Programa de Pós Graduação em Bioinformática

Marie-Anne Van Sluys

Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade do Estado do Rio de Janeiro (UERJ) em 1983 e o título de Doutor pela Université Paris XI (Centre dOrsay, França) em 1989. É professora titular do Departamento de Botânica da Universidade de São Paulo desde 2007. Dois interesses principais orientam a sua atuação acadêmica-científica e são eles a compreensão de processos moleculares para diversificação biológica e a interação entre plantas e microrganismos. Estes interesses direcionaram a atuação do grupo GaTE em genômica comparativa e função biológica dos elementos de transposição. É membro da ACIESP (2015-atual), ABC (2016-atual), CDES (2016-2018) e TWAS (2023). Vice presidente da ACIESP (2023-2026). Membro do conselho da SBPC e ABC. Mais de 50 profissionais em diferentes estágios de formação científica passaram pelo GaTE e encontram-se inseridos no setor público e privado no Brasil e no exterior. (Texto informado pelo autor)

  • http://lattes.cnpq.br/5131787064674647 (29/02/2024)
  • Rótulo/Grupo:
  • Bolsa CNPq: Nível 1B
  • Período de análise:
  • Endereço: Universidade de São Paulo, Instituto de Biociências, Departamento de Botânica. rua do matão, 277 Cidade Universitaria 05508090 - São Paulo, SP - Brasil Telefone: (11) 30917759 Fax: (11) 30917724 URL da Homepage: http://www.ib.usp.br/botanica/gatelab/
  • Grande área: Ciências Biológicas
  • Área: Microbiologia
  • Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Produção técnica

Produção artística

Orientações em andamento

Supervisões e orientações concluídas

Projetos de pesquisa

Prêmios e títulos

Participação em eventos

Organização de eventos

Lista de colaborações

Produção bibliográfica

Produção técnica

Produção artística

Orientações em andamento

Supervisões e orientações concluídas

Projetos de pesquisa

  • Total de projetos de pesquisa (2)
    1. 2018-Atual. GEMACANA: Contribuição de genes, genomas e elementos de transposição na interação entre plantas e microorganismos: estudo de caso em cana de açúcar.
      Descrição: A interação planta-microorganismos representa um dos processos de fundamental relevância para o funcionamento de ecossistemas naturais, bem como agrícolas. A compreensão de seus componentes e dos processos que controlam essa interação biológica tem potencial de melhorar a produtividade das culturas e monitorar a qualidade ambiental. Este projeto pretende contribuir na elucidação deste sistema complexo através da utilização de ferramentas moleculares e de bioinformática dos genomas para descobrir os principais genes que controlam e / ou medeiam a interação de cana de açúcar com três patógenos (Leifsonia xyli subsp xyli;. Xanthomonas albilineans; Sporisorium scitamineum) e uma bactéria fixadora de nitrogênio (Gluconacetobacter) considerada promotora de crescimento para a cana. Esses organismos têm uma interação biotrófica/hemibiotrófica com cana de açúcar e os aspectos moleculares sob estas condições são geralmente menos compreendidas. O nosso objetivo é comparar e contrastar respostas moleculares através das interações individuais tanto de cana de açúcar quanto dos microrganismos envolvidos. Especificamente, (i) analisaremos padrões de expressão de um conjunto de genes previamente identificados análogos a genes de resistência (RGA), espécies reativas de oxigênio (ROS), metabolismo de carboidratos, síntese de hormônios e seu controle, elementos de transposição, e uma família de genes relacionados com a edição de genes em organelas e conhecido por ter membros que estão envolvidos na regulação das defesas de plantas via Na-siRNA (pentatricopeptide) bem como de genes envolvidos em respostas metabólicas específicas dos microrganismos; (ii) avaliar e comparar entre espécies de microrganismos os padrões de expressão de genes microbianos com um foco particular em moléculas secretadas entre os quais esperamos encontrar moléculas efetoras; (iii) avaliar e comparar as mudanças nos padrões de expressão durante duas infecções mistas, e (iv) avaliar e comparar as mudanças no microbioma do hospedeiro, como resultado da interação com os micróbios mencionados. Como um produto de extensão, esperamos fornecer informações moleculares sobre a biologia da cana ao interagir com vários micróbios almejando o desenvolvimento de um kit de diagnóstico para monitorar canaviais e construir um banco de dados "phytobiome" de cana que seja abrangente e que poderia ser usado em estudos comparativos com outras Poaceae.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (3) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (9) . Integrantes: Marie-Anne Van Sluys - Coordenador / Luis Eduardo Aranha Camargo - Integrante / Claudia Barros Monteiro-Vitorello - Integrante / Silvana Creste - Integrante / Marcelo Zerillo - Integrante / Paula Turrini - Integrante / Juliane Ishida - Integrante / Tatiane Correa - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
      Membro: Marie-Anne Van Sluys.
    2. 2009-Atual. Genômica de cana de açúcar: elemetos de transposição contribuintes para diversidade gênica, genética e genômica
      Descrição: Este projeto está integrado ao programa BioEn-FAPESP. A cana de açúcar é uma das fontes mais importantes para a produção de biocombustíveis no Brasil. Também ocupa posição de destaque no agronegócio do Estado de São Paulo. A produção de biocombustíveis a partir de cana de açúcar é dependente de sacarose como matéria prima. Espera-se que a indústria sucro alcooleira brasileira ganhe em competividade desde que haja um aumento de produtividade (biomassa) garantindo a preservação do meio ambiente evitando-se o uso de novas terras. Aumento de produção de biomassa pode ser atingido através do uso de técnicas que permitam o monitoramento e modulação do metabolismo de sacarose em condições adequadas e restritivas de crescimento da planta, como por exemplo condições de pouca disponibilidade de água. O uso potencial do bagaço como fonte de biomassa é dependente da disponibilização do carbono fixado nos polímeros que constituem a parede celular. O presente projeto tem como objetivo gerar um sequenciamento parcial de duas cultivares de cana de açúcar (R570 e SP80-3280) de modo a subsidiar o desenvolvimento de ferramentes moleculares que poderão auxiliar na compreensão deste genoma híbrido e poliplóide. A descoberta de genes e a identificação das regiões regulatórias envolvidas no metabolismo de sacarose e partição dos esqueletos de carbono na planta são algumas das áres na pesquisa básica que serão beneficiadas pelo presente estudo. Programas de melhoramento também poderão ser beneficiados tendo a cesso a informações moleculares com potencial ao desenvolvimento de marcadores moleculares. Os cultivares modernos de cana de açúcar são híbridos de Saccharum officinarum e Saccharum spontaneum. Seu genoma monoplóide é estimado em aproximadamente 1Gb comparável em escala aos genomas do milho e do ser humano. Utilizar-se-á uma abordagem combinada de seqüências geradas por pirosequenciamento e pelo método clássico de Sanger de 1000 clones de BAC. Uma coleção de ESTs geradas pelo projeto. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (7) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (6) . Integrantes: Marie-Anne Van Sluys - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
      Membro: Marie-Anne Van Sluys.

