Programa de Pós Graduação em Bioinformática

Marie-Anne Van Sluys

Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade do Estado do Rio de Janeiro (UERJ) em 1983 e o título de Doutor pela Université Paris XI (Centre dOrsay, França) em 1989. É professora titular do Departamento de Botânica da Universidade de São Paulo desde 2007. Dois interesses principais orientam a sua atuação acadêmica-científica e são eles a compreensão de processos moleculares para diversificação biológica e a interação entre plantas e microrganismos. Estes interesses direcionaram a atuação do grupo GaTE em genômica comparativa e função biológica dos elementos de transposição. É membro da ACIESP (2015-atual), ABC (2016-atual), CDES (2016-2018) e TWAS (2023). Vice presidente da ACIESP (2023-2026). Membro do conselho da SBPC e ABC. Mais de 50 profissionais em diferentes estágios de formação científica passaram pelo GaTE e encontram-se inseridos no setor público e privado no Brasil e no exterior. (Texto informado pelo autor)

http://lattes.cnpq.br/5131787064674647 (05/01/2026)

Rótulo/Grupo:

Bolsa CNPq: Nível 1B

Período de análise:

Endereço: Universidade de São Paulo, Instituto de Biociências, Departamento de Botânica. rua do matão, 277 Cidade Universitaria 05508090 - São Paulo, SP - Brasil Telefone: (11) 30917759 Fax: (11) 30917724 URL da Homepage: http://www.ib.usp.br/botanica/gatelab/

