciamento de processos de negócio -BPM no PNAFE: uma proposta de modelo. Tese (Doutorado em Administração) - Universidade de São Paulo, . 2006.
Supervisor: João Eduardo Ferreira.
Dissertação de mestrado (33)

Eduardo Dias Filho. Compiladores para as Linguagens da Abordagem WED-flow. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . 2021.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Rodrigo Müller de Carvalho. Monitoramento do ambiente de execução de processos WED-Flow. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . 2019.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Bruno Padilha. WED-SQL: uma linguagem declarativa intermediáriacom apoio transacional para a modelagem e implementação de Sistemas de Informação Cientes de Processos. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, National Institutes of Health. 2018.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Marino Hilario Catarino. Integrando banco de dados relacional e orientado a grafos para otimizar consultas com alto grau de indireção. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . 2017.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Rafael Germano Rossi. Análise de Componentes Principais em Data Warehouses. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . 2017.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Rodrigo Alves Lima. Modeling of Time WED-flow. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2017.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Ester Risério Matos Bertoldi. Estabelecimento de sistema de armazenamento e recuperação de dados vinculado a projeto de identificação de marcadores moleculares no câncer de pâncreas utilizando sequenciamento de nova geração. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2017.
Orientadores: João Eduardo Ferreira, Eduardo Moraes Rego Reis.
Ester Risério Matos Bertoldi. Modelagem e implementação de banco de dados clínicos e moleculares de pacientes com câncer e seu uso para identificação de marcadores em câncer de pâncreas. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2017.
Supervisor: João Eduardo Ferreira.
André Casimiro. Principais variáveis na ordenação de anúncios. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . 2016.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Marcela Ortega. Implementação do arcabouço WED-ﬂow para controle de processos transacionais. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, NIH-USA Fundacao Pro-Sangue. 2013.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Pedro P. de S. B. da Silva. Uma abordagem transacional para o tratamento de exceções em processos de negócio. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2013.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Gustavo Luiz Duarte. Metadados para reconciliação de transações em bancos de dados autônomos. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2012.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Mauricio Chui Rodrigues. Tratamento de Eventos Aplicado à Composição de Serviços We. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . 2012.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Elisa Pereira Kameda. Redução de dimensionalidade em modelos de bancos de dados multidimensionais. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . 2010.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Mina Cintho. Framework para classificação das mutações de HIV. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2010.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Guilherme Tozo de Carvalho. Aplicação de práticas ágeis na construção de data warehouse evolutivo. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . 2009.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Pedro Losco Takecian. ACP e LOTOS: um estudo comparativo baseado em conceitos de BPEL e padrões de controle de fluxo. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, National Institutes of Health. 2008.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Grace Anne Pontes Borges. Fluxo de dados em redes de Petri coloridas e em grafos orientados a atores. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . 2008.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Gustavo Bianchi Maia. Ferramenta para integração de banco de dados multidimensionais e softwares de visualização de séries temporais. Dissertação (Mestrado em Pós graduação Computação) - Instituto de Matemática e Estatística, . 2007.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Kelly Rosa Braghetto. CONTROLE DE PADRÕES DE FLUXOS DE PROCESSOS EM BANCOS DE DADOS RELACIONAIS. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2006.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Devanir Zuliani. Projeto Conceitual de Workflow. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Software) - Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo, . 2006.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Marcos Eduardo Bolelli Broinizi. Validacao Agil e Precisa de Projetos Conceituais de Banco de Dados. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2006.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
RICARDO DA SILVA CARVALHEIRO. Integração de estruturas de endereçamento para viabilizar a automatização do georreferenciamento de cadastros: Um estudo de caso. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo, . 2006.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Julio Cesar Mila. Utilização de ontologias na especificacao de processos e regras de negocio. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo, . 2005.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Gustavo Tadao Okida. Índices para consultas por conteúdo em bancos de dados heterogêneos. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . 2004.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Marcio Katsumi Oikawa. Integracao para dados e aplicacoes em biologia molecular computacional. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2003.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Marcelo Camacho de Souza. Componente de controle transacional para integracao assincrona de bases de dados. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . 2003.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Elcio Yukio Nanba. Escalonamento de tarefas em clusters de servidores SMP heterogeneos para aplicacoes de biologia molecular. Dissertação (Mestrado em Engenharia Elétrica) - Universidade de São Paulo, . 2003.
Supervisor: João Eduardo Ferreira.
Isabel Italiano. Um Modelo hibrido para atualizacao de dados em projetos de data warehouse. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . 2002.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Bianka M. M. Teixeira Goncalves. Alternativas para propagacao das atualizacoes de um banco de dados operacional para um data warehouse. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . 2002.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Luciano Vieira de Araujo. CCICLO: Componente para cruzamento e integracao de objetos classificados. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . 2002.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
LEONARDO AUGUSTO TANIGUTI MANTOVANI. Uma alternativa para Simplificação de Sincronismo de Dados Temporais entre Ambientes Operacionais e Analíticos. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo, . 2001.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
CARLOS HENRIQUE MAIA BRAGA. Meta Modelo para Controle Corporativo de Estratégia de Replicação de Dados. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . 2001.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (5)