Prêmios e títulos

  • Total de prêmios e títulos (6)
    1. Membro Titular da ABC, Academia Brasileira de Ciências.. 2016.
      Membro: Marie-Anne Van Sluys.
    2. Membro Titular da ACIESP, ACIESP.. 2015.
      Membro: Marie-Anne Van Sluys.
    3. Menção Honrosa pelo projeto de IC desenvolvido por Nilo Saccaro-Junior, 13 SICUSP.. 2005.
      Membro: Marie-Anne Van Sluys.
    4. Medalha de Mérito Científico e Tecnológico, Governo do Estado de São Paulo.. 2000.
      Membro: Marie-Anne Van Sluys.
    5. Professora homenageada do Departamento, Pelos Formandos em Ciências Biológicas.. 2000.
      Membro: Marie-Anne Van Sluys.
    6. Prêmio Mulher do Ano juntamente com Elizabeth Martins, Ana Claudia Rasera, Anamaria A. Camargo, Claudia Monterio-Vitorello, Marilis Marques Valle e Mariana C de Oliveira, Revista Cláudia.. 2000.
      Membro: Marie-Anne Van Sluys.

Participação em eventos

  • Total de participação em eventos (7)
    1. First International Conference on Genomic Impact of Eukaryotic Transposable Elements. A genomic approach to depict transcriptionalle active transposable elements in sugarcane. 2006. (Congresso).
    2. International workshop on Xanthomonas Genome Research: current issues and future challenges. Horizontal gene transfer input in Xanthomonas genome diversification. 2005. (Congresso).
    3. 10th International congress for culture collections: innovative roles of biological resource centers. Mobile genetic elements contribution to the differentiation of closely related Xanthomonas genomes. 2004. (Congresso).
    4. TEGERM: analysis and exploitation of germplasm using trasnposable element molecular marker.TEGERM meeting. 2004. (Outra).
    5. Keystone Symposia on Transposition and other Genome rearrangements. Keystone Symposia on Transposition and other Genome rearrangements. 2003. (Congresso).
    6. A história do projeto Genoma.Seminários de Biologia Funcional e Molecular. 2002. (Seminário).
    7. Is TH11 protein from Arabidopsis a bifunctional protein?.Simpósio Brasil-Coréia: da Pesquisa à Biotecnologia. 2001. (Simpósio).

Organização de eventos

  • Total de organização de eventos (8)
    1. SLUYS MAV.; VANSLUYS, M A ; CAMARGO, A. A. ; MELLO, L. E. ; ZAGO, M. A.. Simpósio Genoma 20+2. 2022. Outro
    2. Van Sluys, Marie Anne; Vasconcelos, Ana Tereza Ribeiro. Workshop on Biodiversity and Biobank in Brazil. 2017. Outro
    3. VAN SLUYS, M.A.; SILVA FILHO, M. C. ; CARRARI, F. ; ULLOA, R.. IPMB 2015. 2015. Congresso
    4. Van Sluys, Marie Anne. UEA/NRP - Brazil workshop on plant sciences. 2012. (Outro).. . 0.
    5. Van Sluys, Marie Anne. International Workshop about the Ethanol Combustion Engines. 2012. (Outro).. . 0.
    6. SOUZA, Glaucia M ; CORTEZ, L. A. B. ; CANTARELLA, H. ; SILVA, C. ; CHAIMOVICH, H. ; Van Sluys, Marie-Anne. First Braziliain Bioenergy Science and Technology Conference - BBEST. 2011. Congresso
    7. VAN SLUYS, M A; MACHADO, M. A. ; SOUZA, A. A.. International Workshop on Xylella fastidiosa. 2007. Outro
    8. SCORTECCI, K. C. ; PERES, L. E. P. ; COSTA, A. P. P. ; VAN SLUYS, M A. I Simposio Brasileiro de Genetica molecular de plantas. 2007. Congresso