Grande área: Ciências Biológicas

Área: Microbiologia

Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Artigos completos publicados em periódicos (100)
1. PARTIDA, VANIA GABRIELA SEDANO ; DIAS, HENRIQUE MOURA ; PORTES, MARIA TERESA ; Van Sluys, Marie-Anne. The genetic puzzle of multicopy genes: challenges and troubleshooting. Plant Methods. v. 21, p. 32, 2025. Qualis: A1
2. DIAS, HENRIQUE MOURA ; DE TOLEDO, NAIARA ALMEIDA ; MURAL, RAVI V ; SCHNABLE, JAMES C ; Van Sluys, Marie-Anne. Gene Evolutionary Trends: A Comprehensive Plant-Focused Assessment via Data Mining and Large-Scale Analysis. Genome Biology and Evolution. v. 16, p. evae212, 2024. Qualis: A1
3. MIRANDA, RAQUEL P. ; TURRINI, PAULA C. G. ; BONADIO, DORA T. ; ZERILLO, MARCELO M. ; BERSELLI, ARTHUR P. ; CRESTE, SILVANA ; Van Sluys, Marie-Anne. Genome Organization of Four Brazilian Xanthomonas albilineans Strains Does Not Correlate with Aggressiveness. MICROBIOLOGY SPECTRUM. v. XX, p. 1-17, 2023. Qualis: A2
4. MOURA DIAS, HENRIQUE ; VIEIRA, ANDREIA PRATA ; DE JESUS, ERIKA MARIA ; de Setta, Nathalia ; BARROS, GESIELE ; Van Sluys, Marie-Anne. Functional and comparative analysis of THI1 gene in grasses with a focus on sugarcane. PeerJ. v. 11, p. e14973-27, 2023. Qualis: A2
5. BINI, ANDRESSA PERES ; ROSSI, GUILHERME DUARTE ; POESCHL, YVONNE ; SERRA, MARINA CARNAZ DUARTE ; CAMARGO, Luis Eduardo Aranha ; Monteiro-Vitorello, Claudia Barros ; Van Sluys, Marie-Anne ; VAN DAM, NICOLE M. ; UTHE, HENRIETTE ; CRESTE, SILVANA. Molecular, biochemical and metabolomics analyses reveal constitutive and pathogen-induced defense responses of two sugarcane contrasting genotypes against leaf scald disease. PLANT PHYSIOLOGY AND BIOCHEMISTRY. v. 203, p. 108033, 2023. Qualis: A1
6. BINI, ANDRESSA PERES ; SERRA, MARINA CARNAZ DUARTE ; PASTORE, IZADORA FARINA ; BRONDI, CAROLINA VELUCI ; CAMARGO, Luis Eduardo Aranha ; Monteiro-Vitorello, Claudia Barros ; Van Sluys, Marie-Anne ; ROSSI, GUILHERME DUARTE ; CRESTE, SILVANA. Transmission of Xanthomonas albilineans by the spittlebug, Mahanarva fimbriolata (Hemiptera: Cercopidae), in Brazil: first report of an insect vector for the causal agent of sugarcane leaf scald. JOURNAL OF INSECT SCIENCE. v. 23, p. 116, 2023. Qualis: C
7. ISHIDA, JULIANE K. ; BINI, ANDRESSA P. ; CRESTE, SILVANA ; Van Sluys, Marie-Anne. Towards defining the core Saccharum microbiome: input from five genotypes. BMC MICROBIOLOGY. v. 22, p. 193, 2022. Qualis: A2
8. SOUSA'BAENA, MARIANE S ; HERNANDES-LOPES, JOSÉ ; Van Sluys, Marie-Anne. Reaching the top through a tortuous path: helical growth in climbing plants. CURRENT OPINION IN PLANT BIOLOGY. v. 59, p. 101982, 2021. Qualis: A1
9. PARTIDA, VANIA GABRIELA SEDANO ; DIAS, HENRIQUE MOURA ; CORCINO, DIANA SUSANA MARTINEZ ; Van Sluys, Marie-Anne. Sucrose-phosphate phosphatase from sugarcane reveals an ancestral tandem duplication. BMC PLANT BIOLOGY. v. 21, p. 23, 2021. Qualis: A1
10. MASUDA, HANA PAULA ; NAKABASHI, MYNA ; MORGANTE, PATRICIA G ; KAJIHARA, DANIELA ; DE SETTA, NATHALIA ; MENCK, Carlos Frederico Martins ; Van Sluys, Marie-Anne. Evidence for sub-functionalization of tandemly duplicated XPB nucleotide excision repair genes in Arabidopsis thaliana. GENE. v. 754, p. 144818, 2020. Qualis: A4
11. Sforça, Danilo Augusto ; VAUTRIN, SONIA ; CARDOSO-SILVA, CLAUDIO BENICIO ; MANCINI, MELINA CRISTINA ; ROMERO-DA CRUZ, MARÍA VICTORIA ; PEREIRA, GUILHERME DA SILVA ; CONTE, MÔNICA ; BELLEC, ARNAUD ; DAHMER, NAIR ; FOURMENT, JOELLE ; RODDE, NATHALIE ; SLUYS MAV. ; VICENTINI, RENATO ; GARCIA, ANTÔNIO AUGUSTO FRANCO ; FORNI-MARTINS, ELIANA REGINA ; CARNEIRO, MONALISA SAMPAIO ; HOFFMANN, HERMANN PAULO ; PINTO, Luciana Rossini ; LANDELL, MARCOS GUIMARÃES DE ANDRADE ; VINCENTZ, MICHEL ; et.al. Gene Duplication in the Sugarcane Genome: A Case Study of Allele Interactions and Evolutionary Patterns in Two Genic Regions. Frontiers in Plant Science. v. 10, p. 1-15, 2019. Qualis: A1
12. BARROS-CARVALHO, GESIELE ALMEIDA ; HUNGRIA, MARIANGELA ; LOPES, FABRÍCIO MARTINS ; VAN SLUYS, MARIE-ANNE. Brazilian-adapted soybean Bradyrhizobium strains uncover IS elements with potential impact on biological nitrogen fixation. FEMS Microbiology Letters. v. 366, p. fnz046, 2019. Qualis: B2
13. TAVARES, EVELINE Q P ; DE SOUZA, AMANDA P ; ROMIM, GRAYCE H ; GRANDIS, ADRIANA ; PLASENCIA, ANNA ; GAIARSA, JONAS W ; GRIMA-PETTENATI, JACQUELINE ; DE SETTA, NATHALIA ; Van Sluys, Marie-Anne ; BUCKERIDGE, MARCOS S. The control of endopolygalacturonase expression by the sugarcane RAV transcription factor during aerenchyma formation. JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY. v. 70, p. 497-506, 2019. Qualis: A1
14. SOUZA, GLAUCIA MENDES ; VAN SLUYS, MARIE-ANNE ; LEMBKE, CAROLINA GIMILIANI ; LEE, HAYAN ; MARGARIDO, GABRIEL RODRIGUES ALVES ; HOTTA, CARLOS TAKESHI ; GAIARSA, JONAS WEISSMANN ; DINIZ, AUGUSTO LIMA ; OLIVEIRA, MAURO DE MEDEIROS ; FERREIRA, SÁVIO DE SIQUEIRA ; NISHIYAMA, MILTON YUTAKA ; TEN-CATEN, FELIPE ; RAGAGNIN, GEOVANI TOLFO ; ANDRADE, PABLO DE MORAIS ; DE SOUZA, ROBSON FRANCISCO ; NICASTRO, GIANLUCCA GONÇALVES ; PANDYA, RAVI ; KIM, CHANGSOO ; GUO, HUI ; DURHAM, ALAN MITCHELL ; et.al. Assembly of the 373k gene space of the polyploid sugarcane genome reveals reservoirs of functional diversity in the world's leading biomass crop. GigaScience. v. 8, p. 129, 2019. Qualis: A1
15. RODY, HUGO V. S. ; BOMBARDELLI, RENATO G. H. ; CRESTE, SILVANA ; CAMARGO, LUÍS E. A. ; Van Sluys, Marie-Anne ; MONTEIRO-VITORELLO, CLAUDIA B.. Genome survey of resistance gene analogs in sugarcane: genomic features and differential expression of the innate immune system from a smut-resistant genotype. BMC GENOMICS. v. 20, p. 809, 2019. Qualis: A2
16. DA COSTA, ZIRLANE PORTUGAL ; CAUZ-SANTOS, LUIZ AUGUSTO ; RAGAGNIN, GEOVANI TOLFO ; Van Sluys, Marie-Anne ; DORNELAS, MARCELO CARNIER ; BERGES, HÉLÈNE ; DE MELLO VARANI, ALESSANDRO ; Vieira, Maria Lucia Carneiro. Transposable element discovery and characterization of LTR-retrotransposon evolutionary lineages in the tropical fruit species Passiflora edulis. MOLECULAR BIOLOGY REPORTS. v. 46, p. 6117, 2019. Qualis: B1
17. HERNANDES'LOPES, JOSÉ ; SOUSA'BAENA, MARIANE S. ; LEMOS, RENATA C. C. ; CORRÊA, TATIANA C. S. ; VAN SLUYS, MARIE'ANNE ; MELO'DE'PINNA, GLADYS FLAVIA DE ALBUQUERQUE. Toward understanding inflorescence development and architecture in Passiflora : insights from comparative anatomy and expression of APETALA1. AMERICAN JOURNAL OF BOTANY. v. 106, p. 1173, 2019. Qualis: A2
18. Garsmeur, Olivier ; DROC, GAETAN ; ANTONISE, RUDIE ; GRIMWOOD, JANE ; POTIER, BERNARD ; AITKEN, KAREN ; JENKINS, JERRY ; MARTIN, GUILLAUME ; Charron, Carine ; HERVOUET, CATHERINE ; COSTET, LAURENT ; YAHIAOUI, NABILA ; HEALEY, ADAM ; SIMS, DAVID ; CHERUKURI, YESESRI ; SREEDASYAM, AVINASH ; KILIAN, ANDRZEJ ; CHAN, AGNES ; Van Sluys, Marie-Anne ; SWAMINATHAN, KANKSHITA ; et.al. A mosaic monoploid reference sequence for the highly complex genome of sugarcane. Nature Communications. v. 9, p. 2638, 2018. Qualis: A1
19. ZHANG, JISEN ; ZHANG, XINGTAN ; TANG, HAIBAO ; ZHANG, QING ; HUA, XIUTING ; MA, XIAOKAI ; ZHU, FAN ; JONES, TYLER ; ZHU, XINGUANG ; BOWERS, JOHN ; WAI, CHING MAN ; ZHENG, CHUNFANG ; SHI, YAN ; CHEN, SHUAI ; XU, XIUMING ; YUE, JINGJING ; NELSON, DAVID R. ; HUANG, LIXIAN ; LI, ZHEN ; SOUZA, G. M. ; et.al. Allele-defined genome of the autopolyploid sugarcane Saccharum spontaneum L.. NATURE GENETICS. v. 50, p. 1565-1573, 2018. Qualis: A1
20. LEWIN, HARRIS A. ; ROBINSON, GENE E. ; KRESS, W. JOHN ; BAKER, WILLIAM J. ; CODDINGTON, JONATHAN ; CRANDALL, KEITH A. ; DURBIN, RICHARD ; EDWARDS, SCOTT V. ; FOREST, FÉLIX ; GILBERT, M. THOMAS P. ; GOLDSTEIN, MELISSA M. ; GRIGORIEV, IGOR V. ; HACKETT, KEVIN J. ; HAUSSLER, DAVID ; JARVIS, ERICH D. ; JOHNSON, WARREN E. ; PATRINOS, ARISTIDES ; RICHARDS, STEPHEN ; CASTILLA-RUBIO, JUAN CARLOS ; Van Sluys, Marie-Anne ; et.al. Earth BioGenome Project: Sequencing life for the future of life. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA. v. 115, p. 4325-4333, 2018. Qualis: A1
21. NAGEL, RAIMUND ; TURRINI, PAULA C. G. ; NETT, RYAN S. ; Leach, Jan E. ; VERDIER, VALÉRIE ; Van Sluys, Marie-Anne ; PETERS, REUBEN J.. An operon for production of bioactive gibberellin A 4 phytohormone with wide distribution in the bacterial rice leaf streak pathogen Xanthomonas oryzae pv. oryzicola. NEW PHYTOLOGIST. v. 214, p. 1-7, 2017. Qualis: A1
22. BARROS-CARVALHO, GESIELE ALMEIDA ; Van Sluys, Marie-Anne ; LOPES, FABRICIO MARTINS. An Efficient Approach to Explore and Discriminate Anomalous Regions in Bacterial Genomes Based on Maximum Entropy. JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY. v. xxx, p. xxx-xxx, 2017. Qualis: A4
23. MILLER, ROBERT NEIL GERARD ; COSTA ALVES, GABRIEL SERGIO ; Van Sluys, Marie-Anne. Plant immunity: unravelling the complexity of plant responses to biotic stresses. ANNALS OF BOTANY. v. 119, p. 681-687, 2017. Qualis: A1
24. VILELA, MARIANE DE MENDONÇA ; DEL-BEM, LUIZ-EDUARDO ; Van Sluys, Marie-Anne ; DE SETTA, NATHALIA ; KITAJIMA, JOÃO PAULO ; CRUZ, GUILHERME MARCELO QUEIROGA ; SFORÇA, DANILO AUGUSTO ; DE SOUZA, ANETE PEREIRA ; FERREIRA, PAULO CAVALCANTI GOMES ; GRATIVOL, CLÍCIA ; CARDOSO-SILVA, CLAUDIO BENICIO ; Vicentini, Renato ; VINCENTZ, Michel. Analysis of three sugarcane homo/homeologous regions suggests independent polyploidization events of Saccharum officinarum and Saccharum spontaneum. Genome Biology and Evolution. v. 9, p. evw293-278, 2017. Qualis: A1
25. FIRETTI, FABIANA ; ZUNTINI, ALEXANDRE RIZZO ; GAIARSA, JONAS WEISMANN ; OLIVEIRA, RENATA SOUZA ; LOHMANN, LÚCIA G. ; Van Sluys, Marie-Anne. Complete chloroplast genome sequences contribute to plant species delimitation: A case study of the Anemopaegma species complex. AMERICAN JOURNAL OF BOTANY. v. 104, p. 1493-1509, 2017. Qualis: A2
26. OCHOA CRUZ, EDGAR ANDRES ; CRUZ, GUILHERME MARCELLO QUEIROGA ; VIEIRA, ANDRÉIA PRATA ; Van Sluys, Marie-Anne. Virus-like attachment sites as structural landmarks of plants retrotransposons. Mobile DNA. v. 7, p. 14, 2016. Qualis: A1
27. MEDEIROS, AMANDA L. ; FURTADO, CRISTIANE M. ; LEITE, FRANCINALDO S. ; SOUTO, VALESKA S. ; DE SETTA, NATHALIA ; Van Sluys, Marie-Anne ; KITAJIMA, JOÃO PAULO ; COSTA, ANA PAULA P. ; BENEDITO, VAGNER A. ; SCORTECCI, KATIA C.. Molecular Genetic Dissection of Sugarcane Flowering under Equatorial Field Conditions. Tropical Plant Biology. v. 9, p. 252-266, 2016. Qualis: A3
28. MIES, MIGUEL ; Van Sluys, M. A. ; METCALFE, C. J. ; SUMIDA, P. Y. G.. Molecular evidence of symbiotic activity between Symbiodinium and Tridacna maxima larvae. Symbiosis. v. 70, p. 1-10, 2016. Qualis: A2
29. SCHAKER, PATRICIA D. C. ; PALHARES, A. C. ; TANIGUTI, LUCAS M. ; PETERS, LEILA P. ; CRESTE, SILVANA ; AITKEN, KAREN S. ; SLUYS MAV. ; KITAJIMA, JOÃO P. ; VIEIRA, MARIA L. C. ; MONTEIRO-VITORELLO, CLAUDIA B.. RNAseq Transcriptional Profiling following Whip Development in Sugarcane Smut Disease. Plos One. v. 11, p. e0162237, 2016. Qualis: A1
30. METCALFE, CUSHLA J. ; OLIVEIRA, SARAH G. ; GAIARSA, JONAS W. ; AITKEN, KAREN S. ; CARNEIRO, MONALISA S. ; ZATTI, FERNANDA ; Van Sluys, Marie-Anne. Using quantitative PCR with retrotransposon-based insertion polymorphisms as markers in sugarcane. Journal of Experimental Botany. v. 66, p. 4239-4250, 2015. Qualis: A1
31. SOUZA, GLAUCIA MENDES ; VICTORIA, R. L. ; VERDADE, L. M. ; JOLY, C. A. ; NETTO, P. E. A. ; CRUZ, C. H. B. ; CANTARELLA, H. ; CHUM, H. ; CORTEZ, L. A. B. ; DIAZ-CHAVEZ, R. ; FERNANDES, E. ; FINCHER, G. ; FINCHER, G. B. ; GOLDEMBERG, J. ; NOGUEIRA, L. A. H. ; HUNTLEY, B. J. ; JOHNSON, F. X. ; KAFFKA, S. ; KARP, A. ; SLUYS MAV. ; et.al. SCOPE Bioenergy and Sustainability Technical Summary. Bioenergy and Sustainability bridging the gaps. v. 72, p. 1-779, 2015.Qualis: Não identificado (BIOENERGY AND SUSTAINABILITY BRIDGING THE GAPS)
32. Cruz, Guilherme M. Q. ; METCALFE, CUSHLA J. ; de Setta, Nathalia ; CRUZ, EDGAR A. O. ; VIEIRA, ANDRÉIA PRATA ; MEDINA, ROSARIO ; Van Sluys, Marie-Anne. Virus-Like Attachment Sites and Plastic CpG Islands: Landmarks of Diversity in Plant Del Retrotransposons. Plos One. v. 9, p. e97099, 2014. Qualis: A1
33. de Setta, Nathalia ; MONTEIRO-VITORELLO, CLÁUDIA BARROS ; METCALFE, CUSHLA JANE ; CRUZ, GUILHERME MARCELO ; DEL BEM, LUIZ EDUARDO ; Vicentini, Renato ; NOGUEIRA, FÁBIO TEBALDI ; CAMPOS, ROBERTA ALVARES ; NUNES, SIDENY LIMA ; TURRINI, PAULA CRISTINA ; VIEIRA, ANDREIA PRATA ; OCHOA CRUZ, EDGAR ANDRÉS ; CORRÊA, TATIANA CAROLINE ; HOTTA, CARLOS TAKESHI ; de Mello Varani, Alessandro ; VAUTRIN, SONIA ; DA TRINDADE, ADILSON SILVA ; DE MENDONÇA VILELA, MARIANE ; LEMBKE, CAROLINA GIMILIANI ; SLUYS MAV. ; et.al. Building the sugarcane genome for biotechnology and identifying evolutionary trends. BMC GENOMICS. v. 15, p. 540, 2014. Qualis: A2
34. VARANI, A. M. ; MONTEIRO-VITORELLO, C. B. ; NAKAYA, H. I. ; VANSLUYS MA. The Role of Prophage in Plant Pathogenic Bacteria. Annual Review of Phytopathology (Print). v. 51, p. 429, 2013. Qualis: A1
35. DARRASSE, ARMELLE ; CARRÈRE, SÉBASTIEN ; BARBE, VALÉRIE ; BOUREAU, TRISTAN ; ARRIETA-ORTIZ, MARIO L ; BONNEAU, SOPHIE ; BRIAND, MARTIAL ; BRIN, CHRYSTELLE ; COCIANCICH, STÉPHANE ; DURAND, KARINE ; FOUTEAU, STÉPHANIE ; GAGNEVIN, LIONEL ; GUÉRIN, FABIEN ; GUY, ENDRICK ; INDIANA, ARNAUD ; Koebnik, Ralf ; LAUBER, EMMANUELLE ; MUNOZ, ALEJANDRA ; NOËL, LAURENT D ; SLUYS MAV. ; et.al. Genome sequence of Xanthomonas fuscans subsp. fuscans strain 4834-R reveals that flagellar motility is not a general feature of xanthomonads. BMC Genomics. v. 14, p. 761, 2013. Qualis: A2
36. GARCIA, ANTONIO A. F. ; Mollinari, Marcelo ; Marconi, Thiago G. ; SERANG, OLIVER R. ; SILVA, RENATO R. ; VIEIRA, MARIA L. C. ; Vicentini, Renato ; COSTA, ESTELA A. ; MANCINI, MELINA C. ; GARCIA, MELISSA O. S. ; PASTINA, MARIA M. ; Gazaffi, Rodrigo ; MARTINS, ELIANA R. F. ; DAHMER, NAIR ; SFORÇA, DANILO A. ; SILVA, CLAUDIO B. C. ; BUNDOCK, PETER ; HENRY, ROBERT J. ; Souza, Glaucia M. ; Van Sluys, Marie-Anne ; et.al. SNP genotyping allows an in-depth characterisation of the genome of sugarcane and other complex autopolyploids. Scientific Reports. v. 3, p. 3399, 2013. Qualis: A2
37. MONTEIRO-VITORELLO, C.B. ; MONTEIRO-VITORELLO, C. B. ; ZERILLO, M. M. ; ZERILLO, M.M. ; VAN SLUYS, M.A. ; VAN SLUYS, M.-A. ; CAMARGO, L. E. A. ; CAMARGO, L.E.A. ; KITAJIMA, J.P. ; KITAJIMA, J. P.. Complete Genome Sequence of Leifsonia xyli subsp. cynodontis Strain DSM46306, a Gram-Positive Bacterial Pathogen of Grasses. Genome Announcements. v. 1, p. e00915-13-e00915-13, 2013. Qualis: B3
38. Palhares, Alessandra C ; Maccheroni, Walter ; Souza, Anete P ; Marconi, Thiago G ; Mollinari, Marcelo ; Gazaffi, Rodrigo ; Garcia, Antonio Augusto F ; Vieira, Maria Lucia Carneiro ; Rodrigues-Morais, Taislene B ; Jordão, Hamilton ; Van Sluys, Marie-Anne ; Domingues, Douglas S ; et.al. A novel linkage map of sugarcane with evidence for clustering of retrotransposon-based markers. BMC Genetics (Online). v. 13, p. 51, 2012. Qualis: A3
39. VICENTINI, R. ; NOGUEIRA, F. T. S. ; Vincentz, M. ; BEM, L. E. V. ; SLUYS, M. A.. Gene Content Analysis of Sugarcane Public ESTs Reveals Thousands of Missing Coding-Genes and an Unexpected Pool of Grasses Conserved ncRNAs. Tropical Plant Biology (Online). v. 1, p. 1, 2012. Qualis: A3
40. KAJIHARA, D. ; Godoy F ; Hamaji TA ; BLANCO, S. R. ; VANSLUYS, M A ; SLUYS MAV. ; ROSSI, M.. Functional characterization of sugarcane mustang domesticated transposases and comparative diversity in sugarcane, rice, maize and sorghum. Genetics and Molecular Biology (Impresso). v. 35, p. 632-639, 2012.Qualis: A4
41. Varani, Alessandro M. ; MONTEIRO-VITORELLO, CLAUDIA B. ; ALMEIDA, LUIZ G.P. DE ; SOUZA, RANGEL C. ; CUNHA, OBERDAN L. ; Lima, Wanessa C. ; Civerolo, Edwin ; SLUYS, MARIE-ANNE VAN ; VASCONCELOS, ANA T.R.. Xylella fastidiosa comparative genomic database is an information resource to explore the annotation, genomic features, and biology of different strains. Genetics and Molecular Biology (Impresso). v. 35, p. 149-152, 2012. Qualis: A4
42. JOLY, C. A. ; BERLINCK, R. G. S. ; BOLZANI, V. S. ; HADDAD, C. F. B. ; OLIVEIRA, M. C. ; VAN SLUYS, MARIE-ANNE ; SOUZA, G. M. ; VERDADE, L. M. ; VICTORIA, R. L.. Principais conclusões do workshop conjunto dos programas FAPESP BIOTA-BIOEN-Mudanças Climáticas: ciência e políticas públicas para uma economia mais verde, no contexto da RIO+20. Biota Neotropica. v. 12(2), p. 19-21, 2012. Qualis: B1
43. Domingues, Douglas S ; Cruz, Guilherme MQ ; Metcalfe, Cushla J ; Nogueira, Fabio TS ; Vicentini, Renato ; de S Alves, Cristiane ; Van Sluys, Marie-Anne. Analysis of plant LTR-retrotransposons at the fine-scale family level reveals individual molecular patterns. BMC GENOMICS. v. 13, p. 137, 2012. Qualis: A2
44. Manetti, M. E. ; ROSSI, M. ; CRUZ, G. M. Q. ; SACCARO, N. L. ; NAKABASHI, M. ; ALTEBARMAKIAN, V. ; RODIER-GOUD, M. ; DOMINGUES, D. ; D?HONT, A. ; SLUYS, M. A.. Mutator System Derivatives Isolated from Sugarcane Genome Sequence. Tropical Plant Biology. v. 5, p. 233-243, 2012. Qualis: A3
45. Jesus, Erika M. ; Ochoa Cruz, Edgar A. ; Cruz, Guilherme M. Q. ; Van Sluys, Marie-Anne. Diversification of hAT transposase paralogues in the sugarcane genome. MOLECULAR GENETICS AND GENOMICS. v. 287, p. 205-219, 2012. Qualis: A4
