Programa de Pós Graduação em Bioinformática

Sergio Verjovski Almeida

Possui graduação em Medicina pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (1974), mestrado em Biofísica pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (1976) e doutorado em Biofísica pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (1979), sob orientação de Leopoldo de Meis. Foi bolsista da Muscular Dystrophy Association of USA (1976-1978) trabalhando com G. Inesi na University of the Pacific, San Francisco, California. Pesquisador visitante no Department of Genetics, Yale University, New Haven, Connecticut (1991-1992), trabalhando com Carolyn W. Slayman. Foi professor e pesquisador no Departamento de Bioquímica Médica da Universidade Federal do Rio de Janeiro de 1979 até 1993, tendo se tornado professor titular naquele Departamento em 1992. Desde 1994 é professor titular do Departamento de Bioquímica, Instituto de Química da Universidade de São Paulo, e desde novembro de 2014 é Professor Titular Aposentado, Colaborador Senior nesse Departamento. É atualmente Liderança Científica no Laboratório de Ciclo Celular do Instituto Butantan, bolsista da Fundação Butantan. Membro da Academia Brasileira de Ciências desde 1986. Admitido na classe de Comendador da Ordem Nacional do Mérito Científico da Presidência da República Federativa do Brasil em 2006. Tem experiência na área de Bioquímica, com ênfase em Biologia Molecular, atuando principalmente nos seguintes temas: (1) identificação dos mecanismos de ação de RNAs não-codificadores de proteínas em células humanas, e seu possível papel funcional em câncer, e (2) regulação da expressão gênica em larga escala em Schistosoma mansoni. (Texto informado pelo autor)

http://lattes.cnpq.br/5508865855321722 (11/02/2025)

Rótulo/Grupo:

Bolsa CNPq: Nível 1A

Período de análise:

Endereço: Instituto Butantan, Laboratório Especial de Zoonóses e Endemias Parasitárias, Laboratório de Expressão Gênica em Eucariotos. Av. Vital Brasil 1500 Butantã 05503900 - São Paulo, SP - Brasil Telefone: (11) 26273855 URL da Homepage: http://www2.iq.usp.br/docente/verjo