Lista de colaborações

  • Colaborações endôgenas (10)
    • Marie-Anne Van Sluys ⇔ Carlos Frederico Martins Menck (16.0)
      1. MASUDA, HANA PAULA ; NAKABASHI, MYNA ; MORGANTE, PATRICIA G ; KAJIHARA, DANIELA ; DE SETTA, NATHALIA ; MENCK, Carlos Frederico Martins ; Van Sluys, Marie-Anne. Evidence for sub-functionalization of tandemly duplicated XPB nucleotide excision repair genes in Arabidopsis thaliana. GENE. v. 754, p. 144818, 2020. Qualis: A4
      2. LIMA, W. ; PAQUOLA, A. C. ; VARANI, A. M. ; VANSLUYS MA ; MENCK, C. F. M.. Laterally transferred genomic islands in Xanthomonadales related to pathogenicity and primary metabolism.. FEMS Microbiology Letters. v. 281, p. 87-97, 2008. Qualis: B2
      3. Godoi, P. H. C. ; Galhardo, R. S. ; LUCHE, D. D. ; Van Sluys, M.-A. ; MENCK CF ; Oliva, G.. Structure of the Thiazole Biosynthetic Enzyme THI1 from Arabidopsis thaliana. The Journal of Biological Chemistry. v. 281, p. 30957-30966, 2006. Qualis: A1
      4. MORGANTE, P. G. ; BERRA, C. M. ; NAKABASHI, M. ; COSTA, R. M. A. ; MENCK CF ; M.A. VanSluys. Functional XPB/RAD25 redundancy in Arabidopsis genome: characterization of AtXPB2 and expression analysis.. Gene (Amsterdam), Netherlands. v. 344, p. 93-103, 2005. Qualis: Não identificado (GENE , NETHERLANDS)
      5. RIBEIRO, D. ; FARIAS, L. P. ; ALMEIDA, J. D. ; KASHIWABARA, P. M. ; RIBEIRO, A. F. C. ; SILVA FILHO, M. C. ; MENCK, C. F. M. ; SLUYS MAV.. Functional characterization of the thi1 promoter region from Arabidopsis thaliana. Journal of Experimental Botany, England. v. 56, n. 417, p. 1797-1804, 2005. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY, ENGLAND)
      6. LIMA, W. ; Lima, Wanessa C. ; Menck, C. F. M. ; Sluys, Marie-Anne Van ; Menck, Carlos F.M.. Non-gamma-proteobacteria gene islands contribute to the Xanthomonas genome. Journal of Integrative Biology / Omics (Larchmont). v. 9, n. 2, p. 160-172, 2005. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOLOGY / OMICS)
      7. VINCENTZ, Michel ; CARA, F A ; OKURA, V K ; SILVA, F R da ; et al ; SLUYS MAV. ; NOBREGA, Francisco Gorgonio da ; ARRUDA, Paulo ; MENCK, Carlos Frederico Martins. Evaluation of monocot and eudicot divergence using the sugarcane transcriptome.. Plant Physiology (Bethesda), Estados Unidos. v. 134, n. 3, p. 951-959, 2004. Qualis: Não identificado (PLANT PHYSIOLOGY , ESTADOS UNIDOS)
      8. NASCIMENTO, A. L. T. O. ; KO, A. I. ; MARTINS, E. A. L. ; MONTEIRO-VITORELLO, C. B. ; HO, P. L. ; HAAKE, D. A. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S. ; HARTSKEERL, R. A. ; MARQUES, M. V. ; OLIVEIRA, M. C. ; MENCK, C. F. M. ; LEITE, L. C. C. ; CARRER, H. ; COUTINHO, L. L. ; DEGRAVE, W. M. ; DELLAGOSTIN, O. A. ; EL-DORRY, H. ; FERRO, E. S. ; FERRO, M. I. T.. Comparative genomics of two Leptospira interrogans serovars reveals novel insights into physiology and pathogenesis.. Journal of Bacteriology, estados unidos. v. 186, n. 7, p. 2164-2172, 2004. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF BACTERIOLOGY, ESTADOS UNIDOS)
      9. MONTEIRO-VITORELLO, Claudia B. ; Camargo, Luis E. A. ; Van Sluys, Marie A. ; Kitajima, João P. ; Truffi, Daniela ; do Amaral, Alexandre M. ; Harakava, Ricardo ; de Oliveira, Julio C. F. ; Wood, Derek ; de Oliveira, Mariana C. ; Miyaki, Cristina ; Takita, Marco A. ; da Silva, Ana C. R. ; Furlan, Luis R. ; Carraro, Dirce M. ; Camarotte, Giovana ; Almeida, Nalvo F. ; Carrer, Helaine ; Coutinho, Luiz L. ; SETUBAL, J. C.. The genome sequence of the gram-positive sugarcane pathogen Leifsonia xyli subsp. xyli. Molecular Plant-Microbe Interactions, United States. v. 17, n. 8, p. 827-836, 2004. Qualis: Não identificado (MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS, UNITED STATES)
      10. VETTORE, A. L. ; da SILVA, F. R. ; KEMPER, E. L. ; SOUZA, G. M. ; DA SILVA, A. M. ; FERRO, M. I. T. ; HENRIQUE-SILVA, F. ; GIGLIOTI, E. A. ; LEMOS, M. V. F. ; Coutinho, L. L. ; NOBREGA, M. P. ; Carrer, H. ; FRANCA, S. C. ; BACCI, M. ; GOLDMAN, M. H. S. ; GOMES, S. L. ; NUNES, L. R. ; Camargo, L. E. A. ; SIQUEIRA, W. J. ; VAN SLUYS, M. A.. Analysis and functional annotation of an expressed sequence tag collection for tropical crop sugarcane.. Genome Research, United States. v. 13, n. 12, p. 2725-2735, 2003. Qualis: Não identificado (GENOME RESEARCH, UNITED STATES)
      11. CHABREGAS, S. M. ; LUCHE, D. D. ; MENCK, Carlos Frederico Martins ; SLUYS MAV. ; SILVA FILHO, M. C.. Differential usage of two in-frame translational start codons regulates subcellular localization of Arabidopsis thaliana THI1. Journal of Cell Science, England. v. 116, p. 285-291, 2003. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF CELL SCIENCE, ENGLAND)
      12. PAPINITERZI, F. S. ; GALHARDO, R. ; FARIAS, L. P. ; MENCK, C. F. M. ; SLUYS MAV.. Point Mutation is Responsible for Arabidopsis tz-201 Mutant Phenotype Affecting Thiamin Biosynthesis.. Plant and Cell Physiology, Japan. v. 44, n. 8, p. 865-860, 2003.Qualis: Não identificado (PLANT AND CELL PHYSIOLOGY, JAPAN)
      13. da Silva, A. C. R. ; Ferro, J. A. ; Reinach, F. C. ; Farah, C. S. ; Furlan, L. R. ; Quaggio, R. B. ; Monteiro-Vitorello, C. B. ; Sluys, M. A. Van ; Almeida, N. F. ; Alves, L. M. C. ; do Amaral, A. M. ; Bertolini, M. C. ; Camargo, L. E. A. ; Camarotte, G. ; Cannavan, F. ; Cardozo, J. ; Chambergo, F. ; Ciapina, L. P. ; Cicarelli, R. M. B. ; de SOUZA, Robson Francisco. Comparison of the genomes of two Xanthomonas pathogens with differing host specificities.. Nature (London), Estados Unidos. v. 417, n. 6887, p. 459-463, 2002. Qualis: Não identificado (NATURE , ESTADOS UNIDOS)
      14. SLUYS MAV.; VITORELLO, C. B. M. ; CAMARGO, L E A ; MENCK, Carlos Frederico Martins ; SILVA, A. C. R. ; FERRO, J. A. ; OLIVEIRA, Mariana Cabral de ; SETUBAL, J. C. ; KITAJIMA, J. P. ; SIMPSON, A. J.. Comparative genomic analysis of plant-associated bacteria.. Annual Review of Phytopathology (Print), Estados Unidos. v. 40, p. 169-189, 2002. Qualis: Não identificado (ANNUAL REVIEW OF PHYTOPATHOLOGY , ESTADOS UNIDOS)
      15. COSTA, R. M. A. ; MORGANTE, P. G. ; BERRA, C. M. ; NAKABASHI, M. ; BRUNEAU, D. ; BOUCHEZ, D. ; SWEDER, K. ; M.A. VanSluys ; MENCK CF. The participation of AtXPB1, the XPB/RAD25 homologue gene from Arabidopsis thaliana, in DNA repair and plant development.. Plant J, Inglaterra. v. 28, n. 4, p. 385-395, 2001. Qualis: Não identificado (PLANT J, INGLATERRA)
      16. Simpson, A. J. G. ; Reinach, F.C. ; Arruda, P. ; Abreu, F. A. ; Acencio, M. ; Alvarenga, R. ; Alves, L. M. C. ; Araya, J. E. ; Baia, G. S. ; Baptista, C. S. ; Barros, M. H. ; Bonaccorsi, E. D. ; Bordin, S. ; Bové, J. M. ; Briones, M. R. S. ; Bueno, M. R. P. ; CAMARGO, A. A. ; Camargo, L. E. A. ; Carraro, D. M. ; DA SILVA, A. M.. The genome sequence of the plant pathogen Xylella fastidiosa.. Nature (London), Londres. v. 406, p. 151-157, 2000. Qualis: Não identificado (NATURE , LONDRES)