46. Setta, Nathalia ; Sluys, Marie-Anne ; Capy, Pierre ; Carareto, Claudia Marcia Aparecida. Copia Retrotransposon in the Zaprionus Genus: Another Case of Transposable Element Sharing with the Drosophila melanogaster Subgroup. Journal of Molecular Evolution. v. 72, p. 326-338, 2011. Qualis: A3
47. Garsmeur, Olivier ; Charron, Carine ; Bocs, Stéphanie ; Jouffe, Vincent ; Samain, Sylvie ; Couloux, Arnaud ; Droc, Gaëtan ; Zini, Cyrille ; Glaszmann, Jean-Christophe ; Van Sluys, Marie-Anne ; D¿Hont, Angélique. High homologous gene conservation despite extreme autopolyploid redundancy in sugarcane. New Phytologist (Print). v. 189, p. 629-642, 2011. Qualis: A1
48. Ryan, Robert P. ; Vorhölter, Frank-Jörg ; Potnis, Neha ; Jones, Jeffrey B. ; Van Sluys, Marie-Anne ; Bogdanove, Adam J. ; Dow, J. Maxwell. Pathogenomics of Xanthomonas: understanding bacterium¿plant interactions. Nature Review, Microbiology (Print). v. 9, p. 344-355, 2011. Qualis: A1
49. Bogdanove, A. J. ; Koebnik, R. ; Lu, H. ; Furutani, A. ; Angiuoli, S. V. ; Patil, P. B. ; Van Sluys, M.-A. ; Ryan, R. P. ; Meyer, D. F. ; Han, S.-W. ; Aparna, G. ; Rajaram, M. ; Delcher, A. L. ; Phillippy, A. M. ; Puiu, D. ; Schatz, M. C. ; Shumway, M. ; Sommer, D. D. ; Trapnell, C. ; Benahmed, F. ; et.al. Two new complete genome sequences offer insight into host and tissue specificity of plant pathogenic Xanthomonas spp.. Journal of Bacteriology (Print). v. 193, p. 5450-5464, 2011. Qualis: A3
50. SOUZA, GLAUCIA MENDES ; BERGES, HELENE ; BOCS, STEPHANIE ; CASU, ROSANNE ; D'HONT, ANGELIQUE ; FERREIRA, JOÃO EDUARDO ; HENRY, ROBERT ; Ming, Ray ; POTIER, BERNARD ; Sluys, Marie-Anne ; VINCENTZ, Michel ; PATERSON, ANDREW H.. The Sugarcane Genome Challenge: Strategies for Sequencing a Highly Complex Genome. Tropical Plant Biology (Online). v. 4, p. 145-156, 2011. Qualis: A3
51. Freschi, L. ; Rodrigues, M. A. ; Domingues, D. S. ; Purgatto, E. ; Van Sluys, M. A. ; Magalhaes, J. R. ; Kaiser, W. M. ; Mercier, H.. Nitric Oxide Mediates the Hormonal Control of Crassulacean Acid Metabolism Expression in Young Pineapple Plants. Plant Physiology (Bethesda). v. 152, p. 1971-1985, 2010. Qualis: A1
52. Kamenetzky, L. ; Asis, R. ; Bassi, S. ; de Godoy, F. ; Bermudez, L. ; Fernie, A. R. ; Van Sluys, M. A. ; Vrebalov, J. ; Giovannoni, J. J. ; ROSSI, M. ; Carrari, F.. Genomic Analysis of Wild Tomato Introgressions Determining Metabolism- and Yield-Associated Traits. Plant Physiology (Bethesda). v. 152, p. 1772-1786, 2010. Qualis: A1
53. Wang, Jianping ; Roe, Bruce ; Macmil, Simone ; Yu, Qingyi ; Murray, Jan ; Tang, Haibao ; Chen, Cuixia ; Najar, Fares ; Wiley, Graham ; Bowers, John ; Van Sluys, Marie-Anne ; Rokhsar, Daniel S ; Hudson, Matthew E ; Moose, Stephen P ; Paterson, Andrew H ; Ming, Ray. Microcollinearity between autopolyploid sugarcane and diploid sorghum genomes. BMC Genomics. v. 11, p. 261, 2010. Qualis: A2
54. Lang, Jillian M. ; Hamilton, John P. ; Diaz, Maria Genaleen Q. ; Van Sluys, Marie Anne ; Burgos, Ma. Ruby G. ; Vera Cruz, Casiana M. ; Buell, C. Robin ; Tisserat, Ned A. ; Leach, Jan E.. Genomics-Based Diagnostic Marker Development for pv. and pv.. Plant Disease. v. 94, p. 311-319, 2010. Qualis: A2
55. Souza, Beatriz M. ; Molfetta-Machado, Jeanne B. ; Freschi, Luciano ; Figueira, Antonio ; Purgatto, Eduardo ; Buckeridge, Marcos S. ; Sluys, Marie-Anne ; Mercier, Helenice. Axillary bud development in pineapple nodal segments correlates with changes on cell cycle gene expression, hormone level, and sucrose and glutamate contents. In Vitro Cellular & Developmental Biology-Plant. v. 46, p. 281-288, 2010. Qualis: A4 (IN VITRO CELLULAR & DEVELOPMENTAL BIOLOGY. PLANT)
56. Hotta, Carlos T. ; Souza, Amanda P. ; Margarido, Gabriel R. A. ; Sluys, Marie-Anne ; GARCIA, ANTÃ´NIO A. F. ; Domingues, Douglas S. ; Mollinari, Marcelo ; Ochoa, Edgar A. ; Carrer, Helaine ; Melotto-Passarin, Danila M. ; Hoshino, Andrea A. ; Souza, Glaucia M. ; Santos, Melissa O. ; Menossi, Marcelo ; Souza, Anete P. ; Santos, Wanderley D. ; Marconi, Thiago G. ; CRIVELLARI, AUGUSTO CÃ©SAR ; Buckeridge, Marcos S. ; Cruz, Guilherme M. Q. ; et.al. The Biotechnology Roadmap for Sugarcane Improvement. Tropical Plant Biology (Online). v. 3, p. 75-87, 2010. Qualis: A3
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100. Simpson, A. J. G. ; Reinach, F.C. ; Arruda, P. ; Abreu, F. A. ; Acencio, M. ; Alvarenga, R. ; Alves, L. M. C. ; Araya, J. E. ; Baia, G. S. ; Baptista, C. S. ; Barros, M. H. ; Bonaccorsi, E. D. ; Bordin, S. ; Bové, J. M. ; Briones, M. R. S. ; Bueno, M. R. P. ; CAMARGO, A. A. ; Camargo, L. E. A. ; Carraro, D. M. ; DA SILVA, A. M.. The genome sequence of the plant pathogen Xylella fastidiosa.. Nature (London), Londres. v. 406, p. 151-157, 2000. Qualis: Não identificado (NATURE , LONDRES)
Livros publicados/organizados ou edições (4)
1. MENCK, Carlos Frederico Martins ; Val AL ; PENA, S. D. J. ; KELNER, A. W. A. ; DAMINELLI, A. ; CORDANI, U. G. ; FAIRCHILD, T. R. ; BABINSKI, M. ; CUCCOVIA, I. ; CHAIMOVICH, H. ; FARIA, S. T. ; PORFIRIO-SOUSA, A. L. ; LAHR, D. G. ; VAN SLUYS, M A ; OLIVEIRA, Mariana Cabral de ; VERCESI, A. ; RIBEIRO, G. M. ; WINTER, L. ; COLLI, W. ; SOUZA, S. J. ; et.al. A Evolução é fato. 1 ed. Academia Brasileira de Ciências, 2024. v. 1, p. 222.
2. MENCK, Carlos Frederico Martins ; Van Sluys, Marie Anne. Genetica Molecular Basica. 1 ed. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2017. v. 01, p. 500.
3. CARARETO, C. M. ; MONTEIRO-VITORELLO, C. B. ; Van-Sluys, M.-A.. Elementos de Transposição. 1 ed. Rio de Janeiro: Fiocruz, 2015. v. 1000, p. 196.
4. LEACH, J. E. ; BARBOSA, Pedro ; SCHULTZ, Jack ; SLUYS MAV. ; DAVIS, Michael J ; STASKAWICZ, Brian ; MOFFIT, L Joe ; ROOT, Terry L ; POWER, Alison G ; et al. California Agricultural Research Priorities on Pierce's Disease. Washington, DC: The National Academies Press. California Agricultural Research Priorities on Pierce's Disease. Washington, DC: The National Academies Press, 2004. v. 1, p. 161.
Capítulos de livros publicados (10)
1. VERAS, M. ; Van Sluys M.A. ; SALDIVA, P.. Climate change and Health: an urban approach. Em: MCTI. (Org.). Climate Change and Brazil. 1ed.BrasiliaI. : IBICT. 2025.v. 1, p. 358-364.
2. Van Sluys, M.-A.; MELLO, L. E. ; BOLZANI, V. S. ; ARTAXO, P. ; ANDRICOPULO, A. ; ZAGO, M. A.. FAPESP 60 anos: uma homenagem da ACIESP. Em: Adriano Andricopulo. (Org.). FAPESP 60 anos: a ciência no desenvolvimento nacional. 1ed.São Carlos. : Cubo. 2022.v. 1, p. 2-8.
3. JESUS, Erika Maria de ; MALUF, D. Q. ; SETTA, N. ; Van Sluys, Marie Anne. 17 - Genoma Movel:Mecanismos de Transposição e Impacto Evolutivo. Em: Menck e Van Sluys. (Org.). Genetica Molecular Basica. 1ed.Rio de Janeiro. : Guanabara Koogan. 2017.v. 1, p. 335-354.
4. Menck, Carlos F.M. ; Van Sluys, Marie Anne. 1 - Histórico das descobertas - De Mendel às análises genomas. Em: Menck & Van Sluys. (Org.). Genética Molecular Báscia. 1ed.Rio de Janeiro. : Gen. 2017.v. 1, p. 3-16.
5. BASSALO, M. ; TEIXEIRA, G. S. ; PEREIRA, G. A. G. ; VIEIRA, ANDREIA PRATA ; Van Sluys, Marie Anne ; BARAU, J. ; TAVARES, K. C. S. ; BORSOI, J. ; PEREIRA, L. V.. Metodos para uso de CRISPR. Em: Tiago Campos Pereira. (Org.). Introdução a Técnica de CRISPR. 1ed.Ribeirao Preto. : SBG. 2016.v. 1, p. 151-192.
6. Setta, Nathalia ; METCALFE, CUSHLA J. ; Cruz, Guilherme M. Q. ; Ochoa, Edgar A. ; Sluys, Marie-Anne. Noise or Symphony: Comparative Evolutionary Analysis of Sugarcane Transposable Elements with Other Grasses. Topics in Current Genetics. 1ed. Em: . : Springer Berlin Heidelberg. 2012.p. 169-192.
7. VARANI, A. M. ; LIMA, W. ; MOREIRA, L. M. ; OLIVEIRA, M. C. ; SOUZA, R. ; CIVEROLO, E. L. ; VASCONCELOS, Ana Tereza ; VAN SLUYS, M A. Common Genes and Genomic Breaks: A Detailed Case Study of the Xylella fastidiosa Genome Backbone and Evolutionary Insights. Em: Robert W. Jackson. (Org.). Plant Pathogenic Bacteria: Genomics and Molecular Biology. Reading. : Caister Academic Press. 2008.v. prelo, p. 2009.
8. MONTEIROVITORELLO, C B ; ZERILLO, M. M. ; VAN SLUYS, M A ; CAMARGO, Luis Eduardo Aranha. Genome Sequence-based Insights into the Biology of the Sugarcane Pathogen Leifsonia xyli subsp. xyli. Em: Robert W. Jackson. (Org.). Plant Pathogenic Bacteria: Genomics and Molecular Biology |. Reading. : Caister Academic Press. 2008.v. prelo, p. 2009.
9. MENCK, Carlos Frederico Martins ; SLUYS MAV.. Fundamentos da Biologia Molecular: a construção do conhecimento. Em: Luis Mihr. (Org.). Fundamentos da genômica. : Atheneu. 2004..
10. SLUYS MAV.; COSTA, A. P. P. ; SCORTECCI, K. C.. Elementos transponíveis. Em: Sergio Matioli. (Org.). Genética e Evolução Molecular. Ribeirão Preto. : HOLOS. 2001.p. 70-81.
Textos em jornais de notícias/revistas (1)
1. Van Sluys, Marie Anne. Viagem pelo mundo da genômica. Revista PESQUISA, Sao Paulo, p. 94-94, 01 jul. 2016.
Trabalhos completos publicados em anais de congressos (0)
Resumos expandidos publicados em anais de congressos (1)
1. SLUYS MAV.; MONTEIROVITORELLO, C B. Mobile genetic elements contribution to the differentiation of closely related Xanthomonas genomes. Em: ICCC-10, 2004, Tsukuba. Innovative roles of Biological Resource Centers. Tsukuba: Japan society for Culture Collections and World Federation for culture Collections, v. 1, p. 227-231, 2004. Qualis: Não identificado (ICCC-10, 2004, TSUKUBA. INNOVATIVE ROLES OF BIOLOGICAL RESOURCE CENTERS. TSUKUBA: JAPAN SOCIETY FOR CULTURE COLLECTIONS AND WORLD FEDERATION FOR CULTURE COLLECTIONS)
Resumos publicados em anais de congressos (9)
1. ARAÚJO, P. G. ; ROSSI, M. ; JESUS, Erika Maria de ; VM Dias ; FELIX, J. M. ; DRUMMOND, R. D. ; MENOSSI, M. ; SLUYS MAV.. Identification and expression analysis of sugarcane transposable elements homologues. Em: Plant and Animal Gemones, 2003, San Diego. Proceedings PAG, 2003.
2. SLUYS MAV.; ARAÚJO, P. G. ; ROSSI, M. ; VARANI, A. M. ; JESUS, Erika Maria de ; COSTA, A. P. P.. Looking for transposable elements in sugarcane. Em: Transposition and other genome rearrengements, 2003, Santa Fe. Keystone Symposia abstract book, 2003.
3. SLUYS MAV. Xylella fastidiosa and comparative analysis to whole genome sequences of other phytopathogenic bacteria. Em: XIX International Genetics Congress, 2003, Melbourne. Genetics Book of Abstracts and Posters, 2003.
4. COSTA, A. P. P. ; HASHIMOTO, R. Y. ; ARAÚJO, P. G. ; SLUYS MAV.. Genomic distribution and expression analysis of Retrolyc1 retrotransposon. Em: XIX Internacional Genetics Congress, 2003, Melbourne. Genetics BooK of Abstract and Poster, 2003.
5. COSTA, A. P. P. ; ROSSI, M. ; ARAÚJO, P. G. ; SLUYS MAV.. Assessment of sugarcane genetic diversity using retrotransposons. Em: International Symposium on Plant Molecular Biology, 2003, Barcelona. ISPMB Book of Abstract and Poster, 2003.
6. HASHIMOTO, R. Y. ; SLUYS MAV.. Expression analysis of Retrolyc 1 retrotransposon of Lycopersicon peruvianum controlled by U3 regulatory region. Em: XXXª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2001, Caxambu. Livro de resumos, v. 01, p. 45-45, 2001.
7. MORGANTE, P. G. ; NAKABASHI, M. ; MENCK, Carlos Frederico Martins ; SLUYS MAV.. Investigating the Arabidopsis thaliana XPB Gene Duplication. Em: XXXª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2001, Caxambu. Bioquímica e Biologia Molecular de Plantas, p. 45-45, 2001.
8. NAKABASHI, M. ; MORGANTE, P. G. ; MENCK, Carlos Frederico Martins ; SLUYS MAV.. GUS expression analysis driven by AtXPB2 promoter gene. Em: xxxª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2001, Caxambu. Bioquímica e Biologia Molecular de Plantas, p. 45-45, 2001.
9. TAKITA, M. A. ; SLUYS MAV. ; MACHADO, M. A.. Identification of reverse transcriptase homologous sequences in citrus. Em: xxxª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2001, Caxambu. Bioquímica e Biologia Molecular de Plantas, p. 54-54, 2001.
Artigos aceitos para publicação (1)
1. RODY, HUGO V. S. ; CAMARGO, LUIS E. A. ; CRESTE, SILVANA ; Van Sluys, Marie-Anne ; RIESEBERG, LOREN H. ; MONTEIRO-VITORELLO, CLAUDIA B.. Arabidopsis-Based Dual-Layered Biological Network Analysis Elucidates Fully Modulated Pathways Related to Sugarcane Resistance on Biotrophic Pathogen Infection. Frontiers in Plant Science. 2021. Qualis: A1
Apresentações de trabalho (28)
1. Van Sluys, M. A. CIÊNCIA ABERTA: COMO AVANÇAR? UM OLHAR DA PRÁTICA DA CIÊNCIA. 2025. Apresentação de Trabalho/Simpósio
2. Van Sluys MA. A evolução dos organismos fotossintetizantes. 2025. Apresentação de Trabalho/Simpósio
3. Van Sluys, Marie Anne. Introduction to TE Biology: dynamics and fucntions. 2025. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
4. ANTONELLO, P. C. ; LEITE JR, J. N. ; CIRINO, H. ; TURRINI, P. ; ZERILLO, MARCELO M. ; ISHIDA, JULIANE K. ; RODY, HUGO V. S. ; VITORELLO, C. B. M. ; SEVERO, R. ; CAMARGO, L. E. A. ; BINI, ANDRESSA P. ; CRESTE, SILVANA ; Van Sluys, M. A.. Gene co-expression networks based on tolerant and susceptible transcriptome enable a broad view of plant responses to differing pathogens. 2023. Apresentação de Trabalho/Outra
5. MIRANDA, RAQUEL P. ; TURRINI, PAULA C. G. ; BONADIO, D. ; ZERILLO, MARCELO M. ; BERSELLI, ARTHUR P. ; BINI, ANDRESSA P. ; CRESTE, SILVANA ; Van Sluys, M.-A.. What is it, in these Xanthomonas albilineans genomes, that makes a difference in the disease's varying intensities?. 2021. Apresentação de Trabalho/Simpósio
6. Van Sluys, Marie Anne. W954-Virus-like Attachment Sites as Structural Landmarks of Plants Retrotransposons. 2017. Apresentação de Trabalho/Simpósio
7. Van Sluys, M. A. Aplicações do genoma em Biotecnologia. 2017. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
8. VAN SLUYS, M.-A. ; Van Sluys, Marie Anne. Transposable elements between two karma; evolutionary and cell biology viewpoints. 2017. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
9. Van Sluys, Marie Anne; MALUF, D. Q. ; JESUS, Erika Maria de ; HERNANDES, J. ; SCHIAVO-MUCHE, A. P.. Tnt1 retrotransposon and ethylene mediates tobacco defense responses. 2016. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
10. Van Sluys, Marie Anne. Funding Agency Panel Sao Paulo Research Foundation FAPESP. 2016. Apresentação de Trabalho/Simpósio
11. Van Sluys, M. A. O olhar de McClintock sobre o vivo. 2016. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
12. Van Sluys, M. A.; CRUZ, C. H. B.. Science and Technology in the State of Sao Paulo. 2016. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
13. Van Sluys, M. A.; CRUZ, C. H. B.. FAPESP e o financiamento à pesquisa no Estado de São Paulo. 2016. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
14. Van Sluys, Marie Anne. Sugarcane genome and BIOEN initiative. 2014. Apresentação de Trabalho/Simpósio
15. Van Sluys, Marie Anne. Energy security: BIOEN Research Program and the Sugarcane genome. 2014. Apresentação de Trabalho/Simpósio
16. Van Sluys, Marie Anne. Sugarcane genome sequence. 2014. Apresentação de Trabalho/Simpósio
17. SLUYS, M. A. ; Van Sluys, Marie Anne. The Role of Science in Coping with the Grand Challenges Facing Humanity. 2013. Apresentação de Trabalho/Simpósio
18. Van Sluys, Marie Anne. Sugarcane Genomics. 2013. Apresentação de Trabalho/Simpósio
19. VAN SLUYS, M A. Transposable elements in sugarcane. 2007. Apresentação de Trabalho/Simpósio
20. VAN SLUYS, M A. Plant genomics in Brazil. 2007. Apresentação de Trabalho/Simpósio
21. VAN SLUYS, M A; ROSSI, M. ; SACCARO, Nilo ; JESUS, Erika Maria de ; DOMINGUES, Douglas Silva ; COSTA, Ana Paula Pimentel. A genomic approach to depict transcriptionally active transposable elements in sugarcane. 2006. Apresentação de Trabalho/Simpósio
22. VILTORELLO, C. B. M. ; LIMA, W. ; VARANI, A. M. ; SOUZA, R. ; VASCONCELOS, Ana Tereza ; MENCK, C. F. M. ; VAN SLUYS, M A. Plant pathogens comparative genomics: genetic móbile elements as sources of gene diversity. 2006. Apresentação de Trabalho/Simpósio
23. VAN SLUYS, M A; LIMA, W. ; MENCK, C. F. M. ; BOGDANOVE, A. ; LEACH, J. E.. Comparative genomic analysis among Xanthomonadales. 2006. Apresentação de Trabalho/Simpósio
24. VAN SLUYS, M A. Horizontal gene transfer input in Xanthomonas genome diversification. 2005. Apresentação de Trabalho/Simpósio
25. VAN SLUYS, M A; OLIVEIRA, M. C. ; ZERILLO, Marcelo ; VARANI, A. M. ; VITORELLO, C. B. M.. Genetic mobile elements induced mutations and their impact genome evolution. 2005. Apresentação de Trabalho/Simpósio
26. ROSSI, M. ; ARAÚJO, P. G. ; JESUS, Erika Maria de ; VARANI, A. M. ; VAN SLUYS, M A. Comparative analysis of sugarcane expressed transposable elements. 2004. Apresentação de Trabalho/Simpósio
27. VAN SLUYS, M A; VITORELLO, C. B. M.. Mobile genetic elements contribution to the differentiation of closely related Xanthomonas genomes. 2004. Apresentação de Trabalho/Simpósio
28. VAN SLUYS, M A. Xylella fastidiosa and comparative analysis to whole genome sequences of other phytopathogenic bacteria. 2003. Apresentação de Trabalho/Simpósio
Demais tipos de produção bibliográfica (2)
1. HERNANDES, J. ; MALUF, D. Q. ; JESUS, Erika Maria de ; Lopes FR ; PARMIGIANI, R. B. ; KAROLSKI, Bruno ; DIAS, H. M. ; JACOBS, T. B. ; CAMARGO, A. A. ; KITAJIMA, J.P. ; Van Sluys, M. A.. Evidence-based gene expression modulation correlates with transposable element knock-down. 2020. Divulgação Científica
2. SECKENDORF, M. V. ; Zerillo, Marcelo M ; BONADIO, D. ; VANSLUYS, M A ; SLUYS MAV.. Projeto GEMACana. Sao Paulo. 2020. Divulgação Científica