Mina Cintho. Classificação das mutações de vírus HIV. (Graduando em Bacharelado em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo, NIH-USA Fundacao Pro-Sangue. 2010.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Marcela Ortega. Indexação de Dados Semi-estruturados para o Sistema de Informação CEGH. (Graduando em Bacharelado em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo, NIH-USA Fundacao Pro-Sangue. 2009.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Pedro Paulo de Souza Bento da Silva. Atualização Incremental de Data Warehouses. (Graduando em Bacharelado em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo, NIH-USA Fundacao Pro-Sangue. 2009.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Mauricio Chui Rodrigues. Encapsulando a NavigationPlanTool como Serviços Web. (Graduando em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2007.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Marcos Eduardo Bolelli Broinzi. Genflow: um ambiente para integração de dados e processos em aplicações de bioinformática. Iniciação Científica - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2003.
Orientador: João Eduardo Ferreira.
Orientações de outra natureza (0)

Projetos de pesquisa

Total de projetos de pesquisa (15)

2021-Atual. Center for Research and Development on Live Knowledge
Descrição: With hundreds of millions of video cameras in several cities around the world, human operators remain the main users of video data whose volume is growing explosively. This situation must change so that automated monitoring of live video in open spaces can become a cornerstone of operational planning for public security, intelligent transport and epidemiological surveillance. Despite the success in closed environments, such as airports and shopping malls (for example, in face recognition), the automated recognition of events in open spaces remains a major, important and urgent research and technological development challenge. The technical and fundamental difficulty arises in view of the occurrence of unprecedented events in open environments, exceeding the knowledge of the Machine Learning (ML) classifiers, trained and tested in fixed data sets, such as CIFAR (Canadian Institute for Advanced Research). Specifically, new entities and events, which appear as outliers, are generally considered noise by these classifiers. A tragic example of this limitation was the accident caused by Uber's automatic driving system (Arizona, 2018), when a pedestrian walking with a bicycle was fatally run over. The press described the cause of the accident as: "Uber software does not recognize human beings outside pedestrian crossings". This proposal describes the project called Automated Intelligent Monitoring System (AIMS), which aims to develop research, effective technologies and human resources training for real-time monitoring of live video, based on the premise of Evidence Based Knowledge Acquisition (EBKA).. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (12) . Integrantes: João Eduardo Ferreira - Coordenador. Financiador(es): (FAPESP) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: João Eduardo Ferreira.
2016-2020. Storage, Modeling and Analysis of Dynamical Systems for e-Science Applications.
Descrição: The astonishing fast rate of technology evolution has given rise to a new era of scientific knowledge discovery. This new age of science, known as e-Science, is described as the new great computational and multidisciplinary team science requiring novel methodologies for data storage, modeling and analysis. In particular, the development of transactional and analytical software systems for e-Science applications when viewed from a dynamic systems perspective, presents a number of new computational challenges. Among them are the scientific knowledge discovery processes, which involve frequent changes of requirements for data storage, modeling and analysis. The need to address scientific dynamic systems in order to cope with complex applications of e-Science has woken up the scientific community for the development of robust and evolutionary software systems to meet these new challenges. Dynamical system is the classical mathematical formalism to represent phenomena that evolute with time, which are of great interest in science. In this project, our main goal is to develop computational models and methodologies to support e-Science applications viewed as dynamic systems. Our fundamental research covers three key research areas, namely storage, modeling, and analysis of dynamic systems. These research areas are significant and relevant to the FAPESP e-Science Program since many of the present e-Science challenges are related to the proper treatment of dynamic systems. Hence, we plan to develop and apply computational methodologies that will ease the development of e-Science applications, thereby contributing to the improvement of worldwide scientific knowledge, while respecting legal and ethical restrictions in data management.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (2) . Integrantes: João Eduardo Ferreira - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: João Eduardo Ferreira.
2015-2019. The use of modern autopsy techniques to investigate human diseases