    • Marie-Anne Van Sluys ⇔ Glaucia Mendes Souza (9.0)
      1. SOUZA, GLAUCIA MENDES ; VAN SLUYS, MARIE-ANNE ; LEMBKE, CAROLINA GIMILIANI ; LEE, HAYAN ; MARGARIDO, GABRIEL RODRIGUES ALVES ; HOTTA, CARLOS TAKESHI ; GAIARSA, JONAS WEISSMANN ; DINIZ, AUGUSTO LIMA ; OLIVEIRA, MAURO DE MEDEIROS ; FERREIRA, SÁVIO DE SIQUEIRA ; NISHIYAMA, MILTON YUTAKA ; TEN-CATEN, FELIPE ; RAGAGNIN, GEOVANI TOLFO ; ANDRADE, PABLO DE MORAIS ; DE SOUZA, ROBSON FRANCISCO ; NICASTRO, GIANLUCCA GONÇALVES ; PANDYA, RAVI ; KIM, CHANGSOO ; GUO, HUI ; DURHAM, ALAN MITCHELL. Assembly of the 373k gene space of the polyploid sugarcane genome reveals reservoirs of functional diversity in the world's leading biomass crop. GigaScience. v. 8, p. 1-18, 2019. Qualis: A1
      2. ZHANG, JISEN ; ZHANG, XINGTAN ; TANG, HAIBAO ; ZHANG, QING ; HUA, XIUTING ; MA, XIAOKAI ; ZHU, FAN ; JONES, TYLER ; ZHU, XINGUANG ; BOWERS, JOHN ; WAI, CHING MAN ; ZHENG, CHUNFANG ; SHI, YAN ; CHEN, SHUAI ; XU, XIUMING ; YUE, JINGJING ; NELSON, DAVID R. ; HUANG, LIXIAN ; LI, ZHEN ; SOUZA, G. M.. Allele-defined genome of the autopolyploid sugarcane Saccharum spontaneum L.. NATURE GENETICS. v. 50, p. 1565-1573, 2018. Qualis: A1
      3. de Setta, Nathalia ; MONTEIRO-VITORELLO, CLÁUDIA BARROS ; METCALFE, CUSHLA JANE ; CRUZ, GUILHERME MARCELO ; DEL BEM, LUIZ EDUARDO ; Vicentini, Renato ; NOGUEIRA, FÁBIO TEBALDI ; CAMPOS, ROBERTA ALVARES ; NUNES, SIDENY LIMA ; TURRINI, PAULA CRISTINA ; VIEIRA, ANDREIA PRATA ; OCHOA CRUZ, EDGAR ANDRÉS ; CORRÊA, TATIANA CAROLINE ; HOTTA, CARLOS TAKESHI ; de Mello Varani, Alessandro ; VAUTRIN, SONIA ; DA TRINDADE, ADILSON SILVA ; DE MENDONÇA VILELA, MARIANE ; LEMBKE, CAROLINA GIMILIANI ; SLUYS MAV.. Building the sugarcane genome for biotechnology and identifying evolutionary trends. BMC GENOMICS. v. 15, p. 540, 2014. Qualis: A2
      4. GARCIA, ANTONIO A. F. ; Mollinari, Marcelo ; Marconi, Thiago G. ; SERANG, OLIVER R. ; SILVA, RENATO R. ; VIEIRA, MARIA L. C. ; Vicentini, Renato ; COSTA, ESTELA A. ; MANCINI, MELINA C. ; GARCIA, MELISSA O. S. ; PASTINA, MARIA M. ; Gazaffi, Rodrigo ; MARTINS, ELIANA R. F. ; DAHMER, NAIR ; SFORÇA, DANILO A. ; SILVA, CLAUDIO B. C. ; BUNDOCK, PETER ; HENRY, ROBERT J. ; Souza, Glaucia M. ; Van Sluys, Marie-Anne. SNP genotyping allows an in-depth characterisation of the genome of sugarcane and other complex autopolyploids. Scientific Reports. v. 3, p. 3399, 2013. Qualis: A2
      5. JOLY, C. A. ; BERLINCK, R. G. S. ; BOLZANI, V. S. ; HADDAD, C. F. B. ; OLIVEIRA, M. C. ; VAN SLUYS, MARIE-ANNE ; SOUZA, G. M. ; VERDADE, L. M. ; VICTORIA, R. L.. Principais conclusões do workshop conjunto dos programas FAPESP BIOTA-BIOEN-Mudanças Climáticas: ciência e políticas públicas para uma economia mais verde, no contexto da RIO+20. Biota Neotropica. v. 12(2), p. 19-21, 2012.Qualis: B1
      6. SOUZA, GLAUCIA MENDES ; BERGES, HELENE ; BOCS, STEPHANIE ; CASU, ROSANNE ; D'HONT, ANGELIQUE ; FERREIRA, JOÃO EDUARDO ; HENRY, ROBERT ; Ming, Ray ; POTIER, BERNARD ; Sluys, Marie-Anne ; VINCENTZ, Michel ; PATERSON, ANDREW H.. The Sugarcane Genome Challenge: Strategies for Sequencing a Highly Complex Genome. Tropical Plant Biology (Online). v. 4, p. 145-156, 2011. Qualis: A3
      7. Hotta, Carlos T. ; Lembke, Carolina G. ; Domingues, Douglas S. ; Ochoa, Edgar A. ; Cruz, Guilherme M. Q. ; Melotto-Passarin, Danila M. ; Marconi, Thiago G. ; Santos, Melissa O. ; Mollinari, Marcelo ; Margarido, Gabriel R. A. ; Crivellari, Augusto César ; Santos, Wanderley D. ; Souza, Amanda P. ; Hoshino, Andrea A. ; Carrer, Helaine ; Souza, Anete P. ; Garcia, Antônio A. F. ; Buckeridge, Marcos S. ; BUCKERIDGE, M. S. ; Menossi, Marcelo ; Sluys, Marie-Anne. The Biotechnology Roadmap for Sugarcane Improvement. Tropical Plant Biology (Online). v. 3, p. 75-87, 2010. Qualis: A3
      8. MENOSSI, M. ; SILVA-FILHO, M. C. ; Vincentz, M. ; Van-Sluys, M.-A. ; Souza, G. M.. Sugarcane Functional Genomics: Gene Discovery for Agronomic Trait Development. International Journal of Plant Genomics (Print). v. 2008, p. 458732, 2008. Qualis: A2 (INTERNATIONAL JOURNAL OF GENOMICS)
      9. VETTORE, A. L. ; da SILVA, F. R. ; KEMPER, E. L. ; SOUZA, G. M. ; DA SILVA, A. M. ; FERRO, M. I. T. ; HENRIQUE-SILVA, F. ; GIGLIOTI, E. A. ; LEMOS, M. V. F. ; Coutinho, L. L. ; NOBREGA, M. P. ; Carrer, H. ; FRANCA, S. C. ; BACCI, M. ; GOLDMAN, M. H. S. ; GOMES, S. L. ; NUNES, L. R. ; Camargo, L. E. A. ; SIQUEIRA, W. J. ; VAN SLUYS, M. A.. Analysis and functional annotation of an expressed sequence tag collection for tropical crop sugarcane.. Genome Research, United States. v. 13, n. 12, p. 2725-2735, 2003. Qualis: Não identificado (GENOME RESEARCH, UNITED STATES)