Grande área: Ciências Biológicas

Área: Bioquímica

Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Artigos completos publicados em periódicos (139)
1. FISCHER-CARVALHO, AGATHA ; Taveira-Barbosa, TC ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S. ; Haeberlein, S. ; AMARAL, M. S.. Antischistosomal Potential of Animal-Derived Natural Products and Compounds. Microorganisms. v. 13, p. 397, 2025. Qualis: B1
2. WOELLNER-SANTOS, DAISY ; TAHIRA, ANA C. ; MALVEZZI, JOÃO V. M. ; MESEL, VINICIUS ; MORALES-VICENTE, DAVID A. ; TRENTINI, MONALISA M. ; MARQUES-NETO, LÁZARO M. ; MATOS, ISAAC A. ; KANNO, ALEX I. ; PEREIRA, ADRIANA S. A. ; TEIXEIRA, ANDRÉ A. R. ; GIORDANO, RICARDO J. ; LEITE, LUCIANA C. C. ; PEREIRA, CARLOS A. B. ; DEMARCO, Ricardo ; AMARAL, MURILO S. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S.. Schistosoma mansoni vaccine candidates identified by unbiased phage display screening in self-cured rhesus macaques. npj Vaccines. v. 9, p. 5, 2024. Qualis: Não identificado (NPJ VACCINES)
3. DE MELLO, F. N. ; TAHIRA, A. C. ; BERZOTI-COELHO, M. G. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S.. The CUT&RUN greenlist: genomic regions of consistent noise are effective normalizing factors for quantitative epigenome mapping. BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS. v. 25, p. bbad358, 2024. Qualis: A1
4. JARDIM POLI, PEDRO ; FISCHER-CARVALHO, AGATHA ; TAHIRA, ANA CAROLINA ; CHAN, JOHN D. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; SENA AMARAL, MURILO. Long Non-Coding RNA Levels Are Modulated in Schistosoma mansoni Following In Vivo Praziquantel Exposure. Non-Coding Rna. v. 10, p. 27, 2024. Qualis: B2
5. MORALES-VICENTE, DAVID A ; Tahira, Ana C ; WOELLNER-SANTOS, DAISY ; AMARAL, MURILO S ; BERZOTI-COELHO, MARIA G ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S.. The human developing cerebral cortex is characterized by an elevated de novo expression of lncRNAs in excitatory neurons. MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION. v. 41, p. msae123, 2024. Qualis: A1
6. SILVEIRA, GILBERT O. ; COELHO, HELENA S. ; PEREIRA, ADRIANA S. A. ; MIYASATO, PATRÍCIA A. ; SANTOS, DAISY W. ; MACIEL, LUCAS F. ; OLBERG, GIOVANNA G. G. ; TAHIRA, ANA C. ; NAKANO, ELIANA ; OLIVEIRA, MARIA LEONOR S. ; AMARAL, MURILO S. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S.. Long non-coding RNAs are essential for Schistosoma mansoni pairing-dependent adult worm homeostasis and fertility. PLoS Pathogens. v. 19, p. e1011369, 2023. Qualis: A1
7. LOPES-JUNIOR, E. H. ; BERTEVELLO, C. R. ; SILVEIRA, GILBERT O. ; GUEDES, C. B. ; RODRIGUES, G. D. ; RIBEIRO, V. S. ; AMARAL, M. S. ; KANAMURA, C. T. ; PINTO, P. L. S. ; KRUGER, R. F. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S. ; Oliveira, Katia C.. Human tumor necrosis factor alpha affects the egg-laying dynamics and glucose metabolism of Schistosoma mansoni adult worms in vitro. Parasites & Vectors. v. 15, p. 176, 2022. Qualis: A1
8. SILVEIRA, GILBERT O. ; COELHO, HELENA S. ; AMARAL, MURILO S. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S.. Long non-coding RNAs as possible therapeutic targets in protozoa, and in Schistosoma and other helminths. PARASITOLOGY RESEARCH. v. 121, p. 1091-1115, 2022. Qualis: A1
9. MORALES-VICENTE, D. A. ; ZHAO, L. ; SILVEIRA, GILBERT O. ; TAHIRA, A. C. ; AMARAL, MURILO S ; COLLINSIII, J. J. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S.. Single-cell RNA-seq analyses show that long non-coding RNAs are conspicuously expressed in Schistosoma mansoni gamete and tegument progenitor cell populations. Frontiers in Genetics. v. 13, p. 924877, 2022. Qualis: A2
10. VIDEIRA, ALEXANDRE ; BECKEDORFF, FELIPE C. ; DASILVA, LUCAS F. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S.. PVT1 signals an androgen-dependent transcriptional repression program in prostate cancer cells and a set of the repressed genes predicts high-risk tumors. Cell Communication and Signaling. v. 19, p. 5, 2021. Qualis: A2
11. OLIVEIRA, DANYLLO ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; Zatz, Mayana. Phenotypic heterogeneity in amyotrophic lateral sclerosis type 8 and modifying mechanisms of neurodegeneration. Neural Regeneration Research. v. 16, p. 1776-1778, 2021. Qualis: B2 (NEURAL REGENERATION RESEARCH.)
12. FARIAS, LEONARDO PAIVA ; VITORIANO-SOUZA, JULIANA ; CARDOZO, LUCAS ESTEVES ; GAMA, LEONARDO DOS REIS ; SINGH, YOUVIKA ; MIYASATO, PATRÍCIA AOKI ; Almeida, Giulliana Tessarin ; RODRIGUEZ, DUNIA ; BARBOSA, MAYRA MARA FERRARI ; FERNANDES, RAFAELA SACHETTO ; BARBOSA, TEREZA CRISTINA ; NETO, ALMIRO PIRES DA SILVA ; NAKANO, ELIANA ; HO, PAULO LEE ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; NAKAYA, HELDER IMOTO ; WILSON, ROBERT ALAN ; Leite, Luciana Cezar de Cerqueira. Systems Biology Analysis of the Radiation-Attenuated Schistosome Vaccine Reveals a Role for Growth Factors in Protection and Hemostasis Inhibition in Parasite Survival. Frontiers in Immunology. v. 12, p. 624191, 2021. Qualis: A1
13. SILVEIRA, GILBERT O. ; AMARAL, MURILO S. ; COELHO, HELENA S. ; MACIEL, LUCAS F. ; PEREIRA, ADRIANA S. A. ; OLBERG, GIOVANNA G. O. ; Miyasato, Patricia A. ; NAKANO, ELIANA ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S.. Assessment of reference genes at six different developmental stages of Schistosoma mansoni for quantitative RT-PCR. Scientific Reports. v. 11, p. 16816, 2021. Qualis: A2
14. PICCHI-CONSTANTE, G. F. A. ; GUERRA-SLOMPO, E. P. ; Tahira, Ana C ; ALCANTARA, M. V. ; AMARAL, M. S. ; FERREIRA, A. S. ; BATISTA, M. ; BATISTA, C. M. ; GOLDENBERG, S. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S. ; ZANCHIN, N. I. T.. Metacyclogenesis defects and gene expression hallmarks of histone deacetylase 4-deficient Trypanosoma cruzi cells. Scientific Reports. v. 11, p. 21671, 2021. Qualis: A2
15. Amaral, Murilo Sena ; SANTOS, DAISY WOELLNER ; PEREIRA, ADRIANA S. A. ; TAHIRA, ANA CAROLINA ; MALVEZZI, JOÃO V. M. ; MIYASATO, PATRÍCIA AOKI ; FREITAS, RAFAELA DE PAULA ; KALIL, JORGE ; TJON KON FAT, ELISA M. ; DE DOOD, CLAUDIA J. ; CORSTJENS, PAUL L. A. M. ; VAN DAM, GOVERT J. ; NAKANO, ELIANA ; CASTRO, SIMONE DE OLIVEIRA ; MATTARAIA, VÂNIA GOMES DE MOURA ; AUGUSTO, RONALDO DE CARVALHO ; GRUNAU, CHRISTOPH ; Wilson, R. Alan ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; et.al. Rhesus macaques self-curing from a schistosome infection can display complete immunity to challenge. Nature Communications. v. 12, p. 6181, 2021. Qualis: A1
16. TAHIRA, ANA C. ; VERJOVSKI'ALMEIDA, SERGIO ; FERREIRA, SERGIO T.. Dementia is an age-independent risk factor for severity and death in COVID-19 inpatients. Alzheimers & Dementia. v. 17, p. 1818-1831, 2021. Qualis: A1 (ALZHEIMER'S & DEMENTIA)
17. LOBO-SILVA, JESSICA ; CABRAL, FERNANDA J. ; AMARAL, MURILO S. ; MIYASATO, PATRÍCIA A. ; DE FREITAS, RAFAELA PAULA ; PEREIRA, ADRIANA S. A. ; KHOURI, MARIANA I. ; BARBOSA, MAYRA M. F. ; RAMOS, PABLO I. P. ; LEITE, LUCIANA C. C. ; ASOJO, OLUWATOYIN A. ; NAKANO, ELIANA ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; Farias, Leonardo P.. The antischistosomal potential of GSK-J4, an H3K27 demethylase inhibitor: insights from molecular modeling, transcriptomics and in vitro assays. Parasites & Vectors. v. 13, p. 140, 2020. Qualis: A1
18. MACIEL, LUCAS F. ; MORALES-VICENTE, DAVID A. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S.. Dynamic Expression of Long Non-Coding RNAs Throughout Parasite Sexual and Neural Maturation in Schistosoma japonicum. Non-Coding RNA. v. 6, p. 15, 2020. Qualis: B2
19. COUTINHO CARNEIRO, VITOR ; DE ABREU DA SILVA, ISABEL CAETANO ; Amaral, Murilo Sena ; PEREIRA, ADRIANA S. A. ; SILVEIRA, GILBERT OLIVEIRA ; PIRES, DAVID DA SILVA ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; DEKKER, FRANK J. ; ROTILI, DANTE ; MAI, ANTONELLO ; LOPES-TORRES, EDUARDO JOSÉ ; ROBAA, DINA ; SIPPL, WOLFGANG ; Pierce, Raymond J. ; BORRELLO, M. TERESA ; GANESAN, A. ; LANCELOT, JULIEN ; THIENGO, SILVANA ; FERNANDEZ, MONICA AMMON ; et.al. Pharmacological inhibition of lysine-specific demethylase 1 (LSD1) induces global transcriptional deregulation and ultrastructural alterations that impair viability in Schistosoma mansoni. PLoS Neglected Tropical Diseases. v. 14, p. e0008332, 2020. Qualis: A1
20. Amaral, Murilo Sena ; GOULART, ERNESTO ; CAIRES-JÚNIOR, LUIZ CARLOS ; MORALES-VICENTE, DAVID ABRAHAM ; SOARES-SCHANOSKI, ALESSANDRA ; GOMES, ROSELANE PAIVA ; OLBERG, GIOVANNA GONÇALVES DE OLIVEIRA ; ASTRAY, RENATO MANCINI ; KALIL, JORGE E. ; Zatz, Mayana ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S.. Differential gene expression elicited by ZIKV infection in trophoblasts from congenital Zika syndrome discordant twins. PLoS Neglected Tropical Diseases. v. 14, p. e0008424, 2020. Qualis: A1
21. OLIVEIRA, DANYLLO ; MORALES-VICENTE, DAVID A ; AMARAL, MURILO S ; LUZ, LIVIA ; SERTIÉ, ANDREA L ; LEITE, FELIPE S ; NAVARRO, CLAUDIA ; KAID, CAROLINI ; ESPOSITO, JOYCE ; GOULART, ERNESTO ; CAIRES, LUIZ ; ALVES, LUCIANA M ; MELO, UIRÁ S ; FIGUEIREDO, THALITA ; MITNE-NETO, MIGUEL ; OKAMOTO, OSWALDO K ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; Zatz, Mayana. Different gene expression profiles in iPSC-derived motor neurons from ALS8 patients with variable clinical courses suggest mitigating pathways for neurodegeneration. HUMAN MOLECULAR GENETICS. v. 29, p. 1465-1475, 2020. Qualis: A1
22. AMARAL, MURILO S. ; MACIEL, LUCAS F. ; SILVEIRA, GILBERT O. ; OLBERG, GIOVANNA G. O. ; LEITE, JOÃO V. P. ; IMAMURA, LUCAS K. ; PEREIRA, ADRIANA S. A. ; Miyasato, Patricia A. ; NAKANO, ELIANA ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S.. Long non-coding RNA levels can be modulated by 5-azacytidine in Schistosoma mansoni. Scientific Reports. v. 10, p. 21565, 2020. Qualis: A2
23. PIERRY, PAULO MARQUES ; DE SANTANA, WESLEY OLIVEIRA ; Kitajima, João Paulo ; MARTINS-JUNIOR, JOAQUIM ; ZAINI, PAULO ADRIANO ; UCEDA-CAMPOS, GUILLERMO ; FEITOSA-JUNIOR, OSEIAS R. ; PESSOA, PATRÍCIA ISABELA SILVA ; COLETTA-FILHO, HELVÉCIO DELLA ; DE SOUZA, ALESSANDRA ALVES ; MACHADO, MARCOS ANTONIO ; GESTEIRA, ABELMON DA SILVA ; MARTINS, LAYLA FARAGE ; Amaral, Murilo Sena ; BECKEDORFF, FELIPE CESAR ; DE ALMEIDA, LUIZ GONZAGA PAULA ; DE VASCONCELOS, ANA TEREZA RIBEIRO ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; Setubal, João Carlos ; et.al. High-Quality Draft Genome Sequence Resources of Eight Strains Isolated from Citrus, Coffee, Plum, and Hibiscus in South America. PHYTOPATHOLOGY. v. 110, p. 1751-1755, 2020. Qualis: A1
24. MACIEL, LUCAS F. ; MORALES-VICENTE, DAVID A. ; SILVEIRA, GILBERT O. ; RIBEIRO, RAPHAEL O. ; OLBERG, GIOVANNA G. O. ; PIRES, DAVID S. ; AMARAL, MURILO S. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S.. Weighted Gene Co-Expression Analyses Point to Long Non-Coding RNA Hub Genes at Different Schistosoma mansoni Life-Cycle Stages. Frontiers in Genetics. v. 10, p. 823, 2019. Qualis: A2
25. PEREIRA, ADRIANA S. A. ; SILVEIRA, GILBERT O. ; AMARAL, MURILO S. ; ALMEIDA, SINARA M. V. ; OLIVEIRA, JAMERSON F. ; LIMA, MARIA C. A. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S.. In vitro activity of aryl-thiazole derivatives against Schistosoma mansoni schistosomula and adult worms. PLoS One. v. 14, p. e0225425, 2019. Qualis: A1
26. BAPTISTA, M.S. ; ALVES, M.J.M. ; ARANTES, G.M. ; ARMELIN, H.A. ; AUGUSTO, O. ; BALDINI, R.L. ; BASSERES, D.S. ; BECHARA, E.J.H. ; BRUNI-CARDOSO, A. ; CHAIMOVICH, H. ; COLEPICOLO NETO, P. ; COLLI, W. ; CUCCOVIA, I.M. ; DA-SILVA, A.M. ; DI MASCIO, P. ; FARAH, S.C. ; Ferreira, C. ; FORTI, F.L. ; GIORDANO, R.J. ; Verjovski-Almeida, S. ; et.al. Where do we aspire to publish? A position paper on scientific communication in biochemistry and molecular biology. Brazilian Journal of Medical and Biological Research (on line). v. 52, p. 1414-431x201989, 2019. Qualis: A4