Descrição: Ao longo de toda a história, desde os primeiros estudos anatômicos conhecidos na Idade Média até o uso de modernas técnicas moleculares para o estudo de processos fisiopatológicos, a autópsia mostrou ser um processo importante e fonte de muito material para o avanço do conhecimento científico. Apesar do surgimento de um amplo conjunto de técnicas de imagem vários estudos têm demonstrado que a autópsia continua a ser crucial para a avaliação integrada do processo de doença, a avaliação de novas patologias e controle de qualidade do serviço médico. Neste projeto objetiva-se empregar novas técnicas apoiada pelos serviços computacionais tanto para controle operacional como análise de dados.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (2) . Integrantes: João Eduardo Ferreira - Integrante / Paulo Hilário Nascimento Saldiva - Coordenador / Antonio Carlos Pedroso de Lima - Integrante / Julio da Motta Singer - Integrante. Financiador(es): (FAPESP) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: João Eduardo Ferreira.
2015-2017. Detecção de Multieventos em Fontes de Dados Ativas e Altamente Heterogêneas
Descrição: A Internet tem tratado várias fontes de dados ativas e altamente heterogêneas permitindo novas aplicações e acesso a informações valiosas. Duas dimensões da heterogeneidade têm dificultado o acesso pleno e crescente de novas informações. A primeira dimensão é a enorme variedade de fontes de dados e conteúdo incluindo seu formato e estrutura. A segunda dimensão é o crescimento exponencial das fontes de dados ativas e inteligentes, como smartphones, que geram muitos tipos de dados com mais de 20 sensores físicos e com enorme variedade nas mídias sociais. Assim, propomos uma pesquisa para a integração de fontes de dados ativas e altamente heterogêneas para detectar multieventos. Multieventos são sequências de eventos que terminam em um evento principal. Exemplos de multieventos incluem desastres naturais, tais como desliza-mentos de terra e desastres nucleares. Primeiro, vamos construir ferramentas de software para apoiar dois tipos de alta heterogeneidade: fontes mutáveis e muitas fontes de multimídia não-estruturadas incluindo mídia social em línguas estrangeiras. Em seguida vamos utilizar esses conceitos e ferramentas em aplicações para mostrar sua viabilidade e avaliar a sua eficácia.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . Integrantes: João Eduardo Ferreira - Coordenador / Calton Pu - Integrante. Financiador(es): CAPES - Centro Anhanguera de Promoção e Educação Social - Auxílio financeiro.
Membro: João Eduardo Ferreira.
2014-Atual. Retrovirus Epidemiology Donor Study - REDS III, REDS IV
Descrição: Descrição: Há 15 anos os National Institute of Health nos Estados Unidos financia um grupo de seis bancos de sangue nos EUA denominado REDS (Retrovirus Epidemiology Donor Study) que desenvolvem pesquisas relacionadas à segurança transfusional. Em 2005, uma concorrência para que outros países submetessem projetos de pesquisa para fazerem parte desta rede. Com base no mérito do trabalho, foram escolhidos o Brasil e a China para participarem desta nova etapa, que se chama REDS Internacional O projeto terá duração de 4 anos e serão aplicados cerca de US 3 milhões na proposta brasileira. Três hemocentro brasileiros (Fundação Pró-Sangue/ Hemocentro de São Paulo, Hemominas, e HEMOPE) submeteram um proposta juntamente com o Blood Systems Research Institute (BSRI) em São Francisco. Este projeto também terá a participação do Departamento de Ciência da Computação do IME/USP e do Depto. de Medicina Preventiva e Social da UFMG. O projeto será liderado pela Dra Ester C Sabino da Fundação Pró-Sangue e terá a participação dos seguintes pesquisadores do Brasil: Anna Barbara F. Carneiro-Proietti- Fundação Hemominas Divaldo Sampaio - HEMOPE Thelma Gonzalez - Fundação Pró-Sangue Hemocentro de São Paulo Fernando A Proietti - Depto. de Medicina Preventiva e Social da Universidade Federal de Minas Gerais João Eduardo Ferreira - Departamento de Ciência da Computação do Instituto de Matemática e Estatística da Universidade de São Paulo. O principal objetivo do estudo é obter informações que possam reverter na melhoria da segurança transfusional. O projeto prevê o desenvolvimento de um banco de dados que auxilie os hemocentros a analisar os dados guardados por seu sistema operacional. Serão desenvolvidos 3 projetos de pesquisa: a) Risco residual de transmissão de HIV b) Estudo epidemiológico epidemiológico relacionado à validade das perguntas usadas na triagem de doadores. c) Historia Natural da doença de Chagas, com História natural da doença de Chagas.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . Integrantes: João Eduardo Ferreira - Coordenador / Pedro Paulo de Souza Bento da Silva - Integrante / Pedro L. Takecian - Integrante. Financiador(es): National Institure of Health- USA - Cooperação.
Membro: João Eduardo Ferreira.
2012-2017. Núcleo e-Science de Apoio a Pesquisa da Universidade de São Paulo
Descrição: Projeto financiado pela Pró-Reitoria de Pesquisa da Universidade de Sáo Paulo. vigência 30/06/2012 a 30/05/2016. Coordenador Geral: Roberto Marcondes Cesar Jr.. Coordenador da área de Banco de Dados: João Eduardo Ferreira.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . Integrantes: João Eduardo Ferreira - Integrante / Marcelo Camacho Souza - Integrante / Roberto Marcondes Cesar Junior - Coordenador / Mina Cintho - Integrante / João Marcelo Borovina Josko - Integrante. Financiador(es): Universidade de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: João Eduardo Ferreira.