    • Marie-Anne Van Sluys ⇔ Joao Carlos Setubal (6.0)
      1. NASCIMENTO, A. L. T. O. ; KO, A. I. ; MARTINS, E. A. L. ; MONTEIRO-VITORELLO, C. B. ; HO, P. L. ; HAAKE, D. A. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S. ; HARTSKEERL, R. A. ; MARQUES, M. V. ; OLIVEIRA, M. C. ; MENCK, C. F. M. ; LEITE, L. C. C. ; CARRER, H. ; COUTINHO, L. L. ; DEGRAVE, W. M. ; DELLAGOSTIN, O. A. ; EL-DORRY, H. ; FERRO, E. S. ; FERRO, M. I. T.. Comparative genomics of two Leptospira interrogans serovars reveals novel insights into physiology and pathogenesis.. Journal of Bacteriology, estados unidos. v. 186, n. 7, p. 2164-2172, 2004. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF BACTERIOLOGY, ESTADOS UNIDOS)
      2. MONTEIRO-VITORELLO, Claudia B. ; Camargo, Luis E. A. ; Van Sluys, Marie A. ; Kitajima, João P. ; Truffi, Daniela ; do Amaral, Alexandre M. ; Harakava, Ricardo ; de Oliveira, Julio C. F. ; Wood, Derek ; de Oliveira, Mariana C. ; Miyaki, Cristina ; Takita, Marco A. ; da Silva, Ana C. R. ; Furlan, Luis R. ; Carraro, Dirce M. ; Camarotte, Giovana ; Almeida, Nalvo F. ; Carrer, Helaine ; Coutinho, Luiz L. ; SETUBAL, J. C.. The genome sequence of the gram-positive sugarcane pathogen Leifsonia xyli subsp. xyli. Molecular Plant-Microbe Interactions, United States. v. 17, n. 8, p. 827-836, 2004. Qualis: Não identificado (MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS, UNITED STATES)
      3. SETUBAL, J. C.; NASCIMENTO, Ana Lucia Tabet ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; SLUYS, Marie Anne Van ; MONTEIRO-VITORELLO, Claudia B. ; CAMARGO, Luis Eduardo Aranha ; DIGIAMPIETRI, Luciano A. ; HARTSKEERL, Rudy ; HO, Paulo Lee ; MARQUES, Marilis ; OLIVEIRA, Mariana Cabral de ; HAAKE, David ; MARTINS, Elizabeth. Genome features of Leptospira interrogans serovar Copenhageni.. Brazilian Journal of Medical and Biological Research. v. 37, n. 4, p. 459-477, 2004. Qualis: A4
      4. SLUYS MAV.; OLIVEIRA, Mariana Cabral de ; MONTEIROVITORELLO, C B ; MIYAKI, C. Y. ; FURLAN, L. R. ; CAMARGO, L E A ; SILVA, A. C. R. ; MOON, D. H. ; TAKITA, M. A. ; LEMOS, E. G. M. ; MACHADO, M. A. ; FERRO, M. I. T. ; SILVA, F R da ; GOLDMAN, M. H. S. ; GOLDMAN, G. H. ; LEMOS, M. V. F. ; DORRY, H. E. ; TSAI, S. M. ; CARRER, H. ; CARRARO, D. M.. Comparative Analyses of the Complete Genome Sequences of Pierce's Disease and Citrus Variegated Chlorosis Strains of Xylella fastidiosa. Journal of Bacteriology, EUA. v. 185, n. 3, p. 1018-1026, 2003. Qualis: A3 (JOURNAL OF BACTERIOLOGY)
      5. da Silva, A. C. R. ; Ferro, J. A. ; Reinach, F. C. ; Farah, C. S. ; Furlan, L. R. ; Quaggio, R. B. ; Monteiro-Vitorello, C. B. ; Sluys, M. A. Van ; Almeida, N. F. ; Alves, L. M. C. ; do Amaral, A. M. ; Bertolini, M. C. ; Camargo, L. E. A. ; Camarotte, G. ; Cannavan, F. ; Cardozo, J. ; Chambergo, F. ; Ciapina, L. P. ; Cicarelli, R. M. B. ; de SOUZA, Robson Francisco. Comparison of the genomes of two Xanthomonas pathogens with differing host specificities.. Nature (London), Estados Unidos. v. 417, n. 6887, p. 459-463, 2002. Qualis: Não identificado (NATURE , ESTADOS UNIDOS)
      6. Simpson, A. J. G. ; Reinach, F.C. ; Arruda, P. ; Abreu, F. A. ; Acencio, M. ; Alvarenga, R. ; Alves, L. M. C. ; Araya, J. E. ; Baia, G. S. ; Baptista, C. S. ; Barros, M. H. ; Bonaccorsi, E. D. ; Bordin, S. ; Bové, J. M. ; Briones, M. R. S. ; Bueno, M. R. P. ; CAMARGO, A. A. ; Camargo, L. E. A. ; Carraro, D. M. ; DA SILVA, A. M.. The genome sequence of the plant pathogen Xylella fastidiosa.. Nature (London), Londres. v. 406, p. 151-157, 2000. Qualis: Não identificado (NATURE , LONDRES)