Produção técnica

Programas de computador com registro (0)
Programas de computador sem registro (0)
Produtos tecnológicos (0)
Processos ou técnicas (5)
1. SLUYS MAV.; ROSSI, M. ; ARAÚJO, P. G.. Retroprom: método de obtenção e uso. 2004.
2. SLUYS MAV.; VANSLUYS, M A ; SOUZA, G.. O Genoma da Cana de açucar. 2020.Programa de rádio ou TV/Entrevista
3. Van Sluys M.A.; Margarido, Gabriel R. A.. Um quebra-cabeça genômico. 2019.Programa de rádio ou TV/Entrevista
4. Van Sluys, Marie Anne. De Bacteria e Louco todo mundo tem um pouco. 2016.
5. MOURA, M. ; Van Sluys, Marie Anne. DNA móvel. 2012.Programa de rádio ou TV/Entrevista
Trabalhos técnicos (0)
Demais tipos de produção técnica (0)

Produção artística

Total de produção artística (0)

Orientações em andamento

Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (2)
1. Naiara Almeida de Toledo. A VIA DE RECUPERAÇÃO DA MOLÉCULA DE TIAMINA EM PLANTA. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências (USP), Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2023.
  Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
2. Joel Nunes Junior. Detecção e quantificação de long non-coding RNA e elementos de transposição em experimento piloto da interação cana e Xanthomonas albilineans. Tese (Doutorado em Bioinformatica) - Instituto de Biociências (USP), Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2023.
  Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Dissertação de mestrado (2)
1. Guilherme Yudi Aiabe Sagawa. Investigando o Endomicrobioma da Cana-de-Açúcar: Estratégias, Desafios e Novas Abordagens. Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2025.
  Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
2. Dora Takyia Bonadio. Descrição de nova partícula viral encontrada em linhagem fitopatogênica de Xanthomonas albilineans.. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências (USP), Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2022.
  Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (1)
1. Luciana Renata de Almeida. Identificação de estruturas de proteínas utilizando o AphaFold em dados de transcriptoma de planta-microorganismos. Orientação de outra natureza. Instituto de Biociências (USP). Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, . Início: 2024.
  Orientador: Marie-Anne Van Sluys.

Supervisões e orientações concluídas

Supervisão de pós-doutorado (19)
1. Helba Cirino. . Instituto de Biociências (USP), Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2024.
  Supervisor: Marie-Anne Van Sluys.
2. Juliane Karina Ishida. . Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2018.
  Supervisor: Marie-Anne Van Sluys.
3. Mariane Sousa-Baena. . Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2018.
  Supervisor: Marie-Anne Van Sluys.
4. Paula Turrini. . Instituto de Biociências, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2017.
  Supervisor: Marie-Anne Van Sluys.
5. Jose Hernandes. . Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2016.
  Supervisor: Marie-Anne Van Sluys.
6. Renata Souza de Oliveira. . Instituto de Biociências, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2014.
  Supervisor: Marie-Anne Van Sluys.
7. Cushla J Metcalfe. . Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2014.
  Supervisor: Marie-Anne Van Sluys.
8. Edgar Andres Ochoa Cruz. . Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2013.
  Supervisor: Marie-Anne Van Sluys.
9. Fabiana Firetti-Leggieri. . Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2013.
  Supervisor: Marie-Anne Van Sluys.
10. Sarah Gomes de Oliveira. . Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2013.
  Supervisor: Marie-Anne Van Sluys.
11. Nathalia de Setta Costa. . Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2011.
  Supervisor: Marie-Anne Van Sluys.
12. Cushla J. Metcalfe. Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2009.
  Supervisor: Marie-Anne Van Sluys.
13. Erika Maria de Jesus. . Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2009.
  Supervisor: Marie-Anne Van Sluys.
14. Robson Francisco de Souza. . Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2008.
  Supervisor: Marie-Anne Van Sluys.
15. Hana Paula Masuda. Estudo da duplicação gënica AtXPB1 e AtXPB2 de Arabidopsis thaliana. Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2007.
  Supervisor: Marie-Anne Van Sluys.
16. Maria Magdalena Rossi. . Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2004.
  Supervisor: Marie-Anne Van Sluys.
17. Denise Ribeiro. . Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2003.
  Supervisor: Marie-Anne Van Sluys.
18. Paula Goçalves de Araújo. . Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2003.
  Supervisor: Marie-Anne Van Sluys.
19. Ana Paula Pimentel Costa. . Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2001.
  Supervisor: Marie-Anne Van Sluys.
Tese de doutorado (25)