2012-2016. Modelos e métodos de e-Science para ciências da vida e agrárias
Descrição: Este projeto visa a criação de uma rede colaborativa de eScience para acelerar pesquisa avançada em ciências da vida (biologia, medicina, oceanografia) e ciências agrárias. Está estruturado em tomo de cinco linhas de pesquisa - biologia de sistemas, planejamento de safras, computação visual, modelagem matemática e bancos de dados. Vigência: 01 de fevereiro de 2012 - 31 de janeiro de 2016. Coordenador Geral Roberto Marcondes Cesar Jr.. Coordenador da área de Banco de Dados: João Eduardo Ferreira.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . Integrantes: João Eduardo Ferreira - Integrante / Marcelo Camacho Souza - Integrante / Roberto Marcondes Cesar Junior - Coordenador / João Marcelo Borovina Josko - Integrante.
Membro: João Eduardo Ferreira.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: André Fujita - Integrante / Roberto Marcondes Cesar Jr. - Coordenador.
Membro: André Fujita.
2012-2014. Transactional Model and Performance Analysis for Business Processes and e-Science Applications.
Descrição: In modern science and business process studies the main challenge is not anymore in data acquisition but mainly in data processing, analysis, storage and transfer. To treat these challenges, workow and business process systems have received increased attention from research and industry communities. Despite of the signicant eorts and software tools developed, the workows and business processes still oer a scenario with several research challenges, mainly related to the scalability and reliability of their execution in the new collaborative and high-performance computing platforms. In this pro ject, we are focusing in two important issues (called axes) belonging to this scenario: transaction processing and prediction of performance related to dierent phases of the workow life cycle. The rst axis is related to transaction processing aiming to grant a exible and reliable environment for the modeling and execution of workows. The second research axis is related to prediction of performance of workows by means of formal modeling, in order to support a better provisioning of resources and a better scheduling of tasks in such type of applications. To validate the results obtained in these two research axes, we will use two real-world case studies that are important examples of both workows and e-Science applications. In addition to the academic results provided in this project, we also hope to increase the research capability of the DATA group through two important research axes and also the validation of academic results based on two important case studies.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (2) . Integrantes: João Eduardo Ferreira - Coordenador / Luciano V Araújo - Integrante / Marcio Katsumi Oikawa - Integrante / Osvaldo Kotaro Takai - Integrante / Kelly Rosa Braghetto - Integrante / Pedro Paulo de Souza Bento da Silva - Integrante / André Luis schwerz - Integrante / Marcela Ortega Garcia - Integrante / Rafael Liberato - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: João Eduardo Ferreira.
2012-Atual. Sao Paulo- Minas Gerais Neglected Tropical Disease Research Center for Biomarker Discovery
Descrição: Chagas disease remains one of the most neglected diseases in the world, with recent estimates indicating 8-10 million infected people in Latin and Central America and only one marginally effective therapeutic. The lack of good biomarkers for active infection or clinical end-points poses a problem both for individual patient prognosis and for assessing the performance of new drugs or therapeutic interventions. In this project the main computer challenge is the development of database system in order to integrate data clinical and data tests from patients.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . Integrantes: João Eduardo Ferreira - Integrante / Ester C. Sabino - Coordenador / Osvaldo Kotaro Takai - Integrante / Helves Domingues - Integrante / Leonardo Tadashi Kamaura - Integrante. Financiador(es): National Institure of Health- USA - Auxílio financeiro.
Membro: João Eduardo Ferreira.
2010-2017. Criação e análise de indicadores de dados clínicos e moleculares de pacientes HIV para gestão e tomada de decisão do PN-DST-AIDS
Descrição: Desenvolvimento de ferramentas computacionais para criação e análise de indicadores dos dados clínicos e moleculares de pacientes HIV para gestão e tomada de decisão do Departamento de DST, Aids e Hepatites Virais, bem como a Implementação do Teste de Genotipagem para detecção de mutações que geram resistência ao Inibidor de Entrada ? Enfuvirtida ? em pacientes submetidos ao HAART, mas sem tratamento prévio com esta classe de drogas.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: João Eduardo Ferreira - Coordenador / Luciano V Araújo - Integrante / Ester C. Sabino - Integrante / Leonardo Tadashi Kamaura - Integrante. Financiador(es): Ministéria da Saúde - Programa Nacional Doenças Sexualmente Transmissíveis - Cooperação.
Membro: João Eduardo Ferreira.
2007-2009. Análise e Classificação de Comportamentos de Doadores de Sangue em Banco de Dados Multidimensionais