    • Marie-Anne Van Sluys ⇔ Marcos Silveira Buckeridge (3.0)
      1. TAVARES, EVELINE Q P ; DE SOUZA, AMANDA P ; ROMIM, GRAYCE H ; GRANDIS, ADRIANA ; PLASENCIA, ANNA ; GAIARSA, JONAS W ; GRIMA-PETTENATI, JACQUELINE ; DE SETTA, NATHALIA ; Van Sluys, Marie-Anne ; BUCKERIDGE, MARCOS S. The control of endopolygalacturonase expression by the sugarcane RAV transcription factor during aerenchyma formation. JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY. v. 70, p. 497-506, 2019. Qualis: A1
      2. Hotta, Carlos T. ; Lembke, Carolina G. ; Domingues, Douglas S. ; Ochoa, Edgar A. ; Cruz, Guilherme M. Q. ; Melotto-Passarin, Danila M. ; Marconi, Thiago G. ; Santos, Melissa O. ; Mollinari, Marcelo ; Margarido, Gabriel R. A. ; Crivellari, Augusto César ; Santos, Wanderley D. ; Souza, Amanda P. ; Hoshino, Andrea A. ; Carrer, Helaine ; Souza, Anete P. ; Garcia, Antônio A. F. ; Buckeridge, Marcos S. ; BUCKERIDGE, M. S. ; Menossi, Marcelo ; Sluys, Marie-Anne. The Biotechnology Roadmap for Sugarcane Improvement. Tropical Plant Biology (Online). v. 3, p. 75-87, 2010. Qualis: A3
      3. Souza, Beatriz M. ; Molfetta-Machado, Jeanne B. ; Freschi, Luciano ; Figueira, Antonio ; Purgatto, Eduardo ; Buckeridge, Marcos S. ; BUCKERIDGE, M. S. ; Sluys, Marie-Anne ; Mercier, Helenice. Axillary bud development in pineapple nodal segments correlates with changes on cell cycle gene expression, hormone level, and sucrose and glutamate contents. In Vitro Cellular & Developmental Biology. Plant. v. 46, p. 281-288, 2010. Qualis: C