Vania Gabriela Sedano. Metabolismo de sacarose e a interação planta microrganismos. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências, . 2024.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Henrique Moura Dias. INVESTIGANDO OS ASPECTOS BIOLÓGICOS DE THI1 EM PLANTAS. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências, . 2024.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Diana Suzana Martinez Corcino. Arquitetura molecular do Locus Xa21 em resposta à infecção por Xanthomonas em cana de açúcar. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2024.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Raquel Paulini Miranda. Análise comparativa de genomas de quatro estirpes de Xanthomonas albilineans e prospecção de genes alvo para estudo de associação a fenótipos conhecidos. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2022.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Augusto Cesar Crivellari. PROSPECÇÃO in silico DE PEQUENOS RNAs NA RELAÇÃO DE FUNGOS FITOPATOGÊNICOS E SEUS HOSPEDEIROS. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências, . 2019.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Paula Cristina Gasperazzo Turrini. INFLUÊNCIA DE ELEMENTOS MÓVEIS EM LINHAGENS DE XANTHOMONAS ORYZAE. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2013.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Edgar Andres Ochoa Cruz. Estudos de elementos de transposição em plantas: elementos tipo hAT em cana de açucar. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2012.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Andreia Prata Vieira. Homólogos a At-thi1 em cana de açúcar: estudo molecular e funcional.. Tese (Doutorado em INTERNACIONAL BIOLOGIA) - Universidade de São Paulo, . 2012.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Gesiele Almeida Barros de Carvalho. Impacto dos elementos transponíveis nos genomas de estirpes brasileiras de Bradyrhizobium. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Instituto de Biociências, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2012.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Fabrício Martins Lopes. Redes complexas de expressão gênica: síntese, identificação, análise e aplicações.. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2011.
Supervisor: Marie-Anne Van Sluys.
Danielle Maluf Quintanilha. Discriminação de fenótipos Tnt1-U3 específicos em linhagens de Nicotiana RNAi. Tese (Doutorado em Internacional Biologia Vegetal) - Instituto de Biociências, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2010.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
GUILHERME MARCELLO QUEIROGA CRUZ. RETROTRANSPOSONS DAS FAMILIAS OPIE, HOPSCOTCH E MAGGY: DESVENDANDO AS INTERACOES COM O GENOMA DA CANA-DE-ACUCAR. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2009.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Bruno Karolski. Análise do perfil genômico e de expressão gênica de microorganismos em diferentes áreas afetadas por BTEX na cidade de Cubatão, SP. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2009.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Jonas Weissmann Gaiarsa. Genômica comparativa de enzimas de degradação da parede celular vegetal em Xanthomonas, Xylella e Stenotrophomonas. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2008.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Érika Maria de Jesus. Caracterização da diversidade de famílias de elementos transponíveis expressos em cana-de-açúcar (Saccharum spp). Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Botânica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2007.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Maria Elisa Manetti. Diversidade de retrotransposons similares a Retrolyc1 em Solanum. Tese (Doutorado em Pos Graduação em Botânica) - Instituto de Biociências, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2007.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Myna Nakabashi. Genes parálogos AtXPB1 e AtXPB2: estudo da duplicação e expressão em Arabidopsis thaliana.. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Botânica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2005.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Alessandro M. Varani. Análise comparativa de integrases de 4 linhagens de Xylella fastidiosa. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências, . 2004.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Regina Yuri Hashimoto Miura. Análise da expressão do retrotransposon Retrolyc1 em Lycopersicon esculentum e Lycopersicon peruvianum. Tese (Doutorado em Pos Graduação em Botânica) - Instituto de Biociências, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2004.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Douglas Silva Domingues. SURE e Garapa: caracterização molecular e distribuição de dois retrotransposons com LTR em cana-de-açúcar. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2004.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Patricia G. Morgante. Organização genômica e estudos da função do gene araXPB em Arabidopsis thaliana. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Botânica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2003.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Marisa Moura Momoli. Aspectos funcionais do gene thi1 em plantas selvagens e mutantes de Arabidopsis thaliana (Brassicaceae). Tese (Doutorado em Pos Graduação em Botânica) - Instituto de Biociências da USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2003.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Marcelo Zerillo. Estrutura do genoma de Leifsonia xuli pv cynodontis e impacto de elementos IS. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2002.
Supervisor: Marie-Anne Van Sluys.
Flavia Stal Papini-Terzi. Estudos de complementação de mutantes de Arabidopsis thaliana com o gene thi1. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Botânica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2001.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Paula Gonçalves de Araújo. Diversidade da Região U3 do retrotransposon Retrolyc1 em quatro espécies do gênero Lycopersicon spp.. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Botânica)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2000.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Dissertação de mestrado (10)

Rike Overmeyer. Colonization of Grasses by Xanthomonas albilineans: Using a Scissor-clip Inoculation Method to Study Plant-Pathogen Interactions. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Botânica)) - Universidade de São Paulo, . 2025.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Arthur Peixoto Berselli. ESTUDO DA COLONIZAÇÃO DE DIFERENTES VARIANTES DE XANTHOMONAS ALBILINEANS EM SACCHARUM SPP. Dissertação (Mestrado em Pos Graduação em Botânica) - Instituto de Biociências, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2022.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Geovani Tolfo Ragagnin. Uso do ?Polimorfismo baseado na inserção de Retrotransposon? (RBIP) mais o PCR quantitativo na verificação de associação entre genes de resistência e Elementos Transponíveis. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2015.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Vania Gabriela Sedano Partida. Caracterização genômica dos genes s6pp de Saccharum spp. vinculados na produção de sacarose.. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2015.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Mayra Akemi Kuroki. Desenvolvimento de Método de Identificação de Promotores de Cana-de-Açúcar: Análise comparativa de clonagem dirigida e clonagem aleatória. Dissertação (Mestrado em Programa Interunidades Biotecnologia) - Instituto de Biociências, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2012.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Juliane Karine Ishida. Perfil transcricional do retrotransposon Retrolyc 1 em mutantes de tomate Micro-Tom e em suspensão celular de fumo.. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós Graduação em Botânica) - Instituto de Biociências da USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2008.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Bruno Karolski. Estudo da inativação por RNAi de retrotransposons da família Tnt1. Dissertação (Mestrado em Pos Graduação em Botânica) - Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2007.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Priscila Mayumi Kashiwabara. Interferência na expressão do gene thi1 de Arabidopsis thaliana e seus efeitos biológicos. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2003.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Danyella Doggini. Detecção in vivo da atividade promotora do elemento de transposição Ac em Arabidopsis thaliana através da utilização do gene reporter GFP. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2001.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Leonardo P. Farias. Caracterização genômica e investigação da região promotora do gene thi1 de Arabidopsis thaliana. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2001.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (19)

Laura Naomi Yamada. O efeito da luz na biologia de Xanthomonas albilineans. Iniciação Científica - Instituto de Biociências (USP), Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2024.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Guilherme Yudi Aiabe Sagawa. Xanthomonas albilineans e Gluconacetobacter diazotrophicus: influência no microbioma da cana de açúcar. (Graduando em Ciências Moleculares) - Instituto de Biociências (USP), . 2023.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Eduarda Figueiredo Ribeiro. Análise do impacto de genes presentes em elementos genéticos móveis do genoma de Xanthomonas albilineans em seus perfis patogênicos. (Graduando em Ciências Biomédicas) - Instituto de Ciência Biomédicas (USP), . 2022.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Dora Takyia Bonadio. Estudos fisiológicos comparativos in vitro de isolados de Xanthomonas albilineas com diferentes graus de agressividade da doença ?escaldadura da folha? de cana-de-açúcar. Iniciação Científica - Instituto de Biociências, . 2021.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Gabrielle O S V Navarro. Obtenção de 04 linhagens de Xanthonomas albilineans expressando cada uma uma proteína fluorescente. (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal de Pelotas, . 2017.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Ana Paula Muche Schiavo. Caracterização da relação entre o retrotransposon tnt1 e o ciclo celular de Nicotiana tabacum. (Graduando em Ciências Moleculares) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2015.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Sirlene da Silva Rodrigues. Identificação e mapeamento das proteínas de repetição do pentatricopeptídeo em cultivares modernas de cana-de-açúcar. Iniciação Científica - Intituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2015.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Andreia Prata Vieira. Estudo da atividade transcricional de três diferentes cópias de retrotransposons da linhagem evolutiva DEL em cana-de-açúcar.. Iniciação Científica - Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2012.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Mayra Akemi Kuroki. ANÁLISE DA REGIÃO PROMOTORA DO ELEMENTO RETROSOL. Iniciação Científica - Intituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2008.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Monique Gonçalves. Análise do padrão de inserção dos transposons IS em 9 genomas de Xanthomonas spp. Iniciação Científica - Instituto de Biociências, . 2008.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Danielle Quintanilha. Estudo de interferência de RNA na expressão e atividade de Tnt1 em plantas de tabaco. Iniciação Científica - Instituto de Biociências, . 2008.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Jonas Weissmann Gaiarsa. Anãlise das toxinas do tipo hemaglutininas, RTX e killer/antikiller presentes em xylella fastidiosa.. Iniciação Científica - Instituto de Biociências, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2007.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Edgar Takashi Maki. Inativação por RNAi de seqüências similares à transcriptase reversa do retroelemento Tnt1 em linhagem celular BY-2 de Nicotiana tabacum (Solanaceae). Iniciação Científica - Instituto de Biociências, . 2007.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Daniela Kajihara. Atividade transcricional associada a região LTR de retrotransposons. (Graduando em Licenciatura Plena em Ciências Biológicas) - Centro Universitário Fundação Santo André, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2006.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Guilherme Marcello Queiroga Cruz. Uso de cDNA-AFLP para indentificar genes envolvidos na floração de cana de açúcar. Iniciação Científica - Instituto de Biociências, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2006.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Nilo Saccaro Junior. Estudo da atividade transcricional de retrotransposons de cana de açúcar. (Graduando em Ciências Bilógicas) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2005.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Juliane Karine Ishida. Regulação da expressão gênica de Retrolyc1. (Graduando em Ciências Moleculares) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2005.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Gabriela de Azevedo Couto. Análise comparativa da expressão de Retrolyc 1B isolado do genoma de Lycopersicon.. Iniciação Científica - Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2001.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Priscila Mayumi Kashiwabara. Otimização das condições de transformação in vivo de Arabidopsis thaliana.. Iniciação Científica - Instituto de Biociências, . 2000.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Orientações de outra natureza (14)

Guilherme Yudi Aiabe Sagawa. Curadoria na montagem ea notação de genomas bacterianos. Orientação de outra natureza - Instituto de Biociências (USP), Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2024.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Naiara Almeida de Toledo. Capacitação em técnicas moleculares e crescimento controlado de plantas. Orientação de outra natureza - Instituto de Biociências (USP), . 2023.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Larissa Fernanda Quintino. Biotecnologia bacteriana: construção de vetores de expressão e edição genômica. Orientação de outra natureza - Instituto de Biociências (USP), . 2021.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Joel Nunes Junior. Detecção e quantificação de long non-coding RNA e elementos de transposição em experimento piloto da interação cana e Xanthomonas albilineans. Orientação de outra natureza - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2020.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Marcelo Marques Zerillo. Plataforma GEMAC de alvos, anotação e integração de resultados.. Orientação de outra natureza - Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2018.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Diana Suzana Martinez Corcino. Desenvolvimento de sistema Taqman® para determinação alélica de locus RGA em cana-de-açúcar. Orientação de outra natureza - Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2018.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Vania Gabriela Sedano Partida. Treinamento em manutenção de estoques de bactérias, linhagens de plantas e estratégias moleculares de construção gênica.. Orientação de outra natureza - Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2015.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Veronica Meyer Gaiarsa. Tratamento Bioinformático em Larga Escala de Sequências de Cana de Açúcar e busca de padrões em elementos de transposição.. Orientação de outra natureza - Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2014.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Jonas Weissmann Gaiarsa. Anotação de 1000 clones BAC do genoma da cana de açúcar: banco de dados, integração e interface web.. Orientação de outra natureza - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2013.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Rosario Alejandra Medina Rodríguez. Tratamento Bioinformático em Larga Escala de Sequências de Cana de Açúcar e busca de padrões em elementos de transposição.. Orientação de outra natureza - Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2013.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Theodore Milton Fagin. Treinamento em manutenção de estoques de bactérias, linhagens de plantas e estratégias moleculares de construção gênica.. Orientação de outra natureza - Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2013.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Mayra Akemi Kuroki. Treinamento Técnico em biologia molecular de plantas com enfoque em bioenergia. Orientação de outra natureza - Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2009.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Kleber Alves Gomes. Título em português Sequenciamento de DNA com uso de novas tecnologias e análise comparativa com metodologia convecional por método de Sanger.. Orientação de outra natureza - Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2009.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.
Caroline Roullier. Análise comparativa das sequencias de elementos de transposição entre o milho moderno e antigo. Orientação de outra natureza - Instituto de Biociências, . 2005.
Orientador: Marie-Anne Van Sluys.