27. VASCONCELOS, ELTON J R ; MESEL, VINÍCIUS C ; DASILVA, LUCAS F ; PIRES, DAVID S ; LAVEZZO, GUILHERME M ; PEREIRA, ADRIANA S A ; AMARAL, MURILO S ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S.. Atlas of Schistosoma mansoni long non-coding RNAs and their expression correlation to protein-coding genes. Database-The Journal of Biological Databases and Curation. v. 2018, p. bay068, 2018. Qualis: A1 (DATABASE: THE JOURNAL OF BIOLOGICAL DATABASES AND CURATION)
28. DASILVA, LUCAS F. ; BECKEDORFF, FELIPE C. ; AYUPE, ANA C. ; AMARAL, MURILO S. ; MESEL, VINÍCIUS ; VIDEIRA, ALEXANDRE ; Reis, Eduardo M. ; SETUBAL, JOÃO C. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S.. Chromatin Landscape Distinguishes the Genomic Loci of Hundreds of Androgen-Receptor-Associated LincRNAs From the Loci of Non-associated LincRNAs. Frontiers in Genetics. v. 9, p. 132, 2018. Qualis: A2
29. PEREIRA, ADRIANA S. A. ; AMARAL, MURILO S. ; VASCONCELOS, ELTON J. R. ; PIRES, DAVID S. ; ASIF, HUMA ; DASILVA, LUCAS F. ; MORALES-VICENTE, DAVID A. ; CARNEIRO, VITOR C. ; ANGELI, CLAUDIA B. ; PALMISANO, GIUSEPPE ; FANTAPPIE, MARCELO R. ; PIERCE, RAYMOND J. ; Setubal, João C. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio. Inhibition of histone methyltransferase EZH2 in Schistosoma mansoni in vitro by GSK343 reduces egg laying and decreases the expression of genes implicated in DNA replication and noncoding RNA metabolism. PLoS Neglected Tropical Diseases. v. 12, p. e0006873, 2018. Qualis: A1
30. CAIRES-JÚNIOR, LUIZ CARLOS ; GOULART, ERNESTO ; MELO, UIRÁ SOUTO ; ARAUJO, BRUNO HENRIQUE SILVA ; ALVIZI, LUCAS ; SOARES-SCHANOSKI, ALESSANDRA ; DE OLIVEIRA, DANYLLO FELIPE ; KOBAYASHI, GERSON SHIGERU ; GRIESI-OLIVEIRA, KARINA ; MUSSO, CAMILA MANSO ; Amaral, Murilo Sena ; DASILVA, LUCAS FERREIRA ; ASTRAY, RENATO MANCINI ; SUÁREZ-PATIÑO, SANDRA FERNANDA ; VENTINI, DANIELLA CRISTINA ; DA SILVA, SÉRGIO GOMES ; YAMAMOTO, GUILHERME LOPES ; EZQUINA, SUZANA ; NASLAVSKY, MICHEL SATYA ; Verjovski-Almeida, S. ; et.al. Publisher Correction: Discordant congenital Zika syndrome twins show differential in vitro viral susceptibility of neural progenitor cells. Nature Communications. v. 9, p. 1114, 2018. Qualis: A1
31. ROVERSI, F. M. ; PERICOLE, F. V. ; MACHADO-NETO, J. A. ; DUARTE, A. S. ; LONGHINI, A. L. L. ; CORROCHER, F. A. ; PALODETTO, B. ; FERRO, K. P. ; ROSA, R. G. ; Baratti, Mariana O ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S. ; TRAINA, F. ; MOLINARI, A. ; BOTTA, M. ; SAAD, S. T. O.. Hematopoietic cell kinase (HCK) is a potential therapeutic target for dysplastic and leukemic cells due to integration of erythropoietin/PI3K pathway and regulation of erythropoiesis. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA. MOLECULAR BASIS OF DISEASE. v. 1863, p. 450-461, 2017. Qualis: Não identificado (MOLECULAR BASIS OF DISEASE)
32. DE ALMEIDA, DANILO CANDIDO ; BASSI, ÊNIO JOSE ; AZEVEDO, HATYLAS ; Anderson, Letícia ; ORIGASSA, CLARICE SILVIA TAEMI ; CENEDEZE, MARCOS ANTÔNIO ; ANDRADE-OLIVEIRA, VINICIUS DE ; FELIZARDO, RAPHAEL JOSÉ FERREIRA ; SILVA, REINALDO CORREIA DA ; HIYANE, MEIRE IOSHIE ; SEMEDO, PATRICIA ; REIS, MARLENE ANTÔNIA DOS ; MOREIRA-FILHO, CARLOS ALBERTO ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; PACHECO-SILVA, ÁLVARO ; CÂMARA, NIELS OLSEN SARAIVA. A Regulatory miRNA-mRNA Network Is Associated with Tissue Repair Induced by Mesenchymal Stromal Cells in Acute Kidney Injury. Frontiers in Immunology (Online). v. 7, p. 645, 2017. Qualis: A1
33. SHERIDAN, MEGAN A. ; YUNUSOV, DINAR ; BALARAMAN, VELMURUGAN ; ALEXENKO, ANDREI P. ; YABE, SHINICHIRO ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; SCHUST, DANNY J. ; FRANZ, ALEXANDER ; SADOVSKY, YOEL ; EZASHI, TOSHIHIKO ; ROBERTS, R. MICHAEL. Vulnerability of primitive human placental trophoblast to Zika virus. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. v. 00, p. 201616097, 2017. Qualis: A1
34. VASCONCELOS, E. J. R. ; DASILVA, LUCAS FERREIRA ; PIRES, D. S. ; LAVEZZO, G. M. ; PEREIRA, ADRIANA DA SILVA ANDRADE ; AMARAL, MURILO S. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S.. The Schistosoma mansoni genome encodes thousands of long non-coding RNAs predicted to be functional at different parasite life-cycle stages. Scientific Reports. v. 7, p. 10508, 2017. Qualis: A2
35. MORAIS, ENYARA R. ; OLIVEIRA, K. C. ; PAULA, R. G. ; ORNELAS, A. M. ; MOREIRA, E. B. C. ; BADOCO, F. R. ; MAGALHÃES, LIZANDRA G. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; RODRIGUES, Vanderlei. Effects of proteasome inhibitor MG-132 on the parasite Schistosoma mansoni. PLoS One. v. 12, p. e0184192, 2017. Qualis: A1
36. Vieira, Natassia M. ; SPINAZZOLA, JANELLE M. ; ALEXANDER, MATTHEW S. ; Moreira, Yuri B. ; KAWAHARA, GENRI ; GIBBS, DEVIN E. ; MEAD, LILLIAN C. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; Zatz, Mayana ; KUNKEL, LOUIS M.. Repression of phosphatidylinositol transfer protein α ameliorates the pathology of Duchenne muscular dystrophy. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA (ONLINE). v. 114, p. 201703556, 2017. Qualis: A1
37. Anderson, Letícia ; GOMES, MONETE RAJÃO ; DASILVA, LUCAS FERREIRA ; PEREIRA, ADRIANA DA SILVA ANDRADE ; MOURÃO, MARINA M. ; ROMIER, CHRISTOPHE ; PIERCE, RAYMOND ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S.. Histone deacetylase inhibition modulates histone acetylation at gene promoter regions and affects genome-wide gene transcription in Schistosoma mansoni. PLoS Neglected Tropical Diseases. v. 11, p. e0005539, 2017. Qualis: A1
38. Oliveira, Katia C. ; Carvalho, Mariana L. P. ; BONATTO, JOSÉ MATHEUS C. ; SCHECHTMAN, DEBORA ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S.. Human TNF-α induces differential protein phosphorylation in Schistosoma mansoni adult male worms. Parasitology Research (1987. Print). v. 115, p. 817-828, 2016. Qualis: Não identificado (PRINT))
39. DEOCESANO-PEREIRA, CARLOS ; AMARAL, MURILO S. ; PARREIRA, KLEBER S. ; AYUPE, ANA C. ; JACYSYN, JACQUELINE F. ; AMARANTE-MENDES, GUSTAVO P. ; Reis, Eduardo M. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S.. Long non-coding RNA INXS is a critical mediator of BCL-XS induced apoptosis. Nucleic Acids Research. v. 00, p. gkw713, 2016. Qualis: A1
40. YUNUSOV, D. ; ANDERSON, L. ; SILVA, L. F. ; WYSOCKA, J. ; EZASHI, T. ; ROBERTS, R. M. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S.. HIPSTR and thousands of lncRNAs are heterogeneously expressed in human embryos, primordial germ cells and stable cell lines. Scientific Reports. v. 6, p. 32753, 2016. Qualis: A2
41. ORCIA, DÉBORA ; ZERAIK, ANA ELIZA ; LOPES, JOSÉ L.S. ; MACEDO, JOCI N.A. ; SANTOS, CLARISSA ROMANO DOS ; Oliveira, Katia C. ; ANDERSON, LETICIA ; WALLACE, B.A. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; ARAUJO, ANA P.U. ; DEMARCO, Ricardo. Interaction of an esophageal MEG protein from schistosomes with a human S100 protein involved in inflammatory response. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENERAL SUBJECTS. v. 1861, p. 3490-3497, 2016. Qualis: A1 (BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA. G, GENERAL SUBJECTS)
42. CANEVARI, RENATA A. ; MARCHI, FABIO A. ; DOMINGUES, MARIA A. C. ; DE ANDRADE, VICTOR PIANA ; CALDEIRA, JOSÉ R. F. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; ROGATTO, SILVIA R. ; Reis, Eduardo M.. Identification of novel biomarkers associated with poor patient outcomes in invasive breast carcinoma. Tumor Biology. v. 37, p. 13855-13870, 2016. Qualis: A4
43. ALMEIDA, GIULLIANA T. ; LAGE, REGINA C. G. ; ANDERSON, LETICIA ; VENANCIO, THIAGO M. ; Nakaya, Helder I. ; MIYASATO, PATRÍCIA A. ; ROFATTO, HENRIQUE K. ; ZERLOTINI, ADHEMAR ; NAKANO, ELIANA ; OLIVEIRA, GUILHERME ; Verjovski-Almeida, Sergio. Synergy of Omeprazole and Praziquantel In Vitro Treatment against Schistosoma mansoni Adult Worms. PLoS Neglected Tropical Diseases (Online). v. 9, p. e0004086, 2015. Qualis: A1
44. AYUPE, ANA C ; Tahira, Ana C ; CAMARGO, LAUREN ; BECKEDORFF, FELIPE C ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; REIS, Eduardo M. Global analysis of biogenesis, stability and sub-cellular localization of lncRNAs mapping to intragenic regions of the human genome. RNA Biology. v. 12, p. 877-892, 2015. Qualis: A2
45. Anderson, Letícia ; AMARAL, MURILO S. ; BECKEDORFF, FELIPE ; SILVA, LUCAS F. ; Dazzani, Bianca ; Oliveira, Katia C. ; Almeida, Giulliana T. ; GOMES, MONETE R. ; PIRES, DAVID S. ; SETUBAL, JOÃO C. ; DEMARCO, Ricardo ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S.. Schistosoma mansoni Egg, Adult Male and Female Comparative Gene Expression Analysis and Identification of Novel Genes by RNA-Seq. PLoS Neglected Tropical Diseases (Online). v. 9, p. e0004334, 2015. Qualis: A1
46. VIEIRA, NATASSIA M. ; ELVERS, INGEGERD ; ALEXANDER, MATTHEW S. ; MOREIRA, YURI B. ; ERAN, ALAL ; GOMES, JULIANA P. ; MARSHALL, JAMIE L. ; KARLSSON, ELINOR K. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; LINDBLAD-TOH, KERSTIN ; KUNKEL, LOUIS M. ; Zatz, Mayana. Jagged 1 Rescues the Duchenne Muscular Dystrophy Phenotype. Cell (Cambridge). v. 163, p. 1204-1213, 2015. Qualis: A1
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110. LEVANOGARCIA, Julio ; Verjovski-Almeida, S. ; DASILVA, Ana C R. Mapping transposon insertion sites by touchdown PCR and hybrid degenerate primer.. BioTechniques. v. 38, p. 225-229, 2005.Qualis: A4
111. Reis, E. M. ; OJOPI, Elida ; ALBERTO, Fernando L ; RAHAL, Paula ; TSUKUMO, Fernando ; MANCINI, Ulises M ; GUIMARAES, Gustavo S ; THOMPSON, Gloria M A ; CAMACHO, Cleber ; MIRACCA, Elisabete ; CARVALHO, Andre L ; MACHADO, Abimael A ; PAQUOLA, Apua ; CERUTTI, Janette ; DA SILVA, A. M. ; PEREIRA, Gonçalo G ; VALENTINI, Sandro R ; KOWALSKI, Luiz P ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; TAJARA, Eloiza H. Large-scale transcriptome analyses reveal new genetic marker candidates of head, neck and thyroid cancer.. Cancer Research (Chicago, Ill.). v. 65, p. 1693-1699, 2005. Qualis: A1
112. SIMOES, Ana C ; DASILVA, Aline M ; Verjovski-Almeida, S. ; REIS, Eduardo M. SAM Method as an Approach to Select Candidates for Human Prostate Cancer Markers. Lecture Notes In Bioinformatics. v. 3594, p. 202-205, 2005.Qualis: Não identificado (LECTURE NOTES IN BIOINFORMATICS)
113. VENANCIO, Thiago M ; DEMARCO, Ricardo ; OLIVEIRA, Katia Cp ; SIMOES, Ana C ; DASILVA, Aline M ; Verjovski-Almeida, S.. Genomics and Gene Expression Management Tools for the Schistosoma Mansoni cDNA Microarray Project. Lecture Notes In Bioinformatics. v. 3594, p. 198-201, 2005.Qualis: Não identificado (LECTURE NOTES IN BIOINFORMATICS)
114. Reis, Eduardo M. ; LOURO, Rodrigo ; NAKAYA, HELDER I. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S.. As Antisense RNA Gets Intronic. Journal of Integrative Biology / Omics (Larchmont), New Rochelle, NY. v. 9, n. 1, p. 2-12, 2005. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOLOGY / OMICS , NEW ROCHELLE, NY)
115. BRENTANI, RICARDO R. ; CARRARO, DIRCE MARIA ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; Reis, Eduardo M. ; NEVES, E. JORDÃO ; DE SOUZA, SANDRO J. ; CARVALHO, ALEX F. ; BRENTANI, Helena ; REIS, LUIZ F.L.. Gene expression arrays in Cancer Research: Methods and Applications.. Critical Reviews in Oncology/Hematology. v. 54, p. 95-105, 2005. Qualis: A1
116. DEMARCO, Ricardo ; MACHADO, ABIMAEL A. ; BISSON-FILHO, ALEXANDRE W. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S.. Identification of 18 new transcribed retrotransposons in Schistosoma mansoni. Biochemical and Biophysical Research Communications (Print). v. 333, p. 230-240, 2005. Qualis: A3
117. Verjovski-Almeida, S.; DEMARCO, Ricardo. Genoma contra a esquistossomose. Scientific American Brasil, São Paulo. v. 28, p. 54-61, 2004.Qualis: Não identificado (SCIENTIFIC AMERICAN BRASIL, SÃO PAULO)
118. REIS, Eduardo M ; NAKAYA, Helder I ; LOURO, Rodrigo ; CANAVEZ, Flavio C ; FLATSCHART, ÁUREA V F ; ALMEIDA, Giulliana T ; EGIDIO, Camila M ; PAQUOLA, Apuã C ; MACHADO, Abimael A ; FESTA, Fernanda ; YAMAMOTO, Denise ; ALVARENGA, Renato ; DA SILVA, CAMILLE C ; BRITO, Glauber C ; SIMON, Sérgio D ; MOREIRA-FILHO, CARLOS A ; LEITE, Katia R ; CAMARA-LOPES, Luiz H ; CAMPOS, Franz S ; Verjovski-Almeida, S. ; et.al. Antisense intronic non-coding RNA levels correlate to the degree of tumor differentiation in prostate cancer. Oncogene (Basingstoke). v. 23, n. 39, p. 6684-6692, 2004. Qualis: A1