    • Marie-Anne Van Sluys ⇔ Sergio Verjovski Almeida (3.0)
      1. NASCIMENTO, A. L. T. O. ; KO, A. I. ; MARTINS, E. A. L. ; MONTEIRO-VITORELLO, C. B. ; HO, P. L. ; HAAKE, D. A. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S. ; HARTSKEERL, R. A. ; MARQUES, M. V. ; OLIVEIRA, M. C. ; MENCK, C. F. M. ; LEITE, L. C. C. ; CARRER, H. ; COUTINHO, L. L. ; DEGRAVE, W. M. ; DELLAGOSTIN, O. A. ; EL-DORRY, H. ; FERRO, E. S. ; FERRO, M. I. T.. Comparative genomics of two Leptospira interrogans serovars reveals novel insights into physiology and pathogenesis.. Journal of Bacteriology, estados unidos. v. 186, n. 7, p. 2164-2172, 2004. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF BACTERIOLOGY, ESTADOS UNIDOS)
      2. SETUBAL, J. C.; NASCIMENTO, Ana Lucia Tabet ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; SLUYS, Marie Anne Van ; MONTEIRO-VITORELLO, Claudia B. ; CAMARGO, Luis Eduardo Aranha ; DIGIAMPIETRI, Luciano A. ; HARTSKEERL, Rudy ; HO, Paulo Lee ; MARQUES, Marilis ; OLIVEIRA, Mariana Cabral de ; HAAKE, David ; MARTINS, Elizabeth. Genome features of Leptospira interrogans serovar Copenhageni.. Brazilian Journal of Medical and Biological Research. v. 37, n. 4, p. 459-477, 2004. Qualis: A4
      3. Simpson, A. J. G. ; Reinach, F.C. ; Arruda, P. ; Abreu, F. A. ; Acencio, M. ; Alvarenga, R. ; Alves, L. M. C. ; Araya, J. E. ; Baia, G. S. ; Baptista, C. S. ; Barros, M. H. ; Bonaccorsi, E. D. ; Bordin, S. ; Bové, J. M. ; Briones, M. R. S. ; Bueno, M. R. P. ; CAMARGO, A. A. ; Camargo, L. E. A. ; Carraro, D. M. ; DA SILVA, A. M.. The genome sequence of the plant pathogen Xylella fastidiosa.. Nature (London), Londres. v. 406, p. 151-157, 2000. Qualis: Não identificado (NATURE , LONDRES)

    • Marie-Anne Van Sluys ⇔ Aline Maria da Silva (2.0)
      1. VETTORE, A. L. ; da SILVA, F. R. ; KEMPER, E. L. ; SOUZA, G. M. ; DA SILVA, A. M. ; FERRO, M. I. T. ; HENRIQUE-SILVA, F. ; GIGLIOTI, E. A. ; LEMOS, M. V. F. ; Coutinho, L. L. ; NOBREGA, M. P. ; Carrer, H. ; FRANCA, S. C. ; BACCI, M. ; GOLDMAN, M. H. S. ; GOMES, S. L. ; NUNES, L. R. ; Camargo, L. E. A. ; SIQUEIRA, W. J. ; VAN SLUYS, M. A.. Analysis and functional annotation of an expressed sequence tag collection for tropical crop sugarcane.. Genome Research, United States. v. 13, n. 12, p. 2725-2735, 2003. Qualis: Não identificado (GENOME RESEARCH, UNITED STATES)
      2. Simpson, A. J. G. ; Reinach, F.C. ; Arruda, P. ; Abreu, F. A. ; Acencio, M. ; Alvarenga, R. ; Alves, L. M. C. ; Araya, J. E. ; Baia, G. S. ; Baptista, C. S. ; Barros, M. H. ; Bonaccorsi, E. D. ; Bordin, S. ; Bové, J. M. ; Briones, M. R. S. ; Bueno, M. R. P. ; CAMARGO, A. A. ; Camargo, L. E. A. ; Carraro, D. M. ; DA SILVA, A. M.. The genome sequence of the plant pathogen Xylella fastidiosa.. Nature (London), Londres. v. 406, p. 151-157, 2000. Qualis: Não identificado (NATURE , LONDRES)