Projetos de pesquisa

Total de projetos de pesquisa (2)

2018-Atual. GEMACANA: Contribuição de genes, genomas e elementos de transposição na interação entre plantas e microorganismos: estudo de caso em cana de açúcar.
Descrição: A interação planta-microorganismos representa um dos processos de fundamental relevância para o funcionamento de ecossistemas naturais, bem como agrícolas. A compreensão de seus componentes e dos processos que controlam essa interação biológica tem potencial de melhorar a produtividade das culturas e monitorar a qualidade ambiental. Este projeto pretende contribuir na elucidação deste sistema complexo através da utilização de ferramentas moleculares e de bioinformática dos genomas para descobrir os principais genes que controlam e / ou medeiam a interação de cana de açúcar com três patógenos (Leifsonia xyli subsp xyli;. Xanthomonas albilineans; Sporisorium scitamineum) e uma bactéria fixadora de nitrogênio (Gluconacetobacter) considerada promotora de crescimento para a cana. Esses organismos têm uma interação biotrófica/hemibiotrófica com cana de açúcar e os aspectos moleculares sob estas condições são geralmente menos compreendidas. O nosso objetivo é comparar e contrastar respostas moleculares através das interações individuais tanto de cana de açúcar quanto dos microrganismos envolvidos. Especificamente, (i) analisaremos padrões de expressão de um conjunto de genes previamente identificados análogos a genes de resistência (RGA), espécies reativas de oxigênio (ROS), metabolismo de carboidratos, síntese de hormônios e seu controle, elementos de transposição, e uma família de genes relacionados com a edição de genes em organelas e conhecido por ter membros que estão envolvidos na regulação das defesas de plantas via Na-siRNA (pentatricopeptide) bem como de genes envolvidos em respostas metabólicas específicas dos microrganismos; (ii) avaliar e comparar entre espécies de microrganismos os padrões de expressão de genes microbianos com um foco particular em moléculas secretadas entre os quais esperamos encontrar moléculas efetoras; (iii) avaliar e comparar as mudanças nos padrões de expressão durante duas infecções mistas, e (iv) avaliar e comparar as mudanças no microbioma do hospedeiro, como resultado da interação com os micróbios mencionados. Como um produto de extensão, esperamos fornecer informações moleculares sobre a biologia da cana ao interagir com vários micróbios almejando o desenvolvimento de um kit de diagnóstico para monitorar canaviais e construir um banco de dados "phytobiome" de cana que seja abrangente e que poderia ser usado em estudos comparativos com outras Poaceae.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (3) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (9) . Integrantes: Marie-Anne Van Sluys - Coordenador / Luis Eduardo Aranha Camargo - Integrante / Claudia Barros Monteiro-Vitorello - Integrante / Silvana Creste - Integrante / Marcelo Zerillo - Integrante / Paula Turrini - Integrante / Juliane Ishida - Integrante / Tatiane Correa - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
Membro: Marie-Anne Van Sluys.
2009-Atual. Genômica de cana de açúcar: elemetos de transposição contribuintes para diversidade gênica, genética e genômica
Descrição: Este projeto está integrado ao programa BioEn-FAPESP. A cana de açúcar é uma das fontes mais importantes para a produção de biocombustíveis no Brasil. Também ocupa posição de destaque no agronegócio do Estado de São Paulo. A produção de biocombustíveis a partir de cana de açúcar é dependente de sacarose como matéria prima. Espera-se que a indústria sucro alcooleira brasileira ganhe em competividade desde que haja um aumento de produtividade (biomassa) garantindo a preservação do meio ambiente evitando-se o uso de novas terras. Aumento de produção de biomassa pode ser atingido através do uso de técnicas que permitam o monitoramento e modulação do metabolismo de sacarose em condições adequadas e restritivas de crescimento da planta, como por exemplo condições de pouca disponibilidade de água. O uso potencial do bagaço como fonte de biomassa é dependente da disponibilização do carbono fixado nos polímeros que constituem a parede celular. O presente projeto tem como objetivo gerar um sequenciamento parcial de duas cultivares de cana de açúcar (R570 e SP80-3280) de modo a subsidiar o desenvolvimento de ferramentes moleculares que poderão auxiliar na compreensão deste genoma híbrido e poliplóide. A descoberta de genes e a identificação das regiões regulatórias envolvidas no metabolismo de sacarose e partição dos esqueletos de carbono na planta são algumas das áres na pesquisa básica que serão beneficiadas pelo presente estudo. Programas de melhoramento também poderão ser beneficiados tendo a cesso a informações moleculares com potencial ao desenvolvimento de marcadores moleculares. Os cultivares modernos de cana de açúcar são híbridos de Saccharum officinarum e Saccharum spontaneum. Seu genoma monoplóide é estimado em aproximadamente 1Gb comparável em escala aos genomas do milho e do ser humano. Utilizar-se-á uma abordagem combinada de seqüências geradas por pirosequenciamento e pelo método clássico de Sanger de 1000 clones de BAC. Uma coleção de ESTs geradas pelo projeto. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (7) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (6) . Integrantes: Marie-Anne Van Sluys - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Marie-Anne Van Sluys.

Prêmios e títulos

Total de prêmios e títulos (6)

Membro Titular da ABC, Academia Brasileira de Ciências.. 2016.
Membro: Marie-Anne Van Sluys.
Membro Titular da ACIESP, ACIESP.. 2015.
Membro: Marie-Anne Van Sluys.
Menção Honrosa pelo projeto de IC desenvolvido por Nilo Saccaro-Junior, 13 SICUSP.. 2005.
Membro: Marie-Anne Van Sluys.
Medalha de Mérito Científico e Tecnológico, Governo do Estado de São Paulo.. 2000.
Membro: Marie-Anne Van Sluys.
Professora homenageada do Departamento, Pelos Formandos em Ciências Biológicas.. 2000.
Membro: Marie-Anne Van Sluys.
Prêmio Mulher do Ano juntamente com Elizabeth Martins, Ana Claudia Rasera, Anamaria A. Camargo, Claudia Monterio-Vitorello, Marilis Marques Valle e Mariana C de Oliveira, Revista Cláudia.. 2000.
Membro: Marie-Anne Van Sluys.

Participação em eventos

Total de participação em eventos (9)

77ª Reunião Anual da SBPC.Mesa Redonda Ciëncia Aberrta. 2025. (Simpósio).
77ª Reunião Anual da SBPC.Evolução é fato. 2025. (Simpósio).
First International Conference on Genomic Impact of Eukaryotic Transposable Elements. A genomic approach to depict transcriptionalle active transposable elements in sugarcane. 2006. (Congresso).
International workshop on Xanthomonas Genome Research: current issues and future challenges. Horizontal gene transfer input in Xanthomonas genome diversification. 2005. (Congresso).
10th International congress for culture collections: innovative roles of biological resource centers. Mobile genetic elements contribution to the differentiation of closely related Xanthomonas genomes. 2004. (Congresso).
TEGERM: analysis and exploitation of germplasm using trasnposable element molecular marker.TEGERM meeting. 2004. (Outra).
Keystone Symposia on Transposition and other Genome rearrangements. Keystone Symposia on Transposition and other Genome rearrangements. 2003. (Congresso).
A história do projeto Genoma.Seminários de Biologia Funcional e Molecular. 2002. (Seminário).
Is TH11 protein from Arabidopsis a bifunctional protein?.Simpósio Brasil-Coréia: da Pesquisa à Biotecnologia. 2001. (Simpósio).

Organização de eventos

Total de organização de eventos (8)

SLUYS MAV.; VANSLUYS, M A ; CAMARGO, A. A. ; MELLO, L. E. ; ZAGO, M. A.. Simpósio Genoma 20+2. 2022. Outro
Van Sluys, Marie Anne; Vasconcelos, Ana Tereza Ribeiro. Workshop on Biodiversity and Biobank in Brazil. 2017. Outro
VAN SLUYS, M.A.; SILVA FILHO, M. C. ; CARRARI, F. ; ULLOA, R.. IPMB 2015. 2015. Congresso
Van Sluys, Marie Anne. UEA/NRP - Brazil workshop on plant sciences. 2012. (Outro).. . 0.
Van Sluys, Marie Anne. International Workshop about the Ethanol Combustion Engines. 2012. (Outro).. . 0.
SOUZA, Glaucia M ; CORTEZ, L. A. B. ; CANTARELLA, H. ; SILVA, C. ; CHAIMOVICH, H. ; Van Sluys, Marie-Anne. First Braziliain Bioenergy Science and Technology Conference - BBEST. 2011. Congresso
VAN SLUYS, M A; MACHADO, M. A. ; SOUZA, A. A.. International Workshop on Xylella fastidiosa. 2007. Outro
SCORTECCI, K. C. ; PERES, L. E. P. ; COSTA, A. P. P. ; VAN SLUYS, M A. I Simposio Brasileiro de Genetica molecular de plantas. 2007. Congresso

Lista de colaborações

Colaborações endôgenas (10)

Marie-Anne Van Sluys ⇔ Carlos Frederico Martins Menck (17.0)
MASUDA, HANA PAULA ; NAKABASHI, MYNA ; MORGANTE, PATRICIA G ; KAJIHARA, DANIELA ; DE SETTA, NATHALIA ; MENCK, Carlos Frederico Martins ; Van Sluys, Marie-Anne. Evidence for sub-functionalization of tandemly duplicated XPB nucleotide excision repair genes in Arabidopsis thaliana. GENE. v. 754, p. 144818, 2020. Qualis: A4
LIMA, W. ; PAQUOLA, A. C. ; VARANI, A. M. ; VANSLUYS MA ; MENCK, C. F. M.. Laterally transferred genomic islands in Xanthomonadales related to pathogenicity and primary metabolism.. FEMS Microbiology Letters. v. 281, p. 87-97, 2008. Qualis: B2
Godoi, P. H. C. ; Galhardo, R. S. ; LUCHE, D. D. ; Van Sluys, M.-A. ; MENCK CF ; Oliva, G.. Structure of the Thiazole Biosynthetic Enzyme THI1 from Arabidopsis thaliana. The Journal of Biological Chemistry. v. 281, p. 30957-30966, 2006. Qualis: A1
MORGANTE, P. G. ; BERRA, C. M. ; NAKABASHI, M. ; COSTA, R. M. A. ; MENCK CF ; M.A. VanSluys. Functional XPB/RAD25 redundancy in Arabidopsis genome: characterization of AtXPB2 and expression analysis.. Gene (Amsterdam), Netherlands. v. 344, p. 93-103, 2005. Qualis: Não identificado (GENE , NETHERLANDS)
RIBEIRO, D. ; FARIAS, L. P. ; ALMEIDA, J. D. ; KASHIWABARA, P. M. ; RIBEIRO, A. F. C. ; SILVA FILHO, M. C. ; MENCK, C. F. M. ; SLUYS MAV.. Functional characterization of the thi1 promoter region from Arabidopsis thaliana. Journal of Experimental Botany, England. v. 56, n. 417, p. 1797-1804, 2005. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY, ENGLAND)
LIMA, W. ; Lima, Wanessa C. ; Menck, C. F. M. ; Sluys, Marie-Anne Van ; Menck, Carlos F.M.. Non-gamma-proteobacteria gene islands contribute to the Xanthomonas genome. Journal of Integrative Biology / Omics (Larchmont). v. 9, n. 2, p. 160-172, 2005. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOLOGY / OMICS)
VINCENTZ, Michel ; CARA, F A ; OKURA, V K ; SILVA, F R da ; et al ; SLUYS MAV. ; NOBREGA, Francisco Gorgonio da ; ARRUDA, Paulo ; MENCK, Carlos Frederico Martins. Evaluation of monocot and eudicot divergence using the sugarcane transcriptome.. Plant Physiology (Bethesda), Estados Unidos. v. 134, n. 3, p. 951-959, 2004. Qualis: Não identificado (PLANT PHYSIOLOGY , ESTADOS UNIDOS)
NASCIMENTO, A. L. T. O. ; KO, A. I. ; MARTINS, E. A. L. ; MONTEIRO-VITORELLO, C. B. ; HO, P. L. ; HAAKE, D. A. ; Verjovski-Almeida, S. ; HARTSKEERL, R. A. ; MARQUES, M. V. ; OLIVEIRA, M. C. ; MENCK, C. F. M. ; LEITE, L. C. C. ; CARRER, H. ; COUTINHO, L. L. ; DEGRAVE, W. M. ; DELLAGOSTIN, O. A. ; EL-DORRY, H. ; FERRO, E. S. ; FERRO, M. I. T. ; FURLAN, L. R. ; et.al. Comparative genomics of two Leptospira interrogans serovars reveals novel insights into physiology and pathogenesis.. Journal of Bacteriology, estados unidos. v. 186, n. 7, p. 2164-2172, 2004. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF BACTERIOLOGY, ESTADOS UNIDOS)
MONTEIRO-VITORELLO, Claudia B. ; Camargo, Luis E. A. ; Van Sluys, Marie A. ; Kitajima, João P. ; Truffi, Daniela ; do Amaral, Alexandre M. ; Harakava, Ricardo ; de Oliveira, Julio C. F. ; Wood, Derek ; de Oliveira, Mariana C. ; Miyaki, Cristina ; Takita, Marco A. ; da Silva, Ana C. R. ; Furlan, Luis R. ; Carraro, Dirce M. ; Camarotte, Giovana ; Almeida, Nalvo F. ; Carrer, Helaine ; Coutinho, Luiz L. ; SETUBAL, J. C. ; et.al. The genome sequence of the gram-positive sugarcane pathogen Leifsonia xyli subsp. xyli. Molecular Plant-Microbe Interactions, United States. v. 17, n. 8, p. 827-836, 2004. Qualis: Não identificado (MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS, UNITED STATES)
VETTORE, A. ; da SILVA, F. R. ; KEMPER, E. ; SOUZA, G. M. ; da SILVA, A. M. ; FERRO, M. I. ; HENRIQUE-SILVA, F. ; GIGLIOTI, E. A. ; LEMOS, M. V. ; COUTINHO, L. L. ; NOBREGA, M. P. ; CARRER, H. ; FRANCA, S. C. ; BASSI JUNIOR, M. ; GOLDMAN, M. H. ; GOMES, S. L. ; NUNES, L. R. ; CAMARGO, L. E. A. ; SIQUEIRA, W. J. ; VAN SLUYS, MARIE-ANNE ; et.al. Analysis and functional annotation of an expressed sequence tag collection for tropical crop sugarcane.. Genome Research, United States. v. 13, n. 12, p. 2725-2735, 2003. Qualis: Não identificado (GENOME RESEARCH, UNITED STATES)
CHABREGAS, S. M. ; LUCHE, D. D. ; MENCK, Carlos Frederico Martins ; SLUYS MAV. ; SILVA FILHO, M. C.. Differential usage of two in-frame translational start codons regulates subcellular localization of Arabidopsis thaliana THI1. Journal of Cell Science, England. v. 116, p. 285-291, 2003. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF CELL SCIENCE, ENGLAND)
PAPINITERZI, F. S. ; GALHARDO, R. ; FARIAS, L. P. ; MENCK, C. F. M. ; SLUYS MAV.. Point Mutation is Responsible for Arabidopsis tz-201 Mutant Phenotype Affecting Thiamin Biosynthesis.. Plant and Cell Physiology, Japan. v. 44, n. 8, p. 865-860, 2003.Qualis: Não identificado (PLANT AND CELL PHYSIOLOGY, JAPAN)
da Silva, A. C. R. ; Ferro, J. A. ; Reinach, F. C. ; Farah, C. S. ; Furlan, L. R. ; Quaggio, R. B. ; Monteiro-Vitorello, C. B. ; Sluys, M. A. Van ; Almeida, N. F. ; Alves, L. M. C. ; do Amaral, A. M. ; Bertolini, M. C. ; Camargo, L. E. A. ; Camarotte, G. ; Cannavan, F. ; Cardozo, J. ; Chambergo, F. ; Ciapina, L. P. ; Cicarelli, R. M. B. ; de SOUZA, Robson Francisco ; et.al. Comparison of the genomes of two Xanthomonas pathogens with differing host specificities.. Nature (London), Estados Unidos. v. 417, n. 6887, p. 459-463, 2002. Qualis: Não identificado (NATURE , ESTADOS UNIDOS)
SLUYS MAV.; VITORELLO, C. B. M. ; CAMARGO, L E A ; MENCK, Carlos Frederico Martins ; SILVA, A. C. R. ; FERRO, J. A. ; OLIVEIRA, Mariana Cabral de ; SETUBAL, J. C. ; KITAJIMA, J. P. ; SIMPSON, A. J.. Comparative genomic analysis of plant-associated bacteria.. Annual Review of Phytopathology (Print), Estados Unidos. v. 40, p. 169-189, 2002. Qualis: Não identificado (ANNUAL REVIEW OF PHYTOPATHOLOGY , ESTADOS UNIDOS)
COSTA, R. M. A. ; MORGANTE, P. G. ; BERRA, C. M. ; NAKABASHI, M. ; BRUNEAU, D. ; BOUCHEZ, D. ; SWEDER, K. ; M.A. VanSluys ; MENCK CF. The participation of AtXPB1, the XPB/RAD25 homologue gene from Arabidopsis thaliana, in DNA repair and plant development.. Plant J, Inglaterra. v. 28, n. 4, p. 385-395, 2001. Qualis: Não identificado (PLANT J, INGLATERRA)
Simpson, A. J. G. ; Reinach, F.C. ; Arruda, P. ; Abreu, F. A. ; Acencio, M. ; Alvarenga, R. ; Alves, L. M. C. ; Araya, J. E. ; Baia, G. S. ; Baptista, C. S. ; Barros, M. H. ; Bonaccorsi, E. D. ; Bordin, S. ; Bové, J. M. ; Briones, M. R. S. ; Bueno, M. R. P. ; CAMARGO, A. A. ; Camargo, L. E. A. ; Carraro, D. M. ; DA SILVA, A. M.. The genome sequence of the plant pathogen Xylella fastidiosa.. Nature (London), Londres. v. 406, p. 151-157, 2000. Qualis: Não identificado (NATURE , LONDRES)
MENCK, Carlos Frederico Martins ; Val AL ; PENA, S. D. J. ; KELNER, A. W. A. ; DAMINELLI, A. ; CORDANI, U. G. ; FAIRCHILD, T. R. ; BABINSKI, M. ; CUCCOVIA, I. ; CHAIMOVICH, H. ; FARIA, S. T. ; PORFIRIO-SOUSA, A. L. ; LAHR, D. G. ; VAN SLUYS, M A ; OLIVEIRA, Mariana Cabral de ; VERCESI, A. ; RIBEIRO, G. M. ; WINTER, L. ; COLLI, W. ; SOUZA, S. J. ; et.al. A Evolução é fato. 1 ed. Academia Brasileira de Ciências, 2024. v. 1, p. 222.