Descrição: Um dos desafios para aplicações E-Science é a análise em larga escala de séries temporais, originárias de grandes bancos de dados multidimensionais. Este projeto propõe a integração de algoritmos de visualização e classificação não-supervisionada de séries temporais armazenadas em banco de dados multidimensionais. Essa integração será validada com a utilização de um banco de dados real de doadores de sangue de três grandes hemocentros do Brasil, de modo a melhor caracterizar o comportamento desses doadores tendo em vista a melhoria da segurança transfusional.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) . Integrantes: João Eduardo Ferreira - Coordenador / Roberto Marcondes Cesar Junior - Integrante / Ester C. Sabino - Integrante / Nina Sumiko Tomita Hirata - Integrante. Financiador(es): (CNPq) Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: João Eduardo Ferreira.
2006-2009. Processamento de Requisições em Larga Escala Utilizando o Conceito de Plano de Navegação
Descrição: Processamento de requisição é uma aplicação importante no gerenciamento de processos de negócio. Dois dos principais desafios para projeto e implementação de sistemas de processamento de requisi-ções são: (1) inter-operação e integração de sistemas de informação autônomos e heterogêneos; (2) evolução flexível e composição de elementos de software que implementam o workflow de processa-mento de requisições. Nesse projeto de pesquisa propomos o conceito de Plano de Navegação como solução para vários desafios de processamento de requisições. A hipótese principal de nossa pesquisa é que os três estágios de processamento de requisições podem ser separados, implementados, integrados e executados através de interfaces que apóiam tanto a integração de sistemas autônomos e heterogêneos como também a evolução flexível de workflows. Os três estágios são: primeiro, um cli-ente (usuário ou outro programa) gera uma requisição, isto é, um pedido de informação, materiais ou serviços; segundo, a requisição é validada através de uma série de passos de negócio. Isso é impor-tante desde que as requisições validadas possam ser finalizadas apenas quando elas satisfaçam as exigências especificadas nos passos de negócio; terceiro, a requisição validada é submetida aos pro-cessos de execução apropriados para atender às exigências especificadas. A representação e execu-ção de passos de negocio em ambientes de workflows tem gerado vários desafios. Um deles é: Qual é a melhor fundamentação formal e linguagem para controlar padrões de workflow? Algumas das lin-guagens workflow advogam abordagem de Redes de Petri ou Álgebra de Processos, como fundamen-tação formal. Entretanto, a implementação de padrões de workflow descritas por Álgebra de Proces-sos ainda é um problema em aberto. Nessa pesquisa, Álgebra de Processos tem sido usada para representar uma descrição semi-formal da linguagem de definição de Plano de Navegação (NPDL). Seis atividades são propostas nesse projeto de pesquisa para aprofu. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (3) Doutorado: (3) . Integrantes: João Eduardo Ferreira - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T & A: 2
Membro: João Eduardo Ferreira.
2002-2006. Desenvolvimento de ambiente informatizado para análise determinística de dados epidemiológicos e de resistência genotípica do HIV-1.
Descrição: Este projeto pretende implementar um banco de dados através da integração de bancos do Programa de DST-AIDS já existentes (SICLOM, SISCEL e RENAGENO) de modo a viabilizar os elementos analíticos para cruzamento de informações vinculadas aos aspectos clínicos, epidemiológicos e de genotipagem dos pacientes com HIV positivo. Pretende-se também adequar ferramentas de bioinformática que permitam analisar sequências do HIV, gerando laudos de genotipagem e subtipagem.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . Integrantes: João Eduardo Ferreira - Coordenador. Financiador(es): Ministério da Saúde - Auxílio financeiro. Número de produções C, T & A: 2
Membro: João Eduardo Ferreira.
2001-2006. Aproximação Genômica e Pós-Genômica ao Estudo das Malárias Humanas de Plasmodium vivax e Plasmodium falciparum na Amazônia Brasileira.-ClinMalDB
Descrição: A finalização do genoma de P. falciparum, bem como avanços significativos no genoma de P. vivax foram anunciados recentemente na revista Nature [415:702-709 (2002)]. Este projeto propõe o uso de abordagens genômicas e pós-genômicas em três áreas principais de pesquisa em malária: fatores de virulência, genética de populações e quimioterapia. Além disso, através da integração com o Núcleo de Bioinformática da USP, propomos a criação de um banco de dados de seqüências e imagens de microarrays (MalDB) para explorar de modo completo toda essa nova informação biológica.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: João Eduardo Ferreira - Integrante / Hernando A del Portillo, - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T & A: 1
Membro: João Eduardo Ferreira.
2000-2003. Indexing and Data Mining in Multimedia Databases-ImiMD
Descrição: Indexação de resultados de classificadores em grandes volumes de dados.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: João Eduardo Ferreira - Integrante / Caetano Traina Junior - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Número de produções C, T & A: 1
Membro: João Eduardo Ferreira.