119. FIETTO, JULIANA L.R. ; DEMARCO, Ricardo ; NASCIMENTO, IVAN P. ; CASTRO, IESO M. ; CARVALHO, TÉCIA M.U. ; DE SOUZA, WANDERLEY ; Bahia, Maria T. ; ALVES, MARIA J.M. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S.. Characterization and immunolocalization of an NTP diphosphohydrolase of Trypanosoma cruzi. Biochemical and Biophysical Research Communications (Print). v. 316, p. 454-460, 2004. Qualis: A3
120. NASCIMENTO, A. L. T. O. ; KO, A. I. ; MARTINS, E. A. L. ; MONTEIRO-VITORELLO, C. B. ; HO, P. L. ; HAAKE, D. A. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S. ; HARTSKEERL, R. A. ; MARQUES, M. V. ; OLIVEIRA, M. C. ; MENCK, C. F. M. ; LEITE, L. C. C. ; CARRER, H. ; COUTINHO, L. L. ; DEGRAVE, W. M. ; DELLAGOSTIN, O. A. ; EL-DORRY, H. ; FERRO, E. S. ; FERRO, M. I. T. ; et.al. Comparative genomics of two Leptospira interrogans serovars reveals novel insights into physiology and pathogenesis.. Journal of Bacteriology, estados unidos. v. 186, n. 7, p. 2164-2172, 2004. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF BACTERIOLOGY, ESTADOS UNIDOS)
121. KOIDE, T. ; ZAINI, P. A. ; MOREIRA, L. M. ; VENCIO, R. Z. N. ; MATSUKUMA, A. Y. ; DURHAM, A. M. ; TEIXEIRA, D. C. ; EL-DORRY, H. ; MONTEIRO, P. B. ; DA SILVA, A. C. R. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S. ; da SILVA, A. M. ; GOMES, S. L.. DNA Microarray-Based Genome Comparison of a Pathogenic and a Nonpathogenic Strain of Xylella fastidiosa Delineates Genes Important for Bacterial Virulence. Journal of Bacteriology (Print). v. 186, p. 5442-5449, 2004. Qualis: A3
122. SETUBAL, J. C.; NASCIMENTO, Ana Lucia Tabet ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; SLUYS, Marie Anne Van ; MONTEIRO-VITORELLO, Claudia B. ; CAMARGO, Luis Eduardo Aranha ; DIGIAMPIETRI, Luciano A. ; HARTSKEERL, Rudy ; HO, Paulo Lee ; MARQUES, Marilis ; OLIVEIRA, Mariana Cabral de ; HAAKE, David ; MARTINS, Elizabeth. Genome features of Leptospira interrogans serovar Copenhageni.. Brazilian Journal of Medical and Biological Research. v. 37, n. 4, p. 459-477, 2004. Qualis: A4
123. LOURO, Rodrigo ; NAKAYA, HELDER I. ; PAQUOLA, APUÃ C.M. ; MARTINS, ELIZABETH A.L. ; SILVA, ALINE M.DA ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; Reis, Eduardo M.. RASL11A, member of a novel small monomeric GTPase gene family, is down-regulated in prostate tumors.. Biochemical and Biophysical Research Communications, Estados Unidos. v. 316, n. 3, p. 618-627, 2004. Qualis: A3 (BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS)
124. DEMARCO, R. ; KOWALTOWSKI, A. T. ; MACHADO, A. A. ; SOARES, M. B. ; GARGIONI, C. ; KAWANO, T. ; RODRIGUES, V. ; MADEIRA, A. M. B. N. ; Wilson, R. A. ; MENCK, C. F. M. ; SETUBAL, J. C. ; DIAS-NETO, E. ; LEITE, L. C. C. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S.. Saci-1, -2, and -3 and Perere, Four Novel Retrotransposons with High Transcriptional Activities from the Human Parasite Schistosoma mansoni. Journal of Virology, estados unidos. v. 78, n. 6, p. 2967-2978, 2004. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF VIROLOGY, ESTADOS UNIDOS)
125. Verjovski-Almeida, S.; Verjovski-Almeida, Sergio ; LEITE, LUCIANA C.C. ; DIAS-NETO, EMMANUEL ; MENCK, CARLOS F.M. ; WILSON, R.ALAN. Schistosome transcriptome: insights and perspectives for functional genomics. Trends in Parasitology. v. 20, p. 304-308, 2004. Qualis: A1
126. MADEIRA, L. ; DEMARCO, R. ; GAZARINI, M. ; Verjovski-Almeida, S. ; GARCIA, C.. Human Malaria Parasites Display a Receptor for Activated C Kinase (RACK) Ortholog. Biochemical and Biophysical Research Communications (Print), USA. v. 306, p. 995-1001, 2003.Qualis: A3 (BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS)
127. VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; DeMarco, Ricardo ; Martins, Elizabeth A L ; Guimarães, Pedro E M ; Ojopi, Elida P B ; Paquola, Apuã C M ; Piazza, João P ; Nishiyama, Milton Y ; Kitajima, João P ; Adamson, Rachel E ; Ashton, Peter D ; Bonaldo, Maria F ; Coulson, Patricia S ; Dillon, Gary P ; Farias, Leonardo P ; Gregorio, Sheila P ; Ho, Paulo L ; Leite, Ricardo A ; Malaquias, L Cosme C ; SETUBAL, J. C. ; et.al. Transcriptome analysis of the acoelomate human parasite Schistosoma mansoni. Nature Genetics, Reino Unido. v. 35, p. 148-157, 2003. Qualis: Não identificado (NATURE GENETICS, REINO UNIDO)
128. PAQUOLA, A. C. M. ; NISHYIAMA, M. Y. ; REIS, E. M. ; da SILVA, A. M. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S.. ESTWeb: bioinformatics services for EST sequencing projects. Bioinformatics (Oxford. Print). v. 19, p. 1587-1588, 2003. Qualis: Não identificado (PRINT))
129. DEMARCO, Ricardo ; KOWALTOWSKI, ANDRE T ; MORTARA, Renato A ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S.. Molecular characterization and immunolocalization of Schistosoma mansoni ATP-diphosphohydrolase. Biochemical and Biophysical Research Communications (Print). v. 307, p. 831-838, 2003. Qualis: A3
130. PAQUOLA, A. C.M. ; MACHADO, A. A. ; REIS, E. M. ; da SILVA, A. M. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S.. Zerg: a very fast BLAST parser library. Bioinformatics (Oxford. Print). v. 19, p. 1035-1036, 2003. Qualis: Não identificado (PRINT))
131. MEIDANIS, J. ; BRAGA, M. ; Verjovski-Almeida, S.. Whole Genome Analysis of Transporters in the plant pathogen Xylella fastidiosa. Microbiology and Molecular Biology Reviews. v. 66, n. 6, p. 272-299, 2002.Qualis: Não identificado (MICROBIOLOGY AND MOLECULAR BIOLOGY REVIEWS)
132. FIETTO, J. L. R. ; DEMARCO, Ricardo ; Verjovski-Almeida, S.. Use of degenerate primers and touchdown PCR for construction of cDNA Libraries.. BioTechniques. v. 32, n. 6, p. 1404-1411, 2002.Qualis: A4
133. FROHME, M. ; CAMARGO, A. ; CZINK, C. ; MATSUKUMA, A. ; SIMPSON, A. ; HOHEISEL, J. ; Verjovski-Almeida, S.. Directed gap closure in large scale sequencing projects. Genome Research, USA. v. 11, p. 901-903, 2001.Qualis: Não identificado (GENOME RESEARCH, USA)
134. CAMARGO, A. ; SAMAIA, H. ; DIASNETO, Emmanuel ; SIMAO, D. ; MIGOTTO, I. ; BRIONES, M. ; COSTA, F. ; NAGAI, M ; Verjovski-Almeida, S. ; ZAGO, M. ; et.alli ; 87_other_authors ; BRENTANI, R. R. ; SIMPSON, A. J. ; DESOUZA, S.. The contribution of 700,000 ?ORF sequence tags? to the definition of the human transcriptome.. PNAS. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, USA. v. 98, n. 21, p. 12103-12108, 2001. Qualis: A1 (PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA)
135. D NETO, e ; CORREA, R.G ; Verjovski-Almeida, S. ; BRIONES, M. ; NAGAI, M. A. ; JUNIOR, W.S ; ZAGO, M. A. ; BORDIN, S. ; COSTA, F. F. ; GOLDMAN, G. H. ; CARVALHO, A. F. ; MATSUKUMA, A. ; BAIA, G. S. ; SIMPSON, D. H. ; BURSTEIN, A. ; OLIVEIRA, P. S. L. ; BUCHER, P. ; JONGENEEL, C. V. ; O'HARE, M. J. ; SOARES, F. ; et.al. Shotgun sequencing of the human transcriptome with open reading frame expressed sequence tags,. PNAS. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. v. 97, p. 3491-3496, 2000.Qualis: A1
136. CARVALHO-ALVES, P. C. ; HERING, V. R. ; OLIVEIRA, J. M. S. ; SALINAS, R. K. ; Verjovski-Almeida, S.. Requirement of the hinge domain for dimerization of Ca2+-ATPase large cytoplasmic portion expressed in bacteria. Biochimica et Biophysica Acta. Bioenergetics. v. 1467, n. 1, p. 73-84, 2000.Qualis: C
137. DESOUZA, S. ; CAMARGO, A. ; BRIONES, M. ; COSTA, F. ; NAGAI, M ; Verjovski-Almeida, S. ; 69_other_authors ; BRENTANI, R. R. ; REIS, L. F. L. ; DIAS NETO, E. ; SIMPSON, A. J.. Identification of human chromosome 22 transcribed sequences with ORF expressed sequence tags. PNAS. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. v. 97, p. 12690-12693, 2000.Qualis: A1
138. FIETTO, J. ; DEMARCO, R. ; Verjovski-Almeida, S. ; D NETO, e ; SIMPSON, A.. Construction of ORESTES cDNA Libraries using Touch-down PCR. U S Letters Patent Application no 196716, Addendum to the Patent. 2000.Qualis: Não identificado (U S LETTERS PATENT APPLICATION NO 196716, ADDENDUM TO THE PATENT)
139. Simpson, A. J. G. ; Reinach, F.C. ; Arruda, P. ; Abreu, F. A. ; Acencio, M. ; Alvarenga, R. ; Alves, L. M. C. ; Araya, J. E. ; Baia, G. S. ; Baptista, C. S. ; Barros, M. H. ; Bonaccorsi, E. D. ; Bordin, S. ; Bové, J. M. ; Briones, M. R. S. ; Bueno, M. R. P. ; CAMARGO, A. A. ; Camargo, L. E. A. ; Carraro, D. M. ; DA SILVA, A. M.. The genome sequence of the plant pathogen Xylella fastidiosa.. Nature (London), Londres. v. 406, p. 151-157, 2000. Qualis: Não identificado (NATURE , LONDRES)
Livros publicados/organizados ou edições (0)
Capítulos de livros publicados (5)
1. MACIEL, LUCAS F. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S.. Step-by-Step Bioinformatics Analysis of Schistosoma mansoni Long Non-coding RNA Sequences. Em: Timson D.. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York, NY. : Springer US. 2020.v. 2151, p. 109-133.
2. DEMARCO, Ricardo ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S.. Expressed Sequence Tags (ESTs) and Gene Discovery: Schistosoma mansoni. Em: Gruber, A.; Durham, A.M.; Huynh, C.; del Portillo, H.A.. (Org.). Bioinformatics in Tropical Disease Research: A Practical and Case-Study Approach. Bethesda, MD. : National Library of Medicine. 2008..
3. DEMARCO, Ricardo ; Verjovski-Almeida, S.. Schistosome DNA transposons. Em: PJ Brindley. (Org.). Mobile genetic elements in metazoan parasites. Austin, Tx. : Eurekah Press/Landesbioscience. 2007..
4. Nakaya, Helder I.; Reis, Eduardo M. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio. Concepts on microarray design for genome and transcriptome analyses. Em: Anton A. Buzdin; Sergey A. Lukyanov. (Org.). Nucleic Acids Hybridization Modern Applications. 1ed.Berlim. : Springer Netherlands. 2007.p. 265-307.
5. Verjovski-Almeida, S.; DEMARCO, Ricardo. The Schistosome Transcriptome. Em: A.G. Maule; N.J. Marks. (Org.). Parasitic Flatworms: Molecular Biology, Biochemistry, Immunology and Physiology. Wallingford, UK. : CAB International. 2006.p. 138-148.
Textos em jornais de notícias/revistas (0)
Trabalhos completos publicados em anais de congressos (0)
Resumos expandidos publicados em anais de congressos (0)
Resumos publicados em anais de congressos (0)
Artigos aceitos para publicação (0)
Apresentações de trabalho (0)
Demais tipos de produção bibliográfica (3)
1. DASILVA, LUCAS F ; TAHIRA, A. C. ; MESEL, VINÍCIUS ; Verjovski-Almeida S. A Deep Learning approach predicts the impact of point mutations in intronic flanking regions on micro-exon splicing definition. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/868786v1.full. 2019. preprint
2. CARNEIRO, V. C. ; SILVA, I C A ; AMARAL, MURILO ; PEREIRA, ADRIANA S. A. ; SILVEIRA, GILBERT O. ; PIRES, DAVID S ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S. ; DEKKER, F. J. ; ROTILI, D. ; MAI, A. ; TORRES, E. J. L. ; ROBAA, D. ; SIPPL, W. ; Pierce, Raymond J. ; BORRELLO, M. T. ; GANESAN, A. ; LANCELOT, J. ; THIENGO, S. ; FERNANDEZ, M. A. ; et.al. Pharmacological inhibition of lysine-specific demethylase 1 (LSD1) induces global transcriptional deregulation and ultrastructural alterations that impair viability in Schistosoma mansoni. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/829549v2.full. 2019. LSD1) induces global transcriptional deregulation and ultrastructural alterations that impair viability in Schistosoma mansoni. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/829549v2.full, 2019 (preprint
3. AMARAL, MURILO S ; GOULART, ERNESTO ; CAIRES-JÚNIOR, LUIZ CARLOS ; MORALES-VICENTE, DAVID A. ; SOARES-SCHANOSKI, ALESSANDRA ; GOMES, R. P. ; OLBERG, GIOVANNA G. O. ; ASTRAY, RENATO MANCINI ; KALIL, JORGE ; Zatz, Mayana ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S.. Differential gene expression elicited by ZIKV infection in trophoblasts from congenital Zika syndrome discordant twins. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/867465v2.full. 2019. preprint