Marie-Anne Van Sluys ⇔ Glaucia Mendes Souza (9.0)
SOUZA, GLAUCIA MENDES ; VAN SLUYS, MARIE-ANNE ; LEMBKE, CAROLINA GIMILIANI ; LEE, HAYAN ; MARGARIDO, GABRIEL RODRIGUES ALVES ; HOTTA, CARLOS TAKESHI ; GAIARSA, JONAS WEISSMANN ; DINIZ, AUGUSTO LIMA ; OLIVEIRA, MAURO DE MEDEIROS ; FERREIRA, SÁVIO DE SIQUEIRA ; NISHIYAMA, MILTON YUTAKA ; TEN-CATEN, FELIPE ; RAGAGNIN, GEOVANI TOLFO ; ANDRADE, PABLO DE MORAIS ; DE SOUZA, ROBSON FRANCISCO ; NICASTRO, GIANLUCCA GONÇALVES ; PANDYA, RAVI ; KIM, CHANGSOO ; GUO, HUI ; DURHAM, ALAN MITCHELL ; et.al. Assembly of the 373k gene space of the polyploid sugarcane genome reveals reservoirs of functional diversity in the world's leading biomass crop. GigaScience. v. 8, p. 1-18, 2019. Qualis: A1
ZHANG, JISEN ; ZHANG, XINGTAN ; TANG, HAIBAO ; ZHANG, QING ; HUA, XIUTING ; MA, XIAOKAI ; ZHU, FAN ; JONES, TYLER ; ZHU, XINGUANG ; BOWERS, JOHN ; WAI, CHING MAN ; ZHENG, CHUNFANG ; SHI, YAN ; CHEN, SHUAI ; XU, XIUMING ; YUE, JINGJING ; NELSON, DAVID R. ; HUANG, LIXIAN ; LI, ZHEN ; SOUZA, G. M. ; et.al. Allele-defined genome of the autopolyploid sugarcane Saccharum spontaneum L.. NATURE GENETICS. v. 50, p. 1565-1573, 2018. Qualis: A1
de Setta, Nathalia ; MONTEIRO-VITORELLO, CLÁUDIA BARROS ; METCALFE, CUSHLA JANE ; CRUZ, GUILHERME MARCELO ; DEL BEM, LUIZ EDUARDO ; Vicentini, Renato ; NOGUEIRA, FÁBIO TEBALDI ; CAMPOS, ROBERTA ALVARES ; NUNES, SIDENY LIMA ; TURRINI, PAULA CRISTINA ; VIEIRA, ANDREIA PRATA ; OCHOA CRUZ, EDGAR ANDRÉS ; CORRÊA, TATIANA CAROLINE ; HOTTA, CARLOS TAKESHI ; de Mello Varani, Alessandro ; VAUTRIN, SONIA ; DA TRINDADE, ADILSON SILVA ; DE MENDONÇA VILELA, MARIANE ; LEMBKE, CAROLINA GIMILIANI ; SLUYS MAV. ; et.al. Building the sugarcane genome for biotechnology and identifying evolutionary trends. BMC GENOMICS. v. 15, p. 540, 2014. Qualis: A2
GARCIA, ANTONIO A. F. ; Mollinari, Marcelo ; Marconi, Thiago G. ; SERANG, OLIVER R. ; SILVA, RENATO R. ; VIEIRA, MARIA L. C. ; Vicentini, Renato ; COSTA, ESTELA A. ; MANCINI, MELINA C. ; GARCIA, MELISSA O. S. ; PASTINA, MARIA M. ; Gazaffi, Rodrigo ; MARTINS, ELIANA R. F. ; DAHMER, NAIR ; SFORÇA, DANILO A. ; SILVA, CLAUDIO B. C. ; BUNDOCK, PETER ; HENRY, ROBERT J. ; Souza, Glaucia M. ; Van Sluys, Marie-Anne ; et.al. SNP genotyping allows an in-depth characterisation of the genome of sugarcane and other complex autopolyploids. Scientific Reports. v. 3, p. 3399, 2013. Qualis: A2
JOLY, C. A. ; BERLINCK, R. G. S. ; BOLZANI, V. S. ; HADDAD, C. F. B. ; OLIVEIRA, M. C. ; VAN SLUYS, MARIE-ANNE ; SOUZA, G. M. ; VERDADE, L. M. ; VICTORIA, R. L.. Principais conclusões do workshop conjunto dos programas FAPESP BIOTA-BIOEN-Mudanças Climáticas: ciência e políticas públicas para uma economia mais verde, no contexto da RIO+20. Biota Neotropica. v. 12(2), p. 19-21, 2012. Qualis: B1
SOUZA, GLAUCIA MENDES ; BERGES, HELENE ; BOCS, STEPHANIE ; CASU, ROSANNE ; D'HONT, ANGELIQUE ; FERREIRA, JOÃO EDUARDO ; HENRY, ROBERT ; Ming, Ray ; POTIER, BERNARD ; Sluys, Marie-Anne ; VINCENTZ, Michel ; PATERSON, ANDREW H.. The Sugarcane Genome Challenge: Strategies for Sequencing a Highly Complex Genome. Tropical Plant Biology (Online). v. 4, p. 145-156, 2011. Qualis: A3
Hotta, Carlos T. ; Souza, Amanda P. ; Margarido, Gabriel R. A. ; Sluys, Marie-Anne ; GARCIA, ANTÃ´NIO A. F. ; Domingues, Douglas S. ; Mollinari, Marcelo ; Ochoa, Edgar A. ; Carrer, Helaine ; Melotto-Passarin, Danila M. ; Hoshino, Andrea A. ; Souza, Glaucia M. ; Santos, Melissa O. ; Menossi, Marcelo ; Souza, Anete P. ; Santos, Wanderley D. ; Marconi, Thiago G. ; CRIVELLARI, AUGUSTO CÃ©SAR ; Buckeridge, Marcos S. ; Cruz, Guilherme M. Q. ; et.al. The Biotechnology Roadmap for Sugarcane Improvement. Tropical Plant Biology (Online). v. 3, p. 75-87, 2010. Qualis: A3
MENOSSI, M. ; SILVA-FILHO, M. C. ; Vincentz, M. ; Van-Sluys, M.-A. ; Souza, G. M.. Sugarcane Functional Genomics: Gene Discovery for Agronomic Trait Development. International Journal of Plant Genomics (Print). v. 2008, p. 1-12, 2008. Qualis: A2 (INTERNATIONAL JOURNAL OF GENOMICS)
VETTORE, A. ; da SILVA, F. R. ; KEMPER, E. ; SOUZA, G. M. ; da SILVA, A. M. ; FERRO, M. I. ; HENRIQUE-SILVA, F. ; GIGLIOTI, E. A. ; LEMOS, M. V. ; COUTINHO, L. L. ; NOBREGA, M. P. ; CARRER, H. ; FRANCA, S. C. ; BASSI JUNIOR, M. ; GOLDMAN, M. H. ; GOMES, S. L. ; NUNES, L. R. ; CAMARGO, L. E. A. ; SIQUEIRA, W. J. ; VAN SLUYS, MARIE-ANNE ; et.al. Analysis and functional annotation of an expressed sequence tag collection for tropical crop sugarcane.. Genome Research, United States. v. 13, n. 12, p. 2725-2735, 2003. Qualis: Não identificado (GENOME RESEARCH, UNITED STATES)