Prêmios e títulos

Total de prêmios e títulos (11)

Best Student Paper Award:, Services Conference Federation -ICWS 2018.. 2018.
Membro: João Eduardo Ferreira.
Outstanding Services Awards for SCF 2018, Services Conference Federation.. 2018.
Membro: João Eduardo Ferreira.
Prêmio de Destaque CIO SP de 2017, IT4CIO.. 2017.
Membro: João Eduardo Ferreira.
Prêmio de Melhor Artigo dos Anais do SBBD 2014: http://www.inf.ufpr.br/sbbd-sbsc2014/sbbd/premiacao.htm, Sociedade Brasileira de Computação.. 2014.
Membro: João Eduardo Ferreira.
Prêmio de Incentivo em Ciência e Tecnologia para o SUS com o trabalho: HIVSetSubtype, Software for subtype classification of HIV-1, SUS-Ministério da Saúde.. 2009.
Membro: João Eduardo Ferreira.
Best Student Paper Award:"Business Processes Management Using Process Algebra and Relational Database Model", International Conference in e-Business (ICE-B).. 2008.
Membro: João Eduardo Ferreira.
Prêmio de Incentivo em Ciência e Tecnologia para o SUS com o trabalho: Sistema Cooperativo para Estudos do HIV/AIDS no Brasil., Ministério da Saúde.. 2007.
Membro: João Eduardo Ferreira.
Professor homenageado dos formandos do BCC - 2007, USP - São Paulo, IME-USP.. 2007.
Membro: João Eduardo Ferreira.
2 º colocado do concurso modalidade Monografias do VII Prêmio CONIP 2004 de Excelência em Informática Aplicada aos Serviços Públicos., VII Prêmio CONIP 2004 - Órgão: SUCESU-SP e IDETI... 2004.
Membro: João Eduardo Ferreira.
Prêmio jovens talentos 2003 - Coordenador da equipe, IBM - http://www.ibm.com/news/br/2003/03/18-03-2003.html.. 2003.
Membro: João Eduardo Ferreira.
Melhor Site Transacional de Serviços Públicos - Posto Fiscal Eletrônico Secretaria da Fazenda do Estado de São Paulo, CONIP - 2001.. 2001.
Membro: João Eduardo Ferreira.

Participação em eventos

Total de participação em eventos (34)

International Conference on Web Services, 2018. Modeling Time-Critical Processes with WED-flow. 2018. (Congresso).
IEEE International Conference on Services Computing. Web Services Composition through Data Events Approach. 2013. (Congresso).
19th International Conference on Web Services. Transactional Recovery Support for Robust Exception Handling in Business Process Services. 2012. (Congresso).
5th LNCC Meeting om Computacional Modeling. 2012. (Congresso).
The São Paulo School of Advanced Science on e-Science for Bioenergy Research.Transaction Processing for e-Science Applications. 2012. (Simpósio).
XXVII Simpósio Brasileiro de Bancos de Dados. Workshop de Teses e Dissertações no SBBD 2012. 2012. (Congresso).
CoopIS 2010 - OTM. Reducing Exception Handling Complexity in Business Process Modeling and Implementation: The WED-Flow Approach. 2010. (Congresso).
Semana de Sistemas de Informação.Transações Assíncronas para Workflows Científicos. 2010. (Simpósio).
Simpósio Brasileiro de Banco de Dados. 2010. (Congresso).
Business Process Management. Towards Algorithmic Generation of Business Processes: From Business Step Dependencies to Process Algebra Expressions. 2009. (Congresso).
Simposio Brasileiro de Banco de Dados. Banco de dados evolutivos e metodos ageis. 2008. (Congresso).
The 4th International Conference on Collaborative Computing. The RiverFish Approach to Business Process Modeling: Linking Business Steps to Control-Flow Patterns. 2008. (Congresso).
Congresso de Tecnologias para Gestão de Dados e Metadados do Cone Sul. Gerenciamento de Processos de Negócio Usando Álgebra de Processos. 2007. (Congresso).
Database and Expert Systems Applications - DEXA. The use of Multidimensional Scaling as Applied to the BPM Performance in Brazilian e-Government Administration. 2007. (Congresso).
Symposium on Apllied Computing. Using Control-Flow Patterns for Specifying Business Processes in Cooperative Environments. 2007. (Congresso).
Intelligent Systems for Molecular Biology. 2006. (Congresso).
Simpósio Brasileiro de Banco de Dados. 2006. (Congresso).
1o. International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computacional Biology. A Database System for Collaborative HIV analysis in Brazil. 2005. (Congresso).
7th International IEEE Conference on E-Commerce Technology. Integration of Business Processes with Autonomous Information Systems: A Case Study in Government Services. 2005. (Congresso).
IDEAS-2005. International Database Engineering and Applications Symposium. 2005. (Congresso).
International IEEE Conference om E-Commerce Techonology. Integration of Business Processes with Autonomous Information Systems: A Case Study in Government Services. 2005. (Congresso).
Simpósio Brasileiro de Banco de Dados. 2005. (Congresso).
1st. International Conference on Information Systems and Technology Management. Local: FEA/USP. The unified interface for the government business registration through unified model. 2004. (Congresso).
CONIP-2004 SUCESU-SP e IDETI. O Processo Unificado de Cadastramento de Empresas: um estudo de caso. 2004. (Congresso).
III Latin American Course on Bioinformatics for Tropical Disease Research - OMS.Workshop: Introduction to Bioinformatics Databases. 2004. (Oficina).
SBBD 2004. Mini-curso SBBD 2004: Naked Objects. 2004. (Congresso).
Simpósio Brasileiro de Banco de Dados. Simpósio Brasileiro de Banco de Dados. 2004. (Congresso).
1st International Conference on Bioinformatics and Computational Biology. Genflow: generic flow for integration, management and analysis. 2003. (Congresso).
CN DST e Aids.Projeto de Construção de Data Warehouse e Desenvolvimento de Ferramentas para Bioinformática. 2003. (Outra).
Encontro de Informática da Unesp.Estratégias de Distribuição e Replicação de Dados em Sistemas Corporativos. 2003. (Encontro).
ENITEC.I Encontro de Informação e Tecnologia - ENITEC. 2003. (Encontro).
II Latin American Course on Bioinformatics for Tropical Disease Research.Introduction for Bioinformatic Databases - OMS. 2003. (Oficina).
Escola Brasileira de Computação 2000.Controle de Concorrência e distribuição de dados: a teoria clássica, suas limitações e extensões modernas. 2000. (Outra).
Microarray Patterns.Microarray database patterns. 2000. (Encontro).