Produção técnica

Programas de computador com registro (0)
Programas de computador sem registro (0)
Produtos tecnológicos (0)
Processos ou técnicas (3)
1. Verjovski-Almeida, S.; SILVA, A. C. R.. Metodo para detectar por sequenciamento a presença do RNA da apirase de Schistosoma mansoni, metodo para produção de fragmento vacinal de apirase em organismo recombinante. 2003.
2. Verjovski-Almeida, S.; GARGIONE, Cybele ; KAWANO, Toshie ; MENCK, Carlos Cf ; SETUBAL, Joao C ; LEITE, Luciana Cc ; RODRIGUES, Vanderlei ; MADEIRA, Alda Bn ; DIASNETO, Emmanuel. Schistosoma mansoni genes and uses thereof. 2003.
3. Verjovski-Almeida, S.; SILVA, A. C. R.. Metodo para identificar o local de inserção de um segmento de DNA cuja sequência é conhecida, inserido em trecho de local ignorado do DNAgenômico de um organismo. 2003.
Trabalhos técnicos (0)
Demais tipos de produção técnica (0)

Produção artística

Total de produção artística (0)

Orientações em andamento

Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (2)
1. Karolline Monteiro Vieira da Silva. Caracterização e quantificação da expressão da família de genes de microexons (MEGs) em Schistosoma mansoni. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, . Início: 2024.
  Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
2. Thalles Souza-Lopes. Identificação de RNAs longos não-codificadores envolvidos no programa de regulação do desenvolvimento celular de trofoblastos humanos. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2021.
  Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
Dissertação de mestrado (1)
1. Caio Felipe Freire de Sousa. Identificação de novos RNAs longos não codificadores em Schistosoma mansoni e mapeamento na versão 10 do genoma. Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2024.
  Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (0)

Supervisões e orientações concluídas

Supervisão de pós-doutorado (18)
1. Maria Gabriela Berzoti Coelho. . Instituto Butantan, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2024.
  Supervisor: Sergio Verjovski Almeida.
2. Adriana da Silva Andrade Pereira. . Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2020.
  Supervisor: Sergio Verjovski Almeida.
3. Raphael Orelis Ribeiro. . Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2020.
  Supervisor: Sergio Verjovski Almeida.
4. Elton José Rosas de Vasconcelos. . Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2016.
  Supervisor: Sergio Verjovski Almeida.
5. Felipe Cesar Ferrarezi Beckedorff. . Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2015.
  Supervisor: Sergio Verjovski Almeida.
6. Murilo Sena Amaral. . Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2014.
  Supervisor: Sergio Verjovski Almeida.
7. Kleber Parreira. . Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2013.
  Supervisor: Sergio Verjovski Almeida.
8. Angela Fachel. . Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2013.
  Supervisor: Sergio Verjovski Almeida.
9. Giulliana Tessarin e Almeida. . Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2013.
  Supervisor: Sergio Verjovski Almeida.
10. Katia C P Oliveira. . Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2012.
  Supervisor: Sergio Verjovski Almeida.
11. Yuri J C B Moreira. . Universidade de São Paulo, . 2010.
  Supervisor: Sergio Verjovski Almeida.
12. Rodrigo Louro. . Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2009.
  Supervisor: Sergio Verjovski Almeida.
13. Anna Smirnova. . Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2009.
  Supervisor: Sergio Verjovski Almeida.
14. Helder I. Nakaya. Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2008.
  Supervisor: Sergio Verjovski Almeida.
15. Ricardo de Marco. . Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2007.
  Supervisor: Sergio Verjovski Almeida.
16. Tarik El-Jundi. . Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2006.
  Supervisor: Sergio Verjovski Almeida.
17. EDUARDO M REIS. . Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2005.
  Supervisor: Sergio Verjovski Almeida.
18. Flavio C Canavez. . Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2002.
  Supervisor: Sergio Verjovski Almeida.
Tese de doutorado (24)

Daisy Woellner Santos. Identificação de epítopos antigênicos do parasita Schistosoma mansoni alvejados pela resposta imune de macacos rhesus (Macaca mulatta) auto curados e resistentes à reinfecção utilizando uma biblioteca de Phage display contendo sequências de DNA sintéticas.. Tese (Doutorado em Quimica Bioquimica) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2023.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
Gilbert de Oliveira Silveira. Caracterização funcional de RNAs longos não-codificadores de proteínas em Schistosoma mansoni. Tese (Doutorado em Quimica Bioquimica) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2022.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
David Abraham Morales Vicente. Caracterização da evolução dos RNAs longos não-codificadores no transcriptoma do cortex cerebral em desenvolvimento.. Tese (Doutorado em Quimica Bioquimica) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2022.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
Alexandre Videira. Efeito do lincRNA PVT1 associado ao potenciador de Zeste homólogo 2 (EZH2) e ao receptor de andrógeno (AR) sobre a expressão gênica em larga escala em células LNCaP de câncer de próstata. Tese (Doutorado em Quimica Bioquimica) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2019.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
Lucas Ferreira da Silva. LincRNAs fisicamente associados ao receptor de andrógeno modificam o perfil de marcas da cromatina vizinha e alteram a expressão gênica local. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2017.
Orientadores: Joao Carlos Setubal, Sergio Verjovski Almeida.
Dinar Yunusov. Caracterização do HIPSTR destaca o padrão de expressão heterogênea de lncRNAs em embriões humanos e linhagens estáveis de células.. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2016.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
Leticia Anderson. Regulação epigenética da expressão gênica de Schistosoma mansoni induzida por inibidor de histona deacetilase.. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2016.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
Carlos DeOcesano Pereira. INXS, um longo RNA não codificador de proteínas mediador da apoptose. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2015.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
Vinicius Ramos Henriques Maracajá Coutinho. Caracterização in silico e análise de expressão de RNAs não codificadores longos no genoma de eucariotos. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2013.
Orientadores: Joao Carlos Setubal, Sergio Verjovski Almeida.
Murilo Sena Amaral. Caracterização da interação entre RNAs não codificadores (ncRNAs) intrônicos e proteínas com domínios de ligação a RNA. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2013.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
Felipe Cesar Ferrarezi Beckedorff. Recrutamento do complexo repressivo polycomb 2 pelo RNA não codificador longo antissenso ANRASSF1 modula a expressão do gene RASSF1A e a proliferação celular. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2012.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
Giulliana T Almeida. Expressão genica em S. mansoni. Tese (Doutorado em Quimica Bioquimica) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2010.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
Yuri J C B Moreira. Expressão gênica em tumores de próstata de pacientes com longo período de acompanhamento. Tese (Doutorado em Quimica Bioquimica) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2010.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
Leticia Anderson. Enzimas modificadoras de histonas em Schistosoma mansoni. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Universidade de São Paulo, . 2010.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
Angela Fachel. Expressão gênica em larga escala em cancer de rim. Tese (Doutorado em Quimica Bioquimica) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2009.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
Katia Cristina Pereira Oliveira. Expressão gênica em Schistosoma mansoni com o uso de microarrays de DNA. Tese (Doutorado em Quimica Bioquimica) - Universidade de São Paulo, . 2009.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
Julio Cesar Levano Garcia. Caracterização bioquímica e imunológica das enzimas recombinantes ATP-difosfohidrolases 1 e 2 do parasita Schistosoma mansoni. Tese (Doutorado em Quimica Bioquimica) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2008.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
Thiago Motta Venancio. Análise computacional da expressão gênica no parasita protostomado Schistosoma mansoni. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2008.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
Helder Takashi Imoto Nakaya. Identificação e Análise de Expressão de RNAs Intrônicos Não Codificadores Humanos. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2007.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
Ana Claudia Oliveira Carreira. Expressão e caracterização de mutantes pontuais da Calcio-ATPase de músculo. Tese (Doutorado em Quimica Bioquimica) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2006.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
Rodrigo Louro. Caracterização de transcritos humanos: novos genes da família das pequenas GTPases e novos RNAs intrônicos não-codificantes. Tese (Doutorado em Quimica Bioquimica) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2006.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
Ricardo deMarco. Construção de bibliotecas de cDNA com métodos de RT-PCR de baixa estringência e primers híbridos consenso-degenerados e clonagem da apirase de S. mansoni. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2003.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
Juliana L R Fietto. Clonagem da ATP-difosfohidrolase de S. mansoni. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2001.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
EDUARDO M REIS. Expressão heteróloga da Ca-ATPase de coelho em levedura. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2000.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
Dissertação de mestrado (7)

Fabio Nunes de Mello. Análise dos mecanismos de regulação transcricional mediados pelo lincRNA PVT1 em modelo de câncer de próstata. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2024.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
Lucas Ferreira Maciel. RNAs longos não codificadores em Schistosoma mansoni e S. japonicum. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2020.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
João Vicente de Morais Malvezzi. Identificação por phage display de candidatos vacinais para esquistossomose mansônica baseada na auto-cura de macacos rhesus (Macaca mulatta). Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2020.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
Bruno Ferreira de Souza. Desenvolvimento de um pipeline para identificar automaticamente os genes compostos predominantemente por microexons arranjados em tandem no genoma anotado de Schistosoma mansoni. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2016.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
André Anversa Oliveira Reis. Estudo da regulação por microRNAs do RNA longo não codificador de proteínas TUG1 envolvido em processos tumorigênicos.. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2016.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
Mariana Lombardi Peres de Carvalho. Identificação de proteínas modificadas por fosforilação em Schistosoma mansoni após tratamento com TNF-alfa humano. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2015.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
Adriana Matsukuma. Sequenciamento do DNA da Xylella fastidiosa e análise da sequência e predição dos genes presentes nos cosmídeos sequenciados. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2001.
Orientador: Sergio Verjovski Almeida.
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (0)