    • Marie-Anne Van Sluys ⇔ Robson Francisco de Souza (2.0)
      1. SOUZA, GLAUCIA MENDES ; VAN SLUYS, MARIE-ANNE ; LEMBKE, CAROLINA GIMILIANI ; LEE, HAYAN ; MARGARIDO, GABRIEL RODRIGUES ALVES ; HOTTA, CARLOS TAKESHI ; GAIARSA, JONAS WEISSMANN ; DINIZ, AUGUSTO LIMA ; OLIVEIRA, MAURO DE MEDEIROS ; FERREIRA, SÁVIO DE SIQUEIRA ; NISHIYAMA, MILTON YUTAKA ; TEN-CATEN, FELIPE ; RAGAGNIN, GEOVANI TOLFO ; ANDRADE, PABLO DE MORAIS ; DE SOUZA, ROBSON FRANCISCO ; NICASTRO, GIANLUCCA GONÇALVES ; PANDYA, RAVI ; KIM, CHANGSOO ; GUO, HUI ; DURHAM, ALAN MITCHELL. Assembly of the 373k gene space of the polyploid sugarcane genome reveals reservoirs of functional diversity in the world's leading biomass crop. GigaScience. v. 8, p. 1-18, 2019. Qualis: A1
      2. da Silva, A. C. R. ; Ferro, J. A. ; Reinach, F. C. ; Farah, C. S. ; Furlan, L. R. ; Quaggio, R. B. ; Monteiro-Vitorello, C. B. ; Sluys, M. A. Van ; Almeida, N. F. ; Alves, L. M. C. ; do Amaral, A. M. ; Bertolini, M. C. ; Camargo, L. E. A. ; Camarotte, G. ; Cannavan, F. ; Cardozo, J. ; Chambergo, F. ; Ciapina, L. P. ; Cicarelli, R. M. B. ; de SOUZA, Robson Francisco. Comparison of the genomes of two Xanthomonas pathogens with differing host specificities.. Nature (London), Estados Unidos. v. 417, n. 6887, p. 459-463, 2002. Qualis: Não identificado (NATURE , ESTADOS UNIDOS)

    • Marie-Anne Van Sluys ⇔ Alan Mitchell Durham (1.0)
      1. SOUZA, GLAUCIA MENDES ; VAN SLUYS, MARIE-ANNE ; LEMBKE, CAROLINA GIMILIANI ; LEE, HAYAN ; MARGARIDO, GABRIEL RODRIGUES ALVES ; HOTTA, CARLOS TAKESHI ; GAIARSA, JONAS WEISSMANN ; DINIZ, AUGUSTO LIMA ; OLIVEIRA, MAURO DE MEDEIROS ; FERREIRA, SÁVIO DE SIQUEIRA ; NISHIYAMA, MILTON YUTAKA ; TEN-CATEN, FELIPE ; RAGAGNIN, GEOVANI TOLFO ; ANDRADE, PABLO DE MORAIS ; DE SOUZA, ROBSON FRANCISCO ; NICASTRO, GIANLUCCA GONÇALVES ; PANDYA, RAVI ; KIM, CHANGSOO ; GUO, HUI ; DURHAM, ALAN MITCHELL. Assembly of the 373k gene space of the polyploid sugarcane genome reveals reservoirs of functional diversity in the world's leading biomass crop. GigaScience. v. 8, p. 1-18, 2019. Qualis: A1

    • Marie-Anne Van Sluys ⇔ Helder Takashi Imoto Nakaya (1.0)
      1. de Mello Varani, Alessandro ; Souza, Rangel Celso ; Nakaya, Helder I. ; de Lima, Wanessa Cristina ; Paula de Almeida, Luiz Gonzaga ; Kitajima, Elliot Watanabe ; Chen, Jianchi ; Civerolo, Edwin ; Vasconcelos, Ana Tereza Ribeiro ; Van Sluys, Marie-Anne. Origins of the Xylella fastidiosa Prophage-Like Regions and Their Impact in Genome Differentiation. Plos One. v. 3, p. e4059, 2008. Qualis: A1

    • Marie-Anne Van Sluys ⇔ João Eduardo Ferreira (1.0)
      1. SOUZA, GLAUCIA MENDES ; BERGES, HELENE ; BOCS, STEPHANIE ; CASU, ROSANNE ; D'HONT, ANGELIQUE ; FERREIRA, JOÃO EDUARDO ; HENRY, ROBERT ; Ming, Ray ; POTIER, BERNARD ; Sluys, Marie-Anne ; VINCENTZ, Michel ; PATERSON, ANDREW H.. The Sugarcane Genome Challenge: Strategies for Sequencing a Highly Complex Genome. Tropical Plant Biology (Online). v. 4, p. 145-156, 2011. Qualis: A3




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Data de processamento: 05/12/2024 01:27:53