Organização de eventos

Total de organização de eventos (16)

FERREIRA, J.E.. Sao Paulo School of Advanced Science Learning from data. 2019. (Congresso).. . 0.
CESAR JUNIOR, R. M. ; MEDEIROS, C. M. B. ; FERREIRA, J. E. ; OLIVEIRA, M. C. F.. IEEE e-Science 2014. 2014. Congresso
FERREIRA, J. E.. 27th Brazilian Symposium on Databases. 2012. (Congresso).. . 0.
FERREIRA, J. E.. Iberoamerican Congress on Pattern Recognition. 2010. (Congresso).. . 0.
FERREIRA, J. E.. Comitê de Programa Sixteenth Conference on Information and Knowledge Management. 2007. (Congresso).. . 0.
FERREIRA, J. E.. Comitê de Programa e-Science Workshop. 2007. (Congresso).. . 0.
FERREIRA, J. E.. Xmeeting - Comitê Editorial. 2006. (Congresso).. . 0.
FERREIRA, J. E.. Xmeeting - Comitê Editorial. 2005. (Congresso).. . 0.
FERREIRA, J. E.. SBBD - Comitê de Programa. 2005. (Congresso).. . 0.
FERREIRA, J. E.. ICOBICOBI - comitê organizador. 2004. (Congresso).. . 0.
FERREIRA, J. E.. SBBD - Comitê de Programa. 2004. (Congresso).. . 0.
FERREIRA, J. E.. ICOBICOBI - comitê organizador. 2003. (Congresso).. . 0.
FERREIRA, J. E.. SBBD - Comitê de Programa. 2001. (Congresso).. . 0.
FERREIRA, J. E.. SBBD - Comitê de Programa. 2000. (Congresso).. . 0.
FERREIRA, J. E.. SBBD - Comitê Organizador. 1996. (Congresso).. . 0.
FERREIRA, J. E.. SBBD - Comitê Organizador. 1994. (Congresso).. . 0.

Lista de colaborações

Colaborações endôgenas (6)

João Eduardo Ferreira ⇔ Alan Mitchell Durham (3.0)
MERINO, E. F. ; FERNANDEZ-BECERRA, C. ; DURHAM, A. M. ; FERREIRA, J. E. ; TUMILASCI, V. F. ; DARC-NEVES, J. ; DADARIO, A. ; SILVA-NUNES, M. ; FERREIRA, M. U. ; WICKRAMARACHCHI, T. A. ; PORTILLO, H. A.. Multi-character population study of the vir subtelomeric multigene superfamily of Plasmodium vivax, a major human malaria parasite. Molecular and Biochemical Parasitology (Print). v. 149, p. 10-16, 2006. Qualis: A4
DURHAM, A. M.; ALBRECHT, L. ; Emilio F. Merino ; HOFFMANN, E. H. ; URBANO, M. ; de Mattos Ferreira, R.G. ; OSAKABE, A. L. ; Dalla Martha, R.C. ; Ramharter, M. ; FERREIRA, J. E. ; Hernando A. del Portillo ; WUNDERLICH, G.. Extense variant gene family repertoire overlap in Western Amazon Plasmodium falciparum isolates. Molecular and Biochemical Parasitology (Print). v. 150, p. 157-165, 2006. Qualis: A4
OIKAWA, M.K. ; SILVA, P. ; MERINO, E. F. ; FERNANDEZ-BECERRA, C. ; WUNDERLICH, G. ; BARRERA, J. ; DURHAM, A. M. ; Hernando A. del Portillo ; del PORTILLO, H. ; FERREIRA, J. E.. . ClinMaldb: a clinical field-research oriented relational database to study human malaria. Em: IADIS International Conference e-Health 2009, v. 1, p. 1-9, 2009.Qualis: Não identificado (IADIS International Conference e-Health 2009)