Projetos de pesquisa

Total de projetos de pesquisa (7)

2019-Atual. Mecanismos de ação de RNAs longos não-codificadores envolvidos nos programas de ativação gênica em eucariotos
Descrição: Projeto Temático de pesquisa financiado pela FAPESP. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Sergio Verjovski Almeida - Coordenador.
Membro: Sergio Verjovski Almeida.
2017-Atual. Avaliando os mecanismos de auto cura em macacos rhesus infectados com Schistosoma mansoni como uma nova base para uma vacina
Descrição: Faremos um screening dos anticorpos gerados por macacos rhesus infectados com Schistosoma mansoni, ao longo do processo de auto-cura destes macacos, usando a técnica de phage-display. O objetivo é identificar alvos do parasita atingidos pelos anticorpos do macaco, que sejam críticos para a sobrevida do parasita e que se correlacionem com a auto-cura da esquistossomose observada nesta espécie.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Sergio Verjovski Almeida - Integrante / Sergio Verjovski-Almeida - Coordenador / Murilo Sena Amaral - Integrante / Ricardo Giordano - Integrante.
Membro: Sergio Verjovski Almeida.
2014-2019. Caracterização dos mecanismos de ação de RNAs longos não-codificadores envolvidos nos programas de ativação gênica em células humanas
Descrição: Projeto temático financiado pela FAPESP. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Sergio Verjovski Almeida - Integrante / Sergio Verjovski-Almeida - Coordenador.
Membro: Sergio Verjovski Almeida.
2014-2017. A-PARADDISE: Anti-Parasitic Drug Discovery in Epigenetics
Descrição: Coordenador do Work Package 3 - "Functional characterization and target validation", que faz parte do projeto em colaboração de 9 grupos de pesquisa da Europa e do Brasil, financiado pelo The Seventh Framework Programme (FP7) of the European Commission, sob coordenação geral de Raymond Pierce, Institut Pasteur de Lille, França.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Sergio Verjovski Almeida - Integrante / Sergio Verjovski-Almeida - Coordenador. Financiador(es): European Commission - Auxílio financeiro.
Membro: Sergio Verjovski Almeida.
2009-2016. INCT em Oncogenômica
Descrição: Vice-coordenador do projeto, cuja sede é no Hospital do Câncer A. C. Camargo, sob coordenação do Dr. Luiz Paulo Kowalski. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Sergio Verjovski Almeida - Coordenador / Sergio Verjovski-Almeida - Integrante / Luis Paulo Kowalski - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Sergio Verjovski Almeida.
2008-2024. CATG - Centro Avançado de Tecnologias em Genômica
Descrição: O CATG é um laboratório do Departamento de Bioquímica do Instituto de Química da Universidade de São Paulo (IQ-USP), criado em julho de 2008 sob a supervisão do Prof. Dr. Sergio Verjovski-Almeida. O laboratório tem a finalidade de integrar as atividades de seqüenciamento em larga-escala de DNA e de RNA com as atividades de bioinformática, para permitir o melhor uso dos seqüenciadores de nova geração instalados no Departamento. A partir de 2014 passou a ser coordenado pela Profa. Dra. Aline M. da Silva.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Sergio Verjovski Almeida - Integrante / Sergio Verjovski-Almeida - Integrante / Aline Maria da Silva - Coordenador.
Membro: Sergio Verjovski Almeida.
2001-2004. Obtenção e análise do transcriptoma de Schistosoma mansoni
Descrição: Coordenei o projeto de obtenção e análise do transcriptoma de Schistosoma mansoni. Este projeto reuniu 6 laboratórios de sequenciamento do Estado de São Paulo, sendo 4 da Universidade de São Paulo, 1 do Hospital AC Camargo, e 1 do Instituto Butantan, além do laboratório de Bioinformática da Unicamp e de dois laboratórios de manutenção do ciclo de vida do parasita, um no Instituto Butantan e outro no Instituto Adolfo Lutz. O projeto teve também a participação de dois colaboradores estrangeiros, o grupo do Dr. Bento Soares, da University of Iowa, USA, e o grupo do Dr. Alan Wilson, da University of York, UK, que forneceram mRNA e bibliotecas de dois estágios diferentes do parasita. Os dados de sequencias foram depositados no Genbank. Um trabalho foi publicado, contendo as análises do transcriptoma e a identificação de genes importantes para a fisiologia e o parasitismo, além de apontar possíveis alvos para vacina e drogas (Verjovski-Almeida et al., Nature Genetics 35(2): 148-157, 2003). Outro trabalho apontou a existência de 4 novos retrotransposons de S. mansoni, três do tipo LTR e um do tipo non-LTR, todos com alta atividade transcricional (deMarco et al., J. Virol. 78: 2967-2978, 2004). Um terceiro artigo foi publicado, contendo uma comparação entre os transcriptomas de S. mansoni e S. japonicum, e apontando novos caminhos para a exploração experimental futura dos dados de transcriptoma (Verjovski-Almeida et al., Trends in Parasitology 20: 304-308, 2004).. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Sergio Verjovski Almeida - Coordenador / Marcelo B Soares - Integrante / Cybele Gargioni - Integrante / Toshie Kawano - Integrante / Vanderlei Rodrigues - Integrante / R Alan Wilson - Integrante / Carlos Menck - Integrante / Luciana C Leite - Integrante / Paulo Lee Ho - Integrante / Emmanuel Dias Neto - Integrante / Alda Maria B.N. Madeira - Integrante / Ana Lucia O. Nascimento - Integrante / Elizabeth Martins - Integrante / Arthur Gruber - Integrante / João Carlos Setubal - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Sergio Verjovski Almeida.

Prêmios e títulos

Total de prêmios e títulos (4)

Medalha PIRAJÁ DA SILVA pela importante contribuição na luta contra a esquistossomose no Brasil, Ministério da Saude da República do Brasil.. 2008.
Membro: Sergio Verjovski Almeida.
Comendador da Ordem Nacional do Mérito Científico, Presidência da República do Brasil.. 2006.
Membro: Sergio Verjovski Almeida.
Membro Titular, Academia Brasileira de Ciências.. 2003.
Membro: Sergio Verjovski Almeida.
Merito Cientifico e Tecnologico do Estado de Sao Paulo, Governo do Estado de SP.. 2000.
Membro: Sergio Verjovski Almeida.

Participação em eventos

Total de participação em eventos (0)

Organização de eventos

Total de organização de eventos (0)

Lista de colaborações

Colaborações endôgenas (7)

Sergio Verjovski Almeida ⇔ Helder Takashi Imoto Nakaya (12.0)
FARIAS, LEONARDO PAIVA ; VITORIANO-SOUZA, JULIANA ; CARDOZO, LUCAS ESTEVES ; GAMA, LEONARDO DOS REIS ; SINGH, YOUVIKA ; MIYASATO, PATRÍCIA AOKI ; Almeida, Giulliana Tessarin ; RODRIGUEZ, DUNIA ; BARBOSA, MAYRA MARA FERRARI ; FERNANDES, RAFAELA SACHETTO ; BARBOSA, TEREZA CRISTINA ; NETO, ALMIRO PIRES DA SILVA ; NAKANO, ELIANA ; HO, PAULO LEE ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; NAKAYA, HELDER IMOTO ; WILSON, ROBERT ALAN ; Leite, Luciana Cezar de Cerqueira. Systems Biology Analysis of the Radiation-Attenuated Schistosome Vaccine Reveals a Role for Growth Factors in Protection and Hemostasis Inhibition in Parasite Survival. Frontiers in Immunology. v. 12, p. 624191, 2021. Qualis: A1
CAIRES-JÚNIOR, LUIZ CARLOS ; GOULART, ERNESTO ; MELO, UIRÁ SOUTO ; ARAUJO, BRUNO HENRIQUE SILVA ; ALVIZI, LUCAS ; SOARES-SCHANOSKI, ALESSANDRA ; DE OLIVEIRA, DANYLLO FELIPE ; KOBAYASHI, GERSON SHIGERU ; GRIESI-OLIVEIRA, KARINA ; MUSSO, CAMILA MANSO ; Amaral, Murilo Sena ; DASILVA, LUCAS FERREIRA ; ASTRAY, RENATO MANCINI ; SUÁREZ-PATIÑO, SANDRA FERNANDA ; VENTINI, DANIELLA CRISTINA ; DA SILVA, SÉRGIO GOMES ; YAMAMOTO, GUILHERME LOPES ; EZQUINA, SUZANA ; NASLAVSKY, MICHEL SATYA ; Verjovski-Almeida, S. ; et.al. Publisher Correction: Discordant congenital Zika syndrome twins show differential in vitro viral susceptibility of neural progenitor cells. Nature Communications. v. 9, p. 1114, 2018. Qualis: A1
ALMEIDA, GIULLIANA T. ; LAGE, REGINA C. G. ; ANDERSON, LETICIA ; VENANCIO, THIAGO M. ; Nakaya, Helder I. ; MIYASATO, PATRÍCIA A. ; ROFATTO, HENRIQUE K. ; ZERLOTINI, ADHEMAR ; NAKANO, ELIANA ; OLIVEIRA, GUILHERME ; Verjovski-Almeida, Sergio. Synergy of Omeprazole and Praziquantel In Vitro Treatment against Schistosoma mansoni Adult Worms. PLoS Neglected Tropical Diseases (Online). v. 9, p. e0004086, 2015. Qualis: A1
BECKEDORFF, FELIPE C. ; AYUPE, ANA C. ; CROCCI-SOUZA, RENAN ; AMARAL, MURILO S. ; Nakaya, Helder I. ; SOLTYS, DANIELA T. ; MENCK, CARLOS F. M. ; Reis, Eduardo M. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio. The Intronic Long Noncoding RNA ANRASSF1 Recruits PRC2 to the RASSF1A Promoter, Reducing the Expression of RASSF1A and Increasing Cell Proliferation. PLOS Genetics (Online). v. 9, p. e1003705, 2013. Qualis: A1
LOURO, R ; ELJUNDI, T ; NAKAYA, H ; REIS, E ; VERJOVSKIALMEIDA, S ; Verjovski-Almeida, S.. Conserved tissue expression signatures of intronic noncoding RNAs transcribed from human and mouse loci. Genomics (San Diego). v. 92, p. 18-25, 2008. Qualis: A3
LOURO, Rodrigo ; NAKAYA, Helder I ; AMARAL, P. P. ; FESTA, Fernanda ; SOGAYAR, Mari C ; DA SILVA, A. M. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; REIS, Eduardo M.. Androgen responsive intronic non-coding RNAs. BMC BIOLOGY. v. 5:4, p. 1-14, 2007. Qualis: A1
NAKAYA, Helder I ; AMARAL, P. P. ; LOURO, Rodrigo ; LOPES, A. ; FACHEL, A. A. ; Moreira, Y.B. ; El-Jundi, T.A. ; DA SILVA, A. M. ; REIS, Eduardo M. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio. Genome mapping and expression analyses of human intronic noncoding RNAs reveal tissue-specific patterns and enrichment in genes related to regulation of transcription. Genome Biology. v. 8, p. 1-25, 2007. Qualis: Não identificado (GENOME BIOLOGY)
NAKAYA, Helder I ; BECKEDORFF, Felipe Cesar F ; Baldini, ML ; FACHEL, A. ; REIS, Eduardo M ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S.. Splice Variants of TLE Family Genes and Up-Regulation of a TLE3 Isoform in Prostate Tumors.. Biochemical and Biophysical Research Communications. v. 364, p. 918-923, 2007. Qualis: A3
Reis, Eduardo M. ; LOURO, Rodrigo ; NAKAYA, HELDER I. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S.. As Antisense RNA Gets Intronic. Journal of Integrative Biology / Omics (Larchmont), New Rochelle, NY. v. 9, n. 1, p. 2-12, 2005. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOLOGY / OMICS , NEW ROCHELLE, NY)
LOURO, Rodrigo ; NAKAYA, HELDER I. ; PAQUOLA, APUÃ C.M. ; MARTINS, ELIZABETH A.L. ; SILVA, ALINE M.DA ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; Reis, Eduardo M.. RASL11A, member of a novel small monomeric GTPase gene family, is down-regulated in prostate tumors.. Biochemical and Biophysical Research Communications, Estados Unidos. v. 316, n. 3, p. 618-627, 2004. Qualis: A3 (BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS)
REIS, Eduardo M ; NAKAYA, Helder I ; LOURO, Rodrigo ; CANAVEZ, Flavio C ; FLATSCHART, ÁUREA V F ; ALMEIDA, Giulliana T ; EGIDIO, Camila M ; PAQUOLA, Apuã C ; MACHADO, Abimael A ; FESTA, Fernanda ; YAMAMOTO, Denise ; ALVARENGA, Renato ; DA SILVA, CAMILLE C ; BRITO, Glauber C ; SIMON, Sérgio D ; MOREIRA-FILHO, CARLOS A ; LEITE, Katia R ; CAMARA-LOPES, Luiz H ; CAMPOS, Franz S ; Verjovski-Almeida, S. ; et.al. Antisense intronic non-coding RNA levels correlate to the degree of tumor differentiation in prostate cancer. Oncogene (Basingstoke). v. 23, n. 39, p. 6684-6692, 2004. Qualis: A1
Nakaya, Helder I.; Reis, Eduardo M. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio. Concepts on microarray design for genome and transcriptome analyses. Em: Anton A. Buzdin; Sergey A. Lukyanov. (Org.). Nucleic Acids Hybridization Modern Applications. 1ed.Berlim. : Springer Netherlands. 2007.p. 265-307.