Marie-Anne Van Sluys ⇔ Joao Carlos Setubal (6.0)
NASCIMENTO, A. L. T. O. ; KO, A. I. ; MARTINS, E. A. L. ; MONTEIRO-VITORELLO, C. B. ; HO, P. L. ; HAAKE, D. A. ; Verjovski-Almeida, S. ; HARTSKEERL, R. A. ; MARQUES, M. V. ; OLIVEIRA, M. C. ; MENCK, C. F. M. ; LEITE, L. C. C. ; CARRER, H. ; COUTINHO, L. L. ; DEGRAVE, W. M. ; DELLAGOSTIN, O. A. ; EL-DORRY, H. ; FERRO, E. S. ; FERRO, M. I. T. ; FURLAN, L. R. ; et.al. Comparative genomics of two Leptospira interrogans serovars reveals novel insights into physiology and pathogenesis.. Journal of Bacteriology, estados unidos. v. 186, n. 7, p. 2164-2172, 2004. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF BACTERIOLOGY, ESTADOS UNIDOS)
MONTEIRO-VITORELLO, Claudia B. ; Camargo, Luis E. A. ; Van Sluys, Marie A. ; Kitajima, João P. ; Truffi, Daniela ; do Amaral, Alexandre M. ; Harakava, Ricardo ; de Oliveira, Julio C. F. ; Wood, Derek ; de Oliveira, Mariana C. ; Miyaki, Cristina ; Takita, Marco A. ; da Silva, Ana C. R. ; Furlan, Luis R. ; Carraro, Dirce M. ; Camarotte, Giovana ; Almeida, Nalvo F. ; Carrer, Helaine ; Coutinho, Luiz L. ; SETUBAL, J. C. ; et.al. The genome sequence of the gram-positive sugarcane pathogen Leifsonia xyli subsp. xyli. Molecular Plant-Microbe Interactions, United States. v. 17, n. 8, p. 827-836, 2004. Qualis: Não identificado (MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS, UNITED STATES)
SETUBAL, J. C.; NASCIMENTO, Ana Lucia Tabet ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; SLUYS, Marie Anne Van ; MONTEIRO-VITORELLO, Claudia B. ; CAMARGO, Luis Eduardo Aranha ; DIGIAMPIETRI, Luciano A. ; HARTSKEERL, Rudy ; HO, Paulo Lee ; MARQUES, Marilis ; OLIVEIRA, Mariana Cabral de ; HAAKE, David ; MARTINS, Elizabeth. Genome features of Leptospira interrogans serovar Copenhageni.. Brazilian Journal of Medical and Biological Research. v. 37, n. 4, p. 459-477, 2004. Qualis: A4
SLUYS MAV.; OLIVEIRA, Mariana Cabral de ; MONTEIROVITORELLO, C B ; MIYAKI, C. Y. ; FURLAN, L. R. ; CAMARGO, L E A ; SILVA, A. C. R. ; MOON, D. H. ; TAKITA, M. A. ; LEMOS, E. G. M. ; MACHADO, M. A. ; FERRO, M. I. T. ; SILVA, F R da ; GOLDMAN, M. H. S. ; GOLDMAN, G. H. ; LEMOS, M. V. F. ; DORRY, H. E. ; TSAI, S. M. ; CARRER, H. ; CARRARO, D. M. ; et.al. Comparative Analyses of the Complete Genome Sequences of Pierce's Disease and Citrus Variegated Chlorosis Strains of Xylella fastidiosa. Journal of Bacteriology, EUA. v. 185, n. 3, p. 1018-1026, 2003. Qualis: A3 (JOURNAL OF BACTERIOLOGY)
da Silva, A. C. R. ; Ferro, J. A. ; Reinach, F. C. ; Farah, C. S. ; Furlan, L. R. ; Quaggio, R. B. ; Monteiro-Vitorello, C. B. ; Sluys, M. A. Van ; Almeida, N. F. ; Alves, L. M. C. ; do Amaral, A. M. ; Bertolini, M. C. ; Camargo, L. E. A. ; Camarotte, G. ; Cannavan, F. ; Cardozo, J. ; Chambergo, F. ; Ciapina, L. P. ; Cicarelli, R. M. B. ; de SOUZA, Robson Francisco ; et.al. Comparison of the genomes of two Xanthomonas pathogens with differing host specificities.. Nature (London), Estados Unidos. v. 417, n. 6887, p. 459-463, 2002. Qualis: Não identificado (NATURE , ESTADOS UNIDOS)
Simpson, A. J. G. ; Reinach, F.C. ; Arruda, P. ; Abreu, F. A. ; Acencio, M. ; Alvarenga, R. ; Alves, L. M. C. ; Araya, J. E. ; Baia, G. S. ; Baptista, C. S. ; Barros, M. H. ; Bonaccorsi, E. D. ; Bordin, S. ; Bové, J. M. ; Briones, M. R. S. ; Bueno, M. R. P. ; CAMARGO, A. A. ; Camargo, L. E. A. ; Carraro, D. M. ; DA SILVA, A. M.. The genome sequence of the plant pathogen Xylella fastidiosa.. Nature (London), Londres. v. 406, p. 151-157, 2000. Qualis: Não identificado (NATURE , LONDRES)

Marie-Anne Van Sluys ⇔ Marcos Silveira Buckeridge (3.0)
TAVARES, EVELINE Q P ; DE SOUZA, AMANDA P ; ROMIM, GRAYCE H ; GRANDIS, ADRIANA ; PLASENCIA, ANNA ; GAIARSA, JONAS W ; GRIMA-PETTENATI, JACQUELINE ; DE SETTA, NATHALIA ; Van Sluys, Marie-Anne ; BUCKERIDGE, MARCOS S. The control of endopolygalacturonase expression by the sugarcane RAV transcription factor during aerenchyma formation. JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY. v. 70, p. 497-506, 2019. Qualis: A1
Hotta, Carlos T. ; Souza, Amanda P. ; Margarido, Gabriel R. A. ; Sluys, Marie-Anne ; GARCIA, ANTÃ´NIO A. F. ; Domingues, Douglas S. ; Mollinari, Marcelo ; Ochoa, Edgar A. ; Carrer, Helaine ; Melotto-Passarin, Danila M. ; Hoshino, Andrea A. ; Souza, Glaucia M. ; Santos, Melissa O. ; Menossi, Marcelo ; Souza, Anete P. ; Santos, Wanderley D. ; Marconi, Thiago G. ; CRIVELLARI, AUGUSTO CÃ©SAR ; Buckeridge, Marcos S. ; Cruz, Guilherme M. Q. ; et.al. The Biotechnology Roadmap for Sugarcane Improvement. Tropical Plant Biology (Online). v. 3, p. 75-87, 2010. Qualis: A3
Souza, Beatriz M. ; Molfetta-Machado, Jeanne B. ; Freschi, Luciano ; Figueira, Antonio ; Purgatto, Eduardo ; Buckeridge, Marcos S. ; Sluys, Marie-Anne ; Mercier, Helenice. Axillary bud development in pineapple nodal segments correlates with changes on cell cycle gene expression, hormone level, and sucrose and glutamate contents. In Vitro Cellular & Developmental Biology-Plant. v. 46, p. 281-288, 2010. Qualis: A4 (IN VITRO CELLULAR & DEVELOPMENTAL BIOLOGY. PLANT)

Marie-Anne Van Sluys ⇔ Sergio Verjovski Almeida (3.0)
NASCIMENTO, A. L. T. O. ; KO, A. I. ; MARTINS, E. A. L. ; MONTEIRO-VITORELLO, C. B. ; HO, P. L. ; HAAKE, D. A. ; Verjovski-Almeida, S. ; HARTSKEERL, R. A. ; MARQUES, M. V. ; OLIVEIRA, M. C. ; MENCK, C. F. M. ; LEITE, L. C. C. ; CARRER, H. ; COUTINHO, L. L. ; DEGRAVE, W. M. ; DELLAGOSTIN, O. A. ; EL-DORRY, H. ; FERRO, E. S. ; FERRO, M. I. T. ; FURLAN, L. R. ; et.al. Comparative genomics of two Leptospira interrogans serovars reveals novel insights into physiology and pathogenesis.. Journal of Bacteriology, estados unidos. v. 186, n. 7, p. 2164-2172, 2004. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF BACTERIOLOGY, ESTADOS UNIDOS)
SETUBAL, J. C.; NASCIMENTO, Ana Lucia Tabet ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; SLUYS, Marie Anne Van ; MONTEIRO-VITORELLO, Claudia B. ; CAMARGO, Luis Eduardo Aranha ; DIGIAMPIETRI, Luciano A. ; HARTSKEERL, Rudy ; HO, Paulo Lee ; MARQUES, Marilis ; OLIVEIRA, Mariana Cabral de ; HAAKE, David ; MARTINS, Elizabeth. Genome features of Leptospira interrogans serovar Copenhageni.. Brazilian Journal of Medical and Biological Research. v. 37, n. 4, p. 459-477, 2004. Qualis: A4
Simpson, A. J. G. ; Reinach, F.C. ; Arruda, P. ; Abreu, F. A. ; Acencio, M. ; Alvarenga, R. ; Alves, L. M. C. ; Araya, J. E. ; Baia, G. S. ; Baptista, C. S. ; Barros, M. H. ; Bonaccorsi, E. D. ; Bordin, S. ; Bové, J. M. ; Briones, M. R. S. ; Bueno, M. R. P. ; CAMARGO, A. A. ; Camargo, L. E. A. ; Carraro, D. M. ; DA SILVA, A. M.. The genome sequence of the plant pathogen Xylella fastidiosa.. Nature (London), Londres. v. 406, p. 151-157, 2000. Qualis: Não identificado (NATURE , LONDRES)

Marie-Anne Van Sluys ⇔ Aline Maria da Silva (2.0)
VETTORE, A. ; da SILVA, F. R. ; KEMPER, E. ; SOUZA, G. M. ; da SILVA, A. M. ; FERRO, M. I. ; HENRIQUE-SILVA, F. ; GIGLIOTI, E. A. ; LEMOS, M. V. ; COUTINHO, L. L. ; NOBREGA, M. P. ; CARRER, H. ; FRANCA, S. C. ; BASSI JUNIOR, M. ; GOLDMAN, M. H. ; GOMES, S. L. ; NUNES, L. R. ; CAMARGO, L. E. A. ; SIQUEIRA, W. J. ; VAN SLUYS, MARIE-ANNE ; et.al. Analysis and functional annotation of an expressed sequence tag collection for tropical crop sugarcane.. Genome Research, United States. v. 13, n. 12, p. 2725-2735, 2003. Qualis: Não identificado (GENOME RESEARCH, UNITED STATES)
Simpson, A. J. G. ; Reinach, F.C. ; Arruda, P. ; Abreu, F. A. ; Acencio, M. ; Alvarenga, R. ; Alves, L. M. C. ; Araya, J. E. ; Baia, G. S. ; Baptista, C. S. ; Barros, M. H. ; Bonaccorsi, E. D. ; Bordin, S. ; Bové, J. M. ; Briones, M. R. S. ; Bueno, M. R. P. ; CAMARGO, A. A. ; Camargo, L. E. A. ; Carraro, D. M. ; DA SILVA, A. M.. The genome sequence of the plant pathogen Xylella fastidiosa.. Nature (London), Londres. v. 406, p. 151-157, 2000. Qualis: Não identificado (NATURE , LONDRES)

Marie-Anne Van Sluys ⇔ Robson Francisco de Souza (2.0)
SOUZA, GLAUCIA MENDES ; VAN SLUYS, MARIE-ANNE ; LEMBKE, CAROLINA GIMILIANI ; LEE, HAYAN ; MARGARIDO, GABRIEL RODRIGUES ALVES ; HOTTA, CARLOS TAKESHI ; GAIARSA, JONAS WEISSMANN ; DINIZ, AUGUSTO LIMA ; OLIVEIRA, MAURO DE MEDEIROS ; FERREIRA, SÁVIO DE SIQUEIRA ; NISHIYAMA, MILTON YUTAKA ; TEN-CATEN, FELIPE ; RAGAGNIN, GEOVANI TOLFO ; ANDRADE, PABLO DE MORAIS ; DE SOUZA, ROBSON FRANCISCO ; NICASTRO, GIANLUCCA GONÇALVES ; PANDYA, RAVI ; KIM, CHANGSOO ; GUO, HUI ; DURHAM, ALAN MITCHELL ; et.al. Assembly of the 373k gene space of the polyploid sugarcane genome reveals reservoirs of functional diversity in the world's leading biomass crop. GigaScience. v. 8, p. 1-18, 2019. Qualis: A1
da Silva, A. C. R. ; Ferro, J. A. ; Reinach, F. C. ; Farah, C. S. ; Furlan, L. R. ; Quaggio, R. B. ; Monteiro-Vitorello, C. B. ; Sluys, M. A. Van ; Almeida, N. F. ; Alves, L. M. C. ; do Amaral, A. M. ; Bertolini, M. C. ; Camargo, L. E. A. ; Camarotte, G. ; Cannavan, F. ; Cardozo, J. ; Chambergo, F. ; Ciapina, L. P. ; Cicarelli, R. M. B. ; de SOUZA, Robson Francisco ; et.al. Comparison of the genomes of two Xanthomonas pathogens with differing host specificities.. Nature (London), Estados Unidos. v. 417, n. 6887, p. 459-463, 2002. Qualis: Não identificado (NATURE , ESTADOS UNIDOS)

Marie-Anne Van Sluys ⇔ Alan Mitchell Durham (1.0)
SOUZA, GLAUCIA MENDES ; VAN SLUYS, MARIE-ANNE ; LEMBKE, CAROLINA GIMILIANI ; LEE, HAYAN ; MARGARIDO, GABRIEL RODRIGUES ALVES ; HOTTA, CARLOS TAKESHI ; GAIARSA, JONAS WEISSMANN ; DINIZ, AUGUSTO LIMA ; OLIVEIRA, MAURO DE MEDEIROS ; FERREIRA, SÁVIO DE SIQUEIRA ; NISHIYAMA, MILTON YUTAKA ; TEN-CATEN, FELIPE ; RAGAGNIN, GEOVANI TOLFO ; ANDRADE, PABLO DE MORAIS ; DE SOUZA, ROBSON FRANCISCO ; NICASTRO, GIANLUCCA GONÇALVES ; PANDYA, RAVI ; KIM, CHANGSOO ; GUO, HUI ; DURHAM, ALAN MITCHELL ; et.al. Assembly of the 373k gene space of the polyploid sugarcane genome reveals reservoirs of functional diversity in the world's leading biomass crop. GigaScience. v. 8, p. 1-18, 2019. Qualis: A1

Marie-Anne Van Sluys ⇔ Helder Takashi Imoto Nakaya (1.0)
de Mello Varani, Alessandro ; Souza, Rangel Celso ; Nakaya, Helder I. ; de Lima, Wanessa Cristina ; Paula de Almeida, Luiz Gonzaga ; Kitajima, Elliot Watanabe ; Chen, Jianchi ; Civerolo, Edwin ; Vasconcelos, Ana Tereza Ribeiro ; Van Sluys, Marie-Anne. Origins of the Xylella fastidiosa Prophage-Like Regions and Their Impact in Genome Differentiation. Plos One. v. 3, p. e4059, 2008. Qualis: A1

Marie-Anne Van Sluys ⇔ João Eduardo Ferreira (1.0)
SOUZA, GLAUCIA MENDES ; BERGES, HELENE ; BOCS, STEPHANIE ; CASU, ROSANNE ; D'HONT, ANGELIQUE ; FERREIRA, JOÃO EDUARDO ; HENRY, ROBERT ; Ming, Ray ; POTIER, BERNARD ; Sluys, Marie-Anne ; VINCENTZ, Michel ; PATERSON, ANDREW H.. The Sugarcane Genome Challenge: Strategies for Sequencing a Highly Complex Genome. Tropical Plant Biology (Online). v. 4, p. 145-156, 2011. Qualis: A3

(*) Relatório criado com produções desde 2000 até 2025
Data de processamento: 27/01/2026 13:30:34

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