João Eduardo Ferreira ⇔ André Fujita (1.0)
YANCY-CABALLERO, DAISON ; LING, LIU Y. ; Fujita, André ; FERREIRA, JOÃO E. ; DRIEMEIER, CARLOS. Intraparticle Connectivity in Sugarcane Bagasse Unveiled by Pore Network Modeling. BioEnergy Research. v. 12, p. 546-557, 2019. Qualis: A1

João Eduardo Ferreira ⇔ Eduardo Moraes Rego Reis (1.0)
DA PAIXÃO, VINICIUS FERREIRA ; SOSA, OMAR JULIO ; DA SILVA PELLEGRINA, DIOGO VIEIRA ; DAZZANI, BIANCA ; CORRÊA, THALITA BUENO ; RISÉRIO BERTOLDI, ESTER ; DA CRUZ E ALVES-DE-MORAES, LUÍS BRUNO ; DE OLIVEIRA PESSOA, DIOGO ; DE PAIVA OLIVEIRA, VICTORIA ; ALBERTO CHIONG ZEVALLOS, RICARDO ; RUSSO, LILIAN CRISTINA ; LUIS FORTI, FABIO ; EDUARDO FERREIRA, JOÃO ; CARIOCA FREITAS, HELANO ; JUKEMURA, JOSÉ ; MACHADO, MARCEL CERQUEIRA CÉSAR ; DIRLEI BEGNAMI, MARIA ; SETUBAL, JOÃO CARLOS ; BASSÈRES, DANIELA SANCHEZ ; MORAES REIS, EDUARDO. Annotation and functional characterization of long noncoding RNAs deregulated in pancreatic adenocarcinoma. CELLULAR ONCOLOGY. v. 45, p. 479-504, 2022. Qualis: A1

João Eduardo Ferreira ⇔ Glaucia Mendes Souza (1.0)
SOUZA, GLAUCIA MENDES ; BERGES, HELENE ; BOCS, STEPHANIE ; CASU, ROSANNE ; D'HONT, ANGELIQUE ; FERREIRA, JOÃO EDUARDO ; HENRY, ROBERT ; Ming, Ray ; POTIER, BERNARD ; Sluys, Marie-Anne ; VINCENTZ, Michel ; PATERSON, ANDREW H.. The Sugarcane Genome Challenge: Strategies for Sequencing a Highly Complex Genome. Tropical Plant Biology (Online). v. 4, p. 145-156, 2011. Qualis: A3

João Eduardo Ferreira ⇔ Joao Carlos Setubal (1.0)
DA PAIXÃO, VINICIUS FERREIRA ; SOSA, OMAR JULIO ; DA SILVA PELLEGRINA, DIOGO VIEIRA ; DAZZANI, BIANCA ; CORRÊA, THALITA BUENO ; RISÉRIO BERTOLDI, ESTER ; DA CRUZ E ALVES-DE-MORAES, LUÍS BRUNO ; DE OLIVEIRA PESSOA, DIOGO ; DE PAIVA OLIVEIRA, VICTORIA ; ALBERTO CHIONG ZEVALLOS, RICARDO ; RUSSO, LILIAN CRISTINA ; LUIS FORTI, FABIO ; EDUARDO FERREIRA, JOÃO ; CARIOCA FREITAS, HELANO ; JUKEMURA, JOSÉ ; MACHADO, MARCEL CERQUEIRA CÉSAR ; DIRLEI BEGNAMI, MARIA ; SETUBAL, JOÃO CARLOS ; BASSÈRES, DANIELA SANCHEZ ; MORAES REIS, EDUARDO. Annotation and functional characterization of long noncoding RNAs deregulated in pancreatic adenocarcinoma. CELLULAR ONCOLOGY. v. 45, p. 479-504, 2022. Qualis: A1

João Eduardo Ferreira ⇔ Marie-Anne Van Sluys (1.0)
SOUZA, GLAUCIA MENDES ; BERGES, HELENE ; BOCS, STEPHANIE ; CASU, ROSANNE ; D'HONT, ANGELIQUE ; FERREIRA, JOÃO EDUARDO ; HENRY, ROBERT ; Ming, Ray ; POTIER, BERNARD ; Sluys, Marie-Anne ; VINCENTZ, Michel ; PATERSON, ANDREW H.. The Sugarcane Genome Challenge: Strategies for Sequencing a Highly Complex Genome. Tropical Plant Biology (Online). v. 4, p. 145-156, 2011. Qualis: A3

(*) Relatório criado com produções desde 2000 até 2024
Data de processamento: 05/12/2024 01:27:53

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