Sergio Verjovski Almeida ⇔ Joao Carlos Setubal (12.0)
BAPTISTA, M.S. ; ALVES, M.J.M. ; ARANTES, G.M. ; ARMELIN, H.A. ; AUGUSTO, O. ; BALDINI, R.L. ; BASSERES, D.S. ; BECHARA, E.J.H. ; BRUNI-CARDOSO, A. ; CHAIMOVICH, H. ; COLEPICOLO NETO, P. ; COLLI, W. ; CUCCOVIA, I.M. ; DA-SILVA, A.M. ; DI MASCIO, P. ; FARAH, S.C. ; Ferreira, C. ; FORTI, F.L. ; GIORDANO, R.J. ; Verjovski-Almeida, S. ; et.al. Where do we aspire to publish? A position paper on scientific communication in biochemistry and molecular biology. Brazilian Journal of Medical and Biological Research (on line). v. 52, p. 1414-431x201989, 2019. Qualis: A4
DASILVA, LUCAS F. ; BECKEDORFF, FELIPE C. ; AYUPE, ANA C. ; AMARAL, MURILO S. ; MESEL, VINÍCIUS ; VIDEIRA, ALEXANDRE ; Reis, Eduardo M. ; SETUBAL, JOÃO C. ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S.. Chromatin Landscape Distinguishes the Genomic Loci of Hundreds of Androgen-Receptor-Associated LincRNAs From the Loci of Non-associated LincRNAs. Frontiers in Genetics. v. 9, p. 132, 2018. Qualis: A2
PEREIRA, ADRIANA S. A. ; AMARAL, MURILO S. ; VASCONCELOS, ELTON J. R. ; PIRES, DAVID S. ; ASIF, HUMA ; DASILVA, LUCAS F. ; MORALES-VICENTE, DAVID A. ; CARNEIRO, VITOR C. ; ANGELI, CLAUDIA B. ; PALMISANO, GIUSEPPE ; FANTAPPIE, MARCELO R. ; PIERCE, RAYMOND J. ; Setubal, João C. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio. Inhibition of histone methyltransferase EZH2 in Schistosoma mansoni in vitro by GSK343 reduces egg laying and decreases the expression of genes implicated in DNA replication and noncoding RNA metabolism. PLoS Neglected Tropical Diseases. v. 12, p. e0006873, 2018. Qualis: A1
Anderson, Letícia ; AMARAL, MURILO S. ; BECKEDORFF, FELIPE ; SILVA, LUCAS F. ; Dazzani, Bianca ; Oliveira, Katia C. ; Almeida, Giulliana T. ; GOMES, MONETE R. ; PIRES, DAVID S. ; SETUBAL, JOÃO C. ; DEMARCO, Ricardo ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S.. Schistosoma mansoni Egg, Adult Male and Female Comparative Gene Expression Analysis and Identification of Novel Genes by RNA-Seq. PLoS Neglected Tropical Diseases (Online). v. 9, p. e0004334, 2015. Qualis: A1
Verjovski-Almeida, S.; MARTINS, L. F. ; ANTUNES, L. P. ; PASCON, R. C. ; OLIVEIRA, J. C. F. ; DIGIAMPIETRI, L. A. ; BARBOSA, D. ; PEIXOTO, B. M. ; VALLIM, M. A. ; VIANA-NIERO, C. ; OSTROSKI, E. H. ; TELLES, G. P. ; DIAS, Z. ; CRUZ, J. B. ; JULIANO, L. ; Verjovski-Almeida, S. ; DASILVA, A. M. ; SETUBAL, J. C.. Metagenomic Analysis of a Tropical Composting Operation at the São Paulo Zoo Park Reveals Diversity of Biomass Degradation Functions and Organisms. Plos One. v. 8, p. e61928, 2013. Qualis: A1
Verjovski-Almeida, S.; Paschoal, Alexandre Rossi ; Maracaja-Coutinho, Vinicius ; Setubal, João Carlos ; Simões, Zilá Luz Paulino ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Durham, Alan Mitchell. Non-coding transcription characterization and annotation: A guide and web resource for non-coding RNA databases. RNA Biology. v. 9, p. 274-282, 2012. Qualis: A2
VENANCIO, Thiago M ; DEMARCO, Ricardo ; ALMEIDA, Giulliana T ; OLIVEIRA, Katia C P ; SETUBAL, Joao C ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S.. Analysis of Schistosoma mansoni genes shared with Deuterostomia and with possible roles in host interactions.. BMC Genomics. v. 8, p. 407, 2007. Qualis: A2
SETUBAL, J. C.; NASCIMENTO, Ana Lucia Tabet ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; SLUYS, Marie Anne Van ; MONTEIRO-VITORELLO, Claudia B. ; CAMARGO, Luis Eduardo Aranha ; DIGIAMPIETRI, Luciano A. ; HARTSKEERL, Rudy ; HO, Paulo Lee ; MARQUES, Marilis ; OLIVEIRA, Mariana Cabral de ; HAAKE, David ; MARTINS, Elizabeth. Genome features of Leptospira interrogans serovar Copenhageni.. Brazilian Journal of Medical and Biological Research. v. 37, n. 4, p. 459-477, 2004. Qualis: A4
NASCIMENTO, A. L. T. O. ; KO, A. I. ; MARTINS, E. A. L. ; MONTEIRO-VITORELLO, C. B. ; HO, P. L. ; HAAKE, D. A. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S. ; HARTSKEERL, R. A. ; MARQUES, M. V. ; OLIVEIRA, M. C. ; MENCK, C. F. M. ; LEITE, L. C. C. ; CARRER, H. ; COUTINHO, L. L. ; DEGRAVE, W. M. ; DELLAGOSTIN, O. A. ; EL-DORRY, H. ; FERRO, E. S. ; FERRO, M. I. T. ; et.al. Comparative genomics of two Leptospira interrogans serovars reveals novel insights into physiology and pathogenesis.. Journal of Bacteriology, estados unidos. v. 186, n. 7, p. 2164-2172, 2004. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF BACTERIOLOGY, ESTADOS UNIDOS)
DEMARCO, R. ; KOWALTOWSKI, A. T. ; MACHADO, A. A. ; SOARES, M. B. ; GARGIONI, C. ; KAWANO, T. ; RODRIGUES, V. ; MADEIRA, A. M. B. N. ; Wilson, R. A. ; MENCK, C. F. M. ; SETUBAL, J. C. ; DIAS-NETO, E. ; LEITE, L. C. C. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S.. Saci-1, -2, and -3 and Perere, Four Novel Retrotransposons with High Transcriptional Activities from the Human Parasite Schistosoma mansoni. Journal of Virology, estados unidos. v. 78, n. 6, p. 2967-2978, 2004. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF VIROLOGY, ESTADOS UNIDOS)
VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; DeMarco, Ricardo ; Martins, Elizabeth A L ; Guimarães, Pedro E M ; Ojopi, Elida P B ; Paquola, Apuã C M ; Piazza, João P ; Nishiyama, Milton Y ; Kitajima, João P ; Adamson, Rachel E ; Ashton, Peter D ; Bonaldo, Maria F ; Coulson, Patricia S ; Dillon, Gary P ; Farias, Leonardo P ; Gregorio, Sheila P ; Ho, Paulo L ; Leite, Ricardo A ; Malaquias, L Cosme C ; SETUBAL, J. C. ; et.al. Transcriptome analysis of the acoelomate human parasite Schistosoma mansoni. Nature Genetics, Reino Unido. v. 35, p. 148-157, 2003. Qualis: Não identificado (NATURE GENETICS, REINO UNIDO)
Simpson, A. J. G. ; Reinach, F.C. ; Arruda, P. ; Abreu, F. A. ; Acencio, M. ; Alvarenga, R. ; Alves, L. M. C. ; Araya, J. E. ; Baia, G. S. ; Baptista, C. S. ; Barros, M. H. ; Bonaccorsi, E. D. ; Bordin, S. ; Bové, J. M. ; Briones, M. R. S. ; Bueno, M. R. P. ; CAMARGO, A. A. ; Camargo, L. E. A. ; Carraro, D. M. ; DA SILVA, A. M.. The genome sequence of the plant pathogen Xylella fastidiosa.. Nature (London), Londres. v. 406, p. 151-157, 2000. Qualis: Não identificado (NATURE , LONDRES)

Sergio Verjovski Almeida ⇔ Aline Maria da Silva (11.0)
BAPTISTA, M.S. ; ALVES, M.J.M. ; ARANTES, G.M. ; ARMELIN, H.A. ; AUGUSTO, O. ; BALDINI, R.L. ; BASSERES, D.S. ; BECHARA, E.J.H. ; BRUNI-CARDOSO, A. ; CHAIMOVICH, H. ; COLEPICOLO NETO, P. ; COLLI, W. ; CUCCOVIA, I.M. ; DA-SILVA, A.M. ; DI MASCIO, P. ; FARAH, S.C. ; Ferreira, C. ; FORTI, F.L. ; GIORDANO, R.J. ; Verjovski-Almeida, S. ; et.al. Where do we aspire to publish? A position paper on scientific communication in biochemistry and molecular biology. Brazilian Journal of Medical and Biological Research (on line). v. 52, p. 1414-431x201989, 2019. Qualis: A4
Verjovski-Almeida, S.; MARTINS, L. F. ; ANTUNES, L. P. ; PASCON, R. C. ; OLIVEIRA, J. C. F. ; DIGIAMPIETRI, L. A. ; BARBOSA, D. ; PEIXOTO, B. M. ; VALLIM, M. A. ; VIANA-NIERO, C. ; OSTROSKI, E. H. ; TELLES, G. P. ; DIAS, Z. ; CRUZ, J. B. ; JULIANO, L. ; Verjovski-Almeida, S. ; DASILVA, A. M. ; SETUBAL, J. C.. Metagenomic Analysis of a Tropical Composting Operation at the São Paulo Zoo Park Reveals Diversity of Biomass Degradation Functions and Organisms. Plos One. v. 8, p. e61928, 2013. Qualis: A1
LOURO, Rodrigo ; NAKAYA, Helder I ; AMARAL, P. P. ; FESTA, Fernanda ; SOGAYAR, Mari C ; DA SILVA, A. M. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; REIS, Eduardo M.. Androgen responsive intronic non-coding RNAs. BMC BIOLOGY. v. 5:4, p. 1-14, 2007. Qualis: A1
NAKAYA, Helder I ; AMARAL, P. P. ; LOURO, Rodrigo ; LOPES, A. ; FACHEL, A. A. ; Moreira, Y.B. ; El-Jundi, T.A. ; DA SILVA, A. M. ; REIS, Eduardo M. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio. Genome mapping and expression analyses of human intronic noncoding RNAs reveal tissue-specific patterns and enrichment in genes related to regulation of transcription. Genome Biology. v. 8, p. 1-25, 2007. Qualis: Não identificado (GENOME BIOLOGY)
Reis, E. M. ; OJOPI, Elida ; ALBERTO, Fernando L ; RAHAL, Paula ; TSUKUMO, Fernando ; MANCINI, Ulises M ; GUIMARAES, Gustavo S ; THOMPSON, Gloria M A ; CAMACHO, Cleber ; MIRACCA, Elisabete ; CARVALHO, Andre L ; MACHADO, Abimael A ; PAQUOLA, Apua ; CERUTTI, Janette ; DA SILVA, A. M. ; PEREIRA, Gonçalo G ; VALENTINI, Sandro R ; KOWALSKI, Luiz P ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; TAJARA, Eloiza H. Large-scale transcriptome analyses reveal new genetic marker candidates of head, neck and thyroid cancer.. Cancer Research (Chicago, Ill.). v. 65, p. 1693-1699, 2005. Qualis: A1
KOIDE, T. ; ZAINI, P. A. ; MOREIRA, L. M. ; VENCIO, R. Z. N. ; MATSUKUMA, A. Y. ; DURHAM, A. M. ; TEIXEIRA, D. C. ; EL-DORRY, H. ; MONTEIRO, P. B. ; DA SILVA, A. C. R. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S. ; da SILVA, A. M. ; GOMES, S. L.. DNA microarray-based genome comparison of a pathogenic and a nonpathogenic strain of Xylella fastidiosa delineates genes important for bacterial virulence.. Journal of Bacteriology (Print). v. 186, p. 5442-5449, 2004. Qualis: A3
LOURO, Rodrigo ; NAKAYA, HELDER I. ; PAQUOLA, APUÃ C.M. ; MARTINS, ELIZABETH A.L. ; SILVA, ALINE M.DA ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; Reis, Eduardo M.. RASL11A, member of a novel small monomeric GTPase gene family, is down-regulated in prostate tumors.. Biochemical and Biophysical Research Communications, Estados Unidos. v. 316, n. 3, p. 618-627, 2004. Qualis: A3 (BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS)
REIS, Eduardo M ; NAKAYA, Helder I ; LOURO, Rodrigo ; CANAVEZ, Flavio C ; FLATSCHART, ÁUREA V F ; ALMEIDA, Giulliana T ; EGIDIO, Camila M ; PAQUOLA, Apuã C ; MACHADO, Abimael A ; FESTA, Fernanda ; YAMAMOTO, Denise ; ALVARENGA, Renato ; DA SILVA, CAMILLE C ; BRITO, Glauber C ; SIMON, Sérgio D ; MOREIRA-FILHO, CARLOS A ; LEITE, Katia R ; CAMARA-LOPES, Luiz H ; CAMPOS, Franz S ; Verjovski-Almeida, S. ; et.al. Antisense intronic non-coding RNA levels correlate to the degree of tumor differentiation in prostate cancer. Oncogene (Basingstoke). v. 23, n. 39, p. 6684-6692, 2004. Qualis: A1
PAQUOLA, A. C. M. ; NISHYIAMA, M. Y. ; REIS, E. M. ; da SILVA, A. M. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S.. ESTWeb: bioinformatics services for EST sequencing projects. Bioinformatics (Oxford. Print). v. 19, p. 1587-1588, 2003. Qualis: Não identificado (PRINT))
PAQUOLA, A. C.M. ; MACHADO, A. A. ; REIS, E. M. ; da SILVA, A. M. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S.. Zerg: a very fast BLAST parser library. Bioinformatics (Oxford. Print). v. 19, p. 1035-1036, 2003. Qualis: Não identificado (PRINT))
Simpson, A. J. G. ; Reinach, F.C. ; Arruda, P. ; Abreu, F. A. ; Acencio, M. ; Alvarenga, R. ; Alves, L. M. C. ; Araya, J. E. ; Baia, G. S. ; Baptista, C. S. ; Barros, M. H. ; Bonaccorsi, E. D. ; Bordin, S. ; Bové, J. M. ; Briones, M. R. S. ; Bueno, M. R. P. ; CAMARGO, A. A. ; Camargo, L. E. A. ; Carraro, D. M. ; DA SILVA, A. M.. The genome sequence of the plant pathogen Xylella fastidiosa.. Nature (London), Londres. v. 406, p. 151-157, 2000. Qualis: Não identificado (NATURE , LONDRES)

Sergio Verjovski Almeida ⇔ Marie-Anne Van Sluys (3.0)
SETUBAL, J. C.; NASCIMENTO, Ana Lucia Tabet ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; SLUYS, Marie Anne Van ; MONTEIRO-VITORELLO, Claudia B. ; CAMARGO, Luis Eduardo Aranha ; DIGIAMPIETRI, Luciano A. ; HARTSKEERL, Rudy ; HO, Paulo Lee ; MARQUES, Marilis ; OLIVEIRA, Mariana Cabral de ; HAAKE, David ; MARTINS, Elizabeth. Genome features of Leptospira interrogans serovar Copenhageni.. Brazilian Journal of Medical and Biological Research. v. 37, n. 4, p. 459-477, 2004. Qualis: A4
NASCIMENTO, A. L. T. O. ; KO, A. I. ; MARTINS, E. A. L. ; MONTEIRO-VITORELLO, C. B. ; HO, P. L. ; HAAKE, D. A. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S. ; HARTSKEERL, R. A. ; MARQUES, M. V. ; OLIVEIRA, M. C. ; MENCK, C. F. M. ; LEITE, L. C. C. ; CARRER, H. ; COUTINHO, L. L. ; DEGRAVE, W. M. ; DELLAGOSTIN, O. A. ; EL-DORRY, H. ; FERRO, E. S. ; FERRO, M. I. T. ; et.al. Comparative genomics of two Leptospira interrogans serovars reveals novel insights into physiology and pathogenesis.. Journal of Bacteriology, estados unidos. v. 186, n. 7, p. 2164-2172, 2004. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF BACTERIOLOGY, ESTADOS UNIDOS)
Simpson, A. J. G. ; Reinach, F.C. ; Arruda, P. ; Abreu, F. A. ; Acencio, M. ; Alvarenga, R. ; Alves, L. M. C. ; Araya, J. E. ; Baia, G. S. ; Baptista, C. S. ; Barros, M. H. ; Bonaccorsi, E. D. ; Bordin, S. ; Bové, J. M. ; Briones, M. R. S. ; Bueno, M. R. P. ; CAMARGO, A. A. ; Camargo, L. E. A. ; Carraro, D. M. ; DA SILVA, A. M.. The genome sequence of the plant pathogen Xylella fastidiosa.. Nature (London), Londres. v. 406, p. 151-157, 2000. Qualis: Não identificado (NATURE , LONDRES)

Sergio Verjovski Almeida ⇔ Alan Mitchell Durham (2.0)
Verjovski-Almeida, S.; Paschoal, Alexandre Rossi ; Maracaja-Coutinho, Vinicius ; Setubal, João Carlos ; Simões, Zilá Luz Paulino ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Durham, Alan Mitchell. Non-coding transcription characterization and annotation: A guide and web resource for non-coding RNA databases. RNA Biology. v. 9, p. 274-282, 2012. Qualis: A2
KOIDE, T. ; ZAINI, P. A. ; MOREIRA, L. M. ; VENCIO, R. Z. N. ; MATSUKUMA, A. Y. ; DURHAM, A. M. ; TEIXEIRA, D. C. ; EL-DORRY, H. ; MONTEIRO, P. B. ; DA SILVA, A. C. R. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S. ; da SILVA, A. M. ; GOMES, S. L.. DNA microarray-based genome comparison of a pathogenic and a nonpathogenic strain of Xylella fastidiosa delineates genes important for bacterial virulence.. Journal of Bacteriology (Print). v. 186, p. 5442-5449, 2004. Qualis: A3

Sergio Verjovski Almeida ⇔ Helena Paula Brentani (2.0)
BRENTANI, RICARDO R. ; CARRARO, DIRCE MARIA ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Verjovski-Almeida, S. ; Reis, Eduardo M. ; NEVES, E. JORDÃO ; DE SOUZA, SANDRO J. ; CARVALHO, ALEX F. ; BRENTANI, Helena ; REIS, LUIZ F.L.. Gene expression arrays in Cancer Research: Methods and Applications.. Critical Reviews in Oncology/Hematology. v. 54, p. 95-105, 2005. Qualis: A1
CAMARGO, A. ; SAMAIA, H. ; DIASNETO, Emmanuel ; SIMAO, D. ; MIGOTTO, I. ; BRIONES, M. ; COSTA, F. ; NAGAI, M ; Verjovski-Almeida, S. ; ZAGO, M. ; et.alli ; 87_other_authors ; BRENTANI, R. R. ; SIMPSON, A. J. ; DESOUZA, S.. The contribution of 700,000 ?ORF sequence tags? to the definition of the human transcriptome.. PNAS. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, USA. v. 98, n. 21, p. 12103-12108, 2001. Qualis: A1 (PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA)

Sergio Verjovski Almeida ⇔ Tie Koide (1.0)
KOIDE, T. ; ZAINI, P. A. ; MOREIRA, L. M. ; VENCIO, R. Z. N. ; MATSUKUMA, A. Y. ; DURHAM, A. M. ; TEIXEIRA, D. C. ; EL-DORRY, H. ; MONTEIRO, P. B. ; DA SILVA, A. C. R. ; Verjovski-Almeida, S. ; Verjovski-Almeida, S. ; da SILVA, A. M. ; GOMES, S. L.. DNA microarray-based genome comparison of a pathogenic and a nonpathogenic strain of Xylella fastidiosa delineates genes important for bacterial virulence.. Journal of Bacteriology (Print). v. 186, p. 5442-5449, 2004. Qualis: A3

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Data de processamento: 18/02/2025 12:52:38

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